Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0126
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0126, 1073 aa
1>>>pF1KSDA0126 1073 - 1073 aa - 1073 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8588+/-0.000437; mu= 19.1030+/- 0.027
mean_var=70.8853+/-14.253, 0's: 0 Z-trim(109.5): 47 B-trim: 1011 in 1/53
Lambda= 0.152334
statistics sampled from 17700 (17715) to 17700 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.538), E-opt: 0.2 (0.208), width: 16
Scan time: 12.140
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004779 (OMIM: 603753) ubiquitin conjugation fac (1073) 7071 1564.1 0
NP_001191006 (OMIM: 603753) ubiquitin conjugation (1066) 6995 1547.3 0
XP_016855525 (OMIM: 613565) PREDICTED: ubiquitin c (1057) 738 172.2 1.4e-41
NP_006039 (OMIM: 613565) ubiquitin conjugation fac (1173) 738 172.3 1.5e-41
XP_016855524 (OMIM: 613565) PREDICTED: ubiquitin c (1214) 738 172.3 1.5e-41
XP_011538790 (OMIM: 613565) PREDICTED: ubiquitin c (1237) 738 172.3 1.6e-41
NP_001099032 (OMIM: 613565) ubiquitin conjugation (1302) 738 172.3 1.6e-41
XP_005263479 (OMIM: 613565) PREDICTED: ubiquitin c (1353) 738 172.3 1.7e-41
XP_011538791 (OMIM: 613565) PREDICTED: ubiquitin c (1184) 203 54.7 3.8e-06
XP_011538792 (OMIM: 613565) PREDICTED: ubiquitin c (1172) 193 52.5 1.7e-05
NP_001280126 (OMIM: 607207,615768) E3 ubiquitin-pr ( 231) 161 45.2 0.00052
NP_005852 (OMIM: 607207,615768) E3 ubiquitin-prote ( 303) 161 45.2 0.00067
>>NP_004779 (OMIM: 603753) ubiquitin conjugation factor (1073 aa)
initn: 7071 init1: 7071 opt: 7071 Z-score: 8389.5 bits: 1564.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7071; 99.9% identity (99.9% similar) in 1073 aa overlap (1-1073:1-1073)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MTDQENNNNISSNPFAALFGSLADAKQFAAIQKEQLKQQSDELPASPDDSDNSVSESLDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MTDQENNNNISSNPFAALFGSLADAKQFAAIQKEQLKQQSDELPASPDDSDNSVSESLDE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD FDYSVAEISRSFRSQQEICEQLNINHMIQRIFLITLDNSDPSLKSGNGIPSRCVYLEEMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FDYSVAEISRSFRSQQEICEQLNINHMIQRIFLITLDNSDPSLKSGNGIPSRCVYLEEMA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VELEDQDWLDMSNVEQALFARLLLQDPGNHLINMTSSTTLNLSADRDAGERHIFCYLYSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VELEDQDWLDMSNVEQALFARLLLQDPGNHLINMTSSTTLNLSADRDAGERHIFCYLYSC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD FQRAKEEITKVPENLLPFAVQCRNLTVSNTRTVLLTLEIYVDQNIHEQLVDLMLEAIQGA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
NP_004 FQRAKEEITKVPENLLPFAVQCRNLTVSNTRTVLLTPEIYVDQNIHEQLVDLMLEAIQGA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD REYMNKIYFEDVTEFLEEVIEALILDEEVRTFPEVMIPVFDILLGRIKDLELCQILLYAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 REYMNKIYFEDVTEFLEEVIEALILDEEVRTFPEVMIPVFDILLGRIKDLELCQILLYAY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LDILLYFTRQKDMAKVFVEYIQPKDPTNGQMYQKTLLGVILSISCLLKTPGVVENHGYFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LDILLYFTRQKDMAKVFVEYIQPKDPTNGQMYQKTLLGVILSISCLLKTPGVVENHGYFL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD NPSRSSPQEIKVQEANIHQFMAQFHEKIYQMLKNLLQLSPETKHCILSWLGNCLHANAGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 NPSRSSPQEIKVQEANIHQFMAQFHEKIYQMLKNLLQLSPETKHCILSWLGNCLHANAGR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD TKIWANQMPEIFFQMYASDAFFLNLGAALLKLCQPFCKPRSSRLLTFNPTYCALKELNDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TKIWANQMPEIFFQMYASDAFFLNLGAALLKLCQPFCKPRSSRLLTFNPTYCALKELNDE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ERKIKNVHMRGLDKETCLIPAVQEPKFPQNYNLVTENLALTEYTLYLGFHRLHDQMVKIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ERKIKNVHMRGLDKETCLIPAVQEPKFPQNYNLVTENLALTEYTLYLGFHRLHDQMVKIN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD QNLHRLQVAWRDAQQSSSPAADNLREQFERLMTIYLSTKTAMTEPQMLQNCLNLQVSMAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 QNLHRLQVAWRDAQQSSSPAADNLREQFERLMTIYLSTKTAMTEPQMLQNCLNLQVSMAV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LLVQLAIGNEGSQPIELTFPLPDGYSSLAYVPEFFADNLGDFLIFLRRFADDILETSADS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LLVQLAIGNEGSQPIELTFPLPDGYSSLAYVPEFFADNLGDFLIFLRRFADDILETSADS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LEHVLHFITIFTGSIERMKNPHLRAKLAEVLEAVMPHLDQTPNPLVSSVFHRKRVFCNFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LEHVLHFITIFTGSIERMKNPHLRAKLAEVLEAVMPHLDQTPNPLVSSVFHRKRVFCNFQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD YAPQLAEALIKVFVDIEFTGDPHQFEQKFNYRRPMYPILRYMWGTDTYRESIKDLADYAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 YAPQLAEALIKVFVDIEFTGDPHQFEQKFNYRRPMYPILRYMWGTDTYRESIKDLADYAS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD KNLEAMNPPLFLRFLNLLMNDAIFLLDEAIQYLSKIKIQQIEKDRGEWDSLTPEARREKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KNLEAMNPPLFLRFLNLLMNDAIFLLDEAIQYLSKIKIQQIEKDRGEWDSLTPEARREKE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD AGLQMFGQLARFHNIMSNETIGTLAFLTSEIKSLFVHPFLAERIISMLNYFLQHLVGPKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AGLQMFGQLARFHNIMSNETIGTLAFLTSEIKSLFVHPFLAERIISMLNYFLQHLVGPKM
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD GALKVKDFSEFDFKPQQLVSDICTIYLNLGDEENFCATVPKDGRSYSPTLFAQTVRVLKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GALKVKDFSEFDFKPQQLVSDICTIYLNLGDEENFCATVPKDGRSYSPTLFAQTVRVLKK
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD INKPGNMIMAFSNLAERIKSLADLQQQEEETYADACDEFLDPIMSTLMCDPVVLPSSRVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 INKPGNMIMAFSNLAERIKSLADLQQQEEETYADACDEFLDPIMSTLMCDPVVLPSSRVT
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD VDRSTIARHLLSDQTDPFNRSPLTMDQIRPNTELKEKIQRWLAERKQQKEQLE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VDRSTIARHLLSDQTDPFNRSPLTMDQIRPNTELKEKIQRWLAERKQQKEQLE
1030 1040 1050 1060 1070
>>NP_001191006 (OMIM: 603753) ubiquitin conjugation fact (1066 aa)
initn: 5474 init1: 5474 opt: 6995 Z-score: 8299.3 bits: 1547.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6995; 99.2% identity (99.3% similar) in 1073 aa overlap (1-1073:1-1066)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MTDQENNNNISSNPFAALFGSLADAKQFAAIQKEQLKQQSDELPASPDDSDNSVSESLDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MTDQENNNNISSNPFAALFGSLADAKQFAAIQKEQLKQQSDELPASPDDSDNSVSESLDE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD FDYSVAEISRSFRSQQEICEQLNINHMIQRIFLITLDNSDPSLKSGNGIPSRCVYLEEMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FDYSVAEISRSFRSQQEICEQLNINHMIQRIFLITLDNSDPSLKSGNGIPSRCVYLEEMA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VELEDQDWLDMSNVEQALFARLLLQDPGNHLINMTSSTTLNLSADRDAGERHIFCYLYSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VELEDQDWLDMSNVEQALFARLLLQDPGNHLINMTSSTTLNLSADRDAGERHIFCYLYSC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD FQRAKEEITKVPENLLPFAVQCRNLTVSNTRTVLLTLEIYVDQNIHEQLVDLMLEAIQGA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
NP_001 FQRAKEEITKVPENLLPFAVQCRNLTVSNTRTVLLTPEIYVDQNIHEQLVDLMLEAIQGA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD REYMNKIYFEDVTEFLEEVIEALILDEEVRTFPEVMIPVFDILLGRIKDLELCQILLYAY
.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 -------HFEDVTEFLEEVIEALILDEEVRTFPEVMIPVFDILLGRIKDLELCQILLYAY
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LDILLYFTRQKDMAKVFVEYIQPKDPTNGQMYQKTLLGVILSISCLLKTPGVVENHGYFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LDILLYFTRQKDMAKVFVEYIQPKDPTNGQMYQKTLLGVILSISCLLKTPGVVENHGYFL
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD NPSRSSPQEIKVQEANIHQFMAQFHEKIYQMLKNLLQLSPETKHCILSWLGNCLHANAGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NPSRSSPQEIKVQEANIHQFMAQFHEKIYQMLKNLLQLSPETKHCILSWLGNCLHANAGR
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KSD TKIWANQMPEIFFQMYASDAFFLNLGAALLKLCQPFCKPRSSRLLTFNPTYCALKELNDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TKIWANQMPEIFFQMYASDAFFLNLGAALLKLCQPFCKPRSSRLLTFNPTYCALKELNDE
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ERKIKNVHMRGLDKETCLIPAVQEPKFPQNYNLVTENLALTEYTLYLGFHRLHDQMVKIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ERKIKNVHMRGLDKETCLIPAVQEPKFPQNYNLVTENLALTEYTLYLGFHRLHDQMVKIN
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KSD QNLHRLQVAWRDAQQSSSPAADNLREQFERLMTIYLSTKTAMTEPQMLQNCLNLQVSMAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QNLHRLQVAWRDAQQSSSPAADNLREQFERLMTIYLSTKTAMTEPQMLQNCLNLQVSMAV
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LLVQLAIGNEGSQPIELTFPLPDGYSSLAYVPEFFADNLGDFLIFLRRFADDILETSADS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLVQLAIGNEGSQPIELTFPLPDGYSSLAYVPEFFADNLGDFLIFLRRFADDILETSADS
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LEHVLHFITIFTGSIERMKNPHLRAKLAEVLEAVMPHLDQTPNPLVSSVFHRKRVFCNFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LEHVLHFITIFTGSIERMKNPHLRAKLAEVLEAVMPHLDQTPNPLVSSVFHRKRVFCNFQ
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KSD YAPQLAEALIKVFVDIEFTGDPHQFEQKFNYRRPMYPILRYMWGTDTYRESIKDLADYAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YAPQLAEALIKVFVDIEFTGDPHQFEQKFNYRRPMYPILRYMWGTDTYRESIKDLADYAS
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KSD KNLEAMNPPLFLRFLNLLMNDAIFLLDEAIQYLSKIKIQQIEKDRGEWDSLTPEARREKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KNLEAMNPPLFLRFLNLLMNDAIFLLDEAIQYLSKIKIQQIEKDRGEWDSLTPEARREKE
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KSD AGLQMFGQLARFHNIMSNETIGTLAFLTSEIKSLFVHPFLAERIISMLNYFLQHLVGPKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AGLQMFGQLARFHNIMSNETIGTLAFLTSEIKSLFVHPFLAERIISMLNYFLQHLVGPKM
840 850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KSD GALKVKDFSEFDFKPQQLVSDICTIYLNLGDEENFCATVPKDGRSYSPTLFAQTVRVLKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GALKVKDFSEFDFKPQQLVSDICTIYLNLGDEENFCATVPKDGRSYSPTLFAQTVRVLKK
900 910 920 930 940 950
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD INKPGNMIMAFSNLAERIKSLADLQQQEEETYADACDEFLDPIMSTLMCDPVVLPSSRVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 INKPGNMIMAFSNLAERIKSLADLQQQEEETYADACDEFLDPIMSTLMCDPVVLPSSRVT
960 970 980 990 1000 1010
1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD VDRSTIARHLLSDQTDPFNRSPLTMDQIRPNTELKEKIQRWLAERKQQKEQLE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VDRSTIARHLLSDQTDPFNRSPLTMDQIRPNTELKEKIQRWLAERKQQKEQLE
1020 1030 1040 1050 1060
>>XP_016855525 (OMIM: 613565) PREDICTED: ubiquitin conju (1057 aa)
initn: 610 init1: 326 opt: 738 Z-score: 867.7 bits: 172.2 E(85289): 1.4e-41
Smith-Waterman score: 1058; 27.4% identity (58.9% similar) in 932 aa overlap (170-1066:178-1053)
140 150 160 170 180 190
pF1KSD ARLLLQDPGNHLINMTSSTTLNLSADRDAGERHIFCYLYSCFQRAKEEITKVPENLLPFA
: .. :: ::.:. : :.:. :
XP_016 GASSLSSLGASGGASNWDSYSDHFTIETCKETDMLNYLIECFDRVGIEEKKAPKMCSQPA
150 160 170 180 190 200
200 210 220 230 240 250
pF1KSD VQCRNLTVSNTRTVLLTLEIYVDQNIHEQLVDLMLEAIQGAREYMNKIYFEDVTEFLEEV
: . .:: :. .. : :. : .:. .. .. . :..:.
XP_016 V---SQLLSNIRSQCISHTALVLQGSLTQPRSLQQPSFLVPYMLCRNLPY----GFIQEL
210 220 230 240 250 260
260 270 280 290 300 310
pF1KSD IEALILDEEVRTFPEVMIPVFDILLGRIK----DLELCQILLYAYLDIL-LYFTRQKDMA
... :::: : ...::... : : : . . :.: .. : . . .
XP_016 VRTTHQDEEV--FKQIFIPILQGLALAAKECSLDSDYFKYPLMALGELCETKFGKTHPVC
270 280 290 300 310
320 330 340 350 360
pF1KSD KVF--VEYIQPKD--PTNGQMYQK-TLLGVILSISCLLKTP-GVVENHGYFLNPSRSSPQ
.. .. ::. : :. :. . ::...:.: . . :::. :: .:. . .
XP_016 NLVASLRLWLPKSLSPGCGRELQRLSYLGAFFSFSVFAEDDVKVVEK--YFSGPA-ITLE
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KSD EIKVQEANIHQFMAQFHEKIYQMLKNLLQLSPETKHCILSWLGNCLHANAGRTKIWANQM
. .: ...... .......:...: :. ::.. ::... ..:: .... ...
XP_016 NTRVVSQSLQHYLELGRQELFKILHSIL-LNGETREAALSYMAAVVNANMKKAQMQTDD-
380 390 400 410 420 430
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PEIFFQMYASDAFFLNLGAALLKLCQPFCKPRSSRLLTFNPTY-----CALKELNDEERK
.. ..:.:.::. .: .: . .: : .::: : . ::: :
XP_016 -----RLVSTDGFMLNFLWVLQQLSTKI------KLETVDPTYIFHPRCRITLPNDETR-
440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KSD IKNVHMRGL-DKETCLI---PAVQEPKFPQNYNLVT---ENLA-LTEYTLYLGFHRLHDQ
:. :. . : : : : .::::: . ..: ..:. : :. : .
XP_016 -VNATMEDVNDWLTELYGDQPPFSEPKFPTECFFLTLHAHHLSILPSCRRYIRRLRAIRE
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580
pF1KSD MVKINQNLHRLQVAWRDAQQSSSPAADNLRE-------QFERLMTIYLSTKTAMTEPQML
. . ..:. . :.: :: : :: :...:. . ... . ..:
XP_016 LNRTVEDLKNNESQWKD-----SPLATRHREMLKRCKTQLKKLVRCKACADAGLLDESFL
550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KSD QNCLNLQVSMAVLLVQLAIGNEGSQPIELTFPL-PDGYSSLAYVPEFFADNLGDFLIFLR
. :::. ::.:: . ..:.:: : . .: .:::.......::.:.
XP_016 RRCLNFYG----LLIQLLLRILDPAYPDITLPLNSDVPKVFAALPEFYVEDVAEFLFFIV
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KSD RFADDILETSADSLEHVLHFITIFTGSIERMKNPHLRAKLAEVLEAVMPHLDQTPNPLVS
... . : . .. :.... . . ..::.: :::.::. . : .. : ..
XP_016 QYSPQALYEPCT--QDIVMFLVVMLCNQNYIRNPYLVAKLVEVMFMTNPAVQ----PRTQ
660 670 680 690 700
710 720 730 740 750 760
pF1KSD SVFHRKRVFCNFQYAPQL-AEALIKVFVDIEFTGDPHQFEQKFNYRRPMYPILRYMWGTD
. :. .. : . .: . .:.: ..:.: :: .: .::. : . :.. .:
XP_016 KFFE---MIENHPLSTKLLVPSLMKFYTDVEHTGATSEFYDKFTIRYHISTIFKSLW---
710 720 730 740 750
770 780 790 800 810 820
pF1KSD TYRESIKDLADYASKNLEAMNPPLFLRFLNLLMNDAIFLLDEAIQYLSKI-KIQQIEKDR
...: ... : . :.:..:.:.::. :::::... :..: ..:. :..
XP_016 ------QNIAHHGTFMEEFNSGKQFVRYINMLINDTTFLLDESLESLKRIHEVQEEMKNK
760 770 780 790 800 810
830 840 850 860 870 880
pF1KSD GEWDSLTPEARREKEAGLQMFGQLARFHNIMSNETIGTLAFLTSEIKSLFVHPFLAERII
.::.: . .. ... : . ...: . ...::. . .::..... :..: :. :.
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XP_011 KFFE---MIENHPLSTKLLVPSLMKFYTDVEHTGATSEFYDKFTIRYHISTIFKSLW---
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pF1KSD TYRESIKDLADYASKNLEAMNPPLFLRFLNLLMNDAIFLLDEAIQYLSKI-KIQQIEKDR
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XP_011 ------QNIAHHGTFMEEFNSGKQFVRYINMLINDTTFLLDESLESLKRIHEVQEEMKNK
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XP_011 EQWDQLPRDQQQARQSQLAQDERVSRSYLALATETVDMFHILTKQVQKPFLRPELGPRLA
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XP_011 YSKELFEEVISKMRKAGIKSTIAIEKFKLLAEKVEEIVAKNARAEIDYSDAPDEFRDPLM
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pF1KSD STLMCDPVVLPSSRVTVDRSTIARHLLSDQTDPFNRSPLTMDQIRPNTELKEKIQRWLAE
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XP_005 AMLNFNLQQLCGPKCRDLKVENPEKYGFEPKKLLDQLTDIYLQL-DCARFAKAIADDQRS
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pF1KSD YSPTLFAQTVRVLKKIN-KPGNMIMAFSNLAERIKSLADLQQQEEETYADACDEFLDPIM
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XP_005 YSKELFEEVISKMRKAGIKSTIAIEKFKLLAEKVEEIVAKNARAEIDYSDAPDEFRDPLM
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pF1KSD STLMCDPVVLPSSRVTVDRSTIARHLLSDQTDPFNRSPLTMDQIRPNTELKEKIQRWLAE
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XP_005 KQNSDH
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pF1KSD IEALILDEEVRTFPEVMIPVFDILLGRIK----DLELCQILLYAYLDIL-LYFTRQKDMA
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XP_011 VRTTHQDEEV--FKQIFIPILQGLALAAKECSLDSDYFKYPLMALGELCETKFGKTHPVC
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pF1KSD KVF--VEYIQPKD--PTNGQMYQK-TLLGVILSISCLLKTP-GVVENHGYFLNPSRSSPQ
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XP_011 RRCLNFYG----LLIQLLLRILDPAYPDITLPLNSDVPKVFAALPEFYVEDVAEFLFFIV
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pF1KSD RFADDILETSADSLEHVLHFITIFTGSIERMKNPHLRAKLAEVLEAVMPHLDQTPNPLVS
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XP_011 QYSPQALYEPCT--QDIVMFLVVMLCNQNYIRNPYLVAKLVEVMFMTNPAVQ----PRTQ
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XP_011 KFFE---MIENHPLSTKLLVPSLMKFYTDVEHTGATSEFYDKFTIRYHISTIFKSLW---
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XP_011 ------QNIAHHGTFMEEFNSGKQFVRYINMLINDTTFLLDESLESLKRIHEVQEEMKNK
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pF1KSD GEWDSLTPEARREKEAGLQMFGQLARFHNIMSNETIGTLAFLTSEIKSLFVHPFLAERII
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XP_011 EQWDQLPRDQQQARQSQLAQDERVSRSYLALATETVDMFHILTKQVQKPFLRPLLNSEI-
1110 1120 1130 1140 1150 1160
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pF1KSD SMLNYFLQHLVGPKMGALKVKDFSEFDFKPQQLVSDICTIYLNLGDEENFCATVPKDGRS
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XP_011 --QEYSVQKQILEKLSIC
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XP_011 CVQFGSSLGASGGASNWDSYSDHFTIETCKETDMLNYLIECFDRVGIEEKKAPKMCSQPA
450 460 470 480 490 500
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pF1KSD VQCRNLTVSNTRTVLLTLEIYVDQNIHEQLVDLMLEAIQGAREYMNKIYFEDVTEFLEEV
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XP_011 V---SQLLSNIRSQCISHTALVLQGSLTQPRSLQQPSFLVPYMLCRNLPYG----FIQEL
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pF1KSD IEALILDEEVRTFPEVMIPVFDILLGRIK----DLELCQILLYAYLDIL-LYFTRQKDMA
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XP_011 VRTTHQDEEV--FKQIFIPILQGLALAAKECSLDSDYFKYPLMALGELCETKFGKTHPVC
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