Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0119
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0119, 323 aa
1>>>pF1KSDA0119 323 - 323 aa - 323 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6862+/-0.000853; mu= 13.5294+/- 0.051
mean_var=66.6097+/-13.583, 0's: 0 Z-trim(105.6): 33 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.157147
statistics sampled from 8479 (8507) to 8479 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.651), E-opt: 0.2 (0.261), width: 16
Scan time: 2.020
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7063.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 ( 323) 2166 500.0 1e-141
CCDS73062.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 ( 323) 2162 499.1 2e-141
CCDS7061.1 AKR1C1 gene_id:1645|Hs108|chr10 ( 323) 1924 445.1 3.4e-125
CCDS7062.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 323) 1904 440.6 8e-124
CCDS7064.1 AKR1C4 gene_id:1109|Hs108|chr10 ( 323) 1835 424.9 4.1e-119
CCDS5846.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 326) 1274 297.8 7.9e-81
CCDS55169.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 290) 1148 269.2 2.8e-72
CCDS81438.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 297) 1053 247.6 8.8e-66
CCDS5831.1 AKR1B1 gene_id:231|Hs108|chr7 ( 316) 1046 246.1 2.8e-65
CCDS5832.1 AKR1B10 gene_id:57016|Hs108|chr7 ( 316) 990 233.4 1.9e-61
CCDS47715.2 AKR1B15 gene_id:441282|Hs108|chr7 ( 344) 926 218.9 4.7e-57
CCDS523.1 AKR1A1 gene_id:10327|Hs108|chr1 ( 325) 870 206.2 3e-53
CCDS44350.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 139) 715 170.9 5.2e-43
CCDS31134.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 320) 573 138.8 5.4e-33
CCDS55170.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 285) 558 135.4 5.2e-32
CCDS59210.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 222) 345 87.1 1.4e-17
CCDS59209.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 263) 345 87.1 1.7e-17
>>CCDS7063.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 (323 aa)
initn: 2166 init1: 2166 opt: 2166 Z-score: 2657.6 bits: 500.0 E(32554): 1e-141
Smith-Waterman score: 2166; 99.7% identity (100.0% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDSKQQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPPEVPRSKALEVTKLAIEAGFRHIDSAHLYNNEEQ
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CCDS70 MDSKHQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPPEVPRSKALEVTKLAIEAGFRHIDSAHLYNNEEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSTFHRPELVRPALENSLKKAQLDYVDLYLIHSPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSTFHRPELVRPALENSLKKAQLDYVDLYLIHSPM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SLKPGEELSPTDENGKVIFDIVDLCTTWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMILNKP
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CCDS70 SLKPGEELSPTDENGKVIFDIVDLCTTWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMILNKP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GLKYKPVCNQVECHPYFNRSKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSQRDKRWVDPNSPVLLEDPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 GLKYKPVCNQVECHPYFNRSKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSQRDKRWVDPNSPVLLEDPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTAEDMKAIDGLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTAEDMKAIDGLD
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KSD RNLHYFNSDSFASHPNYPYSDEY
:::::::::::::::::::::::
CCDS70 RNLHYFNSDSFASHPNYPYSDEY
310 320
>>CCDS73062.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 (323 aa)
initn: 2162 init1: 2162 opt: 2162 Z-score: 2652.7 bits: 499.1 E(32554): 2e-141
Smith-Waterman score: 2162; 99.4% identity (100.0% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDSKQQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPPEVPRSKALEVTKLAIEAGFRHIDSAHLYNNEEQ
::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MDSKHQCLKLNDGHFMPVLGFGTYAPPEVPRSKALEVTKLAIEAGFRHIDSAHLYNNEEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSTFHRPELVRPALENSLKKAQLDYVDLYLIHSPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSTFHRPELVRPALENSLKKAQLDYVDLYLIHSPM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SLKPGEELSPTDENGKVIFDIVDLCTTWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMILNKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SLKPGEELSPTDENGKVIFDIVDLCTTWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMILNKP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GLKYKPVCNQVECHPYFNRSKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSQRDKRWVDPNSPVLLEDPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GLKYKPVCNQVECHPYFNRSKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSQRDKRWVDPNSPVLLEDPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTAEDMKAIDGLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTAEDMKAIDGLD
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KSD RNLHYFNSDSFASHPNYPYSDEY
:::::::::::::::::::::::
CCDS73 RNLHYFNSDSFASHPNYPYSDEY
310 320
>>CCDS7061.1 AKR1C1 gene_id:1645|Hs108|chr10 (323 aa)
initn: 1924 init1: 1924 opt: 1924 Z-score: 2361.1 bits: 445.1 E(32554): 3.4e-125
Smith-Waterman score: 1924; 87.9% identity (95.4% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDSKQQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPPEVPRSKALEVTKLAIEAGFRHIDSAHLYNNEEQ
:::: ::::::::::::::::::::: :::.:::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS70 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPAEVPKSKALEATKLAIEAGFRHIDSAHLYNNEEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSTFHRPELVRPALENSLKKAQLDYVDLYLIHSPM
:::::::::::::::::::::::::: . ::::::::::: :::. ::::::::::: :.
CCDS70 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIHFPV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SLKPGEELSPTDENGKVIFDIVDLCTTWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMILNKP
:.:::::. : :::::..:: ::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 SVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAVEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMILNKP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GLKYKPVCNQVECHPYFNRSKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSQRDKRWVDPNSPVLLEDPV
::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::.:.. ::::::::::::::
CCDS70 GLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLEDPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTAEDMKAIDGLD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::::.
CCDS70 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAIDGLN
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KSD RNLHYFNSDSFASHPNYPYSDEY
::..:.. : ::. ::::.::::
CCDS70 RNVRYLTLDIFAGPPNYPFSDEY
310 320
>>CCDS7062.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 (323 aa)
initn: 1904 init1: 1904 opt: 1904 Z-score: 2336.5 bits: 440.6 E(32554): 8e-124
Smith-Waterman score: 1904; 87.0% identity (95.4% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDSKQQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPPEVPRSKALEVTKLAIEAGFRHIDSAHLYNNEEQ
:::: ::::::::::::::::::::: :::.:::::..::::::::.::::::.::::::
CCDS70 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPAEVPKSKALEAVKLAIEAGFHHIDSAHVYNNEEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSTFHRPELVRPALENSLKKAQLDYVDLYLIHSPM
:::::::::::::::::::::::::::. ::::::::::: :::. ::::::::::: :.
CCDS70 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIHFPV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SLKPGEELSPTDENGKVIFDIVDLCTTWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMILNKP
:.:::::. : :::::..:: ::::.:::::::::::::::::::::::.: ::::::::
CCDS70 SVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNHRLLEMILNKP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GLKYKPVCNQVECHPYFNRSKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSQRDKRWVDPNSPVLLEDPV
::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::.:.. ::::::::::::::
CCDS70 GLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLEDPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTAEDMKAIDGLD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::::.
CCDS70 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAIDGLN
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KSD RNLHYFNSDSFASHPNYPYSDEY
::..:.. : ::. ::::.::::
CCDS70 RNVRYLTLDIFAGPPNYPFSDEY
310 320
>>CCDS7064.1 AKR1C4 gene_id:1109|Hs108|chr10 (323 aa)
initn: 1835 init1: 1835 opt: 1835 Z-score: 2252.0 bits: 424.9 E(32554): 4.1e-119
Smith-Waterman score: 1835; 83.9% identity (93.2% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDSKQQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPPEVPRSKALEVTKLAIEAGFRHIDSAHLYNNEEQ
:: : : :.::::::::::::::::::::::..:.:::::::::::::::::.:::::::
CCDS70 MDPKYQRVELNDGHFMPVLGFGTYAPPEVPRNRAVEVTKLAIEAGFRHIDSAYLYNNEEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSTFHRPELVRPALENSLKKAQLDYVDLYLIHSPM
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CCDS70 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCTFFQPQMVQPALESSLKKLQLDYVDLYLLHFPM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SLKPGEELSPTDENGKVIFDIVDLCTTWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMILNKP
.::::: : ::::::::: ::: .:::.::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS70 ALKPGETPLPKDENGKVIFDTVDLSATWEVMEKCKDAGLAKSIGVSNFNCRQLEMILNKP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GLKYKPVCNQVECHPYFNRSKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSQRDKRWVDPNSPVLLEDPV
::::::::::::::::.:.::::::::::::::::.::::.:: : ::::::::::::::
CCDS70 GLKYKPVCNQVECHPYLNQSKLLDFCKSKDIVLVAHSALGTQRHKLWVDPNSPVLLEDPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTAEDMKAIDGLD
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:.::::::::.::::..:::.
CCDS70 LCALAKKHKQTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRENIQVFEFQLTSEDMKVLDGLN
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KSD RNLHYFNSDSFASHPNYPYSDEY
:: .: : . .::.::.::::
CCDS70 RNYRYVVMDFLMDHPDYPFSDEY
310 320
>>CCDS5846.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 (326 aa)
initn: 1257 init1: 1198 opt: 1274 Z-score: 1564.6 bits: 297.8 E(32554): 7.9e-81
Smith-Waterman score: 1274; 56.2% identity (84.9% similar) in 317 aa overlap (8-323:10-326)
10 20 30 40 50
pF1KSD MDSKQQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPPE-VPRSKALEVTKLAIEAGFRHIDSAHLYNN
. :.::. .:..:.:::. :. .:.. .:.::..:.::::.:..:.:
CCDS58 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD EEQVGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSTFHRPELVRPALENSLKKAQLDYVDLYLIH
:..:: ::: :::.:.:.:::::: .:::.: : ::.:::.:: .:. ::::::::.:.
CCDS58 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD SPMSLKPGEELSPTDENGKVIFDIVDLCTTWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMIL
::..:::.:. : ::::: .. .::.:::::: ::::::.::.:::::::::::.::
CCDS58 VPMAFKPGDEIYPRDENGKWLYHKSNLCATWEAMEACKDAGLVKSLGVSNFNRRQLELIL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD NKPGLKYKPVCNQVECHPYFNRSKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSQRDKRWVDPNSPVLLE
::::::.::: :::::::::.. ::: ::...:::..::: ::..:. ::. .:: ::.
CCDS58 NKPGLKHKPVSNQVECHPYFTQPKLLKFCQQHDIVITAYSPLGTSRNPIWVNVSSPPLLK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD DPVLCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTAEDMKAID
: .: .:.:....: : :.::...::::::. ::.: .::..: :.:.:.:: :.:: :.
CCDS58 DALLNSLGKRYNKTAAQIVLRFNIQRGVVVIPKSFNLERIKENFQIFDFSLTEEEMKDIE
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KSD GLDRNLHYFNSDSFASHPNYPYSDEY
.:..:... . . .::.::. :::
CCDS58 ALNKNVRFVELLMWRDHPEYPFHDEY
310 320
>>CCDS55169.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 (290 aa)
initn: 1131 init1: 1072 opt: 1148 Z-score: 1411.0 bits: 269.2 E(32554): 2.8e-72
Smith-Waterman score: 1148; 58.5% identity (85.6% similar) in 277 aa overlap (8-283:10-286)
10 20 30 40 50
pF1KSD MDSKQQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPPE-VPRSKALEVTKLAIEAGFRHIDSAHLYNN
. :.::. .:..:.:::. :. .:.. .:.::..:.::::.:..:.:
CCDS55 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD EEQVGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSTFHRPELVRPALENSLKKAQLDYVDLYLIH
:..:: ::: :::.:.:.:::::: .:::.: : ::.:::.:: .:. ::::::::.:.
CCDS55 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD SPMSLKPGEELSPTDENGKVIFDIVDLCTTWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMIL
::..:::.:. : ::::: .. .::.:::::: ::::::.::.:::::::::::.::
CCDS55 VPMAFKPGDEIYPRDENGKWLYHKSNLCATWEAMEACKDAGLVKSLGVSNFNRRQLELIL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD NKPGLKYKPVCNQVECHPYFNRSKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSQRDKRWVDPNSPVLLE
::::::.::: :::::::::.. ::: ::...:::..::: ::..:. ::. .:: ::.
CCDS55 NKPGLKHKPVSNQVECHPYFTQPKLLKFCQQHDIVITAYSPLGTSRNPIWVNVSSPPLLK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD DPVLCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTAEDMKAID
: .: .:.:....: : :.::...::::::. ::.: .::..: ::
CCDS55 DALLNSLGKRYNKTAAQIVLRFNIQRGVVVIPKSFNLERIKENFQVARSS
250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KSD GLDRNLHYFNSDSFASHPNYPYSDEY
>>CCDS81438.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 (297 aa)
initn: 1040 init1: 1040 opt: 1053 Z-score: 1294.4 bits: 247.6 E(32554): 8.8e-66
Smith-Waterman score: 1692; 81.1% identity (88.2% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDSKQQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPPEVPRSKALEVTKLAIEAGFRHIDSAHLYNNEEQ
:::: ::::::::::::::::::::: :::.:::::..::::::::.::::::.::::::
CCDS81 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPAEVPKSKALEAVKLAIEAGFHHIDSAHVYNNEEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSTFHRPELVRPALENSLKKAQLDYVDLYLIHSPM
:::::::::::::::::::::::::::. ::::::::::: :::. ::::::::::: :.
CCDS81 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIHFPV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SLKPGEELSPTDENGKVIFDIVDLCTTWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMILNKP
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]