Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0111
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0111, 411 aa
1>>>pF1KSDA0111 411 - 411 aa - 411 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5790+/-0.00114; mu= 15.1678+/- 0.068
mean_var=63.8164+/-12.975, 0's: 0 Z-trim(100.5): 72 B-trim: 19 in 1/48
Lambda= 0.160549
statistics sampled from 6083 (6156) to 6083 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.543), E-opt: 0.2 (0.189), width: 16
Scan time: 1.880
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17 ( 411) 2659 625.2 3.4e-179
CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3 ( 407) 1801 426.5 2.3e-119
CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 406) 1791 424.1 1.1e-118
CCDS58511.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 347) 1422 338.7 5.3e-93
CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11 ( 483) 948 228.9 7.9e-60
CCDS44766.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 483) 907 219.4 5.7e-57
CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6 ( 428) 884 214.1 2.1e-55
CCDS10889.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 478) 870 210.8 2.2e-54
CCDS10888.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 479) 865 209.7 4.8e-54
CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19 ( 427) 858 208.0 1.3e-53
CCDS81646.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 369) 838 203.4 2.9e-52
CCDS42187.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 370) 811 197.1 2.2e-50
CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1 ( 824) 798 194.3 3.7e-49
CCDS82009.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 447) 777 189.3 6.2e-48
CCDS32475.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 448) 774 188.6 1e-47
CCDS58478.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 453) 774 188.6 1e-47
CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 455) 762 185.8 7e-47
CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031) 744 181.8 2.6e-45
CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032) 744 181.8 2.6e-45
CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6 ( 648) 731 178.7 1.4e-44
CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1 ( 619) 725 177.3 3.5e-44
CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 ( 796) 710 173.9 4.9e-43
CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 881) 704 172.5 1.4e-42
CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 882) 704 172.5 1.4e-42
CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 729) 688 168.8 1.5e-41
CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 731) 688 168.8 1.5e-41
CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 678 166.4 6.6e-41
CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 678 166.4 6.6e-41
CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19 ( 483) 666 163.6 3.7e-40
CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17 ( 938) 662 162.8 1.3e-39
CCDS55404.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 646) 655 161.1 2.8e-39
CCDS43931.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 662) 655 161.1 2.8e-39
CCDS14782.1 DDX3Y gene_id:8653|Hs108|chrY ( 660) 645 158.8 1.4e-38
CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX ( 631) 629 155.1 1.8e-37
CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2 ( 670) 596 147.4 3.7e-35
CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 715) 591 146.3 8.8e-35
CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 783) 591 146.3 9.6e-35
CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 575) 560 139.1 1.1e-32
CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5 ( 622) 560 139.1 1.1e-32
CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 690) 560 139.1 1.2e-32
CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 704) 560 139.1 1.3e-32
CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 724) 560 139.1 1.3e-32
CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17 ( 599) 544 135.4 1.4e-31
CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10 ( 737) 545 135.6 1.5e-31
CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11 ( 875) 531 132.4 1.6e-30
CCDS8656.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 406) 445 112.4 8e-25
CCDS8770.1 DDX23 gene_id:9416|Hs108|chr12 ( 820) 379 97.2 6e-20
CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12 ( 600) 369 94.8 2.3e-19
CCDS59053.1 DDX56 gene_id:54606|Hs108|chr7 ( 507) 307 80.5 4.1e-15
CCDS10858.1 DDX28 gene_id:55794|Hs108|chr16 ( 540) 304 79.8 7e-15
>>CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17 (411 aa)
initn: 2659 init1: 2659 opt: 2659 Z-score: 3330.5 bits: 625.2 E(32554): 3.4e-179
Smith-Waterman score: 2659; 100.0% identity (100.0% similar) in 411 aa overlap (1-411:1-411)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MATTATMATSGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MATTATMATSGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PSAIQQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PSAIQQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD QIQKGLLALGDYMNVQCHACIGGTNVGEDIRKLDYGQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QIQKGLLALGDYMNVQCHACIGGTNVGEDIRKLDYGQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD IKMLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IKMLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRIL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD NFTVSSMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNREL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NFTVSSMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNREL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KSD YIHRIGRSGRYGRKGVAINFVKNDDIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YIHRIGRSGRYGRKGVAINFVKNDDIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
370 380 390 400 410
>>CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3 (407 aa)
initn: 1802 init1: 1258 opt: 1801 Z-score: 2256.5 bits: 426.5 E(32554): 2.3e-119
Smith-Waterman score: 1801; 71.4% identity (89.7% similar) in 378 aa overlap (35-411:30-407)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD ATMATSGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEKPSAI
... .:: :.:.:.::::::::::::::::
CCDS32 MSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD QQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQIQK
::::: ::: :::::.::::::::::.::.:: :.:. .:::::.:::::::: ::::
CCDS32 QQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GLLALGDYMNVQCHACIGGTNVGEDIRKLDY-GQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKM
.:::::::.. :::::::::: ....::. . :.:.:::::::::. :: : . :::
CCDS32 VILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKM
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKR
.:::::::::..:::.:::.... : . ::::.:::.: ..::.:.::: ::::::::.
CCDS32 FVLDEADEMLSRGFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD DELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREANFT
.::::::::::.. :::::::.:::::::.:::::::::: ::.::::::::::. .::
CCDS32 EELTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFT
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD VSSMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELYIH
::..:::: ::::. ::.:::::.:::::.::. :::.:: ::::.::::::.::: :::
CCDS32 VSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIH
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KSD RIGRSGRYGRKGVAINFVKNDDIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
::::.::.:::::::::: ..: ::::::: .:.: ..::::::::::
CCDS32 RIGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI
360 370 380 390 400
>>CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 (406 aa)
initn: 1782 init1: 1254 opt: 1791 Z-score: 2244.0 bits: 424.1 E(32554): 1.1e-118
Smith-Waterman score: 1791; 66.7% identity (86.7% similar) in 406 aa overlap (7-411:1-406)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MATTATMATSGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEK
:..: ..:.: . : :. ... .:: :.: :.::::::::::::
CCDS11 MSASQDSRSRDNGPDGMEPEGVIESNWNEIVDSFDDMNLSESLLRGIYAYGFEK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PSAIQQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAV
::::::::: ::: :::::.::::::::::.::.:: ...... ::::.::::::::
CCDS11 PSAIQQRAILPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQIELDLKATQALVLAPTRELAQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KSD QIQKGLLALGDYMNVQCHACIGGTNVGEDIRKLDY-GQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTR
:::: ..::::::...:::::::::: ...::.. . :...:::::::::. :: : .
CCDS11 QIQKVVMALGDYMGASCHACIGGTNVRAEVQKLQMEAPHIIVGTPGRVFDMLNRRYLSPK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD AIKMLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRI
:::.:::::::::..:::.::::... : :::::.:::.: ..::.:.::: :::::
CCDS11 YIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYDIFQKLNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTKKFMRDPIRI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD LVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMRE
:::..:::::::.::.. :::::::.:::::::.:::::::::: ::.::::::::::.
CCDS11 LVKKEELTLEGIRQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFINTRRKVDWLTEKMHA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD ANFTVSSMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRE
.::::.::::: ::::. ::.:::::.:::::.::. :::.:: ::::.::::::.:::
CCDS11 RDFTVSAMHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LYIHRIGRSGRYGRKGVAINFVKNDDIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
:::::::.::.::::::::.: ..: : ::::: .:.:.:.:::.::::::
CCDS11 NYIHRIGRGGRFGRKGVAINMVTEEDKRTLRDIETFYNTSIEEMPLNVADLI
360 370 380 390 400
>>CCDS58511.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 (347 aa)
initn: 1395 init1: 867 opt: 1422 Z-score: 1783.2 bits: 338.7 E(32554): 5.3e-93
Smith-Waterman score: 1422; 64.7% identity (85.6% similar) in 334 aa overlap (7-339:1-334)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MATTATMATSGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEK
:..: ..:.: . : :. ... .:: :.: :.::::::::::::
CCDS58 MSASQDSRSRDNGPDGMEPEGVIESNWNEIVDSFDDMNLSESLLRGIYAYGFEK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PSAIQQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAV
::::::::: ::: :::::.::::::::::.::.:: ...... ::::.::::::::
CCDS58 PSAIQQRAILPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQIELDLKATQALVLAPTRELAQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KSD QIQKGLLALGDYMNVQCHACIGGTNVGEDIRKLDY-GQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTR
:::: ..::::::...:::::::::: ...::.. . :...:::::::::. :: : .
CCDS58 QIQKVVMALGDYMGASCHACIGGTNVRAEVQKLQMEAPHIIVGTPGRVFDMLNRRYLSPK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD AIKMLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRI
:::.:::::::::..:::.::::... : :::::.:::.: ..::.:.::: :::::
CCDS58 YIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYDIFQKLNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTKKFMRDPIRI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD LVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMRE
:::..:::::::.::.. :::::::.:::::::.:::::::::: ::.::::::::::.
CCDS58 LVKKEELTLEGIRQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFINTRRKVDWLTEKMHA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD ANFTVSSMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRE
.::::.::::: ::::. ::.:::::.:::::.::. ..
CCDS58 RDFTVSAMHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLGKLYPQNRSRWTVWP
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LYIHRIGRSGRYGRKGVAINFVKNDDIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
>>CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11 (483 aa)
initn: 865 init1: 372 opt: 948 Z-score: 1187.5 bits: 228.9 E(32554): 7.9e-60
Smith-Waterman score: 948; 36.8% identity (71.7% similar) in 410 aa overlap (4-407:63-464)
10 20 30
pF1KSD MATTATMATSGSARKRL-LKEEDMTKVEFETSE
:.:. . . .: : : .:. ...::
CCDS44 GGGTQTQQQMNQLKNTNTINNGTQQQAQSMTTTIKPGDDWKKTLKLPPKDL---RIKTS-
40 50 60 70 80
40 50 60 70 80
pF1KSD EVDVTPT----FDTMGLREDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGK
::: : :. . :...:: ::. .:.:::: ::...: ..:::..:....::::
CCDS44 --DVTSTKGNEFEDYCLKRELLMGIFEMGWEKPSPIQEESIPIALSGRDILARAKNGTGK
90 100 110 120 130 140
90 100 110 120 130 140
pF1KSD TATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQIQKGLLALGDYMN-VQCHACIGGTNVG
.... : .:. ::.. . ::....::::::.:... . .. .:. .. : ::::.
CCDS44 SGAYLIPLLERLDLKKDNIQAMVIVPTRELALQVSQICIQVSKHMGGAKVMATTGGTNLR
150 160 170 180 190 200
150 160 170 180 190 200
pF1KSD EDIRKLDYGQHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKMLVLDEADEMLNKGFKEQIYDVYRY
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CCDS44 DDIMRLDDTVHVVIATPGRILDLIKKGVAKVDHVQMIVLDEADKLLSQDFVQIMEDIILT
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KSD LPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDT
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CCDS44 LPKNRQILLYSATFPLSVQKFMNSHLQKPYEINLM-EELTLKGVTQYYAYVT-ERQKVHC
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310 320
pF1KSD LCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREANFTVSSMHGDMPQKERESIMKEFRSGA
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CCDS44 LNTLFSRLQINQSIIFCNSSQRVELLAKKISQLGYSCFYIHAKMRQEHRNRVFHDFRNGL
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330 340 350 360 370 380
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CCDS44 CRNLVCTDLFTRGIDIQAVNVVINFDFPKLAETYLHRIGRSGRFGHLGLAINLITYDDRF
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390 400 410
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CCDS44 NLKSIEEQLGTEIKPIPSNIDKSLYVAEYHSEPVEDEKP
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70 80 90 100 110 120
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CCDS44 LPMMLAHPPQNLIAQSQSGTGKTAAFVLAMLSRVNALELFPQCLCLAPTYELALQTGRVV
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130 140 150 160 170 180
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CCDS44 VLDEADVMIDTQGFSDHSIRIQRALPSECQMLLFSATFEDSVWHFAERIIPDPNVIKLRK
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CCDS44 EELTLNNIRQYYVLCEHRKDKYQALCNIYGSITIGQAIIFCQTRRNAKWLTVEMIQDGHQ
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310 320 330 340 350
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CCDS44 VSLLSGELTVEQRASIIQRFRDGKEKVLITTNVCARGIDVKQVTIVVNFDLPVKQGEEPD
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CCDS44 YETYLHRIGRTGRFGKKGLAFNMIEVDELPSLMKIQDHFNSSIKQ--LNAEDMDEIEKID
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CCDS44 Y
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CCDS46 ECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDPMEIFVDDETK
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CCDS46 ARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDISSYIEQTR
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310 320 330 340 350
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360 370 380 390 400 410
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CCDS10 NETYLHRIGRTGRFGKRGLAVNMVDSKHSMNILNRIQEHFNKKIERLDTDDLDEIEKIAN
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CCDS10 NKLIRSNLVDNTNQVEVLQRDPNSPLYSVKSFEELRLKPQLLQGVYAMGFNRPSKIQENA
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CCDS10 LPLMLAEPPQNLIAQSQSGTGKTAAFVLAMLSQVEPANKYPQCLCLSPTYELALQTGKVI
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CCDS10 EQMGKFYPELKLAYAVRGNKL-ERGQKIS--EQIVIGTPGTVLDWCSKLKFIDPKKIKVF
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CCDS10 VLDEADVMIATQGHQDQSIRIQRMLPRNCQMLLFSATFEDSVWKFAQKVVPDPNVIKLKR
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pF1KSD DELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREANFT
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CCDS10 EEETLDTIKQYYVLCSSRDEKFQALCNLYGAITIAQAMIFCHTRKTASWLAAELSKEGHQ
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CCDS10 VALLSGEMMVEQRAAVIERFREGKEKVLVTTNVCARGIDVEQVSVVINFDLPVDKDGNPD
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360 370 380 390 400 410
pF1KSD -ELYIHRIGRSGRYGRKGVAINFVKND-DIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
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CCDS10 NETYLHRIGRTGRFGKRGLAVNMVDSKHSMNILNRIQEHFNKKIERLDTDDLDEIEKIAN
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CCDS12 EEEPQAPQESTPAPPKKDIKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECI
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pF1KSD KQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQIQKGLLAL
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CCDS12 PQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVMCHTRELAFQISKEYERF
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CCDS12 ECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLSKDIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETK
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pF1KSD LTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREANFTVS
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CCDS12 LTLHGLQQYYVKLKDSE-KNRKLFDLLDVLEFNQVIIFVKSVQRCMALAQLLVEQNFPAI
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pF1KSD SMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELYIHRI
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CCDS12 AIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFNYDMPEDSDTYLHRV
320 330 340 350 360 370
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CCDS12 ARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDISTYIEQSR
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411 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 00:01:54 2016 done: Thu Nov 3 00:01:54 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]