Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0096
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0096, 765 aa
1>>>pF1KSDA0096 765 - 765 aa - 765 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3284+/-0.000506; mu= 3.6622+/- 0.031
mean_var=420.7497+/-91.485, 0's: 0 Z-trim(120.0): 1986 B-trim: 761 in 1/52
Lambda= 0.062526
statistics sampled from 32141 (34676) to 32141 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.723), E-opt: 0.2 (0.407), width: 16
Scan time: 10.480
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_060189 (OMIM: 612760) SNF-related serine/threon ( 765) 5084 474.0 1e-132
XP_005265302 (OMIM: 612760) PREDICTED: SNF-related ( 765) 5084 474.0 1e-132
NP_001094064 (OMIM: 612760) SNF-related serine/thr ( 765) 5084 474.0 1e-132
NP_001317679 (OMIM: 612760) SNF-related serine/thr ( 559) 3717 350.5 1.1e-95
NP_775490 (OMIM: 605705,616341) serine/threonine-p ( 783) 985 104.2 2.1e-21
NP_056006 (OMIM: 608973) serine/threonine-protein ( 926) 937 100.0 4.7e-20
XP_011543095 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 784) 923 98.6 1e-19
XP_011541028 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre ( 660) 921 98.4 1.1e-19
XP_016872799 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 763) 917 98.1 1.5e-19
XP_005271541 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1261) 921 98.8 1.5e-19
XP_011541024 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1309) 921 98.8 1.6e-19
NP_079440 (OMIM: 614776) serine/threonine-protein (1321) 921 98.8 1.6e-19
XP_005271538 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1369) 921 98.8 1.6e-19
XP_011541023 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1369) 921 98.8 1.6e-19
NP_001034558 (OMIM: 600526) serine/threonine-prote ( 788) 915 97.9 1.7e-19
XP_011543094 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 793) 915 97.9 1.7e-19
XP_011543092 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 799) 915 97.9 1.7e-19
XP_011543091 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 808) 915 97.9 1.7e-19
NP_059672 (OMIM: 600526) serine/threonine-protein ( 745) 909 97.4 2.4e-19
XP_011543096 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 753) 909 97.4 2.4e-19
XP_011543093 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 798) 909 97.4 2.5e-19
NP_001273055 (OMIM: 606511) serine/threonine-prote ( 780) 906 97.1 3e-19
XP_005273191 (OMIM: 606511) PREDICTED: serine/thre ( 781) 906 97.1 3e-19
XP_011507863 (OMIM: 606511) PREDICTED: serine/thre ( 788) 906 97.1 3e-19
NP_061120 (OMIM: 606511) serine/threonine-protein ( 795) 906 97.1 3e-19
NP_001273053 (OMIM: 606511) serine/threonine-prote ( 796) 906 97.1 3e-19
NP_113605 (OMIM: 606495) MAP/microtubule affinity- ( 688) 904 96.9 3.1e-19
NP_001186796 (OMIM: 606495) MAP/microtubule affini ( 752) 904 96.9 3.3e-19
XP_016872800 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 738) 902 96.7 3.7e-19
NP_001156768 (OMIM: 600526) serine/threonine-prote ( 719) 900 96.5 4.1e-19
XP_011543099 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 739) 900 96.5 4.2e-19
XP_011543097 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 745) 899 96.5 4.5e-19
XP_016876782 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 708) 897 96.2 4.9e-19
NP_001156769 (OMIM: 600526) serine/threonine-prote ( 709) 897 96.2 4.9e-19
XP_016876781 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 722) 897 96.3 5e-19
NP_004945 (OMIM: 600526) serine/threonine-protein ( 724) 897 96.3 5e-19
XP_011543100 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 729) 897 96.3 5e-19
XP_011543098 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 744) 897 96.3 5.1e-19
NP_001122392 (OMIM: 602678) MAP/microtubule affini ( 713) 895 96.1 5.6e-19
XP_016876780 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 728) 895 96.1 5.7e-19
XP_005267699 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 737) 895 96.1 5.7e-19
NP_002367 (OMIM: 602678) MAP/microtubule affinity- ( 729) 893 95.9 6.4e-19
XP_005267700 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 643) 888 95.4 8.2e-19
XP_005267698 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 738) 889 95.5 8.3e-19
XP_006720209 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 739) 889 95.5 8.3e-19
NP_001122391 (OMIM: 602678) MAP/microtubule affini ( 744) 889 95.5 8.4e-19
NP_001122390 (OMIM: 602678) MAP/microtubule affini ( 753) 889 95.6 8.4e-19
XP_011527776 (OMIM: 605705,616341) PREDICTED: seri ( 734) 866 93.5 3.5e-18
XP_016872913 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1213) 847 92.1 1.5e-17
NP_001268678 (OMIM: 614776) serine/threonine-prote (1261) 847 92.1 1.6e-17
>>NP_060189 (OMIM: 612760) SNF-related serine/threonine- (765 aa)
initn: 5084 init1: 5084 opt: 5084 Z-score: 2503.6 bits: 474.0 E(85289): 1e-132
Smith-Waterman score: 5084; 100.0% identity (100.0% similar) in 765 aa overlap (1-765:1-765)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAGFKRGYDGKIAGLYDLDKTLGRGHFAVVKLARHVFTGEKVAVKVIDKTKLDTLATGHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 MAGFKRGYDGKIAGLYDLDKTLGRGHFAVVKLARHVFTGEKVAVKVIDKTKLDTLATGHL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD FQEVRCMKLVQHPNIVRLYEVIDTQTKLYLILELGDGGDMFDYIMKHEEGLNEDLAKKYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 FQEVRCMKLVQHPNIVRLYEVIDTQTKLYLILELGDGGDMFDYIMKHEEGLNEDLAKKYF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD AQIVHAISYCHKLHVVHRDLKPENVVFFEKQGLVKLTDFGFSNKFQPGKKLTTSCGSLAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 AQIVHAISYCHKLHVVHRDLKPENVVFFEKQGLVKLTDFGFSNKFQPGKKLTTSCGSLAY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SAPEILLGDEYDAPAVDIWSLGVILFMLVCGQPPFQEANDSETLTMIMDCKYTVPSHVSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 SAPEILLGDEYDAPAVDIWSLGVILFMLVCGQPPFQEANDSETLTMIMDCKYTVPSHVSK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD ECKDLITRMLQRDPKRRASLEEIENHPWLQGVDPSPATKYNIPLVSYKNLSEEEHNSIIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 ECKDLITRMLQRDPKRRASLEEIENHPWLQGVDPSPATKYNIPLVSYKNLSEEEHNSIIQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD RMVLGDIADRDAIVEALETNRYNHITATYFLLAERILREKQEKEIQTRSASPSNIKAQFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 RMVLGDIADRDAIVEALETNRYNHITATYFLLAERILREKQEKEIQTRSASPSNIKAQFR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD QSWPTKIDVPQDLEDDLTATPLSHATVPQSPARAADSVLNGHRSKGLCDSAKKDDLPELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 QSWPTKIDVPQDLEDDLTATPLSHATVPQSPARAADSVLNGHRSKGLCDSAKKDDLPELA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GPALSTVPPASLKPTASGRKCLFRVEEDEEEDEEDKKPMSLSTQVVLRRKPSVTNRLTSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 GPALSTVPPASLKPTASGRKCLFRVEEDEEEDEEDKKPMSLSTQVVLRRKPSVTNRLTSR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KSAPVLNQIFEEGESDDEFDMDENLPPKLSRLKMNIASPGTVHKRYHRRKSQGRGSSCSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 KSAPVLNQIFEEGESDDEFDMDENLPPKLSRLKMNIASPGTVHKRYHRRKSQGRGSSCSS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD SETSDDDSESRRRLDKDSGFTYSWHRRDSSEGPPGSEGDGGGQSKPSNASGGVDKASPSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 SETSDDDSESRRRLDKDSGFTYSWHRRDSSEGPPGSEGDGGGQSKPSNASGGVDKASPSE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD NNAGGGSPSSGSGGNPTNTSGTTRRCAGPSNSMQLASRSAGELVESLKLMSLCLGSQLHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 NNAGGGSPSSGSGGNPTNTSGTTRRCAGPSNSMQLASRSAGELVESLKLMSLCLGSQLHG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD STKYIIDPQNGLSFSSVKVQEKSTWKMCISSTGNAGQVPAVGGIKFFSDHMADTTTELER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 STKYIIDPQNGLSFSSVKVQEKSTWKMCISSTGNAGQVPAVGGIKFFSDHMADTTTELER
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KSD IKSKNLKNNVLQLPLCEKTISVNIQRNPKEGLLCASSPASCCHVI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 IKSKNLKNNVLQLPLCEKTISVNIQRNPKEGLLCASSPASCCHVI
730 740 750 760
>>XP_005265302 (OMIM: 612760) PREDICTED: SNF-related ser (765 aa)
initn: 5084 init1: 5084 opt: 5084 Z-score: 2503.6 bits: 474.0 E(85289): 1e-132
Smith-Waterman score: 5084; 100.0% identity (100.0% similar) in 765 aa overlap (1-765:1-765)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAGFKRGYDGKIAGLYDLDKTLGRGHFAVVKLARHVFTGEKVAVKVIDKTKLDTLATGHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MAGFKRGYDGKIAGLYDLDKTLGRGHFAVVKLARHVFTGEKVAVKVIDKTKLDTLATGHL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD FQEVRCMKLVQHPNIVRLYEVIDTQTKLYLILELGDGGDMFDYIMKHEEGLNEDLAKKYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FQEVRCMKLVQHPNIVRLYEVIDTQTKLYLILELGDGGDMFDYIMKHEEGLNEDLAKKYF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD AQIVHAISYCHKLHVVHRDLKPENVVFFEKQGLVKLTDFGFSNKFQPGKKLTTSCGSLAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AQIVHAISYCHKLHVVHRDLKPENVVFFEKQGLVKLTDFGFSNKFQPGKKLTTSCGSLAY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SAPEILLGDEYDAPAVDIWSLGVILFMLVCGQPPFQEANDSETLTMIMDCKYTVPSHVSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SAPEILLGDEYDAPAVDIWSLGVILFMLVCGQPPFQEANDSETLTMIMDCKYTVPSHVSK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD ECKDLITRMLQRDPKRRASLEEIENHPWLQGVDPSPATKYNIPLVSYKNLSEEEHNSIIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ECKDLITRMLQRDPKRRASLEEIENHPWLQGVDPSPATKYNIPLVSYKNLSEEEHNSIIQ
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310 320 330 340 350 360
pF1KSD RMVLGDIADRDAIVEALETNRYNHITATYFLLAERILREKQEKEIQTRSASPSNIKAQFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RMVLGDIADRDAIVEALETNRYNHITATYFLLAERILREKQEKEIQTRSASPSNIKAQFR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD QSWPTKIDVPQDLEDDLTATPLSHATVPQSPARAADSVLNGHRSKGLCDSAKKDDLPELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QSWPTKIDVPQDLEDDLTATPLSHATVPQSPARAADSVLNGHRSKGLCDSAKKDDLPELA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GPALSTVPPASLKPTASGRKCLFRVEEDEEEDEEDKKPMSLSTQVVLRRKPSVTNRLTSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GPALSTVPPASLKPTASGRKCLFRVEEDEEEDEEDKKPMSLSTQVVLRRKPSVTNRLTSR
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490 500 510 520 530 540
pF1KSD KSAPVLNQIFEEGESDDEFDMDENLPPKLSRLKMNIASPGTVHKRYHRRKSQGRGSSCSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KSAPVLNQIFEEGESDDEFDMDENLPPKLSRLKMNIASPGTVHKRYHRRKSQGRGSSCSS
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550 560 570 580 590 600
pF1KSD SETSDDDSESRRRLDKDSGFTYSWHRRDSSEGPPGSEGDGGGQSKPSNASGGVDKASPSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SETSDDDSESRRRLDKDSGFTYSWHRRDSSEGPPGSEGDGGGQSKPSNASGGVDKASPSE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD NNAGGGSPSSGSGGNPTNTSGTTRRCAGPSNSMQLASRSAGELVESLKLMSLCLGSQLHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NNAGGGSPSSGSGGNPTNTSGTTRRCAGPSNSMQLASRSAGELVESLKLMSLCLGSQLHG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD STKYIIDPQNGLSFSSVKVQEKSTWKMCISSTGNAGQVPAVGGIKFFSDHMADTTTELER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 STKYIIDPQNGLSFSSVKVQEKSTWKMCISSTGNAGQVPAVGGIKFFSDHMADTTTELER
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KSD IKSKNLKNNVLQLPLCEKTISVNIQRNPKEGLLCASSPASCCHVI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IKSKNLKNNVLQLPLCEKTISVNIQRNPKEGLLCASSPASCCHVI
730 740 750 760
>>NP_001094064 (OMIM: 612760) SNF-related serine/threoni (765 aa)
initn: 5084 init1: 5084 opt: 5084 Z-score: 2503.6 bits: 474.0 E(85289): 1e-132
Smith-Waterman score: 5084; 100.0% identity (100.0% similar) in 765 aa overlap (1-765:1-765)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAGFKRGYDGKIAGLYDLDKTLGRGHFAVVKLARHVFTGEKVAVKVIDKTKLDTLATGHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAGFKRGYDGKIAGLYDLDKTLGRGHFAVVKLARHVFTGEKVAVKVIDKTKLDTLATGHL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD FQEVRCMKLVQHPNIVRLYEVIDTQTKLYLILELGDGGDMFDYIMKHEEGLNEDLAKKYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FQEVRCMKLVQHPNIVRLYEVIDTQTKLYLILELGDGGDMFDYIMKHEEGLNEDLAKKYF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD AQIVHAISYCHKLHVVHRDLKPENVVFFEKQGLVKLTDFGFSNKFQPGKKLTTSCGSLAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AQIVHAISYCHKLHVVHRDLKPENVVFFEKQGLVKLTDFGFSNKFQPGKKLTTSCGSLAY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SAPEILLGDEYDAPAVDIWSLGVILFMLVCGQPPFQEANDSETLTMIMDCKYTVPSHVSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SAPEILLGDEYDAPAVDIWSLGVILFMLVCGQPPFQEANDSETLTMIMDCKYTVPSHVSK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD ECKDLITRMLQRDPKRRASLEEIENHPWLQGVDPSPATKYNIPLVSYKNLSEEEHNSIIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ECKDLITRMLQRDPKRRASLEEIENHPWLQGVDPSPATKYNIPLVSYKNLSEEEHNSIIQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD RMVLGDIADRDAIVEALETNRYNHITATYFLLAERILREKQEKEIQTRSASPSNIKAQFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RMVLGDIADRDAIVEALETNRYNHITATYFLLAERILREKQEKEIQTRSASPSNIKAQFR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD QSWPTKIDVPQDLEDDLTATPLSHATVPQSPARAADSVLNGHRSKGLCDSAKKDDLPELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSWPTKIDVPQDLEDDLTATPLSHATVPQSPARAADSVLNGHRSKGLCDSAKKDDLPELA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GPALSTVPPASLKPTASGRKCLFRVEEDEEEDEEDKKPMSLSTQVVLRRKPSVTNRLTSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GPALSTVPPASLKPTASGRKCLFRVEEDEEEDEEDKKPMSLSTQVVLRRKPSVTNRLTSR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KSAPVLNQIFEEGESDDEFDMDENLPPKLSRLKMNIASPGTVHKRYHRRKSQGRGSSCSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KSAPVLNQIFEEGESDDEFDMDENLPPKLSRLKMNIASPGTVHKRYHRRKSQGRGSSCSS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD SETSDDDSESRRRLDKDSGFTYSWHRRDSSEGPPGSEGDGGGQSKPSNASGGVDKASPSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SETSDDDSESRRRLDKDSGFTYSWHRRDSSEGPPGSEGDGGGQSKPSNASGGVDKASPSE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD NNAGGGSPSSGSGGNPTNTSGTTRRCAGPSNSMQLASRSAGELVESLKLMSLCLGSQLHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NNAGGGSPSSGSGGNPTNTSGTTRRCAGPSNSMQLASRSAGELVESLKLMSLCLGSQLHG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD STKYIIDPQNGLSFSSVKVQEKSTWKMCISSTGNAGQVPAVGGIKFFSDHMADTTTELER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STKYIIDPQNGLSFSSVKVQEKSTWKMCISSTGNAGQVPAVGGIKFFSDHMADTTTELER
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KSD IKSKNLKNNVLQLPLCEKTISVNIQRNPKEGLLCASSPASCCHVI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IKSKNLKNNVLQLPLCEKTISVNIQRNPKEGLLCASSPASCCHVI
730 740 750 760
>>NP_001317679 (OMIM: 612760) SNF-related serine/threoni (559 aa)
initn: 3717 init1: 3717 opt: 3717 Z-score: 1838.6 bits: 350.5 E(85289): 1.1e-95
Smith-Waterman score: 3717; 100.0% identity (100.0% similar) in 559 aa overlap (207-765:1-559)
180 190 200 210 220 230
pF1KSD SLAYSAPEILLGDEYDAPAVDIWSLGVILFMLVCGQPPFQEANDSETLTMIMDCKYTVPS
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLVCGQPPFQEANDSETLTMIMDCKYTVPS
10 20 30
240 250 260 270 280 290
pF1KSD HVSKECKDLITRMLQRDPKRRASLEEIENHPWLQGVDPSPATKYNIPLVSYKNLSEEEHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HVSKECKDLITRMLQRDPKRRASLEEIENHPWLQGVDPSPATKYNIPLVSYKNLSEEEHN
40 50 60 70 80 90
300 310 320 330 340 350
pF1KSD SIIQRMVLGDIADRDAIVEALETNRYNHITATYFLLAERILREKQEKEIQTRSASPSNIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SIIQRMVLGDIADRDAIVEALETNRYNHITATYFLLAERILREKQEKEIQTRSASPSNIK
100 110 120 130 140 150
360 370 380 390 400 410
pF1KSD AQFRQSWPTKIDVPQDLEDDLTATPLSHATVPQSPARAADSVLNGHRSKGLCDSAKKDDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AQFRQSWPTKIDVPQDLEDDLTATPLSHATVPQSPARAADSVLNGHRSKGLCDSAKKDDL
160 170 180 190 200 210
420 430 440 450 460 470
pF1KSD PELAGPALSTVPPASLKPTASGRKCLFRVEEDEEEDEEDKKPMSLSTQVVLRRKPSVTNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PELAGPALSTVPPASLKPTASGRKCLFRVEEDEEEDEEDKKPMSLSTQVVLRRKPSVTNR
220 230 240 250 260 270
480 490 500 510 520 530
pF1KSD LTSRKSAPVLNQIFEEGESDDEFDMDENLPPKLSRLKMNIASPGTVHKRYHRRKSQGRGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTSRKSAPVLNQIFEEGESDDEFDMDENLPPKLSRLKMNIASPGTVHKRYHRRKSQGRGS
280 290 300 310 320 330
540 550 560 570 580 590
pF1KSD SCSSSETSDDDSESRRRLDKDSGFTYSWHRRDSSEGPPGSEGDGGGQSKPSNASGGVDKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SCSSSETSDDDSESRRRLDKDSGFTYSWHRRDSSEGPPGSEGDGGGQSKPSNASGGVDKA
340 350 360 370 380 390
600 610 620 630 640 650
pF1KSD SPSENNAGGGSPSSGSGGNPTNTSGTTRRCAGPSNSMQLASRSAGELVESLKLMSLCLGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPSENNAGGGSPSSGSGGNPTNTSGTTRRCAGPSNSMQLASRSAGELVESLKLMSLCLGS
400 410 420 430 440 450
660 670 680 690 700 710
pF1KSD QLHGSTKYIIDPQNGLSFSSVKVQEKSTWKMCISSTGNAGQVPAVGGIKFFSDHMADTTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QLHGSTKYIIDPQNGLSFSSVKVQEKSTWKMCISSTGNAGQVPAVGGIKFFSDHMADTTT
460 470 480 490 500 510
720 730 740 750 760
pF1KSD ELERIKSKNLKNNVLQLPLCEKTISVNIQRNPKEGLLCASSPASCCHVI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELERIKSKNLKNNVLQLPLCEKTISVNIQRNPKEGLLCASSPASCCHVI
520 530 540 550
>>NP_775490 (OMIM: 605705,616341) serine/threonine-prote (783 aa)
initn: 775 init1: 444 opt: 985 Z-score: 505.1 bits: 104.2 E(85289): 2.1e-21
Smith-Waterman score: 987; 36.1% identity (67.3% similar) in 498 aa overlap (2-486:12-489)
10 20 30 40
pF1KSD MAGFKRGYDGKI-AGLYDLDKTLGRGHFAVVKLARHVFTGEKVAVKVIDK
:: .: . . .:.::...:::.:.::::::::: : .::.:.:::
NP_775 MVIMSEFSADPAGQGQGQQKPLRVGFYDIERTLGKGNFAVVKLARHRVTKTQVAIKIIDK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KSD TKLDTLATGHLFQEVRCMKLVQHPNIVRLYEVIDTQTKLYLILELGDGGDMFDYIMKHEE
:.::. ....::. :::..::.:..::.:..:. ::.. :.. .:.::::. .. .
NP_775 TRLDSSNLEKIYREVQLMKLLNHPHIIKLYQVMETKDMLYIVTEFAKNGEMFDYLTSNGH
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KSD GLNEDLAKKYFAQIVHAISYCHKLHVVHRDLKPENVVFFEKQGLVKLTDFGFSNKFQPGK
:.:. :.: : ::. :. ::: :.:::::: ::... . . .::.::::.: .. :.
NP_775 -LSENEARKKFWQILSAVEYCHDHHIVHRDLKTENLLL-DGNMDIKLADFGFGNFYKSGE
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD KLTTSCGSLAYSAPEILLGDEYDAPAVDIWSLGVILFMLVCGQPPFQEANDSETLTMIMD
:.: ::: :.:::.. : ::..: .:::::::.:..::::. ::. : ...
NP_775 PLSTWCGSPPYAAPEVFEGKEYEGPQLDIWSLGVVLYVLVCGSLPFDGPNLPTLRQRVLE
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD CKYTVPSHVSKECKDLITRMLQRDPKRRASLEEIENHPWLQGVD--PSPATKYNIPLVSY
.. .: .:..:..:: ::: :: :: .. .:..: :... :.:: . ::
NP_775 GRFRIPFFMSQDCESLIRRMLVVDPARRITIAQIRQHRWMRAEPCLPGPACP-AFSAHSY
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD -KNLSEEEHNSIIQRMVLGDIADRDAIVEALETNRYNHITATYFLLAERILREKQEKEIQ
.::.. ..... ..:: .::. ::.:... :::..: :.:: ::. :. .. :
NP_775 TSNLGDYDEQALGIMQTLG--VDRQRTVESLQNSSYNHFAAIYYLLLERL---KEYRNAQ
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD TRSASPSNIKAQFRQSWPTKIDVPQDLEDDLTATPLSHATVPQSPARAADSVLNGHRSKG
.:. . . :.: . ..:::. :.. :. : . .: ..:::... .
NP_775 CARPGPAR-QPRPRSSDLSGLEVPQE---GLSTDPFRPALLCPQPQTLVQSVLQAEMD--
360 370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KSD LCDSAKKDDLPELAGPALST---------VPPASLKPTASGRKCLFRVEEDEEEDEEDKK
:. .. . : : :. .. : :.:: :: ... .::.: ...
NP_775 -CELQSSLQWP-LFFPVDASCSGVFRPRPVSPSSLLDTAISEEARQGPGLEEEQDTQESL
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KSD PMSLSTQVVLRRKPSVTNRLTSRKSAPVLNQIFEEGESDDEFDMDENLPPKLSRLKMNIA
: : . . .: :..:: : .:: .
NP_775 PSSTGRRHTL---AEVSTRL-SPLTAPCIVVSPSTTASPAEGTSSDSCLTFSASKSPAGL
470 480 490 500 510 520
>>NP_056006 (OMIM: 608973) serine/threonine-protein kina (926 aa)
initn: 886 init1: 357 opt: 937 Z-score: 481.0 bits: 100.0 E(85289): 4.7e-20
Smith-Waterman score: 951; 34.4% identity (64.9% similar) in 515 aa overlap (14-501:18-519)
10 20 30 40 50
pF1KSD MAGFKRGYDGKIAGLYDLDKTLGRGHFAVVKLARHVFTGEKVAVKVIDKTKLDTLA
:.::.. :::.:.::::::.:: .: .::.:.:::..::..
NP_056 MVMADGPRHLQRGPVRVGFYDIEGTLGKGNFAVVKLGRHRITKTEVAIKIIDKSQLDAVN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD TGHLFQEVRCMKLVQHPNIVRLYEVIDTQTKLYLILELGDGGDMFDYIMKHEEGLNEDLA
....::. ::...::.:..::.:..:.. :::. : . .:..:::. .: . :::. :
NP_056 LEKIYREVQIMKMLDHPHIIKLYQVMETKSMLYLVTEYAKNGEIFDYLANHGR-LNESEA
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD KKYFAQIVHAISYCHKLHVVHRDLKPENVVFFEKQGLVKLTDFGFSNKFQPGKKLTTSCG
.. : ::. :..::: ..:::::: ::... ... .:..::::.: :. :. :.: ::
NP_056 RRKFWQILSAVDYCHGRKIVHRDLKAENLLL-DNNMNIKIADFGFGNFFKSGELLATWCG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD SLAYSAPEILLGDEYDAPAVDIWSLGVILFMLVCGQPPFQEANDSETLTM----IMDCKY
: :.:::.. :..:..: .::::.::.:..:::: :: :. :: . ... ..
NP_056 SPPYAAPEVFEGQQYEGPQLDIWSMGVVLYVLVCGALPF----DGPTLPILRQRVLEGRF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD TVPSHVSKECKDLITRMLQRDPKRRASLEEIENHPWLQGVDPSPATKYNI-PLVSYKNLS
.: .:..:. :: ::: ::..: .. .:..: :. . :. . . : . .. :
NP_056 RIPYFMSEDCEHLIRRMLVLDPSKRLTIAQIKEHKWM--LIEVPVQRPVLYPQEQENEPS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KSD EEEHNSIIQRMVLGDIADRDAIVEALETNRYNHITATYFLLAERILREKQ----EKEIQT
: : . :.. . :.. .:.:... :::..: ::::.::. ... :....
NP_056 IGEFNEQVLRLMHSLGIDQQKTIESLQNKSYNHFAAIYFLLVERLKSHRSSFPVEQRLDG
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD RSASPSNIKAQFRQSWPTKIDVPQDLEDDLTATPLSHATVPQSPARAADSV-LNGHRSKG
:. ::.: : . : . .: ... . : : .::. : : .: ....
NP_056 RQRRPSTIAEQTVAKAQT-VGLPVTMHSP-NMRLLRSALLPQASNVEAFSFPASGCQAEA
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KSD LCDSAKKDDLPELAGPALSTVPPASLK------PTASGRKCLFRVEEDEEEDEEDKK---
. : :.. : :. :::. .. :. . . . : : : :::
NP_056 AFMEEECVDTPKVNGCLLDPVPPVLVRKGCQSLPSNMMETSIDEGLETEGEAEEDPAHAF
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500
pF1KSD PMSLSTQVVLRRKP--SVTNRLTSRKSAPVLNQIFEEGES------DDEFDMDENLPPKL
::. ::. :::.:. : ..:: ..: :.:.::
NP_056 EAFQSTRSGQRRHTLSEVTNQLV---VMPGAGKIFSMNDSPSLDSVDSEYDMGSVQRDLN
480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KSD SRLKMNIASPGTVHKRYHRRKSQGRGSSCSSSETSDDDSESRRRLDKDSGFTYSWHRRDS
NP_056 FLEDNPSLKDIMLANQPSPRMTSPFISLRPTNPAMQALSSQKREVHNRSPVSFREGRRAS
530 540 550 560 570 580
>>XP_011543095 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/threonin (784 aa)
initn: 915 init1: 375 opt: 923 Z-score: 474.9 bits: 98.6 E(85289): 1e-19
Smith-Waterman score: 960; 34.0% identity (60.2% similar) in 608 aa overlap (14-620:71-606)
10 20 30 40
pF1KSD MAGFKRGYDGKIAGLYDLDKTLGRGHFAVVKLARHVFTGEKVA
: : : ::.:.:.:: ::::::..::..::
XP_011 LGHLDSKPSSKSNMIRGRNSATSADEQPHIGNYRLLKTIGKGNFAKVKLARHILTGKEVA
50 60 70 80 90 100
50 60 70 80 90 100
pF1KSD VKVIDKTKLDTLATGHLFQEVRCMKLVQHPNIVRLYEVIDTQTKLYLILELGDGGDMFDY
::.::::.:.. . .::.::: ::...:::::.:.:::.:. :::..: ..::..:::
XP_011 VKIIDKTQLNSSSLQKLFREVRIMKVLNHPNIVKLFEVIETEKTLYLVMEYASGGEVFDY
110 120 130 140 150 160
110 120 130 140 150 160
pF1KSD IMKHEEGLNEDLAKKYFAQIVHAISYCHKLHVVHRDLKPENVVFFEKQGLVKLTDFGFSN
.. : . ..: :. : ::: :..:::. .:::::: ::... . . .:..::::::
XP_011 LVAHGR-MKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKFIVHRDLKAENLLL-DADMNIKIADFGFSN
170 180 190 200 210
170 180 190 200 210 220
pF1KSD KFQPGKKLTTSCGSLAYSAPEILLGDEYDAPAVDIWSLGVILFMLVCGQPPFQEANDSET
.: :.:: : ::: :.:::.. : .::.: ::.:::::::. :: :. ::. : .:
XP_011 EFTFGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKEL
220 230 240 250 260 270
230 240 250 260 270 280
pF1KSD LTMIMDCKYTVPSHVSKECKDLITRMLQRDPKRRASLEEIENHPWLQ-GVDPSPATKYNI
.. :: .: ..: .:..:. ..: .:..:..::.: . :.. : . . :
XP_011 RERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKFLILNPSKRGTLEQIMKDRWMNVGHEDDELKPYVE
280 290 300 310 320 330
290 300 310 320 330 340
pF1KSD PLVSYKNLSEEEHNSIIQRMVLGDIADRDAIVEALETNRYNHITATYFLLAERILREKQE
:: .::. . : .... :. : ..: .:::.. :::.::. . ..:
XP_011 PLPDYKDPRRTE-------LMVSMGYTREEIQDSLVGQRYNEVMATYLLLGYK----SSE
340 350 360 370 380
350 360 370 380 390 400
pF1KSD KEIQTRSASPSNIKAQFRQSWPTKIDVPQDLEDDLTATPLSHATVPQSPARAADSVLNGH
: .: . .: :. ::: ....:. .. :: .
XP_011 LEGDTITLKPR----------PSA---------DLT-----NSSAPSPSHKVQRSVSANP
390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KSD RSKGLCDSAKKDDLPELAGPALSTVPPASLKPTASGRKCLFRVEEDEEEDEEDKKPMSLS
... . :.: ::::. : : : ... . .. :::.:. . : .
XP_011 KQRRFSDQA--------AGPAIPTSNSYSKKTQSNNAE-----NKRPEEDRESGRKASST
430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD TQVVLRRKPSVTNRLTSRKSAPVLNQIFEEGESDDEFDMDENLPPKLSRLKMNIASPGTV
..: :.. . :. .: :... . . ..: : : : :: : .
XP_011 AKVPASPLPGLERKKTT--PTPSTNSVLSTST-----NRSRN-SPLLER-----ASLGQA
480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KSD HKRYHRRKSQGRGSSCSSSETSDDDSESRRRLDKDSGFTYSWHRRDSSEGPPGSEGDGGG
. . . :: :.. .: : .: : . : .. : : .: :: .:..
XP_011 SIQNGKDSLTMPGSRASTASASAAVSAARPRQHQKS-MSASVHPNKASGLPP-TESNCE-
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KSD QSKPSNASGGVDKASPSENNAGGGSPSSGSGGNPTNTSGTTRRCAGPSNSMQLASRSAGE
.::.: : :::: .: :.::: : :.
XP_011 VPRPSTAPQRVPVASPSAHNI------SSSGGAPDRTNFPRGVSSRSTFHAGQLRQVRDQ
580 590 600 610 620
650 660 670 680 690 700
pF1KSD LVESLKLMSLCLGSQLHGSTKYIIDPQNGLSFSSVKVQEKSTWKMCISSTGNAGQVPAVG
XP_011 QNLPYGVTPASPSGHSQGRRGASGSIFSKFTSKFVRRPHVVGSGGNDKEKEEFREAKPRS
630 640 650 660 670 680
>>XP_011541028 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/threonin (660 aa)
initn: 740 init1: 417 opt: 921 Z-score: 474.7 bits: 98.4 E(85289): 1.1e-19
Smith-Waterman score: 921; 38.0% identity (69.5% similar) in 397 aa overlap (14-406:64-451)
10 20 30 40
pF1KSD MAGFKRGYDGKIAGLYDLDKTLGRGHFAVVKLARHVFTGEKVA
: :..:.:.:.:.::::: : :. : :::
XP_011 SPAAPAAVSPAAGQPRPPAPASRGPMPARIGYYEIDRTIGKGNFAVVKRATHLVTKAKVA
40 50 60 70 80 90
50 60 70 80 90 100
pF1KSD VKVIDKTKLDTLATGHLFQEVRCMKLVQHPNIVRLYEVIDTQTKLYLILELGDGGDMFDY
.:.::::.:: ..:.::. ::.. ::.:.:::.:..:. .::. : ..::..::.
XP_011 IKIIDKTQLDEENLKKIFREVQIMKMLCHPHIIRLYQVMETERMIYLVTEYASGGEIFDH
100 110 120 130 140 150
110 120 130 140 150 160
pF1KSD IMKHEEGLNEDLAKKYFAQIVHAISYCHKLHVVHRDLKPENVVFFEKQGLVKLTDFGFSN
.. : . . : :.. : ::: :. .:: ..:::::: ::... . . .:..::::::
XP_011 LVAHGR-MAEKEARRKFKQIVTAVYFCHCRNIVHRDLKAENLLL-DANLNIKIADFGFSN
160 170 180 190 200 210
170 180 190 200 210 220
pF1KSD KFQPGKKLTTSCGSLAYSAPEILLGDEYDAPAVDIWSLGVILFMLVCGQPPFQEANDSET
: ::. : : ::: :.:::.. : :::.: ::::::::.:..:::: ::. .. ..
XP_011 LFTPGQLLKTWCGSPPYAAPELFEGKEYDGPKVDIWSLGVVLYVLVCGALPFDGSTLQNL
220 230 240 250 260 270
230 240 250 260 270 280
pF1KSD LTMIMDCKYTVPSHVSKECKDLITRMLQRDPKRRASLEEIENHPWLQGVDPSPATKYNIP
. ... :. .: .: ::. :: .:: ::..: :.:.: .: :.. : .: ...
XP_011 RARVLSGKFRIPFFMSTECEHLIRHMLVLDPNKRLSMEQICKHKWMKLGDADP--NFDRL
280 290 300 310 320
290 300 310 320 330
pF1KSD LVSYKNLSEEEHNSIIQRMVL---GDIA-DRDAIVEALETNRYNHITATYFLLAERILRE
.. ..:.::.. . ... :: :.. :.. ...:... :.: .: : :: . :.
XP_011 IAECQQLKEERQVDPLNEDVLLAMEDMGLDKEQTLQSLRSDAYDHYSAIYSLLCD---RH
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KSD KQEKEIQTRSASPSNIKAQFRQSWPTKIDVPQDLEDDLTATPLSHATVPQSPARAADSVL
:..: .. .: :: .: :. :..:.. : ..: . :.. :..:
XP_011 KRHKTLRL-GALPSMPRALAFQA-PVNIQAEQAGTAMNISVPQVQLINPENQIVEPDGTL
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KSD NGHRSKGLCDSAKKDDLPELAGPALSTVPPASLKPTASGRKCLFRVEEDEEEDEEDKKPM
: ..:
XP_011 NLDSDEGEEPSPEALVRYLSMRRHTVGVADPRTEVMEDLQKLLPGFPGVNPQAPFLQVAP
450 460 470 480 490 500
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>>XP_005271541 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/threonin (1261 aa)
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60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]