Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0093
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0093, 900 aa
1>>>pF1KSDA0093 900 - 900 aa - 900 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8296+/-0.00106; mu= 8.5883+/- 0.063
mean_var=155.7256+/-31.586, 0's: 0 Z-trim(108.5): 141 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.102777
statistics sampled from 10090 (10244) to 10090 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.664), E-opt: 0.2 (0.315), width: 16
Scan time: 3.490
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45265.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 ( 900) 6131 922.0 0
CCDS61644.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 (1319) 5502 828.9 0
CCDS10156.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 (1247) 5026 758.3 2e-218
CCDS61643.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 (1303) 4906 740.5 4.7e-213
CCDS58632.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 911) 2951 450.5 6.4e-126
CCDS45875.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 854) 2830 432.6 1.5e-120
CCDS45874.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 967) 2830 432.6 1.7e-120
CCDS45872.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 975) 2830 432.6 1.7e-120
CCDS45876.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 834) 2827 432.1 2e-120
CCDS59323.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 947) 2827 432.1 2.3e-120
CCDS45873.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 955) 2827 432.1 2.3e-120
CCDS58769.1 ITCH gene_id:83737|Hs108|chr20 ( 752) 1678 261.7 3.6e-69
CCDS13234.1 ITCH gene_id:83737|Hs108|chr20 ( 862) 1678 261.8 4e-69
CCDS58768.1 ITCH gene_id:83737|Hs108|chr20 ( 903) 1678 261.8 4.2e-69
CCDS58477.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16 ( 431) 1501 235.3 1.8e-61
CCDS58476.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16 ( 754) 1501 235.5 2.9e-61
CCDS10885.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16 ( 870) 1501 235.5 3.2e-61
CCDS6242.1 WWP1 gene_id:11059|Hs108|chr8 ( 922) 1483 232.9 2.2e-60
CCDS32707.1 SMURF2 gene_id:64750|Hs108|chr17 ( 748) 1395 219.7 1.5e-56
CCDS77499.1 HECW2 gene_id:57520|Hs108|chr2 (1216) 1363 215.1 6.1e-55
CCDS33354.1 HECW2 gene_id:57520|Hs108|chr2 (1572) 1363 215.2 7.5e-55
CCDS69286.1 HECW1 gene_id:23072|Hs108|chr7 (1572) 1350 213.3 2.9e-54
CCDS5469.2 HECW1 gene_id:23072|Hs108|chr7 (1606) 1350 213.3 2.9e-54
CCDS34689.1 SMURF1 gene_id:57154|Hs108|chr7 ( 731) 1340 211.6 4.3e-54
CCDS34690.1 SMURF1 gene_id:57154|Hs108|chr7 ( 757) 1340 211.6 4.5e-54
CCDS35301.1 HUWE1 gene_id:10075|Hs108|chrX (4374) 1159 185.3 2.2e-45
CCDS5050.1 HACE1 gene_id:57531|Hs108|chr6 ( 909) 963 155.7 3.5e-37
CCDS32177.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15 ( 852) 693 115.7 3.7e-25
CCDS45191.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15 ( 872) 693 115.7 3.8e-25
CCDS45192.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15 ( 875) 693 115.7 3.8e-25
CCDS34789.1 UBE3C gene_id:9690|Hs108|chr7 (1083) 641 108.1 9.4e-23
CCDS34028.1 HERC3 gene_id:8916|Hs108|chr4 (1050) 620 104.9 8e-22
CCDS7274.1 HERC4 gene_id:26091|Hs108|chr10 (1049) 592 100.8 1.4e-20
CCDS41533.1 HERC4 gene_id:26091|Hs108|chr10 (1057) 592 100.8 1.4e-20
CCDS41971.1 AREL1 gene_id:9870|Hs108|chr14 ( 823) 586 99.8 2.2e-20
CCDS3630.1 HERC5 gene_id:51191|Hs108|chr4 (1024) 578 98.7 5.8e-20
CCDS9129.1 UBE3B gene_id:89910|Hs108|chr12 (1068) 543 93.5 2.2e-18
CCDS45277.1 HERC1 gene_id:8925|Hs108|chr15 (4861) 529 91.9 3.1e-17
CCDS54777.1 HERC6 gene_id:55008|Hs108|chr4 ( 986) 499 87.0 1.9e-16
CCDS47098.1 HERC6 gene_id:55008|Hs108|chr4 (1022) 499 87.0 2e-16
CCDS7414.1 HECTD2 gene_id:143279|Hs108|chr10 ( 776) 455 80.4 1.4e-14
CCDS60591.1 HECTD2 gene_id:143279|Hs108|chr10 ( 780) 455 80.4 1.4e-14
CCDS10021.1 HERC2 gene_id:8924|Hs108|chr15 (4834) 428 76.9 1e-12
>>CCDS45265.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 (900 aa)
initn: 6131 init1: 6131 opt: 6131 Z-score: 4922.5 bits: 922.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6131; 99.8% identity (100.0% similar) in 900 aa overlap (1-900:1-900)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MATCAVEVFGLLEDEENSRIVRVRVIAGIGLAKKDILGASDPYVRVTLYDPMNGVLTSVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MATCAVEVFGLLEDEENSRIVRVRVIAGIGLAKKDILGASDPYVRVTLYDPMNGVLTSVQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TKTIKKSLNPKWNEEILFRVHPQQHRLLFEVFDENRLTRDDFLGQVDVPLYPLPTENPRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TKTIKKSLNPKWNEEILFRVHPQQHRLLFEVFDENRLTRDDFLGQVDVPLYPLPTENPRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ERPYTFKDFVLHPRSHKSRVKGYLRLKMTYLPKTSGSEDDNAEQAEELEPGWVVLDQPDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ERPYTFKDFVLHPRSHKSRVKGYLRLKMTYLPKTSGSEDDNAEQAEELEPGWVVLDQPDA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD ACHLQQQQEPSPLPPGWEERQDILGRTYYVNHESRRTQWKRPTPQDNLTDAENGNIQLQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ACHLQQQQEPSPLPPGWEERQDILGRTYYVNHESRRTQWKRPTPQDNLTDAENGNIQLQA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QRAFTTRRQISEETESVDNQESSENWEIIREDEATMYSSQAFPSPPPSSNLDVPTHLAEE
:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS45 QRAFTTRRQISEETESVDNRESSENWEIIREDEATMYSNQAFPSPPPSSNLDVPTHLAEE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LNARLTIFGNSAVSQPASSSNHSSRRGSLQAYTFEEQPTLPVLLPTSSGLPPGWEEKQDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LNARLTIFGNSAVSQPASSSNHSSRRGSLQAYTFEEQPTLPVLLPTSSGLPPGWEEKQDE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RGRSYYVDHNSRTTTWTKPTVQATVETSQLTSSQSSAGPQSQASTSDSGQQVTQPSEIEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RGRSYYVDHNSRTTTWTKPTVQATVETSQLTSSQSSAGPQSQASTSDSGQQVTQPSEIEQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GFLPKGWEVRHAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLKIPAHLRGKTSLDTSNDLGPLPPGWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GFLPKGWEVRHAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLKIPAHLRGKTSLDTSNDLGPLPPGWE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ERTHTDGRIFYINHNIKRTQWEDPRLENVAITGPAVPYSRDYKRKYEFFRRKLKKQNDIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ERTHTDGRIFYINHNIKRTQWEDPRLENVAITGPAVPYSRDYKRKYEFFRRKLKKQNDIP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD NKFEMKLRRATVLEDSYRRIMGVKRADFLKARLWIEFDGEKGLDYGGVAREWFFLISKEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NKFEMKLRRATVLEDSYRRIMGVKRADFLKARLWIEFDGEKGLDYGGVAREWFFLISKEM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD FNPYYGLFEYSATDNYTLQINPNSGLCNEDHLSYFKFIGRVAGMAVYHGKLLDGFFIRPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FNPYYGLFEYSATDNYTLQINPNSGLCNEDHLSYFKFIGRVAGMAVYHGKLLDGFFIRPF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD YKMMLHKPITLHDMESVDSEYYNSLRWILENDPTELDLRFIIDEELFGQTHQHELKNGGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YKMMLHKPITLHDMESVDSEYYNSLRWILENDPTELDLRFIIDEELFGQTHQHELKNGGS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD EIVVTNKNKKEYIYLVIQWRFVNRIQKQMAAFKEGFFELIPQDLIKIFDENELELLMCGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EIVVTNKNKKEYIYLVIQWRFVNRIQKQMAAFKEGFFELIPQDLIKIFDENELELLMCGL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD GDVDVNDWREHTKYKNGYSANHQVIQWFWKAVLMMDSEKRIRLLQFVTGTSRVPMNGFAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GDVDVNDWREHTKYKNGYSANHQVIQWFWKAVLMMDSEKRIRLLQFVTGTSRVPMNGFAE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD LYGSNGPQSFTVEQWGTPEKLPRAHTCFNRLDLPPYESFEELWDKLQMAIENTQGFDGVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LYGSNGPQSFTVEQWGTPEKLPRAHTCFNRLDLPPYESFEELWDKLQMAIENTQGFDGVD
850 860 870 880 890 900
>>CCDS61644.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 (1319 aa)
initn: 5502 init1: 5502 opt: 5502 Z-score: 4416.1 bits: 828.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5502; 99.8% identity (100.0% similar) in 803 aa overlap (98-900:517-1319)
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LNPKWNEEILFRVHPQQHRLLFEVFDENRLTRDDFLGQVDVPLYPLPTENPRLERPYTFK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 KFASGNEGKVDNLSRDSNRDCTNELSNSCKTRDDFLGQVDVPLYPLPTENPRLERPYTFK
490 500 510 520 530 540
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DFVLHPRSHKSRVKGYLRLKMTYLPKTSGSEDDNAEQAEELEPGWVVLDQPDAACHLQQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 DFVLHPRSHKSRVKGYLRLKMTYLPKTSGSEDDNAEQAEELEPGWVVLDQPDAACHLQQQ
550 560 570 580 590 600
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QEPSPLPPGWEERQDILGRTYYVNHESRRTQWKRPTPQDNLTDAENGNIQLQAQRAFTTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 QEPSPLPPGWEERQDILGRTYYVNHESRRTQWKRPTPQDNLTDAENGNIQLQAQRAFTTR
610 620 630 640 650 660
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RQISEETESVDNQESSENWEIIREDEATMYSSQAFPSPPPSSNLDVPTHLAEELNARLTI
::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 RQISEETESVDNRESSENWEIIREDEATMYSNQAFPSPPPSSNLDVPTHLAEELNARLTI
670 680 690 700 710 720
310 320 330 340 350 360
pF1KSD FGNSAVSQPASSSNHSSRRGSLQAYTFEEQPTLPVLLPTSSGLPPGWEEKQDERGRSYYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 FGNSAVSQPASSSNHSSRRGSLQAYTFEEQPTLPVLLPTSSGLPPGWEEKQDERGRSYYV
730 740 750 760 770 780
370 380 390 400 410 420
pF1KSD DHNSRTTTWTKPTVQATVETSQLTSSQSSAGPQSQASTSDSGQQVTQPSEIEQGFLPKGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 DHNSRTTTWTKPTVQATVETSQLTSSQSSAGPQSQASTSDSGQQVTQPSEIEQGFLPKGW
790 800 810 820 830 840
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EVRHAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLKIPAHLRGKTSLDTSNDLGPLPPGWEERTHTDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 EVRHAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLKIPAHLRGKTSLDTSNDLGPLPPGWEERTHTDG
850 860 870 880 890 900
490 500 510 520 530 540
pF1KSD RIFYINHNIKRTQWEDPRLENVAITGPAVPYSRDYKRKYEFFRRKLKKQNDIPNKFEMKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 RIFYINHNIKRTQWEDPRLENVAITGPAVPYSRDYKRKYEFFRRKLKKQNDIPNKFEMKL
910 920 930 940 950 960
550 560 570 580 590 600
pF1KSD RRATVLEDSYRRIMGVKRADFLKARLWIEFDGEKGLDYGGVAREWFFLISKEMFNPYYGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 RRATVLEDSYRRIMGVKRADFLKARLWIEFDGEKGLDYGGVAREWFFLISKEMFNPYYGL
970 980 990 1000 1010 1020
610 620 630 640 650 660
pF1KSD FEYSATDNYTLQINPNSGLCNEDHLSYFKFIGRVAGMAVYHGKLLDGFFIRPFYKMMLHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 FEYSATDNYTLQINPNSGLCNEDHLSYFKFIGRVAGMAVYHGKLLDGFFIRPFYKMMLHK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
670 680 690 700 710 720
pF1KSD PITLHDMESVDSEYYNSLRWILENDPTELDLRFIIDEELFGQTHQHELKNGGSEIVVTNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 PITLHDMESVDSEYYNSLRWILENDPTELDLRFIIDEELFGQTHQHELKNGGSEIVVTNK
1090 1100 1110 1120 1130 1140
730 740 750 760 770 780
pF1KSD NKKEYIYLVIQWRFVNRIQKQMAAFKEGFFELIPQDLIKIFDENELELLMCGLGDVDVND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 NKKEYIYLVIQWRFVNRIQKQMAAFKEGFFELIPQDLIKIFDENELELLMCGLGDVDVND
1150 1160 1170 1180 1190 1200
790 800 810 820 830 840
pF1KSD WREHTKYKNGYSANHQVIQWFWKAVLMMDSEKRIRLLQFVTGTSRVPMNGFAELYGSNGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 WREHTKYKNGYSANHQVIQWFWKAVLMMDSEKRIRLLQFVTGTSRVPMNGFAELYGSNGP
1210 1220 1230 1240 1250 1260
850 860 870 880 890 900
pF1KSD QSFTVEQWGTPEKLPRAHTCFNRLDLPPYESFEELWDKLQMAIENTQGFDGVD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 QSFTVEQWGTPEKLPRAHTCFNRLDLPPYESFEELWDKLQMAIENTQGFDGVD
1270 1280 1290 1300 1310
>>CCDS10156.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 (1247 aa)
initn: 5018 init1: 5018 opt: 5026 Z-score: 4035.0 bits: 758.3 E(32554): 2e-218
Smith-Waterman score: 5026; 98.1% identity (99.2% similar) in 748 aa overlap (157-900:500-1247)
130 140 150 160 170 180
pF1KSD KDFVLHPRSHKSRVKGYLRLKMTYLPKTSGSEDDNAEQAEEL----EPGWVVLDQPDAAC
:.:.: . ..:: .:::::::::::::
CCDS10 SSLKHNCSKGGPSQLLIKFASGNEGKVDNLSRDSNRDCTNELSNSCKPGWVVLDQPDAAC
470 480 490 500 510 520
190 200 210 220 230 240
pF1KSD HLQQQQEPSPLPPGWEERQDILGRTYYVNHESRRTQWKRPTPQDNLTDAENGNIQLQAQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HLQQQQEPSPLPPGWEERQDILGRTYYVNHESRRTQWKRPTPQDNLTDAENGNIQLQAQR
530 540 550 560 570 580
250 260 270 280 290 300
pF1KSD AFTTRRQISEETESVDNQESSENWEIIREDEATMYSSQAFPSPPPSSNLDVPTHLAEELN
:::::::::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS10 AFTTRRQISEETESVDNRESSENWEIIREDEATMYSNQAFPSPPPSSNLDVPTHLAEELN
590 600 610 620 630 640
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ARLTIFGNSAVSQPASSSNHSSRRGSLQAYTFEEQPTLPVLLPTSSGLPPGWEEKQDERG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ARLTIFGNSAVSQPASSSNHSSRRGSLQAYTFEEQPTLPVLLPTSSGLPPGWEEKQDERG
650 660 670 680 690 700
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RSYYVDHNSRTTTWTKPTVQATVETSQLTSSQSSAGPQSQASTSDSGQQVTQPSEIEQGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RSYYVDHNSRTTTWTKPTVQATVETSQLTSSQSSAGPQSQASTSDSGQQVTQPSEIEQGF
710 720 730 740 750 760
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LPKGWEVRHAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLKIPAHLRGKTSLDTSNDLGPLPPGWEER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LPKGWEVRHAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLKIPAHLRGKTSLDTSNDLGPLPPGWEER
770 780 790 800 810 820
490 500 510 520 530 540
pF1KSD THTDGRIFYINHNIKRTQWEDPRLENVAITGPAVPYSRDYKRKYEFFRRKLKKQNDIPNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 THTDGRIFYINHNIKRTQWEDPRLENVAITGPAVPYSRDYKRKYEFFRRKLKKQNDIPNK
830 840 850 860 870 880
550 560 570 580 590 600
pF1KSD FEMKLRRATVLEDSYRRIMGVKRADFLKARLWIEFDGEKGLDYGGVAREWFFLISKEMFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FEMKLRRATVLEDSYRRIMGVKRADFLKARLWIEFDGEKGLDYGGVAREWFFLISKEMFN
890 900 910 920 930 940
610 620 630 640 650 660
pF1KSD PYYGLFEYSATDNYTLQINPNSGLCNEDHLSYFKFIGRVAGMAVYHGKLLDGFFIRPFYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PYYGLFEYSATDNYTLQINPNSGLCNEDHLSYFKFIGRVAGMAVYHGKLLDGFFIRPFYK
950 960 970 980 990 1000
670 680 690 700 710 720
pF1KSD MMLHKPITLHDMESVDSEYYNSLRWILENDPTELDLRFIIDEELFGQTHQHELKNGGSEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MMLHKPITLHDMESVDSEYYNSLRWILENDPTELDLRFIIDEELFGQTHQHELKNGGSEI
1010 1020 1030 1040 1050 1060
730 740 750 760 770 780
pF1KSD VVTNKNKKEYIYLVIQWRFVNRIQKQMAAFKEGFFELIPQDLIKIFDENELELLMCGLGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VVTNKNKKEYIYLVIQWRFVNRIQKQMAAFKEGFFELIPQDLIKIFDENELELLMCGLGD
1070 1080 1090 1100 1110 1120
790 800 810 820 830 840
pF1KSD VDVNDWREHTKYKNGYSANHQVIQWFWKAVLMMDSEKRIRLLQFVTGTSRVPMNGFAELY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VDVNDWREHTKYKNGYSANHQVIQWFWKAVLMMDSEKRIRLLQFVTGTSRVPMNGFAELY
1130 1140 1150 1160 1170 1180
850 860 870 880 890 900
pF1KSD GSNGPQSFTVEQWGTPEKLPRAHTCFNRLDLPPYESFEELWDKLQMAIENTQGFDGVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GSNGPQSFTVEQWGTPEKLPRAHTCFNRLDLPPYESFEELWDKLQMAIENTQGFDGVD
1190 1200 1210 1220 1230 1240
>>CCDS61643.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 (1303 aa)
initn: 4906 init1: 4906 opt: 4906 Z-score: 3938.5 bits: 740.5 E(32554): 4.7e-213
Smith-Waterman score: 5334; 97.8% identity (98.0% similar) in 803 aa overlap (98-900:517-1303)
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LNPKWNEEILFRVHPQQHRLLFEVFDENRLTRDDFLGQVDVPLYPLPTENPRLERPYTFK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 KFASGNEGKVDNLSRDSNRDCTNELSNSCKTRDDFLGQVDVPLYPLPTENPRLERPYTFK
490 500 510 520 530 540
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DFVLHPRSHKSRVKGYLRLKMTYLPKTSGSEDDNAEQAEELEPGWVVLDQPDAACHLQQQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS61 DFVLHPRSHKSRVKGYLRLKMTYLPKTSGSEDDNAEQAEELE----------------QQ
550 560 570 580 590
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QEPSPLPPGWEERQDILGRTYYVNHESRRTQWKRPTPQDNLTDAENGNIQLQAQRAFTTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 QEPSPLPPGWEERQDILGRTYYVNHESRRTQWKRPTPQDNLTDAENGNIQLQAQRAFTTR
600 610 620 630 640 650
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RQISEETESVDNQESSENWEIIREDEATMYSSQAFPSPPPSSNLDVPTHLAEELNARLTI
::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 RQISEETESVDNRESSENWEIIREDEATMYSNQAFPSPPPSSNLDVPTHLAEELNARLTI
660 670 680 690 700 710
310 320 330 340 350 360
pF1KSD FGNSAVSQPASSSNHSSRRGSLQAYTFEEQPTLPVLLPTSSGLPPGWEEKQDERGRSYYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 FGNSAVSQPASSSNHSSRRGSLQAYTFEEQPTLPVLLPTSSGLPPGWEEKQDERGRSYYV
720 730 740 750 760 770
370 380 390 400 410 420
pF1KSD DHNSRTTTWTKPTVQATVETSQLTSSQSSAGPQSQASTSDSGQQVTQPSEIEQGFLPKGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 DHNSRTTTWTKPTVQATVETSQLTSSQSSAGPQSQASTSDSGQQVTQPSEIEQGFLPKGW
780 790 800 810 820 830
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EVRHAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLKIPAHLRGKTSLDTSNDLGPLPPGWEERTHTDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 EVRHAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLKIPAHLRGKTSLDTSNDLGPLPPGWEERTHTDG
840 850 860 870 880 890
490 500 510 520 530 540
pF1KSD RIFYINHNIKRTQWEDPRLENVAITGPAVPYSRDYKRKYEFFRRKLKKQNDIPNKFEMKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 RIFYINHNIKRTQWEDPRLENVAITGPAVPYSRDYKRKYEFFRRKLKKQNDIPNKFEMKL
900 910 920 930 940 950
550 560 570 580 590 600
pF1KSD RRATVLEDSYRRIMGVKRADFLKARLWIEFDGEKGLDYGGVAREWFFLISKEMFNPYYGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 RRATVLEDSYRRIMGVKRADFLKARLWIEFDGEKGLDYGGVAREWFFLISKEMFNPYYGL
960 970 980 990 1000 1010
610 620 630 640 650 660
pF1KSD FEYSATDNYTLQINPNSGLCNEDHLSYFKFIGRVAGMAVYHGKLLDGFFIRPFYKMMLHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 FEYSATDNYTLQINPNSGLCNEDHLSYFKFIGRVAGMAVYHGKLLDGFFIRPFYKMMLHK
1020 1030 1040 1050 1060 1070
670 680 690 700 710 720
pF1KSD PITLHDMESVDSEYYNSLRWILENDPTELDLRFIIDEELFGQTHQHELKNGGSEIVVTNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 PITLHDMESVDSEYYNSLRWILENDPTELDLRFIIDEELFGQTHQHELKNGGSEIVVTNK
1080 1090 1100 1110 1120 1130
730 740 750 760 770 780
pF1KSD NKKEYIYLVIQWRFVNRIQKQMAAFKEGFFELIPQDLIKIFDENELELLMCGLGDVDVND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 NKKEYIYLVIQWRFVNRIQKQMAAFKEGFFELIPQDLIKIFDENELELLMCGLGDVDVND
1140 1150 1160 1170 1180 1190
790 800 810 820 830 840
pF1KSD WREHTKYKNGYSANHQVIQWFWKAVLMMDSEKRIRLLQFVTGTSRVPMNGFAELYGSNGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 WREHTKYKNGYSANHQVIQWFWKAVLMMDSEKRIRLLQFVTGTSRVPMNGFAELYGSNGP
1200 1210 1220 1230 1240 1250
850 860 870 880 890 900
pF1KSD QSFTVEQWGTPEKLPRAHTCFNRLDLPPYESFEELWDKLQMAIENTQGFDGVD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 QSFTVEQWGTPEKLPRAHTCFNRLDLPPYESFEELWDKLQMAIENTQGFDGVD
1260 1270 1280 1290 1300
>>CCDS58632.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 (911 aa)
initn: 3705 init1: 2525 opt: 2951 Z-score: 2374.1 bits: 450.5 E(32554): 6.4e-126
Smith-Waterman score: 3967; 66.3% identity (81.7% similar) in 920 aa overlap (1-900:1-911)
10 20 30 40 50
pF1KSD MATCAVE-VFGLLEDEENSRIVRVRVIAGIGLAKKDILGASDPYVRVTLY-DPMNGVLTS
::: : :.:: ::: .:::.::.:..:: ::::::.:::::::...:: : :.
CCDS58 MATGLGEPVYGLSEDEGESRILRVKVVSGIDLAKKDIFGASDPYVKLSLYVADENRELAL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD VQTKTIKKSLNPKWNEEILFRVHPQQHRLLFEVFDENRLTRDDFLGQVDVPLYPLPTENP
::::::::.::::::::. :::.:..:::::::::::::::::::::::::: ::::.:
CCDS58 VQTKTIKKTLNPKWNEEFYFRVNPSNHRLLFEVFDENRLTRDDFLGQVDVPLSHLPTEDP
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD RLERPYTFKDFVLHPRSHKSRVKGYLRLKMTYLPKTSGSEDDNAEQAEELEPGWVVLDQP
.:::::::::.:.::::::::::.:::::.:.::..:....:..: ...: :: :.:.
CCDS58 TMERPYTFKDFLLRPRSHKSRVKGFLRLKMAYMPKNGGQDEENSDQRDDMEHGWEVVDSN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD DAACHLQQQQEPSPLPPGWEERQDILGRTYYVNHESRRTQWKRPTPQDNLTDAENGNIQL
:.: . :.. : ::::::::. : :::::::::..: :::.::. .: ....:. :.
CCDS58 DSASQHQEELPPPPLPPGWEEKVDNLGRTYYVNHNNRTTQWHRPSLMDVSSESDNNIRQI
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD Q---AQRAFTTRRQISE--ETESVDNQESSENWEIIREDEATMYSSQ--AFPSPPPS-SN
. :.: : .::.::: : : .. . : :: : :. .: :.: :: : ..
CCDS58 NQEAAHRRFRSRRHISEDLEPEPSEGGDVPEPWETISEEVNIAGDSLGLALPPPPASPGS
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KSD LDVPTHLAEELNARLTIFGNSAVSQPAS--SSNHSSR-RGSLQAYTFEEQPTLPVLLPT-
: .:.:::. :: : .: : .: . . ::: :. . . :: :: :
CCDS58 RTSPQELSEELSRRLQITPDSNGEQFSSLIQREPSSRLRSCSVTDAVAEQGHLPPLAEDG
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KSD SSGLPPGWE----EKQDERGRSYYVDHNSRTTTWTKPTVQATVETSQLTSSQSSAGPQS-
.:: . . : : .: :: .: :.: . : : . . ... ..:::
CCDS58 ASGSATNSNNHLIEPQIRRPRSL----SSPTVTLSAPLEGAKDSPVRRAVKDTLSNPQSP
370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD QASTSDSGQQVTQPS-EIEQGFLPKGWEVRHAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLKIPAHL
: : .: .:. .. :.::: :::.: ::::::::::::::::::::::::.:.:.
CCDS58 QPSPYNS----PKPQHKVTQSFLPPGWEMRIAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLKFPVHM
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD RGKTSLDTSNDLGPLPPGWEERTHTDGRIFYINHNIKRTQWEDPRLENVAITGPAVPYSR
:.::::. ::::::::::::: : ::: :::.:: : ::::::::.: :::::::::::
CCDS58 RSKTSLNP-NDLGPLPPGWEERIHLDGRTFYIDHNSKITQWEDPRLQNPAITGPAVPYSR
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KSD DYKRKYEFFRRKLKKQNDIPNKFEMKLRRATVLEDSYRRIMGVKRADFLKARLWIEFDGE
..:.::..::.:::: ::::.:::::.: ...:.::::::.::: : :::::::::..:
CCDS58 EFKQKYDYFRKKLKKPADIPNRFEMKLHRNNIFEESYRRIMSVKRPDVLKARLWIEFESE
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KSD KGLDYGGVAREWFFLISKEMFNPYYGLFEYSATDNYTLQINPNSGLCNEDHLSYFKFIGR
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
CCDS58 KGLDYGGVAREWFFLLSKEMFNPYYGLFEYSATDNYTLQINPNSGLCNEDHLSYFTFIGR
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KSD VAGMAVYHGKLLDGFFIRPFYKMMLHKPITLHDMESVDSEYYNSLRWILENDPTELDLRF
:::.::.:::::::::::::::::: : :::.:::::::::::::.:::::::::::: :
CCDS58 VAGLAVFHGKLLDGFFIRPFYKMMLGKQITLNDMESVDSEYYNSLKWILENDPTELDLMF
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KSD IIDEELFGQTHQHELKNGGSEIVVTNKNKKEYIYLVIQWRFVNRIQKQMAAFKEGFFELI
:::: ::::.: .:: .::::.:::.::.::: ::::::::::.:::: :: ::: ::.
CCDS58 CIDEENFGQTYQVDLKPNGSEIMVTNENKREYIDLVIQWRFVNRVQKQMNAFLEGFTELL
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KSD PQDLIKIFDENELELLMCGLGDVDVNDWREHTKYKNGYSANHQVIQWFWKAVLMMDSEKR
: :::::::::::::::::::::::::::.:. ::::: :: ::::::::::.::.:::
CCDS58 PIDLIKIFDENELELLMCGLGDVDVNDWRQHSIYKNGYCPNHPVIQWFWKAVLLMDAEKR
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KSD IRLLQFVTGTSRVPMNGFAELYGSNGPQSFTVEQWGTPEKLPRAHTCFNRLDLPPYESFE
:::::::::::::::::::::::::::: ::.::::.::::::::::::::::::::.::
CCDS58 IRLLQFVTGTSRVPMNGFAELYGSNGPQLFTIEQWGSPEKLPRAHTCFNRLDLPPYETFE
840 850 860 870 880 890
890 900
pF1KSD ELWDKLQMAIENTQGFDGVD
.: .:: ::.::.:::.:::
CCDS58 DLREKLLMAVENAQGFEGVD
900 910
>>CCDS45875.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 (854 aa)
initn: 3220 init1: 2525 opt: 2830 Z-score: 2277.6 bits: 432.6 E(32554): 1.5e-120
Smith-Waterman score: 3528; 63.6% identity (78.4% similar) in 855 aa overlap (120-900:1-854)
90 100 110 120 130 140
pF1KSD EVFDENRLTRDDFLGQVDVPLYPLPTENPRLERPYTFKDFVLHPRSHKSRVKGYLRLKMT
.:::::::::.:.::::::::::.:::::.
CCDS45 MERPYTFKDFLLRPRSHKSRVKGFLRLKMA
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KSD YLPKTSGSEDDNAEQAEELEPGWVVLDQPDAACHLQQQQEPSPLPPGWEERQDILGRTYY
:.::..:....:..: ...: :: :.:. :.: . :.. : ::::::::. : ::::::
CCDS45 YMPKNGGQDEENSDQRDDMEHGWEVVDSNDSASQHQEELPPPPLPPGWEEKVDNLGRTYY
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KSD VNHESRRTQWKRPTPQDNLTDAENGNIQLQ---AQRAFTTRRQISE--ETESVDNQESSE
:::..: :::.::. .: ....:. :.. :.: : .::.::: : : .. . :
CCDS45 VNHNNRTTQWHRPSLMDVSSESDNNIRQINQEAAHRRFRSRRHISEDLEPEPSEGGDVPE
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310
pF1KSD NWEIIREDEATMYSSQ--AFPSPPPS-SNLDVPTHLAEELNARLTIFGNSAVSQPAS--S
:: : :. .: :.: :: : .. : .:.:::. :: : .: : .: .
CCDS45 PWETISEEVNIAGDSLGLALPPPPASPGSRTSPQELSEELSRRLQITPDSNGEQFSSLIQ
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350
pF1KSD SNHSSR------------RGSL------------QAYTFEEQPTLPV-LLPTSSGLPPGW
. ::: .: : .. : :.:: : . :. ::: ::
CCDS45 REPSSRLRSCSVTDAVAEQGHLPPPSAPAGRARSSTVTGGEEPTPSVAYVHTTPGLPSGW
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390
pF1KSD EEKQDERGRSYYVDHNSRTTTWTKPTVQ---------ATVETSQLTSSQ-------SS--
::..: .::.:::.::.::::::.: .: :: ...: : ::
CCDS45 EERKDAKGRTYYVNHNNRTTTWTRPIMQLAEDGASGSATNSNNHLIEPQIRRPRSLSSPT
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430
pF1KSD ---AGPQSQASTSD---------SGQQVTQPS---------EIEQGFLPKGWEVRHAPNG
..: :. : :. : ::: .. :.::: :::.: ::::
CCDS45 VTLSAPLEGAKDSPVRRAVKDTLSNPQSPQPSPYNSPKPQHKVTQSFLPPGWEMRIAPNG
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KSD RPFFIDHNTKTTTWEDPRLKIPAHLRGKTSLDTSNDLGPLPPGWEERTHTDGRIFYINHN
::::::::::::::::::::.:.:.:.::::. ::::::::::::: : ::: :::.::
CCDS45 RPFFIDHNTKTTTWEDPRLKFPVHMRSKTSLNP-NDLGPLPPGWEERIHLDGRTFYIDHN
400 410 420 430 440
500 510 520 530 540 550
pF1KSD IKRTQWEDPRLENVAITGPAVPYSRDYKRKYEFFRRKLKKQNDIPNKFEMKLRRATVLED
: ::::::::.: :::::::::::..:.::..::.:::: ::::.:::::.: ...:.
CCDS45 SKITQWEDPRLQNPAITGPAVPYSREFKQKYDYFRKKLKKPADIPNRFEMKLHRNNIFEE
450 460 470 480 490 500
560 570 580 590 600 610
pF1KSD SYRRIMGVKRADFLKARLWIEFDGEKGLDYGGVAREWFFLISKEMFNPYYGLFEYSATDN
::::::.::: : :::::::::..::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS45 SYRRIMSVKRPDVLKARLWIEFESEKGLDYGGVAREWFFLLSKEMFNPYYGLFEYSATDN
510 520 530 540 550 560
620 630 640 650 660 670
pF1KSD YTLQINPNSGLCNEDHLSYFKFIGRVAGMAVYHGKLLDGFFIRPFYKMMLHKPITLHDME
:::::::::::::::::::: :::::::.::.:::::::::::::::::: : :::.:::
CCDS45 YTLQINPNSGLCNEDHLSYFTFIGRVAGLAVFHGKLLDGFFIRPFYKMMLGKQITLNDME
570 580 590 600 610 620
680 690 700 710 720 730
pF1KSD SVDSEYYNSLRWILENDPTELDLRFIIDEELFGQTHQHELKNGGSEIVVTNKNKKEYIYL
::::::::::.:::::::::::: : :::: ::::.: .:: .::::.:::.::.::: :
CCDS45 SVDSEYYNSLKWILENDPTELDLMFCIDEENFGQTYQVDLKPNGSEIMVTNENKREYIDL
630 640 650 660 670 680
740 750 760 770 780 790
pF1KSD VIQWRFVNRIQKQMAAFKEGFFELIPQDLIKIFDENELELLMCGLGDVDVNDWREHTKYK
:::::::::.:::: :: ::: ::.: :::::::::::::::::::::::::::.:. ::
CCDS45 VIQWRFVNRVQKQMNAFLEGFTELLPIDLIKIFDENELELLMCGLGDVDVNDWRQHSIYK
690 700 710 720 730 740
800 810 820 830 840 850
pF1KSD NGYSANHQVIQWFWKAVLMMDSEKRIRLLQFVTGTSRVPMNGFAELYGSNGPQSFTVEQW
::: :: ::::::::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::: ::.:::
CCDS45 NGYCPNHPVIQWFWKAVLLMDAEKRIRLLQFVTGTSRVPMNGFAELYGSNGPQLFTIEQW
750 760 770 780 790 800
860 870 880 890 900
pF1KSD GTPEKLPRAHTCFNRLDLPPYESFEELWDKLQMAIENTQGFDGVD
:.::::::::::::::::::::.::.: .:: ::.::.:::.:::
CCDS45 GSPEKLPRAHTCFNRLDLPPYETFEDLREKLLMAVENAQGFEGVD
810 820 830 840 850
>>CCDS45874.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 (967 aa)
initn: 3716 init1: 2525 opt: 2830 Z-score: 2276.8 bits: 432.6 E(32554): 1.7e-120
Smith-Waterman score: 3894; 64.4% identity (79.0% similar) in 933 aa overlap (43-900:36-967)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD EDEENSRIVRVRVIAGIGLAKKDILGASDPYVRVTLY-DPMNGVLTSVQTKTIKKSLNPK
::...:: : :. ::::::::.::::
CCDS45 FEQGESRILRVKVVSGIDLAKKDIFGASDPYVKLSLYVADENRELALVQTKTIKKTLNPK
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KSD WNEEILFRVHPQQHRLLFEVFDENRLTRDDFLGQVDVPLYPLPTENPRLERPYTFKDFVL
::::. :::.:..:::::::::::::::::::::::::: ::::.: .:::::::::.:
CCDS45 WNEEFYFRVNPSNHRLLFEVFDENRLTRDDFLGQVDVPLSHLPTEDPTMERPYTFKDFLL
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KSD HPRSHKSRVKGYLRLKMTYLPKTSGSEDDNAEQAEELEPGWVVLDQPDAACHLQQQQEPS
.::::::::::.:::::.:.::..:....:..: ...: :: :.:. :.: . :.. :
CCDS45 RPRSHKSRVKGFLRLKMAYMPKNGGQDEENSDQRDDMEHGWEVVDSNDSASQHQEELPPP
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240
pF1KSD PLPPGWEERQDILGRTYYVNHESRRTQWKRPTPQDNLTDAENGNIQLQ---AQRAFTTRR
::::::::. : :::::::::..: :::.::. .: ....:. :.. :.: : .::
CCDS45 PLPPGWEEKVDNLGRTYYVNHNNRTTQWHRPSLMDVSSESDNNIRQINQEAAHRRFRSRR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QISE--ETESVDNQESSENWEIIREDEATMYSSQ--AFPSPPPS-SNLDVPTHLAEELNA
.::: : : .. . : :: : :. .: :.: :: : .. : .:.:::.
CCDS45 HISEDLEPEPSEGGDVPEPWETISEEVNIAGDSLGLALPPPPASPGSRTSPQELSEELSR
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KSD RLTIFGNSAVSQPAS--SSNHSSR------------RGSL------------QAYTFEEQ
:: : .: : .: . . ::: .: : .. : :.
CCDS45 RLQITPDSNGEQFSSLIQREPSSRLRSCSVTDAVAEQGHLPPPSAPAGRARSSTVTGGEE
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380
pF1KSD PTLPV-LLPTSSGLPPGWEEKQDERGRSYYVDHNSRTTTWTKPTVQ---------ATVET
:: : . :. ::: ::::..: .::.:::.::.::::::.: .: :: .
CCDS45 PTPSVAYVHTTPGLPSGWEERKDAKGRTYYVNHNNRTTTWTRPIMQLAEDGASGSATNSN
370 380 390 400 410 420
390 400 410
pF1KSD SQLTSSQ-------SS-----AGPQSQASTSD---------SGQQVTQPS---------E
..: : :: ..: :. : :. : ::: .
CCDS45 NHLIEPQIRRPRSLSSPTVTLSAPLEGAKDSPVRRAVKDTLSNPQSPQPSPYNSPKPQHK
430 440 450 460 470 480
420 430 440 450 460 470
pF1KSD IEQGFLPKGWEVRHAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLKIPAHLRGKTSLDTSNDLGPLPP
. :.::: :::.: ::::::::::::::::::::::::.:.:.:.::::. ::::::::
CCDS45 VTQSFLPPGWEMRIAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLKFPVHMRSKTSLNP-NDLGPLPP
490 500 510 520 530 540
480 490 500 510 520 530
pF1KSD GWEERTHTDGRIFYINHNIKRTQWEDPRLENVAITGPAVPYSRDYKRKYEFFRRKLKKQN
::::: : ::: :::.:: : ::::::::.: :::::::::::..:.::..::.::::
CCDS45 GWEERIHLDGRTFYIDHNSKITQWEDPRLQNPAITGPAVPYSREFKQKYDYFRKKLKKPA
550 560 570 580 590 600
540 550 560 570 580 590
pF1KSD DIPNKFEMKLRRATVLEDSYRRIMGVKRADFLKARLWIEFDGEKGLDYGGVAREWFFLIS
::::.:::::.: ...:.::::::.::: : :::::::::..::::::::::::::::.:
CCDS45 DIPNRFEMKLHRNNIFEESYRRIMSVKRPDVLKARLWIEFESEKGLDYGGVAREWFFLLS
610 620 630 640 650 660
600 610 620 630 640 650
pF1KSD KEMFNPYYGLFEYSATDNYTLQINPNSGLCNEDHLSYFKFIGRVAGMAVYHGKLLDGFFI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.::.::::::::::
CCDS45 KEMFNPYYGLFEYSATDNYTLQINPNSGLCNEDHLSYFTFIGRVAGLAVFHGKLLDGFFI
670 680 690 700 710 720
660 670 680 690 700 710
pF1KSD RPFYKMMLHKPITLHDMESVDSEYYNSLRWILENDPTELDLRFIIDEELFGQTHQHELKN
:::::::: : :::.:::::::::::::.:::::::::::: : :::: ::::.: .::
CCDS45 RPFYKMMLGKQITLNDMESVDSEYYNSLKWILENDPTELDLMFCIDEENFGQTYQVDLKP
730 740 750 760 770 780
720 730 740 750 760 770
pF1KSD GGSEIVVTNKNKKEYIYLVIQWRFVNRIQKQMAAFKEGFFELIPQDLIKIFDENELELLM
.::::.:::.::.::: ::::::::::.:::: :: ::: ::.: :::::::::::::::
CCDS45 NGSEIMVTNENKREYIDLVIQWRFVNRVQKQMNAFLEGFTELLPIDLIKIFDENELELLM
790 800 810 820 830 840
780 790 800 810 820 830
pF1KSD CGLGDVDVNDWREHTKYKNGYSANHQVIQWFWKAVLMMDSEKRIRLLQFVTGTSRVPMNG
::::::::::::.:. ::::: :: ::::::::::.::.::::::::::::::::::::
CCDS45 CGLGDVDVNDWRQHSIYKNGYCPNHPVIQWFWKAVLLMDAEKRIRLLQFVTGTSRVPMNG
850 860 870 880 890 900
840 850 860 870 880 890
pF1KSD FAELYGSNGPQSFTVEQWGTPEKLPRAHTCFNRLDLPPYESFEELWDKLQMAIENTQGFD
::::::::::: ::.::::.::::::::::::::::::::.::.: .:: ::.::.:::.
CCDS45 FAELYGSNGPQLFTIEQWGSPEKLPRAHTCFNRLDLPPYETFEDLREKLLMAVENAQGFE
910 920 930 940 950 960
900
pF1KSD GVD
:::
CCDS45 GVD
>>CCDS45872.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 (975 aa)
initn: 3751 init1: 2525 opt: 2830 Z-score: 2276.8 bits: 432.6 E(32554): 1.7e-120
Smith-Waterman score: 3894; 64.4% identity (79.0% similar) in 933 aa overlap (43-900:44-975)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD EDEENSRIVRVRVIAGIGLAKKDILGASDPYVRVTLY-DPMNGVLTSVQTKTIKKSLNPK
::...:: : :. ::::::::.::::
CCDS45 EDEGESRILRVKVVSGIDLAKKDIFGASDPYVKLSLYVADENRELALVQTKTIKKTLNPK
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KSD WNEEILFRVHPQQHRLLFEVFDENRLTRDDFLGQVDVPLYPLPTENPRLERPYTFKDFVL
::::. :::.:..:::::::::::::::::::::::::: ::::.: .:::::::::.:
CCDS45 WNEEFYFRVNPSNHRLLFEVFDENRLTRDDFLGQVDVPLSHLPTEDPTMERPYTFKDFLL
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KSD HPRSHKSRVKGYLRLKMTYLPKTSGSEDDNAEQAEELEPGWVVLDQPDAACHLQQQQEPS
.::::::::::.:::::.:.::..:....:..: ...: :: :.:. :.: . :.. :
CCDS45 RPRSHKSRVKGFLRLKMAYMPKNGGQDEENSDQRDDMEHGWEVVDSNDSASQHQEELPPP
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240
pF1KSD PLPPGWEERQDILGRTYYVNHESRRTQWKRPTPQDNLTDAENGNIQLQ---AQRAFTTRR
::::::::. : :::::::::..: :::.::. .: ....:. :.. :.: : .::
CCDS45 PLPPGWEEKVDNLGRTYYVNHNNRTTQWHRPSLMDVSSESDNNIRQINQEAAHRRFRSRR
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QISE--ETESVDNQESSENWEIIREDEATMYSSQ--AFPSPPPS-SNLDVPTHLAEELNA
.::: : : .. . : :: : :. .: :.: :: : .. : .:.:::.
CCDS45 HISEDLEPEPSEGGDVPEPWETISEEVNIAGDSLGLALPPPPASPGSRTSPQELSEELSR
260 270 280 290 300 310
310 320 330
pF1KSD RLTIFGNSAVSQPAS--SSNHSSR------------RGSL------------QAYTFEEQ
:: : .: : .: . . ::: .: : .. : :.
CCDS45 RLQITPDSNGEQFSSLIQREPSSRLRSCSVTDAVAEQGHLPPPSAPAGRARSSTVTGGEE
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380
pF1KSD PTLPV-LLPTSSGLPPGWEEKQDERGRSYYVDHNSRTTTWTKPTVQ---------ATVET
:: : . :. ::: ::::..: .::.:::.::.::::::.: .: :: .
CCDS45 PTPSVAYVHTTPGLPSGWEERKDAKGRTYYVNHNNRTTTWTRPIMQLAEDGASGSATNSN
380 390 400 410 420 430
390 400 410
pF1KSD SQLTSSQ-------SS-----AGPQSQASTSD---------SGQQVTQPS---------E
..: : :: ..: :. : :. : ::: .
CCDS45 NHLIEPQIRRPRSLSSPTVTLSAPLEGAKDSPVRRAVKDTLSNPQSPQPSPYNSPKPQHK
440 450 460 470 480 490
420 430 440 450 460 470
pF1KSD IEQGFLPKGWEVRHAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLKIPAHLRGKTSLDTSNDLGPLPP
. :.::: :::.: ::::::::::::::::::::::::.:.:.:.::::. ::::::::
CCDS45 VTQSFLPPGWEMRIAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLKFPVHMRSKTSLNP-NDLGPLPP
500 510 520 530 540 550
480 490 500 510 520 530
pF1KSD GWEERTHTDGRIFYINHNIKRTQWEDPRLENVAITGPAVPYSRDYKRKYEFFRRKLKKQN
::::: : ::: :::.:: : ::::::::.: :::::::::::..:.::..::.::::
CCDS45 GWEERIHLDGRTFYIDHNSKITQWEDPRLQNPAITGPAVPYSREFKQKYDYFRKKLKKPA
560 570 580 590 600 610
540 550 560 570 580 590
pF1KSD DIPNKFEMKLRRATVLEDSYRRIMGVKRADFLKARLWIEFDGEKGLDYGGVAREWFFLIS
::::.:::::.: ...:.::::::.::: : :::::::::..::::::::::::::::.:
CCDS45 DIPNRFEMKLHRNNIFEESYRRIMSVKRPDVLKARLWIEFESEKGLDYGGVAREWFFLLS
620 630 640 650 660 670
600 610 620 630 640 650
pF1KSD KEMFNPYYGLFEYSATDNYTLQINPNSGLCNEDHLSYFKFIGRVAGMAVYHGKLLDGFFI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.::.::::::::::
CCDS45 KEMFNPYYGLFEYSATDNYTLQINPNSGLCNEDHLSYFTFIGRVAGLAVFHGKLLDGFFI
680 690 700 710 720 730
660 670 680 690 700 710
pF1KSD RPFYKMMLHKPITLHDMESVDSEYYNSLRWILENDPTELDLRFIIDEELFGQTHQHELKN
:::::::: : :::.:::::::::::::.:::::::::::: : :::: ::::.: .::
CCDS45 RPFYKMMLGKQITLNDMESVDSEYYNSLKWILENDPTELDLMFCIDEENFGQTYQVDLKP
740 750 760 770 780 790
720 730 740 750 760 770
pF1KSD GGSEIVVTNKNKKEYIYLVIQWRFVNRIQKQMAAFKEGFFELIPQDLIKIFDENELELLM
.::::.:::.::.::: ::::::::::.:::: :: ::: ::.: :::::::::::::::
CCDS45 NGSEIMVTNENKREYIDLVIQWRFVNRVQKQMNAFLEGFTELLPIDLIKIFDENELELLM
800 810 820 830 840 850
780 790 800 810 820 830
pF1KSD CGLGDVDVNDWREHTKYKNGYSANHQVIQWFWKAVLMMDSEKRIRLLQFVTGTSRVPMNG
::::::::::::.:. ::::: :: ::::::::::.::.::::::::::::::::::::
CCDS45 CGLGDVDVNDWRQHSIYKNGYCPNHPVIQWFWKAVLLMDAEKRIRLLQFVTGTSRVPMNG
860 870 880 890 900 910
840 850 860 870 880 890
pF1KSD FAELYGSNGPQSFTVEQWGTPEKLPRAHTCFNRLDLPPYESFEELWDKLQMAIENTQGFD
::::::::::: ::.::::.::::::::::::::::::::.::.: .:: ::.::.:::.
CCDS45 FAELYGSNGPQLFTIEQWGSPEKLPRAHTCFNRLDLPPYETFEDLREKLLMAVENAQGFE
920 930 940 950 960 970
900
pF1KSD GVD
:::
CCDS45 GVD
>>CCDS45876.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 (834 aa)
initn: 3219 init1: 2525 opt: 2827 Z-score: 2275.3 bits: 432.1 E(32554): 2e-120
Smith-Waterman score: 3564; 64.9% identity (80.0% similar) in 835 aa overlap (120-900:1-834)
90 100 110 120 130 140
pF1KSD EVFDENRLTRDDFLGQVDVPLYPLPTENPRLERPYTFKDFVLHPRSHKSRVKGYLRLKMT
.:::::::::.:.::::::::::.:::::.
CCDS45 MERPYTFKDFLLRPRSHKSRVKGFLRLKMA
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KSD YLPKTSGSEDDNAEQAEELEPGWVVLDQPDAACHLQQQQEPSPLPPGWEERQDILGRTYY
:.::..:....:..: ...: :: :.:. :.: . :.. : ::::::::. : ::::::
CCDS45 YMPKNGGQDEENSDQRDDMEHGWEVVDSNDSASQHQEELPPPPLPPGWEEKVDNLGRTYY
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KSD VNHESRRTQWKRPTPQDNLTDAENGNIQLQ---AQRAFTTRRQISE--ETESVDNQESSE
:::..: :::.::. .: ....:. :.. :.: : .::.::: : : .. . :
CCDS45 VNHNNRTTQWHRPSLMDVSSESDNNIRQINQEAAHRRFRSRRHISEDLEPEPSEGGDVPE
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310
pF1KSD NWEIIREDEATMYSSQ--AFPSPPPS-SNLDVPTHLAEELNARLTIFGNSAVSQPAS--S
:: : :. .: :.: :: : .. : .:.:::. :: : .: : .: .
CCDS45 PWETISEEVNIAGDSLGLALPPPPASPGSRTSPQELSEELSRRLQITPDSNGEQFSSLIQ
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KSD SNHSSR-RGSLQAYTFEEQPTLP----VLLPTSSGLPPGWEEKQDERGRSYYVDHNSRTT
. ::: :. . . :: :: . . :. ::: ::::..: .::.:::.::.:::
CCDS45 REPSSRLRSCSVTDAVAEQGHLPPPSVAYVHTTPGLPSGWEERKDAKGRTYYVNHNNRTT
220 230 240 250 260 270
380 390 400
pF1KSD TWTKPTVQ---------ATVETSQLTSSQ-------SS-----AGPQSQASTSD------
:::.: .: :: ...: : :: ..: :. :
CCDS45 TWTRPIMQLAEDGASGSATNSNNHLIEPQIRRPRSLSSPTVTLSAPLEGAKDSPVRRAVK
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450
pF1KSD ---SGQQVTQPS---------EIEQGFLPKGWEVRHAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLK
:. : ::: .. :.::: :::.: ::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DTLSNPQSPQPSPYNSPKPQHKVTQSFLPPGWEMRIAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLK
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490 500 510
pF1KSD IPAHLRGKTSLDTSNDLGPLPPGWEERTHTDGRIFYINHNIKRTQWEDPRLENVAITGPA
.:.:.:.::::. ::::::::::::: : ::: :::.:: : ::::::::.: ::::::
CCDS45 FPVHMRSKTSLNP-NDLGPLPPGWEERIHLDGRTFYIDHNSKITQWEDPRLQNPAITGPA
400 410 420 430 440
520 530 540 550 560 570
pF1KSD VPYSRDYKRKYEFFRRKLKKQNDIPNKFEMKLRRATVLEDSYRRIMGVKRADFLKARLWI
:::::..:.::..::.:::: ::::.:::::.: ...:.::::::.::: : :::::::
CCDS45 VPYSREFKQKYDYFRKKLKKPADIPNRFEMKLHRNNIFEESYRRIMSVKRPDVLKARLWI
450 460 470 480 490 500
580 590 600 610 620 630
pF1KSD EFDGEKGLDYGGVAREWFFLISKEMFNPYYGLFEYSATDNYTLQINPNSGLCNEDHLSYF
::..::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EFESEKGLDYGGVAREWFFLLSKEMFNPYYGLFEYSATDNYTLQINPNSGLCNEDHLSYF
510 520 530 540 550 560
640 650 660 670 680 690
pF1KSD KFIGRVAGMAVYHGKLLDGFFIRPFYKMMLHKPITLHDMESVDSEYYNSLRWILENDPTE
:::::::.::.:::::::::::::::::: : :::.:::::::::::::.:::::::::
CCDS45 TFIGRVAGLAVFHGKLLDGFFIRPFYKMMLGKQITLNDMESVDSEYYNSLKWILENDPTE
570 580 590 600 610 620
700 710 720 730 740 750
pF1KSD LDLRFIIDEELFGQTHQHELKNGGSEIVVTNKNKKEYIYLVIQWRFVNRIQKQMAAFKEG
::: : :::: ::::.: .:: .::::.:::.::.::: ::::::::::.:::: :: ::
CCDS45 LDLMFCIDEENFGQTYQVDLKPNGSEIMVTNENKREYIDLVIQWRFVNRVQKQMNAFLEG
630 640 650 660 670 680
760 770 780 790 800 810
pF1KSD FFELIPQDLIKIFDENELELLMCGLGDVDVNDWREHTKYKNGYSANHQVIQWFWKAVLMM
: ::.: :::::::::::::::::::::::::::.:. ::::: :: ::::::::::.:
CCDS45 FTELLPIDLIKIFDENELELLMCGLGDVDVNDWRQHSIYKNGYCPNHPVIQWFWKAVLLM
690 700 710 720 730 740
820 830 840 850 860 870
pF1KSD DSEKRIRLLQFVTGTSRVPMNGFAELYGSNGPQSFTVEQWGTPEKLPRAHTCFNRLDLPP
:.::::::::::::::::::::::::::::::: ::.::::.::::::::::::::::::
CCDS45 DAEKRIRLLQFVTGTSRVPMNGFAELYGSNGPQLFTIEQWGSPEKLPRAHTCFNRLDLPP
750 760 770 780 790 800
880 890 900
pF1KSD YESFEELWDKLQMAIENTQGFDGVD
::.::.: .:: ::.::.:::.:::
CCDS45 YETFEDLREKLLMAVENAQGFEGVD
810 820 830
>>CCDS59323.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 (947 aa)
initn: 3715 init1: 2525 opt: 2827 Z-score: 2274.5 bits: 432.1 E(32554): 2.3e-120
Smith-Waterman score: 4032; 65.8% identity (80.8% similar) in 933 aa overlap (23-900:16-947)
10 20 30 40 50
pF1KSD MATCAVEVFGLLEDEENSRIVRVRVIAGIGLAKKDILGASDPYVRVTLY-DPMNGVLTSV
:.:..:: ::::::.:::::::...:: : :. :
CCDS59 MRRLAFEQGESRILRVKVVSGIDLAKKDIFGASDPYVKLSLYVADENRELALV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD QTKTIKKSLNPKWNEEILFRVHPQQHRLLFEVFDENRLTRDDFLGQVDVPLYPLPTENPR
:::::::.::::::::. :::.:..:::::::::::::::::::::::::: ::::.:
CCDS59 QTKTIKKTLNPKWNEEFYFRVNPSNHRLLFEVFDENRLTRDDFLGQVDVPLSHLPTEDPT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD LERPYTFKDFVLHPRSHKSRVKGYLRLKMTYLPKTSGSEDDNAEQAEELEPGWVVLDQPD
.:::::::::.:.::::::::::.:::::.:.::..:....:..: ...: :: :.:. :
CCDS59 MERPYTFKDFLLRPRSHKSRVKGFLRLKMAYMPKNGGQDEENSDQRDDMEHGWEVVDSND
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD AACHLQQQQEPSPLPPGWEERQDILGRTYYVNHESRRTQWKRPTPQDNLTDAENGNIQLQ
.: . :.. : ::::::::. : :::::::::..: :::.::. .: ....:. :..
CCDS59 SASQHQEELPPPPLPPGWEEKVDNLGRTYYVNHNNRTTQWHRPSLMDVSSESDNNIRQIN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD ---AQRAFTTRRQISE--ETESVDNQESSENWEIIREDEATMYSSQ--AFPSPPPS-SNL
:.: : .::.::: : : .. . : :: : :. .: :.: :: : ..
CCDS59 QEAAHRRFRSRRHISEDLEPEPSEGGDVPEPWETISEEVNIAGDSLGLALPPPPASPGSR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KSD DVPTHLAEELNARLTIFGNSAVSQPAS--SSNHSSR-RGSLQAYTFEEQPTLP----VLL
: .:.:::. :: : .: : .: . . ::: :. . . :: :: . .
CCDS59 TSPQELSEELSRRLQITPDSNGEQFSSLIQREPSSRLRSCSVTDAVAEQGHLPPPSVAYV
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KSD PTSSGLPPGWEEKQDERGRSYYVDHNSRTTTWTKPTVQ---------ATVETSQLTSSQ-
:. ::: ::::..: .::.:::.::.::::::.: .: :: ...: :
CCDS59 HTTPGLPSGWEERKDAKGRTYYVNHNNRTTTWTRPIMQLAEDGASGSATNSNNHLIEPQI
360 370 380 390 400 410
400 410 420
pF1KSD ------SS-----AGPQSQASTSD---------SGQQVTQPS---------EIEQGFLPK
:: ..: :. : :. : ::: .. :.:::
CCDS59 RRPRSLSSPTVTLSAPLEGAKDSPVRRAVKDTLSNPQSPQPSPYNSPKPQHKVTQSFLPP
420 430 440 450 460 470
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GWEVRHAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLKIPAHLRGKTSLDTSNDLGPLPPGWEERTHT
:::.: ::::::::::::::::::::::::.:.:.:.::::. ::::::::::::: :
CCDS59 GWEMRIAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLKFPVHMRSKTSLNP-NDLGPLPPGWEERIHL
480 490 500 510 520 530
490 500 510 520 530 540
pF1KSD DGRIFYINHNIKRTQWEDPRLENVAITGPAVPYSRDYKRKYEFFRRKLKKQNDIPNKFEM
::: :::.:: : ::::::::.: :::::::::::..:.::..::.:::: ::::.:::
CCDS59 DGRTFYIDHNSKITQWEDPRLQNPAITGPAVPYSREFKQKYDYFRKKLKKPADIPNRFEM
540 550 560 570 580 590
550 560 570 580 590 600
pF1KSD KLRRATVLEDSYRRIMGVKRADFLKARLWIEFDGEKGLDYGGVAREWFFLISKEMFNPYY
::.: ...:.::::::.::: : :::::::::..::::::::::::::::.:::::::::
CCDS59 KLHRNNIFEESYRRIMSVKRPDVLKARLWIEFESEKGLDYGGVAREWFFLLSKEMFNPYY
600 610 620 630 640 650
610 620 630 640 650 660
pF1KSD GLFEYSATDNYTLQINPNSGLCNEDHLSYFKFIGRVAGMAVYHGKLLDGFFIRPFYKMML
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.::.::::::::::::::::::
CCDS59 GLFEYSATDNYTLQINPNSGLCNEDHLSYFTFIGRVAGLAVFHGKLLDGFFIRPFYKMML
660 670 680 690 700 710
670 680 690 700 710 720
pF1KSD HKPITLHDMESVDSEYYNSLRWILENDPTELDLRFIIDEELFGQTHQHELKNGGSEIVVT
: :::.:::::::::::::.:::::::::::: : :::: ::::.: .:: .::::.::
CCDS59 GKQITLNDMESVDSEYYNSLKWILENDPTELDLMFCIDEENFGQTYQVDLKPNGSEIMVT
720 730 740 750 760 770
730 740 750 760 770 780
pF1KSD NKNKKEYIYLVIQWRFVNRIQKQMAAFKEGFFELIPQDLIKIFDENELELLMCGLGDVDV
:.::.::: ::::::::::.:::: :: ::: ::.: :::::::::::::::::::::::
CCDS59 NENKREYIDLVIQWRFVNRVQKQMNAFLEGFTELLPIDLIKIFDENELELLMCGLGDVDV
780 790 800 810 820 830
790 800 810 820 830 840
pF1KSD NDWREHTKYKNGYSANHQVIQWFWKAVLMMDSEKRIRLLQFVTGTSRVPMNGFAELYGSN
::::.:. ::::: :: ::::::::::.::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 NDWRQHSIYKNGYCPNHPVIQWFWKAVLLMDAEKRIRLLQFVTGTSRVPMNGFAELYGSN
840 850 860 870 880 890
850 860 870 880 890 900
pF1KSD GPQSFTVEQWGTPEKLPRAHTCFNRLDLPPYESFEELWDKLQMAIENTQGFDGVD
::: ::.::::.::::::::::::::::::::.::.: .:: ::.::.:::.:::
CCDS59 GPQLFTIEQWGSPEKLPRAHTCFNRLDLPPYETFEDLREKLLMAVENAQGFEGVD
900 910 920 930 940
900 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 23:56:49 2016 done: Wed Nov 2 23:56:50 2016
Total Scan time: 3.490 Total Display time: 0.290
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]