Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0088
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0088, 847 aa
1>>>pF1KSDA0088 847 - 847 aa - 847 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9510+/-0.00101; mu= 17.8346+/- 0.061
mean_var=81.0435+/-16.473, 0's: 0 Z-trim(105.9): 28 B-trim: 102 in 2/47
Lambda= 0.142467
statistics sampled from 8688 (8703) to 8688 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.267), width: 16
Scan time: 3.840
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS60817.1 GANAB gene_id:23193|Hs108|chr11 ( 847) 5900 1222.9 0
CCDS8026.1 GANAB gene_id:23193|Hs108|chr11 ( 944) 5900 1223.0 0
CCDS60818.1 GANAB gene_id:23193|Hs108|chr11 ( 852) 5316 1102.9 0
CCDS41656.1 GANAB gene_id:23193|Hs108|chr11 ( 966) 5316 1102.9 0
CCDS10084.1 GANC gene_id:2595|Hs108|chr15 ( 914) 2893 604.9 2e-172
CCDS47727.1 MGAM gene_id:8972|Hs108|chr7 (1857) 721 158.6 9e-38
CCDS78281.1 MGAM2 gene_id:93432|Hs108|chr7 (2515) 668 147.8 2.2e-34
CCDS32760.1 GAA gene_id:2548|Hs108|chr17 ( 952) 646 143.1 2.2e-33
CCDS3196.1 SI gene_id:6476|Hs108|chr3 (1827) 621 138.1 1.4e-31
CCDS76738.1 GANC gene_id:2595|Hs108|chr15 ( 357) 580 129.3 1.2e-29
>>CCDS60817.1 GANAB gene_id:23193|Hs108|chr11 (847 aa)
initn: 5900 init1: 5900 opt: 5900 Z-score: 6549.7 bits: 1222.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5900; 99.9% identity (100.0% similar) in 847 aa overlap (1-847:1-847)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MTRFRIDELEPRRPRYRVPDVLVADPPIARLSVSGRDENSVELTMAEGPYKIILTARPFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MTRFRIDELEPRRPRYRVPDVLVADPPIARLSVSGRDENSVELTMAEGPYKIILTARPFR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LDLLEDRSLLLSVNARGLLEFEHQRAPRVSQGSKDPAEGDGAQPEETPRDGDKPEETQGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LDLLEDRSLLLSVNARGLLEFEHQRAPRVSQGSKDPAEGDGAQPEETPRDGDKPEETQGK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD AEKDEPGAWEETFKTHSDSKPYGPMSVGLDFSLPGMEHVYGIPEHADNLRLKVTEGGEPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 AEKDEPGAWEETFKTHSDSKPYGPMSVGLDFSLPGMEHVYGIPEHADNLRLKVTEGGEPY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RLYNLDVFQYELYNPMALYGSVPVLLAHNPHRDLGIFWLNAAETWVDISSNTAGKTLFGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RLYNLDVFQYELYNPMALYGSVPVLLAHNPHRDLGIFWLNAAETWVDISSNTAGKTLFGK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD MMDYLQGSGETPQTDVRWMSETGIIDVFLLLGPSISDVFRQYASLTGTQALPPLFSLGYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MMDYLQGSGETPQTDVRWMSETGIIDVFLLLGPSISDVFRQYASLTGTQALPPLFSLGYH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD QSRWNYRDEADVLEVDQGFDDHNLPCDVIWLDIEHADGKRYFTWDPSRFPQPRTMLERLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 QSRWNYRDEADVLEVDQGFDDHNLPCDVIWLDIEHADGKRYFTWDPSRFPQPRTMLERLA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SKRRKLVAIVDPHIKVDSGYRVHEELRNLGLYVKTRDGSDYEGWCWPGSAGYPDFTNPTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SKRRKLVAIVDPHIKVDSGYRVHEELRNLGLYVKTRDGSDYEGWCWPGSAGYPDFTNPTM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD RAWWANMFSYDNYEGSAPNLFVWNDMNEPSVFNGPEVTMLKDAQHYGGWEHRDVHNIYGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RAWWANMFSYDNYEGSAPNLFVWNDMNEPSVFNGPEVTMLKDAQHYGGWEHRDVHNIYGL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD YVHMATADGLRQRSGGMERPFVLARAFFAGSQRFGAVWTGDNTAEWDHLKISIPMCLSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 YVHMATADGLRQRSGGMERPFVLARAFFAGSQRFGAVWTGDNTAEWDHLKISIPMCLSLG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD LVGLSFCGADVGGFFKNPEPELLVRWYQMGAYQPFFRAHAHLDTGRREPWLLPSQHNDII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LVGLSFCGADVGGFFKNPEPELLVRWYQMGAYQPFFRAHAHLDTGRREPWLLPSQHNDII
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD RDALGQRYSLLPFWYTLLYQAHREGIPVMRPLWVQYPQDVTTFNIDDQYLLGDALLVHPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RDALGQRYSLLPFWYTLLYQAHREGIPVMRPLWVQYPQDVTTFNIDDQYLLGDALLVHPV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD SDSGAHGVQVYLPGQGEVWYDIQSYQKHHGPQTLYLPVTLSSIPVFQRGGTIVPRWMRVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SDSGAHGVQVYLPGQGEVWYDIQSYQKHHGPQTLYLPVTLSSIPVFQRGGTIVPRWMRVR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD RSSECMKDDPITLFVALSPQGTAQGELFLDDGYTFNYQTRQEFLLRRFSFSGNTLVSSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RSSECMKDDPITLFVALSPQGTAQGELFLDDGHTFNYQTRQEFLLRRFSFSGNTLVSSSA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD DPEGHFETPIWIERVVIIGAGKPAAVVLQTKGSPESRLSFQHDPETSVLVLRKPGINVAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 DPEGHFETPIWIERVVIIGAGKPAAVVLQTKGSPESRLSFQHDPETSVLVLRKPGINVAS
790 800 810 820 830 840
pF1KSD DWSIHLR
:::::::
CCDS60 DWSIHLR
>>CCDS8026.1 GANAB gene_id:23193|Hs108|chr11 (944 aa)
initn: 5900 init1: 5900 opt: 5900 Z-score: 6549.0 bits: 1223.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5900; 99.9% identity (100.0% similar) in 847 aa overlap (1-847:98-944)
10 20 30
pF1KSD MTRFRIDELEPRRPRYRVPDVLVADPPIAR
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 QLGPDSLTVHLIHEVTKVLLVLELQGLQKNMTRFRIDELEPRRPRYRVPDVLVADPPIAR
70 80 90 100 110 120
40 50 60 70 80 90
pF1KSD LSVSGRDENSVELTMAEGPYKIILTARPFRLDLLEDRSLLLSVNARGLLEFEHQRAPRVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 LSVSGRDENSVELTMAEGPYKIILTARPFRLDLLEDRSLLLSVNARGLLEFEHQRAPRVS
130 140 150 160 170 180
100 110 120 130 140 150
pF1KSD QGSKDPAEGDGAQPEETPRDGDKPEETQGKAEKDEPGAWEETFKTHSDSKPYGPMSVGLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 QGSKDPAEGDGAQPEETPRDGDKPEETQGKAEKDEPGAWEETFKTHSDSKPYGPMSVGLD
190 200 210 220 230 240
160 170 180 190 200 210
pF1KSD FSLPGMEHVYGIPEHADNLRLKVTEGGEPYRLYNLDVFQYELYNPMALYGSVPVLLAHNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 FSLPGMEHVYGIPEHADNLRLKVTEGGEPYRLYNLDVFQYELYNPMALYGSVPVLLAHNP
250 260 270 280 290 300
220 230 240 250 260 270
pF1KSD HRDLGIFWLNAAETWVDISSNTAGKTLFGKMMDYLQGSGETPQTDVRWMSETGIIDVFLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 HRDLGIFWLNAAETWVDISSNTAGKTLFGKMMDYLQGSGETPQTDVRWMSETGIIDVFLL
310 320 330 340 350 360
280 290 300 310 320 330
pF1KSD LGPSISDVFRQYASLTGTQALPPLFSLGYHQSRWNYRDEADVLEVDQGFDDHNLPCDVIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 LGPSISDVFRQYASLTGTQALPPLFSLGYHQSRWNYRDEADVLEVDQGFDDHNLPCDVIW
370 380 390 400 410 420
340 350 360 370 380 390
pF1KSD LDIEHADGKRYFTWDPSRFPQPRTMLERLASKRRKLVAIVDPHIKVDSGYRVHEELRNLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 LDIEHADGKRYFTWDPSRFPQPRTMLERLASKRRKLVAIVDPHIKVDSGYRVHEELRNLG
430 440 450 460 470 480
400 410 420 430 440 450
pF1KSD LYVKTRDGSDYEGWCWPGSAGYPDFTNPTMRAWWANMFSYDNYEGSAPNLFVWNDMNEPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 LYVKTRDGSDYEGWCWPGSAGYPDFTNPTMRAWWANMFSYDNYEGSAPNLFVWNDMNEPS
490 500 510 520 530 540
460 470 480 490 500 510
pF1KSD VFNGPEVTMLKDAQHYGGWEHRDVHNIYGLYVHMATADGLRQRSGGMERPFVLARAFFAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 VFNGPEVTMLKDAQHYGGWEHRDVHNIYGLYVHMATADGLRQRSGGMERPFVLARAFFAG
550 560 570 580 590 600
520 530 540 550 560 570
pF1KSD SQRFGAVWTGDNTAEWDHLKISIPMCLSLGLVGLSFCGADVGGFFKNPEPELLVRWYQMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 SQRFGAVWTGDNTAEWDHLKISIPMCLSLGLVGLSFCGADVGGFFKNPEPELLVRWYQMG
610 620 630 640 650 660
580 590 600 610 620 630
pF1KSD AYQPFFRAHAHLDTGRREPWLLPSQHNDIIRDALGQRYSLLPFWYTLLYQAHREGIPVMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 AYQPFFRAHAHLDTGRREPWLLPSQHNDIIRDALGQRYSLLPFWYTLLYQAHREGIPVMR
670 680 690 700 710 720
640 650 660 670 680 690
pF1KSD PLWVQYPQDVTTFNIDDQYLLGDALLVHPVSDSGAHGVQVYLPGQGEVWYDIQSYQKHHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 PLWVQYPQDVTTFNIDDQYLLGDALLVHPVSDSGAHGVQVYLPGQGEVWYDIQSYQKHHG
730 740 750 760 770 780
700 710 720 730 740 750
pF1KSD PQTLYLPVTLSSIPVFQRGGTIVPRWMRVRRSSECMKDDPITLFVALSPQGTAQGELFLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 PQTLYLPVTLSSIPVFQRGGTIVPRWMRVRRSSECMKDDPITLFVALSPQGTAQGELFLD
790 800 810 820 830 840
760 770 780 790 800 810
pF1KSD DGYTFNYQTRQEFLLRRFSFSGNTLVSSSADPEGHFETPIWIERVVIIGAGKPAAVVLQT
::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 DGHTFNYQTRQEFLLRRFSFSGNTLVSSSADPEGHFETPIWIERVVIIGAGKPAAVVLQT
850 860 870 880 890 900
820 830 840
pF1KSD KGSPESRLSFQHDPETSVLVLRKPGINVASDWSIHLR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 KGSPESRLSFQHDPETSVLVLRKPGINVASDWSIHLR
910 920 930 940
>>CCDS60818.1 GANAB gene_id:23193|Hs108|chr11 (852 aa)
initn: 5316 init1: 5316 opt: 5316 Z-score: 5901.0 bits: 1102.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5645; 97.3% identity (97.4% similar) in 840 aa overlap (30-847:13-852)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MTRFRIDELEPRRPRYRVPDVLVADPPIARLSVSGRDENSVELTMAEGPYKIILTARPFR
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MAAVAAVAARRRRLSVSGRDENSVELTMAEGPYKIILTARPFR
10 20 30 40
70 80 90
pF1KSD LDLLEDRSLLLSVNARGLLEFEHQRAPRVS----------------------QGSKDPAE
:::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS60 LDLLEDRSLLLSVNARGLLEFEHQRAPRVSFSDKVNLTLGSIWDKIKNLFSRQGSKDPAE
50 60 70 80 90 100
100 110 120 130 140 150
pF1KSD GDGAQPEETPRDGDKPEETQGKAEKDEPGAWEETFKTHSDSKPYGPMSVGLDFSLPGMEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 GDGAQPEETPRDGDKPEETQGKAEKDEPGAWEETFKTHSDSKPYGPMSVGLDFSLPGMEH
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KSD VYGIPEHADNLRLKVTEGGEPYRLYNLDVFQYELYNPMALYGSVPVLLAHNPHRDLGIFW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 VYGIPEHADNLRLKVTEGGEPYRLYNLDVFQYELYNPMALYGSVPVLLAHNPHRDLGIFW
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KSD LNAAETWVDISSNTAGKTLFGKMMDYLQGSGETPQTDVRWMSETGIIDVFLLLGPSISDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LNAAETWVDISSNTAGKTLFGKMMDYLQGSGETPQTDVRWMSETGIIDVFLLLGPSISDV
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KSD FRQYASLTGTQALPPLFSLGYHQSRWNYRDEADVLEVDQGFDDHNLPCDVIWLDIEHADG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 FRQYASLTGTQALPPLFSLGYHQSRWNYRDEADVLEVDQGFDDHNLPCDVIWLDIEHADG
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KSD KRYFTWDPSRFPQPRTMLERLASKRRKLVAIVDPHIKVDSGYRVHEELRNLGLYVKTRDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 KRYFTWDPSRFPQPRTMLERLASKRRKLVAIVDPHIKVDSGYRVHEELRNLGLYVKTRDG
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KSD SDYEGWCWPGSAGYPDFTNPTMRAWWANMFSYDNYEGSAPNLFVWNDMNEPSVFNGPEVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SDYEGWCWPGSAGYPDFTNPTMRAWWANMFSYDNYEGSAPNLFVWNDMNEPSVFNGPEVT
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KSD MLKDAQHYGGWEHRDVHNIYGLYVHMATADGLRQRSGGMERPFVLARAFFAGSQRFGAVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MLKDAQHYGGWEHRDVHNIYGLYVHMATADGLRQRSGGMERPFVLARAFFAGSQRFGAVW
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KSD TGDNTAEWDHLKISIPMCLSLGLVGLSFCGADVGGFFKNPEPELLVRWYQMGAYQPFFRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 TGDNTAEWDHLKISIPMCLSLGLVGLSFCGADVGGFFKNPEPELLVRWYQMGAYQPFFRA
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610 620 630
pF1KSD HAHLDTGRREPWLLPSQHNDIIRDALGQRYSLLPFWYTLLYQAHREGIPVMRPLWVQYPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 HAHLDTGRREPWLLPSQHNDIIRDALGQRYSLLPFWYTLLYQAHREGIPVMRPLWVQYPQ
590 600 610 620 630 640
640 650 660 670 680 690
pF1KSD DVTTFNIDDQYLLGDALLVHPVSDSGAHGVQVYLPGQGEVWYDIQSYQKHHGPQTLYLPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 DVTTFNIDDQYLLGDALLVHPVSDSGAHGVQVYLPGQGEVWYDIQSYQKHHGPQTLYLPV
650 660 670 680 690 700
700 710 720 730 740 750
pF1KSD TLSSIPVFQRGGTIVPRWMRVRRSSECMKDDPITLFVALSPQGTAQGELFLDDGYTFNYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS60 TLSSIPVFQRGGTIVPRWMRVRRSSECMKDDPITLFVALSPQGTAQGELFLDDGHTFNYQ
710 720 730 740 750 760
760 770 780 790 800 810
pF1KSD TRQEFLLRRFSFSGNTLVSSSADPEGHFETPIWIERVVIIGAGKPAAVVLQTKGSPESRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 TRQEFLLRRFSFSGNTLVSSSADPEGHFETPIWIERVVIIGAGKPAAVVLQTKGSPESRL
770 780 790 800 810 820
820 830 840
pF1KSD SFQHDPETSVLVLRKPGINVASDWSIHLR
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SFQHDPETSVLVLRKPGINVASDWSIHLR
830 840 850
>>CCDS41656.1 GANAB gene_id:23193|Hs108|chr11 (966 aa)
initn: 5316 init1: 5316 opt: 5316 Z-score: 5900.1 bits: 1102.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5846; 97.4% identity (97.5% similar) in 869 aa overlap (1-847:98-966)
10 20 30
pF1KSD MTRFRIDELEPRRPRYRVPDVLVADPPIAR
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QLGPDSLTVHLIHEVTKVLLVLELQGLQKNMTRFRIDELEPRRPRYRVPDVLVADPPIAR
70 80 90 100 110 120
40 50 60 70 80 90
pF1KSD LSVSGRDENSVELTMAEGPYKIILTARPFRLDLLEDRSLLLSVNARGLLEFEHQRAPRVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LSVSGRDENSVELTMAEGPYKIILTARPFRLDLLEDRSLLLSVNARGLLEFEHQRAPRVS
130 140 150 160 170 180
100 110 120
pF1KSD ----------------------QGSKDPAEGDGAQPEETPRDGDKPEETQGKAEKDEPGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FSDKVNLTLGSIWDKIKNLFSRQGSKDPAEGDGAQPEETPRDGDKPEETQGKAEKDEPGA
190 200 210 220 230 240
130 140 150 160 170 180
pF1KSD WEETFKTHSDSKPYGPMSVGLDFSLPGMEHVYGIPEHADNLRLKVTEGGEPYRLYNLDVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 WEETFKTHSDSKPYGPMSVGLDFSLPGMEHVYGIPEHADNLRLKVTEGGEPYRLYNLDVF
250 260 270 280 290 300
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QYELYNPMALYGSVPVLLAHNPHRDLGIFWLNAAETWVDISSNTAGKTLFGKMMDYLQGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QYELYNPMALYGSVPVLLAHNPHRDLGIFWLNAAETWVDISSNTAGKTLFGKMMDYLQGS
310 320 330 340 350 360
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GETPQTDVRWMSETGIIDVFLLLGPSISDVFRQYASLTGTQALPPLFSLGYHQSRWNYRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GETPQTDVRWMSETGIIDVFLLLGPSISDVFRQYASLTGTQALPPLFSLGYHQSRWNYRD
370 380 390 400 410 420
310 320 330 340 350 360
pF1KSD EADVLEVDQGFDDHNLPCDVIWLDIEHADGKRYFTWDPSRFPQPRTMLERLASKRRKLVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EADVLEVDQGFDDHNLPCDVIWLDIEHADGKRYFTWDPSRFPQPRTMLERLASKRRKLVA
430 440 450 460 470 480
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SYDNYEGSAPNLFVWNDMNEPSVFNGPEVTMLKDAQHYGGWEHRDVHNIYGLYVHMATAD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GLRQRSGGMERPFVLARAFFAGSQRFGAVWTGDNTAEWDHLKISIPMCLSLGLVGLSFCG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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CCDS41 SLLPFWYTLLYQAHREGIPVMRPLWVQYPQDVTTFNIDDQYLLGDALLVHPVSDSGAHGV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QVYLPGQGEVWYDIQSYQKHHGPQTLYLPVTLSSIPVFQRGGTIVPRWMRVRRSSECMKD
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CCDS41 PIWIERVVIIGAGKPAAVVLQTKGSPESRLSFQHDPETSVLVLRKPGINVASDWSIHLR
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: :: : .:. :. ..: : .:: ::..::. .. ...:.:. : : ::: . . ..
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:: :.::.::::.::.. .:: : :. ::::::::. :..:. :..::::: ::::.
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220 230 240 250 260 270
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: .:::::::.:: :.:... : . . .: . .: :.::::.::::::::
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280 290 300 310 320 330
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460 470 480 490 500 510
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: ::: :: :.: :.:.::::..:::::.: .::::.:: .:: : ::::::.:.:::::
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520 530 540 550 560 570
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:..::::::::::::..::::::: :.:...:.::::::.:::. ::: :::::::: ::
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580 590 600 610 620 630
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::::::.:: ..: ::::::. .:. .::.:. .::.:::.::.:.:.:: . :::::
CCDS10 YQPFFRGHATMNTKRREPWLFGEEHTRLIREAIRERYGLLPYWYSLFYHAHVASQPVMRP
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640 650 660 670 680 690
pF1KSD LWVQYPQDVTTFNIDDQYLLGDALLVHPVSDSGAHGVQVYLPGQGEVWYDIQSYQKHHGP
:::..:... ::...:.:.::.:::::::.. : :.:.:::..::::: ... . .:
CCDS10 LWVEFPDELKTFDMEDEYMLGSALLVHPVTEPKATTVDVFLPGSNEVWYDYKTFAHWEGG
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700 710 720 730 740 750
pF1KSD QTLYLPVTLSSIPVFQRGGTIVPRWMRVRRSSECMKDDPITLFVALSPQGTAQGELFLDD
:. .::.:..::::::::...: : .:. : .. : :::: .:.. :::.:::
CCDS10 CTVKIPVALDTIPVFQRGGSVIPIKTTVGKSTGWMTESSYGLRVALSTKGSSVGELYLDD
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760 770 780 790 800 810
pF1KSD GYTFNYQTRQEFLLRRFSFSGNTLVSSSADPEGHFETPIWIERVVIIGAGK-PAAVVLQT
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CCDS10 GHSFQYLHQKQFLHRKFSFCSSVLINSFADQRGHYPSKCVVEKILVLGFRKEPSSVTTHS
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820 830 840
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CCDS10 SDGKDQPVAFTYCAKTSILSLEKLSLNIATDWEVRII
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CCDS47 TWPIFNRDTTPNG--NGTNLYGAQTFFLCLEDASGLSFGVFLMN---------SNA----
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. :: ::.: .. :.::.:: . .:::.. . . .: :.:.:
CCDS47 PRILDGYLFCKTLCMDAVQHWG--KQYDIHNLYGYSMAVATAEAAKTVFPN-KRSFILTR
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. :::: .:.: : ::::: :: :. ::: : ..: :. . : :. :: . :: :
CCDS47 STFAGSGKFAAHWLGDNTATWDDLRWSIPGVLEFNLFGIPMVGPDICGFALDTPEELCRR
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CCDS47 WMQLGAFYPFSRNHNGQGYKDQDPASFGADSLLLNSSRHYLNIRYTLLPYLYTLFFRAHS
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CCDS47 RGDTVARPLLHEFYEDNSTWDVHQQFLWGPGLLITPVLDEGAEKVMAYVPDA--VWYDYE
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CCDS47 TGSQVRWRKQKVEMELPGDKIGLHLRGGYIFPT-QQPNTTTLASRKNPLGLIIALDENKE
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CCDS47 AKGELFWDNGETKDTVANKVYLLCEFSVTQNRLEVNISQSTYKDPNN-----LAFNEIKI
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CCDS47 LGTEEPSNVTVKHNGVPSQTSPTVTYDSNLKVAIITDIDLLLGEAYTVEWSIKIRDEEKI
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CCDS47 DCYPDENGASAENCTARGCIWEASNSSGVPFCYFVNDLYSVSDVQYNSHGATADISLKSS
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CCDS47 YTELIGRPVMVPYWSLGFQLCRYGYQNDSEIASLYDEMVAAQIPYDVQYSDIDYMERQLD
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. : :: :: ...::: . :: . :.: ..
CCDS47 DIVWGKVWPDFPDVVVNGSLDWDSQVELYRAYVAFPDFFRNSTAKWWKREIEELYNNPQN
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. :. .: .:::.:: : ..... .: .: :..:. : .: :... : :
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CCDS47 DNTAAWDQLKKSIIGMMEFSLFGISYTGADICGFFQDAEYEMCVRWMQLGAFYPFSRNHN
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CCDS47 TIGTRRQDPVSWDVAFVNISRTVLQTRYTLLPYLYTLMHKAHTEGVTVVRPLLHEFVSDQ
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CCDS47 VTWDIDSQFLLGPAFLVSPVLERNARNVTAYFPRA--RWYDYYTGVDINARGEWKTLPAP
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pF1KSD LSSIPVFQRGGTIVPRWMRVRRSSECMKDDPITLFVALSPQGTAQGELFLDDGYTFNYQT
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CCDS47 LDHINLHVRGGYILP-WQEPALNTHLSRQKFMGFKIALDDEGTAGGWLFWDDGQSIDTYG
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pF1KSD RQEFLLRRFSFSGNTLVSSSA-DPEGHFETPIWIERVVIIGAGK-PAAVVLQTKGSPESR
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CCDS47 KGLYYLASFSASQNTMQSHIIFNNYITGTNPLKLGYIEIWGVGSVPVTSVSISVSGMVIT
1770 1780 1790 1800 1810 1820
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pF1KSD LSFQHDPETSVLVLRKPGINVASDWSIHLR
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CCDS47 PSFNNDPTTQVLSIDVTDRNISLHNFTSLTWISTL
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pF1KSD GKAEKDEPGAWEETFKTHSDSKPYGPMSVGLDFSLPGMEHVYGIPEHA-DNLRLKVTEGG
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CCDS78 FSIKIMRTSNRRVLLDTSIGPLQFAQQYLQLSFRLPSA-NVYGLGEHVHQQYRHNMTWKT
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180 190 200 210 220 230
pF1KSD EPYRLYNLDVFQYELYNPMALYGSVPVLLAHNPHR--DLGIFWLNAAETWVDISSNTAGK
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CCDS78 WP--IFTRDATPTE--GMINLYGAHTFFLCLEDARGSSFGVFLMN---------SNAMEV
240 250 260 270 280
240 250 260 270 280 290
pF1KSD TLFGKMMDYLQGSGETPQTDVRWMSETGIIDVFLLLGPSISDVFRQYASLTGTQALPPLF
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CCDS78 TL-------------QPAPAITYRTIGGILDFYVFLGNTPEQVVQEYLELVGRPFFPPYW
290 300 310 320 330
300 310 320 330 340 350
pF1KSD SLGYHQSRWNYRDEADVLEVDQGFDDHNLPCDVIWLDIEHADGKRYFTWDPSRFPQPRTM
:::.. :: .: . :: . ..: :: . ::.. :::. :: : . .
CCDS78 SLGFQLSRRDYGGINKLKEVVSRNRLAEIPYDVQYSDIDYMDGKKDFTVDEVAYSGLPDF
340 350 360 370 380 390
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LERLASKRRKLVAIVDPHIKVDSGYRVHEELRNLGLYVKTRDGSDYEGWCWPGSAGYPDF
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CCDS31 FHPYYMALEEEGNAHGVFLLNSNAMDVTFQPTPALTYRTVGGILDFYMFLGPTPEVATKQ
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CCDS31 YHEVIGHPVMPAYWALGFQLCRYGYANTSEVRELYDAMVAANIPYDVQYTDIDYMERQLD
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CCDS31 DIC-WAKVWPDLPNITIDKTLTEDEAVNASRAHVAFPDFFRTSTAEWWAREI-VDFYNEK
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