Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0086
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0086, 1040 aa
1>>>pF1KSDA0086 1040 - 1040 aa - 1040 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9288+/-0.000406; mu= 13.8286+/- 0.025
mean_var=99.2066+/-19.711, 0's: 0 Z-trim(112.7): 24 B-trim: 47 in 1/55
Lambda= 0.128767
statistics sampled from 21727 (21743) to 21727 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.614), E-opt: 0.2 (0.255), width: 16
Scan time: 8.080
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011538731 (OMIM: 609682) PREDICTED: DNA cross-l (1040) 6986 1309.1 0
NP_055696 (OMIM: 609682) DNA cross-link repair 1A (1040) 6986 1309.1 0
NP_001258745 (OMIM: 609682) DNA cross-link repair (1040) 6986 1309.1 0
XP_006718153 (OMIM: 609682) PREDICTED: DNA cross-l (1040) 6986 1309.1 0
NP_073747 (OMIM: 609683) 5' exonuclease Apollo iso ( 532) 470 98.5 1e-19
XP_011517922 (OMIM: 602450,603554,605988) PREDICTE ( 388) 312 69.1 5.3e-11
XP_016872045 (OMIM: 602450,603554,605988) PREDICTE ( 614) 312 69.2 7.9e-11
NP_001029027 (OMIM: 602450,603554,605988) protein ( 692) 312 69.2 8.8e-11
XP_011517923 (OMIM: 602450,603554,605988) PREDICTE ( 310) 246 56.8 2.1e-07
XP_016872049 (OMIM: 602450,603554,605988) PREDICTE ( 494) 245 56.7 3.6e-07
XP_016872048 (OMIM: 602450,603554,605988) PREDICTE ( 499) 238 55.4 9.1e-07
>>XP_011538731 (OMIM: 609682) PREDICTED: DNA cross-link (1040 aa)
initn: 6986 init1: 6986 opt: 6986 Z-score: 7012.3 bits: 1309.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6986; 100.0% identity (100.0% similar) in 1040 aa overlap (1-1040:1-1040)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLEDISEEDIWEYKSKRKPKRVDPNNGSKNILKSVEKATDGKYQSKRSRNRKRAAEAKEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MLEDISEEDIWEYKSKRKPKRVDPNNGSKNILKSVEKATDGKYQSKRSRNRKRAAEAKEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KDHEVPLGNAGCQTSVASSQNSSCGDGIQQTQDKETTPGKLCRTQKSQHVSPKIRPVYDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KDHEVPLGNAGCQTSVASSQNSSCGDGIQQTQDKETTPGKLCRTQKSQHVSPKIRPVYDG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD YCPNCQMPFSSLIGQTPRWHVFECLDSPPRSETECPDGLLCTSTIPFHYKRYTHFLLAQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YCPNCQMPFSSLIGQTPRWHVFECLDSPPRSETECPDGLLCTSTIPFHYKRYTHFLLAQS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RAGDHPFSSPSPASGGSFSETKSGVLCSLEERWSSYQNQTDNSVSNDPLLMTQYFKKSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RAGDHPFSSPSPASGGSFSETKSGVLCSLEERWSSYQNQTDNSVSNDPLLMTQYFKKSPS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LTEASEKISTHIQTSQQALQFTDFVENDKLVGVALRLANNSEHINLPLPENDFSDCEISY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LTEASEKISTHIQTSQQALQFTDFVENDKLVGVALRLANNSEHINLPLPENDFSDCEISY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SPLQSDEDTHDIDEKPDDSQEQLFFTESSKDGSLEEDDDSCGFFKKRHGPLLKDQDESCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SPLQSDEDTHDIDEKPDDSQEQLFFTESSKDGSLEEDDDSCGFFKKRHGPLLKDQDESCP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KVNSFLTRDKYDEGLYRFNSLNDLSQPISQNNESTLPYDLACTGGDFVLFPPALAGKLAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KVNSFLTRDKYDEGLYRFNSLNDLSQPISQNNESTLPYDLACTGGDFVLFPPALAGKLAA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SVHQATKAKPDEPEFHSAQSNKQKQVIEESSVYNQVSLPLVKSLMLKPFESQVEGYLSSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SVHQATKAKPDEPEFHSAQSNKQKQVIEESSVYNQVSLPLVKSLMLKPFESQVEGYLSSQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD PTQNTIRKLSSENLNAKNNTNSACFCRKALEGVPVGKATILNTENLSSTPAPKYLKILPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PTQNTIRKLSSENLNAKNNTNSACFCRKALEGVPVGKATILNTENLSSTPAPKYLKILPS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD GLKYNARHPSTKVMKQMDIGVYFGLPPKRKEEKLLGESALEGINLNPVPSPNQKRSSQCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GLKYNARHPSTKVMKQMDIGVYFGLPPKRKEEKLLGESALEGINLNPVPSPNQKRSSQCK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD RKAEKSLSDLEFDASTLHESQLSVELSSERSQRQKKRCRKSNSLQEGACQKRSDHLINTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RKAEKSLSDLEFDASTLHESQLSVELSSERSQRQKKRCRKSNSLQEGACQKRSDHLINTE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD SEAVNLSKVKVFTKSAHGGLQRGNKKIPESSNVGGSRKKTCPFYKKIPGTGFTVDAFQYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SEAVNLSKVKVFTKSAHGGLQRGNKKIPESSNVGGSRKKTCPFYKKIPGTGFTVDAFQYG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD VVEGCTAYFLTHFHSDHYAGLSKHFTFPVYCSEITGNLLKNKLHVQEQYIHPLPLDTECI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VVEGCTAYFLTHFHSDHYAGLSKHFTFPVYCSEITGNLLKNKLHVQEQYIHPLPLDTECI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD VNGVKVVLLDANHCPGAVMILFYLPNGTVILHTGDFRADPSMERSLLADQKVHMLYLDTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VNGVKVVLLDANHCPGAVMILFYLPNGTVILHTGDFRADPSMERSLLADQKVHMLYLDTT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD YCSPEYTFPSQQEVIRFAINTAFEAVTLNPHALVVCGTYSIGKEKVFLAIADVLGSKVGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YCSPEYTFPSQQEVIRFAINTAFEAVTLNPHALVVCGTYSIGKEKVFLAIADVLGSKVGM
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD SQEKYKTLQCLNIPEINSLITTDMCSSLVHLLPMMQINFKGLQSHLKKCGGKYNQILAFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SQEKYKTLQCLNIPEINSLITTDMCSSLVHLLPMMQINFKGLQSHLKKCGGKYNQILAFR
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD PTGWTHSNKFTRIADVIPQTKGNISIYGIPYSEHSSYLEMKRFVQWLKPQKIIPTVNVGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PTGWTHSNKFTRIADVIPQTKGNISIYGIPYSEHSSYLEMKRFVQWLKPQKIIPTVNVGT
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040
pF1KSD WKSRSTMEKYFREWKLEAGY
::::::::::::::::::::
XP_011 WKSRSTMEKYFREWKLEAGY
1030 1040
>>NP_055696 (OMIM: 609682) DNA cross-link repair 1A prot (1040 aa)
initn: 6986 init1: 6986 opt: 6986 Z-score: 7012.3 bits: 1309.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6986; 100.0% identity (100.0% similar) in 1040 aa overlap (1-1040:1-1040)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLEDISEEDIWEYKSKRKPKRVDPNNGSKNILKSVEKATDGKYQSKRSRNRKRAAEAKEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MLEDISEEDIWEYKSKRKPKRVDPNNGSKNILKSVEKATDGKYQSKRSRNRKRAAEAKEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KDHEVPLGNAGCQTSVASSQNSSCGDGIQQTQDKETTPGKLCRTQKSQHVSPKIRPVYDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KDHEVPLGNAGCQTSVASSQNSSCGDGIQQTQDKETTPGKLCRTQKSQHVSPKIRPVYDG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD YCPNCQMPFSSLIGQTPRWHVFECLDSPPRSETECPDGLLCTSTIPFHYKRYTHFLLAQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 YCPNCQMPFSSLIGQTPRWHVFECLDSPPRSETECPDGLLCTSTIPFHYKRYTHFLLAQS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RAGDHPFSSPSPASGGSFSETKSGVLCSLEERWSSYQNQTDNSVSNDPLLMTQYFKKSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RAGDHPFSSPSPASGGSFSETKSGVLCSLEERWSSYQNQTDNSVSNDPLLMTQYFKKSPS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LTEASEKISTHIQTSQQALQFTDFVENDKLVGVALRLANNSEHINLPLPENDFSDCEISY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LTEASEKISTHIQTSQQALQFTDFVENDKLVGVALRLANNSEHINLPLPENDFSDCEISY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SPLQSDEDTHDIDEKPDDSQEQLFFTESSKDGSLEEDDDSCGFFKKRHGPLLKDQDESCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SPLQSDEDTHDIDEKPDDSQEQLFFTESSKDGSLEEDDDSCGFFKKRHGPLLKDQDESCP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KVNSFLTRDKYDEGLYRFNSLNDLSQPISQNNESTLPYDLACTGGDFVLFPPALAGKLAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KVNSFLTRDKYDEGLYRFNSLNDLSQPISQNNESTLPYDLACTGGDFVLFPPALAGKLAA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SVHQATKAKPDEPEFHSAQSNKQKQVIEESSVYNQVSLPLVKSLMLKPFESQVEGYLSSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SVHQATKAKPDEPEFHSAQSNKQKQVIEESSVYNQVSLPLVKSLMLKPFESQVEGYLSSQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD PTQNTIRKLSSENLNAKNNTNSACFCRKALEGVPVGKATILNTENLSSTPAPKYLKILPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PTQNTIRKLSSENLNAKNNTNSACFCRKALEGVPVGKATILNTENLSSTPAPKYLKILPS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD GLKYNARHPSTKVMKQMDIGVYFGLPPKRKEEKLLGESALEGINLNPVPSPNQKRSSQCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GLKYNARHPSTKVMKQMDIGVYFGLPPKRKEEKLLGESALEGINLNPVPSPNQKRSSQCK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD RKAEKSLSDLEFDASTLHESQLSVELSSERSQRQKKRCRKSNSLQEGACQKRSDHLINTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RKAEKSLSDLEFDASTLHESQLSVELSSERSQRQKKRCRKSNSLQEGACQKRSDHLINTE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD SEAVNLSKVKVFTKSAHGGLQRGNKKIPESSNVGGSRKKTCPFYKKIPGTGFTVDAFQYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SEAVNLSKVKVFTKSAHGGLQRGNKKIPESSNVGGSRKKTCPFYKKIPGTGFTVDAFQYG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD VVEGCTAYFLTHFHSDHYAGLSKHFTFPVYCSEITGNLLKNKLHVQEQYIHPLPLDTECI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VVEGCTAYFLTHFHSDHYAGLSKHFTFPVYCSEITGNLLKNKLHVQEQYIHPLPLDTECI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD VNGVKVVLLDANHCPGAVMILFYLPNGTVILHTGDFRADPSMERSLLADQKVHMLYLDTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VNGVKVVLLDANHCPGAVMILFYLPNGTVILHTGDFRADPSMERSLLADQKVHMLYLDTT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD YCSPEYTFPSQQEVIRFAINTAFEAVTLNPHALVVCGTYSIGKEKVFLAIADVLGSKVGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 YCSPEYTFPSQQEVIRFAINTAFEAVTLNPHALVVCGTYSIGKEKVFLAIADVLGSKVGM
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD SQEKYKTLQCLNIPEINSLITTDMCSSLVHLLPMMQINFKGLQSHLKKCGGKYNQILAFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SQEKYKTLQCLNIPEINSLITTDMCSSLVHLLPMMQINFKGLQSHLKKCGGKYNQILAFR
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD PTGWTHSNKFTRIADVIPQTKGNISIYGIPYSEHSSYLEMKRFVQWLKPQKIIPTVNVGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PTGWTHSNKFTRIADVIPQTKGNISIYGIPYSEHSSYLEMKRFVQWLKPQKIIPTVNVGT
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040
pF1KSD WKSRSTMEKYFREWKLEAGY
::::::::::::::::::::
NP_055 WKSRSTMEKYFREWKLEAGY
1030 1040
>>NP_001258745 (OMIM: 609682) DNA cross-link repair 1A p (1040 aa)
initn: 6986 init1: 6986 opt: 6986 Z-score: 7012.3 bits: 1309.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6986; 100.0% identity (100.0% similar) in 1040 aa overlap (1-1040:1-1040)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLEDISEEDIWEYKSKRKPKRVDPNNGSKNILKSVEKATDGKYQSKRSRNRKRAAEAKEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLEDISEEDIWEYKSKRKPKRVDPNNGSKNILKSVEKATDGKYQSKRSRNRKRAAEAKEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KDHEVPLGNAGCQTSVASSQNSSCGDGIQQTQDKETTPGKLCRTQKSQHVSPKIRPVYDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KDHEVPLGNAGCQTSVASSQNSSCGDGIQQTQDKETTPGKLCRTQKSQHVSPKIRPVYDG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD YCPNCQMPFSSLIGQTPRWHVFECLDSPPRSETECPDGLLCTSTIPFHYKRYTHFLLAQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YCPNCQMPFSSLIGQTPRWHVFECLDSPPRSETECPDGLLCTSTIPFHYKRYTHFLLAQS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RAGDHPFSSPSPASGGSFSETKSGVLCSLEERWSSYQNQTDNSVSNDPLLMTQYFKKSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RAGDHPFSSPSPASGGSFSETKSGVLCSLEERWSSYQNQTDNSVSNDPLLMTQYFKKSPS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LTEASEKISTHIQTSQQALQFTDFVENDKLVGVALRLANNSEHINLPLPENDFSDCEISY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTEASEKISTHIQTSQQALQFTDFVENDKLVGVALRLANNSEHINLPLPENDFSDCEISY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SPLQSDEDTHDIDEKPDDSQEQLFFTESSKDGSLEEDDDSCGFFKKRHGPLLKDQDESCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPLQSDEDTHDIDEKPDDSQEQLFFTESSKDGSLEEDDDSCGFFKKRHGPLLKDQDESCP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KVNSFLTRDKYDEGLYRFNSLNDLSQPISQNNESTLPYDLACTGGDFVLFPPALAGKLAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KVNSFLTRDKYDEGLYRFNSLNDLSQPISQNNESTLPYDLACTGGDFVLFPPALAGKLAA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SVHQATKAKPDEPEFHSAQSNKQKQVIEESSVYNQVSLPLVKSLMLKPFESQVEGYLSSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVHQATKAKPDEPEFHSAQSNKQKQVIEESSVYNQVSLPLVKSLMLKPFESQVEGYLSSQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD PTQNTIRKLSSENLNAKNNTNSACFCRKALEGVPVGKATILNTENLSSTPAPKYLKILPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PTQNTIRKLSSENLNAKNNTNSACFCRKALEGVPVGKATILNTENLSSTPAPKYLKILPS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD GLKYNARHPSTKVMKQMDIGVYFGLPPKRKEEKLLGESALEGINLNPVPSPNQKRSSQCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLKYNARHPSTKVMKQMDIGVYFGLPPKRKEEKLLGESALEGINLNPVPSPNQKRSSQCK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD RKAEKSLSDLEFDASTLHESQLSVELSSERSQRQKKRCRKSNSLQEGACQKRSDHLINTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RKAEKSLSDLEFDASTLHESQLSVELSSERSQRQKKRCRKSNSLQEGACQKRSDHLINTE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD SEAVNLSKVKVFTKSAHGGLQRGNKKIPESSNVGGSRKKTCPFYKKIPGTGFTVDAFQYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SEAVNLSKVKVFTKSAHGGLQRGNKKIPESSNVGGSRKKTCPFYKKIPGTGFTVDAFQYG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD VVEGCTAYFLTHFHSDHYAGLSKHFTFPVYCSEITGNLLKNKLHVQEQYIHPLPLDTECI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVEGCTAYFLTHFHSDHYAGLSKHFTFPVYCSEITGNLLKNKLHVQEQYIHPLPLDTECI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD VNGVKVVLLDANHCPGAVMILFYLPNGTVILHTGDFRADPSMERSLLADQKVHMLYLDTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VNGVKVVLLDANHCPGAVMILFYLPNGTVILHTGDFRADPSMERSLLADQKVHMLYLDTT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD YCSPEYTFPSQQEVIRFAINTAFEAVTLNPHALVVCGTYSIGKEKVFLAIADVLGSKVGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SQEKYKTLQCLNIPEINSLITTDMCSSLVHLLPMMQINFKGLQSHLKKCGGKYNQILAFR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PTGWTHSNKFTRIADVIPQTKGNISIYGIPYSEHSSYLEMKRFVQWLKPQKIIPTVNVGT
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NP_001 WKSRSTMEKYFREWKLEAGY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_006 PTGWTHSNKFTRIADVIPQTKGNISIYGIPYSEHSSYLEMKRFVQWLKPQKIIPTVNVGT
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pF1KSD WKSRSTMEKYFREWKLEAGY
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XP_006 WKSRSTMEKYFREWKLEAGY
1030 1040
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:: : ..:: .. . .::.:.:::
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: .:::. .. :.::: ::..::. .:.:..:.: : :::: : . . :.:
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::::::::.::.:: :: ::.::::: ::: : .: ...: ::::.: :.:
NP_073 LDANHCPGSVMFLFEGYFGT-ILYTGDFRYTPSMLKEPALTLGKQIHTLYLDNTNCNPAL
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pF1KSD TFPSQQEVIRFAINTAFEAVTLNPHALVVCGTYSIGKEKVFLAIADVLGSKVGMSQEKYK
..::.:: : . . . .:. . : ::.:::... .: . . : .: .. .
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pF1KSD TLQCLNIPEINSLITTDMCSSLVHLLPMMQINFKGLQSHLKKCGGKYNQILAFRPTGWTH
.: :.. .. .:.. .. .: . :.: ... ..:: .::
NP_073 LVQLLGLADV---FTVEEKAGRIHAVDHMEICHSNML--------RWNQT---HPT----
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:: ..: .. .. .:. ::::.:::: :.. :: ::: ...: :.
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pF1KSD SRSTMEKYFREWKLEAGY
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. .::: .: .:: . : . .. : . ..: .. : :
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:.:: :.::::.::.:: :::: :.::::: :. : : . .. .
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:::::.:.:. : .::..: . ... . .: .: :.. . . : : .: ...
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:: .: .. : . :.::: .::: .. .: : . :. :.: ::
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. :.: ....: : : .. .: ..:: .: :. : : .: :::: :.: :..
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.: : . :.: :::
XP_011 YLCPVNAYPNVIPVGTTMDKVVEILKPLCRSSQSTEPKYKPLGKLKRARTVHRDSGTE
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. .::: .: .:: . : . .. : . ..: .. : :
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:.:: :.::::.::.:: :::: :.::::: :. : : . .. .
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pF1KSD YLDTTYCSPE-YTFPSQQEVIRFAINTAFEAVTLNP-HALVVCGTYSIGKEKVFLAIADV
:::::.:.:. : .::..: . ... . .: .: :.. . . : : .: ...
XP_016 YLDTTFCDPRFYQIPSREECLSGVLELVRSWITRSPYHVVWLNCKAAYGYEYLFTNLSEE
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:: .: .. : . :.::: .::: .. .: : . :. :.: ::
XP_016 LGVQVHVN----KLDMFRNMPEILHHLTTDR-NTQIHACRHPKAEEYFQ--WSKLP-CGI
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pF1KSD GKYNQI----LAFRP-TGWTHSNKFTRIADVIPQTKGNISIYGIPYSEHSSYLEMKRFVQ
. :.: ....: : : .. .: ..:: .: :. : : .: :::: :.: :..
XP_016 TSRNRIPLHIISIKPSTMWF--GERSRKTNVIVRT-GESS-YRACFSFHSSYSEIKDFLS
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.: : . :.: :::
XP_016 YLCPVNAYPNVIPVGTTMDKVVEILKPLCRSSQSTEPKYKPLGKLKRARTVHRDSEEEDD
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..: :. ... ::::.: :.::. ::
NP_001 MSSFEGQMAEYPTISIDRFDRENLRA-RAYFLSHCHKDHMKGLR
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. .::: .: .:: . : . .. : . ..: .. : :
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:.:: :.::::.::.:: :::: :.::::: :. : : . .. .
NP_001 EEIVVTLLPAGHCPGSVMFLFQGNNGTV-LYTGDFRLAQGEAARMELLHSGGRVKDIQSV
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:::::.:.:. : .::..: . ... . .: .: :.. . . : : .: ...
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pF1KSD LGSKVGMSQEKYKTLQCLNIPEINSLITTDMCSSLVHLL--PMMQINFKGLQSHLKKCG-
:: .: .. : . :.::: .::: .. .: : . :. :.: ::
NP_001 LGVQVHVN----KLDMFRNMPEILHHLTTDR-NTQIHACRHPKAEEYFQ--WSKLP-CGI
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pF1KSD GKYNQI----LAFRP-TGWTHSNKFTRIADVIPQTKGNISIYGIPYSEHSSYLEMKRFVQ
. :.: ....: : : .. .: ..:: .: :. : : .: :::: :.: :..
NP_001 TSRNRIPLHIISIKPSTMWF--GERSRKTNVIVRT-GESS-YRACFSFHSSYSEIKDFLS
280 290 300 310 320 330
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pF1KSD WLKPQKIIPTV-NVGTWKSRSTMEKYFREWKLEAGY
.: : . :.: :::
NP_001 YLCPVNAYPNVIPVGTTMDKVVEILKPLCRSSQSTEPKYKPLGKLKRARTVHRDSEEEDD
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pF1KSD GNKKIPESSNVGGSRKKTCPFYKKIPGTGFTVDAFQYGVVEGCTAYFLTHFHSDHYAGLS
..: :. ... ::::.: :.::. ::
XP_011 MSSFEGQMAEYPTISIDRFDRENLRA-RAYFLSHCHKDHMKGLR
10 20 30 40
750 760 770 780
pF1KSD K---------HFTFPVYCSEITGNLL--KNKLHVQEQYIHPLPLDTECIVN------GVK
. .::: .: .:: . : . .. : . ..: .. : :
XP_011 APTLKRRLECSLKVYLYCSPVTKELLLTSPKYRFWKKRIISIEIETPTQISLVDEASGEK
50 60 70 80 90 100
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pF1KSD ----VVLLDANHCPGAVMILFYLPNGTVILHTGDFR-ADPSMERSLLAD-----QKVHML
:.:: :.::::.::.:: :::: :.::::: :. : : . .. .
XP_011 EEIVVTLLPAGHCPGSVMFLFQGNNGTV-LYTGDFRLAQGEAARMELLHSGGRVKDIQSV
110 120 130 140 150 160
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pF1KSD YLDTTYCSPE-YTFPSQQEVIRFAINTAFEAVTLNP-HALVVCGTYSIGKEKVFLAIADV
:::::.:.:. : .::..: . ... . .: .: :.. . . : : .: ...
XP_011 YLDTTFCDPRFYQIPSREECLSGVLELVRSWITRSPYHVVWLNCKAAYGYEYLFTNLSEE
170 180 190 200 210 220
900 910 920 930 940 950
pF1KSD LGSKVGMSQEKYKTLQCLNIPEINSLITTDMCSSLVHLL--PMMQINFKGLQSHLKKCG-
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