Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0080
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0080, 431 aa
1>>>pF1KSDA0080 431 - 431 aa - 431 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2399+/-0.000438; mu= 12.7973+/- 0.027
mean_var=123.0567+/-25.385, 0's: 0 Z-trim(114.3): 307 B-trim: 410 in 1/50
Lambda= 0.115617
statistics sampled from 23679 (24117) to 23679 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.662), E-opt: 0.2 (0.283), width: 16
Scan time: 7.350
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_689493 (OMIM: 608741) synaptotagmin-11 [Homo sa ( 431) 2851 487.3 3.3e-137
XP_016856248 (OMIM: 608741) PREDICTED: synaptotagm ( 434) 2830 483.8 3.8e-136
XP_005245071 (OMIM: 608741) PREDICTED: synaptotagm ( 430) 2826 483.1 6e-136
NP_065834 (OMIM: 600103) synaptotagmin-4 [Homo sap ( 425) 1497 261.4 3.2e-69
XP_006723404 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 383) 815 147.6 5.2e-35
NP_001284703 (OMIM: 600782) synaptotagmin-5 isofor ( 382) 811 146.9 8.2e-35
XP_016882665 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 386) 797 144.6 4.2e-34
NP_003171 (OMIM: 600782) synaptotagmin-5 isoform 1 ( 386) 797 144.6 4.2e-34
XP_006723402 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 386) 797 144.6 4.2e-34
XP_016882664 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 386) 797 144.6 4.2e-34
XP_006723403 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 385) 793 143.9 6.6e-34
XP_005269170 (OMIM: 185605) PREDICTED: synaptotagm ( 419) 788 143.1 1.3e-33
XP_006719639 (OMIM: 185605) PREDICTED: synaptotagm ( 419) 788 143.1 1.3e-33
NP_001278830 (OMIM: 185605) synaptotagmin-1 isofor ( 419) 788 143.1 1.3e-33
NP_796376 (OMIM: 600104,616040) synaptotagmin-2 [H ( 419) 787 143.0 1.4e-33
XP_016855802 (OMIM: 600104,616040) PREDICTED: syna ( 419) 787 143.0 1.4e-33
NP_001129976 (OMIM: 600104,616040) synaptotagmin-2 ( 419) 787 143.0 1.4e-33
XP_016855799 (OMIM: 600104,616040) PREDICTED: syna ( 476) 787 143.0 1.5e-33
NP_005630 (OMIM: 185605) synaptotagmin-1 isoform 1 ( 422) 785 142.6 1.8e-33
XP_011537012 (OMIM: 185605) PREDICTED: synaptotagm ( 422) 785 142.6 1.8e-33
NP_001129277 (OMIM: 185605) synaptotagmin-1 isofor ( 422) 785 142.6 1.8e-33
XP_016875398 (OMIM: 185605) PREDICTED: synaptotagm ( 422) 785 142.6 1.8e-33
NP_001129278 (OMIM: 185605) synaptotagmin-1 isofor ( 422) 785 142.6 1.8e-33
XP_016855801 (OMIM: 600104,616040) PREDICTED: syna ( 422) 783 142.3 2.3e-33
XP_011507494 (OMIM: 600104,616040) PREDICTED: syna ( 422) 783 142.3 2.3e-33
XP_016855800 (OMIM: 600104,616040) PREDICTED: syna ( 422) 783 142.3 2.3e-33
XP_016855798 (OMIM: 600104,616040) PREDICTED: syna ( 479) 783 142.4 2.5e-33
XP_006718799 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 293) 773 140.5 5.5e-33
NP_004191 (OMIM: 604146) synaptotagmin-7 isoform 2 ( 403) 774 140.8 6.2e-33
XP_011543645 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 409) 774 140.8 6.2e-33
NP_001287702 (OMIM: 604146) synaptotagmin-7 isofor ( 447) 774 140.8 6.6e-33
XP_005274444 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 449) 774 140.8 6.7e-33
XP_011543643 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 453) 774 140.8 6.7e-33
NP_001238994 (OMIM: 604146) synaptotagmin-7 isofor ( 478) 774 140.9 7e-33
XP_011543642 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 484) 774 140.9 7e-33
XP_011543641 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 528) 774 140.9 7.5e-33
XP_005274442 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 611) 774 141.0 8.3e-33
XP_011543640 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 617) 774 141.0 8.4e-33
XP_005274441 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 642) 774 141.0 8.6e-33
XP_011543639 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 648) 774 141.0 8.7e-33
XP_011543638 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 651) 774 141.0 8.7e-33
XP_005274440 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 686) 774 141.0 9e-33
XP_011543637 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 692) 774 141.0 9.1e-33
NP_001257734 (OMIM: 607718) synaptotagmin-6 [Homo ( 425) 750 136.8 1e-31
NP_995320 (OMIM: 607718) synaptotagmin-6 [Homo sap ( 425) 750 136.8 1e-31
XP_016855860 (OMIM: 607718) PREDICTED: synaptotagm ( 443) 750 136.8 1.1e-31
XP_011525692 (OMIM: 600327) PREDICTED: synaptotagm ( 590) 724 132.6 2.6e-30
NP_115674 (OMIM: 600327) synaptotagmin-3 [Homo sap ( 590) 724 132.6 2.6e-30
XP_011525693 (OMIM: 600327) PREDICTED: synaptotagm ( 590) 724 132.6 2.6e-30
NP_001153801 (OMIM: 600327) synaptotagmin-3 [Homo ( 590) 724 132.6 2.6e-30
>>NP_689493 (OMIM: 608741) synaptotagmin-11 [Homo sapien (431 aa)
initn: 2851 init1: 2851 opt: 2851 Z-score: 2584.3 bits: 487.3 E(85289): 3.3e-137
Smith-Waterman score: 2851; 99.8% identity (100.0% similar) in 431 aa overlap (1-431:1-431)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAEITNIRPSFDVSPVVAGLIGASVLVVCVSVTVFVWSCCHQQAEKKHKNPPYKFIHMLK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
NP_689 MAEITNIRPSFDVSPVVAGLIGASVLVVCVSVTVFVWSCCHQQAEKKQKNPPYKFIHMLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GISIYPETLSNKKKIIKVRRDKDGPGREGGRRNLLVDAAEAGLLSRDKDPRGPSSGSCID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 GISIYPETLSNKKKIIKVRRDKDGPGREGGRRNLLVDAAEAGLLSRDKDPRGPSSGSCID
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD QLPIKMDYGEELRSPITSLTPGESKTTSPSSPEEDVMLGSLTFSVDYNFPKKALVVTIQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 QLPIKMDYGEELRSPITSLTPGESKTTSPSSPEEDVMLGSLTFSVDYNFPKKALVVTIQE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD AHGLPVMDDQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRKTLDPVFDETFTFYGIPYSQLQDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 AHGLPVMDDQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRKTLDPVFDETFTFYGIPYSQLQDL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VLHFLVLSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGKVQLTRDIIKRNIQKCISRGELQVSLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 VLHFLVLSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGKVQLTRDIIKRNIQKCISRGELQVSLS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD YQPVAQRMTVVVLKARHLPKMDITGLSGNPYVKVNVYYGRKRIAKKKTHVKKCTLNPIFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 YQPVAQRMTVVVLKARHLPKMDITGLSGNPYVKVNVYYGRKRIAKKKTHVKKCTLNPIFN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ESFIYDIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRLILGAHSVTASGAEHWREVCESPRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 ESFIYDIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRLILGAHSVTASGAEHWREVCESPRK
370 380 390 400 410 420
430
pF1KSD PVAKWHSLSEY
:::::::::::
NP_689 PVAKWHSLSEY
430
>>XP_016856248 (OMIM: 608741) PREDICTED: synaptotagmin-1 (434 aa)
initn: 2157 init1: 2157 opt: 2830 Z-score: 2565.3 bits: 483.8 E(85289): 3.8e-136
Smith-Waterman score: 2830; 98.8% identity (99.3% similar) in 434 aa overlap (1-431:1-434)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAEITNIRPSFDVSPVVAGLIGASVLVVCVSVTVFVWSCCHQQAEKKHKNPPYKFIHMLK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
XP_016 MAEITNIRPSFDVSPVVAGLIGASVLVVCVSVTVFVWSCCHQQAEKKQKNPPYKFIHMLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GISIYPETLSNKKKIIKVRRDKDGPGREGGRRNLLVDAAEAGLLSRDKDPRGPSSGSCID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GISIYPETLSNKKKIIKVRRDKDGPGREGGRRNLLVDAAEAGLLSRDKDPRGPSSGSCID
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD QLPIKMDYGEELRSPITSLTPGESKTTSPSSPEEDVMLGSLTFSVDYNFPKKALVVTIQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QLPIKMDYGEELRSPITSLTPGESKTTSPSSPEEDVMLGSLTFSVDYNFPKKALVVTIQE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD AHGLPVMDDQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRKTLDPVFDETFTFYGIPYSQLQDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AHGLPVMDDQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRKTLDPVFDETFTFYGIPYSQLQDL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VLHFLVLSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGKVQLTRDIIKRNIQKCISRGELQVSLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VLHFLVLSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGKVQLTRDIIKRNIQKCISRGELQVSLS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KSD YQPVAQRMTVVVLKARHLPKMDITGLSG---NPYVKVNVYYGRKRIAKKKTHVKKCTLNP
:::::::::::::::::::::::::::: .::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YQPVAQRMTVVVLKARHLPKMDITGLSGRAPDPYVKVNVYYGRKRIAKKKTHVKKCTLNP
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD IFNESFIYDIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRLILGAHSVTASGAEHWREVCES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IFNESFIYDIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRLILGAHSVTASGAEHWREVCES
370 380 390 400 410 420
420 430
pF1KSD PRKPVAKWHSLSEY
::::::::::::::
XP_016 PRKPVAKWHSLSEY
430
>>XP_005245071 (OMIM: 608741) PREDICTED: synaptotagmin-1 (430 aa)
initn: 2149 init1: 2149 opt: 2826 Z-score: 2561.7 bits: 483.1 E(85289): 6e-136
Smith-Waterman score: 2826; 99.3% identity (99.8% similar) in 431 aa overlap (1-431:1-430)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAEITNIRPSFDVSPVVAGLIGASVLVVCVSVTVFVWSCCHQQAEKKHKNPPYKFIHMLK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
XP_005 MAEITNIRPSFDVSPVVAGLIGASVLVVCVSVTVFVWSCCHQQAEKKQKNPPYKFIHMLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GISIYPETLSNKKKIIKVRRDKDGPGREGGRRNLLVDAAEAGLLSRDKDPRGPSSGSCID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GISIYPETLSNKKKIIKVRRDKDGPGREGGRRNLLVDAAEAGLLSRDKDPRGPSSGSCID
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD QLPIKMDYGEELRSPITSLTPGESKTTSPSSPEEDVMLGSLTFSVDYNFPKKALVVTIQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QLPIKMDYGEELRSPITSLTPGESKTTSPSSPEEDVMLGSLTFSVDYNFPKKALVVTIQE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD AHGLPVMDDQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRKTLDPVFDETFTFYGIPYSQLQDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AHGLPVMDDQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRKTLDPVFDETFTFYGIPYSQLQDL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VLHFLVLSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGKVQLTRDIIKRNIQKCISRGELQVSLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VLHFLVLSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGKVQLTRDIIKRNIQKCISRGELQVSLS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD YQPVAQRMTVVVLKARHLPKMDITGLSGNPYVKVNVYYGRKRIAKKKTHVKKCTLNPIFN
::::::::::::::::::::::::::: .:::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YQPVAQRMTVVVLKARHLPKMDITGLS-DPYVKVNVYYGRKRIAKKKTHVKKCTLNPIFN
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ESFIYDIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRLILGAHSVTASGAEHWREVCESPRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ESFIYDIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRLILGAHSVTASGAEHWREVCESPRK
360 370 380 390 400 410
430
pF1KSD PVAKWHSLSEY
:::::::::::
XP_005 PVAKWHSLSEY
420 430
>>NP_065834 (OMIM: 600103) synaptotagmin-4 [Homo sapiens (425 aa)
initn: 1124 init1: 825 opt: 1497 Z-score: 1363.8 bits: 261.4 E(85289): 3.2e-69
Smith-Waterman score: 1497; 53.0% identity (79.5% similar) in 434 aa overlap (1-430:1-424)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAEITNIRPSFDVSPVVAGLIGASVLVVCVSVTVFVWSCCHQQAEKKHKNPPYKFIHMLK
:: ::. : :: :.:.:...: :: ::. :.: ::.... :..:.:::::.:.::
NP_065 MAPITTSREEFDEIPTVVGIFSAFGLVFTVSL--FAWICCQRKSSKSNKTPPYKFVHVLK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KSD GISIYPETLSNKKKIIKVRRD--KDGPGREGGRRNLLVDAAEAGLLSR-DKDPRGPSSGS
:..::::.:..:::. .. :. :. . .: .: . : . : :.: :
NP_065 GVDIYPENLNSKKKFGADDKNEVKNKPAVP--KNSLHLDLEKRDLNGNFPKTNLKPGSPS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD CIDQLPIKMDYGEELRSPITSLTPGESKT-TSPSSPEEDVMLGSLTFSVDYNFPKKALVV
... :. :.. :..: :. :: .: :.. ::.: ::..::: .::.::
NP_065 DLENATPKL----FLEGEKESVSPESLKSSTSLTSEEKQEKLGTLFFSLEYNFERKAFVV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD TIQEAHGLPVMDDQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRKTLDPVFDETFTFYGIPYSQ
.:.::.:::.::.:.. :::::::::::.:.:.::::::::::::.::::::::::::.:
NP_065 NIKEARGLPAMDEQSMTSDPYIKMTILPEKKHKVKTRVLRKTLDPAFDETFTFYGIPYTQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD LQDLVLHFLVLSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGKVQLTRDIIKRNIQKCISRGELQ
.:.:.::: .::::::::::.::::..::.:.. : ::. ..:.:::::..: .::::
NP_065 IQELALHFTILSFDRFSRDDIIGEVLIPLSGIELSEGKMLMNREIIKRNVRKSSGRGELL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD VSLSYQPVAQRMTVVVLKARHLPKMDITGLSGNPYVKVNVYYGRKRIAKKKTHVKKCTLN
.:: :: ... .:::::::::::: :..::: .::::::.:...:::.:::::::::: :
NP_065 ISLCYQSTTNTLTVVVLKARHLPKSDVSGLS-DPYVKVNLYHAKKRISKKKTHVKKCTPN
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD PIFNESFIYDIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRLILGAHSVTASGAEHWREVCE
.::: :..::: . : :::.::::.: .: ..:::.:.:.::: .. ..:.:::.:.:.
NP_065 AVFNELFVFDIPCEGLEDISVEFLVLDSERGSRNEVIGQLVLGA-AAEGTGGEHWKEICD
360 370 380 390 400 410
420 430
pF1KSD SPRKPVAKWHSLSEY
::. .:::: : .
NP_065 YPRRQIAKWHVLCDG
420
>>XP_006723404 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagmin-5 (383 aa)
initn: 737 init1: 253 opt: 815 Z-score: 749.5 bits: 147.6 E(85289): 5.2e-35
Smith-Waterman score: 815; 41.7% identity (68.0% similar) in 331 aa overlap (108-428:48-371)
80 90 100 110 120 130
pF1KSD VRRDKDGPGREGGRRNLLVDAAEAGLLSRDKDPRGPSSGSCIDQLPIKMDYGEELRSPIT
:: : : : : : . .: .:..
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140 150 160 170 180
pF1KSD SLTPG-----ESKTTSPSSPEEDVM----LGSLTFSVDYNFPKKALVVTIQEAHGLPVMD
: : : .::.: ..: :: : .:.::.: . :.: : .: :: ..:
XP_006 SATAQVQPEVEELEPAPSGPGQQVADKHELGRLQYSLDYDFQSGQLLVGILQAMGLAALD
80 90 100 110 120 130
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRKTLDPVFDETFTFYGIPYSQLQDLVLHFLVLS
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XP_006 -LGGSSDPYVRVYLLPDKRRRYETKVHRQTLNPHFGETFAFK-VPYVELGGRVLVMAVYD
140 150 160 170 180 190
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pF1KSD FDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGK-VQLTRDIIKRNIQKCISRGELQVSLSYQPVAQR
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200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KSD MTVVVLKARHLPKMDITGLSGNPYVKVNVYYGRKRIAKKKTHVKKCTLNPIFNESFIYDI
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XP_006 LTVIVLEAKNLKKMDVGGLS-DPYVKVHLLQGGKKVRKKKTTIKKNTLNPYYNEAFSFEV
260 270 280 290 300 310
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pF1KSD PTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRLILGAHSVTASGAEHWREVCESPRKPVAKWHS
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XP_006 PCDQVQKVQVELTVLDYDKLGKNEAIGRVAVGA-AAGGAGLRHWADMLANPRRPIAQWHS
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430
pF1KSD LSEY
:
XP_006 LRPPDRVRLLPAP
380
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pF1KSD VRRDKDGPGREGGRRNLLVDAAEAGLLSRDKDPRGPSSGSCIDQLPIKMDYGEELRSPIT
:: : : : : : . .: .:..
NP_001 HGSWSSLLCVGLKGRLGWEWGTRVLECLCRKDSRTPPPCSRSPQ-PRGLHRPTRLPTPVA
20 30 40 50 60 70
140 150 160 170 180
pF1KSD SLTPG-----ESKTTSPSSPEEDVM----LGSLTFSVDYNFPKKALVVTIQEAHGLPVMD
: : : .::.: ..: :: : .:.::.: . :.: : .: :: ..:
NP_001 SATAQVQPEVEELEPAPSGPGQQVADKHELGRLQYSLDYDFQSGQLLVGILQAMGLAALD
80 90 100 110 120 130
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pF1KSD DQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRKTLDPVFDETFTFYGIPYSQLQDLVLHFLVLS
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NP_001 -LGGSSDPYVRVYLLPDKRRRYETKVHRQTLNPHFGETFAFK-VPYVELGGRVLVMAVYD
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pF1KSD FDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGK-VQLTRDI--IKRNIQKCISRGELQVSLSYQPVA
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pF1KSD QRMTVVVLKARHLPKMDITGLSGNPYVKVNVYYGRKRIAKKKTHVKKCTLNPIFNESFIY
..::.::.:..: :::. ::: .:::::.. : :.. :::: .:: :::: .::.: .
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pF1KSD DIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRLILGAHSVTASGAEHWREVCESPRKPVAKW
..: : . ...:. :.:.:. :::..::. .:: .. ..: .:: .. .::.:.:.:
NP_001 EVPCDQVQKVQVELTVLDYDKLGKNEAIGRVAVGA-AAGGAGLRHWADMLANPRRPIAQW
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pF1KSD HSLSEY
:::
NP_001 HSLRPPDRVRLLPAP
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pF1KSD LLSRDKDPRGPSSGSCIDQLPIKMDYGEELRSPITSLTPG-ESKTTSPSSPEEDVM----
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pF1KSD LGSLTFSVDYNFPKKALVVTIQEAHGLPVMDDQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRK
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XP_016 LGRLQYSLDYDFQSGQLLVGILQAMGLAALD-LGGSSDPYVRVYLLPDKRRRYETKVHRQ
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pF1KSD TLDPVFDETFTFYGIPYSQLQDLVLHFLVLSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGK-VQ
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pF1KSD LTRDIIKRNIQKCISRGELQVSLSYQPVAQRMTVVVLKARHLPKMDITGLSGNPYVKVNV
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XP_016 AWRELQAAPREEQEKLGDICFSLRYVPTAGKLTVIVLEAKNLKKMDVGGLS-DPYVKVHL
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pF1KSD YYGRKRIAKKKTHVKKCTLNPIFNESFIYDIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRL
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XP_016 LQGGKKVRKKKTTIKKNTLNPYYNEAFSFEVPCDQVQKVQVELTVLDYDKLGKNEAIGRV
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pF1KSD ILGAHSVTASGAEHWREVCESPRKPVAKWHSLSEY
.:: .. ..: .:: .. .::.:.:.::::
XP_016 AVGA-AAGGAGLRHWADMLANPRRPIAQWHSLRPPDRVRLLPAP
350 360 370 380
>>NP_003171 (OMIM: 600782) synaptotagmin-5 isoform 1 [Ho (386 aa)
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Smith-Waterman score: 797; 43.0% identity (71.2% similar) in 302 aa overlap (133-428:79-374)
110 120 130 140 150
pF1KSD LLSRDKDPRGPSSGSCIDQLPIKMDYGEELRSPITSLTPG-ESKTTSPSSPEEDVM----
.: : .. : : .::.: ..:
NP_003 CLYRKSCRRRTGKKSQAQAQVHLQEVKGLGQSYIDKVQPEVEELEPAPSGPGQQVADKHE
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pF1KSD LGSLTFSVDYNFPKKALVVTIQEAHGLPVMDDQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRK
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NP_003 LGRLQYSLDYDFQSGQLLVGILQAMGLAALD-LGGSSDPYVRVYLLPDKRRRYETKVHRQ
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pF1KSD TLDPVFDETFTFYGIPYSQLQDLVLHFLVLSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGK-VQ
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NP_003 TLNPHFGETFAFK-VPYVELGGRVLVMAVYDFDRFSRNDAIGEVRVPMSSVD--LGRPVQ
170 180 190 200 210 220
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pF1KSD LTRDIIKRNIQKCISRGELQVSLSYQPVAQRMTVVVLKARHLPKMDITGLSGNPYVKVNV
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NP_003 AWRELQAAPREEQEKLGDICFSLRYVPTAGKLTVIVLEAKNLKKMDVGGLS-DPYVKVHL
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pF1KSD YYGRKRIAKKKTHVKKCTLNPIFNESFIYDIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRL
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NP_003 LQGGKKVRKKKTTIKKNTLNPYYNEAFSFEVPCDQVQKVQVELTVLDYDKLGKNEAIGRV
290 300 310 320 330 340
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pF1KSD ILGAHSVTASGAEHWREVCESPRKPVAKWHSLSEY
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NP_003 AVGA-AAGGAGLRHWADMLANPRRPIAQWHSLRPPDRVRLLPAP
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initn: 666 init1: 253 opt: 797 Z-score: 733.3 bits: 144.6 E(85289): 4.2e-34
Smith-Waterman score: 797; 43.0% identity (71.2% similar) in 302 aa overlap (133-428:79-374)
110 120 130 140 150
pF1KSD LLSRDKDPRGPSSGSCIDQLPIKMDYGEELRSPITSLTPG-ESKTTSPSSPEEDVM----
.: : .. : : .::.: ..:
XP_006 CLYRKSCRRRTGKKSQAQAQVHLQEVKGLGQSYIDKVQPEVEELEPAPSGPGQQVADKHE
50 60 70 80 90 100
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pF1KSD LGSLTFSVDYNFPKKALVVTIQEAHGLPVMDDQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRK
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XP_006 LGRLQYSLDYDFQSGQLLVGILQAMGLAALD-LGGSSDPYVRVYLLPDKRRRYETKVHRQ
110 120 130 140 150 160
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pF1KSD TLDPVFDETFTFYGIPYSQLQDLVLHFLVLSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGK-VQ
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XP_006 TLNPHFGETFAFK-VPYVELGGRVLVMAVYDFDRFSRNDAIGEVRVPMSSVD--LGRPVQ
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XP_006 AWRELQAAPREEQEKLGDICFSLRYVPTAGKLTVIVLEAKNLKKMDVGGLS-DPYVKVHL
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pF1KSD YYGRKRIAKKKTHVKKCTLNPIFNESFIYDIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRL
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XP_006 LQGGKKVRKKKTTIKKNTLNPYYNEAFSFEVPCDQVQKVQVELTVLDYDKLGKNEAIGRV
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pF1KSD ILGAHSVTASGAEHWREVCESPRKPVAKWHSLSEY
.:: .. ..: .:: .. .::.:.:.::::
XP_006 AVGA-AAGGAGLRHWADMLANPRRPIAQWHSLRPPDRVRLLPAP
350 360 370 380
>>XP_016882664 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagmin-5 (386 aa)
initn: 666 init1: 253 opt: 797 Z-score: 733.3 bits: 144.6 E(85289): 4.2e-34
Smith-Waterman score: 797; 43.0% identity (71.2% similar) in 302 aa overlap (133-428:79-374)
110 120 130 140 150
pF1KSD LLSRDKDPRGPSSGSCIDQLPIKMDYGEELRSPITSLTPG-ESKTTSPSSPEEDVM----
.: : .. : : .::.: ..:
XP_016 CLYRKSCRRRTGKKSQAQAQVHLQEVKGLGQSYIDKVQPEVEELEPAPSGPGQQVADKHE
50 60 70 80 90 100
160 170 180 190 200 210
pF1KSD LGSLTFSVDYNFPKKALVVTIQEAHGLPVMDDQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRK
:: : .:.::.: . :.: : .: :: ..: .::::... .:::::.: .:.: :.
XP_016 LGRLQYSLDYDFQSGQLLVGILQAMGLAALD-LGGSSDPYVRVYLLPDKRRRYETKVHRQ
110 120 130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KSD TLDPVFDETFTFYGIPYSQLQDLVLHFLVLSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGK-VQ
::.: : :::.: .:: .: :: . : .::::::.:.:::: ::...:: :. ::
XP_016 TLNPHFGETFAFK-VPYVELGGRVLVMAVYDFDRFSRNDAIGEVRVPMSSVD--LGRPVQ
170 180 190 200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KSD LTRDIIKRNIQKCISRGELQVSLSYQPVAQRMTVVVLKARHLPKMDITGLSGNPYVKVNV
:.. .. . :.. :: : :.: ..::.::.:..: :::. ::: .:::::..
XP_016 AWRELQAAPREEQEKLGDICFSLRYVPTAGKLTVIVLEAKNLKKMDVGGLS-DPYVKVHL
230 240 250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
pF1KSD YYGRKRIAKKKTHVKKCTLNPIFNESFIYDIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRL
: :.. :::: .:: :::: .::.: ...: : . ...:. :.:.:. :::..::.
XP_016 LQGGKKVRKKKTTIKKNTLNPYYNEAFSFEVPCDQVQKVQVELTVLDYDKLGKNEAIGRV
290 300 310 320 330 340
400 410 420 430
pF1KSD ILGAHSVTASGAEHWREVCESPRKPVAKWHSLSEY
.:: .. ..: .:: .. .::.:.:.::::
XP_016 AVGA-AAGGAGLRHWADMLANPRRPIAQWHSLRPPDRVRLLPAP
350 360 370 380
431 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]