Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0050
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0050, 740 aa
1>>>pF1KSDA0050 740 - 740 aa - 740 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1654+/-0.000471; mu= 4.1831+/- 0.030
mean_var=331.2036+/-66.576, 0's: 0 Z-trim(120.2): 214 B-trim: 609 in 2/51
Lambda= 0.070474
statistics sampled from 34961 (35214) to 34961 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.733), E-opt: 0.2 (0.413), width: 16
Scan time: 10.340
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055531 (OMIM: 607763) arf-GAP with coiled-coil, ( 740) 4937 516.5 1.5e-145
NP_036419 (OMIM: 607766) arf-GAP with coiled-coil, ( 778) 1872 204.9 9.9e-52
XP_006713620 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 785) 1828 200.5 2.2e-50
XP_011510905 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 813) 1799 197.5 1.7e-49
XP_011510904 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 820) 1775 195.1 9.5e-49
XP_011510908 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 776) 757 91.6 1.3e-17
XP_011510906 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 776) 757 91.6 1.3e-17
XP_011510907 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 776) 757 91.6 1.3e-17
XP_016861536 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 841) 757 91.6 1.4e-17
XP_016861535 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 848) 757 91.6 1.4e-17
XP_016861538 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 806) 753 91.2 1.8e-17
XP_016861537 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 813) 753 91.2 1.8e-17
XP_016867224 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 462) 445 59.6 3.4e-08
XP_016867222 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 527) 445 59.7 3.7e-08
XP_005250000 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 565) 445 59.7 3.8e-08
XP_016867223 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 580) 445 59.7 3.9e-08
NP_001268229 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, A ( 580) 445 59.7 3.9e-08
XP_016867221 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 630) 445 59.8 4.1e-08
XP_011514082 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 683) 445 59.8 4.3e-08
NP_060177 (OMIM: 616594) arf-GAP with SH3 domain, ( 903) 446 60.0 4.8e-08
XP_016857174 (OMIM: 616594) PREDICTED: arf-GAP wit ( 924) 446 60.0 4.9e-08
XP_016857175 (OMIM: 616594) PREDICTED: arf-GAP wit ( 905) 445 59.9 5.2e-08
NP_114152 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, ANK ( 911) 445 59.9 5.2e-08
XP_011540057 (OMIM: 616594) PREDICTED: arf-GAP wit ( 926) 445 59.9 5.3e-08
XP_016857176 (OMIM: 616594) PREDICTED: arf-GAP wit ( 883) 442 59.6 6.3e-08
XP_016857177 (OMIM: 616594) PREDICTED: arf-GAP wit ( 793) 434 58.8 1e-07
XP_016857178 (OMIM: 616594) PREDICTED: arf-GAP wit ( 774) 433 58.6 1.1e-07
NP_001137250 (OMIM: 616594) arf-GAP with SH3 domai ( 894) 426 58.0 2e-07
NP_055729 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, ANK ( 804) 407 56.0 7e-07
XP_005246116 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit ( 808) 407 56.0 7e-07
NP_001032208 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, A ( 857) 407 56.0 7.3e-07
XP_006712298 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit ( 882) 407 56.1 7.4e-07
XP_006712297 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit ( 886) 407 56.1 7.4e-07
XP_011508851 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1073) 407 56.2 8.4e-07
XP_011508850 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1098) 407 56.2 8.5e-07
XP_016858771 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1106) 407 56.2 8.6e-07
XP_011508849 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1126) 407 56.2 8.7e-07
XP_006712300 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1147) 407 56.2 8.8e-07
XP_006712302 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1151) 407 56.2 8.8e-07
NP_055585 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, ANK ( 836) 381 53.4 4.5e-06
XP_005268683 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP wit ( 856) 381 53.4 4.5e-06
XP_005268682 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP wit (1172) 381 53.6 5.6e-06
XP_016874261 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP wit (1192) 381 53.6 5.6e-06
NP_001116244 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, A (1192) 381 53.6 5.6e-06
XP_011508711 (OMIM: 603817) PREDICTED: arf-GAP wit ( 891) 350 50.3 4.1e-05
XP_011508710 (OMIM: 603817) PREDICTED: arf-GAP wit ( 959) 350 50.3 4.3e-05
NP_001128663 (OMIM: 603817) arf-GAP with SH3 domai ( 961) 350 50.3 4.3e-05
XP_006711965 (OMIM: 603817) PREDICTED: arf-GAP wit ( 964) 350 50.3 4.4e-05
XP_006711964 (OMIM: 603817) PREDICTED: arf-GAP wit ( 970) 350 50.3 4.4e-05
XP_011508709 (OMIM: 603817) PREDICTED: arf-GAP wit ( 975) 350 50.3 4.4e-05
>>NP_055531 (OMIM: 607763) arf-GAP with coiled-coil, ANK (740 aa)
initn: 4937 init1: 4937 opt: 4937 Z-score: 2734.1 bits: 516.5 E(85289): 1.5e-145
Smith-Waterman score: 4937; 100.0% identity (100.0% similar) in 740 aa overlap (1-740:1-740)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MTVKLDFEECLKDSPRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTGLLESGRHYLAASRAFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MTVKLDFEECLKDSPRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTGLLESGRHYLAASRAFV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD VGICDLARLGPPEPMMAECLEKFTVSLNHKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VGICDLARLGPPEPMMAECLEKFTVSLNHKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRGF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD REARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 REARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD EDKRKFDIMEFVLRLVEAQATHFQQGHEELSRLSQYRKELGAQLHQLVLNSAREKRDMEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EDKRKFDIMEFVLRLVEAQATHFQQGHEELSRLSQYRKELGAQLHQLVLNSAREKRDMEQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RHVLLKQKELGGEEPEPSLREGPGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSRRWFTIQSNQLVYQKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RHVLLKQKELGGEEPEPSLREGPGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSRRWFTIQSNQLVYQKK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD YKDPVTVVVDDLRLCTVKLCPDSERRFCFEVVSTSKSCLLQADSERLLQLWVSAVQSSIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 YKDPVTVVVDDLRLCTVKLCPDSERRFCFEVVSTSKSCLLQADSERLLQLWVSAVQSSIA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SAFSQARLDDSPRGPGQGSGHLAIGSAATLGSGGMARGREPGGVGHVVAQVQSVDGNAQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SAFSQARLDDSPRGPGQGSGHLAIGSAATLGSGGMARGREPGGVGHVVAQVQSVDGNAQC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD CDCREPAPEWASINLGVTLCIQCSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDSWEPELVKLMCELGNVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 CDCREPAPEWASINLGVTLCIQCSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDSWEPELVKLMCELGNVI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD INQIYEARVEAMAVKKPGPSCSRQEKEAWIHAKYVEKKFLTKLPEIRGRRGGRGRPRGQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 INQIYEARVEAMAVKKPGPSCSRQEKEAWIHAKYVEKKFLTKLPEIRGRRGGRGRPRGQP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PVPPKPSIRPRPGSLRSKPEPPSEDLGSLHPGALLFRASGHPPSLPTMADALAHGADVNW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PVPPKPSIRPRPGSLRSKPEPPSEDLGSLHPGALLFRASGHPPSLPTMADALAHGADVNW
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD VNGGQDNATPLIQATAANSLLACEFLLQNGANVNQADSAGRGPLHHATILGHTGLACLFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VNGGQDNATPLIQATAANSLLACEFLLQNGANVNQADSAGRGPLHHATILGHTGLACLFL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KRGADLGARDSEGRDPLTIAMETANADIVTLLRLAKMREAEAAQGQAGDETYLDIFRDFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KRGADLGARDSEGRDPLTIAMETANADIVTLLRLAKMREAEAAQGQAGDETYLDIFRDFS
670 680 690 700 710 720
730 740
pF1KSD LMASDDPEKLSRRSHDLHTL
::::::::::::::::::::
NP_055 LMASDDPEKLSRRSHDLHTL
730 740
>>NP_036419 (OMIM: 607766) arf-GAP with coiled-coil, ANK (778 aa)
initn: 2432 init1: 709 opt: 1872 Z-score: 1049.7 bits: 204.9 E(85289): 9.9e-52
Smith-Waterman score: 2479; 51.6% identity (75.0% similar) in 779 aa overlap (1-732:1-770)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MTVKLDFEECLKDSPRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTGLLESGRHYLAASRAFV
: . .::::::::::::::..: ::..:.::: .:.::.:: .....:. . .:.. :.
NP_036 MKMTVDFEECLKDSPRFRAALEEVEGDVAELELKLDKLVKLCIAMIDTGKAFCVANKQFM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD VGICDLARLGPPEPMMAECLEKFTVSLNHKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRGF
:: :::. . . .. : ::. ::.. .. :. :.: ::.... :.:..::: :: :
NP_036 NGIRDLAQYSSNDAVVETSLTKFSDSLQEMINFHTILFDQTQRSIKAQLQNFVKEDLRKF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD REARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVI
..:...: . .: : ::..::.: : . .:.::: : ..: .: ::::.:::::.
NP_036 KDAKKQFEKVSEEKENALVKNAQVQRNKQHEVEEATNILTATRKCFRHIALDYVLQINVL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD EDKRKFDIMEFVLRLVEAQATHFQQGHEELSRLSQYRKELGAQLHQLVLNSAREKRDMEQ
..::. .:.. .: .. :. . :.::.. .:.:. : :.::::: .::...:.:::.:::
NP_036 QSKRRSEILKSMLSFMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYMKDLGAQLDRLVVDAAKEKREMEQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KSD RHVLLKQKELGGEEPEPSLR-EGPGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSRRWFTIQSNQLVYQK
.: ..::...... . .. .:.::::.::::::::::::.::::.::.:::::::
NP_036 KHSTIQQKDFSSDDSKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRASNAFKTWNRRWFSIQNNQLVYQK
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD KYKDPVTVVVDDLRLCTVKLCPDSERRFCFEVVSTSKSCLLQADSERLLQLWVSAVQSSI
:.:: ::::.:::::::: : : :::::::::: .:::.::::::.: : :..:::.::
NP_036 KFKDNPTVVVEDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSPTKSCMLQADSEKLRQAWIKAVQTSI
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD ASAFSQARLDDSPRGPGQGSGHLAIGSAATLGSGGMARGREPGGVGHVVAQVQSVDGNAQ
:.:. . . :.: . ..: :...: ::. .. . : . .. .:: . :::.
NP_036 ATAYRE-KGDESEKLDKKSSP-----STGSLDSGNESKEKLLKGES-ALQRVQCIPGNAS
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD CCDCREPAPEWASINLGVTLCIQCSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDSWEPELVKLMCELGNV
:::: :.:::::::.::::.:::::::::::::::::::::.:::::.::::::::
NP_036 CCDCGLADPRWASINLGITLCIECSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDTWEPELLKLMCELGND
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD IINQIYEARVEAMAVKKPGPSCSRQEKEAWIHAKYVEKKFLTKL------PEIRGRRGGR
.::..::: :: :..::: :. .::::::.:.:::::.::. : :: . . ..
NP_036 VINRVYEANVEKMGIKKPQPG-QRQEKEAYIRAKYVERKFVDKYSISLSPPEQQKKFVSK
480 490 500 510 520 530
540 550 560
pF1KSD GR-----------PRGQPPVPPKPSIR-----------------PRPGSLRSKPEPPSE-
. : : . . :.: : : : :: .:
NP_036 SSEEKRLSISKFGPGDQVRASAQSSVRSNDSGIQQSSDDGRESLPSTVSANSLYEPEGER
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610
pF1KSD -------DLGSLHPGALLFRASGHPPSLPTMADALAHGADVNWVNGGQDNATPLIQATAA
: :.:: :.::: . .:: ::.::::::::::.:. ...:::::::. .
NP_036 QDSSMFLDSKHLNPGLQLYRAS-YEKNLPKMAEALAHGADVNWANSEENKATPLIQAVLG
600 610 620 630 640 650
620 630 640 650 660 670
pF1KSD NSLLACEFLLQNGANVNQADSAGRGPLHHATILGHTGLACLFLKRGADLGARDSEGRDPL
.::..::::::::::::: : :::::::::.::::: .::::::::. : : ::.:::
NP_036 GSLVTCEFLLQNGANVNQRDVQGRGPLHHATVLGHTGQVCLFLKRGANQHATDEEGKDPL
660 670 680 690 700 710
680 690 700 710 720 730
pF1KSD TIAMETANADIVTLLRLAKM----REAEAAQGQAGDETYLDIFRDFSLMASDDPEKLSRR
.::.:.::::::::::::.: ::.:. :: ::::: ::::::: :::..::::.:
NP_036 SIAVEAANADIVTLLRLARMNEEMRESEGLYGQPGDETYQDIFRDFSQMASNNPEKLNRF
720 730 740 750 760 770
740
pF1KSD SHDLHTL
NP_036 QQDSQKF
>>XP_006713620 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP with co (785 aa)
initn: 2310 init1: 709 opt: 1828 Z-score: 1025.5 bits: 200.5 E(85289): 2.2e-50
Smith-Waterman score: 2430; 51.0% identity (74.1% similar) in 781 aa overlap (1-727:1-772)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MTVKLDFEECLKDSPRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTGLLESGRHYLAASRAFV
: . .::::::::::::::..: ::..:.::: .:.::.:: .....:. . .:.. :.
XP_006 MKMTVDFEECLKDSPRFRAALEEVEGDVAELELKLDKLVKLCIAMIDTGKAFCVANKQFM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD VGICDLARLGPPEPMMAECLEKFTVSLNHKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRGF
:: :::. . . .. : ::. ::.. .. :. :.: ::.... :.:..::: :: :
XP_006 NGIRDLAQYSSNDAVVETSLTKFSDSLQEMINFHTILFDQTQRSIKAQLQNFVKEDLRKF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD REARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVI
..:...: . .: : ::..::.: : . .:.::: : ..: .: ::::.:::::.
XP_006 KDAKKQFEKVSEEKENALVKNAQVQRNKQHEVEEATNILTATRKCFRHIALDYVLQINVL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD EDKRKFDIMEFVLRLVEAQATHFQQGHEELSRLSQYRKELGAQLHQLVLNSAREKRDMEQ
..::. .:.. .: .. :. . :.::.. .:.:. : :.::::: .::...:.:::.:::
XP_006 QSKRRSEILKSMLSFMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYMKDLGAQLDRLVVDAAKEKREMEQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KSD RHVLLKQKELGGEEPEPSLR-EGPGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSR-------RWFTIQS
.: ..::...... . .. .:.::::.::::::::::::.: :::.::.
XP_006 KHSTIQQKDFSSDDSKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRASNAFKTWNRKKPDHIRRWFSIQN
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD NQLVYQKKYKDPVTVVVDDLRLCTVKLCPDSERRFCFEVVSTSKSCLLQADSERLLQLWV
::::::::.:: ::::.:::::::: : : :::::::::: .:::.::::::.: : :.
XP_006 NQLVYQKKFKDNPTVVVEDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSPTKSCMLQADSEKLRQAWI
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD SAVQSSIASAFSQARLDDSPRGPGQGSGHLAIGSAATLGSGGMARGREPGGVGHVVAQVQ
.:::.:::.:. . . :.: . ..: :...: ::. .. . : . .. .::
XP_006 KAVQTSIATAYRE-KGDESEKLDKKSSP-----STGSLDSGNESKEKLLKGES-ALQRVQ
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD SVDGNAQCCDCREPAPEWASINLGVTLCIQCSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDSWEPELVKL
. :::.:::: :.:::::::.::::.:::::::::::::::::::::.:::::.::
XP_006 CIPGNASCCDCGLADPRWASINLGITLCIECSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDTWEPELLKL
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520
pF1KSD MCELGNVIINQIYEARVEAMAVKKPGPSCSRQEKEAWIHAKYVEKKFLTKL------PEI
:::::: .::..::: :: :..::: :. .::::::.:.:::::.::. : ::
XP_006 MCELGNDVINRVYEANVEKMGIKKPQPG-QRQEKEAYIRAKYVERKFVDKYSISLSPPEQ
480 490 500 510 520 530
530 540 550
pF1KSD RGRRGGRGR-----------PRGQPPVPPKPSIR-----------------PRPGSLRSK
. . ... : : . . :.: : : :
XP_006 QKKFVSKSSEEKRLSISKFGPGDQVRASAQSSVRSNDSGIQQSSDDGRESLPSTVSANSL
540 550 560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KSD PEPPSE--------DLGSLHPGALLFRASGHPPSLPTMADALAHGADVNWVNGGQDNATP
:: .: : :.:: :.::: . .:: ::.::::::::::.:. ...:::
XP_006 YEPEGERQDSSMFLDSKHLNPGLQLYRAS-YEKNLPKMAEALAHGADVNWANSEENKATP
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620 630 640 650 660 670
pF1KSD LIQATAANSLLACEFLLQNGANVNQADSAGRGPLHHATILGHTGLACLFLKRGADLGARD
::::. ..::..::::::::::::: : :::::::::.::::: .::::::::. : :
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680 690 700 710 720
pF1KSD SEGRDPLTIAMETANADIVTLLRLAKM----REAEAAQGQAGDETYLDIFRDFSLMASDD
::.:::.::.:.::::::::::::.: ::.:. :: ::::: ::::::: :::..
XP_006 EEGKDPLSIAVEAANADIVTLLRLARMNEEMRESEGLYGQPGDETYQDIFRDFSQMASNN
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730 740
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:
XP_006 PEKLNRFQQDSQKF
780
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: . .::::::::::::::..: ::..:.::: .:.::.:: .....:. . .:.. :.
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:: :::. . . .. : ::. ::.. .. :. :.: ::.... :.:..::: :: :
XP_011 NGIRDLAQYSSNDAVVETSLTKFSDSLQEMINFHTILFDQTQRSIKAQLQNFVKEDLRKF
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..:...: . .: : ::..::.: : . .:.::: : ..: .: ::::.:::::.
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..::. .:.. .: .. :. . :.::.. .:.:. : :.::::: .::...:.:::.:::
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.: ..::...... . .. .:.::::.::::::::::::.::::.::.:::::::
XP_011 KHSTIQQKDFSSDDSKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRASNAFKTWNRRWFSIQNNQLVYQK
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:.:. . . :.: . ..: :...: ::. .. . : . .. .:: . :::.
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:::: :.:::::::.::::.:::::::::::::::::::::.:::::.::::::::
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pF1KSD IINQIYEARVEAMAVKKPGPSCSRQEKEAWIHAKYVEKKFLTKL------PEIRGR----
.::..::: :: :..::: :. .::::::.:.:::::.::. : :: . .
XP_011 VINRVYEANVEKMGIKKPQPG-QRQEKEAYIRAKYVERKFVDKYSISLSPPEQQKKFVSK
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pF1KSD ----------RGGRG---RPRGQPPV---------------PPK--------------PS
. : : : .: : : . :
XP_011 SSEEKRLSISKFGPGDQVRASAQSSVIAVNSDEARRESLFCPDELDSLFSYFDTSSKLRS
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550 560 570 580
pF1KSD IR-----------------PRPGSLRSKPEPPSE--------DLGSLHPGALLFRASGHP
:: : : : :: .: : :.:: :.::: .
XP_011 IRSNDSGIQQSSDDGRESLPSTVSANSLYEPEGERQDSSMFLDSKHLNPGLQLYRAS-YE
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pF1KSD PSLPTMADALAHGADVNWVNGGQDNATPLIQATAANSLLACEFLLQNGANVNQADSAGRG
.:: ::.::::::::::.:. ...:::::::. ..::..::::::::::::: : :::
XP_011 KNLPKMAEALAHGADVNWANSEENKATPLIQAVLGGSLVTCEFLLQNGANVNQRDVQGRG
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650 660 670 680 690 700
pF1KSD PLHHATILGHTGLACLFLKRGADLGARDSEGRDPLTIAMETANADIVTLLRLAKMREAEA
::::::.::::: .::::::::. : : ::.:::.::.:.::::::::::::.: :
XP_011 PLHHATVLGHTGQVCLFLKRGANQHATDEEGKDPLSIAVEAANADIVTLLRLARMNEEMR
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XP_011 MKMTVDFEECLKDSPRFRAALEEVEGDVAELELKLDKLVKLCIAMIDTGKAFCVANKQFM
10 20 30 40 50 60
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:: :::. . . .. : ::. ::.. .. :. :.: ::.... :.:..::: :: :
XP_011 NGIRDLAQYSSNDAVVETSLTKFSDSLQEMINFHTILFDQTQRSIKAQLQNFVKEDLRKF
70 80 90 100 110 120
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pF1KSD REARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVI
..:...: . .: : ::..::.: : . .:.::: : ..: .: ::::.:::::.
XP_011 KDAKKQFEKVSEEKENALVKNAQVQRNKQHEVEEATNILTATRKCFRHIALDYVLQINVL
130 140 150 160 170 180
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pF1KSD EDKRKFDIMEFVLRLVEAQATHFQQGHEELSRLSQYRKELGAQLHQLVLNSAREKRDMEQ
..::. .:.. .: .. :. . :.::.. .:.:. : :.::::: .::...:.:::.:::
XP_011 QSKRRSEILKSMLSFMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYMKDLGAQLDRLVVDAAKEKREMEQ
190 200 210 220 230 240
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.: ..::...... . .. .:.::::.::::::::::::.: :::.::.
XP_011 KHSTIQQKDFSSDDSKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRASNAFKTWNRKKPDHIRRWFSIQN
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XP_011 NQLVYQKKFKDNPTVVVEDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSPTKSCMLQADSEKLRQAWI
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.:::.:::.:. . . :.: . ..: :...: ::. .. . : . .. .::
XP_011 KAVQTSIATAYRE-KGDESEKLDKKSSP-----STGSLDSGNESKEKLLKGES-ALQRVQ
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. :::.:::: :.:::::::.::::.:::::::::::::::::::::.:::::.::
XP_011 CIPGNASCCDCGLADPRWASINLGITLCIECSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDTWEPELLKL
420 430 440 450 460 470
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:::::: .::..::: :: :..::: :. .::::::.:.:::::.::. : ::
XP_011 MCELGNDVINRVYEANVEKMGIKKPQPG-QRQEKEAYIRAKYVERKFVDKYSISLSPPEQ
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530 540
pF1KSD RGR--------------RGGRG---RPRGQPPV---------------PPK---------
. . . : : : .: : : .
XP_011 QKKFVSKSSEEKRLSISKFGPGDQVRASAQSSVIAVNSDEARRESLFCPDELDSLFSYFD
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550 560 570
pF1KSD -----PSIR-----------------PRPGSLRSKPEPPSE--------DLGSLHPGALL
::: : : : :: .: : :.:: :
XP_011 TSSKLRSIRSNDSGIQQSSDDGRESLPSTVSANSLYEPEGERQDSSMFLDSKHLNPGLQL
600 610 620 630 640 650
580 590 600 610 620 630
pF1KSD FRASGHPPSLPTMADALAHGADVNWVNGGQDNATPLIQATAANSLLACEFLLQNGANVNQ
.::: . .:: ::.::::::::::.:. ...:::::::. ..::..:::::::::::::
XP_011 YRAS-YEKNLPKMAEALAHGADVNWANSEENKATPLIQAVLGGSLVTCEFLLQNGANVNQ
660 670 680 690 700 710
640 650 660 670 680 690
pF1KSD ADSAGRGPLHHATILGHTGLACLFLKRGADLGARDSEGRDPLTIAMETANADIVTLLRLA
: :::::::::.::::: .::::::::. : : ::.:::.::.:.::::::::::::
XP_011 RDVQGRGPLHHATVLGHTGQVCLFLKRGANQHATDEEGKDPLSIAVEAANADIVTLLRLA
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pF1KSD KMREAEAAQGQAGDETYLDIFRDFSLMASDDPEKLSRRSHDLHTL
.
XP_011 RMNEEMRESEGLYGQPGDETYQDIFRDFSQMASNNPEKLNRFQQDSQKF
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>>XP_011510908 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP with co (776 aa)
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.. : ::. ::.. .. :. :.: ::.... :.:..::: :: :..:...: . .:
XP_011 VVETSLTKFSDSLQEMINFHTILFDQTQRSIKAQLQNFVKEDLRKFKDAKKQFEKVSEEK
40 50 60 70 80 90
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pF1KSD EAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVIEDKRKFDIMEFVLR
: ::..::.: : . .:.::: : ..: .: ::::.:::::...::. .:.. .:
XP_011 ENALVKNAQVQRNKQHEVEEATNILTATRKCFRHIALDYVLQINVLQSKRRSEILKSMLS
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pF1KSD LVEAQATHFQQGHEELSRLSQYRKELGAQLHQLVLNSAREKRDMEQRHVLLKQKELGGEE
.. :. . :.::.. .:.:. : :.::::: .::...:.:::.:::.: ..::......
XP_011 FMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYMKDLGAQLDRLVVDAAKEKREMEQKHSTIQQKDFSSDD
160 170 180 190 200 210
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pF1KSD PEPSLR-EGPGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSR-------RWFTIQSNQLVYQKKYKDPVT
. .. .:.::::.::::::::::::.: :::.::.::::::::.:: :
XP_011 SKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRASNAFKTWNRKKPDHIRRWFSIQNNQLVYQKKFKDNPT
220 230 240 250 260 270
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pF1KSD VVVDDLRLCTVKLCPDSERRFCFEVVSTSKSCLLQADSERLLQLWVSAVQSSIASAFSQA
:::.:::::::: : : :::::::::: .:::.::::::.: : :..:::.:::.:. .
XP_011 VVVEDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSPTKSCMLQADSEKLRQAWIKAVQTSIATAYRE-
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pF1KSD RLDDSPRGPGQGSGHLAIGSAATLGSGGMARGREPGGVGHVVAQVQSVDGNAQCCDCREP
. :.: . ..: :...: ::. .. . : . .. .:: . :::.::::
XP_011 KGDESEKLDKKSS-----PSTGSLDSGNESKEKLLKGES-ALQRVQCIPGNASCCDCGLA
330 340 350 360 370 380
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:.:::::::.::::.:::::::::::::::::::::.:::::.:::::::: .::..::
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: :: :..::: :. .::::::.:.:::::.::. : :: . .
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pF1KSD ---RGGRG---RPRGQPPV---------------PPK--------------PSIR-----
. : : : .: : : . :::
XP_011 SISKFGPGDQVRASAQSSVIAVNSDEARRESLFCPDELDSLFSYFDTSSKLRSIRSNDSG
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pF1KSD ------------PRPGSLRSKPEPPSE--------DLGSLHPGALLFRASGHPPSLPTMA
: : : :: .: : :.:: :.::: . .:: ::
XP_011 IQQSSDDGRESLPSTVSANSLYEPEGERQDSSMFLDSKHLNPGLQLYRAS-YEKNLPKMA
570 580 590 600 610 620
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pF1KSD DALAHGADVNWVNGGQDNATPLIQATAANSLLACEFLLQNGANVNQADSAGRGPLHHATI
.::::::::::.:. ...:::::::. ..::..::::::::::::: : :::::::::.
XP_011 EALAHGADVNWANSEENKATPLIQAVLGGSLVTCEFLLQNGANVNQRDVQGRGPLHHATV
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650 660 670 680 690 700
pF1KSD LGHTGLACLFLKRGADLGARDSEGRDPLTIAMETANADIVTLLRLAKM----REAEAAQG
::::: .::::::::. : : ::.:::.::.:.::::::::::::.: ::.:. :
XP_011 LGHTGQVCLFLKRGANQHATDEEGKDPLSIAVEAANADIVTLLRLARMNEEMRESEGLYG
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710 720 730 740
pF1KSD QAGDETYLDIFRDFSLMASDDPEKLSRRSHDLHTL
: ::::: ::::::: :::..::::.: ..:
XP_011 QPGDETYQDIFRDFSQMASNNPEKLNRFQQDSQKF
750 760 770
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initn: 2196 init1: 566 opt: 757 Z-score: 437.0 bits: 91.6 E(85289): 1.3e-17
Smith-Waterman score: 2216; 48.8% identity (70.6% similar) in 781 aa overlap (45-736:1-772)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD PRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTGLLESGRHYLAASRAFVVGICDLARLGPPEP
....:. . .:.. :. :: :::. . .
XP_011 MIDTGKAFCVANKQFMNGIRDLAQYSSNDA
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.. : ::. ::.. .. :. :.: ::.... :.:..::: :: :..:...: . .:
XP_011 VVETSLTKFSDSLQEMINFHTILFDQTQRSIKAQLQNFVKEDLRKFKDAKKQFEKVSEEK
40 50 60 70 80 90
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pF1KSD EAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVIEDKRKFDIMEFVLR
: ::..::.: : . .:.::: : ..: .: ::::.:::::...::. .:.. .:
XP_011 ENALVKNAQVQRNKQHEVEEATNILTATRKCFRHIALDYVLQINVLQSKRRSEILKSMLS
100 110 120 130 140 150
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pF1KSD LVEAQATHFQQGHEELSRLSQYRKELGAQLHQLVLNSAREKRDMEQRHVLLKQKELGGEE
.. :. . :.::.. .:.:. : :.::::: .::...:.:::.:::.: ..::......
XP_011 FMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYMKDLGAQLDRLVVDAAKEKREMEQKHSTIQQKDFSSDD
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300
pF1KSD PEPSLR-EGPGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSR-------RWFTIQSNQLVYQKKYKDPVT
. .. .:.::::.::::::::::::.: :::.::.::::::::.:: :
XP_011 SKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRASNAFKTWNRKKPDHIRRWFSIQNNQLVYQKKFKDNPT
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD VVVDDLRLCTVKLCPDSERRFCFEVVSTSKSCLLQADSERLLQLWVSAVQSSIASAFSQA
:::.:::::::: : : :::::::::: .:::.::::::.: : :..:::.:::.:. .
XP_011 VVVEDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSPTKSCMLQADSEKLRQAWIKAVQTSIATAYRE-
280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RLDDSPRGPGQGSGHLAIGSAATLGSGGMARGREPGGVGHVVAQVQSVDGNAQCCDCREP
. :.: . ..: :...: ::. .. . : . .. .:: . :::.::::
XP_011 KGDESEKLDKKSS-----PSTGSLDSGNESKEKLLKGES-ALQRVQCIPGNASCCDCGLA
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KSD APEWASINLGVTLCIQCSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDSWEPELVKLMCELGNVIINQIYE
:.:::::::.::::.:::::::::::::::::::::.:::::.:::::::: .::..::
XP_011 DPRWASINLGITLCIECSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDTWEPELLKLMCELGNDVINRVYE
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520
pF1KSD ARVEAMAVKKPGPSCSRQEKEAWIHAKYVEKKFLTKL------PEIRGR-----------
: :: :..::: :. .::::::.:.:::::.::. : :: . .
XP_011 ANVEKMGIKKPQPG-QRQEKEAYIRAKYVERKFVDKYSISLSPPEQQKKFVSKSSEEKRL
450 460 470 480 490 500
530 540
pF1KSD ---RGGRG---RPRGQPPV---------------PPK--------------PSIR-----
. : : : .: : : . :::
XP_011 SISKFGPGDQVRASAQSSVIAVNSDEARRESLFCPDELDSLFSYFDTSSKLRSIRSNDSG
510 520 530 540 550 560
550 560 570 580
pF1KSD ------------PRPGSLRSKPEPPSE--------DLGSLHPGALLFRASGHPPSLPTMA
: : : :: .: : :.:: :.::: . .:: ::
XP_011 IQQSSDDGRESLPSTVSANSLYEPEGERQDSSMFLDSKHLNPGLQLYRAS-YEKNLPKMA
570 580 590 600 610 620
590 600 610 620 630 640
pF1KSD DALAHGADVNWVNGGQDNATPLIQATAANSLLACEFLLQNGANVNQADSAGRGPLHHATI
.::::::::::.:. ...:::::::. ..::..::::::::::::: : :::::::::.
XP_011 EALAHGADVNWANSEENKATPLIQAVLGGSLVTCEFLLQNGANVNQRDVQGRGPLHHATV
630 640 650 660 670 680
650 660 670 680 690 700
pF1KSD LGHTGLACLFLKRGADLGARDSEGRDPLTIAMETANADIVTLLRLAKM----REAEAAQG
::::: .::::::::. : : ::.:::.::.:.::::::::::::.: ::.:. :
XP_011 LGHTGQVCLFLKRGANQHATDEEGKDPLSIAVEAANADIVTLLRLARMNEEMRESEGLYG
690 700 710 720 730 740
710 720 730 740
pF1KSD QAGDETYLDIFRDFSLMASDDPEKLSRRSHDLHTL
: ::::: ::::::: :::..::::.: ..:
XP_011 QPGDETYQDIFRDFSQMASNNPEKLNRFQQDSQKF
750 760 770
>>XP_011510907 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP with co (776 aa)
initn: 2196 init1: 566 opt: 757 Z-score: 437.0 bits: 91.6 E(85289): 1.3e-17
Smith-Waterman score: 2216; 48.8% identity (70.6% similar) in 781 aa overlap (45-736:1-772)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD PRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTGLLESGRHYLAASRAFVVGICDLARLGPPEP
....:. . .:.. :. :: :::. . .
XP_011 MIDTGKAFCVANKQFMNGIRDLAQYSSNDA
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KSD MMAECLEKFTVSLNHKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRGFREARRDFWRGAESL
.. : ::. ::.. .. :. :.: ::.... :.:..::: :: :..:...: . .:
XP_011 VVETSLTKFSDSLQEMINFHTILFDQTQRSIKAQLQNFVKEDLRKFKDAKKQFEKVSEEK
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KSD EAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVIEDKRKFDIMEFVLR
: ::..::.: : . .:.::: : ..: .: ::::.:::::...::. .:.. .:
XP_011 ENALVKNAQVQRNKQHEVEEATNILTATRKCFRHIALDYVLQINVLQSKRRSEILKSMLS
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KSD LVEAQATHFQQGHEELSRLSQYRKELGAQLHQLVLNSAREKRDMEQRHVLLKQKELGGEE
.. :. . :.::.. .:.:. : :.::::: .::...:.:::.:::.: ..::......
XP_011 FMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYMKDLGAQLDRLVVDAAKEKREMEQKHSTIQQKDFSSDD
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300
pF1KSD PEPSLR-EGPGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSR-------RWFTIQSNQLVYQKKYKDPVT
. .. .:.::::.::::::::::::.: :::.::.::::::::.:: :
XP_011 SKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRASNAFKTWNRKKPDHIRRWFSIQNNQLVYQKKFKDNPT
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD VVVDDLRLCTVKLCPDSERRFCFEVVSTSKSCLLQADSERLLQLWVSAVQSSIASAFSQA
:::.:::::::: : : :::::::::: .:::.::::::.: : :..:::.:::.:. .
XP_011 VVVEDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSPTKSCMLQADSEKLRQAWIKAVQTSIATAYRE-
280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RLDDSPRGPGQGSGHLAIGSAATLGSGGMARGREPGGVGHVVAQVQSVDGNAQCCDCREP
. :.: . ..: :...: ::. .. . : . .. .:: . :::.::::
XP_011 KGDESEKLDKKSS-----PSTGSLDSGNESKEKLLKGES-ALQRVQCIPGNASCCDCGLA
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KSD APEWASINLGVTLCIQCSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDSWEPELVKLMCELGNVIINQIYE
:.:::::::.::::.:::::::::::::::::::::.:::::.:::::::: .::..::
XP_011 DPRWASINLGITLCIECSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDTWEPELLKLMCELGNDVINRVYE
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520
pF1KSD ARVEAMAVKKPGPSCSRQEKEAWIHAKYVEKKFLTKL------PEIRGR-----------
: :: :..::: :. .::::::.:.:::::.::. : :: . .
XP_011 ANVEKMGIKKPQPG-QRQEKEAYIRAKYVERKFVDKYSISLSPPEQQKKFVSKSSEEKRL
450 460 470 480 490 500
530 540
pF1KSD ---RGGRG---RPRGQPPV---------------PPK--------------PSIR-----
. : : : .: : : . :::
XP_011 SISKFGPGDQVRASAQSSVIAVNSDEARRESLFCPDELDSLFSYFDTSSKLRSIRSNDSG
510 520 530 540 550 560
550 560 570 580
pF1KSD ------------PRPGSLRSKPEPPSE--------DLGSLHPGALLFRASGHPPSLPTMA
: : : :: .: : :.:: :.::: . .:: ::
XP_011 IQQSSDDGRESLPSTVSANSLYEPEGERQDSSMFLDSKHLNPGLQLYRAS-YEKNLPKMA
570 580 590 600 610 620
590 600 610 620 630 640
pF1KSD DALAHGADVNWVNGGQDNATPLIQATAANSLLACEFLLQNGANVNQADSAGRGPLHHATI
.::::::::::.:. ...:::::::. ..::..::::::::::::: : :::::::::.
XP_011 EALAHGADVNWANSEENKATPLIQAVLGGSLVTCEFLLQNGANVNQRDVQGRGPLHHATV
630 640 650 660 670 680
650 660 670 680 690 700
pF1KSD LGHTGLACLFLKRGADLGARDSEGRDPLTIAMETANADIVTLLRLAKM----REAEAAQG
::::: .::::::::. : : ::.:::.::.:.::::::::::::.: ::.:. :
XP_011 LGHTGQVCLFLKRGANQHATDEEGKDPLSIAVEAANADIVTLLRLARMNEEMRESEGLYG
690 700 710 720 730 740
710 720 730 740
pF1KSD QAGDETYLDIFRDFSLMASDDPEKLSRRSHDLHTL
: ::::: ::::::: :::..::::.: ..:
XP_011 QPGDETYQDIFRDFSQMASNNPEKLNRFQQDSQKF
750 760 770
>>XP_016861536 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP with co (841 aa)
initn: 2487 init1: 566 opt: 757 Z-score: 436.6 bits: 91.6 E(85289): 1.4e-17
Smith-Waterman score: 2161; 49.7% identity (70.3% similar) in 751 aa overlap (68-736:96-837)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD LLKLGTGLLESGRHYLAASRAFVVGICDLARLGPPEPMMAECLEKFTVSLNHKLDSHAEL
: : : . :: . . : .. . :
XP_016 LAQYSSNDAVVETSLTKFSDSLQEMINFHTRQGLPLSLRLECRGMIIALLWESSHLRMIL
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KSD LDATQHTLQQQIQTLVKEGLRGFREARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGA
.: ::.... :.:..::: :: :..:...: . .: : ::..::.: : . .:.:::
XP_016 FDQTQRSIKAQLQNFVKEDLRKFKDAKKQFEKVSEEKENALVKNAQVQRNKQHEVEEATN
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KSD ALRTARAGYRGRALDYALQINVIEDKRKFDIMEFVLRLVEAQATHFQQGHEELSRLSQYR
: ..: .: ::::.:::::...::. .:.. .: .. :. . :.::.. .:.:. :
XP_016 ILTATRKCFRHIALDYVLQINVLQSKRRSEILKSMLSFMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYM
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KSD KELGAQLHQLVLNSAREKRDMEQRHVLLKQKELGGEEPEPSLR-EGPGGLVMEGHLFKRA
:.::::: .::...:.:::.:::.: ..::...... . .. .:.::::.:::::
XP_016 KDLGAQLDRLVVDAAKEKREMEQKHSTIQQKDFSSDDSKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRA
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KSD SNAFKTWSRRWFTIQSNQLVYQKKYKDPVTVVVDDLRLCTVKLCPDSERRFCFEVVSTSK
:::::::.::::.::.::::::::.:: ::::.:::::::: : : :::::::::: .:
XP_016 SNAFKTWNRRWFSIQNNQLVYQKKFKDNPTVVVEDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSPTK
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KSD SCLLQADSERLLQLWVSAVQSSIASAFSQARLDDSPRGPGQGSGHLAIGSAATLGSGGMA
::.::::::.: : :..:::.:::.:. . . :.: . ..: :...: ::. .
XP_016 SCMLQADSEKLRQAWIKAVQTSIATAYRE-KGDESEKLDKKSSP-----STGSLDSGNES
370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KSD RGREPGGVGHVVAQVQSVDGNAQCCDCREPAPEWASINLGVTLCIQCSGIHRSLGVHFSK
. . : . .. .:: . :::.:::: :.:::::::.::::.::::::::::::::
XP_016 KEKLLKGES-ALQRVQCIPGNASCCDCGLADPRWASINLGITLCIECSGIHRSLGVHFSK
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KSD VRSLTLDSWEPELVKLMCELGNVIINQIYEARVEAMAVKKPGPSCSRQEKEAWIHAKYVE
:::::::.:::::.:::::::: .::..::: :: :..::: :. .::::::.:.:::::
XP_016 VRSLTLDTWEPELLKLMCELGNDVINRVYEANVEKMGIKKPQPG-QRQEKEAYIRAKYVE
480 490 500 510 520 530
520 530 540
pF1KSD KKFLTKL------PEIRGR--------------RGGRG---RPRGQPPV-----------
.::. : :: . . . : : : .: :
XP_016 RKFVDKYSISLSPPEQQKKFVSKSSEEKRLSISKFGPGDQVRASAQSSVIAVNSDEARRE
540 550 560 570 580 590
550 560
pF1KSD ----PPK--------------PSIR-----------------PRPGSLRSKPEPPSE---
: . ::: : : : :: .:
XP_016 SLFCPDELDSLFSYFDTSSKLRSIRSNDSGIQQSSDDGRESLPSTVSANSLYEPEGERQD
600 610 620 630 640 650
570 580 590 600 610
pF1KSD -----DLGSLHPGALLFRASGHPPSLPTMADALAHGADVNWVNGGQDNATPLIQATAANS
: :.:: :.::: . .:: ::.::::::::::.:. ...:::::::. ..:
XP_016 SSMFLDSKHLNPGLQLYRAS-YEKNLPKMAEALAHGADVNWANSEENKATPLIQAVLGGS
660 670 680 690 700 710
620 630 640 650 660 670
pF1KSD LLACEFLLQNGANVNQADSAGRGPLHHATILGHTGLACLFLKRGADLGARDSEGRDPLTI
:..::::::::::::: : :::::::::.::::: .::::::::. : : ::.:::.:
XP_016 LVTCEFLLQNGANVNQRDVQGRGPLHHATVLGHTGQVCLFLKRGANQHATDEEGKDPLSI
720 730 740 750 760 770
680 690 700 710 720 730
pF1KSD AMETANADIVTLLRLAKM----REAEAAQGQAGDETYLDIFRDFSLMASDDPEKLSRRSH
:.:.::::::::::::.: ::.:. :: ::::: ::::::: :::..::::.: ..
XP_016 AVEAANADIVTLLRLARMNEEMRESEGLYGQPGDETYQDIFRDFSQMASNNPEKLNRFQQ
780 790 800 810 820 830
740
pF1KSD DLHTL
:
XP_016 DSQKF
840
>>XP_016861535 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP with co (848 aa)
initn: 2358 init1: 566 opt: 757 Z-score: 436.6 bits: 91.6 E(85289): 1.4e-17
Smith-Waterman score: 2137; 49.2% identity (69.7% similar) in 758 aa overlap (68-736:96-844)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD LLKLGTGLLESGRHYLAASRAFVVGICDLARLGPPEPMMAECLEKFTVSLNHKLDSHAEL
: : : . :: . . : .. . :
XP_016 LAQYSSNDAVVETSLTKFSDSLQEMINFHTRQGLPLSLRLECRGMIIALLWESSHLRMIL
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KSD LDATQHTLQQQIQTLVKEGLRGFREARRDFWRGAESLEAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGA
.: ::.... :.:..::: :: :..:...: . .: : ::..::.: : . .:.:::
XP_016 FDQTQRSIKAQLQNFVKEDLRKFKDAKKQFEKVSEEKENALVKNAQVQRNKQHEVEEATN
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KSD ALRTARAGYRGRALDYALQINVIEDKRKFDIMEFVLRLVEAQATHFQQGHEELSRLSQYR
: ..: .: ::::.:::::...::. .:.. .: .. :. . :.::.. .:.:. :
XP_016 ILTATRKCFRHIALDYVLQINVLQSKRRSEILKSMLSFMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYM
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KSD KELGAQLHQLVLNSAREKRDMEQRHVLLKQKELGGEEPEPSLR-EGPGGLVMEGHLFKRA
:.::::: .::...:.:::.:::.: ..::...... . .. .:.::::.:::::
XP_016 KDLGAQLDRLVVDAAKEKREMEQKHSTIQQKDFSSDDSKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRA
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320
pF1KSD SNAFKTWSR-------RWFTIQSNQLVYQKKYKDPVTVVVDDLRLCTVKLCPDSERRFCF
:::::::.: :::.::.::::::::.:: ::::.:::::::: : : ::::::
XP_016 SNAFKTWNRKKPDHIRRWFSIQNNQLVYQKKFKDNPTVVVEDLRLCTVKHCEDIERRFCF
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KSD EVVSTSKSCLLQADSERLLQLWVSAVQSSIASAFSQARLDDSPRGPGQGSGHLAIGSAAT
:::: .:::.::::::.: : :..:::.:::.:. . . :.: . ..: :...
XP_016 EVVSPTKSCMLQADSEKLRQAWIKAVQTSIATAYRE-KGDESEKLDKKSSP-----STGS
370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KSD LGSGGMARGREPGGVGHVVAQVQSVDGNAQCCDCREPAPEWASINLGVTLCIQCSGIHRS
: ::. .. . : . .. .:: . :::.:::: :.:::::::.::::.:::::::
XP_016 LDSGNESKEKLLKGES-ALQRVQCIPGNASCCDCGLADPRWASINLGITLCIECSGIHRS
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KSD LGVHFSKVRSLTLDSWEPELVKLMCELGNVIINQIYEARVEAMAVKKPGPSCSRQEKEAW
::::::::::::::.:::::.:::::::: .::..::: :: :..::: :. .::::::.
XP_016 LGVHFSKVRSLTLDTWEPELLKLMCELGNDVINRVYEANVEKMGIKKPQPG-QRQEKEAY
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540
pF1KSD IHAKYVEKKFLTKL------PEIRGR--------------RGGRG---RPRGQPPV----
:.:::::.::. : :: . . . : : : .: :
XP_016 IRAKYVERKFVDKYSISLSPPEQQKKFVSKSSEEKRLSISKFGPGDQVRASAQSSVIAVN
540 550 560 570 580 590
550 560
pF1KSD -----------PPK--------------PSIR-----------------PRPGSLRSKPE
: . ::: : : : :
XP_016 SDEARRESLFCPDELDSLFSYFDTSSKLRSIRSNDSGIQQSSDDGRESLPSTVSANSLYE
600 610 620 630 640 650
570 580 590 600 610
pF1KSD PPSE--------DLGSLHPGALLFRASGHPPSLPTMADALAHGADVNWVNGGQDNATPLI
: .: : :.:: :.::: . .:: ::.::::::::::.:. ...:::::
XP_016 PEGERQDSSMFLDSKHLNPGLQLYRAS-YEKNLPKMAEALAHGADVNWANSEENKATPLI
660 670 680 690 700 710
620 630 640 650 660 670
pF1KSD QATAANSLLACEFLLQNGANVNQADSAGRGPLHHATILGHTGLACLFLKRGADLGARDSE
::. ..::..::::::::::::: : :::::::::.::::: .::::::::. : : :
XP_016 QAVLGGSLVTCEFLLQNGANVNQRDVQGRGPLHHATVLGHTGQVCLFLKRGANQHATDEE
720 730 740 750 760 770
680 690 700 710 720
pF1KSD GRDPLTIAMETANADIVTLLRLAKM----REAEAAQGQAGDETYLDIFRDFSLMASDDPE
:.:::.::.:.::::::::::::.: ::.:. :: ::::: ::::::: :::..::
XP_016 GKDPLSIAVEAANADIVTLLRLARMNEEMRESEGLYGQPGDETYQDIFRDFSQMASNNPE
780 790 800 810 820 830
730 740
pF1KSD KLSRRSHDLHTL
::.: ..:
XP_016 KLNRFQQDSQKF
840
740 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 23:38:46 2016 done: Wed Nov 2 23:38:47 2016
Total Scan time: 10.340 Total Display time: 0.250
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]