Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0031
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0031, 972 aa
1>>>pF1KSDA0031 972 - 972 aa - 972 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1828+/-0.00126; mu= 17.8211+/- 0.076
mean_var=99.9968+/-19.759, 0's: 0 Z-trim(103.6): 50 B-trim: 249 in 1/49
Lambda= 0.128257
statistics sampled from 7482 (7509) to 7482 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.584), E-opt: 0.2 (0.231), width: 16
Scan time: 3.090
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11489.1 EFTUD2 gene_id:9343|Hs108|chr17 ( 972) 6506 1215.5 0
CCDS45707.1 EFTUD2 gene_id:9343|Hs108|chr17 ( 937) 6265 1170.9 0
CCDS59295.1 EFTUD2 gene_id:9343|Hs108|chr17 ( 962) 5506 1030.4 0
CCDS12117.1 EEF2 gene_id:1938|Hs108|chr19 ( 858) 1738 333.2 1.4e-90
CCDS42071.1 EFL1 gene_id:79631|Hs108|chr15 (1120) 432 91.6 9.4e-18
>>CCDS11489.1 EFTUD2 gene_id:9343|Hs108|chr17 (972 aa)
initn: 6506 init1: 6506 opt: 6506 Z-score: 6507.2 bits: 1215.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6506; 100.0% identity (100.0% similar) in 972 aa overlap (1-972:1-972)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDTDLYDEFGNYIGPELDSDEDDDELGRETKDLDEMDDDDDDDDVGDHDDDHPGMEVVLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MDTDLYDEFGNYIGPELDSDEDDDELGRETKDLDEMDDDDDDDDVGDHDDDHPGMEVVLH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD EDKKYYPTAEEVYGPEVETIVQEEDTQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EDKKYYPTAEEVYGPEVETIVQEEDTQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKTCFVDCLIEQTHPEIRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKTCFVDCLIEQTHPEIRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD IKSTPVTVVLPDTKGKSYLFNIMDTPGHVNFSDEVTAGLRISDGVVLFIDAAEGVMLNTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IKSTPVTVVLPDTKGKSYLFNIMDTPGHVNFSDEVTAGLRISDGVVLFIDAAEGVMLNTE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RLIKHAVQERLAVTVCINKIDRLILELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLISMYSTDENLIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RLIKHAVQERLAVTVCINKIDRLILELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLISMYSTDENLIL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SPLLGNVCFSSSQYSICFTLGSFAKIYADTFGDINYQEFAKRLWGDIYFNPKTRKFTKKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SPLLGNVCFSSSQYSICFTLGSFAKIYADTFGDINYQEFAKRLWGDIYFNPKTRKFTKKA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD PTSSSQRSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHLTKEELKLNIRPLLRLVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PTSSSQRSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHLTKEELKLNIRPLLRLVC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVGAKPKIEHTYTGGVDSDLGEAMSDCDPDGPLMCHTTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVGAKPKIEHTYTGGVDSDLGEAMSDCDPDGPLMCHTTK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD MYSTDDGVQFHAFGRVLSGTIHAGQPVKVLGENYTLEDEEDSQICTVGRLWISVARYHIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MYSTDDGVQFHAFGRVLSGTIHAGQPVKVLGENYTLEDEEDSQICTVGRLWISVARYHIE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD VNRVPAGNWVLIEGVDQPIVKTATITEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAVEPVNPSEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VNRVPAGNWVLIEGVDQPIVKTATITEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAVEPVNPSEL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD PKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEIDIKVADPVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEIDIKVADPVV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD TFCETVVETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLEKGLAEDIENEVVQITWNRKKLGEFFQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TFCETVVETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLEKGLAEDIENEVVQITWNRKKLGEFFQT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD KYDWDLLAARSIWAFGPDATGPNILVDDTLPSEVDKALLGSVKDSIVQGFQWGTREGPLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KYDWDLLAARSIWAFGPDATGPNILVDDTLPSEVDKALLGSVKDSIVQGFQWGTREGPLC
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD DELIRNVKFKILDAVVAQEPLHRGGGQIIPTARRVVYSAFLMATPRLMEPYYFVEVQAPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DELIRNVKFKILDAVVAQEPLHRGGGQIIPTARRVVYSAFLMATPRLMEPYYFVEVQAPA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD DCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQGQAFSLSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQGQAFSLSV
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD FHHWQIVPGDPLDKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDVSISKFFDDPMLLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FHHWQIVPGDPLDKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDVSISKFFDDPMLLE
910 920 930 940 950 960
970
pF1KSD LAKQDVVLNYPM
::::::::::::
CCDS11 LAKQDVVLNYPM
970
>>CCDS45707.1 EFTUD2 gene_id:9343|Hs108|chr17 (937 aa)
initn: 6265 init1: 6265 opt: 6265 Z-score: 6266.4 bits: 1170.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6265; 100.0% identity (100.0% similar) in 937 aa overlap (36-972:1-937)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD YDEFGNYIGPELDSDEDDDELGRETKDLDEMDDDDDDDDVGDHDDDHPGMEVVLHEDKKY
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MDDDDDDDDVGDHDDDHPGMEVVLHEDKKY
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD YPTAEEVYGPEVETIVQEEDTQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLADLMDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YPTAEEVYGPEVETIVQEEDTQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLADLMDN
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SELIRNVTLCGHLHHGKTCFVDCLIEQTHPEIRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVGIKSTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SELIRNVTLCGHLHHGKTCFVDCLIEQTHPEIRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVGIKSTP
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VTVVLPDTKGKSYLFNIMDTPGHVNFSDEVTAGLRISDGVVLFIDAAEGVMLNTERLIKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VTVVLPDTKGKSYLFNIMDTPGHVNFSDEVTAGLRISDGVVLFIDAAEGVMLNTERLIKH
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD AVQERLAVTVCINKIDRLILELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLISMYSTDENLILSPLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AVQERLAVTVCINKIDRLILELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLISMYSTDENLILSPLLG
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD NVCFSSSQYSICFTLGSFAKIYADTFGDINYQEFAKRLWGDIYFNPKTRKFTKKAPTSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NVCFSSSQYSICFTLGSFAKIYADTFGDINYQEFAKRLWGDIYFNPKTRKFTKKAPTSSS
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD QRSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHLTKEELKLNIRPLLRLVCKKFFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QRSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHLTKEELKLNIRPLLRLVCKKFFG
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EFTGFVDMCVQHIPSPKVGAKPKIEHTYTGGVDSDLGEAMSDCDPDGPLMCHTTKMYSTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EFTGFVDMCVQHIPSPKVGAKPKIEHTYTGGVDSDLGEAMSDCDPDGPLMCHTTKMYSTD
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KSD DGVQFHAFGRVLSGTIHAGQPVKVLGENYTLEDEEDSQICTVGRLWISVARYHIEVNRVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DGVQFHAFGRVLSGTIHAGQPVKVLGENYTLEDEEDSQICTVGRLWISVARYHIEVNRVP
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KSD AGNWVLIEGVDQPIVKTATITEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAVEPVNPSELPKMLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AGNWVLIEGVDQPIVKTATITEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAVEPVNPSELPKMLD
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KSD GLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEIDIKVADPVVTFCET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEIDIKVADPVVTFCET
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KSD VVETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLEKGLAEDIENEVVQITWNRKKLGEFFQTKYDWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VVETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLEKGLAEDIENEVVQITWNRKKLGEFFQTKYDWD
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KSD LLAARSIWAFGPDATGPNILVDDTLPSEVDKALLGSVKDSIVQGFQWGTREGPLCDELIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LLAARSIWAFGPDATGPNILVDDTLPSEVDKALLGSVKDSIVQGFQWGTREGPLCDELIR
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KSD NVKFKILDAVVAQEPLHRGGGQIIPTARRVVYSAFLMATPRLMEPYYFVEVQAPADCVSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NVKFKILDAVVAQEPLHRGGGQIIPTARRVVYSAFLMATPRLMEPYYFVEVQAPADCVSA
760 770 780 790 800 810
850 860 870 880 890 900
pF1KSD VYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQGQAFSLSVFHHWQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQGQAFSLSVFHHWQ
820 830 840 850 860 870
910 920 930 940 950 960
pF1KSD IVPGDPLDKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDVSISKFFDDPMLLELAKQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IVPGDPLDKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDVSISKFFDDPMLLELAKQD
880 890 900 910 920 930
970
pF1KSD VVLNYPM
:::::::
CCDS45 VVLNYPM
>>CCDS59295.1 EFTUD2 gene_id:9343|Hs108|chr17 (962 aa)
initn: 5459 init1: 5459 opt: 5506 Z-score: 5507.2 bits: 1030.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6401; 99.0% identity (99.0% similar) in 972 aa overlap (1-972:1-962)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDTDLYDEFGNYIGPELDSDEDDDELGRETKDLDEMDDDDDDDDVGDHDDDHPGMEVVLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MDTDLYDEFGNYIGPELDSDEDDDELGRETKDLDEMDDDDDDDDVGDHDDDHPGMEVVLH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD EDKKYYPTAEEVYGPEVETIVQEEDTQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EDKKYYPTAEEVYGPEVETIVQEEDTQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKTCFVDCLIEQTHPEIRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVG
::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKT----------HPEIRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVG
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD IKSTPVTVVLPDTKGKSYLFNIMDTPGHVNFSDEVTAGLRISDGVVLFIDAAEGVMLNTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 IKSTPVTVVLPDTKGKSYLFNIMDTPGHVNFSDEVTAGLRISDGVVLFIDAAEGVMLNTE
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RLIKHAVQERLAVTVCINKIDRLILELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLISMYSTDENLIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RLIKHAVQERLAVTVCINKIDRLILELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLISMYSTDENLIL
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SPLLGNVCFSSSQYSICFTLGSFAKIYADTFGDINYQEFAKRLWGDIYFNPKTRKFTKKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SPLLGNVCFSSSQYSICFTLGSFAKIYADTFGDINYQEFAKRLWGDIYFNPKTRKFTKKA
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD PTSSSQRSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHLTKEELKLNIRPLLRLVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PTSSSQRSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHLTKEELKLNIRPLLRLVC
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVGAKPKIEHTYTGGVDSDLGEAMSDCDPDGPLMCHTTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVGAKPKIEHTYTGGVDSDLGEAMSDCDPDGPLMCHTTK
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KSD MYSTDDGVQFHAFGRVLSGTIHAGQPVKVLGENYTLEDEEDSQICTVGRLWISVARYHIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MYSTDDGVQFHAFGRVLSGTIHAGQPVKVLGENYTLEDEEDSQICTVGRLWISVARYHIE
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KSD VNRVPAGNWVLIEGVDQPIVKTATITEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAVEPVNPSEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VNRVPAGNWVLIEGVDQPIVKTATITEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAVEPVNPSEL
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KSD PKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEIDIKVADPVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEIDIKVADPVV
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KSD TFCETVVETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLEKGLAEDIENEVVQITWNRKKLGEFFQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TFCETVVETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLEKGLAEDIENEVVQITWNRKKLGEFFQT
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KSD KYDWDLLAARSIWAFGPDATGPNILVDDTLPSEVDKALLGSVKDSIVQGFQWGTREGPLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KYDWDLLAARSIWAFGPDATGPNILVDDTLPSEVDKALLGSVKDSIVQGFQWGTREGPLC
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KSD DELIRNVKFKILDAVVAQEPLHRGGGQIIPTARRVVYSAFLMATPRLMEPYYFVEVQAPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DELIRNVKFKILDAVVAQEPLHRGGGQIIPTARRVVYSAFLMATPRLMEPYYFVEVQAPA
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KSD DCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQGQAFSLSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQGQAFSLSV
840 850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KSD FHHWQIVPGDPLDKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDVSISKFFDDPMLLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 FHHWQIVPGDPLDKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDVSISKFFDDPMLLE
900 910 920 930 940 950
970
pF1KSD LAKQDVVLNYPM
::::::::::::
CCDS59 LAKQDVVLNYPM
960
>>CCDS12117.1 EEF2 gene_id:1938|Hs108|chr19 (858 aa)
initn: 2117 init1: 637 opt: 1738 Z-score: 1739.9 bits: 333.2 E(32554): 1.4e-90
Smith-Waterman score: 2153; 39.2% identity (69.6% similar) in 873 aa overlap (114-954:4-856)
90 100 110 120 130 140
pF1KSD EDTQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLADLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKT
. .: . .::.. :::... .:. :::.
CCDS12 MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKS
10 20 30
150 160 170 180 190
pF1KSD CFVDCLIEQTHPEIRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVGIKSTPVTVV----------LPDT
..: :. .. : . .:: :::: . :::: ... . ..
CCDS12 TLTDSLVCKAGIIASARAGETR-FTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQS
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KSD K-GKSYLFNIMDTPGHVNFSDEVTAGLRISDGVVLFIDAAEGVMLNTERLIKHAVQERLA
: : ..:.:..:.::::.::.::::.::..::... .: . :: ..:: ....:. ::.
CCDS12 KDGAGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIK
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300
pF1KSD VTVCINKIDRLILELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLISMYSTDE-----NLILSPLLGNV
.. .::.:: .:::.: : . : ...::..:: .:: :. : :....:.::.:
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