Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0024
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0024, 473 aa
1>>>pF1KSDA0024 473 - 473 aa - 473 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0363+/-0.000445; mu= 19.6761+/- 0.027
mean_var=68.4576+/-14.938, 0's: 0 Z-trim(110.3): 30 B-trim: 1080 in 1/49
Lambda= 0.155011
statistics sampled from 18633 (18658) to 18633 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.568), E-opt: 0.2 (0.219), width: 16
Scan time: 5.070
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055569 (OMIM: 151050,612792) phosphatidylserine ( 473) 3317 751.3 1.4e-216
NP_001277154 (OMIM: 151050,612792) phosphatidylser ( 327) 2335 531.5 1.3e-150
NP_110410 (OMIM: 612793) phosphatidylserine syntha ( 487) 844 198.2 4.2e-50
NP_001316477 (OMIM: 612793) phosphatidylserine syn ( 427) 816 191.9 2.9e-48
XP_011518693 (OMIM: 612793) PREDICTED: phosphatidy ( 475) 602 144.1 8.1e-34
NP_001316473 (OMIM: 612793) phosphatidylserine syn ( 503) 602 144.1 8.5e-34
XP_011518695 (OMIM: 612793) PREDICTED: phosphatidy ( 278) 523 126.3 1.1e-28
XP_016873858 (OMIM: 612793) PREDICTED: phosphatidy ( 278) 523 126.3 1.1e-28
XP_016873860 (OMIM: 612793) PREDICTED: phosphatidy ( 278) 523 126.3 1.1e-28
XP_011518694 (OMIM: 612793) PREDICTED: phosphatidy ( 278) 523 126.3 1.1e-28
NP_001316474 (OMIM: 612793) phosphatidylserine syn ( 278) 523 126.3 1.1e-28
XP_016873857 (OMIM: 612793) PREDICTED: phosphatidy ( 278) 523 126.3 1.1e-28
>>NP_055569 (OMIM: 151050,612792) phosphatidylserine syn (473 aa)
initn: 3317 init1: 3317 opt: 3317 Z-score: 4009.6 bits: 751.3 E(85289): 1.4e-216
Smith-Waterman score: 3317; 100.0% identity (100.0% similar) in 473 aa overlap (1-473:1-473)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASCVGSRTLSKDDVNYKMHFRMINEQQVEDITIDFFYRPHTITLLSFTIVSLMYFAFTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MASCVGSRTLSKDDVNYKMHFRMINEQQVEDITIDFFYRPHTITLLSFTIVSLMYFAFTR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DDSVPEDNIWRGILSVIFFFLIISVLAFPNGPFTRPHPALWRMVFGLSVLYFLFLVFLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DDSVPEDNIWRGILSVIFFFLIISVLAFPNGPFTRPHPALWRMVFGLSVLYFLFLVFLLF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LNFEQVKSLMYWLDPNLRYATREADVMEYAVNCHVITWERIISHFDIFAFGHFWGWAMKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LNFEQVKSLMYWLDPNLRYATREADVMEYAVNCHVITWERIISHFDIFAFGHFWGWAMKA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LLIRSYGLCWTISITWELTELFFMHLLPNFAECWWDQVILDILLCNGGGIWLGMVVCRFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LLIRSYGLCWTISITWELTELFFMHLLPNFAECWWDQVILDILLCNGGGIWLGMVVCRFL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD EMRTYHWASFKDIHTTTGKIKRAVLQFTPASWTYVRWFDPKSSFQRVAGVYLFMIIWQLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EMRTYHWASFKDIHTTTGKIKRAVLQFTPASWTYVRWFDPKSSFQRVAGVYLFMIIWQLT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ELNTFFLKHIFVFQASHPLSWGRILFIGGITAPTVRQYYAYLTDTQCKRVGTQCWVFGVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ELNTFFLKHIFVFQASHPLSWGRILFIGGITAPTVRQYYAYLTDTQCKRVGTQCWVFGVI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD GFLEAIVCIKFGQDLFSKTQILYVVLWLLCVAFTTFLCLYGMIWYAEHYGHREKTYSECE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GFLEAIVCIKFGQDLFSKTQILYVVLWLLCVAFTTFLCLYGMIWYAEHYGHREKTYSECE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KSD DGTYSPEISWHHRKGTKGSEDSPPKHAGNNESHSSRRRNRHSKSKVTNGVGKK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DGTYSPEISWHHRKGTKGSEDSPPKHAGNNESHSSRRRNRHSKSKVTNGVGKK
430 440 450 460 470
>>NP_001277154 (OMIM: 151050,612792) phosphatidylserine (327 aa)
initn: 2335 init1: 2335 opt: 2335 Z-score: 2824.9 bits: 531.5 E(85289): 1.3e-150
Smith-Waterman score: 2335; 100.0% identity (100.0% similar) in 327 aa overlap (147-473:1-327)
120 130 140 150 160 170
pF1KSD FLLFLNFEQVKSLMYWLDPNLRYATREADVMEYAVNCHVITWERIISHFDIFAFGHFWGW
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEYAVNCHVITWERIISHFDIFAFGHFWGW
10 20 30
180 190 200 210 220 230
pF1KSD AMKALLIRSYGLCWTISITWELTELFFMHLLPNFAECWWDQVILDILLCNGGGIWLGMVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AMKALLIRSYGLCWTISITWELTELFFMHLLPNFAECWWDQVILDILLCNGGGIWLGMVV
40 50 60 70 80 90
240 250 260 270 280 290
pF1KSD CRFLEMRTYHWASFKDIHTTTGKIKRAVLQFTPASWTYVRWFDPKSSFQRVAGVYLFMII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CRFLEMRTYHWASFKDIHTTTGKIKRAVLQFTPASWTYVRWFDPKSSFQRVAGVYLFMII
100 110 120 130 140 150
300 310 320 330 340 350
pF1KSD WQLTELNTFFLKHIFVFQASHPLSWGRILFIGGITAPTVRQYYAYLTDTQCKRVGTQCWV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WQLTELNTFFLKHIFVFQASHPLSWGRILFIGGITAPTVRQYYAYLTDTQCKRVGTQCWV
160 170 180 190 200 210
360 370 380 390 400 410
pF1KSD FGVIGFLEAIVCIKFGQDLFSKTQILYVVLWLLCVAFTTFLCLYGMIWYAEHYGHREKTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FGVIGFLEAIVCIKFGQDLFSKTQILYVVLWLLCVAFTTFLCLYGMIWYAEHYGHREKTY
220 230 240 250 260 270
420 430 440 450 460 470
pF1KSD SECEDGTYSPEISWHHRKGTKGSEDSPPKHAGNNESHSSRRRNRHSKSKVTNGVGKK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SECEDGTYSPEISWHHRKGTKGSEDSPPKHAGNNESHSSRRRNRHSKSKVTNGVGKK
280 290 300 310 320
>>NP_110410 (OMIM: 612793) phosphatidylserine synthase 2 (487 aa)
initn: 733 init1: 400 opt: 844 Z-score: 1020.5 bits: 198.2 E(85289): 4.2e-50
Smith-Waterman score: 844; 34.4% identity (64.8% similar) in 395 aa overlap (22-404:44-429)
10 20 30 40 50
pF1KSD MASCVGSRTLSKDDVNYKMHFRMINEQQV-EDITIDFFYRPHTITLLSFTI
: .:..: .: : ::.: ::.:.: .
NP_110 PESPVPAGRASLEEPPDGPSAGQATGPGEGRRSTESEVYDDGTNTFFWRAHTLTVLFILT
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100
pF1KSD VSLMYFAFTRDDSVPED---NIWRGILSVIFFFLIISVLAFPNGPFTRPHPALWRMVFGL
.: : .. .. .:.: : :::.. :. :: ..: .:::.::::: ::. . .
NP_110 CTLGYVTLLEE--TPQDTAYNTKRGIVASILVFLCFGVTQAKDGPFSRPHPAYWRFWLCV
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KSD SVLYFLFLVFLLFLNFEQVKSLMYWLDPNLRYATREADVMEYAVNCHVIT-------WER
::.: :::.:.:: . .. .... ..::.: : : :. :: . ..
NP_110 SVVYELFLIFILFQTVQDGRQFLKYVDPKLGVPLPERD---YGGNCLIYDPDNETDPFHN
140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KSD IISHFDIFAFGHFWGWAMKALLIRSYGLCWTISITWELTELFFMHLLPNFAECWWDQVIL
: ...: :. .:: :: .:.:.::.. .: ::. .:. : . : ::::.:::::. :.
NP_110 IWDKLDGFVPAHFLGWYLKTLMIRDWWMCMIISVMFEFLEYSLEHQLPNFSECWWDHWIM
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KSD DILLCNGGGIWLGMVVCRFLEMRTYHWASFKDIHTTTGKIKRAVLQFTPASWTYVRWFDP
:.:.::: ::. :: . ..: ..::.: .. .: : ::.:: ..:::: ::. .: :
NP_110 DVLVCNGLGIYCGMKTLEWLSLKTYKWQGLWNIPTYKGKMKRIAFQFTPYSWVRFEW-KP
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KSD KSSFQRVAGVYLFMIIWQLTELNTFFLKHIFVFQASHPLSWGRILFIGGITAPTVRQYYA
::..: .: ..... :.:::::.:: .. . : : :..:. .. . ..:. :
NP_110 ASSLRRWLAVCGIILVFLLAELNTFYLKFVLWMPPEHYLVLLRLVFFVNVGGVAMREIYD
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390
pF1KSD YLTDTQ-CKRVGTQCWVFGVIGFLEAIVCIKFGQDLFSKTQILYVVLWLLCVAFTTFLCL
.. : . :..: : :. ..: : .. .:. .. . .:. : .. . : :
NP_110 FMDDPKPHKKLGPQAWLVAAITATELLIVVKYDPHTLTLSLPFYISQ---CWTLGSVLAL
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KSD YGMIWYAEHYGHREKTYSECEDGTYSPEISWHHRKGTKGSEDSPPKHAGNNESHSSRRRN
.:
NP_110 TWTVWRFFLRDITLRYKETRWQKWQNKDDQGSTVGNGDQHPLGLDEDLLGPGVAEGEGAP
430 440 450 460 470 480
>>NP_001316477 (OMIM: 612793) phosphatidylserine synthas (427 aa)
initn: 695 init1: 400 opt: 816 Z-score: 987.4 bits: 191.9 E(85289): 2.9e-48
Smith-Waterman score: 816; 34.2% identity (64.7% similar) in 377 aa overlap (39-404:2-369)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD TLSKDDVNYKMHFRMINEQQVEDITIDFFYRPHTITLLSFTIVSLMYFAFTRDDSVPED-
: ::.:.: . .: : .. .. .:.:
NP_001 MRAHTLTVLFILTCTLGYVTLLEE--TPQDT
10 20
70 80 90 100 110 120
pF1KSD --NIWRGILSVIFFFLIISVLAFPNGPFTRPHPALWRMVFGLSVLYFLFLVFLLFLNFEQ
: :::.. :. :: ..: .:::.::::: ::. . .::.: :::.:.:: . ..
NP_001 AYNTKRGIVASILVFLCFGVTQAKDGPFSRPHPAYWRFWLCVSVVYELFLIFILFQTVQD
30 40 50 60 70 80
130 140 150 160 170
pF1KSD VKSLMYWLDPNLRYATREADVMEYAVNCHVIT-------WERIISHFDIFAFGHFWGWAM
.... ..::.: : : :. :: . .. : ...: :. .:: :: .
NP_001 GRQFLKYVDPKLGVPLPERD---YGGNCLIYDPDNETDPFHNIWDKLDGFVPAHFLGWYL
90 100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KSD KALLIRSYGLCWTISITWELTELFFMHLLPNFAECWWDQVILDILLCNGGGIWLGMVVCR
:.:.::.. .: ::. .:. : . : ::::.:::::. :.:.:.::: ::. :: . .
NP_001 KTLMIRDWWMCMIISVMFEFLEYSLEHQLPNFSECWWDHWIMDVLVCNGLGIYCGMKTLE
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KSD FLEMRTYHWASFKDIHTTTGKIKRAVLQFTPASWTYVRWFDPKSSFQRVAGVYLFMIIWQ
.: ..::.: .. .: : ::.:: ..:::: ::. .: : ::..: .: .....
NP_001 WLSLKTYKWQGLWNIPTYKGKMKRIAFQFTPYSWVRFEW-KPASSLRRWLAVCGIILVFL
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KSD LTELNTFFLKHIFVFQASHPLSWGRILFIGGITAPTVRQYYAYLTDTQ-CKRVGTQCWVF
:.:::::.:: .. . : : :..:. .. . ..:. : .. : . :..: : :.
NP_001 LAELNTFYLKFVLWMPPEHYLVLLRLVFFVNVGGVAMREIYDFMDDPKPHKKLGPQAWLV
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KSD GVIGFLEAIVCIKFGQDLFSKTQILYVVLWLLCVAFTTFLCLYGMIWYAEHYGHREKTYS
..: : .. .:. .. . .:. : .. . : : .:
NP_001 AAITATELLIVVKYDPHTLTLSLPFYISQ---CWTLGSVLALTWTVWRFFLRDITLRYKE
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KSD ECEDGTYSPEISWHHRKGTKGSEDSPPKHAGNNESHSSRRRNRHSKSKVTNGVGKK
NP_001 TRWQKWQNKDDQGSTVGNGDQHPLGLDEDLLGPGVAEGEGAPTPN
390 400 410 420
>>XP_011518693 (OMIM: 612793) PREDICTED: phosphatidylser (475 aa)
initn: 666 init1: 400 opt: 602 Z-score: 728.1 bits: 144.1 E(85289): 8.1e-34
Smith-Waterman score: 780; 33.3% identity (62.3% similar) in 393 aa overlap (39-404:34-417)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD TLSKDDVNYKMHFRMINEQQVEDITIDFFYRPHTITLLSFTIVSLMYFAFTRDDSVPED-
: ::.:.: . .: : .. .. .:.:
XP_011 LGAECGRSQGAHASLRSPPSTREAGAAAQRRAHTLTVLFILTCTLGYVTLLEE--TPQDT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD --NIWRGILSVIFFFLIISVLAFPNGPFTRPHPALWRMVFGLSVLYFLFLVFLLF-----
: :::.. :. :: ..: .:::.::::: ::. . .::.: :::.:.::
XP_011 AYNTKRGIVASILVFLCFGVTQAKDGPFSRPHPAYWRFWLCVSVVYELFLIFILFQLPPL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160
pF1KSD --------LNFEQV---KSLMYWLDPNLRYATREADVMEYAVNCHVIT-------WERII
: .. : .... ..::.: : : :. :: . .. :
XP_011 TVAPLTGALALQTVQDGRQFLKYVDPKLGVPLPERD---YGGNCLIYDPDNETDPFHNIW
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD SHFDIFAFGHFWGWAMKALLIRSYGLCWTISITWELTELFFMHLLPNFAECWWDQVILDI
...: :. .:: :: .:.:.::.. .: ::. .:. : . : ::::.:::::. :.:.
XP_011 DKLDGFVPAHFLGWYLKTLMIRDWWMCMIISVMFEFLEYSLEHQLPNFSECWWDHWIMDV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD LLCNGGGIWLGMVVCRFLEMRTYHWASFKDIHTTTGKIKRAVLQFTPASWTYVRWFDPKS
:.::: ::. :: . ..: ..::.: .. .: : ::.:: ..:::: ::. .: : :
XP_011 LVCNGLGIYCGMKTLEWLSLKTYKWQGLWNIPTYKGKMKRIAFQFTPYSWVRFEW-KPAS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD SFQRVAGVYLFMIIWQLTELNTFFLKHIFVFQASHPLSWGRILFIGGITAPTVRQYYAYL
:..: .: ..... :.:::::.:: .. . : : :..:. .. . ..:. : ..
XP_011 SLRRWLAVCGIILVFLLAELNTFYLKFVLWMPPEHYLVLLRLVFFVNVGGVAMREIYDFM
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD TDTQ-CKRVGTQCWVFGVIGFLEAIVCIKFGQDLFSKTQILYVVLWLLCVAFTTFLCLYG
: . :..: : :. ..: : .. .:. .. . .:. : .. . : :
XP_011 DDPKPHKKLGPQAWLVAAITATELLIVVKYDPHTLTLSLPFYISQ---CWTLGSVLALTW
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD MIWYAEHYGHREKTYSECEDGTYSPEISWHHRKGTKGSEDSPPKHAGNNESHSSRRRNRH
.:
XP_011 TVWRFFLRDITLRYKETRWQKWQNKDDQGSTVGNGDQHPLGLDEDLLGPGVAEGEGAPTP
420 430 440 450 460 470
>>NP_001316473 (OMIM: 612793) phosphatidylserine synthas (503 aa)
initn: 666 init1: 400 opt: 602 Z-score: 727.8 bits: 144.1 E(85289): 8.5e-34
Smith-Waterman score: 808; 33.6% identity (62.5% similar) in 411 aa overlap (22-404:44-445)
10 20 30 40 50
pF1KSD MASCVGSRTLSKDDVNYKMHFRMINEQQV-EDITIDFFYRPHTITLLSFTI
: .:..: .: : ::.: ::.:.: .
NP_001 PESPVPAGRASLEEPPDGPSAGQATGPGEGRRSTESEVYDDGTNTFFWRAHTLTVLFILT
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100
pF1KSD VSLMYFAFTRDDSVPED---NIWRGILSVIFFFLIISVLAFPNGPFTRPHPALWRMVFGL
.: : .. .. .:.: : :::.. :. :: ..: .:::.::::: ::. . .
NP_001 CTLGYVTLLEE--TPQDTAYNTKRGIVASILVFLCFGVTQAKDGPFSRPHPAYWRFWLCV
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150
pF1KSD SVLYFLFLVFLLF-------------LNFEQV---KSLMYWLDPNLRYATREADVMEYAV
::.: :::.:.:: : .. : .... ..::.: : : :.
NP_001 SVVYELFLIFILFQLPPLTVAPLTGALALQTVQDGRQFLKYVDPKLGVPLPERD---YGG
140 150 160 170 180
160 170 180 190 200
pF1KSD NCHVIT-------WERIISHFDIFAFGHFWGWAMKALLIRSYGLCWTISITWELTELFFM
:: . .. : ...: :. .:: :: .:.:.::.. .: ::. .:. : .
NP_001 NCLIYDPDNETDPFHNIWDKLDGFVPAHFLGWYLKTLMIRDWWMCMIISVMFEFLEYSLE
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KSD HLLPNFAECWWDQVILDILLCNGGGIWLGMVVCRFLEMRTYHWASFKDIHTTTGKIKRAV
: ::::.:::::. :.:.:.::: ::. :: . ..: ..::.: .. .: : ::.:: .
NP_001 HQLPNFSECWWDHWIMDVLVCNGLGIYCGMKTLEWLSLKTYKWQGLWNIPTYKGKMKRIA
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KSD LQFTPASWTYVRWFDPKSSFQRVAGVYLFMIIWQLTELNTFFLKHIFVFQASHPLSWGRI
.:::: ::. .: : ::..: .: ..... :.:::::.:: .. . : : :.
NP_001 FQFTPYSWVRFEW-KPASSLRRWLAVCGIILVFLLAELNTFYLKFVLWMPPEHYLVLLRL
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KSD LFIGGITAPTVRQYYAYLTDTQ-CKRVGTQCWVFGVIGFLEAIVCIKFGQDLFSKTQILY
.:. .. . ..:. : .. : . :..: : :. ..: : .. .:. .. . .:
NP_001 VFFVNVGGVAMREIYDFMDDPKPHKKLGPQAWLVAAITATELLIVVKYDPHTLTLSLPFY
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KSD VVLWLLCVAFTTFLCLYGMIWYAEHYGHREKTYSECEDGTYSPEISWHHRKGTKGSEDSP
. : .. . : : .:
NP_001 ISQ---CWTLGSVLALTWTVWRFFLRDITLRYKETRWQKWQNKDDQGSTVGNGDQHPLGL
430 440 450 460 470 480
>>XP_011518695 (OMIM: 612793) PREDICTED: phosphatidylser (278 aa)
initn: 438 init1: 346 opt: 523 Z-score: 635.9 bits: 126.3 E(85289): 1.1e-28
Smith-Waterman score: 523; 33.9% identity (65.6% similar) in 224 aa overlap (182-404:1-220)
160 170 180 190 200 210
pF1KSD NCHVITWERIISHFDIFAFGHFWGWAMKALLIRSYGLCWTISITWELTELFFMHLLPNFA
.::.. .: ::. .:. : . : ::::.
XP_011 MIRDWWMCMIISVMFEFLEYSLEHQLPNFS
10 20 30
220 230 240 250 260 270
pF1KSD ECWWDQVILDILLCNGGGIWLGMVVCRFLEMRTYHWASFKDIHTTTGKIKRAVLQFTPAS
:::::. :.:.:.::: ::. :: . ..: ..::.: .. .: : ::.:: ..:::: :
XP_011 ECWWDHWIMDVLVCNGLGIYCGMKTLEWLSLKTYKWQGLWNIPTYKGKMKRIAFQFTPYS
40 50 60 70 80 90
280 290 300 310 320 330
pF1KSD WTYVRWFDPKSSFQRVAGVYLFMIIWQLTELNTFFLKHIFVFQASHPLSWGRILFIGGIT
:. .: : ::..: .: ..... :.:::::.:: .. . : : :..:. ..
XP_011 WVRFEW-KPASSLRRWLAVCGIILVFLLAELNTFYLKFVLWMPPEHYLVLLRLVFFVNVG
100 110 120 130 140
340 350 360 370 380 390
pF1KSD APTVRQYYAYLTDTQ-CKRVGTQCWVFGVIGFLEAIVCIKFGQDLFSKTQILYVVLWLLC
. ..:. : .. : . :..: : :. ..: : .. .:. .. . .:. :
XP_011 GVAMREIYDFMDDPKPHKKLGPQAWLVAAITATELLIVVKYDPHTLTLSLPFYISQ---C
150 160 170 180 190 200
400 410 420 430 440 450
pF1KSD VAFTTFLCLYGMIWYAEHYGHREKTYSECEDGTYSPEISWHHRKGTKGSEDSPPKHAGNN
.. . : : .:
XP_011 WTLGSVLALTWTVWRFFLRDITLRYKETRWQKWQNKDDQGSTVGNGDQHPLGLDEDLLGP
210 220 230 240 250 260
>>XP_016873858 (OMIM: 612793) PREDICTED: phosphatidylser (278 aa)
initn: 438 init1: 346 opt: 523 Z-score: 635.9 bits: 126.3 E(85289): 1.1e-28
Smith-Waterman score: 523; 33.9% identity (65.6% similar) in 224 aa overlap (182-404:1-220)
160 170 180 190 200 210
pF1KSD NCHVITWERIISHFDIFAFGHFWGWAMKALLIRSYGLCWTISITWELTELFFMHLLPNFA
.::.. .: ::. .:. : . : ::::.
XP_016 MIRDWWMCMIISVMFEFLEYSLEHQLPNFS
10 20 30
220 230 240 250 260 270
pF1KSD ECWWDQVILDILLCNGGGIWLGMVVCRFLEMRTYHWASFKDIHTTTGKIKRAVLQFTPAS
:::::. :.:.:.::: ::. :: . ..: ..::.: .. .: : ::.:: ..:::: :
XP_016 ECWWDHWIMDVLVCNGLGIYCGMKTLEWLSLKTYKWQGLWNIPTYKGKMKRIAFQFTPYS
40 50 60 70 80 90
280 290 300 310 320 330
pF1KSD WTYVRWFDPKSSFQRVAGVYLFMIIWQLTELNTFFLKHIFVFQASHPLSWGRILFIGGIT
:. .: : ::..: .: ..... :.:::::.:: .. . : : :..:. ..
XP_016 WVRFEW-KPASSLRRWLAVCGIILVFLLAELNTFYLKFVLWMPPEHYLVLLRLVFFVNVG
100 110 120 130 140
340 350 360 370 380 390
pF1KSD APTVRQYYAYLTDTQ-CKRVGTQCWVFGVIGFLEAIVCIKFGQDLFSKTQILYVVLWLLC
. ..:. : .. : . :..: : :. ..: : .. .:. .. . .:. :
XP_016 GVAMREIYDFMDDPKPHKKLGPQAWLVAAITATELLIVVKYDPHTLTLSLPFYISQ---C
150 160 170 180 190 200
400 410 420 430 440 450
pF1KSD VAFTTFLCLYGMIWYAEHYGHREKTYSECEDGTYSPEISWHHRKGTKGSEDSPPKHAGNN
.. . : : .:
XP_016 WTLGSVLALTWTVWRFFLRDITLRYKETRWQKWQNKDDQGSTVGNGDQHPLGLDEDLLGP
210 220 230 240 250 260
>>XP_016873860 (OMIM: 612793) PREDICTED: phosphatidylser (278 aa)
initn: 438 init1: 346 opt: 523 Z-score: 635.9 bits: 126.3 E(85289): 1.1e-28
Smith-Waterman score: 523; 33.9% identity (65.6% similar) in 224 aa overlap (182-404:1-220)
160 170 180 190 200 210
pF1KSD NCHVITWERIISHFDIFAFGHFWGWAMKALLIRSYGLCWTISITWELTELFFMHLLPNFA
.::.. .: ::. .:. : . : ::::.
XP_016 MIRDWWMCMIISVMFEFLEYSLEHQLPNFS
10 20 30
220 230 240 250 260 270
pF1KSD ECWWDQVILDILLCNGGGIWLGMVVCRFLEMRTYHWASFKDIHTTTGKIKRAVLQFTPAS
:::::. :.:.:.::: ::. :: . ..: ..::.: .. .: : ::.:: ..:::: :
XP_016 ECWWDHWIMDVLVCNGLGIYCGMKTLEWLSLKTYKWQGLWNIPTYKGKMKRIAFQFTPYS
40 50 60 70 80 90
280 290 300 310 320 330
pF1KSD WTYVRWFDPKSSFQRVAGVYLFMIIWQLTELNTFFLKHIFVFQASHPLSWGRILFIGGIT
:. .: : ::..: .: ..... :.:::::.:: .. . : : :..:. ..
XP_016 WVRFEW-KPASSLRRWLAVCGIILVFLLAELNTFYLKFVLWMPPEHYLVLLRLVFFVNVG
100 110 120 130 140
340 350 360 370 380 390
pF1KSD APTVRQYYAYLTDTQ-CKRVGTQCWVFGVIGFLEAIVCIKFGQDLFSKTQILYVVLWLLC
. ..:. : .. : . :..: : :. ..: : .. .:. .. . .:. :
XP_016 GVAMREIYDFMDDPKPHKKLGPQAWLVAAITATELLIVVKYDPHTLTLSLPFYISQ---C
150 160 170 180 190 200
400 410 420 430 440 450
pF1KSD VAFTTFLCLYGMIWYAEHYGHREKTYSECEDGTYSPEISWHHRKGTKGSEDSPPKHAGNN
.. . : : .:
XP_016 WTLGSVLALTWTVWRFFLRDITLRYKETRWQKWQNKDDQGSTVGNGDQHPLGLDEDLLGP
210 220 230 240 250 260
>>XP_011518694 (OMIM: 612793) PREDICTED: phosphatidylser (278 aa)
initn: 438 init1: 346 opt: 523 Z-score: 635.9 bits: 126.3 E(85289): 1.1e-28
Smith-Waterman score: 523; 33.9% identity (65.6% similar) in 224 aa overlap (182-404:1-220)
160 170 180 190 200 210
pF1KSD NCHVITWERIISHFDIFAFGHFWGWAMKALLIRSYGLCWTISITWELTELFFMHLLPNFA
.::.. .: ::. .:. : . : ::::.
XP_011 MIRDWWMCMIISVMFEFLEYSLEHQLPNFS
10 20 30
220 230 240 250 260 270
pF1KSD ECWWDQVILDILLCNGGGIWLGMVVCRFLEMRTYHWASFKDIHTTTGKIKRAVLQFTPAS
:::::. :.:.:.::: ::. :: . ..: ..::.: .. .: : ::.:: ..:::: :
XP_011 ECWWDHWIMDVLVCNGLGIYCGMKTLEWLSLKTYKWQGLWNIPTYKGKMKRIAFQFTPYS
40 50 60 70 80 90
280 290 300 310 320 330
pF1KSD WTYVRWFDPKSSFQRVAGVYLFMIIWQLTELNTFFLKHIFVFQASHPLSWGRILFIGGIT
:. .: : ::..: .: ..... :.:::::.:: .. . : : :..:. ..
XP_011 WVRFEW-KPASSLRRWLAVCGIILVFLLAELNTFYLKFVLWMPPEHYLVLLRLVFFVNVG
100 110 120 130 140
340 350 360 370 380 390
pF1KSD APTVRQYYAYLTDTQ-CKRVGTQCWVFGVIGFLEAIVCIKFGQDLFSKTQILYVVLWLLC
. ..:. : .. : . :..: : :. ..: : .. .:. .. . .:. :
XP_011 GVAMREIYDFMDDPKPHKKLGPQAWLVAAITATELLIVVKYDPHTLTLSLPFYISQ---C
150 160 170 180 190 200
400 410 420 430 440 450
pF1KSD VAFTTFLCLYGMIWYAEHYGHREKTYSECEDGTYSPEISWHHRKGTKGSEDSPPKHAGNN
.. . : : .:
XP_011 WTLGSVLALTWTVWRFFLRDITLRYKETRWQKWQNKDDQGSTVGNGDQHPLGLDEDLLGP
210 220 230 240 250 260
473 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 23:25:50 2016 done: Wed Nov 2 23:25:50 2016
Total Scan time: 5.070 Total Display time: 0.010
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]