Result of FASTA (ccds) for
pF1KF0316
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KF0316, 640 aa
1>>>pF1KF0316 640 - 640 aa - 640 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.6292+/-0.00156; mu= -10.2056+/- 0.092
mean_var=367.5088+/-75.719, 0's: 0 Z-trim(107.3): 32 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.066902
statistics sampled from 9450 (9466) to 9450 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.632), E-opt: 0.2 (0.291), width: 16
Scan time: 3.910
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS721.1 GBP4 gene_id:115361|Hs108|chr1 ( 640) 4115 412.2 1.1e-114
CCDS720.1 GBP7 gene_id:388646|Hs108|chr1 ( 638) 3183 322.2 1.3e-87
CCDS723.1 GBP6 gene_id:163351|Hs108|chr1 ( 633) 2911 296.0 1.1e-79
CCDS718.1 GBP1 gene_id:2633|Hs108|chr1 ( 592) 2162 223.6 5.9e-58
CCDS717.2 GBP3 gene_id:2635|Hs108|chr1 ( 595) 2130 220.6 5e-57
CCDS719.1 GBP2 gene_id:2634|Hs108|chr1 ( 591) 2122 219.8 8.5e-57
CCDS722.1 GBP5 gene_id:115362|Hs108|chr1 ( 586) 1963 204.4 3.5e-52
>>CCDS721.1 GBP4 gene_id:115361|Hs108|chr1 (640 aa)
initn: 4115 init1: 4115 opt: 4115 Z-score: 2172.3 bits: 412.2 E(32554): 1.1e-114
Smith-Waterman score: 4115; 99.1% identity (99.8% similar) in 640 aa overlap (1-640:1-640)
10 20 30 40 50 60
pF1KF0 MGERTLHAAVPTPGYPESESIMMAPICLVENQEEQLTVNSKALEILDKISQPVVVVAIVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MGERTLHAAVPTPGYPESESIMMAPICLVENQEEQLTVNSKALEILDKISQPVVVVAIVG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KF0 LYRTGKSYLMNRLAGKRNGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHLSKPNHTLVLLDTEGLGDVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LYRTGKSYLMNRLAGKRNGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHLSKPNHTLVLLDTEGLGDVE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KF0 KSNPKNDSWIFALAVLLSSSFVYNSVSTINHQALEQLHYVTELAELIRAKSCPRPDEAED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 KSNPKNDSWIFALAVLLSSSFVYNSVSTINHQALEQLHYVTELAELIRAKSCPRPDEAED
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KF0 SSEFASFFPDFIWTVRDFTLELKLDGNPITEDEYLENALKLIPGKNPKIQNSNMPRECIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 SSEFASFFPDFIWTVRDFTLELKLDGNPITEDEYLENALKLIPGKNPKIQNSNMPRECIR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KF0 HFFRKRKCFVFDRPTNDKQYLNHMDEVPEENLERHFLMQSDNFCSYIFTHAKTKTLREGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 HFFRKRKCFVFDRPTNDKQYLNHMDEVPEENLERHFLMQSDNFCSYIFTHAKTKTLREGI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KF0 IVTGKRLGTLVVTYVDAINSGAVPCLENAVTALAQLENPAAVQRAADHYSQQMAQQLRLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 IVTGKRLGTLVVTYVDAINSGAVPCLENAVTALAQLENPAAVQRAADHYSQQMAQQLRLP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KF0 TDTLQELLDVHAACEREAIAVFMEHSFKDENHEFQKKLVDTIEKKKGDFVLQNEEASAKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 TDTLQELLDVHAACEREAIAVFMEHSFKDENHEFQKKLVDTIEKKKGDFVLQNEEASAKY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KF0 CQAELKRLSEHLTESILRGIFSVPGGHNLYLEEKKQVEWDYKLVPRKGVKANEVLQNFLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 CQAELKRLSEHLTESILRGIFSVPGGHNLYLEEKKQVEWDYKLVPRKGVKANEVLQNFLQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KF0 SQVVVEESILQSDKALTAGEKAIAAERAMKEAAEKEQELLREKQKEQQQMMEAQERSFQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 SQVVVEESILQSDKALTAGEKAIAAERAMKEAAEKEQELLREKQKEQQQMMEAQERSFQE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KF0 NIAQLKKKMERERENLLREHERLLKHKLKVQEEMLKEEFQKKSEQLNKEINQLKEKIEST
.::..::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 YMAQMEKKLEEERENLLREHERLLKHKLKVQEEMLKEEFQKKSEQLNKEINQLKEKIEST
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KF0 KNEQLRLLKILDMASNIMIVTLPGASKLLGVGTKYLGSRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 KNEQLRLLKILDMASNIMIVTLPGASKLLGVGTKYLGSRI
610 620 630 640
>>CCDS720.1 GBP7 gene_id:388646|Hs108|chr1 (638 aa)
initn: 3310 init1: 3098 opt: 3183 Z-score: 1686.1 bits: 322.2 E(32554): 1.3e-87
Smith-Waterman score: 3183; 78.8% identity (92.8% similar) in 622 aa overlap (18-638:3-624)
10 20 30 40 50 60
pF1KF0 MGERTLHAAVPTPGYPESESIMMAPICLVENQEEQLTVNSKALEILDKISQPVVVVAIVG
:: : .:.::.:: . .:.:::.:::::. :.::::::::::
CCDS72 MASEIHMPGPVCLTENTKGHLVVNSEALEILSAITQPVVVVAIVG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KF0 LYRTGKSYLMNRLAGKRNGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHLSKPNHTLVLLDTEGLGDVE
:::::::::::.:::: .::::: ::.::::::::::::: :::::::.:::::::::.:
CCDS72 LYRTGKSYLMNKLAGKNKGFPLGCTVKSETKGIWMWCVPHPSKPNHTLILLDTEGLGDME
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KF0 KSNPKNDSWIFALAVLLSSSFVYNSVSTINHQALEQLHYVTELAELIRAKSCPRPDEAED
::.::.:::::::::::::::::::..::::::::::::::::.:::::::::::::.::
CCDS72 KSDPKSDSWIFALAVLLSSSFVYNSMGTINHQALEQLHYVTELTELIRAKSCPRPDEVED
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KF0 SSEFASFFPDFIWTVRDFTLELKLDGNPITEDEYLENALKLIPGKNPKIQNSNMPRECIR
::::.:::::::::::::::::::::.::::::::::::::: ::::.::::: ::: ::
CCDS72 SSEFVSFFPDFIWTVRDFTLELKLDGHPITEDEYLENALKLISGKNPQIQNSNKPREWIR
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KF0 HFFRKRKCFVFDRPTNDKQYLNHMDEVPEENLERHFLMQSDNFCSYIFTHAKTKTLREGI
::: :.:::::::: :::. : :..:: :..:. .: :::.:::::::::::::::::::
CCDS72 HFFPKQKCFVFDRPINDKKLLLHVEEVREDQLDSNFQMQSENFCSYIFTHAKTKTLREGI
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KF0 IVTGKRLGTLVVTYVDAINSGAVPCLENAVTALAQLENPAAVQRAADHYSQQMAQQLRLP
.:::.::: :: ::.:::::::.::::::...::: :: :::::::.:::::::::.:.:
CCDS72 LVTGNRLGMLVETYLDAINSGATPCLENAMAVLAQCENSAAVQRAANHYSQQMAQQVRFP
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KF0 TDTLQELLDVHAACEREAIAVFMEHSFKDENHEFQKKLVDTIEKKKGDFVLQNEEASAKY
::::::::::::.:::::::::::.::::...:::::::::.:::: :::::::::::::
CCDS72 TDTLQELLDVHAVCEREAIAVFMEYSFKDKSQEFQKKLVDTMEKKKEDFVLQNEEASAKY
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KF0 CQAELKRLSEHLTESILRGIFSVPGGHNLYLEEKKQVEWDYKLVPRKGVKANEVLQNFLQ
:::::::::: ::::: :: : ::::::.::: ::..: :: :::::::::.::::.:::
CCDS72 CQAELKRLSELLTESISRGTFFVPGGHNIYLEAKKKIEQDYTLVPRKGVKADEVLQSFLQ
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KF0 SQVVVEESILQSDKALTAGEKAIAAERAMKEAAEKEQELLREKQKEQQQMMEAQERSFQE
::::.::::::::::::::::::::..: ::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS72 SQVVIEESILQSDKALTAGEKAIAAKQAKKEAAEKEQELLRQKQKEQQQMMEAQERSFQE
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KF0 NIAQLKKKMERERENLLREHERLLKHKLKVQEEMLKEEFQKKSEQLNKEINQLKEKIEST
::::::::::::::: .:: ...:.::.:: ::.: : :.. :.::.:::.:::.::..
CCDS72 NIAQLKKKMERERENYMRELRKMLSHKMKVLEELLTEGFKEIFESLNEEINRLKEQIEAA
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640
pF1KF0 KNEQLRLL-KILDMASNIMIVTLPGASKLLGVGTKYLGSRI
.::. .. .:::.:..:.:..::::.::. .: : :.:
CCDS72 ENEEPSVFSQILDVAGSIFIAALPGAAKLVDLGMKILSSLCNRLRNPGKKIIS
590 600 610 620 630
>>CCDS723.1 GBP6 gene_id:163351|Hs108|chr1 (633 aa)
initn: 2910 init1: 2878 opt: 2911 Z-score: 1544.3 bits: 296.0 E(32554): 1.1e-79
Smith-Waterman score: 2911; 71.1% identity (89.9% similar) in 623 aa overlap (17-638:2-624)
10 20 30 40 50 60
pF1KF0 MGERTLHAAVPTPGYPESESIMMAPICLVENQEEQLTVNSKALEILDKISQPVVVVAIVG
:: :.::.:::::..::: ::..:..::.:::::::::::::
CCDS72 MESGPKMLAPVCLVENNNEQLLVNQQAIQILEKISQPVVVVAIVG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KF0 LYRTGKSYLMNRLAGKRNGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHLSKPNHTLVLLDTEGLGDVE
:::::::::::.:::. .:::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS72 LYRTGKSYLMNHLAGQNHGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHPSKPNHTLVLLDTEGLGDVE
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KF0 KSNPKNDSWIFALAVLLSSSFVYNSVSTINHQALEQLHYVTELAELIRAKSCPRPDEAED
:..:::::::::::::: :.:::::.:::::::::::::::::.:::.::: :::: .::
CCDS72 KGDPKNDSWIFALAVLLCSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTELIKAKSSPRPDGVED
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KF0 SSEFASFFPDFIWTVRDFTLELKLDGNPITEDEYLENALKLIPGKNPKIQNSNMPRECIR
:.::.::::::.::::::::::::.:.::::::::::::::: :.::..:.::.::::::
CCDS72 STEFVSFFPDFLWTVRDFTLELKLNGHPITEDEYLENALKLIQGNNPRVQTSNFPRECIR
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KF0 HFFRKRKCFVFDRPTNDKQYLNHMDEVPEENLERHFLMQSDNFCSYIFTHAKTKTLREGI
.:: ::::::::::::::. : ....: :..:. .: :.. :::::::::.::::::::
CCDS72 RFFPKRKCFVFDRPTNDKDLLANIEKVSEKQLDPKFQEQTNIFCSYIFTHARTKTLREGI
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KF0 IVTGKRLGTLVVTYVDAINSGAVPCLENAVTALAQLENPAAVQRAADHYSQQMAQQLRLP
:::.:::::.::::.:::::::::::::: .::: :: ::::::::.:::::::...::
CCDS72 TVTGNRLGTLAVTYVEAINSGAVPCLENAVITLAQRENSAAVQRAADYYSQQMAQRVKLP
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KF0 TDTLQELLDVHAACEREAIAVFMEHSFKDENHEFQKKLVDTIEKKKGDFVLQNEEASAKY
:::::::::.::::::::::.::::::::::.:::::...: .:::::.:::::.:..:
CCDS72 TDTLQELLDMHAACEREAIAIFMEHSFKDENQEFQKKFMETTMNKKGDFLLQNEESSVQY
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KF0 CQAELKRLSEHLTESILRGIFSVPGGHNLYLEEKKQVEWDYKLVPRKGVKANEVLQNFLQ
:::.:..::. : ::: : :::::::.::.: :...: :: ::::::::.::.: ::.
CCDS72 CQAKLNELSKGLMESISAGSFSVPGGHKLYMETKERIEQDYWQVPRKGVKAKEVFQRFLE
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KF0 SQVVVEESILQSDKALTAGEKAIAAERAMKEAAEKEQELLREKQKEQQQMMEAQERSFQE
::.:.:::::::::::: :::.:..:: :::::::::::..: .::::.::::..: .:
CCDS72 SQMVIEESILQSDKALTDREKAVAVDRAKKEAAEKEQELLKQKLQEQQQQMEAQDKSRKE
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KF0 NIAQLKKKMERERENLLREHERLLKHKLKVQEEMLKEEFQKKSEQLNKEINQLKEKIEST
::::::.:.. :::.::::. .:.: :::.. :.: :.:: :..: ::.:.:. :..:
CCDS72 NIAQLKEKLQMEREHLLREQIMMLEHTQKVQNDWLHEGFKKKYEEMNAEISQFKRMIDTT
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640
pF1KF0 KNEQLRLL-KILDMASNIMIVTLPGASKLLGVGTKYLGSRI
::.. . . :: .. . . : . .::.: :.: ..:
CCDS72 KNDDTPWIARTLDNLADELTAILSAPAKLIGHGVKGVSSLFKKHKLPF
590 600 610 620 630
>>CCDS718.1 GBP1 gene_id:2633|Hs108|chr1 (592 aa)
initn: 1848 init1: 1044 opt: 2162 Z-score: 1154.0 bits: 223.6 E(32554): 5.9e-58
Smith-Waterman score: 2162; 55.8% identity (81.9% similar) in 586 aa overlap (18-601:3-587)
10 20 30 40 50 60
pF1KF0 MGERTLHAAVPTPGYPESESIMMAPICLVENQEEQLTVNSKALEILDKISQPVVVVAIVG
:: : .:.::.:: . .: .: .::.::. :.::.:::::::
CCDS71 MASEIHMTGPMCLIENTNGRLMANPEALKILSAITQPMVVVAIVG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KF0 LYRTGKSYLMNRLAGKRNGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHLSKPNHTLVLLDTEGLGDVE
:::::::::::.::::..:: :::::::.::::::::::: .::.: :::::::::::::
CCDS71 LYRTGKSYLMNKLAGKKKGFSLGSTVQSHTKGIWMWCVPHPKKPGHILVLLDTEGLGDVE
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KF0 KSNPKNDSWIFALAVLLSSSFVYNSVSTINHQALEQLHYVTELAELIRAKSCP--RPDEA
:.. .::::::::::::::.:::::..:::.::..::.:::::.. ::.:: : .:.
CCDS71 KGDNQNDSWIFALAVLLSSTFVYNSIGTINQQAMDQLYYVTELTHRIRSKSSPDENENEV
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KF0 EDSSEFASFFPDFIWTVRDFTLELKLDGNPITEDEYLENALKLIPGKNPKIQNSNMPREC
:::..:.::::::.::.:::.:.:. ::.:.: :::: .::: : . : .. :.:: :
CCDS71 EDSADFVSFFPDFVWTLRDFSLDLEADGQPLTPDEYLTYSLKLKKGTSQKDETFNLPRLC
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KF0 IRHFFRKRKCFVFDRPTNDKQYLNHMDEVPEENLERHFLMQSDNFCSYIFTHAKTKTLRE
::.:: :.::::::::.. .. : ..... .:.:. .:..: .::::::...:::::
CCDS71 IRKFFPKKKCFVFDRPVHRRK-LAQLEKLQDEELDPEFVQQVADFCSYIFSNSKTKTLSG
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KF0 GIIVTGKRLGTLVVTYVDAINSGAVPCLENAVTALAQLENPAAVQRAADHYSQQMAQQLR
:: :.: :: .::.:::.::.:: .::.:::: ::::.:: ::::.: :: :::.:...
CCDS71 GIQVNGPRLESLVLTYVNAISSGDLPCMENAVLALAQIENSAAVQKAIAHYEQQMGQKVQ
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KF0 LPTDTLQELLDVHAACEREAIAVFMEHSFKDENHEFQKKLVDTIEKKKGDFVLQNEEASA
:::.:::::::.: ::::: ::.. :::: .: :::.:. .:::. :: ::.:::.
CCDS71 LPTETLQELLDLHRDSEREAIEVFIRSSFKDVDHLFQKELAAQLEKKRDDFCKQNQEASS
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KF0 KYCQAELKRLSEHLTESILRGIFSVPGGHNLYLEEKKQVEWDYKLVPRKGVKANEVLQNF
:.: :. . : : . ::.: :::. :.... .... : ::::..:.:.::..
CCDS71 DRCSALLQVIFSPLEEEVKAGIYSKPGGYRLFVQKLQDLKKKYYEEPRKGIQAEEILQTY
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KF0 LQSQVVVEESILQSDKALTAGEKAIAAERAMKEAAEKEQELLREKQKEQQQMMEAQERSF
:.:. . ..:::.:..:: :: : .::. :.:. ..:.: :....:::: .:::.
CCDS71 LKSKESMTDAILQTDQTLTEKEKEIEVERVKAESAQASAKMLQEMQRKNEQMMEQKERSY
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KF0 QENIAQLKKKMERERENLLREHERLLKHKLKVQEEMLKEEFQKKSEQLNKEINQLKEKIE
::.. :: .::: .: .::.:.:: : ::. ::..::: :::.:. ...::..:. :..
CCDS71 QEHLKQLTEKMENDRVQLLKEQERTLALKLQEQEQLLKEGFQKESRIMKNEIQDLQTKMR
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640
pF1KF0 STKNEQLRLLKILDMASNIMIVTLPGASKLLGVGTKYLGSRI
:
CCDS71 RRKACTIS
590
>>CCDS717.2 GBP3 gene_id:2635|Hs108|chr1 (595 aa)
initn: 2085 init1: 1089 opt: 2130 Z-score: 1137.3 bits: 220.6 E(32554): 5e-57
Smith-Waterman score: 2130; 54.7% identity (81.4% similar) in 590 aa overlap (22-610:7-595)
10 20 30 40 50 60
pF1KF0 MGERTLHAAVPTPGYPESESIMMAPICLVENQEEQLTVNSKALEILDKISQPVVVVAIVG
: .:.::.:: . .:..: .::.::. :.::::::::::
CCDS71 MAPEIHMTGPMCLIENTNGELVANPEALKILSAITQPVVVVAIVG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KF0 LYRTGKSYLMNRLAGKRNGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHLSKPNHTLVLLDTEGLGDVE
:::::::::::.:::: .:: :::::.:.::::::::::: .::.::::::::::::::.
CCDS71 LYRTGKSYLMNKLAGKNKGFSLGSTVKSHTKGIWMWCVPHPKKPEHTLVLLDTEGLGDVK
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KF0 KSNPKNDSWIFALAVLLSSSFVYNSVSTINHQALEQLHYVTELAELIRAKSCPRPDEAED
:.. .::::::.:::::::..::::..:::.::..::.:::::.. ::.:: : .: ::
CCDS71 KGDNQNDSWIFTLAVLLSSTLVYNSMGTINQQAMDQLYYVTELTHRIRSKSSPDENENED
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KF0 SSEFASFFPDFIWTVRDFTLELKLDGNPITEDEYLENALKLIPGKNPKIQNSNMPRECIR
:..:.::::::.::.:::.:.:. ::.:.: ::::: .::: : . : .: :.:: :::
CCDS71 SADFVSFFPDFVWTLRDFSLDLEADGQPLTPDEYLEYSLKLTQGTSQKDKNFNLPRLCIR
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KF0 HFFRKRKCFVFDRPTNDKQYLNHMDEVPEENLERHFLMQSDNFCSYIFTHAKTKTLREGI
.:: :.:::::: : . .. : ..... .:.:. .:..: .::::::...::::: ::
CCDS71 KFFPKKKCFVFDLPIHRRK-LAQLEKLQDEELDPEFVQQVADFCSYIFSNSKTKTLSGGI
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KF0 IVTGKRLGTLVVTYVDAINSGAVPCLENAVTALAQLENPAAVQRAADHYSQQMAQQLRLP
:.: :: .::.::..::. : .::.:::: ::::.:: ::::.: ::.:::.:...::
CCDS71 KVNGPRLESLVLTYINAISRGDLPCMENAVLALAQIENSAAVQKAIAHYDQQMGQKVQLP
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KF0 TDTLQELLDVHAACEREAIAVFMEHSFKDENHEFQKKLVDTIEKKKGDFVLQNEEASAKY
..:::::::.: . :::: :.:..:::: .: :::::. ..::. :: ::.:::.
CCDS71 AETLQELLDLHRVSEREATEVYMKNSFKDVDHLFQKKLAAQLDKKRDDFCKQNQEASSDR
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KF0 CQAELKRLSEHLTESILRGIFSVPGGHNLYLEEKKQVEWDYKLVPRKGVKANEVLQNFLQ
:.: :. . : : . ::.: :::. :.... ...: : ::::..:.:.::..:.
CCDS71 CSALLQVIFSPLEEEVKAGIYSKPGGYCLFIQKLQDLEKKYYEEPRKGIQAEEILQTYLK
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KF0 SQVVVEESILQSDKALTAGEKAIAAERAMKEAAEKEQELLREKQKEQQQMMEAQERSFQE
:. : ..:::.:. :: :: : .: . :.:. ....: : . ::::: .:.:.::
CCDS71 SKESVTDAILQTDQILTEKEKEIEVECVKAESAQASAKMVEEMQIKYQQMMEEKEKSYQE
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590
pF1KF0 NIAQLKKKMERERENLLREHERLLKHKLKVQEEMLKEEFQKKSEQLNKEINQLKEKIES-
.. :: .:::::: .::.:.:. : ::. : ..:::. : .: ::..::..:.. ...
CCDS71 HVKQLTEKMERERAQLLEEQEKTLTSKLQEQARVLKERCQGESTQLQNEIQKLQKTLKKK
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640
pF1KF0 TKNEQLRLLKILDMASNIMIVTLPGASKLLGVGTKYLGSRI
:: . . :::
CCDS71 TKRYMSHKLKI
590
>>CCDS719.1 GBP2 gene_id:2634|Hs108|chr1 (591 aa)
initn: 2190 init1: 1080 opt: 2122 Z-score: 1133.1 bits: 219.8 E(32554): 8.5e-57
Smith-Waterman score: 2122; 55.5% identity (82.1% similar) in 575 aa overlap (25-599:10-583)
10 20 30 40 50 60
pF1KF0 MGERTLHAAVPTPGYPESESIMMAPICLVENQEEQLTVNSKALEILDKISQPVVVVAIVG
:. :..: . ::.:: .::.::. :.::::::::::
CCDS71 MAPEINLPGPMSLIDNTKGQLVVNPEALKILSAITQPVVVVAIVG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KF0 LYRTGKSYLMNRLAGKRNGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHLSKPNHTLVLLDTEGLGDVE
:::::::::::.::::.::: :::::.:.::::::::::: .::.:::::::::::::.:
CCDS71 LYRTGKSYLMNKLAGKKNGFSLGSTVKSHTKGIWMWCVPHPKKPEHTLVLLDTEGLGDIE
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KF0 KSNPKNDSWIFALAVLLSSSFVYNSVSTINHQALEQLHYVTELAELIRAKSCPRPDEAED
:.. .:::::::::.::::.:::::..:::.::..::::::::.. :.:.: : . ..:
CCDS71 KGDNENDSWIFALAILLSSTFVYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIKANSSPGNNSVDD
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KF0 SSEFASFFPDFIWTVRDFTLELKLDGNPITEDEYLENALKLIPGKNPKIQNSNMPRECIR
:..:.:::: :.::.:::::::..::.::: :.::: .::: : . : .. : :: :::
CCDS71 SADFVSFFPAFVWTLRDFTLELEVDGEPITADDYLELSLKLRKGTDKKSKSFNDPRLCIR
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KF0 HFFRKRKCFVFDRPTNDKQYLNHMDEVPEENLERHFLMQSDNFCSYIFTHAKTKTLREGI
.:: :::::::: :. :.:: :.... ::.:. :. : .:::::..:...::: ::
CCDS71 KFFPKRKCFVFDWPA-PKKYLAHLEQLKEEELNPDFIEQVAEFCSYILSHSNVKTLSGGI
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KF0 IVTGKRLGTLVVTYVDAINSGAVPCLENAVTALAQLENPAAVQRAADHYSQQMAQQLRLP
:.: :: .::.:::.::.:: .::.:::: ::::.:: :::..: :: :::.:...::
CCDS71 PVNGPRLESLVLTYVNAISSGDLPCMENAVLALAQIENSAAVEKAIAHYEQQMGQKVQLP
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KF0 TDTLQELLDVHAACEREAIAVFMEHSFKDENHEFQKKLVDTIEKKKGDFVLQNEEASAKY
:.:::::::.: ::::: :::..:::: .. ::.:: .: .. :: :: .::.
CCDS71 TETLQELLDLHRDSEREAIEVFMKNSFKDVDQMFQRKLGAQLEARRDDFCKQNSKASSDC
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KF0 CQAELKRLSEHLTESILRGIFSVPGGHNLYLEEKKQVEWDYKLVPRKGVKANEVLQNFLQ
:.: :. . : :.. .: :: :::. :. .. .... : :::::..:.:::...:.
CCDS71 CMALLQDIFGPLEEDVKQGTFSKPGGYRLFTQKLQELKNKYYQVPRKGIQAKEVLKKYLE
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KF0 SQVVVEESILQSDKALTAGEKAIAAERAMKEAAEKEQELLREKQKEQQQMMEAQERSFQE
:. : ...::.:..:. :::: .:: :.:: ...:.: ::....::: .:.:.::
CCDS71 SKEDVADALLQTDQSLSEKEKAIEVERIKAESAEAAKKMLEEIQKKNEEMMEQKEKSYQE
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KF0 NIAQLKKKMERERENLLREHERLLKHKLKVQEEMLKEEFQKKSEQLNKEINQLKEKIEST
.. :: .::::.: .:. :.:. : ::. ::..::: :...:..:.:.: ... . .:
CCDS71 HVKQLTEKMERDRAQLMAEQEKTLALKLQEQERLLKEGFENESKRLQKDIWDIQMRSKSL
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640
pF1KF0 KNEQLRLLKILDMASNIMIVTLPGASKLLGVGTKYLGSRI
CCDS71 EPICNIL
590
>>CCDS722.1 GBP5 gene_id:115362|Hs108|chr1 (586 aa)
initn: 1960 init1: 1027 opt: 1963 Z-score: 1050.3 bits: 204.4 E(32554): 3.5e-52
Smith-Waterman score: 1963; 51.6% identity (79.6% similar) in 578 aa overlap (22-599:7-579)
10 20 30 40 50 60
pF1KF0 MGERTLHAAVPTPGYPESESIMMAPICLVENQEEQLTVNSKALEILDKISQPVVVVAIVG
: :.::.:: .::: ::..:::::. :.::::::::::
CCDS72 MALEIHMSDPMCLIENFNEQLKVNQEALEILSAITQPVVVVAIVG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KF0 LYRTGKSYLMNRLAGKRNGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHLSKPNHTLVLLDTEGLGDVE
:::::::::::.:::: .:: ..:::::.:::::.::::: . :::::::::::::::::
CCDS72 LYRTGKSYLMNKLAGKNKGFSVASTVQSHTKGIWIWCVPHPNWPNHTLVLLDTEGLGDVE
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KF0 KSNPKNDSWIFALAVLLSSSFVYNSVSTINHQALEQLHYVTELAELIRAKSCPRPDEAED
:.. ::: :::::.::::.::::.:. :.. :.. :: ::::..:..:.. : :..::
CCDS72 KADNKNDIQIFALALLLSSTFVYNTVNKIDQGAIDLLHNVTELTDLLKARNSPDLDRVED
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KF0 SSEFASFFPDFIWTVRDFTLELKLDGNPITEDEYLENALKLIPGKNPKIQNSNMPRECIR
.. ::::::..::.::: : :..::. .: ::::::.:. :.. ..:: :.:: ::.
CCDS72 PADSASFFPDLVWTLRDFCLGLEIDGQLVTPDEYLENSLRPKQGSDQRVQNFNLPRLCIQ
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KF0 HFFRKRKCFVFDRPTNDKQYLNHMDEVPEENLERHFLMQSDNFCSYIFTHAKTKTLREGI
.:: :.:::.:: :...:. : ... .:...:: .:..: .::::::.:. :::: ::
CCDS72 KFFPKKKCFIFDLPAHQKK-LAQLETLPDDELEPEFVQQVTEFCSYIFSHSMTKTLPGGI
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KF0 IVTGKRLGTLVVTYVDAINSGAVPCLENAVTALAQLENPAAVQRAADHYSQQMAQQLRLP
.:.:.:: .::.:::.::.:: .::.:::: :::: :: ::::.: ::.:::.:...::
CCDS72 MVNGSRLKNLVLTYVNAISSGDLPCIENAVLALAQRENSAAVQKAIAHYDQQMGQKVQLP
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KF0 TDTLQELLDVHAACEREAIAVFMEHSFKDENHEFQKKLVDTIEKKKGDFVLQNEEASAKY
.:::::::.: . ::::: :::..:::: .. :::.: .. :..:. .: :::. :
CCDS72 METLQELLDLHRTSEREAIEVFMKNSFKDVDQSFQKELETLLDAKQNDICKRNLEASSDY
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KF0 CQAELKRLSEHLTESILRGIFSVPGGHNLYLEEKKQVEWDYKLVPRKGVKANEVLQNFLQ
:.: :: . : :.. .::.: ::::::.... .... : ::::..:.::::..:.
CCDS72 CSALLKDIFGPLEEAVKQGIYSKPGGHNLFIQKTEELKAKYYREPRKGIQAEEVLQKYLK
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KF0 SQVVVEESILQSDKALTAGEKAIAAERAMKEAAEKEQELLREKQKEQQQMMEAQERSFQE
:. : ..:::.:.::: :: .. :: . : . : :....:::. .:: ::
CCDS72 SKESVSHAILQTDQALTETEKKKKEAQVKAEAEKAEAQRLAAIQRQNEQMMQERERLHQE
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KF0 NIAQLKKKMERERENLLREHERLLKHKLKVQEEMLKEEFQKKSEQLNKEINQLKEKIEST
.. : :: ..: : :.... ..... : .:. :: ....: .:... .. ...
CCDS72 QVRQ----MEIAKQNWLAEQQKMQEQQMQEQAAQLSTTFQAQNRSLLSELQHAQRTVNND
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640
pF1KF0 KNEQLRLLKILDMASNIMIVTLPGASKLLGVGTKYLGSRI
CCDS72 DPCVLL
640 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 06:36:24 2016 done: Sat Nov 5 06:36:25 2016
Total Scan time: 3.910 Total Display time: 0.130
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]