FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9696, 1996 aa
1>>>pF1KE9696 1996 - 1996 aa - 1996 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.9283+/- 0.001; mu= 6.8162+/- 0.061
mean_var=289.0656+/-58.330, 0's: 0 Z-trim(114.2): 129 B-trim: 10 in 1/53
Lambda= 0.075436
statistics sampled from 14882 (15011) to 14882 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.741), E-opt: 0.2 (0.449), width: 16
Scan time: 3.950
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS32554.1 CHD3 gene_id:1107|Hs109|chr17 (2000) 13579 1492.8 0
CCDS32553.2 CHD3 gene_id:1107|Hs109|chr17 (2059) 13347 1467.5 0
CCDS32555.1 CHD3 gene_id:1107|Hs109|chr17 (1966) 11199 1233.7 0
CCDS76510.1 CHD4 gene_id:1108|Hs109|chr12 (1905) 7186 797.0 0
CCDS8552.1 CHD4 gene_id:1108|Hs109|chr12 (1912) 7183 796.7 0
CCDS86267.1 CHD4 gene_id:1108|Hs109|chr12 (1902) 6871 762.7 3.2e-219
CCDS57.1 CHD5 gene_id:26038|Hs109|chr1 (1954) 5272 588.7 7.9e-167
CCDS47865.1 CHD7 gene_id:55636|Hs109|chr8 (2997) 1633 192.8 1.8e-47
CCDS45485.1 CHD9 gene_id:80205|Hs109|chr16 (2881) 1578 186.8 1.1e-45
CCDS76865.1 CHD9 gene_id:80205|Hs109|chr16 (2897) 1578 186.8 1.1e-45
CCDS45081.1 CHD8 gene_id:57680|Hs109|chr14 (2302) 1557 184.5 4.5e-45
CCDS53885.1 CHD8 gene_id:57680|Hs109|chr14 (2581) 1557 184.5 5e-45
CCDS10374.2 CHD2 gene_id:1106|Hs109|chr15 (1828) 1468 174.7 3.2e-42
CCDS34204.1 CHD1 gene_id:1105|Hs109|chr5 (1710) 1420 169.4 1.1e-40
CCDS13317.1 CHD6 gene_id:84181|Hs109|chr20 (2715) 1298 156.3 1.6e-36
CCDS76018.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs109|chrX (1058) 1238 149.5 7.2e-35
CCDS3761.1 SMARCA5 gene_id:8467|Hs109|chr4 (1052) 1188 144.0 3.1e-33
CCDS54218.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs109|chr19 (1613) 1065 130.8 4.6e-29
CCDS54217.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs109|chr19 (1614) 1065 130.8 4.6e-29
CCDS45973.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs109|chr19 (1616) 1058 130.0 7.8e-29
CCDS45972.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs109|chr19 (1617) 1058 130.0 7.8e-29
CCDS34978.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs109|chr9 (1572) 1055 129.7 9.5e-29
CCDS34977.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs109|chr9 (1590) 1046 128.7 1.9e-28
CCDS12253.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs109|chr19 (1647) 1031 127.1 6e-28
CCDS72882.1 CHD1L gene_id:9557|Hs109|chr1 ( 797) 964 119.5 5.5e-26
CCDS927.1 CHD1L gene_id:9557|Hs109|chr1 ( 897) 964 119.6 6e-26
CCDS83338.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs109|chr9 (1514) 832 105.4 1.9e-21
CCDS14612.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs109|chrX (1054) 733 94.5 2.5e-18
CCDS76019.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs109|chrX (1070) 733 94.5 2.5e-18
CCDS7229.1 ERCC6 gene_id:2074|Hs109|chr10 (1493) 718 93.0 1e-17
CCDS58022.1 CHD1L gene_id:9557|Hs109|chr1 ( 616) 696 90.3 2.7e-17
CCDS58021.1 CHD1L gene_id:9557|Hs109|chr1 ( 693) 696 90.3 3e-17
CCDS73164.1 HELLS gene_id:3070|Hs109|chr10 ( 700) 626 82.7 5.9e-15
CCDS73165.1 HELLS gene_id:3070|Hs109|chr10 ( 714) 626 82.7 6e-15
CCDS73163.1 HELLS gene_id:3070|Hs109|chr10 ( 740) 626 82.7 6.2e-15
CCDS7434.1 HELLS gene_id:3070|Hs109|chr10 ( 838) 626 82.8 6.8e-15
CCDS73162.1 HELLS gene_id:3070|Hs109|chr10 ( 884) 626 82.8 7e-15
CCDS10689.2 SRCAP gene_id:10847|Hs109|chr16 (3230) 561 76.2 2.5e-12
CCDS10071.1 INO80 gene_id:54617|Hs109|chr15 (1556) 545 74.2 4.8e-12
>>CCDS32554.1 CHD3 gene_id:1107|Hs109|chr17 (2000 aa)
initn: 11546 init1: 11546 opt: 13579 Z-score: 7994.6 bits: 1492.8 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 13579; 99.8% identity (99.8% similar) in 2000 aa overlap (1-1996:1-2000)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MKAADTVILWARSKNDQLRISFPPGLCWGDRMPDKDDIRLLPSALGVKKRKRGPKKQKEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MKAADTVILWARSKNDQLRISFPPGLCWGDRMPDKDDIRLLPSALGVKKRKRGPKKQKEN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 KPGKPRKRKKRDSEEEFGSERDEYREKSESGGSEYGTGPGRKRRRKHREKKEKKTKRRKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KPGKPRKRKKRDSEEEFGSERDEYREKSESGGSEYGTGPGRKRRRKHREKKEKKTKRRKK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 GEGDGGQKQVEQKSSATLLLTWGLEDVEHVFSEEDYHTLTNYKAFSQFMRPLIAKKNPKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GEGDGGQKQVEQKSSATLLLTWGLEDVEHVFSEEDYHTLTNYKAFSQFMRPLIAKKNPKI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 PMSKMMTILGAKWREFSANNPFKGSAAAVAAAAAAAAAAVAEQVSAAVSSATPIAPSGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PMSKMMTILGAKWREFSANNPFKGSAAAVAAAAAAAAAAVAEQVSAAVSSATPIAPSGPP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 ALPPPPAADIQPPPIRRAKTKEGKGPGHKRRSKSPRVPDGRKKLRGKKMAPLKIKLGLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ALPPPPAADIQPPPIRRAKTKEGKGPGHKRRSKSPRVPDGRKKLRGKKMAPLKIKLGLLG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE9 GKRKKGGS----SDEGPEPEAEESDLDSGSVHSASGRPDGPVRTKKLKRGRPGRKKKKVL
:::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GKRKKGGSYVFQSDEGPEPEAEESDLDSGSVHSASGRPDGPVRTKKLKRGRPGRKKKKVL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE9 GCPAVAGEEEVDGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHLVCLDPELDRAPEGKWSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GCPAVAGEEEVDGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHLVCLDPELDRAPEGKWSC
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE9 PHCEKEGVQWEAKEEEEEYEEEGEEEGEKEEEDDHMEYCRVCKDGGELLCCDACISSYHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PHCEKEGVQWEAKEEEEEYEEEGEEEGEKEEEDDHMEYCRVCKDGGELLCCDACISSYHI
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE9 HCLNPPLPDIPNGEWLCPRCTCPVLKGRVQKILHWRWGEPPVAVPAPQQADGNPDVPPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HCLNPPLPDIPNGEWLCPRCTCPVLKGRVQKILHWRWGEPPVAVPAPQQADGNPDVPPPR
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE9 PLQGRSEREFFVKWVGLSYWHCSWAKELQLEIFHLVMYRNYQRKNDMDEPPPLDYGSGED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PLQGRSEREFFVKWVGLSYWHCSWAKELQLEIFHLVMYRNYQRKNDMDEPPPLDYGSGED
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KE9 DGKSDKRKVKDPHYAEMEEKYYRFGIKPEWMTVHRIINHSVDKKGNYHYLVKWRDLPYDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DGKSDKRKVKDPHYAEMEEKYYRFGIKPEWMTVHRIINHSVDKKGNYHYLVKWRDLPYDQ
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KE9 STWEEDEMNIPEYEEHKQSYWRHRELIMGEDPAQPRKYKKKKKELQGDGPPSSPTNDPTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 STWEEDEMNIPEYEEHKQSYWRHRELIMGEDPAQPRKYKKKKKELQGDGPPSSPTNDPTV
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KE9 KYETQPRFITATGGTLHMYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTIQTIVFLYSLYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KYETQPRFITATGGTLHMYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTIQTIVFLYSLYK
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KE9 EGHTKGPFLVSAPLSTIINWEREFQMWAPKFYVVTYTGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EGHTKGPFLVSAPLSTIINWEREFQMWAPKFYVVTYTGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIKG
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KE9 GKKAFKMKREAQVKFHVLLTSYELITIDQAALGSIRWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GKKAFKMKREAQVKFHVLLTSYELITIDQAALGSIRWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLN
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KE9 GYKIDHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GYKIDHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLL
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE9 GPHMLRRLKADVFKNMPAKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNSRGGGNQVSLLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GPHMLRRLKADVFKNMPAKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNSRGGGNQVSLLN
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE9 IMMDLKKCCNHPYLFPVAAMESPKLPSGAYEGGALIKSSGKLMLLQKMLRKLKEQGHRVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IMMDLKKCCNHPYLFPVAAMESPKLPSGAYEGGALIKSSGKLMLLQKMLRKLKEQGHRVL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE9 IFSQMTKMLDLLEDFLDYEGYKYERIDGGITGALRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IFSQMTKMLDLLEDFLDYEGYKYERIDGGITGALRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE9 LGINLATADTVIIFDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQANKVMIYRFVTRASVEERITQVAKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LGINLATADTVIIFDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQANKVMIYRFVTRASVEERITQVAKR
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KE9 KMMLTHLVVRPGLGSKAGSMSKQELDDILKFGTEELFKDENEGENKEEDSSVIHYDNEAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KMMLTHLVVRPGLGSKAGSMSKQELDDILKFGTEELFKDENEGENKEEDSSVIHYDNEAI
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KE9 ARLLDRNQDATEDTDVQNMNEYLSSFKVAQYVVREEDKIEEIEREIIKQEENVDPDYWEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ARLLDRNQDATEDTDVQNMNEYLSSFKVAQYVVREEDKIEEIEREIIKQEENVDPDYWEK
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KE9 LLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRVRKQVNYNDAAQEDQDNQSEYSVGSEEEDEDFDERPEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRVRKQVNYNDAAQEDQDNQSEYSVGSEEEDEDFDERPEG
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KE9 RRQSKRQLRNEKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNTRQRKAFLNAVMRWGMPPQDAFTTQWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RRQSKRQLRNEKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNTRQRKAFLNAVMRWGMPPQDAFTTQWL
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KE9 VRDLRGKTEKEFKAYVSLFMRHLCEPGADGSETFADGVPREGLSRQQVLTRIGVMSLVKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VRDLRGKTEKEFKAYVSLFMRHLCEPGADGSETFADGVPREGLSRQQVLTRIGVMSLVKK
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1500 1510 1520 1530 1540 1550
pF1KE9 KVQEFEHINGRWSMPELMPDPSADSKRSSRASSPTKTSPTTPEASATNSPCTSKPATPAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KVQEFEHINGRWSMPELMPDPSADSKRSSRASSPTKTSPTTPEASATNSPCTSKPATPAP
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1560 1570 1580 1590 1600 1610
pF1KE9 SEKGEGIRTPLEKEEAENQEEKPEKNSRIGEKMETEADAPSPAPSLGERLEPRKIPLEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SEKGEGIRTPLEKEEAENQEEKPEKNSRIGEKMETEADAPSPAPSLGERLEPRKIPLEDE
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1620 1630 1640 1650 1660 1670
pF1KE9 VPGVPGEMEPEPGYRGDREKSATESTPGERGEEKPLDGQEHRERPEGETGDLGKREDVKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VPGVPGEMEPEPGYRGDREKSATESTPGERGEEKPLDGQEHRERPEGETGDLGKREDVKG
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1680 1690 1700 1710 1720 1730
pF1KE9 DRELRPGPRDEPRSNGRREEKTEKPRFMFNIADGGFTELHTLWQNEERAAISSGKLNEIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DRELRPGPRDEPRSNGRREEKTEKPRFMFNIADGGFTELHTLWQNEERAAISSGKLNEIW
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1740 1750 1760 1770 1780 1790
pF1KE9 HRRHDYWLLAGIVLHGYARWQDIQNDAQFAIINEPFKTEANKGNFLEMKNKFLARRFKLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HRRHDYWLLAGIVLHGYARWQDIQNDAQFAIINEPFKTEANKGNFLEMKNKFLARRFKLL
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1800 1810 1820 1830 1840 1850
pF1KE9 EQALVIEEQLRRAAYLNLSQEPAHPAMALHARFAEAECLAESHQHLSKESLAGNKPANAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EQALVIEEQLRRAAYLNLSQEPAHPAMALHARFAEAECLAESHQHLSKESLAGNKPANAV
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1860 1870 1880 1890 1900 1910
pF1KE9 LHKVLNQLEELLSDMKADVTRLPATLSRIPPIAARLQMSERSILSRLASKGTEPHPTPAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LHKVLNQLEELLSDMKADVTRLPATLSRIPPIAARLQMSERSILSRLASKGTEPHPTPAY
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1920 1930 1940 1950 1960 1970
pF1KE9 PPGPYATPPGYGAAFSAAPVGALAAAGANYSQMPAGSFITAATNGPPVLVKKEKEMVGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PPGPYATPPGYGAAFSAAPVGALAAAGANYSQMPAGSFITAATNGPPVLVKKEKEMVGAL
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1980 1990
pF1KE9 VSDGLDRKEPRAGEVICIDD
::::::::::::::::::::
CCDS32 VSDGLDRKEPRAGEVICIDD
1990 2000
>>CCDS32553.2 CHD3 gene_id:1107|Hs109|chr17 (2059 aa)
initn: 11546 init1: 11546 opt: 13347 Z-score: 7858.0 bits: 1467.5 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 13347; 99.8% identity (99.8% similar) in 1968 aa overlap (33-1996:92-2059)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 AADTVILWARSKNDQLRISFPPGLCWGDRMPDKDDIRLLPSALGVKKRKRGPKKQKENKP
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RDRHSPPGCHLFPPPPPPPPPLPPPPPPPPPDKDDIRLLPSALGVKKRKRGPKKQKENKP
70 80 90 100 110 120
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 GKPRKRKKRDSEEEFGSERDEYREKSESGGSEYGTGPGRKRRRKHREKKEKKTKRRKKGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GKPRKRKKRDSEEEFGSERDEYREKSESGGSEYGTGPGRKRRRKHREKKEKKTKRRKKGE
130 140 150 160 170 180
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 GDGGQKQVEQKSSATLLLTWGLEDVEHVFSEEDYHTLTNYKAFSQFMRPLIAKKNPKIPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GDGGQKQVEQKSSATLLLTWGLEDVEHVFSEEDYHTLTNYKAFSQFMRPLIAKKNPKIPM
190 200 210 220 230 240
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 SKMMTILGAKWREFSANNPFKGSAAAVAAAAAAAAAAVAEQVSAAVSSATPIAPSGPPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SKMMTILGAKWREFSANNPFKGSAAAVAAAAAAAAAAVAEQVSAAVSSATPIAPSGPPAL
250 260 270 280 290 300
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 PPPPAADIQPPPIRRAKTKEGKGPGHKRRSKSPRVPDGRKKLRGKKMAPLKIKLGLLGGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PPPPAADIQPPPIRRAKTKEGKGPGHKRRSKSPRVPDGRKKLRGKKMAPLKIKLGLLGGK
310 320 330 340 350 360
310 320 330 340 350
pF1KE9 RKKGGS----SDEGPEPEAEESDLDSGSVHSASGRPDGPVRTKKLKRGRPGRKKKKVLGC
:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RKKGGSYVFQSDEGPEPEAEESDLDSGSVHSASGRPDGPVRTKKLKRGRPGRKKKKVLGC
370 380 390 400 410 420
360 370 380 390 400 410
pF1KE9 PAVAGEEEVDGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHLVCLDPELDRAPEGKWSCPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PAVAGEEEVDGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHLVCLDPELDRAPEGKWSCPH
430 440 450 460 470 480
420 430 440 450 460 470
pF1KE9 CEKEGVQWEAKEEEEEYEEEGEEEGEKEEEDDHMEYCRVCKDGGELLCCDACISSYHIHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CEKEGVQWEAKEEEEEYEEEGEEEGEKEEEDDHMEYCRVCKDGGELLCCDACISSYHIHC
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480 490 500 510 520 530
pF1KE9 LNPPLPDIPNGEWLCPRCTCPVLKGRVQKILHWRWGEPPVAVPAPQQADGNPDVPPPRPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LNPPLPDIPNGEWLCPRCTCPVLKGRVQKILHWRWGEPPVAVPAPQQADGNPDVPPPRPL
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540 550 560 570 580 590
pF1KE9 QGRSEREFFVKWVGLSYWHCSWAKELQLEIFHLVMYRNYQRKNDMDEPPPLDYGSGEDDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QGRSEREFFVKWVGLSYWHCSWAKELQLEIFHLVMYRNYQRKNDMDEPPPLDYGSGEDDG
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600 610 620 630 640 650
pF1KE9 KSDKRKVKDPHYAEMEEKYYRFGIKPEWMTVHRIINHSVDKKGNYHYLVKWRDLPYDQST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KSDKRKVKDPHYAEMEEKYYRFGIKPEWMTVHRIINHSVDKKGNYHYLVKWRDLPYDQST
670 680 690 700 710 720
660 670 680 690 700 710
pF1KE9 WEEDEMNIPEYEEHKQSYWRHRELIMGEDPAQPRKYKKKKKELQGDGPPSSPTNDPTVKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 WEEDEMNIPEYEEHKQSYWRHRELIMGEDPAQPRKYKKKKKELQGDGPPSSPTNDPTVKY
730 740 750 760 770 780
720 730 740 750 760 770
pF1KE9 ETQPRFITATGGTLHMYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTIQTIVFLYSLYKEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ETQPRFITATGGTLHMYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTIQTIVFLYSLYKEG
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780 790 800 810 820 830
pF1KE9 HTKGPFLVSAPLSTIINWEREFQMWAPKFYVVTYTGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIKGGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HTKGPFLVSAPLSTIINWEREFQMWAPKFYVVTYTGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIKGGK
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pF1KE9 KAFKMKREAQVKFHVLLTSYELITIDQAALGSIRWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KAFKMKREAQVKFHVLLTSYELITIDQAALGSIRWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGY
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900 910 920 930 940 950
pF1KE9 KIDHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KIDHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGP
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960 970 980 990 1000 1010
pF1KE9 HMLRRLKADVFKNMPAKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNSRGGGNQVSLLNIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HMLRRLKADVFKNMPAKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNSRGGGNQVSLLNIM
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE9 MDLKKCCNHPYLFPVAAMESPKLPSGAYEGGALIKSSGKLMLLQKMLRKLKEQGHRVLIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MDLKKCCNHPYLFPVAAMESPKLPSGAYEGGALIKSSGKLMLLQKMLRKLKEQGHRVLIF
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE9 SQMTKMLDLLEDFLDYEGYKYERIDGGITGALRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SQMTKMLDLLEDFLDYEGYKYERIDGGITGALRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLG
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE9 INLATADTVIIFDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQANKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 INLATADTVIIFDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQANKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKM
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KE9 MLTHLVVRPGLGSKAGSMSKQELDDILKFGTEELFKDENEGENKEEDSSVIHYDNEAIAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MLTHLVVRPGLGSKAGSMSKQELDDILKFGTEELFKDENEGENKEEDSSVIHYDNEAIAR
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KE9 LLDRNQDATEDTDVQNMNEYLSSFKVAQYVVREEDKIEEIEREIIKQEENVDPDYWEKLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLDRNQDATEDTDVQNMNEYLSSFKVAQYVVREEDKIEEIEREIIKQEENVDPDYWEKLL
1330 1340 1350 1360 1370 1380
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pF1KE9 RHHYEQQQEDLARNLGKGKRVRKQVNYNDAAQEDQDNQSEYSVGSEEEDEDFDERPEGRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RHHYEQQQEDLARNLGKGKRVRKQVNYNDAAQEDQDNQSEYSVGSEEEDEDFDERPEGRR
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KE9 QSKRQLRNEKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNTRQRKAFLNAVMRWGMPPQDAFTTQWLVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QSKRQLRNEKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNTRQRKAFLNAVMRWGMPPQDAFTTQWLVR
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pF1KE9 DLRGKTEKEFKAYVSLFMRHLCEPGADGSETFADGVPREGLSRQQVLTRIGVMSLVKKKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DLRGKTEKEFKAYVSLFMRHLCEPGADGSETFADGVPREGLSRQQVLTRIGVMSLVKKKV
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1500 1510 1520 1530 1540 1550
pF1KE9 QEFEHINGRWSMPELMPDPSADSKRSSRASSPTKTSPTTPEASATNSPCTSKPATPAPSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QEFEHINGRWSMPELMPDPSADSKRSSRASSPTKTSPTTPEASATNSPCTSKPATPAPSE
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1560 1570 1580 1590 1600 1610
pF1KE9 KGEGIRTPLEKEEAENQEEKPEKNSRIGEKMETEADAPSPAPSLGERLEPRKIPLEDEVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KGEGIRTPLEKEEAENQEEKPEKNSRIGEKMETEADAPSPAPSLGERLEPRKIPLEDEVP
1630 1640 1650 1660 1670 1680
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pF1KE9 GVPGEMEPEPGYRGDREKSATESTPGERGEEKPLDGQEHRERPEGETGDLGKREDVKGDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GVPGEMEPEPGYRGDREKSATESTPGERGEEKPLDGQEHRERPEGETGDLGKREDVKGDR
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1680 1690 1700 1710 1720 1730
pF1KE9 ELRPGPRDEPRSNGRREEKTEKPRFMFNIADGGFTELHTLWQNEERAAISSGKLNEIWHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ELRPGPRDEPRSNGRREEKTEKPRFMFNIADGGFTELHTLWQNEERAAISSGKLNEIWHR
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1740 1750 1760 1770 1780 1790
pF1KE9 RHDYWLLAGIVLHGYARWQDIQNDAQFAIINEPFKTEANKGNFLEMKNKFLARRFKLLEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RHDYWLLAGIVLHGYARWQDIQNDAQFAIINEPFKTEANKGNFLEMKNKFLARRFKLLEQ
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1800 1810 1820 1830 1840 1850
pF1KE9 ALVIEEQLRRAAYLNLSQEPAHPAMALHARFAEAECLAESHQHLSKESLAGNKPANAVLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ALVIEEQLRRAAYLNLSQEPAHPAMALHARFAEAECLAESHQHLSKESLAGNKPANAVLH
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1860 1870 1880 1890 1900 1910
pF1KE9 KVLNQLEELLSDMKADVTRLPATLSRIPPIAARLQMSERSILSRLASKGTEPHPTPAYPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KVLNQLEELLSDMKADVTRLPATLSRIPPIAARLQMSERSILSRLASKGTEPHPTPAYPP
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1920 1930 1940 1950 1960 1970
pF1KE9 GPYATPPGYGAAFSAAPVGALAAAGANYSQMPAGSFITAATNGPPVLVKKEKEMVGALVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GPYATPPGYGAAFSAAPVGALAAAGANYSQMPAGSFITAATNGPPVLVKKEKEMVGALVS
1990 2000 2010 2020 2030 2040
1980 1990
pF1KE9 DGLDRKEPRAGEVICIDD
::::::::::::::::::
CCDS32 DGLDRKEPRAGEVICIDD
2050
>>CCDS32555.1 CHD3 gene_id:1107|Hs109|chr17 (1966 aa)
initn: 9146 init1: 9146 opt: 11199 Z-score: 6594.8 bits: 1233.7 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 13267; 98.1% identity (98.1% similar) in 2000 aa overlap (1-1996:1-1966)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MKAADTVILWARSKNDQLRISFPPGLCWGDRMPDKDDIRLLPSALGVKKRKRGPKKQKEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MKAADTVILWARSKNDQLRISFPPGLCWGDRMPDKDDIRLLPSALGVKKRKRGPKKQKEN
10 20 30 40 50 60
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pF1KE9 KPGKPRKRKKRDSEEEFGSERDEYREKSESGGSEYGTGPGRKRRRKHREKKEKKTKRRKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KPGKPRKRKKRDSEEEFGSERDEYREKSESGGSEYGTGPGRKRRRKHREKKEKKTKRRKK
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pF1KE9 GEGDGGQKQVEQKSSATLLLTWGLEDVEHVFSEEDYHTLTNYKAFSQFMRPLIAKKNPKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GEGDGGQKQVEQKSSATLLLTWGLEDVEHVFSEEDYHTLTNYKAFSQFMRPLIAKKNPKI
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pF1KE9 PMSKMMTILGAKWREFSANNPFKGSAAAVAAAAAAAAAAVAEQVSAAVSSATPIAPSGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PMSKMMTILGAKWREFSANNPFKGSAAAVAAAAAAAAAAVAEQVSAAVSSATPIAPSGPP
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pF1KE9 ALPPPPAADIQPPPIRRAKTKEGKGPGHKRRSKSPRVPDGRKKLRGKKMAPLKIKLGLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ALPPPPAADIQPPPIRRAKTKEGKGPGHKRRSKSPRVPDGRKKLRGKKMAPLKIKLGLLG
250 260 270 280 290 300
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pF1KE9 GKRKKGGS----SDEGPEPEAEESDLDSGSVHSASGRPDGPVRTKKLKRGRPGRKKKKVL
:::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GKRKKGGSYVFQSDEGPEPEAEESDLDSGSVHSASGRPDGPVRTKKLKRGRPGRKKKKVL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE9 GCPAVAGEEEVDGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHLVCLDPELDRAPEGKWSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GCPAVAGEEEVDGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHLVCLDPELDRAPEGKWSC
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE9 PHCEKEGVQWEAKEEEEEYEEEGEEEGEKEEEDDHMEYCRVCKDGGELLCCDACISSYHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PHCEKEGVQWEAKEEEEEYEEEGEEEGEKEEEDDHMEYCRVCKDGGELLCCDACISSYHI
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE9 HCLNPPLPDIPNGEWLCPRCTCPVLKGRVQKILHWRWGEPPVAVPAPQQADGNPDVPPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HCLNPPLPDIPNGEWLCPRCTCPVLKGRVQKILHWRWGEPPVAVPAPQQADGNPDVPPPR
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pF1KE9 PLQGRSEREFFVKWVGLSYWHCSWAKELQLEIFHLVMYRNYQRKNDMDEPPPLDYGSGED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PLQGRSEREFFVKWVGLSYWHCSWAKELQLEIFHLVMYRNYQRKNDMDEPPPLDYGSGED
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pF1KE9 DGKSDKRKVKDPHYAEMEEKYYRFGIKPEWMTVHRIINHSVDKKGNYHYLVKWRDLPYDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DGKSDKRKVKDPHYAEMEEKYYRFGIKPEWMTVHRIINHSVDKKGNYHYLVKWRDLPYDQ
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pF1KE9 STWEEDEMNIPEYEEHKQSYWRHRELIMGEDPAQPRKYKKKKKELQGDGPPSSPTNDPTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 STWEEDEMNIPEYEEHKQSYWRHRELIMGEDPAQPRKYKKKKKELQGDGPPSSPTNDPTV
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pF1KE9 KYETQPRFITATGGTLHMYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTIQTIVFLYSLYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KYETQPRFITATGGTLHMYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTIQTIVFLYSLYK
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pF1KE9 EGHTKGPFLVSAPLSTIINWEREFQMWAPKFYVVTYTGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EGHTKGPFLVSAPLSTIINWEREFQMWAPKFYVVTYTGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIKG
790 800 810 820 830 840
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pF1KE9 GKKAFKMKREAQVKFHVLLTSYELITIDQAALGSIRWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GKKAFKMKREAQVKFHVLLTSYELITIDQAALGSIRWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLN
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pF1KE9 GYKIDHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GYKIDHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLL
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pF1KE9 GPHMLRRLKADVFKNMPAKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNSRGGGNQVSLLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GPHMLRRLKADVFKNMPAKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNSRGGGNQVSLLN
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pF1KE9 IMMDLKKCCNHPYLFPVAAMESPKLPSGAYEGGALIKSSGKLMLLQKMLRKLKEQGHRVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IMMDLKKCCNHPYLFPVAAMESPKLPSGAYEGGALIKSSGKLMLLQKMLRKLKEQGHRVL
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pF1KE9 IFSQMTKMLDLLEDFLDYEGYKYERIDGGITGALRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IFSQMTKMLDLLEDFLDYEGYKYERIDGGITGALRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE9 LGINLATADTVIIFDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQANKVMIYRFVTRASVEERITQVAKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LGINLATADTVIIFDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQANKVMIYRFVTRASVEERITQVAKR
1150 1160 1170 1180 1190 1200
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pF1KE9 KMMLTHLVVRPGLGSKAGSMSKQELDDILKFGTEELFKDENEGENKEEDSSVIHYDNEAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KMMLTHLVVRPGLGSKAGSMSKQELDDILKFGTEELFKDENEGENKEEDSSVIHYDNEAI
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KE9 ARLLDRNQDATEDTDVQNMNEYLSSFKVAQYVVREEDKIEEIEREIIKQEENVDPDYWEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ARLLDRNQDATEDTDVQNMNEYLSSFKVAQYVVREEDKIEEIEREIIKQEENVDPDYWEK
1270 1280 1290 1300 1310 1320
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pF1KE9 LLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRVRKQVNYNDAAQEDQDNQSEYSVGSEEEDEDFDERPEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRVRKQVNYNDAAQEDQDNQSEYSVGSEEEDEDFDERPEG
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KE9 RRQSKRQLRNEKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNTRQRKAFLNAVMRWGMPPQDAFTTQWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RRQSKRQLRNEKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNTRQRKAFLNAVMRWGMPPQDAFTTQWL
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KE9 VRDLRGKTEKEFKAYVSLFMRHLCEPGADGSETFADGVPREGLSRQQVLTRIGVMSLVKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VRDLRGKTEKEFKAYVSLFMRHLCEPGADGSETFADGVPREGLSRQQVLTRIGVMSLVKK
1450 1460 1470 1480 1490 1500
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pF1KE9 KVQEFEHINGRWSMPELMPDPSADSKRSSRASSPTKTSPTTPEASATNSPCTSKPATPAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KVQEFEHINGRWSMPELMPDPSADSKRSSRASSPTKTSPTTPEASATNSPCTSKPATPAP
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1560 1570 1580 1590 1600 1610
pF1KE9 SEKGEGIRTPLEKEEAENQEEKPEKNSRIGEKMETEADAPSPAPSLGERLEPRKIPLEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SEKGEGIRTPLEKEEAENQEEKPEKNSRIGEKMETEADAPSPAPSLGERLEPRKIPLEDE
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1620 1630 1640 1650 1660 1670
pF1KE9 VPGVPGEMEPEPGYRGDREKSATESTPGERGEEKPLDGQEHRERPEGETGDLGKREDVKG
::::::::::::::::::::: :::::
CCDS32 VPGVPGEMEPEPGYRGDREKS----------------------------------EDVKG
1630 1640
1680 1690 1700 1710 1720 1730
pF1KE9 DRELRPGPRDEPRSNGRREEKTEKPRFMFNIADGGFTELHTLWQNEERAAISSGKLNEIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DRELRPGPRDEPRSNGRREEKTEKPRFMFNIADGGFTELHTLWQNEERAAISSGKLNEIW
1650 1660 1670 1680 1690 1700
1740 1750 1760 1770 1780 1790
pF1KE9 HRRHDYWLLAGIVLHGYARWQDIQNDAQFAIINEPFKTEANKGNFLEMKNKFLARRFKLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HRRHDYWLLAGIVLHGYARWQDIQNDAQFAIINEPFKTEANKGNFLEMKNKFLARRFKLL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EQALVIEEQLRRAAYLNLSQEPAHPAMALHARFAEAECLAESHQHLSKESLAGNKPANAV
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pF1KE9 LHKVLNQLEELLSDMKADVTRLPATLSRIPPIAARLQMSERSILSRLASKGTEPHPTPAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LHKVLNQLEELLSDMKADVTRLPATLSRIPPIAARLQMSERSILSRLASKGTEPHPTPAY
1830 1840 1850 1860 1870 1880
1920 1930 1940 1950 1960 1970
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PPGPYATPPGYGAAFSAAPVGALAAAGANYSQMPAGSFITAATNGPPVLVKKEKEMVGAL
1890 1900 1910 1920 1930 1940
1980 1990
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::::::::::::::::::::
CCDS32 VSDGLDRKEPRAGEVICIDD
1950 1960
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: :.:: ... :..: : . :.:. :
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:: .. : : ...::. :: :: :..: .:.: ::.: ::.:...:
CCDS76 KKPRDPKIPKSKRQKKELGDSSGEGPEFVEEEEEVALRSDSEGSDY--TPGKKKKKKLGP
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:::::.: ..: : : . . : :::: :: ::.::..::::::::.:::::::::
CCDS76 KKEKKSKSKRKEEEEEEDDDDDSKEPKSSAQLLEDWGMEDIDHVFSEEDYRTLTNYKAFS
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::.::::: ::::: .:::: .:::::::::.:::::::..: .:::::::.::.:
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.. .:: .:: ::::. .. :::.:::::::::. .:. : ::::::. :: .
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::.:::::::: .:.:::...: :. . : ::.:..:..: : . :... :
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. : .:::: ::::: :::::::::::::::::::::::::::::::.::
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:::....:::::::::::::::.::::::.. : :: :: : . :::::: ::.:::::
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:::::::::.: :::::::::::::.::::::::::::::.:::.::::: :.::.::
CCDS76 DGGELLCCDTCPSSYHIHCLNPPLPEIPNGEWLCPRCTCPALKGKVQKILIWKWGQPPSP
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.:.:. :..:..: :.::.:: ::.::::: :.:::::::..:::::. ::.:::::
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:::::::: :.:. :. :: ::: :::..:::::..::.::::::: .:::.::::::
CCDS76 KNDMDEPPSGDFGGDEE--KSRKRKNKDPKFAEMEERFYRYGIKPEWMMIHRILNHSVDK
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::. :::.:::::::::..:: ....: .:. ::::: ::::. ::. ..: : :: :
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. . :: .:: ::::::: ::... ::::::: ::.::::::::::::::::::::::
CCDS76 LRKLERPPETPTVDPTVKYERQPEYLDATGGTLHPYQMEGLNWLRFSWAQGTDTILADEM
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:::::.:: :::::::::::.::::::::::::::::::::.:::: .:::::.::::::
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pF1KE9 AIIRENEFSFEDNAIKGGKKAFKMKREAQVKFHVLLTSYELITIDQAALGSIRWACLVVD
:::::::::::::::.::::: .::.::.::::::::::::::::.: :::: ::::.::
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pF1KE9 EAHRLKNNQSKFFRVLNGYKIDHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEE
:::::::::::::::::::...:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS76 EAHRLKNNQSKFFRVLNGYSLQHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFHNLEGFLEE
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pF1KE9 FADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRRLKADVFKNMPAKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRN
::::.::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS76 FADIAKEDQIKKLHDMLGPHMLRRLKADVFKNMPSKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRN
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pF1KE9 FEALNSRGGGNQVSLLNIMMDLKKCCNHPYLFPVAAMESPKLPSGAYEGGALIKSSGKLM
:::::.:::::::::::..:::::::::::::::::::.::.:.: :.:.:::..::::.
CCDS76 FEALNARGGGNQVSLLNVVMDLKKCCNHPYLFPVAAMEAPKMPNGMYDGSALIRASGKLL
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pF1KE9 LLQKMLRKLKEQGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLDYEGYKYERIDGGITGALRQEAIDRFN
::::::..::: :::::::::::::::::::::..:::::::::::::: .:::::::::
CCDS76 LLQKMLKNLKEGGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLEHEGYKYERIDGGITGNMRQEAIDRFN
1050 1060 1070 1080 1090 1100
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pF1KE9 APGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIFDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQANKVMIYR
::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::: .::::::
CCDS76 APGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYR
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pF1KE9 FVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVVRPGLGSKAGSMSKQELDDILKFGTEELFKDENE-
::::::::::::::::.::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS76 FVTRASVEERITQVAKKKMMLTHLVVRPGLGSKTGSMSKQELDDILKFGTEELFKDEATD
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pF1KE9 --GENKE-EDSSVIHYDNEAIARLLDRNQDATEDTDVQNMNEYLSSFKVAQYVVREED--
:.::: :::::::::..:: :::::::: ::::..:.::::::::::::::::::.
CCDS76 GGGDNKEGEDSSVIHYDDKAIERLLDRNQDETEDTELQGMNEYLSSFKVAQYVVREEEMG
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pF1KE9 KIEEIEREIIKQEENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRVRKQVNYNDAAQEDQ
. ::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::..:::.
CCDS76 EEEEVEREIIKQEESVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIRKQVNYNDGSQEDR
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pF1KE9 D-------NQSEYSVGSEEEDEDFDERPEG-RRQSKRQLRNEKDKPLPPLLARVGGNIEV
: :::.:::.::: ::::::: :. :: :.. :::.::::::::::::::::::
CCDS76 DWQDDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDERSEAPRRPSRKGLRNDKDKPLPPLLARVGGNIEV
1350 1360 1370 1380 1390 1400
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pF1KE9 LGFNTRQRKAFLNAVMRWGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKTEKEFKAYVSLFMRHLCEPGAD
::::.:::::::::.::.::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS76 LGFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKSEKEFKAYVSLFMRHLCEPGAD
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pF1KE9 GSETFADGVPREGLSRQQVLTRIGVMSLVKKKVQEFEHINGRWSMPELMPDPSADSKRSS
:.:::::::::::::::.::::::::::..::::::::.::::::::: :. ....
CCDS76 GAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLIRKKVQEFEHVNGRWSMPEL-----AEVEENK
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pF1KE9 RASSPTKTSPTTPEASATNSPCTSKPATPAPSEKGE-GIRTPLEK-EEAENQEEKPEKNS
. :.: . :: :: : .: ..: :::: .: ::. .. .: :. : . : .:
CCDS76 KMSQPGSPSPKTPTPS---TPGDTQPNTPAPVPPAEDGIKIEENSLKEEESIEGEKEVKS
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pF1KE9 RIGEKMETEADAPSPA---------PSLGE-RLEPRKIPLEDEVPGVPGEMEPEPGYRGD
: ..::.:: : :: ..: .. . : : :: :: .:
CCDS76 TAPETAIECTQAPAPASEDEKVVVEPPEGEEKVEKAEVKERTEEP-----METEPKGAAD
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pF1KE9 REKSATESTPGERGEEKPLDGQEHRERPEGETGDLGKREDVKGDRELRPGPRDEPRSNGR
:: .:. . :. ....:. : : :.: . . : :.: : .
CCDS76 VEKVEEKSAI----DLTPIVVEDKEEKKEEEE----KKEVMLQNGET---PKD---LNDE
1640 1650 1660 1670
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pF1KE9 REEKTEKPRFMFNIADGGFTELHTLWQNEERAAISSGKLNEIWHRRHDYWLLAGIVLHGY
...:. : :::::::::::::::.::::::::: . : :::::::::::::::. :::
CCDS76 KQKKNIKQRFMFNIADGGFTELHSLWQNEERAATVTKKTYEIWHRRHDYWLLAGIINHGY
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pF1KE9 ARWQDIQNDAQFAIINEPFKTEANKGNFLEMKNKFLARRFKLLEQALVIEEQLRRAAYLN
::::::::: ..::.::::: : :.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ARWQDIQNDPRYAILNEPFKGEMNRGNFLEIKNKFLARRFKLLEQALVIEEQLRRAAYLN
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pF1KE9 LSQEPAHPAMALHARFAEAECLAESHQHLSKESLAGNKPANAVLHKVLNQLEELLSDMKA
.:..:.::.:::..::::.::::::::::::::.::::::::::::::.:::::::::::
CCDS76 MSEDPSHPSMALNTRFAEVECLAESHQHLSKESMAGNKPANAVLHKVLKQLEELLSDMKA
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pF1KE9 DVTRLPATLSRIPPIAARLQMSERSILSRLASKGTEPHPTPAYPPGPYATPPGYGAAFSA
::::::::..::::.:.:::::::.::::::... :: :
CCDS76 DVTRLPATIARIPPVAVRLQMSERNILSRLANRAPEPTPQQVAQQQ
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1940 1950 1960 1970 1980 1990
pF1KE9 APVGALAAAGANYSQMPAGSFITAATNGPPVLVKKEKEMVGALVSDGLDRKEPRAGEVIC
>>CCDS8552.1 CHD4 gene_id:1108|Hs109|chr12 (1912 aa)
initn: 7091 init1: 3218 opt: 7183 Z-score: 4232.9 bits: 796.7 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 8853; 69.8% identity (83.9% similar) in 1943 aa overlap (18-1912:24-1905)
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pF1KE9 MKAADTVILWARSKNDQLRISFPPGLCWGDRMPDKDDIRLLPSALGVKKRKRGP
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CCDS85 MASGLGSPSPCSAGSEEEDMDALLNNSLPPPHPENEEDPEED---LSETETPKLKKKKKP
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...: :::::.: ..: : : . . : :::: :: ::.::..::::::::.::
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:::::::::.::::: ::::: .:::: .:::::::::.:::::::..: .:::::::.:
CCDS85 TNYKAFSQFVRPLIAAKNPKIAVSKMMMVLGAKWREFSTNNPFKGSSGASVAAAAAAAVA
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:.: .. .:: .:: ::::. .. :::.:::::::::. .:. : :::::
CCDS85 VVE----SMVTATEVAP------PPPPV-EV---PIRKAKTKEGKGPNARRKPKGSPRVP
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:. :: . ::.:::::::: .:.:::...: :. . : ::.:..:..: : .
CCDS85 DA-KKPKPKKVAPLKIKLGGFGSKRKRSSSEDDDLDVE---SDFDDASINSYSVSDGSTS
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:... :. : .:::: ::::: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 RSSRSRKKLRTTKKKKK--------GEEEVTAVDGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCP
340 350 360 370 380
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pF1KE9 RAYHLVCLDPELDRAPEGKWSCPHCEKEGVQWEAKEEEEEYEEEGEEEG-EKEEEDDH-M
::::.:::::....:::::::::::::::.::::::.. : :: :: : . :::::: :
CCDS85 RAYHMVCLDPDMEKAPEGKWSCPHCEKEGIQWEAKEDNSEGEEILEEVGGDLEEEDDHHM
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:.::::::::::::::.: :::::::::::::.::::::::::::::.:::.::::: :.
CCDS85 EFCRVCKDGGELLCCDTCPSSYHIHCLNPPLPEIPNGEWLCPRCTCPALKGKVQKILIWK
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pF1KE9 WGEPPVAVPAPQQADGNPDVPPPRPLQGRSEREFFVKWVGLSYWHCSWAKELQLEIFHLV
::.:: .:.:. :..:..: :.::.:: ::.::::: :.:::::::..:::::. :
CCDS85 WGQPPSPTPVPRPPDADPNTPSPKPLEGRPERQFFVKWQGMSYWHCSWVSELQLELHCQV
510 520 530 540 550 560
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pF1KE9 MYRNYQRKNDMDEPPPLDYGSGEDDGKSDKRKVKDPHYAEMEEKYYRFGIKPEWMTVHRI
:.::::::::::::: :.:. :. :: ::: :::..:::::..::.::::::: .:::
CCDS85 MFRNYQRKNDMDEPPSGDFGGDEE--KSRKRKNKDPKFAEMEERFYRYGIKPEWMMIHRI
570 580 590 600 610 620
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pF1KE9 INHSVDKKGNYHYLVKWRDLPYDQSTWEEDEMNIPEYEEHKQSYWRHRELIMGEDPAQPR
.::::::::. :::.:::::::::..:: ....: .:. ::::: ::::. ::. ..:
CCDS85 LNHSVDKKGHVHYLIKWRDLPYDQASWESEDVEIQDYDLFKQSYWNHRELMRGEE-GRPG
630 640 650 660 670 680
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pF1KE9 KYKKKKKELQGDGPPSSPTNDPTVKYETQPRFITATGGTLHMYQLEGLNWLRFSWAQGTD
: :: : . . :: .:: ::::::: ::... ::::::: ::.:::::::::::::::
CCDS85 KKLKKVKLRKLERPPETPTVDPTVKYERQPEYLDATGGTLHPYQMEGLNWLRFSWAQGTD
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pF1KE9 TILADEMGLGKTIQTIVFLYSLYKEGHTKGPFLVSAPLSTIINWEREFQMWAPKFYVVTY
::::::::::::.:: :::::::::::.::::::::::::::::::::.:::: .:::::
CCDS85 TILADEMGLGKTVQTAVFLYSLYKEGHSKGPFLVSAPLSTIINWEREFEMWAPDMYVVTY
750 760 770 780 790 800
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pF1KE9 TGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIKGGKKAFKMKREAQVKFHVLLTSYELITIDQAALGSIR
.:::::::::::::::::::::.::::: .::.::.::::::::::::::::.: ::::
CCDS85 VGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIRGGKKASRMKKEASVKFHVLLTSYELITIDMAILGSID
810 820 830 840 850 860
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pF1KE9 WACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYKIDHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNN
::::.:::::::::::::::::::::...:::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS85 WACLIVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYSLQHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFHN
870 880 890 900 910 920
940 950 960 970 980 990
pF1KE9 LEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRRLKADVFKNMPAKTELIVRVELSPMQKKYY
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CCDS85 LEGFLEEFADIAKEDQIKKLHDMLGPHMLRRLKADVFKNMPSKTELIVRVELSPMQKKYY
930 940 950 960 970 980
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE9 KYILTRNFEALNSRGGGNQVSLLNIMMDLKKCCNHPYLFPVAAMESPKLPSGAYEGGALI
::::::::::::.:::::::::::..:::::::::::::::::::.::.:.: :.:.:::
CCDS85 KYILTRNFEALNARGGGNQVSLLNVVMDLKKCCNHPYLFPVAAMEAPKMPNGMYDGSALI
990 1000 1010 1020 1030 1040
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE9 KSSGKLMLLQKMLRKLKEQGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLDYEGYKYERIDGGITGALRQ
..::::.::::::..::: :::::::::::::::::::::..:::::::::::::: .::
CCDS85 RASGKLLLLQKMLKNLKEGGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLEHEGYKYERIDGGITGNMRQ
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE9 EAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIFDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS85 EAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQN
1110 1120 1130 1140 1150 1160
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pF1KE9 NKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVVRPGLGSKAGSMSKQELDDILKFGTEEL
.::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS85 KKVMIYRFVTRASVEERITQVAKKKMMLTHLVVRPGLGSKTGSMSKQELDDILKFGTEEL
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1240 1250 1260 1270 1280
pF1KE9 FKDENE---GENKE-EDSSVIHYDNEAIARLLDRNQDATEDTDVQNMNEYLSSFKVAQYV
:::: :.::: :::::::::..:: :::::::: ::::..:.::::::::::::::
CCDS85 FKDEATDGGGDNKEGEDSSVIHYDDKAIERLLDRNQDETEDTELQGMNEYLSSFKVAQYV
1230 1240 1250 1260 1270 1280
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pF1KE9 VREED--KIEEIEREIIKQEENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRVRKQVNYN
::::. . ::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS85 VREEEMGEEEEVEREIIKQEESVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIRKQVNYN
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1350 1360 1370 1380 1390
pF1KE9 DAAQEDQD-------NQSEYSVGSEEEDEDFDERPEG-RRQSKRQLRNEKDKPLPPLLAR
:..:::.: :::.:::.::: ::::::: :. :: :.. :::.:::::::::::
CCDS85 DGSQEDRDWQDDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDERSEAPRRPSRKGLRNDKDKPLPPLLAR
1350 1360 1370 1380 1390 1400
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:::::::::::.:::::::::.::.::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS85 VGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKSEKEFKAYVSLFMRH
1410 1420 1430 1440 1450 1460
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pF1KE9 LCEPGADGSETFADGVPREGLSRQQVLTRIGVMSLVKKKVQEFEHINGRWSMPELMPDPS
::::::::.:::::::::::::::.::::::::::..::::::::.:::::::::
CCDS85 LCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLIRKKVQEFEHVNGRWSMPEL-----
1470 1480 1490 1500 1510 1520
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pF1KE9 ADSKRSSRASSPTKTSPTTPEASATNSPCTSKPATPAPSEKGE-GIRTPLEK-EEAENQE
:. ..... :.: . :: :: : .: ..: :::: .: ::. .. .: :. :
CCDS85 AEVEENKKMSQPGSPSPKTPTPS---TPGDTQPNTPAPVPPAEDGIKIEENSLKEEESIE
1530 1540 1550 1560 1570
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pF1KE9 EKPEKNSRIGEKMETEADAPSPA---------PSLGE-RLEPRKIPLEDEVPGVPGEMEP
. : .: : ..::.:: : :: ..: .. . : : ::
CCDS85 GEKEVKSTAPETAIECTQAPAPASEDEKVVVEPPEGEEKVEKAEVKERTEEP-----MET
1580 1590 1600 1610 1620 1630
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE9 EPGYRGDREKSATESTPGERGEEKPLDGQEHRERPEGETGDLGKREDVKGDRELRPGPRD
:: .: :: .:. . :. ....:. : : :.: . . : :.:
CCDS85 EPKGAADVEKVEEKSAI----DLTPIVVEDKEEKKEEEE----KKEVMLQNGET---PKD
1640 1650 1660 1670 1680
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pF1KE9 EPRSNGRREEKTEKPRFMFNIADGGFTELHTLWQNEERAAISSGKLNEIWHRRHDYWLLA
: ....:. : :::::::::::::::.::::::::: . : :::::::::::::
CCDS85 ---LNDEKQKKNIKQRFMFNIADGGFTELHSLWQNEERAATVTKKTYEIWHRRHDYWLLA
1690 1700 1710 1720 1730
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pF1KE9 GIVLHGYARWQDIQNDAQFAIINEPFKTEANKGNFLEMKNKFLARRFKLLEQALVIEEQL
::. :::::::::::: ..::.::::: : :.:::::.::::::::::::::::::::::
CCDS85 GIINHGYARWQDIQNDPRYAILNEPFKGEMNRGNFLEIKNKFLARRFKLLEQALVIEEQL
1740 1750 1760 1770 1780 1790
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pF1KE9 RRAAYLNLSQEPAHPAMALHARFAEAECLAESHQHLSKESLAGNKPANAVLHKVLNQLEE
:::::::.:..:.::.:::..::::.::::::::::::::.::::::::::::::.::::
CCDS85 RRAAYLNMSEDPSHPSMALNTRFAEVECLAESHQHLSKESMAGNKPANAVLHKVLKQLEE
1800 1810 1820 1830 1840 1850
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pF1KE9 LLSDMKADVTRLPATLSRIPPIAARLQMSERSILSRLASKGTEPHPTPAYPPGPYATPPG
:::::::::::::::..::::.:.:::::::.::::::... :: :
CCDS85 LLSDMKADVTRLPATIARIPPVAVRLQMSERNILSRLANRAPEPTPQQVAQQQ
1860 1870 1880 1890 1900 1910
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: :.:: ... :..: : . :.:. :
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:: .. : : . :..:.: :: :: :..: .:.: ::.: ::.:
CCDS86 KKPRDPKIPKSKRQKKERMLLCRQLGDSSGEGPEFVEEEEEVALRSDSEGSDY--TPGKK
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pF1KE9 RRRKHREKKEKKTKRRKKGEG---DGGQKQVEQKSSATLLLTWGLEDVEHVFSEEDYHTL
...: :::::.: ..: : : . . : :::: :: ::.::..::::::::.::
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:::::::::.::::: ::::: .:::: .:::::::::.:::::::..: .:::::::.:
CCDS86 TNYKAFSQFVRPLIAAKNPKIAVSKMMMVLGAKWREFSTNNPFKGSSGASVAAAAAAAVA
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220 230 240 250 260 270
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:.: .. .:: .:: ::::. .. :::.:::::::::. .:. : :::::
CCDS86 VVE----SMVTATEVAP------PPPPV-EV---PIRKAKTKEGKGPNARRKPKGSPRVP
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:. :: . ::.:::::::: .:.:::...: :. . :::.:..:..: : .
CCDS86 DA-KKPKPKKVAPLKIKLGGFGSKRKRSSSEDDDLDV---ESDFDDASINSYSVSDGSTS
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:... :. : .:::: :::::::::::::::::::::::::
CCDS86 RSSRSRKKLRTTKKKKK------------------DHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAY
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:.:::::....:::::::::::::::.::::::.. : :: :: : . :::::: ::.:
CCDS86 HMVCLDPDMEKAPEGKWSCPHCEKEGIQWEAKEDNSEGEEILEEVGGDLEEEDDHHMEFC
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:::::::::::::.: :::::::::::::.::::::::::::::.:::.::::: :.::.
CCDS86 RVCKDGGELLCCDTCPSSYHIHCLNPPLPEIPNGEWLCPRCTCPALKGKVQKILIWKWGQ
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:: .:.:. :..:..: :.::.:: ::.::::: :.:::::::..:::::. ::.:
CCDS86 PPSPTPVPRPPDADPNTPSPKPLEGRPERQFFVKWQGMSYWHCSWVSELQLELHCQVMFR
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pF1KE9 NYQRKNDMDEPPPLDYGSGEDDGKSDKRKVKDPHYAEMEEKYYRFGIKPEWMTVHRIINH
:::::::::::: :.:. :. :: ::: :::..:::::..::.::::::: .:::.::
CCDS86 NYQRKNDMDEPPSGDFGGDEE--KSRKRKNKDPKFAEMEERFYRYGIKPEWMMIHRILNH
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::::::. :::.:::::::::..:: ....: .:. ::::: ::::. ::. ..: :
CCDS86 SVDKKGHVHYLIKWRDLPYDQASWESEDVEIQDYDLFKQSYWNHRELMRGEE-GRPGKKL
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:: : . . :: .:: ::::::: ::... ::::::: ::.::::::::::::::::::
CCDS86 KKVKLRKLERPPETPTVDPTVKYERQPEYLDATGGTLHPYQMEGLNWLRFSWAQGTDTIL
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CCDS86 ADEMGLGKTVQTAVFLYSLYKEGHSKGPFLVSAPLSTIINWEREFEMWAPDMYVVTYVGD
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CCDS86 KDSRAIIRENEFSFEDNAIRGGKKASRMKKEASVKFHVLLTSYELITIDMAILGSIDWAC
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pF1KE9 LVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYKIDHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEG
:.:::::::::::::::::::::...:::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS86 LIVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYSLQHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFHNLEG
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pF1KE9 FLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRRLKADVFKNMPAKTELIVRVELSPMQKKYYKYI
::::::::.::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS86 FLEEFADIAKEDQIKKLHDMLGPHMLRRLKADVFKNMPSKTELIVRVELSPMQKKYYKYI
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:::::::::.:::::::::::..:::::::::::::::::::.::.:.: :.:.:::..:
CCDS86 LTRNFEALNARGGGNQVSLLNVVMDLKKCCNHPYLFPVAAMEAPKMPNGMYDGSALIRAS
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pF1KE9 GKLMLLQKMLRKLKEQGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLDYEGYKYERIDGGITGALRQEAI
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pF1KE9 DRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIFDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQANKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::: .::
CCDS86 DRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKV
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pF1KE9 MIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVVRPGLGSKAGSMSKQELDDILKFGTEELFKD
::::::::::::::::::::.::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS86 MIYRFVTRASVEERITQVAKKKMMLTHLVVRPGLGSKTGSMSKQELDDILKFGTEELFKD
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pF1KE9 ENE---GENKE-EDSSVIHYDNEAIARLLDRNQDATEDTDVQNMNEYLSSFKVAQYVVRE
: :.::: :::::::::..:: :::::::: ::::..:.:::::::::::::::::
CCDS86 EATDGGGDNKEGEDSSVIHYDDKAIERLLDRNQDETEDTELQGMNEYLSSFKVAQYVVRE
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pF1KE9 ED--KIEEIEREIIKQEENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRVRKQVNYNDAA
:. . ::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::..
CCDS86 EEMGEEEEVEREIIKQEESVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIRKQVNYNDGS
1280 1290 1300 1310 1320 1330
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pF1KE9 QEDQD-------NQSEYSVGSEEEDEDFDERPEG-RRQSKRQLRNEKDKPLPPLLARVGG
:::.: :::.:::.::: ::::::: :. :: :.. :::.::::::::::::::
CCDS86 QEDRDWQDDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDERSEAPRRPSRKGLRNDKDKPLPPLLARVGG
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pF1KE9 NIEVLGFNTRQRKAFLNAVMRWGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKTEKEFKAYVSLFMRHLCE
::::::::.:::::::::.::.::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS86 NIEVLGFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKSEKEFKAYVSLFMRHLCE
1400 1410 1420 1430 1440 1450
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pF1KE9 PGADGSETFADGVPREGLSRQQVLTRIGVMSLVKKKVQEFEHINGRWSMPELMPDPSADS
:::::.:::::::::::::::.::::::::::..::::::::.::::::::: :.
CCDS86 PGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLIRKKVQEFEHVNGRWSMPEL-----AEV
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pF1KE9 KRSSRASSPTKTSPTTPEASATNSPCTSKPATPAPSEKGE-GIRTPLEK-EEAENQEEKP
..... :.: . :: :: : .: ..: :::: .: ::. .. .: :. : .
CCDS86 EENKKMSQPGSPSPKTPTPS---TPGDTQPNTPAPVPPAEDGIKIEENSLKEEESIEGEK
1520 1530 1540 1550 1560
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pF1KE9 EKNSRIGEKMETEADAPSPA---------PSLGE-RLEPRKIPLEDEVPGVPGEMEPEPG
: .: : ..::.:: : :: ..: .. . : : :: ::
CCDS86 EVKSTAPETAIECTQAPAPASEDEKVVVEPPEGEEKVEKAEVKERTEEP-----METEPK
1570 1580 1590 1600 1610 1620
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pF1KE9 YRG--DREKSATESTPGERGEEKPLDGQEHRERPEGETGDLGKREDVKGDRELRPGPRDE
.: : :: .:. . :. ....:. : : :.: . . : :.:
CCDS86 GKGAADVEKVEEKSAI----DLTPIVVEDKEEKKEEEE----KKEVMLQNGET---PKD-
1630 1640 1650 1660 1670
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pF1KE9 PRSNGRREEKTEKPRFMFNIADGGFTELHTLWQNEERAAISSGKLNEIWHRRHDYWLLAG
: ....:. : :::::::::::::::.::::::::: . : ::::::::::::::
CCDS86 --LNDEKQKKNIKQRFMFNIADGGFTELHSLWQNEERAATVTKKTYEIWHRRHDYWLLAG
1680 1690 1700 1710 1720
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pF1KE9 IVLHGYARWQDIQNDAQFAIINEPFKTEANKGNFLEMKNKFLARRFKLLEQALVIEEQLR
:. :::::::::::: ..::.::::: : :.:::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS86 IINHGYARWQDIQNDPRYAILNEPFKGEMNRGNFLEIKNKFLARRFKLLEQALVIEEQLR
1730 1740 1750 1760 1770 1780
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pF1KE9 RAAYLNLSQEPAHPAMALHARFAEAECLAESHQHLSKESLAGNKPANAVLHK-VLNQLEE
::::::.:..:.::.:::..::::.::::::::::::::.:::::::::::: .:.::::
CCDS86 RAAYLNMSEDPSHPSMALNTRFAEVECLAESHQHLSKESMAGNKPANAVLHKGILKQLEE
1790 1800 1810 1820 1830 1840
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE9 LLSDMKADVTRLPATLSRIPPIAARLQMSERSILSRLASKGTEPHPTPAYPPGPYATPPG
:::::::::::::::..::::.:.:::::::.::::::... :: :
CCDS86 LLSDMKADVTRLPATIARIPPVAVRLQMSERNILSRLANRAPEPTPQQVAQQQ
1850 1860 1870 1880 1890 1900
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE9 YGAAFSAAPVGALAAAGANYSQMPAGSFITAATNGPPVLVKKEKEMVGALVSDGLDRKEP
>>CCDS57.1 CHD5 gene_id:26038|Hs109|chr1 (1954 aa)
initn: 6766 init1: 3445 opt: 5272 Z-score: 3108.8 bits: 588.7 E(33420): 7.9e-167
Smith-Waterman score: 9050; 69.5% identity (83.5% similar) in 1983 aa overlap (50-1956:49-1952)
20 30 40 50 60 70
pF1KE9 ISFPPGLCWGDRMPDKDDIRLLPSALGVKKRKRGPKKQKENKPGKPRKRKKRDSEEEFGS
.:. ::: :::: : ...::. :..:..
CCDS57 MENEDEMSEEEDGGLEAFDDFFPVEPVSLPKKKKPKKLKENK-CKGKRKKKEGSNDELSE
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KE9 ERDEYREKSESGGSEYGTGPGRKRRRKHREKKEKKTKRRKKGEG-----DGGQKQVEQKS
.... .::::: ::.:. :..:...: ..:::::.::.:: : :: : : ::
CCDS57 NEEDLEEKSESEGSDYS--PNKKKKKKLKDKKEKKAKRKKKDEDEDDNDDGCLK--EPKS
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pF1KE9 SATLLLTWGLEDVEHVFSEEDYHTLTNYKAFSQFMRPLIAKKNPKIPMSKMMTILGAKWR
:. :. :::.::...::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::
CCDS57 SGQLMAEWGLDDVDYLFSEEDYHTLTNYKAFSQFLRPLIAKKNPKIPMSKMMTVLGAKWR
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CCDS57 EFSANNPFKGSSA--AAAAAAVAAAVE-----TVTISPPLAVS-PPQVP-------QPVP
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::.:::::::::: ... :. . ::.:: .::: : ::...: ...:::::.::.:
CCDS57 IRKAKTKEGKGPGVRKKIKGSK--DGKKKGKGKKTAGLKFRFGGISNKRKKGSSSEED--
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: ::::.::.:.:::: : . . : .. : ::::.. .. :::::::
CCDS57 -EREESDFDSASIHSASVRSECSAALGKKSKRR--RKKKRI---------DDGDGYETDH
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::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::.::: :....:
CCDS57 QDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHLVCLDPELEKAPEGKWSCPHCEKEGIQWEPKDDDDE
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:::: : .::::::::.:::::::::::::::: ::::.::::::::.:::::::::
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::::: :::.::.:::::: ::: :..:.: : .:..:::.::.: ::::::::
CCDS57 RCTCPPLKGKVQRILHWRWTEPPAPFMVGLPGP---DVEPSLPPPKPLEGIPEREFFVKW
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.:::::::::.::::::..: :::::::::::::::::.:::::..::::.::: ::: :
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:.:::..::.::::::: .:::.::: ::::. :::.::.:::::: ::: :...:: :.
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. ::.:: ::::..::: :.. :: :.:. : ::..: :::::.. :: .: .
CCDS57 NLKQAYWGHRELMLGEDTRLPKRLLKKGKKLRDDKQEKPPDTPIVDPTVKFDKQPWYIDS
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:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.:::.:::
CCDS57 TGGTLHPYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTIVFLYSLYKEGHSKGPYLVS
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:::::::::::::.:::: ::::::::::.::..:::::::::::::..:::.:.::.:.
CCDS57 APLSTIINWEREFEMWAPDFYVVTYTGDKESRSVIRENEFSFEDNAIRSGKKVFRMKKEV
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CCDS57 GTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRRLKAD
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CCDS57 VFKNMPAKTELIVRVELSQMQKKYYKFILTRNFEALNSKGGGNQVSLLNIMMDLKKCCNH
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CCDS57 QEDQEWQDELSDNQSEYSIGSEDEDEDFEERPEGQSGRRQSRRQLKSDRDKPLPPLLARV
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pF1KE9 -----KEEAENQEEKPEKNSRIGEKMETEADAPSPAPSLGERLEPRKIPLEDEVPGVPGE
. :.:...:.: .. : :. :.. :.: :.: ::. :
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. :: :. . . . :. .: .: : . ....: :: . : .:. :
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