Result of FASTA (ccds) for
pF1KE9678
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9678, 1417 aa
1>>>pF1KE9678 1417 - 1417 aa - 1417 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0339+/-0.00111; mu= 15.1832+/- 0.067
mean_var=122.1939+/-24.861, 0's: 0 Z-trim(106.4): 66 B-trim: 11 in 1/50
Lambda= 0.116024
statistics sampled from 8906 (8965) to 8906 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.627), E-opt: 0.2 (0.275), width: 16
Scan time: 3.540
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10363.1 BLM gene_id:641|Hs108|chr15 (1417) 9341 1576.1 0
CCDS73782.1 BLM gene_id:641|Hs108|chr15 (1286) 7473 1263.4 0
CCDS31756.1 RECQL gene_id:5965|Hs108|chr12 ( 649) 1156 205.8 3.3e-52
CCDS45777.1 RECQL5 gene_id:9400|Hs108|chr17 ( 410) 818 149.1 2.4e-35
CCDS32735.1 RECQL5 gene_id:9400|Hs108|chr17 ( 435) 818 149.2 2.5e-35
CCDS42380.1 RECQL5 gene_id:9400|Hs108|chr17 ( 991) 818 149.4 4.9e-35
CCDS6082.1 WRN gene_id:7486|Hs108|chr8 (1432) 653 121.9 1.4e-26
>>CCDS10363.1 BLM gene_id:641|Hs108|chr15 (1417 aa)
initn: 9341 init1: 9341 opt: 9341 Z-score: 8450.4 bits: 1576.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9341; 100.0% identity (100.0% similar) in 1417 aa overlap (1-1417:1-1417)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MAAVPQNNLQEQLERHSARTLNNKLSLSKPKFSGFTFKKKTSSDNNVSVTNVSVAKTPVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MAAVPQNNLQEQLERHSARTLNNKLSLSKPKFSGFTFKKKTSSDNNVSVTNVSVAKTPVL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 RNKDVNVTEDFSFSEPLPNTTNQQRVKDFFKNAPAGQETQRGGSKSLLPDFLQTPKEVVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RNKDVNVTEDFSFSEPLPNTTNQQRVKDFFKNAPAGQETQRGGSKSLLPDFLQTPKEVVC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 TTQNTPTVKKSRDTALKKLEFSSSPDSLSTINDWDDMDDFDTSETSKSFVTPPQSHFVRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TTQNTPTVKKSRDTALKKLEFSSSPDSLSTINDWDDMDDFDTSETSKSFVTPPQSHFVRV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 STAQKSKKGKRNFFKAQLYTTNTVKTDLPPPSSESEQIDLTEEQKDDSEWLSSDVICIDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 STAQKSKKGKRNFFKAQLYTTNTVKTDLPPPSSESEQIDLTEEQKDDSEWLSSDVICIDD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 GPIAEVHINEDAQESDSLKTHLEDERDNSEKKKNLEEAELHSTEKVPCIEFDDDDYDTDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GPIAEVHINEDAQESDSLKTHLEDERDNSEKKKNLEEAELHSTEKVPCIEFDDDDYDTDF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 VPPSPEEIISASSSSSKCLSTLKDLDTSDRKEDVLSTSKDLLSKPEKMSMQELNPETSTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VPPSPEEIISASSSSSKCLSTLKDLDTSDRKEDVLSTSKDLLSKPEKMSMQELNPETSTD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 CDARQISLQQQLIHVMEHICKLIDTIPDDKLKLLDCGNELLQQRNIRRKLLTEVDFNKSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CDARQISLQQQLIHVMEHICKLIDTIPDDKLKLLDCGNELLQQRNIRRKLLTEVDFNKSD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 ASLLGSLWRYRPDSLDGPMEGDSCPTGNSMKELNFSHLPSNSVSPGDCLLTTTLGKTGFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ASLLGSLWRYRPDSLDGPMEGDSCPTGNSMKELNFSHLPSNSVSPGDCLLTTTLGKTGFS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 ATRKNLFERPLFNTHLQKSFVSSNWAETPRLGKKNESSYFPGNVLTSTAVKDQNKHTASI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ATRKNLFERPLFNTHLQKSFVSSNWAETPRLGKKNESSYFPGNVLTSTAVKDQNKHTASI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 NDLERETQPSYDIDNFDIDDFDDDDDWEDIMHNLAASKSSTAAYQPIKEGRPIKSVSERL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NDLERETQPSYDIDNFDIDDFDDDDDWEDIMHNLAASKSSTAAYQPIKEGRPIKSVSERL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 SSAKTDCLPVSSTAQNINFSESIQNYTDKSAQNLASRNLKHERFQSLSFPHTKEMMKIFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SSAKTDCLPVSSTAQNINFSESIQNYTDKSAQNLASRNLKHERFQSLSFPHTKEMMKIFH
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 KKFGLHNFRTNQLEAINAALLGEDCFILMPTGGGKSLCYQLPACVSPGVTVVISPLRSLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KKFGLHNFRTNQLEAINAALLGEDCFILMPTGGGKSLCYQLPACVSPGVTVVISPLRSLI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 VDQVQKLTSLDIPATYLTGDKTDSEATNIYLQLSKKDPIIKLLYVTPEKICASNRLISTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VDQVQKLTSLDIPATYLTGDKTDSEATNIYLQLSKKDPIIKLLYVTPEKICASNRLISTL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE9 ENLYERKLLARFVIDEAHCVSQWGHDFRQDYKRMNMLRQKFPSVPVMALTATANPRVQKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ENLYERKLLARFVIDEAHCVSQWGHDFRQDYKRMNMLRQKFPSVPVMALTATANPRVQKD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE9 ILTQLKILRPQVFSMSFNRHNLKYYVLPKKPKKVAFDCLEWIRKHHPYDSGIIYCLSRRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ILTQLKILRPQVFSMSFNRHNLKYYVLPKKPKKVAFDCLEWIRKHHPYDSGIIYCLSRRE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE9 CDTMADTLQRDGLAALAYHAGLSDSARDEVQQKWINQDGCQVICATIAFGMGIDKPDVRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CDTMADTLQRDGLAALAYHAGLSDSARDEVQQKWINQDGCQVICATIAFGMGIDKPDVRF
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE9 VIHASLPKSVEGYYQESGRAGRDGEISHCLLFYTYHDVTRLKRLIMMEKDGNHHTRETHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VIHASLPKSVEGYYQESGRAGRDGEISHCLLFYTYHDVTRLKRLIMMEKDGNHHTRETHF
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE9 NNLYSMVHYCENITECRRIQLLAYFGENGFNPDFCKKHPDVSCDNCCKTKDYKTRDVTDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NNLYSMVHYCENITECRRIQLLAYFGENGFNPDFCKKHPDVSCDNCCKTKDYKTRDVTDD
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE9 VKSIVRFVQEHSSSQGMRNIKHVGPSGRFTMNMLVDIFLGSKSAKIQSGIFGKGSAYSRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VKSIVRFVQEHSSSQGMRNIKHVGPSGRFTMNMLVDIFLGSKSAKIQSGIFGKGSAYSRH
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE9 NAERLFKKLILDKILDEDLYINANDQAIAYVMLGNKAQTVLNGNLKVDFMETENSSSVKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NAERLFKKLILDKILDEDLYINANDQAIAYVMLGNKAQTVLNGNLKVDFMETENSSSVKK
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE9 QKALVAKVSQREEMVKKCLGELTEVCKSLGKVFGVHYFNIFNTVTLKKLAESLSSDPEVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QKALVAKVSQREEMVKKCLGELTEVCKSLGKVFGVHYFNIFNTVTLKKLAESLSSDPEVL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE9 LQIDGVTEDKLEKYGAEVISVLQKYSEWTSPAEDSSPGISLSSSRGPGRSAAEELDEEIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LQIDGVTEDKLEKYGAEVISVLQKYSEWTSPAEDSSPGISLSSSRGPGRSAAEELDEEIP
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE9 VSSHYFASKTRNERKRKKMPASQRSKRRKTASSGSKAKGGSATCRKISSKTKSSSIIGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VSSHYFASKTRNERKRKKMPASQRSKRRKTASSGSKAKGGSATCRKISSKTKSSSIIGSS
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410
pF1KE9 SASHTSQATSGANSKLGIMAPPKPINRPFLKPSYAFS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SASHTSQATSGANSKLGIMAPPKPINRPFLKPSYAFS
1390 1400 1410
>>CCDS73782.1 BLM gene_id:641|Hs108|chr15 (1286 aa)
initn: 7515 init1: 7473 opt: 7473 Z-score: 6761.1 bits: 1263.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8250; 90.8% identity (90.8% similar) in 1417 aa overlap (1-1417:1-1286)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MAAVPQNNLQEQLERHSARTLNNKLSLSKPKFSGFTFKKKTSSDNNVSVTNVSVAKTPVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MAAVPQNNLQEQLERHSARTLNNKLSLSKPKFSGFTFKKKTSSDNNVSVTNVSVAKTPVL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 RNKDVNVTEDFSFSEPLPNTTNQQRVKDFFKNAPAGQETQRGGSKSLLPDFLQTPKEVVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RNKDVNVTEDFSFSEPLPNTTNQQRVKDFFKNAPAGQETQRGGSKSLLPDFLQTPKEVVC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 TTQNTPTVKKSRDTALKKLEFSSSPDSLSTINDWDDMDDFDTSETSKSFVTPPQSHFVRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TTQNTPTVKKSRDTALKKLEFSSSPDSLSTINDWDDMDDFDTSETSKSFVTPPQSHFVRV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 STAQKSKKGKRNFFKAQLYTTNTVKTDLPPPSSESEQIDLTEEQKDDSEWLSSDVICIDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 STAQKSKKGKRNFFKAQLYTTNTVKTDLPPPSSESEQIDLTEEQKDDSEWLSSDVICIDD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 GPIAEVHINEDAQESDSLKTHLEDERDNSEKKKNLEEAELHSTEKVPCIEFDDDDYDTDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GPIAEVHINEDAQESDSLKTHLEDERDNSEKKKNLEEAELHSTEKVPCIEFDDDDYDTDF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 VPPSPEEIISASSSSSKCLSTLKDLDTSDRKEDVLSTSKDLLSKPEKMSMQELNPETSTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VPPSPEEIISASSSSSKCLSTLKDLDTSDRKEDVLSTSKDLLSKPEKMSMQELNPETSTD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 CDARQISLQQQLIHVMEHICKLIDTIPDDKLKLLDCGNELLQQRNIRRKLLTEVDFNKSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 CDARQISLQQQLIHVMEHICKLIDTIPDDKLKLLDCGNELLQQRNIRRKLLTEVDFNKSD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 ASLLGSLWRYRPDSLDGPMEGDSCPTGNSMKELNFSHLPSNSVSPGDCLLTTTLGKTGFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ASLLGSLWRYRPDSLDGPMEGDSCPTGNSMKELNFSHLPSNSVSPGDCLLTTTLGKTGFS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 ATRKNLFERPLFNTHLQKSFVSSNWAETPRLGKKNESSYFPGNVLTSTAVKDQNKHTASI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ATRKNLFERPLFNTHLQKSFVSSNWAETPRLGKKNESSYFPGNVLTSTAVKDQNKHTASI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 NDLERETQPSYDIDNFDIDDFDDDDDWEDIMHNLAASKSSTAAYQPIKEGRPIKSVSERL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NDLERETQPSYDIDNFDIDDFDDDDDWEDIMHNLAASKSSTAAYQPIKEGRPIKSVSERL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 SSAKTDCLPVSSTAQNINFSESIQNYTDKSAQNLASRNLKHERFQSLSFPHTKEMMKIFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SSAKTDCLPVSSTAQNINFSESIQNYTDKSAQNLASRNLKHERFQSLSFPHTKEMMKIFH
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 KKFGLHNFRTNQLEAINAALLGEDCFILMPTGGGKSLCYQLPACVSPGVTVVISPLRSLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KKFGLHNFRTNQLEAINAALLGEDCFILMPTGGGKSLCYQLPACVSPGVTVVISPLRSLI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 VDQVQKLTSLDIPATYLTGDKTDSEATNIYLQLSKKDPIIKLLYVTPEKICASNRLISTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VDQVQKLTSLDIPATYLTGDKTDSEATNIYLQLSKKDPIIKLLYVTPEKICASNRLISTL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE9 ENLYERKLLARFVIDEAHCVSQWGHDFRQDYKRMNMLRQKFPSVPVMALTATANPRVQKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ENLYERKLLARFVIDEAHCVSQWGHDFRQDYKRMNMLRQKFPSVPVMALTATANPRVQKD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE9 ILTQLKILRPQVFSMSFNRHNLKYYVLPKKPKKVAFDCLEWIRKHHPYDSGIIYCLSRRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ILTQLKILRPQVFSMSFNRHNLKYYVLPKKPKKVAFDCLEWIRKHHPYDSGIIYCLSRRE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE9 CDTMADTLQRDGLAALAYHAGLSDSARDEVQQKWINQDGCQVICATIAFGMGIDKPDVRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 CDTMADTLQRDGLAALAYHAGLSDSARDEVQQKWINQDGCQVICATIAFGMGIDKPDVRF
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE9 VIHASLPKSVEGYYQESGRAGRDGEISHCLLFYTYHDVTRLKRLIMMEKDGNHHTRETHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VIHASLPKSVEGYYQESGRAGRDGEISHCLLFYTYHDVTRLKRLIMMEKDGNHHTRETHF
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE9 NNLYSMVHYCENITECRRIQLLAYFGENGFNPDFCKKHPDVSCDNCCKTKDYKTRDVTDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NNLYSMVHYCENITECRRIQLLAYFGENGFNPDFCKKHPDVSCDNCCKTKDYKTRDVTDD
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE9 VKSIVRFVQEHSSSQGMRNIKHVGPSGRFTMNMLVDIFLGSKSAKIQSGIFGKGSAYSRH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VKSIVRFVQEHSSSQGMRNIKHVGPSGRFTMNMLVDIFL---------------------
1090 1100 1110
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE9 NAERLFKKLILDKILDEDLYINANDQAIAYVMLGNKAQTVLNGNLKVDFMETENSSSVKK
CCDS73 ------------------------------------------------------------
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE9 QKALVAKVSQREEMVKKCLGELTEVCKSLGKVFGVHYFNIFNTVTLKKLAESLSSDPEVL
::::::::::
CCDS73 --------------------------------------------------ESLSSDPEVL
1120
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE9 LQIDGVTEDKLEKYGAEVISVLQKYSEWTSPAEDSSPGISLSSSRGPGRSAAEELDEEIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LQIDGVTEDKLEKYGAEVISVLQKYSEWTSPAEDSSPGISLSSSRGPGRSAAEELDEEIP
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE9 VSSHYFASKTRNERKRKKMPASQRSKRRKTASSGSKAKGGSATCRKISSKTKSSSIIGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VSSHYFASKTRNERKRKKMPASQRSKRRKTASSGSKAKGGSATCRKISSKTKSSSIIGSS
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1390 1400 1410
pF1KE9 SASHTSQATSGANSKLGIMAPPKPINRPFLKPSYAFS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SASHTSQATSGANSKLGIMAPPKPINRPFLKPSYAFS
1250 1260 1270 1280
>>CCDS31756.1 RECQL gene_id:5965|Hs108|chr12 (649 aa)
initn: 1215 init1: 632 opt: 1156 Z-score: 1050.9 bits: 205.8 E(32554): 3.3e-52
Smith-Waterman score: 1265; 38.1% identity (69.5% similar) in 567 aa overlap (649-1210:73-604)
620 630 640 650 660 670
pF1KE9 FSESIQNYTDKSAQNLASRNLKHERFQSLSFPHTKEMMKIFHKKFGLHNFRTNQLEAINA
:: . .. :... : :..:: :::.::.
CCDS31 TKKIKQCLEDSDAGASNEYDSSPAAWNKEDFPWSGKVKDILQNVFKLEKFRPLQLETINV
50 60 70 80 90 100
680 690 700 710 720 730
pF1KE9 ALLGEDCFILMPTGGGKSLCYQLPACVSPGVTVVISPLRSLIVDQVQKLTSLDIPATYLT
.. :.. :..::::::::::::::: : : :.:: :: ::. ::.. : .: : ::.:.
CCDS31 TMAGKEVFLVMPTGGGKSLCYQLPALCSDGFTLVICPLISLMEDQLMVLKQLGISATMLN
110 120 130 140 150 160
740 750 760 770 780 790
pF1KE9 GDKTDSEATNIYLQLSKKDPIIKLLYVTPEKICASNRLISTLENLYERKLLARFVIDEAH
.... .. .. .. .:. .::.::::::: :. ..: ::. :: . ..:...::.:
CCDS31 ASSSKEHVKWVHAEMVNKNSELKLIYVTPEKIAKSKMFMSRLEKAYEARRFTRIAVDEVH
170 180 190 200 210 220
800 810 820 830 840 850
pF1KE9 CVSQWGHDFRQDYKRMNMLRQKFPSVPVMALTATANPRVQKDILTQLKILRPQVFSMSFN
: :::::::: ::: ...:...::.. ...:::::. .: : : : . .:. :::
CCDS31 CCSQWGHDFRPDYKALGILKRQFPNASLIGLTATATNHVLTDAQKILCIEKCFTFTASFN
230 240 250 260 270 280
860 870 880 890 900 910
pF1KE9 RHNLKYYVLPKKPKKVA-F--DCLEWIRKHHPYDSGIIYCLSRRECDTMADTLQRDGLAA
: :: :: . .::... : : .. : .. .::::::.:... . .. .:: :. :
CCDS31 RPNL-YYEVRQKPSNTEDFIEDIVKLINGRYKGQSGIIYCFSQKDSEQVTVSLQNLGIHA
290 300 310 320 330 340
920 930 940 950 960 970
pF1KE9 LAYHAGLSDSARDEVQQKWINQDGCQVICATIAFGMGIDKPDVRFVIHASLPKSVEGYYQ
::::.: . :..:: . . ::. ::.:::::::::::::::: :. ::.:.:::
CCDS31 GAYHANLEPEDKTTVHRKW-SANEIQVVVATVAFGMGIDKPDVRFVIHHSMSKSMENYYQ
350 360 370 380 390 400
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KE9 ESGRAGRDGEISHCLLFYTYHDVTRLKRLIMMEKDGNHHTRETHFNNLYSMVHYCENITE
:::::::: . :.:.: . :. :.. ...::. :... :: :: ::.::..
CCDS31 ESGRAGRDDMKADCILYYGFGDIFRISSMVVMENVGQQK--------LYEMVSYCQNISK
410 420 430 440 450
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KE9 CRRIQLLAYFGENGFNPDFCKKHPDVSCDNCCKTKDYKTRDVTDDVKSIVRFV-QEHSSS
:::. . .: : .: . :.: :::::: . .. ...:. ....... : . .
CCDS31 CRRVLMAQHFDEV-WNSEACNKM----CDNCCKDSAFERKNITEYCRDLIKILKQAEELN
460 470 480 490 500
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KE9 QGMRNIKHVGPSGRFTMNMLVDIFLGSKSAKIQ-SGIFGKGSAYSRHNAERLFKKLILDK
. . .: :.: ..:. .::.. .:. . . :.. :... ......
CCDS31 EKLTPLK------------LIDSWMGKGAAKLRVAGVVA--PTLPREDLEKIIAHFLIQQ
510 520 530 540 550
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KE9 ILDEDLYINANDQAIAYVMLGNKAQTVLNGNLKVDFMETENSSSVKKQKALVAKVSQREE
: :: ..: .:.:. .: ::. .::.. .. :.. .:. :... :. ::
CCDS31 YLKEDYSFTAY-ATISYLKIGPKAN-LLNNEAHAITMQVTKST----QNSFRAESSQTCH
560 570 580 590 600
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KE9 MVKKCLGELTEVCKSLGKVFGVHYFNIFNTVTLKKLAESLSSDPEVLLQIDGVTEDKLEK
CCDS31 SEQGDKKMEEKNSGNFQKKAANMLQQSGSKNTGAKKRKIDDA
610 620 630 640
>>CCDS45777.1 RECQL5 gene_id:9400|Hs108|chr17 (410 aa)
initn: 700 init1: 292 opt: 818 Z-score: 748.0 bits: 149.1 E(32554): 2.4e-35
Smith-Waterman score: 980; 41.2% identity (68.1% similar) in 405 aa overlap (648-1033:7-409)
620 630 640 650 660 670
pF1KE9 NFSESIQNYTDKSAQNLASRNLKHERFQSLSFPHTKE--MMKIFHKKFGLHNFRTNQLEA
.:: : . . ..: ::. .:.: :.
CCDS45 MSSHHTTFPFDPERRVRSTLKKVFGFDSFKTPLQES
10 20 30
680 690 700 710 720 730
pF1KE9 INAALL--GEDCFILMPTGGGKSLCYQLPACVSPGVTVVISPLRSLIVDQVQKLTSLDIP
. :.. ..: :. ::::.:::::::::: .. :.:.:.::: .:: :::..: .: .
CCDS45 ATMAVVKGNKDVFVCMPTGAGKSLCYQLPALLAKGITIVVSPLIALIQDQVDHLLTLKVR
40 50 60 70 80 90
740 750 760 770 780 790
pF1KE9 ATYLTGDKTDSEATNIYLQLSKKDPIIKLLYVTPEKICASNRLISTLENLYERKLLARFV
.. :.. . .: .. .: .. : :.::.::: . ::. . ::..: :.::. .:
CCDS45 VSSLNSKLSAQERKELLADLEREKPQTKILYITPE-MAASSSFQPTLNSLVSRHLLSYLV
100 110 120 130 140 150
800 810 820 830 840 850
pF1KE9 IDEAHCVSQWGHDFRQDYKRMNMLRQKFPSVPVMALTATANPRVQKDILTQLKILRP-QV
.:::::::::::::: :: :.. ::... .: .::::::.:.::.:... :.. .: .
CCDS45 VDEAHCVSQWGHDFRPDYLRLGALRSRLGHAPCVALTATATPQVQEDVFAALHLKKPVAI
160 170 180 190 200 210
860 870 880 890 900
pF1KE9 FSMSFNRHNLKYYVLPKK----PKKVAFD-CLEWIRKHHPYD---SGIIYCLSRRECDTM
:. : :: : : :. : : ::. . .. ::.:: .:. :. .
CCDS45 FKTPCFRANLFYDVQFKELISDPYGNLKDFCLKALGQEADKGLSGCGIVYCRTREACEQL
220 230 240 250 260 270
910 920 930 940 950 960
pF1KE9 ADTLQRDGLAALAYHAGLSDSARDEVQQKWINQDGCQVICATIAFGMGIDKPDVRFVIHA
: :. :. : ::::::. : : ::. :. .. :: :::.::::.:: .:::: :
CCDS45 AIELSCRGVNAKAYHAGLKASERTLVQNDWM-EEKVPVIVATISFGMGVDKANVRFVAHW
280 290 300 310 320 330
970 980 990 1000 1010
pF1KE9 SLPKSVEGYYQESGRAGRDGEISHCLLFYTYHDVTRLKRLI------MMEKDGNHHTRET
.. ::. :::::::::::::. : : :.:. .: ... :: ..:: ::. . ..
CCDS45 NIAKSMAGYYQESGRAGRDGKPSWCRLYYSRNDRDQVSFLIRKEVAKLQEKRGNKASDKA
340 350 360 370 380 390
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE9 HFNNLYSMVHYCENITECRRIQLLAYFGENGFNPDFCKKHPDVSCDNCCKTKDYKTRDVT
. . ..: .::..
CCDS45 TIMAFDALVTFCEELG
400 410
>>CCDS32735.1 RECQL5 gene_id:9400|Hs108|chr17 (435 aa)
initn: 700 init1: 292 opt: 818 Z-score: 747.7 bits: 149.2 E(32554): 2.5e-35
Smith-Waterman score: 980; 41.2% identity (68.1% similar) in 405 aa overlap (648-1033:7-409)
620 630 640 650 660 670
pF1KE9 NFSESIQNYTDKSAQNLASRNLKHERFQSLSFPHTKE--MMKIFHKKFGLHNFRTNQLEA
.:: : . . ..: ::. .:.: :.
CCDS32 MSSHHTTFPFDPERRVRSTLKKVFGFDSFKTPLQES
10 20 30
680 690 700 710 720 730
pF1KE9 INAALL--GEDCFILMPTGGGKSLCYQLPACVSPGVTVVISPLRSLIVDQVQKLTSLDIP
. :.. ..: :. ::::.:::::::::: .. :.:.:.::: .:: :::..: .: .
CCDS32 ATMAVVKGNKDVFVCMPTGAGKSLCYQLPALLAKGITIVVSPLIALIQDQVDHLLTLKVR
40 50 60 70 80 90
740 750 760 770 780 790
pF1KE9 ATYLTGDKTDSEATNIYLQLSKKDPIIKLLYVTPEKICASNRLISTLENLYERKLLARFV
.. :.. . .: .. .: .. : :.::.::: . ::. . ::..: :.::. .:
CCDS32 VSSLNSKLSAQERKELLADLEREKPQTKILYITPE-MAASSSFQPTLNSLVSRHLLSYLV
100 110 120 130 140 150
800 810 820 830 840 850
pF1KE9 IDEAHCVSQWGHDFRQDYKRMNMLRQKFPSVPVMALTATANPRVQKDILTQLKILRP-QV
.:::::::::::::: :: :.. ::... .: .::::::.:.::.:... :.. .: .
CCDS32 VDEAHCVSQWGHDFRPDYLRLGALRSRLGHAPCVALTATATPQVQEDVFAALHLKKPVAI
160 170 180 190 200 210
860 870 880 890 900
pF1KE9 FSMSFNRHNLKYYVLPKK----PKKVAFD-CLEWIRKHHPYD---SGIIYCLSRRECDTM
:. : :: : : :. : : ::. . .. ::.:: .:. :. .
CCDS32 FKTPCFRANLFYDVQFKELISDPYGNLKDFCLKALGQEADKGLSGCGIVYCRTREACEQL
220 230 240 250 260 270
910 920 930 940 950 960
pF1KE9 ADTLQRDGLAALAYHAGLSDSARDEVQQKWINQDGCQVICATIAFGMGIDKPDVRFVIHA
: :. :. : ::::::. : : ::. :. .. :: :::.::::.:: .:::: :
CCDS32 AIELSCRGVNAKAYHAGLKASERTLVQNDWM-EEKVPVIVATISFGMGVDKANVRFVAHW
280 290 300 310 320 330
970 980 990 1000 1010
pF1KE9 SLPKSVEGYYQESGRAGRDGEISHCLLFYTYHDVTRLKRLI------MMEKDGNHHTRET
.. ::. :::::::::::::. : : :.:. .: ... :: ..:: ::. . ..
CCDS32 NIAKSMAGYYQESGRAGRDGKPSWCRLYYSRNDRDQVSFLIRKEVAKLQEKRGNKASDKA
340 350 360 370 380 390
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE9 HFNNLYSMVHYCENITECRRIQLLAYFGENGFNPDFCKKHPDVSCDNCCKTKDYKTRDVT
. . ..: .::..
CCDS32 TIMAFDALVTFCEELGRWGRGHGKSLRAAWCSQVVSRHAEL
400 410 420 430
>>CCDS42380.1 RECQL5 gene_id:9400|Hs108|chr17 (991 aa)
initn: 705 init1: 292 opt: 818 Z-score: 742.4 bits: 149.4 E(32554): 4.9e-35
Smith-Waterman score: 1022; 40.0% identity (66.0% similar) in 447 aa overlap (648-1075:7-443)
620 630 640 650 660 670
pF1KE9 NFSESIQNYTDKSAQNLASRNLKHERFQSLSFPHTKE--MMKIFHKKFGLHNFRTNQLEA
.:: : . . ..: ::. .:.: :.
CCDS42 MSSHHTTFPFDPERRVRSTLKKVFGFDSFKTPLQES
10 20 30
680 690 700 710 720 730
pF1KE9 INAALL--GEDCFILMPTGGGKSLCYQLPACVSPGVTVVISPLRSLIVDQVQKLTSLDIP
. :.. ..: :. ::::.:::::::::: .. :.:.:.::: .:: :::..: .: .
CCDS42 ATMAVVKGNKDVFVCMPTGAGKSLCYQLPALLAKGITIVVSPLIALIQDQVDHLLTLKVR
40 50 60 70 80 90
740 750 760 770 780 790
pF1KE9 ATYLTGDKTDSEATNIYLQLSKKDPIIKLLYVTPEKICASNRLISTLENLYERKLLARFV
.. :.. . .: .. .: .. : :.::.::: . ::. . ::..: :.::. .:
CCDS42 VSSLNSKLSAQERKELLADLEREKPQTKILYITPE-MAASSSFQPTLNSLVSRHLLSYLV
100 110 120 130 140 150
800 810 820 830 840 850
pF1KE9 IDEAHCVSQWGHDFRQDYKRMNMLRQKFPSVPVMALTATANPRVQKDILTQLKILRP-QV
.:::::::::::::: :: :.. ::... .: .::::::.:.::.:... :.. .: .
CCDS42 VDEAHCVSQWGHDFRPDYLRLGALRSRLGHAPCVALTATATPQVQEDVFAALHLKKPVAI
160 170 180 190 200 210
860 870 880 890 900
pF1KE9 FSMSFNRHNLKYYVLPKK----PKKVAFD-CLEWIRKHHPYD---SGIIYCLSRRECDTM
:. : :: : : :. : : ::. . .. ::.:: .:. :. .
CCDS42 FKTPCFRANLFYDVQFKELISDPYGNLKDFCLKALGQEADKGLSGCGIVYCRTREACEQL
220 230 240 250 260 270
910 920 930 940 950 960
pF1KE9 ADTLQRDGLAALAYHAGLSDSARDEVQQKWINQDGCQVICATIAFGMGIDKPDVRFVIHA
: :. :. : ::::::. : : ::. :. .. :: :::.::::.:: .:::: :
CCDS42 AIELSCRGVNAKAYHAGLKASERTLVQNDWM-EEKVPVIVATISFGMGVDKANVRFVAHW
280 290 300 310 320 330
970 980 990 1000 1010
pF1KE9 SLPKSVEGYYQESGRAGRDGEISHCLLFYTYHDVTRLKRLI------MMEKDGNHHTRET
.. ::. :::::::::::::. : : :.:. .: ... :: ..:: ::. . ..
CCDS42 NIAKSMAGYYQESGRAGRDGKPSWCRLYYSRNDRDQVSFLIRKEVAKLQEKRGNKASDKA
340 350 360 370 380 390
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE9 HFNNLYSMVHYCENITECRRIQLLAYFGENGFNPDFCKKHPDVSCDNCCKTKDYKTRDVT
. . ..: .::.. ::. . :::. : : : .::.: . . :
CCDS42 TIMAFDALVTFCEELG-CRHAAIAKYFGDAL--PA-CAK----GCDHCQNPTAVRRRLEA
400 410 420 430 440
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE9 DDVKSIVRFVQEHSSSQGMRNIKHVGPSGRFTMNMLVDIFLGSKSAKIQSGIFGKGSAYS
CCDS42 LERSSSWSKTCIGPSQGNGFDPELYEGGRKGYGDFSRYDEGSGGSGDEGRDEAHKREWNL
450 460 470 480 490 500
>>CCDS6082.1 WRN gene_id:7486|Hs108|chr8 (1432 aa)
initn: 720 init1: 251 opt: 653 Z-score: 590.8 bits: 121.9 E(32554): 1.4e-26
Smith-Waterman score: 824; 29.5% identity (61.5% similar) in 650 aa overlap (525-1157:414-1030)
500 510 520 530 540 550
pF1KE9 HLQKSFVSSNWAETPRLGKKNESSYFPGNVLTSTAVKDQNKHTASINDLERETQPSYDID
:.. : :. ..: : :: : .: :: :.
CCDS60 KENMERACLMSLDITEHELQILEQQSQEEYLSDIAYKS-TEHL-SPNDNENDT--SYVIE
390 400 410 420 430
560 570 580 590 600 610
pF1KE9 NFDIDDFDDDDDWEDIMHNLAASKSSTAAY----QPIKEGRPIKSVSERLSSAKTDCLPV
. :.: . : . : .. . ..: . : . .::. : :.:. .. :.
CCDS60 S------DEDLEMEMLKHLSPNDNENDTSYVIESDEDLEMEMLKSL-ENLNSGTVE--PT
440 450 460 470 480 490
620 630 640 650 660
pF1KE9 SSTAQNINFSESIQNYTDK-SAQNLASRNLKHERFQSLSFPHTKEMMKIFHKKFGLHNFR
: ... . .. . .. . .: :... . . . : ..:.. .. :: .:.
CCDS60 HSKCLKMERNLGLPTKEEEEDDENEANEGEEDDDKDFLWPAPNEEQVTCLKMYFGHSSFK
500 510 520 530 540 550
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 TNQLEAINAALLGE-DCFILMPTGGGKSLCYQLPACVSPGVTVVISPLRSLIVDQVQKLT
: ..:...: . : .: :: :::::.: : . .::::: ::. ::: .:
CCDS60 PVQWKVIHSVLEERRDNVAVMATGYGKSLCFQYPPVYVGKIGLVISPLISLMEDQVLQLK
560 570 580 590 600 610
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 SLDIPATYLTGDKTDSEATNIYLQLSKKDPIIKLLYVTPEKICASNRLISTLENLYERKL
.::: .: . .... :.: .:.: ...::::: :..: .. :..:
CCDS60 MSNIPACFLGSAQSENVLTDI--KLGK----YRIVYVTPE-YCSGN--MGLLQQLEADIG
620 630 640 650 660
790 800 810 820 830 840
pF1KE9 LARFVIDEAHCVSQWGHDFRQDYKRMNMLRQKFPSVPVMALTATANPRVQKDILTQLKIL
.. ...:::::.:.::::::....... :. .: ::..::::::. ...::. :..
CCDS60 ITLIAVDEAHCISEWGHDFRDSFRKLGSLKTALPMVPIVALTATASSSIREDIVRCLNLR
670 680 690 700 710 720
850 860 870 880 890 900
pF1KE9 RPQVFSMSFNRHNLKYYVLPKKPKKVAFDCLEWIRK---HHPYDSG-IIYCLSRRECDTM
::. .:.: :: : . .: .. : .. : : ... :::: ::. . .
CCDS60 NPQITCTGFDRPNL-YLEVRRKTGNILQDLQPFLVKTSSHWEFEGPTIIYCPSRKMTQQV
730 740 750 760 770 780
910 920 930 940 950 960
pF1KE9 ADTLQRDGLAALAYHAGLSDSARDEVQQKWINQDGCQVICATIAFGMGIDKPDVRFVIHA
. :.. .:. .::::.: :.: ....... .: : . :::::::::.: :.: :::
CCDS60 TGELRKLNLSCGTYHAGMSFSTRKDIHHRFV-RDEIQCVIATIAFGMGINKADIRQVIHY
790 800 810 820 830
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE9 SLPKSVEGYYQESGRAGRDGEISHCLLFYTYHDVTRLKRLIMMEKDGNHHTRETHFNNLY
. ::..:.:::: ::::::: : : .... :.. :.: .. : :.. : ... .
CCDS60 GAPKDMESYYQEIGRAGRDGLQSSCHVLWAPADIN-LNRHLLTEIR-NEKFRLYKLKMMA
840 850 860 870 880 890
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE9 SMVHYCENITECRRIQLLAYFGENGFNP-DFCKKHPDVSCDNCCKTKDYKTRDVTDDVKS
.: .: .. ..::: .:..: .. . .. . :::: . :. .. :. .
CCDS60 KMEKYLHS-SRCRRQIILSHFEDKQVQKASLGIMGTEKCCDNCRSRLDH-CYSMDDSEDT
900 910 920 930 940 950
1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE9 IVRFVQEHSSSQGMRNIKHVGPSG-RFTMNMLVDIFLGSKSAKI-----QSGIFGKGSAY
: . :... .. : : .: ... . .. ::.: .. . ..:: :.
CCDS60 SWDF-----GPQAFKLLSAVDILGEKFGIGLPILFLRGSNSQRLADQYRRHSLFGTGKDQ
960 970 980 990 1000 1010
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE9 SRHNAERLFKKLILDKILDEDLYINANDQAIAYVMLGNKAQTVLNGNLKVDFMETENSSS
.. . . ..:: . .: :
CCDS60 TESWWKAFSRQLITEGFLVEVSRYNKFMKICALTKKGRNWLHKANTESQSLILQANEELC
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1417 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 06:33:15 2016 done: Sun Nov 6 06:33:16 2016
Total Scan time: 3.540 Total Display time: 0.170
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]