Result of FASTA (ccds) for
pF1KE5841
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5841, 1798 aa
1>>>pF1KE5841 1798 - 1798 aa - 1798 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4610+/-0.00134; mu= 11.7146+/- 0.080
mean_var=311.8905+/-61.850, 0's: 0 Z-trim(110.5): 132 B-trim: 15 in 1/52
Lambda= 0.072623
statistics sampled from 11681 (11811) to 11681 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.684), E-opt: 0.2 (0.353), width: 16
Scan time: 3.340
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS2789.1 LAMB2 gene_id:3913|Hs109|chr3 (1798) 12880 1365.6 0
CCDS5750.1 LAMB1 gene_id:3912|Hs109|chr7 (1786) 6768 725.2 5.4e-208
CCDS34732.1 LAMB4 gene_id:22798|Hs109|chr7 (1761) 4242 460.5 2.5e-128
CCDS83218.1 LAMB4 gene_id:22798|Hs109|chr7 ( 772) 2352 262.0 6.1e-69
CCDS86325.1 NTN4 gene_id:59277|Hs109|chr12 ( 605) 1256 147.1 1.9e-34
CCDS9054.1 NTN4 gene_id:59277|Hs109|chr12 ( 628) 1256 147.1 2e-34
CCDS1487.1 LAMB3 gene_id:3914|Hs109|chr1 (1172) 1258 147.7 2.5e-34
CCDS86324.1 NTN4 gene_id:59277|Hs109|chr12 ( 591) 1230 144.3 1.3e-33
CCDS6938.1 LAMC3 gene_id:10319|Hs109|chr9 (1575) 1153 136.8 6.2e-31
CCDS1351.1 LAMC1 gene_id:3915|Hs109|chr1 (1609) 1112 132.5 1.2e-29
CCDS32787.1 LAMA1 gene_id:284217|Hs109|chr18 (3075) 986 119.7 1.7e-25
CCDS5138.1 LAMA2 gene_id:3908|Hs109|chr6 (3122) 927 113.5 1.3e-23
CCDS1516.1 USH2A gene_id:7399|Hs109|chr1 (1546) 846 104.6 2.9e-21
CCDS31025.1 USH2A gene_id:7399|Hs109|chr1 (5202) 846 105.3 6.2e-21
CCDS11148.1 NTN1 gene_id:9423|Hs109|chr17 ( 604) 807 100.0 2.8e-20
CCDS48010.2 MEGF9 gene_id:1955|Hs109|chr9 ( 602) 723 91.2 1.2e-17
CCDS10469.1 NTN3 gene_id:4917|Hs109|chr16 ( 580) 621 80.5 2e-14
CCDS44285.1 LAMC2 gene_id:3918|Hs109|chr1 (1111) 605 79.2 9.6e-14
CCDS1352.1 LAMC2 gene_id:3918|Hs109|chr1 (1193) 605 79.2 1e-13
CCDS43491.1 LAMA4 gene_id:3910|Hs109|chr6 (1823) 600 79.0 1.9e-13
CCDS41237.1 MEGF6 gene_id:1953|Hs109|chr1 (1541) 580 76.8 7.2e-13
CCDS34514.1 LAMA4 gene_id:3910|Hs109|chr6 (1816) 574 76.2 1.2e-12
CCDS45564.1 SCARF1 gene_id:8578|Hs109|chr17 ( 569) 527 70.7 1.8e-11
CCDS11007.1 SCARF1 gene_id:8578|Hs109|chr17 ( 830) 527 70.9 2.3e-11
CCDS30625.1 HSPG2 gene_id:3339|Hs109|chr1 (4391) 521 71.2 9.9e-11
>>CCDS2789.1 LAMB2 gene_id:3913|Hs109|chr3 (1798 aa)
initn: 12880 init1: 12880 opt: 12880 Z-score: 7308.7 bits: 1365.6 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 12880; 100.0% identity (100.0% similar) in 1798 aa overlap (1-1798:1-1798)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MELTSRERGRGQPLPWELRLGLLLSVLAATLAQAPAPDVPGCSRGSCYPATGDLLVGRAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 MELTSRERGRGQPLPWELRLGLLLSVLAATLAQAPAPDVPGCSRGSCYPATGDLLVGRAD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 RLTASSTCGLNGPQPYCIVSHLQDEKKCFLCDSRRPFSARDNPHSHRIQNVVTSFAPQRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 RLTASSTCGLNGPQPYCIVSHLQDEKKCFLCDSRRPFSARDNPHSHRIQNVVTSFAPQRR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AAWWQSENGIPAVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLVERSADFGRTWHVYRYFSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 AAWWQSENGIPAVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLVERSADFGRTWHVYRYFSY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 DCGADFPGVPLAPPRHWDDVVCESRYSEIEPSTEGEVIYRVLDPAIPIPDPYSSRIQNLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 DCGADFPGVPLAPPRHWDDVVCESRYSEIEPSTEGEVIYRVLDPAIPIPDPYSSRIQNLL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 KITNLRVNLTRLHTLGDNLLDPRREIREKYYYALYELVVRGNCFCYGHASECAPAPGAPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 KITNLRVNLTRLHTLGDNLLDPRREIREKYYYALYELVVRGNCFCYGHASECAPAPGAPA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 HAEGMVHGACICKHNTRGLNCEQCQDFYRDLPWRPAEDGHSHACRKCECHGHTHSCHFDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 HAEGMVHGACICKHNTRGLNCEQCQDFYRDLPWRPAEDGHSHACRKCECHGHTHSCHFDM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 AVYLASGNVSGGVCDGCQHNTAGRHCELCRPFFYRDPTKDLRDPAVCRSCDCDPMGSQDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 AVYLASGNVSGGVCDGCQHNTAGRHCELCRPFFYRDPTKDLRDPAVCRSCDCDPMGSQDG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 GRCDSHDDPALGLVSGQCRCKEHVVGTRCQQCRDGFFGLSISDRLGCRRCQCNARGTVPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 GRCDSHDDPALGLVSGQCRCKEHVVGTRCQQCRDGFFGLSISDRLGCRRCQCNARGTVPG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 STPCDPNSGSCYCKRLVTGRGCDRCLPGHWGLSHDLLGCRPCDCDVGGALDPQCDEGTGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 STPCDPNSGSCYCKRLVTGRGCDRCLPGHWGLSHDLLGCRPCDCDVGGALDPQCDEGTGQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 CHCRQHMVGRRCEQVQPGYFRPFLDHLIWEAEDTRGQVLDVVERLVTPGETPSWTGSGFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 CHCRQHMVGRRCEQVQPGYFRPFLDHLIWEAEDTRGQVLDVVERLVTPGETPSWTGSGFV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 RLQEGQTLEFLVASVPKAMDYDLLLRLEPQVPEQWAELELIVQRPGPVPAHSLCGHLVPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 RLQEGQTLEFLVASVPKAMDYDLLLRLEPQVPEQWAELELIVQRPGPVPAHSLCGHLVPK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE5 DDRIQGTLQPHARYLIFPNPVCLEPGISYKLHLKLVRTGGSAQPETPYSGPGLLIDSLVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 DDRIQGTLQPHARYLIFPNPVCLEPGISYKLHLKLVRTGGSAQPETPYSGPGLLIDSLVL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE5 LPRVLVLEMFSGGDAAALERQATFERYQCHEEGLVPSKTSPSEACAPLLISLSTLIYNGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 LPRVLVLEMFSGGDAAALERQATFERYQCHEEGLVPSKTSPSEACAPLLISLSTLIYNGA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE5 LPCQCNPQGSLSSECNPHGGQCLCKPGVVGRRCDLCAPGYYGFGPTGCQACQCSHEGALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 LPCQCNPQGSLSSECNPHGGQCLCKPGVVGRRCDLCAPGYYGFGPTGCQACQCSHEGALS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE5 SLCEKTSGQCLCRTGAFGLRCDRCQRGQWGFPSCRPCVCNGHADECNTHTGACLGCRDHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 SLCEKTSGQCLCRTGAFGLRCDRCQRGQWGFPSCRPCVCNGHADECNTHTGACLGCRDHT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE5 GGEHCERCIAGFHGDPRLPYGGQCRPCPCPEGPGSQRHFATSCHQDEYSQQIVCHCRAGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 GGEHCERCIAGFHGDPRLPYGGQCRPCPCPEGPGSQRHFATSCHQDEYSQQIVCHCRAGY
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE5 TGLRCEACAPGHFGDPSRPGGRCQLCECSGNIDPMDPDACDPHTGQCLRCLHHTEGPHCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 TGLRCEACAPGHFGDPSRPGGRCQLCECSGNIDPMDPDACDPHTGQCLRCLHHTEGPHCA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE5 HCKPGFHGQAARQSCHRCTCNLLGTNPQQCPSPDQCHCDPSSGQCPCLPNVQGPSCDRCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 HCKPGFHGQAARQSCHRCTCNLLGTNPQQCPSPDQCHCDPSSGQCPCLPNVQGPSCDRCA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE5 PNFWNLTSGHGCQPCACHPSRARGPTCNEFTGQCHCRAGFGGRTCSECQELHWGDPGLQC
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CCDS27 PNFWNLTSGHGCQPCACHPSRARGPTCNEFTGQCHCRAGFGGRTCSECQELHWGDPGLQC
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE5 HACDCDSRGIDTPQCHRFTGHCSCRPGVSGVRCDQCARGFSGIFPACHPCHACFGDWDRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 HACDCDSRGIDTPQCHRFTGHCSCRPGVSGVRCDQCARGFSGIFPACHPCHACFGDWDRV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE5 VQDLAARTQRLEQRAQELQQTGVLGAFESSFWHMQEKLGIVQGIVGARNTSAASTAQLVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 VQDLAARTQRLEQRAQELQQTGVLGAFESSFWHMQEKLGIVQGIVGARNTSAASTAQLVE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE5 ATEELRREIGEATEHLTQLEADLTDVQDENFNANHALSGLERDRLALNLTLRQLDQHLDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 ATEELRREIGEATEHLTQLEADLTDVQDENFNANHALSGLERDRLALNLTLRQLDQHLDL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE5 LKHSNFLGAYDSIRHAHSQSAEAERRANTSALAVPSPVSNSASARHRTEALMDAQKEDFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 LKHSNFLGAYDSIRHAHSQSAEAERRANTSALAVPSPVSNSASARHRTEALMDAQKEDFN
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE5 SKHMANQRALGKLSAHTHTLSLTDINELVCGAPGDAPCATSPCGGAGCRDEDGQPRCGGL
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CCDS27 SKHMANQRALGKLSAHTHTLSLTDINELVCGAPGDAPCATSPCGGAGCRDEDGQPRCGGL
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE5 SCNGAAATADLALGRARHTQAELQRALAEGGSILSRVAETRRQASEAQQRAQAALDKANA
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CCDS27 SCNGAAATADLALGRARHTQAELQRALAEGGSILSRVAETRRQASEAQQRAQAALDKANA
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE5 SRGQVEQANQELQELIQSVKDFLNQEGADPDSIEMVATRVLELSIPASAEQIQHLAGAIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 SRGQVEQANQELQELIQSVKDFLNQEGADPDSIEMVATRVLELSIPASAEQIQHLAGAIA
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE5 ERVRSLADVDAILARTVGDVRRAEQLLQDARRARSWAEDEKQKAETVQAALEEAQRAQGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 ERVRSLADVDAILARTVGDVRRAEQLLQDARRARSWAEDEKQKAETVQAALEEAQRAQGI
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE5 AQGAIRGAVADTRDTEQTLYQVQERMAGAERALSSAGERARQLDALLEALKLKRAGNSLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 AQGAIRGAVADTRDTEQTLYQVQERMAGAERALSSAGERARQLDALLEALKLKRAGNSLA
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE5 ASTAEETAGSAQGRAQEAEQLLRGPLGDQYQTVKALAERKAQGVLAAQARAEQLRDEARD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 ASTAEETAGSAQGRAQEAEQLLRGPLGDQYQTVKALAERKAQGVLAAQARAEQLRDEARD
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790
pF1KE5 LLQAAQDKLQRLQELEGTYEENERALESKAAQLDGLEARMRSVLQAINLQVQIYNTCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 LLQAAQDKLQRLQELEGTYEENERALESKAAQLDGLEARMRSVLQAINLQVQIYNTCQ
1750 1760 1770 1780 1790
>>CCDS5750.1 LAMB1 gene_id:3912|Hs109|chr7 (1786 aa)
initn: 3038 init1: 3038 opt: 6768 Z-score: 3847.9 bits: 725.2 E(33420): 5.4e-208
Smith-Waterman score: 6768; 50.4% identity (77.7% similar) in 1785 aa overlap (22-1797:7-1785)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MELTSRERGRGQPLPWELRLGLLLSVLAATLAQ--APAPDVP-GCSRGSCYPATGDLLVG
: .: :: :. : :. ::..:::::::::::.:
CCDS57 MGLLQLLAFSFLALCRARVRAQEPEFSYGCAEGSCYPATGDLLIG
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 RADRLTASSTCGLNGPQPYCIVSHLQDEKKCFLCDSRRPFSARDNPHSHRIQNVVTSFAP
::..:...:::::. :.:::::::::..::::.:.:. :. :: :: :.::::.:::
CCDS57 RAQKLSVTSTCGLHKPEPYCIVSHLQEDKKCFICNSQDPYHETLNPDSHLIENVVTTFAP
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 QRRAAWWQSENGIPAVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLVERSADFGRTWHVYRY
.: :::::::. :::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::.:: ::::
CCDS57 NRLKIWWQSENGVENVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGVYRY
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 FSYDCGADFPGVPLAPPRHWDDVVCESRYSEIEPSTEGEVIYRVLDPAIPIPDPYSSRIQ
:.::: :.:::. .: .. ::..:.::::.::::::::::.:.::::. : :::: :::
CCDS57 FAYDCEASFPGISTGPMKKVDDIICDSRYSDIEPSTEGEVIFRALDPAFKIEDPYSPRIQ
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 NLLKITNLRVNLTRLHTLGDNLLDPRREIREKYYYALYELVVRGNCFCYGHASECAPAPG
:::::::::.....:::::::::: : :::::::::.:..:::::::::::::::::. :
CCDS57 NLLKITNLRIKFVKLHTLGDNLLDSRMEIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAPVDG
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 APAHAEGMVHGACICKHNTRGLNCEQCQDFYRDLPWRPAEDGHSHACRKCECHGHTHSCH
..:::::: :.:.:::.::::: :.:::.:::::::: .:.::.::.:. :. :::
CCDS57 FNEEVEGMVHGHCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSNACKKCNCNEHSISCH
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 FDMAVYLASGNVSGGVCDGCQHNTAGRHCELCRPFFYRDPTKDLRDPAVCRSCDCDPMGS
::::::::.::::::::: ::::: ::.:: :.::.:. : .:.::: :. : ::: ::
CCDS57 FDMAVYLATGNVSGGVCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQHPERDIRDPNFCERCTCDPAGS
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 QDGGRCDSHDDPALGLVSGQCRCKEHVVGTRCQQCRDGFFGLSISDRLGCRRCQCNARGT
:. : :::. : . ::..:::::: .: : .:. :..::. :: : .::. : :: ::
CCDS57 QNEGICDSYTDFSTGLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLSSEDPFGCKSCACNPLGT
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 VPGSTPCDPNSGSCYCKRLVTGRGCDRCLPGHWGLSHDLLGCRPCDCDVGGALDPQCDEG
.::..::: ..: :::::::::. ::.::: :::::.:: ::::::::.::::. .:
CCDS57 IPGGNPCDSETGHCYCKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSNDLDGCRPCDCDLGGALNNSCFAE
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE5 TGQCHCRQHMVGRRCEQVQPGYFRPFLDHLIWEAEDTR-GQVLDVVERLVTPGETPSWTG
.::: :: ::.::.:..:.:::. ::: ..:::.. : ...::: . :::::
CCDS57 SGQCSCRPHMIGRQCNEVEPGYYFATLDHYLYEAEEANLGPGVSIVERQYIQDRIPSWTG
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KE5 SGFVRLQEGQTLEFLVASVPKAMDYDLLLRLEPQVPEQWAELELIVQRPGPVPAHSLCGH
.::::. :: :::.. ..: .:.::.:.: :::.:..: . . ::::: .:. : ::.
CCDS57 AGFVRVPEGAYLEFFIDNIPYSMEYDILIRYEPQLPDHWEKAVITVQRPGRIPTSSRCGN
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KE5 LVPKDDRIQGTLQPHARYLIFPNPVCLEPGISYKLHLKLVR-TGGSAQPETPYSGPGLLI
.: :: .:.: .::...: :::.: : .: ..:.: . :..... :.::. ::
CCDS57 TIPDDDNQVVSLSPGSRYVVLPRPVCFEKGTNYTVRLELPQYTSSDSDVESPYT----LI
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KE5 DSLVLLPRVLVLEMFS-GGDAAALERQA---TFERYQCHEEGLVPSKTSPSEACAPLLIS
:::::.: :..:. ::.. .. .. ::.::.: :.. :: ...: ...:
CCDS57 DSLVLMPYCKSLDIFTVGGSGDGVVTNSAWETFQRYRCLENSRSVVKTPMTDVCRNIIFS
710 720 730 740 750 760
780 790 800 810 820 830
pF1KE5 LSTLIYNGALPCQCNPQGSLSSECNPHGGQCLCKPGVVGRRCDLCAPGYYGFGPTGCQAC
.:.:... .: :.:.::::::: :.:.:::: :.:.:::: :. :::: .::::.::. :
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pF1KE5 DCGADFPGVPLAPPRHWDDVVCESRYSEIEPSTEGEVIYRVLDPAIPIPDPYSSRIQNLL
::...::.. . . :.::.:.::.::::: :::. .::::.. : .::: ::.:.
CCDS83 DCATSFPNITSGQAQGVGDIVCDSKYSDIEPSTGGEVVLKVLDPSFEIENPYSPYIQDLV
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KE5 KITNLRVNLTRLHTLGDNLLDPRR-EIREKYYYALYELVVRGNCFCYGHASECAPAP---
.::::.:.:.:::::: :: :. . .::::::::..:::.::: :::::: :
CCDS83 TLTNLRINFTKLHTLGDALLGRRQNDSLDKYYYALYEMIVRGSCFCNGHASECRPMQKMR
230 240 250 260 270 280
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pF1KE5 GAPAHAEGMVHGACICKHNTRGLNCEQCQDFYRDLPWRPAEDGHSHACRKCECHGHTHSC
: ::::: :.:.::: : :::.:.::..: ::::: : ...:::.: :..:. :
CCDS83 GDVFSPPGMVHGQCVCQHNTDGPNCERCKDFFQDAPWRPAADLQDNACRSCSCNSHSSRC
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pF1KE5 HFDMAVYLASGNVSGGVCDGCQHNTAGRHCELCRPFFYRDPTKDLRDPAVCRSCDCDPMG
::::..:::::..:::::. ::::: :.::. :::.::::: : . :: .: :.::: :
CCDS83 HFDMTTYLASGGLSGGVCEDCQHNTEGQHCDRCRPLFYRDPLKTISDPYACIPCECDPDG
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pF1KE5 SQDGGRCDSHDDPALGLVSGQCRCKEHVVGTRCQQCRDGFFGLSISDRLGCRRCQCNARG
. .:: : ::.::::: :.::: :::.: :..:.::. . .::: .: :::. :.:: :
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pF1KE5 TVPGSTPCDPNSGSCYCKRLVTGRGCDRCLPGHWGLSHDLLGCRPCDCDVGGALDPQCDE
..: : :: ..:.: : ::: :..: :.:::.. : :: :::::.::: . :.
CCDS83 SLPFLT-CDVDTGQCLCLSYVTGAHCEECTVGYWGLGNHLHGCSPCDCDIGGAYSNVCSP
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.:::.:: :..:: : . :::: :. ..:::. : :: .. :
CCDS83 KNGQCECRPHVTGRSCSEPAPGYFFAPLNFYLYEAEEATTLQGLAPLGSETFGQSPAVHV
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pF1KE5 VERLVTPGETPSWTGSGFVRLQEGQTLEFLVASVPKAMDYDLLLRLEPQVPEQWAELELI
: .::. .::: ::.:. : :.: : ..: .:. . .. : : .:. ....
CCDS83 VLGEPVPGNPVTWTGPGFARVLPGAGLRFAVNNIPFPVDFTIAIHYETQSAADWT-VQIV
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:. :: : .:: ... :. : : : ...:.:.:::: ..:.. :
CCDS83 VNPPGGSE------HCIPKTLQSKPQSFALPAATRIMLLPTPICLEPDVQYSID---VYF
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pF1KE5 GGSAQPETPYSGPGLLIDSLVLLPRVLVLEMFSGGDAAALERQATFERYQCHEEGLVPSK
. : :. .. .:.::
CCDS83 SQPLQGES-HAHSHVLVDSAAVQWHNLGSLQPPPPECKQFSCFSFPSSWDYRHPPPHLAN
700 710 720 730 740
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:: . . :.. : : : : . .: : :.: .:
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: .: :..::: :. . ::. :. : . :: :.. : :. : . . .
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.:::...:. ::::::::.: . .. . : .: .. .::.:...:.:.::: ::
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:..: :. : :..: : :::: :.::::: : .:..: .: : ::. : ::.. :
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:: :.:.::. .::::. :. :::: :::::: ::::: :..:. :.: :::: . .
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: .:. :.: :.:: . . ::. .:.: :: :.: ::..: :..:..
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: ::: :.: :: ::: .:.:
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: .: :..::: :. . ::. :. : . :: :.. : :. : . . .
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CCDS90 PYKYFATNCSATF-GLE-------DDVVKKGAICTSKYSSPFPCTGGEVIFKALSPPYDT
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CCDS90 ENPYSAKVQEQLKITNLRVQLLKRQSCPCQRNDLNEEPQHFTHYAIYDFIVKGSCFCNGH
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:: :.:.::. .::::. :. :::: :::::: ::::: :..:. :.: :::: . .
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: ::: :.: :: ::: .:.: . . : : :.. :
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: : . . .: .:.:.:... .:
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CCDS90 THVEVNVKIKKVLKSTKLKIFRGKRTLYPESWTDRGCTCPILNPGLEYLVAGHEDIRTGK
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:..::::. .:.. ...: :. ::.::.:::.:::.::.::.:.. :: . :: :
CCDS14 PVSLQLDLDRRFQLQEVMMEFQGPMPAGMLIERSSDFGKTWRVYQYLAADCTSTFPRVRQ
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. :. :.:: :.: .. . .: .: ..: . :: :..::.. .:::::::.:
CCDS14 GRPQSWQDVRCQSLPQRPNARLNGGKVQLNLMDLVSGIPATQSQKIQEVGEITNLRVNFT
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:: . . : . :::. .: ..:.:::.:::..::: ::: : .::
CCDS14 RLAPVPQRGYHP-----PSAYYAVSQLRLQGSCFCHGHADRCAPKPGASAGPSTAVQVHD
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CCDS14 VCVCQHNTAGPNCERCAPFYNNRPWRPAEGQDAHECQRCDCNGHSETCHFDPAVFAASQG
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. :::::.:. .: :..:: :. ..:. .: ::.::: :. :. ::
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: :.::: ::::: : ::. :. :: ::. .. ::.::.:: :. . ::: .:
CCDS14 P----VTGQCVCKEHVQGERCDLCKPGFTGLTYANPQGCHRCDCNILGSRR-DMPCDEES
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CCDS14 GRCLCLPNVVGPKCDQCAPYHWKLASGQ-GCEPCACDPHNSLSPQCNQFTGQCPCREGFG
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: :
CCDS14 GLMCSAAAIRQCPDRTYGDVATGCRACDCDFRGTEGPGCDKASGRCLCRPGLTGPRCDQC
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>--
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CCDS14 SLSPQCNQFTGQCPCREGFGGLMCSAAAIRQCPDRTYGDVATGCRACDCDFRGTEGPGCD
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. .:.: ::::..: ::::: ::. . .:.: :: :: .: ... : : ::.. .
CCDS14 KASGRCLCRPGLTGPRCDQCQRGYCNRYPVCVACHPCFQTYDADLREQALRFGRLRNATA
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: . : .. : . . :. ....... .. .::.. : :::
CCDS14 SLWSGPGLEDRGLASRILDAKSKIEQIRAVLSSPAVTEQEVAQVASAILSLRRT------
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: :. :: ...:... . : .:.:. .: ::. : .... .. .. ::. .
CCDS14 -LQGLQLDLP-LEEETLSLPRDLESLDRSFNGL-LTMYQRKREQFEKISSADPSGAFRML
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:. :::.: .... :. . . . .: .: . . : .: . ...:
CCDS14 STAYEQSAQAAQQVSDSSRLL-DQLRDSRREAERLVRQAGGGGGTGSPKLVALRLEMSSL
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: :. :.: :: . :. : : : ...: ::. : :. : :.
CCDS14 PDLTPTF-----NKL-CGNSRQMACTPISCPGELCPQDNGTA-CGS-RCRGVLPRAGGAF
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: .. .:. :. . . ....::. :. :: ...:::.:.:. .. .
CCDS14 LMAGQVAEQLRGFNAQLQRTRQMIRAAEESASQIQSSAQRLETQVSASRSQMEEDVRRTR
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:::.:.:::.. .: .:. :. :: : .:. :: .:.. ::: : : .::
CCDS14 LLIQQVRDFLTDPDTDAATIQEVSEAVLALWLPTDSATVLQKMNEIQAIAAR---LPNVD
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.:..: :. ::..: .:..::: :. . ..: : . :... : :: ...:.
CCDS14 LVLSQTKQDIARARRLQAEAEEARSRAHAVEGQVEDVVGNLRQGTVALQEAQDTMQGTSR
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. : .. . .::. . ::. ..: .. .. . .: :. . .. : :.. : .
CCDS14 SLRLIQDRVAEVQQVLRPAEKLVTSMTKQLGDFWTRMEELRHQARQQGAEAVQAQQLAEG
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:. .: :.. .. . ..: .: .: .:. .:. : :: .... ::..:. ...
CCDS14 ASEQALSAQEGFER-IKQKYAELK---DRLGQSSMLGEQGARIQSVKTEAEELFGETMEM
1070 1080 1090 1100 1110 1120
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..:....: .. .:. ..:.: ::: :.... . :: .: : ::.
CCDS14 MDRMKDMELELLRGSQAIMLRSADLTGLEKRVEQIRDHINGRVLYYATCK
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: . :: :.. : :. : . . .:: : .:::: . . :::
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::::::.:::::. ::. :::::...:: :::.::. :.::. .:.: : :.
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:: .:.: . . : : :.. :: : . . .: .
CCDS86 DPITGDC----ISSHTDID------W--YHEVPDFRPVHNKSEPAWEWEDAQGFSALLHS
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:.:.:... .:
CCDS86 GKCECKEQTLGNAKAFCGMKYSYVLKIKILSAHDKGTHVEVNVKIKKVLKSTKLKIFRGK
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: : ::::::.: . :.. :: :.::: : .::.: :..: :: . .:
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. : : :. :: . : :: : : :
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: ..: . :. . ..: : .: .: :. : : .:. :. :
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:::: : : : .. :: :
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:.:: :. :. .:: :. : :: : ::::. ::.:.: . .:.::::: :.
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..: :...:: :: : : :::.: : :::: :. :. :.::::.
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.. . :. . . . .: .::: :: . : .: :. : ::
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. :: . : . ...: :....: . ...:.: . :..: : : : .
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.:. . ::.. .: .: :: .. . . :.. : . .:. : ..
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..: .:: : ...::..: .: : :. . ..::.. : . :. :..
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. . .. .: : :: .:. .....:.: : :: : :: .. :: :
CCDS69 LLRERKQAHRRASRLTSQTQATLQQ---ASQQVLAS--EARRQ--ELEEAERVG-AGLSE
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. .:. : . . .:: . :: : .:. ::.. .: :.::
CCDS69 MEQQIRESRISLEKDIETLSELL-ARLGSLDTHQA-------PAQALNETQWALERLR--
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CCDS69 WQ
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pF1KE5 MELTSRERGRGQPLPWELRLGLLLSVLAATLAQAPAPDVP--GCSRGSCYPATG
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CCDS13 MRGSHRAAPALRPRGRLWPV-----LAVLAAAAAAGCAQAAMDECTDEGGRPQRCMPE--
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CCDS13 --FVNAAFNVTVVATNTCG-TPPEEYCVQTGVTGVTKSCHLCDA-------GQPHLQHGA
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CCDS13 AFLTDYNNQADTTWWQSQTMLAGVQYPSSINLTLHLGKAFDITYVRLKFHTSRPESFAIY
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CCDS13 KRTREDGPWIPYQYYSGSCENTYSKANRGFIRTGGDEQQALCTDEFSDISPLTGGNVAFS
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CCDS13 TLEGRPSAYNFDN-SPVLQEWVTATDIRVTLNRLNTFGDEVFNDPK--VLKSYYYAISDF
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CCDS13 AVGGRCKCNGHASECMKN-----EFDKLV---CNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRRAT
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CCDS13 AESASECLPCDCNGRSQECYFDPELYRSTGH--GGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFR--
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CCDS13 ---LGNNEACSSCHCSPVGSLST-QCDSY---------GRCSCKPGVMGDKCDRCQPGFH
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.:. . ::: :.:. :.. :. ..: : :: : : .:.:: :: ..: : .
CCDS13 SLT---EAGCRPCSCDPSGSI---DECNIETGRCVCKDNVEGFNCERCKPGFFNLESSNP
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CCDS13 SEASL-----------EWSS-------ERQ---------------DIAVISDSYFPRYFI
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CCDS13 AQGNSYPSETTVK---------------YVFRLHEATDYPWRPALTPFE-FQKLLNNLTS
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