Result of FASTA (ccds) for
pF1KE4446
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4446, 461 aa
1>>>pF1KE4446 461 - 461 aa - 461 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3359+/-0.000915; mu= 17.0735+/- 0.055
mean_var=62.6394+/-12.458, 0's: 0 Z-trim(104.8): 21 B-trim: 348 in 1/49
Lambda= 0.162051
statistics sampled from 8186 (8193) to 8186 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.622), E-opt: 0.2 (0.245), width: 16
Scan time: 1.400
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS1672.1 ODC1 gene_id:4953|Hs109|chr2 ( 461) 3101 733.9 8.4e-212
CCDS375.1 AZIN2 gene_id:113451|Hs109|chr1 ( 460) 1569 375.7 5.5e-104
CCDS6295.1 AZIN1 gene_id:51582|Hs109|chr8 ( 448) 1506 361.0 1.5e-99
CCDS76138.1 AZIN2 gene_id:113451|Hs109|chr1 ( 480) 1149 277.5 2.1e-74
>>CCDS1672.1 ODC1 gene_id:4953|Hs109|chr2 (461 aa)
initn: 3101 init1: 3101 opt: 3101 Z-score: 3916.2 bits: 733.9 E(33420): 8.4e-212
Smith-Waterman score: 3101; 100.0% identity (100.0% similar) in 461 aa overlap (1-461:1-461)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MNNFGNEEFDCHFLDEGFTAKDILDQKINEVSSSDDKDAFYVADLGDILKKHLRWLKALP
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CCDS16 MNNFGNEEFDCHFLDEGFTAKDILDQKINEVSSSDDKDAFYVADLGDILKKHLRWLKALP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 RVTPFYAVKCNDSKAIVKTLAATGTGFDCASKTEIQLVQSLGVPPERIIYANPCKQVSQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 RVTPFYAVKCNDSKAIVKTLAATGTGFDCASKTEIQLVQSLGVPPERIIYANPCKQVSQI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 KYAANNGVQMMTFDSEVELMKVARAHPKAKLVLRIATDDSKAVCRLSVKFGATLRTSRLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 KYAANNGVQMMTFDSEVELMKVARAHPKAKLVLRIATDDSKAVCRLSVKFGATLRTSRLL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LERAKELNIDVVGVSFHVGSGCTDPETFVQAISDARCVFDMGAEVGFSMYLLDIGGGFPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 LERAKELNIDVVGVSFHVGSGCTDPETFVQAISDARCVFDMGAEVGFSMYLLDIGGGFPG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 SEDVKLKFEEITGVINPALDKYFPSDSGVRIIAEPGRYYVASAFTLAVNIIAKKIVLKEQ
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CCDS16 SEDVKLKFEEITGVINPALDKYFPSDSGVRIIAEPGRYYVASAFTLAVNIIAKKIVLKEQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 TGSDDEDESSEQTFMYYVNDGVYGSFNCILYDHAHVKPLLQKRPKPDEKYYSSSIWGPTC
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CCDS16 TGSDDEDESSEQTFMYYVNDGVYGSFNCILYDHAHVKPLLQKRPKPDEKYYSSSIWGPTC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 DGLDRIVERCDLPEMHVGDWMLFENMGAYTVAAASTFNGFQRPTIYYVMSGPAWQLMQQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 DGLDRIVERCDLPEMHVGDWMLFENMGAYTVAAASTFNGFQRPTIYYVMSGPAWQLMQQF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KE4 QNPDFPPEVEEQDASTLPVSCAWESGMKRHRAACASASINV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 QNPDFPPEVEEQDASTLPVSCAWESGMKRHRAACASASINV
430 440 450 460
>>CCDS375.1 AZIN2 gene_id:113451|Hs109|chr1 (460 aa)
initn: 1533 init1: 1497 opt: 1569 Z-score: 1980.5 bits: 375.7 E(33420): 5.5e-104
Smith-Waterman score: 1569; 52.5% identity (80.2% similar) in 440 aa overlap (8-444:7-443)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MNNFGNEEFDCHFLDEGFTAKDILDQKINEVS--SSDDKDAFYVADLGDILKKHLRWLKA
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CCDS37 MAGYLSESDFVMVEEGFSTRDLLKELTLGASQATTDEVAAFFVADLGAIVRKHFCFLKC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 LPRVTPFYAVKCNDSKAIVKTLAATGTGFDCASKTEIQLVQSLGVPPERIIYANPCKQVS
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CCDS37 LPRVRPFYAVKCNSSPGVLKVLAQLGLGFSCANKAEMELVQHIGIPASKIICANPCKQIA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 QIKYAANNGVQMMTFDSEVELMKVARAHPKAKLVLRIATDDSKAVCRLSVKFGATLRTSR
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CCDS37 QIKYAAKHGIQLLSFDNEMELAKVVKSHPSAKMVLCIATDDSHSLSCLSLKFGVSLKSCR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 LLLERAKELNIDVVGVSFHVGSGCTDPETFVQAISDARCVFDMGAEVGFSMYLLDIGGGF
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CCDS37 HLLENAKKHHVEVVGVSFHIGSGCPDPQAYAQSIADARLVFEMGTELGHKMHVLDLGGGF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 PGSEDVKLKFEEITGVINPALDKYFPSDSGVRIIAEPGRYYVASAFTLAVNIIAKKIVLK
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CCDS37 PGTEGAKVRFEEIASVINSALDLYFPEGCGVDIFAELGRYYVTSAFTVAVSIIAKKEVLL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 EQTGSDDEDESSEQTFMYYVNDGVYGSFNCILYDHAHVKPLLQKRPKPDEKYYSSSIWGP
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CCDS37 DQPGREEENGSTSKTIVYHLDEGVYGIFNSVLFDNICPTPILQKKPSTEQPLYSSSLWGP
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 TCDGLDRIVERCDLPEMHVGDWMLFENMGAYTVAAASTFNGFQRPTIYYVMSGPAWQ-LM
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CCDS37 AVDGCDCVAEGLWLPQLHVGDWLVFDNMGAYTVGMGSPFWGTQACHITYAMSRVAWEALR
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KE4 QQFQNPDFPPEVEEQDASTLPVSCAWESGMKRHRAACASASINV
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CCDS37 RQLMAAEQEDDVE---GVCKPLSCGWEITDTLCVGPVFTPASIM
420 430 440 450 460
>>CCDS6295.1 AZIN1 gene_id:51582|Hs109|chr8 (448 aa)
initn: 1463 init1: 829 opt: 1506 Z-score: 1901.1 bits: 361.0 E(33420): 1.5e-99
Smith-Waterman score: 1506; 53.1% identity (79.5% similar) in 420 aa overlap (1-418:1-416)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MNNFGNE-EFDCHFLDEGFTAKDILDQKINEVSSSDDKDAFYVADLGDILKKHLRWLKAL
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CCDS62 MKGFIDDANYSVGLLDEGTNLGNVIDNYVYE-HTLTGKNAFFVGDLGKIVKKHSQWQNVV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 PRVTPFYAVKCNDSKAIVKTLAATGTGFDCASKTEIQLVQSLGVPPERIIYANPCKQVSQ
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CCDS62 AQIKPFYTVKCNSAPAVLEILAALGTGFACSSKNEMALVQELGVPPENIIYISPCKQVSQ
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 IKYAANNGVQMMTFDSEVELMKVARAHPKAKLVLRIATDDSKAVCRLSVKFGATLRTSRL
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CCDS62 IKYAAKVGVNILTCDNEIELKKIARNHPNAKVLLHIATEDNIGGEEGNMKFGTTLKNCRH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 LLERAKELNIDVVGVSFHVGSGCTDPETFVQAISDARCVFDMGAEVGFSMYLLDIGGGFP
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CCDS62 LLECAKELDVQIIGVKFHVSSACKESQVYVHALSDARCVFDMAGEIGFTMNMLDIGGGFT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 GSEDVKLKFEEITGVINPALDKYFPSDSGVRIIAEPGRYYVASAFTLAVNIIAKKIVLKE
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CCDS62 GTE---FQLEEVNHVISPLLDIYFPEGSGVKIISEPGSYYVSSAFTLAVNIIAKKVVEND
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 QTGSDDEDESS-EQTFMYYVNDGVYGSFNCILYDHAHVKPLLQKRPKPDEKYYSSSIWGP
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CCDS62 KFPSGVEKTGSDEPAFMYYMNDGVYGSFASKLSEDLNTIPEVHKKYKEDEPLFTSSLWGP
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 TCDGLDRIVERCDLPEMHVGDWMLFENMGAYTVAAASTFNGFQRPTIYYVMSGPAWQLMQ
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CCDS62 SCDELDQIVESCLLPELNVGDWLIFDNMGADSFHEPSAFNDFQRPAIYYMMSFSDWYEMQ
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KE4 QFQNPDFPPEVEEQDASTLPVSCAWESGMKRHRAACASASINV
CCDS62 DAGITSDSMMKNFFFVPSCIQLSQEDSFSAEA
420 430 440
>>CCDS76138.1 AZIN2 gene_id:113451|Hs109|chr1 (480 aa)
initn: 1483 init1: 1109 opt: 1149 Z-score: 1449.5 bits: 277.5 E(33420): 2.1e-74
Smith-Waterman score: 1519; 50.2% identity (76.7% similar) in 460 aa overlap (8-444:7-463)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MNNFGNEEFDCHFLDEGFTAKDILDQKINEVS--SSDDKDAFYVADLGDILKKHLRWLKA
: : ...:::...:.: . .: ..:. ::.::::: :..::. .::
CCDS76 MAGYLSESDFVMVEEGFSTRDLLKELTLGASQATTDEVAAFFVADLGAIVRKHFCFLKC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 LPRVTPFYAVKCNDSKAIVKTLAATGTGFDCASKTEIQLVQSLGVPPERIIYANPCKQVS
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CCDS76 LPRVRPFYAVKCNSSPGVLKVLAQLGLGFSCANKAEMELVQHIGIPASKIICANPCKQIA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 QIKYAANNGVQMMTFDSEVELMKVARAHPKAKLVLRIATDDSKAVCRLSVKFGATLRTSR
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CCDS76 QIKYAAKHGIQLLSFDNEMELAKVVKSHPSAKMVLCIATDDSHSLSCLSLKFGVSLKSCR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 LLLERAKELNIDVVGVSFHVGSGCTDPETFVQAISDARCVFDMGAEVGFSMYLLDIGGGF
::: ::. ...:::::::.:::: ::....:.:.::: ::.::.:.: .:..::.::::
CCDS76 HLLENAKKHHVEVVGVSFHIGSGCPDPQAYAQSIADARLVFEMGTELGHKMHVLDLGGGF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 PGSEDVKLKFEEITGVINPALDKYFPSDSGVRIIAEPGRYYVASAFTLAVNIIAKKIVLK
::.: .:..::::..::: ::: ::: :: :.:: :::::.::::.::.::::: ::
CCDS76 PGTEGAKVRFEEIASVINSALDLYFPEGCGVDIFAELGRYYVTSAFTVAVSIIAKKEVLL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KE4 EQTGSD--------------------DEDESSEQTFMYYVNDGVYGSFNCILYDHAHVKP
.: : . .:. :. .:..:....:::: :: .:.:. :
CCDS76 DQPGREAPLPPPHIATCAASEPSPPAEENGSTSKTIVYHLDEGVYGIFNSVLFDNICPTP
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 LLQKRPKPDEKYYSSSIWGPTCDGLDRIVERCDLPEMHVGDWMLFENMGAYTVAAASTFN
.:::.:. .. ::::.:::. :: : ..: ::..:::::..:.:::::::. .: :
CCDS76 ILQKKPSTEQPLYSSSLWGPAVDGCDCVAEGLWLPQLHVGDWLVFDNMGAYTVGMGSPFW
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 GFQRPTIYYVMSGPAWQ-LMQQFQNPDFPPEVEEQDASTLPVSCAWESGMKRHRAACASA
: : : :.:: ::. : .:.. . .:: . :.::.::
CCDS76 GTQACHITYAMSRVAWEALRRQLMAAEQEDDVE---GVCKPLSCGWEITDTLCVGPVFTP
420 430 440 450 460 470
460
pF1KE4 SINV
CCDS76 ASIM
480
461 residues in 1 query sequences
18921897 residues in 33420 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Oct 12 17:02:24 2018 done: Fri Oct 12 17:02:24 2018
Total Scan time: 1.400 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]