FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4281, 1502 aa
1>>>pF1KE4281 1502 - 1502 aa - 1502 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4070+/-0.00119; mu= 14.9427+/- 0.073
mean_var=156.1940+/-29.751, 0's: 0 Z-trim(107.8): 117 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.102622
statistics sampled from 9677 (9797) to 9677 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.642), E-opt: 0.2 (0.301), width: 16
Scan time: 5.920
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32062.1 ARHGAP5 gene_id:394|Hs108|chr14 (1502) 10038 1499.6 0
CCDS45095.1 ARHGAP5 gene_id:394|Hs108|chr14 (1501) 10019 1496.8 0
CCDS46127.1 ARHGAP35 gene_id:2909|Hs108|chr19 (1499) 4021 608.8 4.1e-173
CCDS56147.1 CHN1 gene_id:1123|Hs108|chr2 ( 334) 444 78.7 3.4e-14
CCDS46454.1 CHN1 gene_id:1123|Hs108|chr2 ( 433) 444 78.7 4.2e-14
CCDS46455.1 CHN1 gene_id:1123|Hs108|chr2 ( 459) 444 78.8 4.4e-14
CCDS47566.1 CHN2 gene_id:1124|Hs108|chr7 ( 332) 422 75.4 3.3e-13
CCDS5420.1 CHN2 gene_id:1124|Hs108|chr7 ( 468) 422 75.5 4.2e-13
CCDS11498.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs108|chr17 ( 548) 414 74.4 1.1e-12
CCDS74082.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs108|chr17 ( 889) 414 74.5 1.6e-12
CCDS2184.1 ARHGAP15 gene_id:55843|Hs108|chr2 ( 475) 387 70.3 1.6e-11
CCDS78219.1 CHN2 gene_id:1124|Hs108|chr7 ( 274) 382 69.4 1.7e-11
>>CCDS32062.1 ARHGAP5 gene_id:394|Hs108|chr14 (1502 aa)
initn: 10038 init1: 10038 opt: 10038 Z-score: 8035.9 bits: 1499.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10038; 100.0% identity (100.0% similar) in 1502 aa overlap (1-1502:1-1502)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 LGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHGCFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHGCFC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE4 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE4 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE4 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE4 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE4 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE4 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYF
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE4 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE4 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE4 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE4 FIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE4 II
::
CCDS32 II
>>CCDS45095.1 ARHGAP5 gene_id:394|Hs108|chr14 (1501 aa)
initn: 8263 init1: 8263 opt: 10019 Z-score: 8020.7 bits: 1496.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10019; 99.9% identity (99.9% similar) in 1502 aa overlap (1-1502:1-1501)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLSTI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEHLN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 WSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHVQH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRES
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 LGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHGCFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHGCFC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQRDSISKNLPILRHQGQQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE4 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNTRESTHQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE4 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE4 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE4 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE4 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE4 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS45 LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKK-KKKTKNFNPPTRRNWESNYF
1210 1220 1230 1240 1250
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE4 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINL
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE4 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPV
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE4 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVET
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE4 FIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KE4 II
::
CCDS45 II
1500
>>CCDS46127.1 ARHGAP35 gene_id:2909|Hs108|chr19 (1499 aa)
initn: 3300 init1: 1368 opt: 4021 Z-score: 3221.4 bits: 608.8 E(32554): 4.1e-173
Smith-Waterman score: 4975; 50.8% identity (78.3% similar) in 1515 aa overlap (1-1496:2-1491)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLST
:::.... : :.:.::.::::::::.::.::.::::::::::: .:::.. .:::::::
CCDS46 MMMARKQDVRIPTYNISVVGLSGTEKEKGQCGIGKSCLCNRFVRPSADEFHLDHTSVLST
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 IDFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRA
::::::::::::::::.. .. :: ::::.:..::::::::::: ::::: ::::::::
CCDS46 SDFGGRVVNNDHFLYWGEVSRSLEDCVECKMHIVEQTEFIDDQTFQPHRSTALQPYIKRA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 AASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKF
::.:: :::::::.:::::::::::::::::.::: :::::: ::::.: ::.:::::::
CCDS46 AATKLASAEKLMYFCTDQLGLEQDFEQKQMPDGKLLVDGFLLGIDVSRGMNRNFDDQLKF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 VNNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCF
:.::. ::.:.:::.... ::::: :..:.:....:: .:::: ::::::: :::.. :
CCDS46 VSNLYNQLAKTKKPIVVVLTKCDEGVERYIRDAHTFALSKKNLQVVETSARSNVNVDLAF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 TALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLV-QTVRDYHATWKTVSNKLK
..:::..::.:.: :::::..: : : : ..:: ::.: :: . :.... .: .:: :..
CCDS46 STLVQLIDKSRGKTKIIPYFEALKQQSQQIATAKDKYEWLVSRIVKNHNENWLSVSRKMQ
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 NHPDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEH
:.:..:. ::::.::.. : .::..::.:::..::. :. .:: ::..:.:::.::.:
CCDS46 ASPEYQDYVYLEGTQKAKKLFLQHIHRLKHEHIERRRKLYLAALPLAFEALIPNLDEIDH
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 LNWSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHV
:. .: ::.: . .: :::::.:::: :.:::.....::::::..:. ::..:. :.
CCDS46 LSCIKAKKLLETKPEFLKWFVVLEETPWDATSHIDNMENERIPFDLMDTVPAEQLYEAHL
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 QHLISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRH
..: .:..::::.. ::..:: ::.::.::::. :.:... :... :. ..::.:
CCDS46 EKLRNERKRVEMRRAFKENLETSPFITPGKPWEEARSFIMNEDFYQWLEESVYMDIYGKH
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 QREIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDR
:..:..::::::::.:.:.:::::.:.:.: ::..::. :. ::.:: :.:::::: .:
CCDS46 QKQIIDKAKEEFQELLLEYSELFYELELDAKPSKEKMGVIQDVLGEEQRFKALQKLQAER
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 ESLLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNL
..:.:::: :::::::::: : :.: :.:.:..: ... . . .. :::..::
CCDS46 DALILKHIHFVYHPTKETCPSCPACVDAKIEHLISSRFIRPSDRNQKNSLSDPNIDRINL
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 FILGKDGLAQELANEIRTQST-DDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHG
::::::::.:::::::. : ::.:..:::.:::.:::.... .... : .:.:::
CCDS46 VILGKDGLARELANEIRALCTNDDKYVIDGKMYELSLRPIEGNVRLPVNSFQTPTFQPHG
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 CFCVFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQR-DSISKNLPILRH
:.:..:: ::::.. : : : : :.. :.:.....::.::::.:.: :. ...: : .
CCDS46 CLCLYNSKESLSYVVESIEKSR-ESTLGRRDNHLVHLPLTLILVNKRGDTSGETLHSLIQ
670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE4 QGQQLANKLQCPFVDVPAGT---YPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDL
::::.:.:::: :.: ::.. : :..:: ::.:.:.:.:.: :.::..:: . :::
CCDS46 QGQQIASKLQCVFLD-PASAGIGYGRNINEKQISQVLKGLLDS-KRNLNLVSSTASIKDL
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KE4 SEADLRIVMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITI
...::::::: :::::::.: :: : :.:..:.... :.:::..:. :: ...::....
CCDS46 ADVDLRIVMCLMCGDPFSADDILFPVLQSQTCKSSHCGSNNSVLLELPIGLHKKRIELSV
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KE4 LSYHSSIGVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFE
::::::...::..::::::. ::::::::..:::::: :::: ::.::::.::. .: ..
CCDS46 LSYHSSFSIRKSRLVHGYIVFYSAKRKASLAMLRAFLCEVQDIIPIQLVALTDGAVDVLD
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KE4 NEAIKELMTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDN
:. .: .::::.:: :: ..::.. :: ... :.: ::.::.::::.:: ... ::
CCDS46 NDLSREQLTEGEEIAQEIDGRFTSI-PCSQPQHKLEIFHPFFKDVVEKKNIIEATHMYDN
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE4 TRESTHQSEDVFLPSPRDCFPY--NNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYR
. :. .:.:: ::: : .: ::..: : : :: . .:..: .:.:.
CCDS46 AAEACSTTEEVF-NSPRAGSPLCNSNLQDSEEDIE--PSYSLFREDTSLPSLSKDHSKLS
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE4 LDLEGNEYPIHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPR
..::::. . . . . :.:::::.:::: : . .. : : :. .. : . :
CCDS46 MELEGND-GLSFIMSNFESKLNNKVPPPVKPKPPV-HFEITKGD---LSYLDQGHRDGQR
1020 1030 1040 1050 1060
1080 1090 1100 1110 1120
pF1KE4 KQTSRVPLAHPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDS-QNRI-KIRNSFVNNT
:..: : . .:::: ::::.:.. : .. ..:: :: :: :..: ::: .:..
CCDS46 KSVSSSPWLPQDGFDPSD-YAEPMDAVVKPRNEEENIYSVPHDSTQGKIITIRN--INKA
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KE4 QGDEENGFSDRTSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRK
:.. .. :: . . .: : . :: .. ... : :: .:.... .
CCDS46 QSNGSGNGSDSEMDTSSLERGRKVSIVSKPVLYRTRC--TRLGRFASYRTSFSVGSDDEL
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KE4 GRHRGSEEDPLLSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNP
: : .::: . . .:: :: .: . . : .. .. ...... : : : :
CCDS46 GPIRKKEED---QASQGYKG--DNAVIPYETDEDPRR-RNILRSLRRNTK-KPKPKPRPS
1190 1200 1210 1220 1230
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KE4 PTRRNWESNYFGMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQ
:. .:::::::.:: .:: :::::.:.:.:.:.:: ::: :::.:::::::......:
CCDS46 ITKATWESNYFGVPLTTVVTPEKPIPIFIERCIEYIEATGLSTEGIYRVSGNKSEMESLQ
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KE4 KQFDQDHNINLVSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHA
.:::::::..:. . :::.::::.:.::..:::::.::... .:.:: :: :. ..:::
CCDS46 RQFDQDHNLDLAEKDFTVNTVAGAMKSFFSELPDPLVPYNMQIDLVEAHKINDREQKLHA
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KE4 LKEIVKKFHPVNYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLS
:::..::: :..::.:::.:::.::...:.::::..::::::::::::::: . . :.
CCDS46 LKEVLKKFPKENHEVFKYVISHLNKVSHNNKVNLMTSENLSICFWPTLMRPDFSTMDALT
1360 1370 1380 1390 1400 1410
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KE4 TTKIHQSVVETFIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVE-----PMV----PLQ
.:. .:...: ::::: ::::: :.: . . : :: .. : :.. : :
CCDS46 ATRTYQTIIELFIQQCPFFFYNRPITEPPG-ARPSSPSAVASTVPFLTSTPVTSQPSPPQ
1420 1430 1440 1450 1460 1470
1490 1500
pF1KE4 LPPPLQPQLIQPQLQTDPLGII
::: . .:: : .
CCDS46 SPPPTPQSPMQPLLPSQLQAEHTL
1480 1490
>>CCDS56147.1 CHN1 gene_id:1123|Hs108|chr2 (334 aa)
initn: 378 init1: 297 opt: 444 Z-score: 368.2 bits: 78.7 E(32554): 3.4e-14
Smith-Waterman score: 444; 37.0% identity (69.4% similar) in 216 aa overlap (1238-1449:120-334)
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE4 KGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYFGMPLQDL
:. .: . : : .. .. : . : :
CCDS56 GPHWCEYCANFMWGLIAQGVKCADCGLNVHKQCSKMVPNDCKPDLKHVKKVY-SCDLTTL
90 100 110 120 130 140
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE4 VTAEKPI-PLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINLVSMEV-
: :. :. :. :.. ::. :: .:::::::: . .... ::.: . .:...
CCDS56 VKAHTTKRPMVVDMCIREIESRGLNSEGLYRVSGFSDLIEDVKMAFDRDGEKADISVNMY
150 160 170 180 190 200
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE4 -TVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPVNYDV
.: ..:::: .: ::: ::: :. .:...:.::: : :.:..:.: .: . :.. ..
CCDS56 EDINIITGALKLYFRDLPIPLITYDAYPKFIESAKIMDPDEQLETLHEALKLLPPAHCET
210 220 230 240 250 260
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE4 FRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMR-PDFENREFLSTTKIHQSVVETFIQ
.::...::.::. ..: :::.:.::.: : ::::: :... :. . .. ::: .:.
CCDS56 LRYLMAHLKRVTLHEKENLMNAENLGIVFGPTLMRSPELDAMAALNDIRYQRLVVELLIK
270 280 290 300 310 320
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE4 QCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLGII
. ...:
CCDS56 NEDILF
330
>>CCDS46454.1 CHN1 gene_id:1123|Hs108|chr2 (433 aa)
initn: 378 init1: 297 opt: 444 Z-score: 366.7 bits: 78.7 E(32554): 4.2e-14
Smith-Waterman score: 444; 37.0% identity (69.4% similar) in 216 aa overlap (1238-1449:219-433)
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE4 KGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYFGMPLQDL
:. .: . : : .. .. : . : :
CCDS46 GPHWCEYCANFMWGLIAQGVKCADCGLNVHKQCSKMVPNDCKPDLKHVKKVY-SCDLTTL
190 200 210 220 230 240
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE4 VTAEKPI-PLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINLVSMEV-
: :. :. :. :.. ::. :: .:::::::: . .... ::.: . .:...
CCDS46 VKAHTTKRPMVVDMCIREIESRGLNSEGLYRVSGFSDLIEDVKMAFDRDGEKADISVNMY
250 260 270 280 290 300
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE4 -TVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPVNYDV
.: ..:::: .: ::: ::: :. .:...:.::: : :.:..:.: .: . :.. ..
CCDS46 EDINIITGALKLYFRDLPIPLITYDAYPKFIESAKIMDPDEQLETLHEALKLLPPAHCET
310 320 330 340 350 360
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE4 FRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMR-PDFENREFLSTTKIHQSVVETFIQ
.::...::.::. ..: :::.:.::.: : ::::: :... :. . .. ::: .:.
CCDS46 LRYLMAHLKRVTLHEKENLMNAENLGIVFGPTLMRSPELDAMAALNDIRYQRLVVELLIK
370 380 390 400 410 420
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE4 QCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLGII
. ...:
CCDS46 NEDILF
430
>>CCDS46455.1 CHN1 gene_id:1123|Hs108|chr2 (459 aa)
initn: 378 init1: 297 opt: 444 Z-score: 366.3 bits: 78.8 E(32554): 4.4e-14
Smith-Waterman score: 444; 37.0% identity (69.4% similar) in 216 aa overlap (1238-1449:245-459)
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE4 KGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYFGMPLQDL
:. .: . : : .. .. : . : :
CCDS46 GPHWCEYCANFMWGLIAQGVKCADCGLNVHKQCSKMVPNDCKPDLKHVKKVY-SCDLTTL
220 230 240 250 260 270
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE4 VTAEKPI-PLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINLVSMEV-
: :. :. :. :.. ::. :: .:::::::: . .... ::.: . .:...
CCDS46 VKAHTTKRPMVVDMCIREIESRGLNSEGLYRVSGFSDLIEDVKMAFDRDGEKADISVNMY
280 290 300 310 320 330
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE4 -TVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPVNYDV
.: ..:::: .: ::: ::: :. .:...:.::: : :.:..:.: .: . :.. ..
CCDS46 EDINIITGALKLYFRDLPIPLITYDAYPKFIESAKIMDPDEQLETLHEALKLLPPAHCET
340 350 360 370 380 390
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE4 FRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMR-PDFENREFLSTTKIHQSVVETFIQ
.::...::.::. ..: :::.:.::.: : ::::: :... :. . .. ::: .:.
CCDS46 LRYLMAHLKRVTLHEKENLMNAENLGIVFGPTLMRSPELDAMAALNDIRYQRLVVELLIK
400 410 420 430 440 450
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE4 QCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLGII
. ...:
CCDS46 NEDILF
>>CCDS47566.1 CHN2 gene_id:1124|Hs108|chr7 (332 aa)
initn: 376 init1: 296 opt: 422 Z-score: 350.7 bits: 75.4 E(32554): 3.3e-13
Smith-Waterman score: 422; 34.7% identity (66.7% similar) in 216 aa overlap (1238-1449:118-332)
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE4 KGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYFGMPLQDL
:. .:.. : : . .. : : :
CCDS47 GPHWCEYCANFMWGLIAQGVRCSDCGLNVHKQCSKHVPNDCQPDLKRIKKVYC-CDLTTL
90 100 110 120 130 140
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE4 VTAEKPI-PLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINLVSMEV-
: :.. :. :. :.. :: :: .:::::::: .... ::.: . .: .:
CCDS47 VKAHNTQRPMVVDICIREIEARGLKSEGLYRVSGFTEHIEDVKMAFDRDGEKADISANVY
150 160 170 180 190 200
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE4 -TVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPVNYDV
.: ..:::: .: ::: :.: :. . ....:::: . :::.:..:.. . :..:..
CCDS47 PDINIITGALKLYFRDLPIPVITYDTYSKFIDAAKISNADERLEAVHEVLMLLPPAHYET
210 220 230 240 250 260
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE4 FRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENR-EFLSTTKIHQSVVETFIQ
.::.. ::..:....: :.:.:.::.: : :::::: .. : . .. .:. .:.
CCDS47 LRYLMIHLKKVTMNEKDNFMNAENLGIVFGPTLMRPPEDSTLTTLHDMRYQKLIVQILIE
270 280 290 300 310 320
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE4 QCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLGII
. . .:
CCDS47 NEDVLF
330
>>CCDS5420.1 CHN2 gene_id:1124|Hs108|chr7 (468 aa)
initn: 376 init1: 296 opt: 422 Z-score: 348.6 bits: 75.5 E(32554): 4.2e-13
Smith-Waterman score: 447; 31.1% identity (60.7% similar) in 318 aa overlap (1138-1449:167-468)
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE4 IYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDRTSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSY
: : :.:..: : .. .. .: : .:
CCDS54 ETKAAEYISKMTTNPIYEHIGYATLLREKVSRRLSRSKNEPRKTNVTHEEHTAVEKISSL
140 150 160 170 180 190
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE4 YRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRH--RGSEEDPLLSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDK
::. . . .:. :. ::. : :: . . : : : . . :: :.
CCDS54 VRRA-ALTHNDNHFNYEKTHNFKVHTFRGPHWCEYCANF-MW-GLIAQGVRCSDCGLN--
200 210 220 230 240 250
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KE4 KMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPPTRRNWESNYFGMPLQDLVTAEKPI-PLFVEKCVEF
.:: . .:. .. .: .: .. . : :: :.. :. :. :..
CCDS54 -----VHK----QCSKHVPNDCQPDLKRI--KKVYCCDLTTLVKAHNTQRPMVVDICIRE
260 270 280 290 300
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KE4 IEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQFDQDHNINLVSMEV--TVNAVAGALKAFFADLP
:: :: .:::::::: .... ::.: . .: .: .: ..:::: .: :::
CCDS54 IEARGLKSEGLYRVSGFTEHIEDVKMAFDRDGEKADISANVYPDINIITGALKLYFRDLP
310 320 330 340 350 360
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KE4 DPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPVNYDVFRYVITHLNRVSQQHKIN
:.: :. . ....:::: . :::.:..:.. . :..:...::.. ::..:....: :
CCDS54 IPVITYDTYSKFIDAAKISNADERLEAVHEVLMLLPPAHYETLRYLMIHLKKVTMNEKDN
370 380 390 400 410 420
1410 1420 1430 1440 1450 1460
pF1KE4 LMTADNLSICFWPTLMRPDFENR-EFLSTTKIHQSVVETFIQQCQFFFYNGEIVETTNIV
.:.:.::.: : :::::: .. : . .. .:. .:.. . .:
CCDS54 FMNAENLGIVFGPTLMRPPEDSTLTTLHDMRYQKLIVQILIENEDVLF
430 440 450 460
1470 1480 1490 1500
pF1KE4 APPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLGII
>>CCDS11498.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs108|chr17 (548 aa)
initn: 404 init1: 287 opt: 414 Z-score: 341.3 bits: 74.4 E(32554): 1.1e-12
Smith-Waterman score: 438; 25.9% identity (54.3% similar) in 540 aa overlap (969-1449:13-545)
940 950 960 970 980 990
pF1KE4 LEKKNMIENSYLSDNTRESTHQSEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPP-YSPIGD-
:: : ..::.: : : :::.:.
CCDS11 MQPGLSPGSPGDPRPPTPETDYPES--LTSYPEEDYSPVGSF
10 20 30 40
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE4 ----DVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYPIHSTPNCHDH-ERNHKVPPPIKPKPVVPKTNV
.. : :: : . . . : : : . . : : : .:. . ..
CCDS11 GEPGPTSPLTTPPGWSCHVSQDKQMLYTNHFTQEQWVRLEDPHGKPYFYNPEDSSVRWEL
50 60 70 80 90 100
1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE4 KKLDPNLLKTIEAGI--GKNPRKQTSRVPLAHPEDMDPSDNYAE--PIDTIFKQKGYSDE
.. ..:. . : .: :.: : ..: .. : : . . : :.
CCDS11 PQVPVPAPRSIHKSSQDGDTP-AQASPPEEKVPAELDEVGSWEEVSPATAAVRTKTL-DK
110 120 130 140 150
1110 1120 1130 1140 1150
pF1KE4 IYVV----PDDSQNRIKIRNSFVNNT--QGDEENGFSD-RTSKSHGERRPSKY-------
:. :. .:.. .. .. : .: . :.: .:: . : :.:::.
CCDS11 AGVLHRTKTADKGKRLRKKHWSASWTVLEGGVLTFFKDSKTSAAGGLRQPSKFSTPEYTV
160 170 180 190 200 210
1160 1170 1180 1190
pF1KE4 KYKSKTLF------SKAKSYYRRTHSDAS------DDEAFTTS--KTKRKGRHRGSEEDP
. .. :: :. :. . :.: :.::. .. :. .: .. : : :
CCDS11 ELRGATLSWAPKDKSSRKNVLELRSRDGSEYLIQHDSEAIISTWHKAIAQGIQELSAELP
220 230 240 250 260 270
1200 1210 1220 1230 1240
pF1KE4 LLSPVETWKGGID---NPAITSDQELDDKKMKKKTHK------VKED-KKQKKKTKNF--
: :. .. .: . . : :: .. . . .. : .: ..: ..:
CCDS11 ---PEESESSRVDFGSSERLGSWQEKEEDARPNAAAPALGPVGLESDLSKVRHKLRKFLQ
280 290 300 310 320 330
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KE4 -NPPTRRNWESNY-----FGMPLQDLVTAEKP-IPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSG
: . :..: :: : : :. .: ::..:.. .: :: .::::.::
CCDS11 RRPTLQSLREKGYIKDQVFGCALAALCERERSRVPRFVQQCIRAVEARGLDIDGLYRISG
340 350 360 370 380 390
1310 1320 1330 1340 1350
pF1KE4 NKTDQDNIQKQFDQDHNINLVSMEVT-VNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAK
: . .... . :.:. ..: . . :....:::: :: .::.::.:.: ... : :
CCDS11 NLATIQKLRYKVDHDERLDLDDGRWEDVHVITGALKLFFRELPEPLFPFSHFRQFIAAIK
400 410 420 430 440 450
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KE4 IPDKTERLHALKEIVKKFHPVNYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMR
. :...: . ....:... :.:..:... :: :: .. . : :......: : :::.:
CCDS11 LQDQARRSRCVRDLVRSLPAPNHDTLRMLFQHLCRVIEHGEQNRMSVQSVAIVFGPTLLR
460 470 480 490 500 510
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KE4 PDFENREFLSTTKIHQSVVETFIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPL
:. :. . : ....::: ..::: .:
CCDS11 PEVEETSMPMTMVFQNQVVELILQQCADIFPPH
520 530 540
>>CCDS74082.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs108|chr17 (889 aa)
initn: 404 init1: 287 opt: 414 Z-score: 338.4 bits: 74.5 E(32554): 1.6e-12
Smith-Waterman score: 438; 25.9% identity (54.3% similar) in 540 aa overlap (969-1449:354-886)
940 950 960 970 980 990
pF1KE4 LEKKNMIENSYLSDNTRESTHQSEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPP-YSPIGD-
:: : ..::.: : : :::.:.
CCDS74 GETAWEDEAENEPEEELEMQPGLSPGSPGDPRPPTPETDYPES--LTSYPEEDYSPVGSF
330 340 350 360 370 380
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE4 ----DVQLLPTPSDRSRYRLDLEGNEYPIHSTPNCHDH-ERNHKVPPPIKPKPVVPKTNV
.. : :: : . . . : : : . . : : : .:. . ..
CCDS74 GEPGPTSPLTTPPGWSCHVSQDKQMLYTNHFTQEQWVRLEDPHGKPYFYNPEDSSVRWEL
390 400 410 420 430 440
1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE4 KKLDPNLLKTIEAGI--GKNPRKQTSRVPLAHPEDMDPSDNYAE--PIDTIFKQKGYSDE
.. ..:. . : .: :.: : ..: .. : : . . : :.
CCDS74 PQVPVPAPRSIHKSSQDGDTP-AQASPPEEKVPAELDEVGSWEEVSPATAAVRTKTL-DK
450 460 470 480 490
1110 1120 1130 1140 1150
pF1KE4 IYVV----PDDSQNRIKIRNSFVNNT--QGDEENGFSD-RTSKSHGERRPSKY-------
:. :. .:.. .. .. : .: . :.: .:: . : :.:::.
CCDS74 AGVLHRTKTADKGKRLRKKHWSASWTVLEGGVLTFFKDSKTSAAGGLRQPSKFSTPEYTV
500 510 520 530 540 550
1160 1170 1180 1190
pF1KE4 KYKSKTLF------SKAKSYYRRTHSDAS------DDEAFTTS--KTKRKGRHRGSEEDP
. .. :: :. :. . :.: :.::. .. :. .: .. : : :
CCDS74 ELRGATLSWAPKDKSSRKNVLELRSRDGSEYLIQHDSEAIISTWHKAIAQGIQELSAELP
560 570 580 590 600 610
1200 1210 1220 1230 1240
pF1KE4 LLSPVETWKGGID---NPAITSDQELDDKKMKKKTHK------VKED-KKQKKKTKNF--
: :. .. .: . . : :: .. . . .. : .: ..: ..:
CCDS74 ---PEESESSRVDFGSSERLGSWQEKEEDARPNAAAPALGPVGLESDLSKVRHKLRKFLQ
620 630 640 650 660 670
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KE4 -NPPTRRNWESNY-----FGMPLQDLVTAEKP-IPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSG
: . :..: :: : : :. .: ::..:.. .: :: .::::.::
CCDS74 RRPTLQSLREKGYIKDQVFGCALAALCERERSRVPRFVQQCIRAVEARGLDIDGLYRISG
680 690 700 710 720 730
1310 1320 1330 1340 1350
pF1KE4 NKTDQDNIQKQFDQDHNINLVSMEVT-VNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAK
: . .... . :.:. ..: . . :....:::: :: .::.::.:.: ... : :
CCDS74 NLATIQKLRYKVDHDERLDLDDGRWEDVHVITGALKLFFRELPEPLFPFSHFRQFIAAIK
740 750 760 770 780 790
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KE4 IPDKTERLHALKEIVKKFHPVNYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMR
. :...: . ....:... :.:..:... :: :: .. . : :......: : :::.:
CCDS74 LQDQARRSRCVRDLVRSLPAPNHDTLRMLFQHLCRVIEHGEQNRMSVQSVAIVFGPTLLR
800 810 820 830 840 850
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KE4 PDFENREFLSTTKIHQSVVETFIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPL
:. :. . : ....::: ..::: .:
CCDS74 PEVEETSMPMTMVFQNQVVELILQQCADIFPPH
860 870 880
1502 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 09:11:35 2016 done: Sun Nov 6 09:11:36 2016
Total Scan time: 5.920 Total Display time: 0.490
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]