Result of FASTA (omim) for
pF1KE4271
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4271, 1137 aa
1>>>pF1KE4271 1137 - 1137 aa - 1137 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0227+/-0.000415; mu= 6.6084+/- 0.026
mean_var=184.4756+/-37.177, 0's: 0 Z-trim(117.4): 16 B-trim: 218 in 1/54
Lambda= 0.094429
statistics sampled from 29394 (29410) to 29394 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.647), E-opt: 0.2 (0.345), width: 16
Scan time: 14.510
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002430 (OMIM: 600887,608089,617100) DNA mismatc (1137) 7323 1010.7 0
NP_001245210 (OMIM: 120435,158320,276300,609309) D ( 868) 778 119.1 1.2e-25
XP_011531169 (OMIM: 120435,158320,276300,609309) P ( 924) 778 119.1 1.3e-25
NP_000242 (OMIM: 120435,158320,276300,609309) DNA ( 934) 778 119.1 1.3e-25
XP_005264389 (OMIM: 120435,158320,276300,609309) P ( 974) 778 119.1 1.3e-25
NP_002431 (OMIM: 602105) mutS protein homolog 4 [H ( 936) 611 96.3 9.2e-19
NP_001268423 (OMIM: 276300,600678,608089,614350) D (1058) 599 94.7 3.2e-18
NP_001268422 (OMIM: 276300,600678,608089,614350) D (1058) 599 94.7 3.2e-18
NP_001268421 (OMIM: 276300,600678,608089,614350) D (1230) 599 94.7 3.6e-18
XP_011531101 (OMIM: 276300,600678,608089,614350) P (1261) 599 94.7 3.7e-18
XP_011531100 (OMIM: 276300,600678,608089,614350) P (1299) 599 94.8 3.8e-18
NP_000170 (OMIM: 276300,600678,608089,614350) DNA (1360) 599 94.8 3.9e-18
NP_002432 (OMIM: 603382) mutS protein homolog 5 is ( 834) 587 93.0 8e-18
NP_751898 (OMIM: 603382) mutS protein homolog 5 is ( 834) 587 93.0 8e-18
NP_079535 (OMIM: 603382) mutS protein homolog 5 is ( 822) 575 91.4 2.5e-17
NP_751897 (OMIM: 603382) mutS protein homolog 5 is ( 835) 575 91.4 2.5e-17
>>NP_002430 (OMIM: 600887,608089,617100) DNA mismatch re (1137 aa)
initn: 7323 init1: 7323 opt: 7323 Z-score: 5398.3 bits: 1010.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7323; 99.7% identity (100.0% similar) in 1137 aa overlap (1-1137:1-1137)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSRRKPASGGLAASSSAPARQAVLSRFFQSTGSLKSTSSSTGAADQVDPGAAAAAAAAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MSRRKPASGGLAASSSAPARQAVLSRFFQSTGSLKSTSSSTGAADQVDPGAAAAAAAAAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 AAPPAPPAPAFPPQLPPHVATEIDRRKKRPLENDGPVKKKVKKVQQKEGGSDLGMSGNSE
::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 AAPPAPPAPAFPPQLPPHIATEIDRRKKRPLENDGPVKKKVKKVQQKEGGSDLGMSGNSE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 PKKCLRTRNVSKSLEKLKEFCCDSALPQSRVQTESLQERFAVLPKCTDFDDISLLHAKNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PKKCLRTRNVSKSLEKLKEFCCDSALPQSRVQTESLQERFAVLPKCTDFDDISLLHAKNA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 VSSEDSKRQINQKDTTLFDLSQFGSSNTSHENLQKTASKSANKRSKSIYTPLELQYIEMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VSSEDSKRQINQKDTTLFDLSQFGSSNTSHENLQKTASKSANKRSKSIYTPLELQYIEMK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 QQHKDAVLCVECGYKYRFFGEDAEIAARELNIYCHLDHNFMTASIPTHRLFVHVRRLVAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 QQHKDAVLCVECGYKYRFFGEDAEIAARELNIYCHLDHNFMTASIPTHRLFVHVRRLVAK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 GYKVGVVKQTETAALKAIGDNRSSLFSRKLTALYTKSTLIGEDVNPLIKLDDAVNVDEIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GYKVGVVKQTETAALKAIGDNRSSLFSRKLTALYTKSTLIGEDVNPLIKLDDAVNVDEIM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 TDTSTSYLLCISENKENVRDKKKGNIFIGIVGVQPATGEVVFDSFQDSASRSELETRMSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TDTSTSYLLCISENKENVRDKKKGNIFIGIVGVQPATGEVVFDSFQDSASRSELETRMSS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 LQPVELLLPSALSEQTEALIHRATSVSVQDDRIRVERMDNIYFEYSHAFQAVTEFYAKDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LQPVELLLPSALSEQTEALIHRATSVSVQDDRIRVERMDNIYFEYSHAFQAVTEFYAKDT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 VDIKGSQIISGIVNLEKPVICSLAAIIKYLKEFNLEKMLSKPENFKQLSSKMEFMTINGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VDIKGSQIISGIVNLEKPVICSLAAIIKYLKEFNLEKMLSKPENFKQLSSKMEFMTINGT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 TLRNLEILQNQTDMKTKGSLLWVLDHTKTSFGRRKLKKWVTQPLLKLREINARLDAVSEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TLRNLEILQNQTDMKTKGSLLWVLDHTKTSFGRRKLKKWVTQPLLKLREINARLDAVSEV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 LHSESSVFGQIENHLRKLPDIERGLCSIYHKKCSTQEFFLIVKTLYHLKSEFQAIIPAVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LHSESSVFGQIENHLRKLPDIERGLCSIYHKKCSTQEFFLIVKTLYHLKSEFQAIIPAVN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 SHIQSDLLRTVILEIPELLSPVEHYLKILNEQAAKVGDKTELFKDLSDFPLIKKRKDEIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SHIQSDLLRTVILEIPELLSPVEHYLKILNEQAAKVGDKTELFKDLSDFPLIKKRKDEIQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 GVIDEIRMHLQEIRKILKNPSAQYVTVSGQEFMIEIKNSAVSCIPTDWVKVGSTKAVSRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GVIDEIRMHLQEIRKILKNPSAQYVTVSGQEFMIEIKNSAVSCIPTDWVKVGSTKAVSRF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 HSPFIVENYRHLNQLREQLVLDCSAEWLDFLEKFSEHYHSLCKAVHHLATVDCIFSLAKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 HSPFIVENYRHLNQLREQLVLDCSAEWLDFLEKFSEHYHSLCKAVHHLATVDCIFSLAKV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 AKQGDYCRPTVQEERKIVIKNGRHPVIDVLLGEQDQYVPNNTDLSEDSERVMIITGPNMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 AKQGDYCRPTVQEERKIVIKNGRHPVIDVLLGEQDQYVPNNTDLSEDSERVMIITGPNMG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE4 GKSSYIKQVALITIMAQIGSYVPAEEATIGIVDGIFTRMGAADNIYKGRSTFMEELTDTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
NP_002 GKSSYIKQVALITIMAQIGSYVPAEEATIGIVDGIFTRMGAADNIYKGQSTFMEELTDTA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE4 EIIRKATSQSLVILDELGRGTSTHDGIAIAYATLEYFIRDVKSLTLFVTHYPPVCELEKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 EIIRKATSQSLVILDELGRGTSTHDGIAIAYATLEYFIRDVKSLTLFVTHYPPVCELEKN
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE4 YSHQVGNYHMGFLVSEDESKLDPGTAEQVPDFVTFLYQITRGIAARSYGLNVAKLADVPG
::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 YSHQVGNYHMGFLVSEDESKLDPGAAEQVPDFVTFLYQITRGIAARSYGLNVAKLADVPG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE4 EILKKAAHKSKELEGLINTKRKRLKYFAKLWTMHNAQDLQKWTEEFNMEETQTSLLH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 EILKKAAHKSKELEGLINTKRKRLKYFAKLWTMHNAQDLQKWTEEFNMEETQTSLLH
1090 1100 1110 1120 1130
>>NP_001245210 (OMIM: 120435,158320,276300,609309) DNA m (868 aa)
initn: 711 init1: 476 opt: 778 Z-score: 581.3 bits: 119.1 E(85289): 1.2e-25
Smith-Waterman score: 871; 28.0% identity (61.0% similar) in 735 aa overlap (388-1094:95-786)
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 EIMTDTSTSYLLCISENKENVRDKKKGNIFIGIVGVQPATGEVVFDSFQDSASRSELETR
.:. :. .. . : :. . :.::.
NP_001 FEDILFGNNDMSASIGVVGVKMSAVDGQRQVGVGYVDSIQRKLGLCEFPDNDQFSNLEAL
70 80 90 100 110 120
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 MSSLQPVELLLPSALSEQTEALIHRATSVSVQDDRIRVERMDNIYFEYSHAFQAVTEFYA
. .. : : .::.. .: . . . .. .: : . . . : . .: ....
NP_001 LIQIGPKECVLPGG---ETAGDMGKLRQI-IQRGGILITERKKADFSTKDIYQDLNRLLK
130 140 150 160 170 180
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 KDTVDIKGSQIISGIV-NLEKPV-ICSLAAIIKYLKEFNLEKMLSKPENFKQLSSKM---
:: :. :... ..:. : . ::.:.::.:. .:: :: :.
NP_001 GK----KGEQMNSAVLPEMENQVAVSSLSAVIKFLE------LLSDDSNFGQFELTTFDF
190 200 210 220 230
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 -EFMTINGTTLRNLEILQNQT-DMKTKGSLLWVLDHTKTSFGRRKLKKWVTQPLLKLREI
..: .. ...: :...:... : . :: .:.. :: :.: ...:. :::. .:
NP_001 SQYMKLDIAAVRALNLFQGSVEDTTGSQSLAALLNKCKTPQGQRLVNQWIKQPLMDKNRI
240 250 260 270 280 290
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 NARLDAVSEVLHSESSVFGQIENHLRKLPDIERGLCSIYHKKCSTQEFFLIVKTLYHLKS
. ::. : ... :. ::..::..: .. .. . :. . . . . .: .
NP_001 EERLNLVEAFVEDAELRQTLQEDLLRRFPDLNRLAKKFQRQAANLQDCYRLYQGINQLPN
300 310 320 330 340 350
660 670 680 690 700
pF1KE4 EFQAIIPAVNSHIQSDLLRTVILEIPELLSPVEHYLKILNE--QAAKVGDKTELFK----
.::. ..: :. :: . . . .: : .. .... . .: .. : :
NP_001 VIQALEKHEGKH-QKLLLAVFVTPLTDLRSDFSKFQEMIETTLDMDQVENHEFLVKPSFD
360 370 380 390 400
710 720 730 740 750
pF1KE4 -DLSDF-PLIKKRKDEIQG-VIDEIR-MHLQEIRKILKNPSAQY-----VTVSGQEFMIE
.::.. ... . ..:. .:. : . :. ..: . :::. :: . .. . .
NP_001 PNLSELREIMNDLEKKMQSTLISAARDLGLDPGKQIKLDSSAQFGYYFRVTCKEEKVLRN
410 420 430 440 450 460
760 770 780 790 800 810
pF1KE4 IKNSAVSCIPTDWVKVGSTKAVSRFHSPFIVENYRHLNQLREQLVLDCSAEWLDFLEKFS
:: .. : . :: ..: .: .. . ..: . .. .. .: : ... .
NP_001 NKNFSTVDIQKNGVKFTNSKLTS-LNEEY-TKNKTEYEEAQDAIV----KEIVNISSGYV
470 480 490 500 510 520
820 830 840 850 860 870
pF1KE4 EHYHSLCKAVHHLATVDCIFSLAKVAKQGD--YCRPTVQE--ERKIVIKNGRHPVIDVLL
: ...: . :: .: . :.:.:.. . : ::.. : . .:..: .:: ..:
NP_001 EPMQTLNDV---LAQLDAVVSFAHVSNGAPVPYVRPAILEKGQGRIILKASRHACVEV--
530 540 550 560 570
880 890 900 910 920
pF1KE4 GEQDQ--YVPNNTDLSEDSERVMIITGPNMGGKSSYIKQVALITIMAQIGSYVPAEEATI
::. ..::.. . .:.. :::::::::::.::.:...:..::::: .:: : : .
NP_001 --QDEIAFIPNDVYFEKDKQMFHIITGPNMGGKSTYIRQTGVIVLMAQIGCFVPCESAEV
580 590 600 610 620 630
930 940 950 960 970 980
pF1KE4 GIVDGIFTRMGAADNIYKGRSTFMEELTDTAEIIRKATSQSLVILDELGRGTSTHDGIAI
.::: :..:.::.:. :: :::: :. .:: :.:.::..::.:.:::::::::.::...
NP_001 SIVDCILARVGAGDSQLKGVSTFMAEMLETASILRSATKDSLIIIDELGRGTSTYDGFGL
640 650 660 670 680 690
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE4 AYATLEYFIRDVKSLTLFVTHYPPVCELEKNYSHQVGNYHMGFLVSEDESKLDPGTAEQV
:.: ::. . .. .:.::. . : : :.: :. :..:.
NP_001 AWAISEYIATKIGAFCMFATHFHELTALA-NQIPTVNNLHVTALTTEET-----------
700 710 720 730 740
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE4 PDFVTFLYQITRGIAARSYGLNVAKLADVPGEILKKAAHKSKELEGLINTKRKRLKYFAK
.:.:::. .:. .:.:..::.::. : .... : .:. :::
NP_001 ---LTMLYQVKKGVCDQSFGIHVAELANFPKHVIECAKQKALELEEFQYIGESQGYDIME
750 760 770 780 790 800
1110 1120 1130
pF1KE4 LWTMHNAQDLQKWTEEFNMEETQTSLLH
NP_001 PAAKKCYLEREQGEKIIQEFLSKVKQMPFTEMSEENITIKLKQLKAEVIAKNNSFVNEII
810 820 830 840 850 860
>>XP_011531169 (OMIM: 120435,158320,276300,609309) PREDI (924 aa)
initn: 747 init1: 476 opt: 778 Z-score: 580.9 bits: 119.1 E(85289): 1.3e-25
Smith-Waterman score: 871; 28.0% identity (61.0% similar) in 735 aa overlap (388-1094:161-852)
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 EIMTDTSTSYLLCISENKENVRDKKKGNIFIGIVGVQPATGEVVFDSFQDSASRSELETR
.:. :. .. . : :. . :.::.
XP_011 FEDILFGNNDMSASIGVVGVKMSAVDGQRQVGVGYVDSIQRKLGLCEFPDNDQFSNLEAL
140 150 160 170 180 190
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 MSSLQPVELLLPSALSEQTEALIHRATSVSVQDDRIRVERMDNIYFEYSHAFQAVTEFYA
. .. : : .::.. .: . . . .. .: : . . . : . .: ....
XP_011 LIQIGPKECVLPGG---ETAGDMGKLRQI-IQRGGILITERKKADFSTKDIYQDLNRLLK
200 210 220 230 240
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 KDTVDIKGSQIISGIV-NLEKPV-ICSLAAIIKYLKEFNLEKMLSKPENFKQLSSKM---
:: :. :... ..:. : . ::.:.::.:. .:: :: :.
XP_011 GK----KGEQMNSAVLPEMENQVAVSSLSAVIKFLE------LLSDDSNFGQFELTTFDF
250 260 270 280 290
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 -EFMTINGTTLRNLEILQNQT-DMKTKGSLLWVLDHTKTSFGRRKLKKWVTQPLLKLREI
..: .. ...: :...:... : . :: .:.. :: :.: ...:. :::. .:
XP_011 SQYMKLDIAAVRALNLFQGSVEDTTGSQSLAALLNKCKTPQGQRLVNQWIKQPLMDKNRI
300 310 320 330 340 350
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 NARLDAVSEVLHSESSVFGQIENHLRKLPDIERGLCSIYHKKCSTQEFFLIVKTLYHLKS
. ::. : ... :. ::..::..: .. .. . :. . . . . .: .
XP_011 EERLNLVEAFVEDAELRQTLQEDLLRRFPDLNRLAKKFQRQAANLQDCYRLYQGINQLPN
360 370 380 390 400 410
660 670 680 690 700
pF1KE4 EFQAIIPAVNSHIQSDLLRTVILEIPELLSPVEHYLKILNE--QAAKVGDKTELFK----
.::. ..: :. :: . . . .: : .. .... . .: .. : :
XP_011 VIQALEKHEGKH-QKLLLAVFVTPLTDLRSDFSKFQEMIETTLDMDQVENHEFLVKPSFD
420 430 440 450 460 470
710 720 730 740 750
pF1KE4 -DLSDF-PLIKKRKDEIQG-VIDEIR-MHLQEIRKILKNPSAQY-----VTVSGQEFMIE
.::.. ... . ..:. .:. : . :. ..: . :::. :: . .. . .
XP_011 PNLSELREIMNDLEKKMQSTLISAARDLGLDPGKQIKLDSSAQFGYYFRVTCKEEKVLRN
480 490 500 510 520 530
760 770 780 790 800 810
pF1KE4 IKNSAVSCIPTDWVKVGSTKAVSRFHSPFIVENYRHLNQLREQLVLDCSAEWLDFLEKFS
:: .. : . :: ..: .: .. . ..: . .. .. .: : ... .
XP_011 NKNFSTVDIQKNGVKFTNSKLTS-LNEEY-TKNKTEYEEAQDAIV----KEIVNISSGYV
540 550 560 570 580
820 830 840 850 860 870
pF1KE4 EHYHSLCKAVHHLATVDCIFSLAKVAKQGD--YCRPTVQE--ERKIVIKNGRHPVIDVLL
: ...: . :: .: . :.:.:.. . : ::.. : . .:..: .:: ..:
XP_011 EPMQTLNDV---LAQLDAVVSFAHVSNGAPVPYVRPAILEKGQGRIILKASRHACVEV--
590 600 610 620 630 640
880 890 900 910 920
pF1KE4 GEQDQ--YVPNNTDLSEDSERVMIITGPNMGGKSSYIKQVALITIMAQIGSYVPAEEATI
::. ..::.. . .:.. :::::::::::.::.:...:..::::: .:: : : .
XP_011 --QDEIAFIPNDVYFEKDKQMFHIITGPNMGGKSTYIRQTGVIVLMAQIGCFVPCESAEV
650 660 670 680 690 700
930 940 950 960 970 980
pF1KE4 GIVDGIFTRMGAADNIYKGRSTFMEELTDTAEIIRKATSQSLVILDELGRGTSTHDGIAI
.::: :..:.::.:. :: :::: :. .:: :.:.::..::.:.:::::::::.::...
XP_011 SIVDCILARVGAGDSQLKGVSTFMAEMLETASILRSATKDSLIIIDELGRGTSTYDGFGL
710 720 730 740 750 760
990 1000 1010 1020 1030 1040
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.:.:::. .:. .:.:..::.::. : .... : .:. :::
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pF1KE4 GEDAEIAARELNIYCHLDHNFMTASIPTHRLFVHVRRLVAKGYKVGVVKQTETAALKAIG
:: :.. ::.. . :. ...: . . :: :::::. :.:::: .
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. : ::.. . . .. ... .: : .. .: : ... ..::: ..:..:.
NP_001 EARC----RKMAHISKYDRVVRREICRIITKGTQTYSVLEGDPSENYSKYLLSLKEKEED
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pF1KE4 VRDKKKGNIFIGIVGVQPATGEVVFDSFQDSASRSELETRMSSLQPVELLLPSA-LSEQT
. .. :. :. . :. . .:.:. :...: .. ::..:. .. ::..:
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..... . : :.:. : . ... :...... : : : : . . :...:
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... .. :.....:: ::::. : :. .:.:.:: .: .: ::.: ::.:. :
NP_001 SGAIFTKAYQRMVLDAVTLNNLEIFLNGTNGSTEGTLLERVDTCHTPFGKRLLKQWLCAP
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pF1KE4 LLKLREINARLDAVSEVLHSESSVFGQIENHLRKLPDIERGLCSIYH--KKCSTQEF---
: . :: ::::. ... ... ... . :.::::.:: : .:.. . ..:.
NP_001 LCNHYAINDRLDAIEDLMVVPDKI-SEVVELLKKLPDLERLLSKIHNVGSPLKSQNHPDS
480 490 500 510 520 530
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pF1KE4 --FLIVKTLYHLKS--EFQA-------------IIPAVNSHIQSDLLRTVI-LE------
.. .: : :. .: . :. : . ..: .:. :: :.
NP_001 RAIMYEETTYSKKKIIDFLSALEGFKVMCKIIGIMEEVADGFKSKILKQVISLQTKNPEG
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pF1KE4 -IPELLSPVEHYLKILN-EQAAKVGDKTEL--FKDLSDFPLIKKRKDEIQGVIDEIRMHL
.:.: .... .. :.: :.: : : . : : :..: :.... .:
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.. :. . . : .. .....:: .: .. .: .. .. :. .:. . : ..
NP_001 EKQRNRIGCRTIVYWGIGRNRYQLEIPENFTTRNLPEEYELKSTKKGCKRYWTKTIEKKL
660 670 680 690 700 710
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.: .. :. . :: . .. .:...:.. .::. .:..: .. ::. .. ::
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.:::.. :. . .:..::: : ...: :...::. .. . :. .
NP_001 PMCRPVILLPEDTPPFLELKGSRHPCITKTFFG--DDFIPNDILIGCEEEEQENGKAYCV
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..:::::::::. ..:..:...:::.: ::::: . .: .:::.::.: :..:.:::
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pF1KE4 MEELTDTAEIIRKATSQSLVILDELGRGTSTHDGIAIAYATLEYFIRDVKSLTLFVTHYP
. ::..:: :. .::..:::..:::::::.: :: ::: :... . . .: ::: :::
NP_001 FVELSETASILMHATAHSLVLVDELGRGTATFDGTAIANAVVKELAETIKCRTLFSTHYH
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. : .: . ..: ::. .: :.: . ::. . .::::.. .: .:::.:
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.:.::..: :...:. .:..:.: . .. :
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:: .. ..:.:. : :.: . : :...
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:: :.. ::.. . :. ...: . . :: :::::. :.:::: .
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. : ::.. . . .. ... .: : .. .: : ... ..::: ..:..:.
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. .. :. :. . :. . .:.:. :...: .. ::..:. .. ::..:
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..... . : :.:. : . ... :...... : : : : . . :...:
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. ..: :: .. .:.. . :::. ... : . ::..
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... .. :.....:: ::::. : :. .:.:.:: .: .: ::.: ::.:. :
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pF1KE4 --FLIVKTLYHLKS--EFQA-------------IIPAVNSHIQSDLLRTVI-LE------
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NP_001 RAIMYEETTYSKKKIIDFLSALEGFKVMCKIIGIMEEVADGFKSKILKQVISLQTKNPEG
540 550 560 570 580 590
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pF1KE4 -IPELLSPVEHYLKILN-EQAAKVGDKTEL--FKDLSDFPLIKKRKDEIQGVIDEIRMHL
.:.: .... .. :.: :.: : : . : : :..: :.... .:
NP_001 RFPDLTVELNRWDTAFDHEKARKTGLITPKAGFDSDYDQALADIRENE-QSLLE----YL
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pF1KE4 QEIRKILKNPSAQYVTVSGQEFMIEI-KNSAVSCIPTDWVKVGSTKAVSRFHSPFIVENY
.. :. . . : .. .....:: .: .. .: .. .. :. .:. . : ..
NP_001 EKQRNRIGCRTIVYWGIGRNRYQLEIPENFTTRNLPEEYELKSTKKGCKRYWTKTIEKKL
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pF1KE4 RHL---NQLREQLVLDCSAEWLDFLEKFSEHYHSLCKAVHHLATVDCIFSLAKVAKQGD-
.: .. :. . :: . .. .:...:.. .::. .:..: .. ::. .. ::
NP_001 ANLINAEERRDVSLKDCMRR---LFYNFDKNYKDWQSAVECIAVLDVLLCLANYSRGGDG
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.:::.. :. . .:..::: : ...: :...::. .. . :. .
NP_001 PMCRPVILLPEDTPPFLELKGSRHPCITKTFFG--DDFIPNDILIGCEEEEQENGKAYCV
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pF1KE4 IITGPNMGGKSSYIKQVALITIMAQIGSYVPAEEATIGIVDGIFTRMGAADNIYKGRSTF
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NP_001 LVTGPNMGGKSTLMRQAGLLAVMAQMGCYVPAEVCRLTPIDRVFTRLGASDRIMSGESTF
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pF1KE4 MEELTDTAEIIRKATSQSLVILDELGRGTSTHDGIAIAYATLEYFIRDVKSLTLFVTHYP
. ::..:: :. .::..:::..:::::::.: :: ::: :... . . .: ::: :::
NP_001 FVELSETASILMHATAHSLVLVDELGRGTATFDGTAIANAVVKELAETIKCRTLFSTHYH
890 900 910 920 930 940
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pF1KE4 PVCE-LEKNYSHQVGNYHMGFLVSEDESKLDPGTAEQVPDFVTFLYQITRGIAARSYGLN
. : .: . ..: ::. .: :.: . ::. . .::::.. .: .:::.:
NP_001 SLVEDYSQNVAVRLG--HMACMV-ENECE-DPSQ-----ETITFLYKFIKGACPKSYGFN
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pF1KE4 VAKLADVPGEILKKAAHKSKELEGLINTKRKRLKYFAKLWTMHNAQDLQKWTEEFNMEET
.:.::..: :...:. .:..:.: . .. :
NP_001 AARLANLPEEVIQKGHRKAREFEKMNQSLRLFREVCLASERSTVDAEAVHKLLTLIKEL
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:: .:: : : : :. . . .::. . :.. :. :.. .
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170 180 190 200 210
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. . . : .:. . ...::.: :: :.. . .: ... ..
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. .: :: .. ..:.:. : :.: . : :... :: :.. ::.. . :
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. ...: . . :: :::::. :.:::: . . : ::.. . . .
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. ... .: : .. .: : ... ..::: ..:..:. . .. :. :. .
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:. . .:.:. :...: .. ::..:. .. ::..:..... . : :.:. :
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. ... :...... : : : : . . :...:. ..: :: ..
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pF1KE4 CSLAAIIKYLKEFNLEKMLSKPENFKQ-----------------LSSKMEFMTINGTTLR
.:.. . :::. ... : . ::.. ... .. :.....::
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pF1KE4 NLEILQNQTDMKTKGSLLWVLDHTKTSFGRRKLKKWVTQPLLKLREINARLDAVSEVLHS
::::. : :. .:.:.:: .: .: ::.: ::.:. :: . :: ::::. ...
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... ... . :.::::.:: : .:.. . ..:. .. .: : :. .: .
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pF1KE4 -------------IIPAVNSHIQSDLLRTVIL--------EIPELLSPVEHYLKILN-EQ
:. : . ..: .:. :: ..:.: .... .. :.
NP_001 ALEGFKVMCKIIGIMEEVADGFKSKILKQVISLQTKNPEGRFPDLTVELNRWDTAFDHEK
740 750 760 770 780 790
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pF1KE4 AAKVGDKTEL--FKDLSDFPLIKKRKDEIQGVIDEIRMHLQEIRKILKNPSAQYVTVSGQ
: :.: : : . : : :..: :.... .:.. :. . . : .. .
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pF1KE4 EFMIEI-KNSAVSCIPTDWVKVGSTKAVSRFHSPFIVENYRHL---NQLREQLVLDCSAE
....:: .: .. .: .. .. :. .:. . : .. .: .. :. . :: .
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pF1KE4 WLDFLEKFSEHYHSLCKAVHHLATVDCIFSLAKVAKQGD--YCRPTV--QEERK--IVIK
.. .:...:.. .::. .:..: .. ::. .. :: .:::.. :. . .:
NP_001 ---LFYNFDKNYKDWQSAVECIAVLDVLLCLANYSRGGDGPMCRPVILLPEDTPPFLELK
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pF1KE4 NGRHPVID-VLLGEQDQYVPNNTDLSEDSER-------VMIITGPNMGGKSSYIKQVALI
..::: : ...: :...::. .. . :. ...:::::::::. ..:..:.
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pF1KE4 TIMAQIGSYVPAEEATIGIVDGIFTRMGAADNIYKGRSTFMEELTDTAEIIRKATSQSLV
..:::.: ::::: . .: .:::.::.: :..:.:::. ::..:: :. .::..:::
NP_001 AVMAQMGCYVPAEVCRLTPIDRVFTRLGASDRIMSGESTFFVELSETASILMHATAHSLV
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pF1KE4 ILDELGRGTSTHDGIAIAYATLEYFIRDVKSLTLFVTHYPPVCELEKNYSHQVGNY--HM
..:::::::.: :: ::: :... . . .: ::: ::: . : .::..:. ::
NP_001 LVDELGRGTATFDGTAIANAVVKELAETIKCRTLFSTHYHSLVE---DYSQNVAVRLGHM
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pF1KE4 GFLVSEDESKLDPGTAEQVPDFVTFLYQITRGIAARSYGLNVAKLADVPGEILKKAAHKS
. .: :.: . ::. . .::::.. .: .:::.:.:.::..: :...:. .:.
NP_001 ACMV-ENECE-DPSQ-----ETITFLYKFIKGACPKSYGFNAARLANLPEEVIQKGHRKA
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pF1KE4 KELEGLINTKRKRLKYFAKLWTMHNAQDLQKWTEEFNMEETQTSLLH
.:.: . .. :
NP_001 REFEKMNQSLRLFREVCLASERSTVDAEAVHKLLTLIKEL
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pF1KE4 AAAAAAAAPPAPPAPAFPPQLPPHVATEIDRRKKRPLEND-GPVKKKVKKVQQKEGGSDL
:: :.: : . : ..::.::
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pF1KE4 GMSG--NSE------PKKCLRTRN-VSKSLEKLKEFCCDSALPQSRVQTESLQERFAVLP
:: .:: : : : :. . . .::. . :.. :. :.. .
XP_011 ISSGVGDSESEGLNSPVKVARKRKRMVTGNGSLKRKSSRKETPSATKQATSISSETKNTL
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170 180 190 200 210
pF1KE4 KCTDFDDISLLHAKNAVSSEDSKRQINQKDTTLFDLSQFGSSNT-----SHENLQKTASK
. . . : .:. . ...::.: :: :.. . .: ... ..
XP_011 RAFSAPQNSESQAHVSGGGDDSSRPTVWYHETLEWLKEEKRRDEHRRRPDHPDFDASTLY
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pF1KE4 SANKRSKSIYTPLELQYIEMKQQHKDAVLCVECGYKYRFFGEDAEIAARELNIYCHLDHN
. .: :: .. ..:.:. : :.: . : :... :: :.. ::.. . :
XP_011 VPEDFLNSC-TPGMRKWWQIKSQNFDLVICYKVGKFYELYHMDALIGVSELGLV-FMKGN
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pF1KE4 FMTASIPTHRLFVHVRRLVAKGYKVGVVKQTETAALKAIGDNRSSLFSRKLTALYTKSTL
. ...: . . :: :::::. :.:::: . . : ::.. . . .
XP_011 WAHSGFPEIAFGRYSDSLVQKGYKVARVEQTETPEMM---EAR----CRKMAHISKYDRV
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pF1KE4 IGEDVNPLI-KLDDAVNVDEI-MTDTSTSYLLCISENKENVRDKKKGNIFIGIVGVQPAT
. ... .: : .. .: : ... ..::: ..:..:. . .. :. :. .
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