Result of FASTA (ccds) for
pF1KE3561
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3561, 926 aa
1>>>pF1KE3561 926 - 926 aa - 926 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5510+/-0.00144; mu= 20.6287+/- 0.086
mean_var=87.2908+/-17.479, 0's: 0 Z-trim(100.4): 51 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.137275
statistics sampled from 6076 (6115) to 6076 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.511), E-opt: 0.2 (0.188), width: 16
Scan time: 2.720
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5112.1 GPRC6A gene_id:222545|Hs108|chr6 ( 926) 6163 1231.9 0
CCDS69185.1 GPRC6A gene_id:222545|Hs108|chr6 ( 751) 3233 651.6 1.6e-186
CCDS69184.1 GPRC6A gene_id:222545|Hs108|chr6 ( 855) 2932 592.0 1.6e-168
CCDS3010.1 CASR gene_id:846|Hs108|chr3 (1078) 737 157.4 1.4e-37
CCDS54632.1 CASR gene_id:846|Hs108|chr3 (1088) 737 157.4 1.4e-37
CCDS82.1 TAS1R1 gene_id:80835|Hs108|chr1 ( 587) 727 155.2 3.4e-37
CCDS30556.1 TAS1R3 gene_id:83756|Hs108|chr1 ( 852) 721 154.1 1e-36
CCDS81.1 TAS1R1 gene_id:80835|Hs108|chr1 ( 841) 632 136.5 2.1e-31
CCDS187.1 TAS1R2 gene_id:80834|Hs108|chr1 ( 839) 594 129.0 3.8e-29
CCDS43042.1 GRM7 gene_id:2917|Hs108|chr3 ( 915) 574 125.0 6.3e-28
CCDS5600.1 GRM3 gene_id:2913|Hs108|chr7 ( 879) 547 119.7 2.5e-26
CCDS2834.1 GRM2 gene_id:2912|Hs108|chr3 ( 872) 506 111.6 6.9e-24
CCDS8283.1 GRM5 gene_id:2915|Hs108|chr11 (1180) 493 109.1 5.2e-23
CCDS44694.1 GRM5 gene_id:2915|Hs108|chr11 (1212) 493 109.1 5.3e-23
CCDS47696.1 GRM8 gene_id:2918|Hs108|chr7 ( 908) 487 107.8 9.7e-23
CCDS5794.1 GRM8 gene_id:2918|Hs108|chr7 ( 908) 487 107.8 9.7e-23
CCDS4787.1 GRM4 gene_id:2914|Hs108|chr6 ( 912) 455 101.5 7.9e-21
CCDS75432.1 GRM4 gene_id:2914|Hs108|chr6 ( 865) 394 89.4 3.3e-17
CCDS47497.1 GRM1 gene_id:2911|Hs108|chr6 ( 906) 373 85.2 6e-16
CCDS64548.1 GRM1 gene_id:2911|Hs108|chr6 ( 908) 373 85.2 6.1e-16
CCDS5209.1 GRM1 gene_id:2911|Hs108|chr6 (1194) 373 85.3 7.5e-16
CCDS4442.1 GRM6 gene_id:2916|Hs108|chr5 ( 877) 361 82.8 3.1e-15
CCDS59010.1 GRM4 gene_id:2914|Hs108|chr6 ( 779) 307 72.1 4.6e-12
CCDS59011.1 GRM4 gene_id:2914|Hs108|chr6 ( 743) 303 71.3 7.7e-12
>>CCDS5112.1 GPRC6A gene_id:222545|Hs108|chr6 (926 aa)
initn: 6163 init1: 6163 opt: 6163 Z-score: 6596.8 bits: 1231.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6163; 99.9% identity (99.9% similar) in 926 aa overlap (1-926:1-926)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MAFLIILITCFVIILATSQPCQTPDDFVAATSPGHIIIGGLFAIHEKMLSSEDSPRRPQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 MAFLIILITCFVIILATSQPCQTPDDFVAATSPGHIIIGGLFAIHEKMLSSEDSPRRPQI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 QECVGFEISVFLQTLAMIHSIEMINNSTLLSGVKLGYEIYDTCTEVTVAMAATLRFLSKF
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 QECVGFEISVFLQTLAMIHSIEMINNSTLLPGVKLGYEIYDTCTEVTVAMAATLRFLSKF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 NCSRETVEFKCDYSSYMPRVKAVIGSGYSEITMAVSRMLNLQLMPQVGYESTAEILSDKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 NCSRETVEFKCDYSSYMPRVKAVIGSGYSEITMAVSRMLNLQLMPQVGYESTAEILSDKI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 RFPSFLRTVPSDFHQIKAMAHLIQKSGWNWIGIITTDDDYGRLALNTFIIQAEANNVCIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 RFPSFLRTVPSDFHQIKAMAHLIQKSGWNWIGIITTDDDYGRLALNTFIIQAEANNVCIA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 FKEVLPAFLSDNTIEVRINRTLKKIILEAQVNVIVVFLRQFHVFDLFNKAIEMNINKMWI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 FKEVLPAFLSDNTIEVRINRTLKKIILEAQVNVIVVFLRQFHVFDLFNKAIEMNINKMWI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 ASDNWSTATKITTIPNVKKIGKVVGFAFRRGNISSFHSFLQNLHLLPSDSHKLLHEYAMH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 ASDNWSTATKITTIPNVKKIGKVVGFAFRRGNISSFHSFLQNLHLLPSDSHKLLHEYAMH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 LSACAYVKDTDLSQCIFNHSQRTLAYKANKAIERNFVMRNDFLWDYAEPGLIHSIQLAVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 LSACAYVKDTDLSQCIFNHSQRTLAYKANKAIERNFVMRNDFLWDYAEPGLIHSIQLAVF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 ALGYAIRDLCQARDCQNPNAFQPWELLGVLKNVTFTDGWNSFHFDAHGDLNTGYDVVLWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 ALGYAIRDLCQARDCQNPNAFQPWELLGVLKNVTFTDGWNSFHFDAHGDLNTGYDVVLWK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 EINGHMTVTKMAEYDLQNDVFIIPDQETKNEFRNLKQIQSKCSKECSPGQMKKTTRSQHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 EINGHMTVTKMAEYDLQNDVFIIPDQETKNEFRNLKQIQSKCSKECSPGQMKKTTRSQHI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 CCYECQNCPENHYTNQTDMPHCLLCNNKTHWAPVRSTMCFEKEVEYLNWNDSLAILLLIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 CCYECQNCPENHYTNQTDMPHCLLCNNKTHWAPVRSTMCFEKEVEYLNWNDSLAILLLIL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 SLLGIIFVLVVGIIFTRNLNTPVVKSSGGLRVCYVILLCHFLNFASTSFFIGEPQDFTCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 SLLGIIFVLVVGIIFTRNLNTPVVKSSGGLRVCYVILLCHFLNFASTSFFIGEPQDFTCK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 TRQTMFGVSFTLCISCILTKSLKILLAFSFDPKLQKFLKCLYRPILIIFTCTGIQVVICT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 TRQTMFGVSFTLCISCILTKSLKILLAFSFDPKLQKFLKCLYRPILIIFTCTGIQVVICT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 LWLIFAAPTVEVNVSLPRVIILECEEGSILAFGTMLGYIAILAFICFIFAFKGKYENYNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 LWLIFAAPTVEVNVSLPRVIILECEEGSILAFGTMLGYIAILAFICFIFAFKGKYENYNE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 AKFITFGMLIYFIAWITFIPIYATTFGKYVPAVEIIVILISNYGILYCTFIPKCYVIICK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 AKFITFGMLIYFIAWITFIPIYATTFGKYVPAVEIIVILISNYGILYCTFIPKCYVIICK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 QEINTKSAFLKMIYSYSSHSVSSIALSPASLDSMSGNVTMTNPSSSGKSATWQKSKDLQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 QEINTKSAFLKMIYSYSSHSVSSIALSPASLDSMSGNVTMTNPSSSGKSATWQKSKDLQA
850 860 870 880 890 900
910 920
pF1KE3 QAFAHICRENATSVSKTLPRKRMSSI
::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 QAFAHICRENATSVSKTLPRKRMSSI
910 920
>>CCDS69185.1 GPRC6A gene_id:222545|Hs108|chr6 (751 aa)
initn: 3233 init1: 3233 opt: 3233 Z-score: 3462.0 bits: 651.6 E(32554): 1.6e-186
Smith-Waterman score: 4612; 81.0% identity (81.0% similar) in 926 aa overlap (1-926:1-751)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MAFLIILITCFVIILATSQPCQTPDDFVAATSPGHIIIGGLFAIHEKMLSSEDSPRRPQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 MAFLIILITCFVIILATSQPCQTPDDFVAATSPGHIIIGGLFAIHEKMLSSEDSPRRPQI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 QECVGFEISVFLQTLAMIHSIEMINNSTLLSGVKLGYEIYDTCTEVTVAMAATLRFLSKF
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 QECVGFEISVFLQTLAMIHSIEMINNSTLLPGVKLGYEIYDTCTEVTVAMAATLRFLSKF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 NCSRETVEFKCDYSSYMPRVKAVIGSGYSEITMAVSRMLNLQLMPQVGYESTAEILSDKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 NCSRETVEFKCDYSSYMPRVKAVIGSGYSEITMAVSRMLNLQLMPQVGYESTAEILSDKI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 RFPSFLRTVPSDFHQIKAMAHLIQKSGWNWIGIITTDDDYGRLALNTFIIQAEANNVCIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 RFPSFLRTVPSDFHQIKAMAHLIQKSGWNWIGIITTDDDYGRLALNTFIIQAEANNVCIA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 FKEVLPAFLSDNTIEVRINRTLKKIILEAQVNVIVVFLRQFHVFDLFNKAIEMNINKMWI
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 FKEVLPAFLSDNTIEVRINRTLKKIILEAQ------------------------------
250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 ASDNWSTATKITTIPNVKKIGKVVGFAFRRGNISSFHSFLQNLHLLPSDSHKLLHEYAMH
CCDS69 ------------------------------------------------------------
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 LSACAYVKDTDLSQCIFNHSQRTLAYKANKAIERNFVMRNDFLWDYAEPGLIHSIQLAVF
CCDS69 ------------------------------------------------------------
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 ALGYAIRDLCQARDCQNPNAFQPWELLGVLKNVTFTDGWNSFHFDAHGDLNTGYDVVLWK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 -------------------------LLGVLKNVTFTDGWNSFHFDAHGDLNTGYDVVLWK
280 290 300
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 EINGHMTVTKMAEYDLQNDVFIIPDQETKNEFRNLKQIQSKCSKECSPGQMKKTTRSQHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 EINGHMTVTKMAEYDLQNDVFIIPDQETKNEFRNLKQIQSKCSKECSPGQMKKTTRSQHI
310 320 330 340 350 360
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 CCYECQNCPENHYTNQTDMPHCLLCNNKTHWAPVRSTMCFEKEVEYLNWNDSLAILLLIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 CCYECQNCPENHYTNQTDMPHCLLCNNKTHWAPVRSTMCFEKEVEYLNWNDSLAILLLIL
370 380 390 400 410 420
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 SLLGIIFVLVVGIIFTRNLNTPVVKSSGGLRVCYVILLCHFLNFASTSFFIGEPQDFTCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 SLLGIIFVLVVGIIFTRNLNTPVVKSSGGLRVCYVILLCHFLNFASTSFFIGEPQDFTCK
430 440 450 460 470 480
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 TRQTMFGVSFTLCISCILTKSLKILLAFSFDPKLQKFLKCLYRPILIIFTCTGIQVVICT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 TRQTMFGVSFTLCISCILTKSLKILLAFSFDPKLQKFLKCLYRPILIIFTCTGIQVVICT
490 500 510 520 530 540
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 LWLIFAAPTVEVNVSLPRVIILECEEGSILAFGTMLGYIAILAFICFIFAFKGKYENYNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 LWLIFAAPTVEVNVSLPRVIILECEEGSILAFGTMLGYIAILAFICFIFAFKGKYENYNE
550 560 570 580 590 600
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 AKFITFGMLIYFIAWITFIPIYATTFGKYVPAVEIIVILISNYGILYCTFIPKCYVIICK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 AKFITFGMLIYFIAWITFIPIYATTFGKYVPAVEIIVILISNYGILYCTFIPKCYVIICK
610 620 630 640 650 660
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 QEINTKSAFLKMIYSYSSHSVSSIALSPASLDSMSGNVTMTNPSSSGKSATWQKSKDLQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 QEINTKSAFLKMIYSYSSHSVSSIALSPASLDSMSGNVTMTNPSSSGKSATWQKSKDLQA
670 680 690 700 710 720
910 920
pF1KE3 QAFAHICRENATSVSKTLPRKRMSSI
::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 QAFAHICRENATSVSKTLPRKRMSSI
730 740 750
>>CCDS69184.1 GPRC6A gene_id:222545|Hs108|chr6 (855 aa)
initn: 2977 init1: 2932 opt: 2932 Z-score: 3139.0 bits: 592.0 E(32554): 1.6e-168
Smith-Waterman score: 5526; 92.2% identity (92.2% similar) in 926 aa overlap (1-926:1-855)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MAFLIILITCFVIILATSQPCQTPDDFVAATSPGHIIIGGLFAIHEKMLSSEDSPRRPQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 MAFLIILITCFVIILATSQPCQTPDDFVAATSPGHIIIGGLFAIHEKMLSSEDSPRRPQI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 QECVGFEISVFLQTLAMIHSIEMINNSTLLSGVKLGYEIYDTCTEVTVAMAATLRFLSKF
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 QECVGFEISVFLQTLAMIHSIEMINNSTLLPGVKLGYEIYDTCTEVTVAMAATLRFLSKF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 NCSRETVEFKCDYSSYMPRVKAVIGSGYSEITMAVSRMLNLQLMPQVGYESTAEILSDKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 NCSRETVEFKCDYSSYMPRVKAVIGSGYSEITMAVSRMLNLQLMPQVGYESTAEILSDKI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 RFPSFLRTVPSDFHQIKAMAHLIQKSGWNWIGIITTDDDYGRLALNTFIIQAEANNVCIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 RFPSFLRTVPSDFHQIKAMAHLIQKSGWNWIGIITTDDDYGRLALNTFIIQAEANNVCIA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 FKEVLPAFLSDNTIEVRINRTLKKIILEAQVNVIVVFLRQFHVFDLFNKAIEMNINKMWI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 FKEVLPAFLSDNTIEVRINRTLKKIILEAQVNVIVVFLRQFHVFDLFNKAIEMNINKMWI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 ASDNWSTATKITTIPNVKKIGKVVGFAFRRGNISSFHSFLQNLHLLPSDSHKLLHEYAMH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 ASDNWSTATKITTIPNVKKIGKVVGFAFRRGNISSFHSFLQNLHLLPSDSHKLLHEYAMH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 LSACAYVKDTDLSQCIFNHSQRTLAYKANKAIERNFVMRNDFLWDYAEPGLIHSIQLAVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 LSACAYVKDTDLSQCIFNHSQRTLAYKANKAIERNFVMRNDFLWDYAEPGLIHSIQLAVF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 ALGYAIRDLCQARDCQNPNAFQPWELLGVLKNVTFTDGWNSFHFDAHGDLNTGYDVVLWK
:::::::::::::::::::::::::
CCDS69 ALGYAIRDLCQARDCQNPNAFQPWE-----------------------------------
430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 EINGHMTVTKMAEYDLQNDVFIIPDQETKNEFRNLKQIQSKCSKECSPGQMKKTTRSQHI
::::::::::::::::::::::::
CCDS69 ------------------------------------QIQSKCSKECSPGQMKKTTRSQHI
450 460
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 CCYECQNCPENHYTNQTDMPHCLLCNNKTHWAPVRSTMCFEKEVEYLNWNDSLAILLLIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 CCYECQNCPENHYTNQTDMPHCLLCNNKTHWAPVRSTMCFEKEVEYLNWNDSLAILLLIL
470 480 490 500 510 520
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 SLLGIIFVLVVGIIFTRNLNTPVVKSSGGLRVCYVILLCHFLNFASTSFFIGEPQDFTCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 SLLGIIFVLVVGIIFTRNLNTPVVKSSGGLRVCYVILLCHFLNFASTSFFIGEPQDFTCK
530 540 550 560 570 580
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 TRQTMFGVSFTLCISCILTKSLKILLAFSFDPKLQKFLKCLYRPILIIFTCTGIQVVICT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 TRQTMFGVSFTLCISCILTKSLKILLAFSFDPKLQKFLKCLYRPILIIFTCTGIQVVICT
590 600 610 620 630 640
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 LWLIFAAPTVEVNVSLPRVIILECEEGSILAFGTMLGYIAILAFICFIFAFKGKYENYNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 LWLIFAAPTVEVNVSLPRVIILECEEGSILAFGTMLGYIAILAFICFIFAFKGKYENYNE
650 660 670 680 690 700
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 AKFITFGMLIYFIAWITFIPIYATTFGKYVPAVEIIVILISNYGILYCTFIPKCYVIICK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 AKFITFGMLIYFIAWITFIPIYATTFGKYVPAVEIIVILISNYGILYCTFIPKCYVIICK
710 720 730 740 750 760
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 QEINTKSAFLKMIYSYSSHSVSSIALSPASLDSMSGNVTMTNPSSSGKSATWQKSKDLQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 QEINTKSAFLKMIYSYSSHSVSSIALSPASLDSMSGNVTMTNPSSSGKSATWQKSKDLQA
770 780 790 800 810 820
910 920
pF1KE3 QAFAHICRENATSVSKTLPRKRMSSI
::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 QAFAHICRENATSVSKTLPRKRMSSI
830 840 850
>>CCDS3010.1 CASR gene_id:846|Hs108|chr3 (1078 aa)
initn: 1247 init1: 462 opt: 737 Z-score: 788.3 bits: 157.4 E(32554): 1.4e-37
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920
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CCDS30 QQQQPLTLPQQQRSQQQPRCKQKVIFGSGTVTFSLSFDEPQKNAMAHRNSTHQNSLEAQK
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>>CCDS54632.1 CASR gene_id:846|Hs108|chr3 (1088 aa)
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CCDS54 MAFYSCCWVLLALTWHTSAYGPDQ--RAQKKGDIILGGLFPIHFGVAAKDQDLKSR
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CCDS54 PESVECIRYNFRGFRWLQAMIFAIEEINSSPALLPNLTLGYRIFDTCNTVSKALEATLSF
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CCDS54 VAQNKIDSLNLDEFCNCSEHIPSTIAVVGATGSGVSTAVANLLGLFYIPQVSYASSSRLL
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CCDS54 SNKNQFKSFLRTIPNDEHQATAMADIIEYFRWNWVGTIAADDDYGRPGIEKFREEAEERD
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CCDS54 GKIWLASEAWASSSLIAMPQYFHVVGGTIGFALKAGQIPGFREFLKKVHPRKSVHNGFAK
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pF1KE3 EYAMHLSAC-------------AYVKDTDLSQCIFNHSQRTLAYKANKAIERNFVMRNDF
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CCDS54 EFWEETFNCHLQEGAKGPLPVDTFLRGHEESGDRFSNS--STAFRPLCTGDENISSVETP
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CCDS54 YIDYTHLRISYNVYLAVYSIAHALQDIYTCLPGRGLFTNGSCADIKKVEAWQVLKHLRHL
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CCDS54 NFTNNMGEQVTFDECGDLVGNYSIINWHLSPEDGSIVFKEVGYYNVYAKKGERLFINEEK
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CCDS54 ILWSGFSREPLTFVLSVLQVPFSNCSRDCLAGTRKGIIEGEPTCCFECVECPDGEYSDET
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CCDS54 LVKTNRVLLVFEAKIPTSFHRKWWGLNLQFLLVFLCTFMQIVICVIWLYTAPPSSYRNQE
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CCDS54 IVWISFIPAYASTYGKFVSAVEVIAILAASFGLLACIFFNKIYIILFKPSRNTIEEVRCS
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CCDS82 YLG-KDLPENYNEAKCVTFSLLFNFVSWIAFFTTASVYDGKYLPAANMMAGLSSLSSGFG
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CCDS30 GPAVLGLSLWALLHPGTGAPLCLSQQLRMKGDYVLGGLFPLGEAEEAGLRSRTRPSSPVC
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CCDS30 TRFSSNGLLWALAMKMAVEEINNKSDLLPGLRLGYDLFDTCSEPVVAMKPSLMFLAKAG-
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pF1KE3 SRETVEFKCDYSSYMPRVKAVIGSGYSEITMAVSRMLNLQLMPQVGYESTAEILSDKIRF
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CCDS30 SRDIAAY-CNYTQYQPRVLAVIGPHSSELAMVTGKFFSFFLMPQVSYGASMELLSARETF
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CCDS30 PSFFRTVPSDRVQLTAAAELLQEFGWNWVAALGSDDEYGRQGLSIFSALAAARGICIAHE
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CCDS30 GLVPLPRADDSRLGKVQDVLHQVN-QSSVQVVLLFASVHAAHALFNYSISSRLSPKVWVA
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pF1KE3 SDNWSTATKITTIPNVKKIGKVVGFAFRRGNISSFHSFLQNLHLLPSDSH--KLLHEYAM
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CCDS30 SEAWLTSDLVMGLPGMAQMGTVLGFLQRGAQLHEFPQYVKTHLALATDPAFCSALGEREQ
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: . . .:: :: . . .. .. : :. ::
CCDS30 GLEEDVVGQRCPQCDCI------TL-----QNVSAGLNHHQTF-----------SVYAAV
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pF1KE3 FALGYAIRDL--CQARDCQNPNAFQPWELLGVLKNVTFTDGWNSFHFDAHGDLNTGYDVV
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CCDS30 YSVAQALHNTLQCNASGCPAQDPVKPWQLLENMYNLTFHVGGLPLRFDSSGNVDMEYDLK
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CCDS30 LW---VWQGSVPRLHDVGRFNGSLRTERLKIRWHTSDNQKPVSRCSRQCQEGQVRRV-KG
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CCDS30 FHSCCYDCVDCEAGSYRQNPDDIACTFCG-QDEWSPERSTRCFRRRSRFLAWGEPAVLLL
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CCDS30 LLLLSLALGLVLAALGLFVHHRDSPLVQASGGPLACFG-LVCLGLVCLSVLLFPGQPSPA
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pF1KE3 TCKTRQTMFGVSFTLCISCILTKSLKIL----LAFSFDPKLQKFLKCLYRPI--LIIFTC
: ..: . . .: :.: .. .. .:. : .:. .:. :: : :...
CCDS30 RCLAQQPLSHLPLTGCLSTLFLQAAEIFVESELPLSWADRLSG---CLRGPWAWLVVLLA
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..:..:: .:. : : .. :: ...:. : ..:: . : :::.::.
CCDS30 MLVEVALCTWYLVAFPPEVVTDWHMLPTEALVHCRTRSWVSFGLAHATNATLAFLCFLGT
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pF1KE3 FAFKGKYENYNEAKFITFGMLIYFIAWITFIPIYATTFGKYVPAVEIIVILISNYGILYC
: ... ::.:. .::.:: :::.:..:.:. :.. :::.. ..:. :::
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pF1KE3 TFIPKCYVIICKQEINTKSAFLKMIYSYSSHSVSSIALSPASLDSMSGNVTMTNPSSSGK
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CCDS30 FHLPRCYLLMRQPGLNTPEFFLGGGPGDAQGQNDGNTGNQGKHE
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:: ....:::::...: .: .. . :. . : . . .: ..:.::: ::. .:: :
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.... :.. :.:.::. :. . .:: .:....:: :.: :... . ....: .
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CCDS81 HGAGLFVMISSAAQLLICLTWLVVWTPLPAREYQRFPHLVMLECTETNSLGFILAF-LYN
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CCDS18 RDKVRFPALLRTTPSADHHIEAMVQLMLHFRWNWIIVLVSSDTYGRDNGQLLGERVARRD
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: . .. .:. . . ..:. : .. : ..: . ..
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..: :. :: ::..: . ::.::::: ..:..:. ::.. .. . . : :
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CCDS18 VSMAFITVLKMVIVVIGMLATGLSPTTRTDPDDPKITIVSCNPNYRNSLLFNTSLDL--L
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CCDS18 LSVVGFSFAYMGKELPTNYNEAKFITLSMTFYFTSSVSLCTFMSAYSGVLVTIVDLLVTV
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CCDS43 HAKG---------PSGVPCGDIKRENGIHRLEAMLYALDQINSDPNLLPNVTLGARILDT
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CCDS43 CSRDTYALEQSLTFVQAL-IQKDTSDVRCTNGEPPVFVKPEKVVGVIGASGSSVSIMVAN
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CCDS43 ILRLFQIPQISYASTAPELSDDRRYDFFSRVVPPDSFQAQAMVDIVKALGWNYVSTLASE
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.::. ....: :. ::...::: . .: .: ::. ..: .:... . ..:.
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.: ... . : . . . :: . : . .. :.. . . . :
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: . ... .: . : .. . ::.:...:. .::: :. : .::
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: . : : : . . :.:.. :.. ..:..:::: .. : : : .::
CCDS43 QHCPYDQRPNENR-TGCQDIPIIKLEWHSPWAVIPVFLAMLGIIATIFVMATFIRYNDTP
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CCDS43 IVRASGR-ELSYVLLTGIFLCYIITFLMIAKPDVAVCSFRRVFLGLGMCISYAALLTKTN
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CCDS43 RIYRIFE-QGKKSVTAPRLISPTSQLAITSSLISVQLLGVFIWFGVDPPNIIIDYDEHKT
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CCDS43 MNPEQARGVLKCDITDLQIICS-LGYSILLMVTCTVYAIKTRGVPENFNEAKPIGFTMYT
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pF1KE3 YFIAWITFIPIY---ATTFGK-YVPAVEIIVIL-ISNYGILYCTFIPKCYVIICKQEINT
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CCDS43 TCIVWLAFIPIFFGTAQSAEKLYIQTTTLTISMNLSASVALGMLYMPKVYIIIFHPELNV
800 810 820 830 840 850
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CCDS43 QKRKRSF-KAVVTAATMS-SRLSHKPSDRPNGEAKTELCENVDPNSPAAKKKYVSYNNLV
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CCDS43 I
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]