Result of FASTA (ccds) for
pF1KE3557
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3557, 548 aa
1>>>pF1KE3557 548 - 548 aa - 548 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7876+/-0.000828; mu= 9.1589+/- 0.050
mean_var=173.6621+/-34.455, 0's: 0 Z-trim(113.5): 130 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.097324
statistics sampled from 14226 (14357) to 14226 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.757), E-opt: 0.2 (0.43), width: 16
Scan time: 1.840
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS11498.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs109|chr17 ( 548) 3738 536.9 2.4e-152
CCDS74082.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs109|chr17 ( 889) 3738 537.1 3.4e-152
CCDS59216.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10 ( 841) 1431 213.1 1.1e-54
CCDS59214.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10 ( 794) 1376 205.4 2.1e-52
CCDS73082.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10 ( 799) 1296 194.2 5.2e-49
CCDS7170.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10 ( 846) 1296 194.2 5.4e-49
CCDS59215.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10 ( 816) 1293 193.8 7.1e-49
CCDS2184.1 ARHGAP15 gene_id:55843|Hs109|chr2 ( 475) 1218 183.0 6.9e-46
CCDS44929.1 ARHGAP9 gene_id:64333|Hs109|chr12 ( 640) 710 111.8 2.6e-24
CCDS54254.1 ARHGAP33 gene_id:115703|Hs109|chr19 (1123) 486 80.6 1.2e-14
CCDS12477.1 ARHGAP33 gene_id:115703|Hs109|chr19 (1126) 486 80.6 1.2e-14
CCDS58497.1 ABR gene_id:29|Hs109|chr17 ( 310) 474 78.4 1.4e-14
CCDS73936.1 ABR gene_id:29|Hs109|chr17 ( 641) 474 78.7 2.4e-14
CCDS54060.1 ABR gene_id:29|Hs109|chr17 ( 813) 474 78.8 2.9e-14
CCDS11000.1 ABR gene_id:29|Hs109|chr17 ( 822) 474 78.8 2.9e-14
CCDS13807.1 BCR gene_id:613|Hs109|chr22 (1227) 477 79.3 3e-14
CCDS10999.1 ABR gene_id:29|Hs109|chr17 ( 859) 474 78.8 3e-14
CCDS13806.1 BCR gene_id:613|Hs109|chr22 (1271) 477 79.3 3.1e-14
CCDS56147.1 CHN1 gene_id:1123|Hs109|chr2 ( 334) 465 77.2 3.6e-14
CCDS46127.1 ARHGAP35 gene_id:2909|Hs109|chr19 (1499) 476 79.3 3.8e-14
CCDS46454.1 CHN1 gene_id:1123|Hs109|chr2 ( 433) 465 77.3 4.3e-14
CCDS46455.1 CHN1 gene_id:1123|Hs109|chr2 ( 459) 465 77.3 4.5e-14
CCDS56027.1 ARHGAP23 gene_id:57636|Hs109|chr17 (1491) 472 78.7 5.6e-14
CCDS44928.1 ARHGAP9 gene_id:64333|Hs109|chr12 ( 547) 463 77.1 6.3e-14
CCDS8941.2 ARHGAP9 gene_id:64333|Hs109|chr12 ( 731) 463 77.2 7.8e-14
CCDS81705.1 ARHGAP9 gene_id:64333|Hs109|chr12 ( 821) 463 77.2 8.6e-14
CCDS47566.1 CHN2 gene_id:1124|Hs109|chr7 ( 332) 443 74.1 3e-13
CCDS5420.1 CHN2 gene_id:1124|Hs109|chr7 ( 468) 443 74.2 3.9e-13
CCDS87488.1 CHN2 gene_id:1124|Hs109|chr7 ( 543) 443 74.3 4.4e-13
CCDS44769.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs109|chr11 (2087) 447 75.3 8.2e-13
CCDS1215.1 ARHGAP30 gene_id:257106|Hs109|chr1 ( 890) 426 72.0 3.3e-12
CCDS30918.1 ARHGAP30 gene_id:257106|Hs109|chr1 (1101) 426 72.1 3.9e-12
CCDS31718.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs109|chr11 (1738) 428 72.6 4.6e-12
CCDS7144.2 ARHGAP21 gene_id:57584|Hs109|chr10 (1958) 427 72.5 5.5e-12
CCDS87332.1 ARHGAP26 gene_id:23092|Hs109|chr5 ( 686) 409 69.6 1.4e-11
CCDS47297.1 ARHGAP26 gene_id:23092|Hs109|chr5 ( 759) 409 69.6 1.5e-11
CCDS45095.1 ARHGAP5 gene_id:394|Hs109|chr14 (1501) 414 70.5 1.6e-11
CCDS32062.1 ARHGAP5 gene_id:394|Hs109|chr14 (1502) 414 70.5 1.6e-11
CCDS4277.1 ARHGAP26 gene_id:23092|Hs109|chr5 ( 814) 409 69.6 1.6e-11
CCDS58080.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs109|chr10 ( 714) 406 69.2 2e-11
CCDS34075.1 ARHGAP10 gene_id:79658|Hs109|chr4 ( 786) 401 68.5 3.5e-11
>>CCDS11498.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs109|chr17 (548 aa)
initn: 3738 init1: 3738 opt: 3738 Z-score: 2848.9 bits: 536.9 E(33420): 2.4e-152
Smith-Waterman score: 3738; 100.0% identity (100.0% similar) in 548 aa overlap (1-548:1-548)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MQPGLSPGSPGDPRPPTPETDYPESLTSYPEEDYSPVGSFGEPGPTSPLTTPPGWSCHVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MQPGLSPGSPGDPRPPTPETDYPESLTSYPEEDYSPVGSFGEPGPTSPLTTPPGWSCHVS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 QDKQMLYTNHFTQEQWVRLEDPHGKPYFYNPEDSSVRWELPQVPVPAPRSIHKSSQDGDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QDKQMLYTNHFTQEQWVRLEDPHGKPYFYNPEDSSVRWELPQVPVPAPRSIHKSSQDGDT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 PAQASPPEEKVPAELDEVGSWEEVSPATAAVRTKTLDKAGVLHRTKTADKGKRLRKKHWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PAQASPPEEKVPAELDEVGSWEEVSPATAAVRTKTLDKAGVLHRTKTADKGKRLRKKHWS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 ASWTVLEGGVLTFFKDSKTSAAGGLRQPSKFSTPEYTVELRGATLSWAPKDKSSRKNVLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ASWTVLEGGVLTFFKDSKTSAAGGLRQPSKFSTPEYTVELRGATLSWAPKDKSSRKNVLE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 LRSRDGSEYLIQHDSEAIISTWHKAIAQGIQELSAELPPEESESSRVDFGSSERLGSWQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LRSRDGSEYLIQHDSEAIISTWHKAIAQGIQELSAELPPEESESSRVDFGSSERLGSWQE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 KEEDARPNAAAPALGPVGLESDLSKVRHKLRKFLQRRPTLQSLREKGYIKDQVFGCALAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KEEDARPNAAAPALGPVGLESDLSKVRHKLRKFLQRRPTLQSLREKGYIKDQVFGCALAA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 LCERERSRVPRFVQQCIRAVEARGLDIDGLYRISGNLATIQKLRYKVDHDERLDLDDGRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LCERERSRVPRFVQQCIRAVEARGLDIDGLYRISGNLATIQKLRYKVDHDERLDLDDGRW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 EDVHVITGALKLFFRELPEPLFPFSHFRQFIAAIKLQDQARRSRCVRDLVRSLPAPNHDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EDVHVITGALKLFFRELPEPLFPFSHFRQFIAAIKLQDQARRSRCVRDLVRSLPAPNHDT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 LRMLFQHLCRVIEHGEQNRMSVQSVAIVFGPTLLRPEVEETSMPMTMVFQNQVVELILQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LRMLFQHLCRVIEHGEQNRMSVQSVAIVFGPTLLRPEVEETSMPMTMVFQNQVVELILQQ
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 CADIFPPH
::::::::
CCDS11 CADIFPPH
>>CCDS74082.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs109|chr17 (889 aa)
initn: 3738 init1: 3738 opt: 3738 Z-score: 2846.0 bits: 537.1 E(33420): 3.4e-152
Smith-Waterman score: 3738; 100.0% identity (100.0% similar) in 548 aa overlap (1-548:342-889)
10 20 30
pF1KE3 MQPGLSPGSPGDPRPPTPETDYPESLTSYP
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ESRRVFFYNPLTGETAWEDEAENEPEEELEMQPGLSPGSPGDPRPPTPETDYPESLTSYP
320 330 340 350 360 370
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 EEDYSPVGSFGEPGPTSPLTTPPGWSCHVSQDKQMLYTNHFTQEQWVRLEDPHGKPYFYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 EEDYSPVGSFGEPGPTSPLTTPPGWSCHVSQDKQMLYTNHFTQEQWVRLEDPHGKPYFYN
380 390 400 410 420 430
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 PEDSSVRWELPQVPVPAPRSIHKSSQDGDTPAQASPPEEKVPAELDEVGSWEEVSPATAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 PEDSSVRWELPQVPVPAPRSIHKSSQDGDTPAQASPPEEKVPAELDEVGSWEEVSPATAA
440 450 460 470 480 490
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 VRTKTLDKAGVLHRTKTADKGKRLRKKHWSASWTVLEGGVLTFFKDSKTSAAGGLRQPSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VRTKTLDKAGVLHRTKTADKGKRLRKKHWSASWTVLEGGVLTFFKDSKTSAAGGLRQPSK
500 510 520 530 540 550
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 FSTPEYTVELRGATLSWAPKDKSSRKNVLELRSRDGSEYLIQHDSEAIISTWHKAIAQGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 FSTPEYTVELRGATLSWAPKDKSSRKNVLELRSRDGSEYLIQHDSEAIISTWHKAIAQGI
560 570 580 590 600 610
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 QELSAELPPEESESSRVDFGSSERLGSWQEKEEDARPNAAAPALGPVGLESDLSKVRHKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QELSAELPPEESESSRVDFGSSERLGSWQEKEEDARPNAAAPALGPVGLESDLSKVRHKL
620 630 640 650 660 670
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 RKFLQRRPTLQSLREKGYIKDQVFGCALAALCERERSRVPRFVQQCIRAVEARGLDIDGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RKFLQRRPTLQSLREKGYIKDQVFGCALAALCERERSRVPRFVQQCIRAVEARGLDIDGL
680 690 700 710 720 730
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 YRISGNLATIQKLRYKVDHDERLDLDDGRWEDVHVITGALKLFFRELPEPLFPFSHFRQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 YRISGNLATIQKLRYKVDHDERLDLDDGRWEDVHVITGALKLFFRELPEPLFPFSHFRQF
740 750 760 770 780 790
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 IAAIKLQDQARRSRCVRDLVRSLPAPNHDTLRMLFQHLCRVIEHGEQNRMSVQSVAIVFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 IAAIKLQDQARRSRCVRDLVRSLPAPNHDTLRMLFQHLCRVIEHGEQNRMSVQSVAIVFG
800 810 820 830 840 850
520 530 540
pF1KE3 PTLLRPEVEETSMPMTMVFQNQVVELILQQCADIFPPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 PTLLRPEVEETSMPMTMVFQNQVVELILQQCADIFPPH
860 870 880
>>CCDS59216.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10 (841 aa)
initn: 1383 init1: 645 opt: 1431 Z-score: 1095.7 bits: 213.1 E(33420): 1.1e-54
Smith-Waterman score: 1432; 44.6% identity (68.3% similar) in 561 aa overlap (9-545:311-839)
10 20 30
pF1KE3 MQPGLSPGSPGDPRPPTPETDYPESLTSYPEEDYSPVG
.::: . . : .: ::: . : : :
CCDS59 CYYYNRGTQERTWKPPRWTRDASISKGDFQNPGDQELLSSEENYYS--TSYSQSD-SQCG
290 300 310 320 330
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 SFGEPGPTSPLTTPPGWSCHVSQDKQMLYTNHFTQEQWVRLEDPHGKPYFYNPEDSSVRW
: : : ::: .... . :::. .:.:.:.. : .:. :.:. . : .:
CCDS59 S-----P------PRGWSEELDERGHTLYTSDYTNEKWLKHVDDQGRQYYYSADGSRSEW
340 350 360 370 380
100 110 120 130
pF1KE3 ELP--------QVPVPAPRSIHKSSQDG-------------DTPAQASPPEEKVPAELDE
::: : . ::. . :. :: . :: : : . :
CCDS59 ELPKYNASSQQQREIIKSRSLDRRLQEPIVLTKWRHSTIVLDTNDKESPTASK-PC-FPE
390 400 410 420 430 440
140 150 160 170 180 190
pF1KE3 VGSWEEVSPATAAVRTKTLDKAGVLHRTKTADKGKRLRKKHWSASWTVLEGGVLTFFKD-
.: ::.. . .: :.:. :: :..::..:: .: .::.::.:. : : :
CCDS59 ----NESSPSSPKHQDTDQEKYGLLNVTKIAENGKKVRK-NWLSSWAVLQGSSLLFTKTQ
450 460 470 480 490
200 210 220 230 240 250
pF1KE3 -SKTSAAGGLRQPSKFSTPEYTVELRGATLSWAPKDKSSRKNVLELRSRDGSEYLIQHDS
:.:: : :. : ::.::.:.:::. : :::::.:::.::..:.:.: ::: :.
CCDS59 GSSTSWFG-----SNQSKPEFTVDLKGATIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGTELLIQSDN
500 510 520 530 540 550
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 EAIISTWHKAIAQGIQELSAELPPEESESSRVDFGSSERLGSWQEKEEDARPNAAAPALG
...:. : :.... :.. ..: : : : . :. ..::.. . ..
CCDS59 DTVINDWFKVLSSTINNQAVETD-EGIEEEIPDSPGIEK----HDKEKEQKDPKKLRSFK
560 570 580 590 600
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 PVGLES-DLSKVRHKLRKFLQRRPTLQSLREKGYIKDQVFGCALAALCERERSRVPRFVQ
...: . .:....:.::: ::::::..:::::::::::: :: ::.:: . ::.::.
CCDS59 VSSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLANLCQRENGTVPKFVK
610 620 630 640 650 660
380 390 400 410 420 430
pF1KE3 QCIRAVEARGLDIDGLYRISGNLATIQKLRYKVDHDERLDLDDGRWEDVHVITGALKLFF
::. :: .::::::.::.:::::.:::::. :.:::.:::.:..:::.::::::::.::
CCDS59 LCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSKWEDIHVITGALKMFF
670 680 690 700 710 720
440 450 460 470 480 490
pF1KE3 RELPEPLFPFSHFRQFIAAIKLQDQARRSRCVRDLVRSLPAPNHDTLRMLFQHLCRVIEH
:::::::: :.:: .:. ::: :. .: :.::.:.:: ::.::...::.:: ::::.
CCDS59 RELPEPLFTFNHFNDFVNAIK-QEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQDTMQILFRHLRRVIEN
730 740 750 760 770 780
500 510 520 530 540
pF1KE3 GEQNRMSVQSVAIVFGPTLLRPEVEETSMPMTMVFQNQVVELILQQCADIFPPH
::.:::. ::.:::::::::.:: : .. . :.:::.::::: . ..::
CCDS59 GEKNRMTYQSIAIVFGPTLLKPEKETGNIAVHTVYQNQIVELILLELSSIFGR
790 800 810 820 830 840
>>CCDS59214.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10 (794 aa)
initn: 1269 init1: 645 opt: 1376 Z-score: 1054.3 bits: 205.4 E(33420): 2.1e-52
Smith-Waterman score: 1377; 43.2% identity (66.9% similar) in 556 aa overlap (13-545:258-792)
10 20 30 40
pF1KE3 MQPGLSPGSPGDPRPPTPETDYPESLTSYPEEDYSPVGSFGE
: : .: . .. .: : . .
CCDS59 RATTPPNQGRPDSPVYANLQELKISQSALPPLPGSPAIQINGEWETH--KDSSGRCYYYN
230 240 250 260 270 280
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 PGPTSPLTTPPGWSCHVSQDKQMLYTNHFTQEQWVRLEDPHGKPYFYNPEDSSVRWELP-
: :: :. .: .: . : :: :.. : .:. :.:. . : .::::
CCDS59 RGTQERTWKPPRWTRDASISKGD-FQNPGDQE-WLKHVDDQGRQYYYSADGSRSEWELPK
290 300 310 320 330 340
110 120 130 140
pF1KE3 -------QVPVPAPRSIHKSSQDG-------------DTPAQASPPEEKVPAELDEVGSW
: . ::. . :. :: . :: : : . :
CCDS59 YNASSQQQREIIKSRSLDRRLQEPIVLTKWRHSTIVLDTNDKESPTASK-PC-FPE----
350 360 370 380 390
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 EEVSPATAAVRTKTLDKAGVLHRTKTADKGKRLRKKHWSASWTVLEGGVLTFFKDSKTSA
.: ::.. . .: :.:. :: :..::..:: .: .::.::.:. : : : . .:.
CCDS59 NESSPSSPKHQDTDQEKYGLLNVTKIAENGKKVRK-NWLSSWAVLQGSSLLFTKTQGSST
400 410 420 430 440 450
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 AG-GLRQPSKFSTPEYTVELRGATLSWAPKDKSSRKNVLELRSRDGSEYLIQHDSEAIIS
. : : : ::.::.:.:::. : :::::.:::.::..:.:.: ::: :....:.
CCDS59 SWFGSNQ----SKPEFTVDLKGATIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGTELLIQSDNDTVIN
460 470 480 490 500 510
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 TWHKAIAQGIQELSAELPPEESESSRVDFGSSERLGSWQEKEEDARPNAAAPALGPVGLE
: :.... :.. ..: : : : . :. ..::.. . .. ...
CCDS59 DWFKVLSSTINNQAVETD-EGIEEEIPDSPGIEK----HDKEKEQKDPKKLRSFKVSSID
520 530 540 550 560
330 340 350 360 370
pF1KE3 S-DLSKVRHKLRKFLQRRPTLQSLREKGYIKDQVFGCALAALCERERSRVPRFVQQCIRA
: . .:....:.::: ::::::..:::::::::::: :: ::.:: . ::.::. ::.
CCDS59 SSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLANLCQRENGTVPKFVKLCIEH
570 580 590 600 610 620
380 390 400 410 420 430
pF1KE3 VEARGLDIDGLYRISGNLATIQKLRYKVDHDERLDLDDGRWEDVHVITGALKLFFRELPE
:: .::::::.::.:::::.:::::. :.:::.:::.:..:::.::::::::.:::::::
CCDS59 VEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSKWEDIHVITGALKMFFRELPE
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440 450 460 470 480 490
pF1KE3 PLFPFSHFRQFIAAIKLQDQARRSRCVRDLVRSLPAPNHDTLRMLFQHLCRVIEHGEQNR
::: :.:: .:. ::: :. .: :.::.:.:: ::.::...::.:: ::::.::.::
CCDS59 PLFTFNHFNDFVNAIK-QEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQDTMQILFRHLRRVIENGEKNR
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500 510 520 530 540
pF1KE3 MSVQSVAIVFGPTLLRPEVEETSMPMTMVFQNQVVELILQQCADIFPPH
:. ::.:::::::::.:: : .. . :.:::.::::: . ..::
CCDS59 MTYQSIAIVFGPTLLKPEKETGNIAVHTVYQNQIVELILLELSSIFGR
750 760 770 780 790
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10 20 30 40
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: :: :. .: .: . : :: :.. : .:. :.:. . : .::::
CCDS73 RGTQERTWKPPRWTRDASISKGD-FQNPGDQE-WLKHVDDQGRQYYYSADGSRSEWELPK
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: . ::. . :. :: . :: : : .. .:
CCDS73 YNASSQQQREIIKSRSLDRRLQEPIVLTKWRHSTIVLDTNDKESPTASK-PCFPENESSP
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. .: : .: :.:. :: :..::..:: .: .::.::.:. : : : . .:.
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. : : : ::.::.:.:::. : :::::.:::.::..:.:.: ::: :....:.
CCDS73 SWFGSNQ----SKPEFTVDLKGATIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGTELLIQSDNDTVIN
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: :.... :.. ..: : : : . :. ..::.. . .. ...
CCDS73 DWFKVLSSTINNQAVETD-EGIEEEIPDSPGIEK----HDKEKEQKDPKKLRSFKVSSID
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CCDS73 SSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLANLCQRENGTVPKFVKLCIEH
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:: .::::::.::.:::::.:::::. :.:::.:::.:..:::.::::::::.:::::::
CCDS73 VEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSKWEDIHVITGALKMFFRELPE
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::: :.:: .:. ::: :. .: :.::.:.:: ::.::...::.:: ::::.::.::
CCDS73 PLFTFNHFNDFVNAIK-QEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQDTMQILFRHLRRVIENGEKNR
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:. ::.:::::::::.:: : .. . :.:::.::::: . ..::
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CCDS71 S-----P------PRGWSEELDERGHTLYTSDYTNEKWLKHVDDQGRQYYYSADGSRSEW
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::: : . ::. . :. :: . :: : : ..
CCDS71 ELPKYNASSQQQREIIKSRSLDRRLQEPIVLTKWRHSTIVLDTNDKESPTASK-PCFPEN
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...:. : :.... :.. ..: : : : . :. ..::.. . ..
CCDS71 DTVINDWFKVLSSTINNQAVETD-EGIEEEIPDSPGIEK----HDKEKEQKDPKKLRSFK
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pF1KE3 PVGLES-DLSKVRHKLRKFLQRRPTLQSLREKGYIKDQVFGCALAALCERERSRVPRFVQ
...: . .:....:.::: ::::::..:::::::::::: :: ::.:: . ::.::.
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CCDS71 LCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSKWEDIHVITGALKMFF
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CCDS71 RELPEPLFTFNHFNDFVNAIK-QEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQDTMQILFRHLRRVIEN
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CCDS71 GEKNRMTYQSIAIVFGPTLLKPEKETGNIAVHTVYQNQIVELILLELSSIFGR
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CCDS59 S-----P------PRGWSEELDERGHTLYTSDYTNEKWLKHVDDQGRQYYYSADGSRSEW
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CCDS59 TVDLKGATIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGTELLIQSDNDTVINDWFKVLSSTINNQAVE
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: : : . :. ..::.. . .. ...: . .:....:.:::
CCDS59 TD-EGIEEEIPDSPGIEK----HDKEKEQKDPKKLRSFKVSSIDSSEQKKTKKNLKKFLT
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::::::..:::::::::::: :: ::.:: . ::.::. ::. :: .::::::.::.::
CCDS59 RRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLANLCQRENGTVPKFVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSG
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:::.:::::. :.:::.:::.:..:::.::::::::.:::::::::: :.:: .:. :::
CCDS59 NLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSKWEDIHVITGALKMFFRELPEPLFTFNHFNDFVNAIK
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CCDS59 -QEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQDTMQILFRHLRRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLK
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CCDS59 PEKETGNIAVHTVYQNQIVELILLELSSIFGR
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CCDS21 GKVTEPISRHRRNHSQHILKDVIPPLEQLMVEKEGYLQKAKIADGGKKLRK-NWSTSWIV
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: . . :.:.:: .: .... : :: .:.: :: . :: :.:::::::... . .
CCDS21 LSSRRIEFYKESKQQALSNMKTGHK---PE-SVDLCGAHIEWA-KEKSSRKNVFQITTVS
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:.:.:.: : . :: : .:: ..:..: . : .. : ... .:: .: : ...
CCDS21 GNEFLLQSDIDFIILDWFHAIKNAIDRLPKDSSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSHYDSDI
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.. .:. . .. :: ..:. .:.::. :::.:..:.::: ::::.:: :
CCDS21 KEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHL
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.:::: : :: ::.:::.::: ::::.::.::.:::::::::::. :...:.:.:::.
CCDS21 HKVCERENSTVPWFVKQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDS
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pF1KE3 RWEDVHVITGALKLFFRELPEPLFPFSHFRQFIAAIKLQDQARRSRCVRDLVRSLPAPNH
.:::.::.:::::.:::::::::::.: :.::. ::: ::. : . :..::..:: ::.
CCDS21 QWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFEQFVEAIKKQDNNTRIEAVKSLVQKLPPPNR
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pF1KE3 DTLRMLFQHLCRVIEHGEQNRMSVQSVAIVFGPTLLRPEVEETSMPMTMVFQNQVVELIL
::...:: :: ... .. .: ::.::..::::::::: : : .: . ::.:::..::.:
CCDS21 DTMKVLFGHLTKIVAKASKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAENETGNMAIHMVYQNQIAELML
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.. . ::
CCDS21 SEYSKIFGSEED
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CCDS44 RSVSTDNLSPSLLKPFQEGPSGRSLSQEDLPSEASASTAGPQPLMSEP-----PVYCNLV
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: . ::: .: . : . : . ::. :. .. : . :. :
CCDS44 DLRRCPRSPPPGPACPLLQ----------RLDAWEQHLDPNSGRCFYINSLTGCKSWKPP
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. : :.. : ..: : :.. . .: :: :: ...: :
CCDS44 RRSRSETNPGSMEGTQTLKRNNDVLQPQAKGFRSDTGTPEPLDPQGSLSLSQRTSQLDPP
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: : : . :: :.:.:. :: :. :..::: .:. ::.:: :. :.:...
CCDS44 ALQAPRPLPQLLDDPHEVEKSGLLNMTKIAQGGRKLRK-NWGPSWVVLTGNSLVFYREPP
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. .::.:. :..:. : : : : ::. : : ::. .. : :
CCDS44 LRAWHRALRTVIERLDRENPLELRLS-----GSGPAELSAGEDEEEESELVSKPLLRLSS
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:: : :.. .::.::.... .:: ::::.:.: ..:::::: : .::.:: .
CCDS44 RRSSIRGPEGTEQN--RVRNKLKRLIAKRPPLQSLQERGLLRDQVFGCQLESLCQREGDT
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:: :.. :: ::. ::::.::.::.:::::..::::. ::...
CCDS44 VPSFLRLCIAAVDKRGLDVDGIYRVSGNLAVVQKLRFLVDRERAVTSDGRYVFPEQPGQE
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:::::. .:.:.::.:::::::.::::.:: : . :::
CCDS44 GRLDLDSTEWDDIHVVTGALKLFLRELPQPLVPPLLLPHFRAALG
600 610 620 630 640
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 DLVRSLPAPNHDTLRMLFQHLCRVIEHGEQNRMSVQSVAIVFGPTLLRPEVEETSMPMTM
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200 210 220 230 240 250
pF1KE3 TFFKDSKTSAAGGLRQPSKFSTPEYTVELRGATLSWAPKDKSSRKNVLELRSRDGSEYLI
: .:.: :. .:. .: :...: .
CCDS54 MLVPLLLQYLETLSGLVDSNLNCGPVLTWMELDNHGRRLLL---SEEAS---L
10 20 30 40
260 270 280 290
pF1KE3 QHDSEAIISTWHKAIAQGIQELSAE---------LPPEESES-------SRVDFGSSE--
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