Result of FASTA (omim) for
pF1KE3547
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3547, 2063 aa
1>>>pF1KE3547 2063 - 2063 aa - 2063 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.8001+/-0.000403; mu= 1.3944+/- 0.025
mean_var=345.4397+/-72.516, 0's: 0 Z-trim(122.6): 318 B-trim: 809 in 1/57
Lambda= 0.069006
statistics sampled from 40661 (41026) to 40661 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.762), E-opt: 0.2 (0.481), width: 16
Scan time: 17.110
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055601 (OMIM: 617043) rho guanine nucleotide ex (2063) 14049 1414.2 0
XP_016874112 (OMIM: 617043) PREDICTED: rho guanine (1057) 6746 686.9 3.1e-196
XP_016874113 (OMIM: 617043) PREDICTED: rho guanine ( 971) 6569 669.3 5.8e-191
XP_016857107 (OMIM: 612494) PREDICTED: rho guanine (1042) 556 70.7 9.8e-11
XP_005245984 (OMIM: 612494) PREDICTED: rho guanine (1057) 556 70.7 9.9e-11
NP_001315053 (OMIM: 612494) rho guanine nucleotide (1057) 556 70.7 9.9e-11
NP_001011722 (OMIM: 612494) rho guanine nucleotide (1240) 556 70.7 1.1e-10
XP_005245982 (OMIM: 612494) PREDICTED: rho guanine (1240) 556 70.7 1.1e-10
XP_011539993 (OMIM: 612494) PREDICTED: rho guanine (1241) 556 70.7 1.1e-10
XP_006710792 (OMIM: 612494) PREDICTED: rho guanine (1243) 556 70.7 1.1e-10
XP_006710794 (OMIM: 612494) PREDICTED: rho guanine (1243) 556 70.7 1.1e-10
XP_006710791 (OMIM: 612494) PREDICTED: rho guanine (1244) 556 70.7 1.1e-10
XP_005245980 (OMIM: 612494) PREDICTED: rho guanine (1244) 556 70.7 1.1e-10
XP_016857110 (OMIM: 612494) PREDICTED: rho guanine (1279) 556 70.7 1.1e-10
NP_060595 (OMIM: 612494) rho guanine nucleotide ex (1279) 556 70.7 1.1e-10
XP_011539997 (OMIM: 612494) PREDICTED: rho guanine ( 689) 548 69.7 1.2e-10
XP_016857108 (OMIM: 612494) PREDICTED: rho guanine (1037) 548 69.9 1.7e-10
XP_011539998 (OMIM: 612494) PREDICTED: rho guanine ( 684) 542 69.1 1.9e-10
XP_016857109 (OMIM: 612494) PREDICTED: rho guanine (1032) 542 69.3 2.6e-10
XP_005245986 (OMIM: 612494) PREDICTED: rho guanine (1052) 542 69.3 2.6e-10
NP_001306766 (OMIM: 612494) rho guanine nucleotide (1235) 542 69.3 2.9e-10
XP_016857106 (OMIM: 612494) PREDICTED: rho guanine (1235) 542 69.3 2.9e-10
XP_011539995 (OMIM: 612494) PREDICTED: rho guanine (1236) 542 69.3 2.9e-10
XP_011539994 (OMIM: 612494) PREDICTED: rho guanine (1239) 542 69.3 2.9e-10
XP_016857111 (OMIM: 612494) PREDICTED: rho guanine (1274) 542 69.3 3e-10
XP_011533072 (OMIM: 608136,608236) PREDICTED: rho (1162) 530 68.1 6.4e-10
XP_011533070 (OMIM: 608136,608236) PREDICTED: rho (1304) 530 68.2 7e-10
XP_011533069 (OMIM: 608136,608236) PREDICTED: rho (1305) 530 68.2 7e-10
NP_001295081 (OMIM: 608136,608236) rho guanine nuc (1306) 530 68.2 7e-10
NP_055444 (OMIM: 608136,608236) rho guanine nucleo (1344) 530 68.2 7.1e-10
XP_005266098 (OMIM: 608136,608236) PREDICTED: rho (1345) 530 68.2 7.1e-10
XP_016869492 (OMIM: 608136,608236) PREDICTED: rho (1369) 530 68.2 7.2e-10
NP_001295082 (OMIM: 608136,608236) rho guanine nuc (1368) 514 66.6 2.2e-09
XP_006720932 (OMIM: 605431) PREDICTED: C-Jun-amino (1083) 426 57.7 7.9e-07
XP_011520735 (OMIM: 605431) PREDICTED: C-Jun-amino (1177) 426 57.8 8.4e-07
XP_016878570 (OMIM: 605431) PREDICTED: C-Jun-amino (1179) 426 57.8 8.4e-07
XP_005255247 (OMIM: 605431) PREDICTED: C-Jun-amino (1322) 426 57.8 9.2e-07
XP_016878569 (OMIM: 605431) PREDICTED: C-Jun-amino (1328) 426 57.8 9.2e-07
NP_001035529 (OMIM: 605431) C-Jun-amino-terminal k (1330) 426 57.8 9.2e-07
XP_011520734 (OMIM: 605431) PREDICTED: C-Jun-amino (1330) 426 57.8 9.2e-07
XP_016878568 (OMIM: 605431) PREDICTED: C-Jun-amino (1331) 426 57.8 9.2e-07
NP_055948 (OMIM: 605431) C-Jun-amino-terminal kina (1336) 426 57.8 9.3e-07
XP_011520733 (OMIM: 605431) PREDICTED: C-Jun-amino (1336) 426 57.8 9.3e-07
NP_001305781 (OMIM: 605431) C-Jun-amino-terminal k (1337) 426 57.8 9.3e-07
XP_011520732 (OMIM: 605431) PREDICTED: C-Jun-amino (1339) 426 57.8 9.3e-07
XP_011520731 (OMIM: 605431) PREDICTED: C-Jun-amino (1345) 426 57.8 9.3e-07
XP_016880774 (OMIM: 605430) PREDICTED: C-Jun-amino (1169) 421 57.3 1.2e-06
NP_001238900 (OMIM: 605430) C-Jun-amino-terminal k (1177) 421 57.3 1.2e-06
XP_016880772 (OMIM: 605430) PREDICTED: C-Jun-amino (1191) 421 57.3 1.2e-06
XP_005257831 (OMIM: 605430) PREDICTED: C-Jun-amino (1164) 420 57.2 1.3e-06
>>NP_055601 (OMIM: 617043) rho guanine nucleotide exchan (2063 aa)
initn: 14049 init1: 14049 opt: 14049 Z-score: 7569.5 bits: 1414.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 14049; 100.0% identity (100.0% similar) in 2063 aa overlap (1-2063:1-2063)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MADGAPRPQLYRSVSFKLLERWSGGPGLREEDTDTPGLRRRASCRPTTAARGQPSRRVSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MADGAPRPQLYRSVSFKLLERWSGGPGLREEDTDTPGLRRRASCRPTTAARGQPSRRVSK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 LASGPLAAPAQPRPLRSLSPSVRQLSRRFDAPRLDDGSAGTRDGGVLPAAAEEAAEGPAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LASGPLAAPAQPRPLRSLSPSVRQLSRRFDAPRLDDGSAGTRDGGVLPAAAEEAAEGPAR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 GAWPSVTEMRKLFGGPGSRRPSADSESPGTPSPDGAAWEPPARESRQPPTPPPRTCFPLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GAWPSVTEMRKLFGGPGSRRPSADSESPGTPSPDGAAWEPPARESRQPPTPPPRTCFPLA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 GLRSARPLTGPETEGRLRRPQQQQERAQRPADGLHSWHIFSQPQAGARASCSSSSIAASY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GLRSARPLTGPETEGRLRRPQQQQERAQRPADGLHSWHIFSQPQAGARASCSSSSIAASY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 PVSRSRAASSSEEEEEGPPQLPGAQSPAYHGGHSSGSDDDRDGEGGHRWGGRPGLRPGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PVSRSRAASSSEEEEEGPPQLPGAQSPAYHGGHSSGSDDDRDGEGGHRWGGRPGLRPGSS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LLDQDCRPDSDGLNLSSMNSAGVSGSPEPPTSPRAPREEGLREWGSGSPPCVPGPQEGLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LLDQDCRPDSDGLNLSSMNSAGVSGSPEPPTSPRAPREEGLREWGSGSPPCVPGPQEGLR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 PMSDSVGGAFRVAKVSFPSYLASPAGSRGSSRYSSTETLKDDDLWSSRGSGGWGVYRSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PMSDSVGGAFRVAKVSFPSYLASPAGSRGSSRYSSTETLKDDDLWSSRGSGGWGVYRSPS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 FGAGEGLLRSQARTRAKGPGGTSRALRDGGFEPEKSRQRKSLSNPDIASETLTLLSFLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FGAGEGLLRSQARTRAKGPGGTSRALRDGGFEPEKSRQRKSLSNPDIASETLTLLSFLRS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 DLSELRVRKPGGSSGDRGSNPLDGRDSPSAGGPVGQLEPIPIPAPASPGTRPTLKDLTAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DLSELRVRKPGGSSGDRGSNPLDGRDSPSAGGPVGQLEPIPIPAPASPGTRPTLKDLTAT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 LRRAKSFTCSEKPMARRLPRTSALKSSSSELLLTGPGAEEDPLPLIVQDQYVQEARQVFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LRRAKSFTCSEKPMARRLPRTSALKSSSSELLLTGPGAEEDPLPLIVQDQYVQEARQVFE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 KIQRMGAQQDDGSDAPPGSPDWAGDVTRGQRSQEELSGPESSLTDEGIGADPEPPVAAFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KIQRMGAQQDDGSDAPPGSPDWAGDVTRGQRSQEELSGPESSLTDEGIGADPEPPVAAFC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 GLGTTGMWRPLSSSSAQTNHHGPGTEDSLGGWALVSPETPPTPGALRRRRKVPPSGSGGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GLGTTGMWRPLSSSSAQTNHHGPGTEDSLGGWALVSPETPPTPGALRRRRKVPPSGSGGS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 ELSNGEAGEAYRSLSDPIPQRHRAATSEEPTGFSVDSNLLGSLSPKTGLPATSAMDEGLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ELSNGEAGEAYRSLSDPIPQRHRAATSEEPTGFSVDSNLLGSLSPKTGLPATSAMDEGLT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 SGHSDWSVGSEESKGYQEVIQSIVQGPGTLGRVVDDRIAGKAPKKKSLSDPSRRGELAGP
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NP_055 SGHSDWSVGSEESKGYQEVIQSIVQGPGTLGRVVDDRIAGKAPKKKSLSDPSRRGELAGP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 GFEGPGGEPIREVEPMLPPSSSEPILVEQRAEPEEPGATRSRAQSERALPEALPPPATAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GFEGPGGEPIREVEPMLPPSSSEPILVEQRAEPEEPGATRSRAQSERALPEALPPPATAH
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 RNFHLDPKLADILSPRLIRRGSKKRPARSSHQELRRDEGSQDQTGSLSRARPSSRHVRHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RNFHLDPKLADILSPRLIRRGSKKRPARSSHQELRRDEGSQDQTGSLSRARPSSRHVRHA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 SVPATFMPIVVPEPPTSVGPPVAVPEPIGFPTRAHPTLQAPSLEDVTKQYMLNLHSGEVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SVPATFMPIVVPEPPTSVGPPVAVPEPIGFPTRAHPTLQAPSLEDVTKQYMLNLHSGEVP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 APVPVDMPCLPLAAPPSAEAKPPEAARPADEPTPASKCCSKPQVDMRKHVAMTLLDTEQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 APVPVDMPCLPLAAPPSAEAKPPEAARPADEPTPASKCCSKPQVDMRKHVAMTLLDTEQS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE3 YVESLRTLMQGYMQPLKQPENSVLCDPSLVDEIFDQIPELLEHHEQFLEQVRHCMQTWHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 YVESLRTLMQGYMQPLKQPENSVLCDPSLVDEIFDQIPELLEHHEQFLEQVRHCMQTWHA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE3 QQKVGALLVQSFSKDVLVNIYSAYIDNFLNAKDAVRVAKEARPAFLKFLEQSMRENKEKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QQKVGALLVQSFSKDVLVNIYSAYIDNFLNAKDAVRVAKEARPAFLKFLEQSMRENKEKQ
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE3 ALSDLMIKPVQRIPRYELLVKDLLKHTPEDHPDHPLLLEAQRNIKQVAERINKGVRSAEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ALSDLMIKPVQRIPRYELLVKDLLKHTPEDHPDHPLLLEAQRNIKQVAERINKGVRSAEE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE3 AERHARVLQEIEAHIEGMEDLQAPLRRFLRQEMVIEVKAIGGKKDRSLFLFTDLIVCTTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 AERHARVLQEIEAHIEGMEDLQAPLRRFLRQEMVIEVKAIGGKKDRSLFLFTDLIVCTTL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE3 KRKSGSLRRSSMSLYTAASVIDTASKYKMLWKLPLEDADIIKGASQATNRENIQKAISRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KRKSGSLRRSSMSLYTAASVIDTASKYKMLWKLPLEDADIIKGASQATNRENIQKAISRL
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE3 DEDLTTLGQMSKLSESLGFPHQSLDDALRDLSAAMHRDLSEKQALCYALSFPPTKLELCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DEDLTTLGQMSKLSESLGFPHQSLDDALRDLSAAMHRDLSEKQALCYALSFPPTKLELCA
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE3 TRPEGTDSYIFEFPHPDARLGFEQAFDEAKRKLASSKSCLDPEFLKAIPIMKTRSGMQFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TRPEGTDSYIFEFPHPDARLGFEQAFDEAKRKLASSKSCLDPEFLKAIPIMKTRSGMQFS
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE3 CAAPTLNSCPEPSPEVWVCNSDGYVGQVCLLSLRAEPDVEACIAVCSARILCIGAVPGLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 CAAPTLNSCPEPSPEVWVCNSDGYVGQVCLLSLRAEPDVEACIAVCSARILCIGAVPGLQ
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE3 PRCHREPPPSLRSPPETAPEPAGPELDVEAAADEEAATLAEPGPQPCLHISIAGSGLEMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PRCHREPPPSLRSPPETAPEPAGPELDVEAAADEEAATLAEPGPQPCLHISIAGSGLEMT
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE3 PGLGEGDPRPELVPFDSDSDDESSPSPSGTLQSQASRSTISSSFGNEETPSSKEATAETT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PGLGEGDPRPELVPFDSDSDDESSPSPSGTLQSQASRSTISSSFGNEETPSSKEATAETT
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE3 SSEEEQEPGFLPLSGSFGPGGPCGTSPMDGRALRRSSHGSFTRGSLEDLLSVDPEAYQSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SSEEEQEPGFLPLSGSFGPGGPCGTSPMDGRALRRSSHGSFTRGSLEDLLSVDPEAYQSS
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE3 VWLGTEDGCVHVYQSSDSIRDRRNSMKLQHAASVTCILYLNNQVFVSLANGELVVYQREA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VWLGTEDGCVHVYQSSDSIRDRRNSMKLQHAASVTCILYLNNQVFVSLANGELVVYQREA
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE3 GHFWDPQNFKSVTLGTQGSPITKMVSVGGRLWCGCQNRVLVLSPDTLQLEHMFYVGQDSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GHFWDPQNFKSVTLGTQGSPITKMVSVGGRLWCGCQNRVLVLSPDTLQLEHMFYVGQDSS
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE3 RCVACMVDSSLGVWVTLKGSAHVCLYHPDTFEQLAEVDVTPPVHRMLAGSDAIIRQHKAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RCVACMVDSSLGVWVTLKGSAHVCLYHPDTFEQLAEVDVTPPVHRMLAGSDAIIRQHKAA
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE3 CLRITALLVCEELLWVGTSAGVVLTMPTSPGTVSCPRAPLSPTGLGQGHTGHVRFLAAVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 CLRITALLVCEELLWVGTSAGVVLTMPTSPGTVSCPRAPLSPTGLGQGHTGHVRFLAAVQ
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KE3 LPDGFNLLCPTPPPPPDTGPEKLPSLEHRDSPWHRGPAPARPKMLVISGGDGYEDFRLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LPDGFNLLCPTPPPPPDTGPEKLPSLEHRDSPWHRGPAPARPKMLVISGGDGYEDFRLSS
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060
pF1KE3 GGGSSSETVGRDDSTNHLLLWRV
:::::::::::::::::::::::
NP_055 GGGSSSETVGRDDSTNHLLLWRV
2050 2060
>>XP_016874112 (OMIM: 617043) PREDICTED: rho guanine nuc (1057 aa)
initn: 6746 init1: 6746 opt: 6746 Z-score: 3644.1 bits: 686.9 E(85289): 3.1e-196
Smith-Waterman score: 6746; 100.0% identity (100.0% similar) in 999 aa overlap (1065-2063:59-1057)
1040 1050 1060 1070 1080 1090
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::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KKKRLGDPGGESRRRAARLQGQVEGVAAGKDMRKHVAMTLLDTEQSYVESLRTLMQGYMQ
30 40 50 60 70 80
1100 1110 1120 1130 1140 1150
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PLKQPENSVLCDPSLVDEIFDQIPELLEHHEQFLEQVRHCMQTWHAQQKVGALLVQSFSK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DVLVNIYSAYIDNFLNAKDAVRVAKEARPAFLKFLEQSMRENKEKQALSDLMIKPVQRIP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RYELLVKDLLKHTPEDHPDHPLLLEAQRNIKQVAERINKGVRSAEEAERHARVLQEIEAH
210 220 230 240 250 260
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IEGMEDLQAPLRRFLRQEMVIEVKAIGGKKDRSLFLFTDLIVCTTLKRKSGSLRRSSMSL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YTAASVIDTASKYKMLWKLPLEDADIIKGASQATNRENIQKAISRLDEDLTTLGQMSKLS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ESLGFPHQSLDDALRDLSAAMHRDLSEKQALCYALSFPPTKLELCATRPEGTDSYIFEFP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HPDARLGFEQAFDEAKRKLASSKSCLDPEFLKAIPIMKTRSGMQFSCAAPTLNSCPEPSP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EVWVCNSDGYVGQVCLLSLRAEPDVEACIAVCSARILCIGAVPGLQPRCHREPPPSLRSP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PETAPEPAGPELDVEAAADEEAATLAEPGPQPCLHISIAGSGLEMTPGLGEGDPRPELVP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FDSDSDDESSPSPSGTLQSQASRSTISSSFGNEETPSSKEATAETTSSEEEQEPGFLPLS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GSFGPGGPCGTSPMDGRALRRSSHGSFTRGSLEDLLSVDPEAYQSSVWLGTEDGCVHVYQ
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1760 1770 1780 1790 1800 1810
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SSDSIRDRRNSMKLQHAASVTCILYLNNQVFVSLANGELVVYQREAGHFWDPQNFKSVTL
750 760 770 780 790 800
1820 1830 1840 1850 1860 1870
pF1KE3 GTQGSPITKMVSVGGRLWCGCQNRVLVLSPDTLQLEHMFYVGQDSSRCVACMVDSSLGVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GTQGSPITKMVSVGGRLWCGCQNRVLVLSPDTLQLEHMFYVGQDSSRCVACMVDSSLGVW
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1880 1890 1900 1910 1920 1930
pF1KE3 VTLKGSAHVCLYHPDTFEQLAEVDVTPPVHRMLAGSDAIIRQHKAACLRITALLVCEELL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VTLKGSAHVCLYHPDTFEQLAEVDVTPPVHRMLAGSDAIIRQHKAACLRITALLVCEELL
870 880 890 900 910 920
1940 1950 1960 1970 1980 1990
pF1KE3 WVGTSAGVVLTMPTSPGTVSCPRAPLSPTGLGQGHTGHVRFLAAVQLPDGFNLLCPTPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WVGTSAGVVLTMPTSPGTVSCPRAPLSPTGLGQGHTGHVRFLAAVQLPDGFNLLCPTPPP
930 940 950 960 970 980
2000 2010 2020 2030 2040 2050
pF1KE3 PPDTGPEKLPSLEHRDSPWHRGPAPARPKMLVISGGDGYEDFRLSSGGGSSSETVGRDDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PPDTGPEKLPSLEHRDSPWHRGPAPARPKMLVISGGDGYEDFRLSSGGGSSSETVGRDDS
990 1000 1010 1020 1030 1040
2060
pF1KE3 TNHLLLWRV
:::::::::
XP_016 TNHLLLWRV
1050
>>XP_016874113 (OMIM: 617043) PREDICTED: rho guanine nuc (971 aa)
initn: 6569 init1: 6569 opt: 6569 Z-score: 3549.4 bits: 669.3 E(85289): 5.8e-191
Smith-Waterman score: 6569; 100.0% identity (100.0% similar) in 971 aa overlap (1093-2063:1-971)
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KE3 QVDMRKHVAMTLLDTEQSYVESLRTLMQGYMQPLKQPENSVLCDPSLVDEIFDQIPELLE
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MQPLKQPENSVLCDPSLVDEIFDQIPELLE
10 20 30
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KE3 HHEQFLEQVRHCMQTWHAQQKVGALLVQSFSKDVLVNIYSAYIDNFLNAKDAVRVAKEAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HHEQFLEQVRHCMQTWHAQQKVGALLVQSFSKDVLVNIYSAYIDNFLNAKDAVRVAKEAR
40 50 60 70 80 90
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pF1KE3 PAFLKFLEQSMRENKEKQALSDLMIKPVQRIPRYELLVKDLLKHTPEDHPDHPLLLEAQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PAFLKFLEQSMRENKEKQALSDLMIKPVQRIPRYELLVKDLLKHTPEDHPDHPLLLEAQR
100 110 120 130 140 150
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KE3 NIKQVAERINKGVRSAEEAERHARVLQEIEAHIEGMEDLQAPLRRFLRQEMVIEVKAIGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NIKQVAERINKGVRSAEEAERHARVLQEIEAHIEGMEDLQAPLRRFLRQEMVIEVKAIGG
160 170 180 190 200 210
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pF1KE3 KKDRSLFLFTDLIVCTTLKRKSGSLRRSSMSLYTAASVIDTASKYKMLWKLPLEDADIIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KKDRSLFLFTDLIVCTTLKRKSGSLRRSSMSLYTAASVIDTASKYKMLWKLPLEDADIIK
220 230 240 250 260 270
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pF1KE3 GASQATNRENIQKAISRLDEDLTTLGQMSKLSESLGFPHQSLDDALRDLSAAMHRDLSEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GASQATNRENIQKAISRLDEDLTTLGQMSKLSESLGFPHQSLDDALRDLSAAMHRDLSEK
280 290 300 310 320 330
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QALCYALSFPPTKLELCATRPEGTDSYIFEFPHPDARLGFEQAFDEAKRKLASSKSCLDP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EFLKAIPIMKTRSGMQFSCAAPTLNSCPEPSPEVWVCNSDGYVGQVCLLSLRAEPDVEAC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GPQPCLHISIAGSGLEMTPGLGEGDPRPELVPFDSDSDDESSPSPSGTLQSQASRSTISS
520 530 540 550 560 570
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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580 590 600 610 620 630
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RGSLEDLLSVDPEAYQSSVWLGTEDGCVHVYQSSDSIRDRRNSMKLQHAASVTCILYLNN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QVFVSLANGELVVYQREAGHFWDPQNFKSVTLGTQGSPITKMVSVGGRLWCGCQNRVLVL
700 710 720 730 740 750
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SPDTLQLEHMFYVGQDSSRCVACMVDSSLGVWVTLKGSAHVCLYHPDTFEQLAEVDVTPP
760 770 780 790 800 810
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VHRMLAGSDAIIRQHKAACLRITALLVCEELLWVGTSAGVVLTMPTSPGTVSCPRAPLSP
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1970 1980 1990 2000 2010 2020
pF1KE3 TGLGQGHTGHVRFLAAVQLPDGFNLLCPTPPPPPDTGPEKLPSLEHRDSPWHRGPAPARP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TGLGQGHTGHVRFLAAVQLPDGFNLLCPTPPPPPDTGPEKLPSLEHRDSPWHRGPAPARP
880 890 900 910 920 930
2030 2040 2050 2060
pF1KE3 KMLVISGGDGYEDFRLSSGGGSSSETVGRDDSTNHLLLWRV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KMLVISGGDGYEDFRLSSGGGSSSETVGRDDSTNHLLLWRV
940 950 960 970
>>XP_016857107 (OMIM: 612494) PREDICTED: rho guanine nuc (1042 aa)
initn: 657 init1: 283 opt: 556 Z-score: 313.7 bits: 70.7 E(85289): 9.8e-11
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pF1KE3 PTLQAPSLEDVTKQYMLNLHSGEVPAPVPVDMPCLPLAAPPSAEAKPPEAARPADEPTPA
:: : ... .. ::: : : :
XP_016 KDGLEKTRMAVMRKVSFLHRKDVLGDSEEEDMGLLEVSV---SDIKPPA---PELGPMPE
20 30 40 50 60 70
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pF1KE3 SKCCSKPQVDMRKHVAMTLLDTEQSYVESLRTLMQGYMQPLKQPENSVLCDPSLVDEIFD
. .:: .:.:. .....: ::::::. ..: : .:: . : ..: . . .:
XP_016 GL---SPQQVVRRHILGSIVQSEGSYVESLKRILQDYRNPLMEMEPKAL-SARKCQVVFF
80 90 100 110 120
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pF1KE3 QIPELLEHHEQFLEQVRHCMQTWHAQQKVGALLVQSFSKDVLVNIYSAYIDNFLNAKDAV
.. :.:. : .: . . : . .:.: :.: ::::......:: :..:: .: . .
XP_016 RVKEILHCHSMFQIALSSRVAEWDSTEKIGDLFVASFSKSMVLDVYSDYVNNFTSAMSII
130 140 150 160 170 180
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pF1KE3 RVAKEARPAFLKFLEQSMRENKEKQALSDLMIKPVQRIPRYELLVKDLLKHTPEDHPDHP
. : ..::::.::.. . . .. .: ::.::.::.:.. ::..:.::.::. :::.
XP_016 KKACLTKPAFLEFLKRRQVCSPDRVTLYGLMVKPIQRFPQFILLLQDMLKNTPRGHPDRL
190 200 210 220 230 240
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pF1KE3 LLLEAQRNIKQVAERINKGVRSAEEAERHARVLQEIEAHIEGMEDLQAPLRRFLRQEMVI
: : ... .::..:. : :... . .. . . . . : . :..: : .
XP_016 SLQLALTELETLAEKLNEQKRLADQVAEIQQLTKSVSDRSSLNKLLTSGQRQLLLCETLT
250 260 270 280 290 300
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pF1KE3 E-VKAIGGK----KDRSLFLFTDLIVCTTLKRKSGSLRRSSMSLYTAASVIDTASKYKML
: : . :. :.: .::..:..::.... : .. .:... . .:.. . :: .
XP_016 ETVYGDRGQLIKSKERRVFLLNDMLVCANINFKPAN-HRGQLEI---SSLVPLGPKYVVK
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pF1KE3 WKLPLEDADIIK-GASQAT-NRENIQKAISRLDEDLTTLGQMSKLSESLGFPH--QSLDD
:. : ...... : . .: ...:. : . .. :: .. . :: :. : :.:
XP_016 WNTALPQVQVVEVGQDGGTYDKDNVLIQHSGAKKA-SASGQAQN-KVYLGPPRLFQELQD
370 380 390 400 410 420
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pF1KE3 ALRDLSAAMHRDLSEKQALCYALSFPPTKLELCATRPEGTDSYIFEFPHPDARLGFEQAF
.::... .. : . .:: . . : :.... .
XP_016 LQKDLAVV-------------------EQITLLISTLHGTYQNLNMTVAQDWCLALQRLM
430 440 450 460
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pF1KE3 DEAKRKLASSKSCLDPEFLKAIPIMKTRSGMQFSCAAPTLNSCPEPSPEV-WVCNSDGYV
.... :...: .: . : .:: .: . .. :.: .. ::
XP_016 RVKEEEIHSANKCRLRLLLPGKP---DKSGRPISFMVVFIT--PNPLSKISWVNRL----
470 480 490 500 510
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pF1KE3 GQVCLLSLRAEPDVEACIAVCSARILCIGAVPGLQPRCHREPPPSLRSPPETAPEPAG--
.. ..:: : . :: : : : . : : :
XP_016 -HLAKIGLREENQ------------------PGWL--CPDEDKKS--KAPFWCPILACCI
520 530 540 550
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pF1KE3 PELDVEAAADEEAATLAEPGPQPCLHISIAGSGLEMTPGLGEGDPRPELVPFDSDSDDES
: .. .: . . .: . : : : .: ....:
XP_016 PAFSSRALSLQLGALVHSPVNCPLLGFSAVSTSL--------------------------
560 570 580
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pF1KE3 SPSPSGTLQSQASRSTISSSFGNEETPSSKEATAETTSSEEEQEPGFLPLSGSFGPGGPC
:.: : ... .. :. : : .. . .:..: : : . :
XP_016 ---PQGYLWVGGGQE---GAGGQVEIFSLNRPSPRTVKSFPLAAP---VLCMEYIP----
590 600 610 620 630
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pF1KE3 GTSPMDGRALRRSSHGSFTRGSLEDLLSVDPEA-YQSSVWLGTEDGCVHVYQSSDSIRDR
.. .: :. :. .:: : . .. :: .:: . .:.: :. .
XP_016 ---ELEEEAESRD----------ESPTVADPSATVHPTICLGLQDGSILLYSSVDTGTQC
640 650 660 670
1770 1780 1790 1800 1810 1820
pF1KE3 RNSMKLQHAASVTCILYLNNQVFVSLANGELVVYQREAGH-FWDPQNFKSVTLGTQGSPI
: . : :. . .....: .: :..: : .: .:: .. : : . .:.
XP_016 LVSCRSPGLQPVLCLRHSPFHLLAGLQDGTLAAYPRTSGGVLWDLES-PPVCLTVGPGPV
680 690 700 710 720 730
1830 1840 1850 1860 1870 1880
pF1KE3 TKMVSVGGRLWCGCQNRVLVLSPDTLQLEHMFYVGQDSSRCVACMVDSSLGVWVTLKGSA
..:. .: .: :: :: ::: .. : . :: . :. :: .. :::.......
XP_016 RTLLSLEDAVWASCGPRVTVLEATTLQPQQSFEAHQDEAVSVTHMVKAGSGVWMAFSSGT
740 750 760 770 780 790
1890 1900 1910 1920 1930 1940
pF1KE3 HVCLYHPDTFEQLAEVDVTPPVHRMLAGSDAIIRQHKAACLRITALLVCEELLWVGTSAG
. :.: .:.:.: :.... . .: : .: : .:.::.:. ::::::. :
XP_016 SIRLFHTETLEHLQEINIATRTTFLLPG-------QKHLC--VTSLLICQGLLWVGTDQG
800 810 820 830 840
1950 1960 1970 1980
pF1KE3 VVLTMPTSPGTVSCPRAPLSPTGLGQ----GHTGHVRFLA---AVQLPD----------G
:.. .:. : . :. :: :. :: : : ::: .. :: :
XP_016 VIVLLPV-PRLEGIPKI----TGKGMVSLNGHCGPVAFLAVATSILAPDILRSDQEEAEG
850 860 870 880 890 900
1990 2000 2010 2020
pF1KE3 FNLLCPTPP-----PPPDT--GPE-----------KLPSLEHRDSPW--HRGPAPA----
: : ::. : : .: : : .: : ::::
XP_016 PRAEEDKPDGQAHEPMPDSHVGRELTRKKGILLQYRLRSTAHLPGPLLSMREPAPADGAA
910 920 930 940 950 960
2030 2040
pF1KE3 -----------------------RP-----------KMLVISGGDGYEDFRLSSGGGSSS
:: .. .::::.::..: . :... .
XP_016 LEHSEEDGSIYEMADDPDIWVRSRPCARDAHRKEICSVAIISGGQGYRNFGSALGSSGRQ
970 980 990 1000 1010 1020
2050 2060
pF1KE3 ETVGRDDSTNHLLLWRV
:. ::: ::.:.:
XP_016 APCGETDST--LLIWQVPLML
1030 1040
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