Result of FASTA (ccds) for
pF1KE3547
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3547, 2063 aa
1>>>pF1KE3547 2063 - 2063 aa - 2063 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.8274+/-0.000989; mu= 7.2340+/- 0.060
mean_var=295.9830+/-59.974, 0's: 0 Z-trim(114.9): 120 B-trim: 172 in 1/52
Lambda= 0.074549
statistics sampled from 15332 (15452) to 15332 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.756), E-opt: 0.2 (0.475), width: 16
Scan time: 4.700
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8221.1 ARHGEF17 gene_id:9828|Hs108|chr11 (2063) 14049 1526.1 0
CCDS30617.1 ARHGEF10L gene_id:55160|Hs108|chr1 (1240) 556 74.7 2.7e-12
CCDS182.1 ARHGEF10L gene_id:55160|Hs108|chr1 (1279) 556 74.7 2.8e-12
CCDS78297.1 ARHGEF10 gene_id:9639|Hs108|chr8 (1306) 530 71.9 2e-11
CCDS34794.1 ARHGEF10 gene_id:9639|Hs108|chr8 (1344) 530 71.9 2e-11
CCDS78296.1 ARHGEF10 gene_id:9639|Hs108|chr8 (1368) 514 70.2 6.7e-11
>>CCDS8221.1 ARHGEF17 gene_id:9828|Hs108|chr11 (2063 aa)
initn: 14049 init1: 14049 opt: 14049 Z-score: 8174.1 bits: 1526.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 14049; 100.0% identity (100.0% similar) in 2063 aa overlap (1-2063:1-2063)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MADGAPRPQLYRSVSFKLLERWSGGPGLREEDTDTPGLRRRASCRPTTAARGQPSRRVSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MADGAPRPQLYRSVSFKLLERWSGGPGLREEDTDTPGLRRRASCRPTTAARGQPSRRVSK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 LASGPLAAPAQPRPLRSLSPSVRQLSRRFDAPRLDDGSAGTRDGGVLPAAAEEAAEGPAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LASGPLAAPAQPRPLRSLSPSVRQLSRRFDAPRLDDGSAGTRDGGVLPAAAEEAAEGPAR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 GAWPSVTEMRKLFGGPGSRRPSADSESPGTPSPDGAAWEPPARESRQPPTPPPRTCFPLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GAWPSVTEMRKLFGGPGSRRPSADSESPGTPSPDGAAWEPPARESRQPPTPPPRTCFPLA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 GLRSARPLTGPETEGRLRRPQQQQERAQRPADGLHSWHIFSQPQAGARASCSSSSIAASY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GLRSARPLTGPETEGRLRRPQQQQERAQRPADGLHSWHIFSQPQAGARASCSSSSIAASY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 PVSRSRAASSSEEEEEGPPQLPGAQSPAYHGGHSSGSDDDRDGEGGHRWGGRPGLRPGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PVSRSRAASSSEEEEEGPPQLPGAQSPAYHGGHSSGSDDDRDGEGGHRWGGRPGLRPGSS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LLDQDCRPDSDGLNLSSMNSAGVSGSPEPPTSPRAPREEGLREWGSGSPPCVPGPQEGLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LLDQDCRPDSDGLNLSSMNSAGVSGSPEPPTSPRAPREEGLREWGSGSPPCVPGPQEGLR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 PMSDSVGGAFRVAKVSFPSYLASPAGSRGSSRYSSTETLKDDDLWSSRGSGGWGVYRSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PMSDSVGGAFRVAKVSFPSYLASPAGSRGSSRYSSTETLKDDDLWSSRGSGGWGVYRSPS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 FGAGEGLLRSQARTRAKGPGGTSRALRDGGFEPEKSRQRKSLSNPDIASETLTLLSFLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 FGAGEGLLRSQARTRAKGPGGTSRALRDGGFEPEKSRQRKSLSNPDIASETLTLLSFLRS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 DLSELRVRKPGGSSGDRGSNPLDGRDSPSAGGPVGQLEPIPIPAPASPGTRPTLKDLTAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 DLSELRVRKPGGSSGDRGSNPLDGRDSPSAGGPVGQLEPIPIPAPASPGTRPTLKDLTAT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 LRRAKSFTCSEKPMARRLPRTSALKSSSSELLLTGPGAEEDPLPLIVQDQYVQEARQVFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LRRAKSFTCSEKPMARRLPRTSALKSSSSELLLTGPGAEEDPLPLIVQDQYVQEARQVFE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 KIQRMGAQQDDGSDAPPGSPDWAGDVTRGQRSQEELSGPESSLTDEGIGADPEPPVAAFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KIQRMGAQQDDGSDAPPGSPDWAGDVTRGQRSQEELSGPESSLTDEGIGADPEPPVAAFC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 GLGTTGMWRPLSSSSAQTNHHGPGTEDSLGGWALVSPETPPTPGALRRRRKVPPSGSGGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GLGTTGMWRPLSSSSAQTNHHGPGTEDSLGGWALVSPETPPTPGALRRRRKVPPSGSGGS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 ELSNGEAGEAYRSLSDPIPQRHRAATSEEPTGFSVDSNLLGSLSPKTGLPATSAMDEGLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ELSNGEAGEAYRSLSDPIPQRHRAATSEEPTGFSVDSNLLGSLSPKTGLPATSAMDEGLT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 SGHSDWSVGSEESKGYQEVIQSIVQGPGTLGRVVDDRIAGKAPKKKSLSDPSRRGELAGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SGHSDWSVGSEESKGYQEVIQSIVQGPGTLGRVVDDRIAGKAPKKKSLSDPSRRGELAGP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 GFEGPGGEPIREVEPMLPPSSSEPILVEQRAEPEEPGATRSRAQSERALPEALPPPATAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GFEGPGGEPIREVEPMLPPSSSEPILVEQRAEPEEPGATRSRAQSERALPEALPPPATAH
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 RNFHLDPKLADILSPRLIRRGSKKRPARSSHQELRRDEGSQDQTGSLSRARPSSRHVRHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RNFHLDPKLADILSPRLIRRGSKKRPARSSHQELRRDEGSQDQTGSLSRARPSSRHVRHA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 SVPATFMPIVVPEPPTSVGPPVAVPEPIGFPTRAHPTLQAPSLEDVTKQYMLNLHSGEVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SVPATFMPIVVPEPPTSVGPPVAVPEPIGFPTRAHPTLQAPSLEDVTKQYMLNLHSGEVP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 APVPVDMPCLPLAAPPSAEAKPPEAARPADEPTPASKCCSKPQVDMRKHVAMTLLDTEQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 APVPVDMPCLPLAAPPSAEAKPPEAARPADEPTPASKCCSKPQVDMRKHVAMTLLDTEQS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE3 YVESLRTLMQGYMQPLKQPENSVLCDPSLVDEIFDQIPELLEHHEQFLEQVRHCMQTWHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 YVESLRTLMQGYMQPLKQPENSVLCDPSLVDEIFDQIPELLEHHEQFLEQVRHCMQTWHA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE3 QQKVGALLVQSFSKDVLVNIYSAYIDNFLNAKDAVRVAKEARPAFLKFLEQSMRENKEKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QQKVGALLVQSFSKDVLVNIYSAYIDNFLNAKDAVRVAKEARPAFLKFLEQSMRENKEKQ
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE3 ALSDLMIKPVQRIPRYELLVKDLLKHTPEDHPDHPLLLEAQRNIKQVAERINKGVRSAEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ALSDLMIKPVQRIPRYELLVKDLLKHTPEDHPDHPLLLEAQRNIKQVAERINKGVRSAEE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE3 AERHARVLQEIEAHIEGMEDLQAPLRRFLRQEMVIEVKAIGGKKDRSLFLFTDLIVCTTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AERHARVLQEIEAHIEGMEDLQAPLRRFLRQEMVIEVKAIGGKKDRSLFLFTDLIVCTTL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE3 KRKSGSLRRSSMSLYTAASVIDTASKYKMLWKLPLEDADIIKGASQATNRENIQKAISRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KRKSGSLRRSSMSLYTAASVIDTASKYKMLWKLPLEDADIIKGASQATNRENIQKAISRL
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE3 DEDLTTLGQMSKLSESLGFPHQSLDDALRDLSAAMHRDLSEKQALCYALSFPPTKLELCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 DEDLTTLGQMSKLSESLGFPHQSLDDALRDLSAAMHRDLSEKQALCYALSFPPTKLELCA
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE3 TRPEGTDSYIFEFPHPDARLGFEQAFDEAKRKLASSKSCLDPEFLKAIPIMKTRSGMQFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TRPEGTDSYIFEFPHPDARLGFEQAFDEAKRKLASSKSCLDPEFLKAIPIMKTRSGMQFS
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE3 CAAPTLNSCPEPSPEVWVCNSDGYVGQVCLLSLRAEPDVEACIAVCSARILCIGAVPGLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 CAAPTLNSCPEPSPEVWVCNSDGYVGQVCLLSLRAEPDVEACIAVCSARILCIGAVPGLQ
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE3 PRCHREPPPSLRSPPETAPEPAGPELDVEAAADEEAATLAEPGPQPCLHISIAGSGLEMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PRCHREPPPSLRSPPETAPEPAGPELDVEAAADEEAATLAEPGPQPCLHISIAGSGLEMT
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE3 PGLGEGDPRPELVPFDSDSDDESSPSPSGTLQSQASRSTISSSFGNEETPSSKEATAETT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PGLGEGDPRPELVPFDSDSDDESSPSPSGTLQSQASRSTISSSFGNEETPSSKEATAETT
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE3 SSEEEQEPGFLPLSGSFGPGGPCGTSPMDGRALRRSSHGSFTRGSLEDLLSVDPEAYQSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SSEEEQEPGFLPLSGSFGPGGPCGTSPMDGRALRRSSHGSFTRGSLEDLLSVDPEAYQSS
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE3 VWLGTEDGCVHVYQSSDSIRDRRNSMKLQHAASVTCILYLNNQVFVSLANGELVVYQREA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VWLGTEDGCVHVYQSSDSIRDRRNSMKLQHAASVTCILYLNNQVFVSLANGELVVYQREA
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE3 GHFWDPQNFKSVTLGTQGSPITKMVSVGGRLWCGCQNRVLVLSPDTLQLEHMFYVGQDSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GHFWDPQNFKSVTLGTQGSPITKMVSVGGRLWCGCQNRVLVLSPDTLQLEHMFYVGQDSS
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE3 RCVACMVDSSLGVWVTLKGSAHVCLYHPDTFEQLAEVDVTPPVHRMLAGSDAIIRQHKAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RCVACMVDSSLGVWVTLKGSAHVCLYHPDTFEQLAEVDVTPPVHRMLAGSDAIIRQHKAA
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE3 CLRITALLVCEELLWVGTSAGVVLTMPTSPGTVSCPRAPLSPTGLGQGHTGHVRFLAAVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 CLRITALLVCEELLWVGTSAGVVLTMPTSPGTVSCPRAPLSPTGLGQGHTGHVRFLAAVQ
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KE3 LPDGFNLLCPTPPPPPDTGPEKLPSLEHRDSPWHRGPAPARPKMLVISGGDGYEDFRLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LPDGFNLLCPTPPPPPDTGPEKLPSLEHRDSPWHRGPAPARPKMLVISGGDGYEDFRLSS
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060
pF1KE3 GGGSSSETVGRDDSTNHLLLWRV
:::::::::::::::::::::::
CCDS82 GGGSSSETVGRDDSTNHLLLWRV
2050 2060
>>CCDS30617.1 ARHGEF10L gene_id:55160|Hs108|chr1 (1240 aa)
initn: 657 init1: 283 opt: 556 Z-score: 334.1 bits: 74.7 E(32554): 2.7e-12
Smith-Waterman score: 789; 24.5% identity (50.6% similar) in 1127 aa overlap (1026-2063:246-1236)
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE3 PTLQAPSLEDVTKQYMLNLHSGEVPAPVPVDMPCLPLAAPPSAEAKPPEAARPADEPTPA
:: : ... .. ::: : : :
CCDS30 KDGLEKTRMAVMRKVSFLHRKDVLGDSEEEDMGLLEVSV---SDIKPPA---PELGPMPE
220 230 240 250 260
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE3 SKCCSKPQVDMRKHVAMTLLDTEQSYVESLRTLMQGYMQPLKQPENSVLCDPSLVDEIFD
. .:: .:.:. .....: ::::::. ..: : .:: . : ..: . . .:
CCDS30 GL---SPQQVVRRHILGSIVQSEGSYVESLKRILQDYRNPLMEMEPKAL-SARKCQVVFF
270 280 290 300 310 320
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE3 QIPELLEHHEQFLEQVRHCMQTWHAQQKVGALLVQSFSKDVLVNIYSAYIDNFLNAKDAV
.. :.:. : .: . . : . .:.: :.: ::::......:: :..:: .: . .
CCDS30 RVKEILHCHSMFQIALSSRVAEWDSTEKIGDLFVASFSKSMVLDVYSDYVNNFTSAMSII
330 340 350 360 370 380
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KE3 RVAKEARPAFLKFLEQSMRENKEKQALSDLMIKPVQRIPRYELLVKDLLKHTPEDHPDHP
. : ..::::.::.. . . .. .: ::.::.::.:.. ::..:.::.::. :::.
CCDS30 KKACLTKPAFLEFLKRRQVCSPDRVTLYGLMVKPIQRFPQFILLLQDMLKNTPRGHPDRL
390 400 410 420 430 440
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KE3 LLLEAQRNIKQVAERINKGVRSAEEAERHARVLQEIEAHIEGMEDLQAPLRRFLRQEMVI
: : ... .::..:. : :... . .. . . . . : . :..: : .
CCDS30 SLQLALTELETLAEKLNEQKRLADQVAEIQQLTKSVSDRSSLNKLLTSGQRQLLLCETLT
450 460 470 480 490 500
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KE3 E-VKAIGGK----KDRSLFLFTDLIVCTTLKRKSGSLRRSSMSLYTAASVIDTASKYKML
: : . :. :.: .::..:..::.... : .. .:... . .:.. . :: .
CCDS30 ETVYGDRGQLIKSKERRVFLLNDMLVCANINFKPAN-HRGQLEI---SSLVPLGPKYVVK
510 520 530 540 550 560
1360 1370 1380 1390 1400
pF1KE3 WKLPLEDADIIK-GASQAT-NRENIQKAISRLDEDLTTLGQMSKLSESLGFPH--QSLDD
:. : ...... : . .: ...:. : . .. :: .. . :: :. : :.:
CCDS30 WNTALPQVQVVEVGQDGGTYDKDNVLIQHSGAKKA-SASGQAQN-KVYLGPPRLFQELQD
570 580 590 600 610
1410 1420 1430 1440 1450 1460
pF1KE3 ALRDLSAAMHRDLSEKQALCYALSFPPTKLELCATRPEGTDSYIFEFPHPDARLGFEQAF
.::... .. : . .:: . . : :.... .
CCDS30 LQKDLAVV-------------------EQITLLISTLHGTYQNLNMTVAQDWCLALQRLM
620 630 640 650 660
1470 1480 1490 1500 1510 1520
pF1KE3 DEAKRKLASSKSCLDPEFLKAIPIMKTRSGMQFSCAAPTLNSCPEPSPEV-WVCNSDGYV
.... :...: .: . : .:: .: . .. :.: .. ::
CCDS30 RVKEEEIHSANKCRLRLLLPGKP---DKSGRPISFMVVFIT--PNPLSKISWVNRL----
670 680 690 700 710
1530 1540 1550 1560 1570 1580
pF1KE3 GQVCLLSLRAEPDVEACIAVCSARILCIGAVPGLQPRCHREPPPSLRSPPETAPEPAG--
.. ..:: : . :: : : : . : : :
CCDS30 -HLAKIGLREENQ------------------PGWL--CPDEDKKS--KAPFWCPILACCI
720 730 740
1590 1600 1610 1620 1630 1640
pF1KE3 PELDVEAAADEEAATLAEPGPQPCLHISIAGSGLEMTPGLGEGDPRPELVPFDSDSDDES
: .. .: . . .: . : : : .: ....:
CCDS30 PAFSSRALSLQLGALVHSPVNCPLLGFSAVSTSL--------------------------
750 760 770 780
1650 1660 1670 1680 1690 1700
pF1KE3 SPSPSGTLQSQASRSTISSSFGNEETPSSKEATAETTSSEEEQEPGFLPLSGSFGPGGPC
:.: : ... .. :. : : .. . .:..: : : . :
CCDS30 ---PQGYLWVGGGQE---GAGGQVEIFSLNRPSPRTVKSFPLAAP---VLCMEYIP----
790 800 810 820
1710 1720 1730 1740 1750 1760
pF1KE3 GTSPMDGRALRRSSHGSFTRGSLEDLLSVDPEA-YQSSVWLGTEDGCVHVYQSSDSIRDR
.. .: :. :. .:: : . .. :: .:: . .:.: :. .
CCDS30 ---ELEEEAESRD----------ESPTVADPSATVHPTICLGLQDGSILLYSSVDTGTQC
830 840 850 860 870
1770 1780 1790 1800 1810 1820
pF1KE3 RNSMKLQHAASVTCILYLNNQVFVSLANGELVVYQREAGH-FWDPQNFKSVTLGTQGSPI
: . : :. . .....: .: :..: : .: .:: .. : : . .:.
CCDS30 LVSCRSPGLQPVLCLRHSPFHLLAGLQDGTLAAYPRTSGGVLWDLES-PPVCLTVGPGPV
880 890 900 910 920 930
1830 1840 1850 1860 1870 1880
pF1KE3 TKMVSVGGRLWCGCQNRVLVLSPDTLQLEHMFYVGQDSSRCVACMVDSSLGVWVTLKGSA
..:. .: .: :: :: ::: .. : . :: . :. :: .. :::.......
CCDS30 RTLLSLEDAVWASCGPRVTVLEATTLQPQQSFEAHQDEAVSVTHMVKAGSGVWMAFSSGT
940 950 960 970 980 990
1890 1900 1910 1920 1930 1940
pF1KE3 HVCLYHPDTFEQLAEVDVTPPVHRMLAGSDAIIRQHKAACLRITALLVCEELLWVGTSAG
. :.: .:.:.: :.... . .: : .: : .:.::.:. ::::::. :
CCDS30 SIRLFHTETLEHLQEINIATRTTFLLPG-------QKHLC--VTSLLICQGLLWVGTDQG
1000 1010 1020 1030 1040
1950 1960 1970 1980
pF1KE3 VVLTMPTSPGTVSCPRAPLSPTGLGQ----GHTGHVRFLA---AVQLPD----------G
:.. .:. : . :. :: :. :: : : ::: .. :: :
CCDS30 VIVLLPV-PRLEGIPKI----TGKGMVSLNGHCGPVAFLAVATSILAPDILRSDQEEAEG
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1990 2000 2010 2020
pF1KE3 FNLLCPTPP-----PPPDT--GPE-----------KLPSLEHRDSPW--HRGPAPA----
: : ::. : : .: : : .: : ::::
CCDS30 PRAEEDKPDGQAHEPMPDSHVGRELTRKKGILLQYRLRSTAHLPGPLLSMREPAPADGAA
1110 1120 1130 1140 1150 1160
2030 2040
pF1KE3 -----------------------RP-----------KMLVISGGDGYEDFRLSSGGGSSS
:: .. .::::.::..: . :... .
CCDS30 LEHSEEDGSIYEMADDPDIWVRSRPCARDAHRKEICSVAIISGGQGYRNFGSALGSSGRQ
1170 1180 1190 1200 1210 1220
2050 2060
pF1KE3 ETVGRDDSTNHLLLWRV
:. ::: ::.:.:
CCDS30 APCGETDST--LLIWQVPLML
1230 1240
>>CCDS182.1 ARHGEF10L gene_id:55160|Hs108|chr1 (1279 aa)
initn: 657 init1: 283 opt: 556 Z-score: 333.9 bits: 74.7 E(32554): 2.8e-12
Smith-Waterman score: 790; 23.5% identity (49.5% similar) in 1466 aa overlap (694-2063:1-1275)
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 TTGMWRPLSSSSAQTNHHGPGTEDSLGGWALVSPETPPTPGALRRRRKVPPSGSGGSELS
..: . :: :. .. :. : : .
CCDS18 MASSNPPPQPAI---GDQLVPGVPGPSSEA
10 20
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 NGEAGEAYRSLSDPIPQRHRAATSEEPT---GFSVDSNLLGSLSPKTGLPATSAMDEGLT
. . :::.. ..: .. .:. :. ..: :. : . : .: :
CCDS18 EDDPGEAFE-FDDSDDEEDTSAALGVPSLAPERDTDPPLIHLDSIPVTDPDPAAAPPG--
30 40 50 60 70 80
790 800 810 820 830
pF1KE3 SGHSDW-SVGSEESKGYQEVIQSIVQGPGTLGRVVDDRIAGKAPKKKSLSDPSRRGELAG
.: : : :. . ... . .: . .. : .: :.. : .. . : .
CCDS18 TGVPAWVSNGDAADAAFSGARHSSWKRKSS--RRID-RFTFPALEEDVIYDDV---PCES
90 100 110 120 130
840 850 860 870 880 890
pF1KE3 PGFEGPGGEPIREVEPMLPPSSSEPILVEQRAEPEEPGATRSRAQSERALPEALPPPATA
: . ::.: :.. .. : .:. . . :. ..:.: ::. ::
CCDS18 PDAHQPGAE--RNLLYEDAHRAGAPRQAEDLGWSSSEFESYSEDSGEEAKPEVEVEPAK-
140 150 160 170 180 190
900 910 920 930 940 950
pF1KE3 HRNFHLDPKLADILSPRLIRRGSKKRPARSSHQELRRDEGSQDQTGSLSRARPSSRHVRH
:: ..::: :: : : :.: ::.... : :..:. ....:
CCDS18 HR-VSFQPKL----SPDLTRL--KERYARTKRDILALRVGGRDM-----------QELKH
200 210 220 230
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE3 ASVPATFMPIVVPEPPTSVG---PPVAVPEPIGFPTRAHPTLQAPSLEDVTKQYMLNLHS
. . . . :. : .:: . ..: : .:: : .
CCDS18 KYDCKMTQLMKAAKSGTKDGLEKTRMAVMRKVSFLHR----------KDV-------LGD
240 250 260 270 280
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE3 GEVPAPVPVDMPCLPLAAPPSAEAKPPEAARPADEPTPASKCCSKPQVDMRKHVAMTLLD
.: :: : ... .. ::: : : : . .:: .:.:. ....
CCDS18 SE-----EEDMGLLEVSV---SDIKPPA---PELGPMPEGL---SPQQVVRRHILGSIVQ
290 300 310 320
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE3 TEQSYVESLRTLMQGYMQPLKQPENSVLCDPSLVDEIFDQIPELLEHHEQFLEQVRHCMQ
.: ::::::. ..: : .:: . : ..: . . .: .. :.:. : .: . .
CCDS18 SEGSYVESLKRILQDYRNPLMEMEPKAL-SARKCQVVFFRVKEILHCHSMFQIALSSRVA
330 340 350 360 370 380
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE3 TWHAQQKVGALLVQSFSKDVLVNIYSAYIDNFLNAKDAVRVAKEARPAFLKFLEQSMREN
: . .:.: :.: ::::......:: :..:: .: . .. : ..::::.::.. . .
CCDS18 EWDSTEKIGDLFVASFSKSMVLDVYSDYVNNFTSAMSIIKKACLTKPAFLEFLKRRQVCS
390 400 410 420 430 440
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KE3 KEKQALSDLMIKPVQRIPRYELLVKDLLKHTPEDHPDHPLLLEAQRNIKQVAERINKGVR
.. .: ::.::.::.:.. ::..:.::.::. :::. : : ... .::..:. :
CCDS18 PDRVTLYGLMVKPIQRFPQFILLLQDMLKNTPRGHPDRLSLQLALTELETLAEKLNEQKR
450 460 470 480 490 500
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KE3 SAEEAERHARVLQEIEAHIEGMEDLQAPLRRFLRQEMVIE-VKAIGGK----KDRSLFLF
:... . .. . . . . : . :..: : . : : . :. :.: .::.
CCDS18 LADQVAEIQQLTKSVSDRSSLNKLLTSGQRQLLLCETLTETVYGDRGQLIKSKERRVFLL
510 520 530 540 550 560
1320 1330 1340 1350 1360
pF1KE3 TDLIVCTTLKRKSGSLRRSSMSLYTAASVIDTASKYKMLWKLPLEDADIIK-GASQAT-N
.:..::.... : .. .:... . .:.. . :: . :. : ...... : . .: .
CCDS18 NDMLVCANINFKPAN-HRGQLEI---SSLVPLGPKYVVKWNTALPQVQVVEVGQDGGTYD
570 580 590 600 610 620
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KE3 RENIQKAISRLDEDLTTLGQMSKLSESLGFPH--QSLDDALRDLSAAMHRDLSEKQALCY
..:. :.. .. . ... . :: :. : :.: .::...
CCDS18 KDNV--LIQHSGAKKASASGQAQNKVYLGPPRLFQELQDLQKDLAVV-------------
630 640 650 660
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KE3 ALSFPPTKLELCATRPEGTDSYIFEFPHPDARLGFEQAFDEAKRKLASSKSCLDPEFLKA
.. : . .:: . . : :.... . .... :...: .: .
CCDS18 ------EQITLLISTLHGTYQNLNMTVAQDWCLALQRLMRVKEEEIHSANKCRLRLLLPG
670 680 690 700 710 720
1490 1500 1510 1520 1530 1540
pF1KE3 IPIMKTRSGMQFSCAAPTLNSCPEPSPEV-WVCNSDGYVGQVCLLSLRAEPDVEACIAVC
: .:: .: . .. :.: .. :: . ..... .:: : .
CCDS18 KP---DKSGRPISFMVVFIT--PNPLSKISWV--NRLHLAKI---GLREENQ--------
730 740 750 760
1550 1560 1570 1580 1590 1600
pF1KE3 SARILCIGAVPGLQPRCHREPPPSLRSPPETAPEPAG--PELDVEAAADEEAATLAEPGP
:: : : : . : : : : .. .: . . .: . :
CCDS18 ----------PGWL--CPDEDKKS--KAPFWCPILACCIPAFSSRALSLQLGALVHSPVN
770 780 790 800
1610 1620 1630 1640 1650 1660
pF1KE3 QPCLHISIAGSGLEMTPGLGEGDPRPELVPFDSDSDDESSPSPSGTLQSQASRSTISSSF
: : .: ....: :.: : ... .
CCDS18 CPLLGFSAVSTSL-----------------------------PQGYLWVGGGQEGAG---
810 820 830
1670 1680 1690 1700 1710 1720
pF1KE3 GNEETPSSKEATAETTSSEEEQEPGFLPLSGSFGPGGPCGTSPMDGRALRRSSHGSFTRG
:. : : .. . .:..: : : . : .. .: :.
CCDS18 GQVEIFSLNRPSPRTVKSFPLAAP---VLCMEYIP-------ELEEEAESRD--------
840 850 860 870
1730 1740 1750 1760 1770 1780
pF1KE3 SLEDLLSVDPEA-YQSSVWLGTEDGCVHVYQSSDSIRDRRNSMKLQHAASVTCILYLNNQ
:. .:: : . .. :: .:: . .:.: :. . : . : :. . .
CCDS18 --ESPTVADPSATVHPTICLGLQDGSILLYSSVDTGTQCLVSCRSPGLQPVLCLRHSPFH
880 890 900 910 920 930
1790 1800 1810 1820 1830 1840
pF1KE3 VFVSLANGELVVYQREAGH-FWDPQNFKSVTLGTQGSPITKMVSVGGRLWCGCQNRVLVL
....: .: :..: : .: .:: .. : : . .:. ..:. .: .: :: ::
CCDS18 LLAGLQDGTLAAYPRTSGGVLWDLES-PPVCLTVGPGPVRTLLSLEDAVWASCGPRVTVL
940 950 960 970 980 990
1850 1860 1870 1880 1890 1900
pF1KE3 SPDTLQLEHMFYVGQDSSRCVACMVDSSLGVWVTLKGSAHVCLYHPDTFEQLAEVDVTPP
::: .. : . :: . :. :: .. :::....... . :.: .:.:.: :....
CCDS18 EATTLQPQQSFEAHQDEAVSVTHMVKAGSGVWMAFSSGTSIRLFHTETLEHLQEINIATR
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1910 1920 1930 1940 1950 1960
pF1KE3 VHRMLAGSDAIIRQHKAACLRITALLVCEELLWVGTSAGVVLTMPTSPGTVSCPRAPLSP
. .: : .: : .:.::.:. ::::::. ::.. .:. : . :.
CCDS18 TTFLLPG-------QKHLC--VTSLLICQGLLWVGTDQGVIVLLPV-PRLEGIPKI----
1060 1070 1080 1090 1100
1970 1980 1990
pF1KE3 TGLGQ----GHTGHVRFLA---AVQLPD----------GFNLLCPTPP-----PPPDT--
:: :. :: : : ::: .. :: : : : ::.
CCDS18 TGKGMVSLNGHCGPVAFLAVATSILAPDILRSDQEEAEGPRAEEDKPDGQAHEPMPDSHV
1110 1120 1130 1140 1150 1160
2000 2010 2020
pF1KE3 GPE-----------KLPSLEHRDSPW--HRGPAPA-------------------------
: : .: : : .: : ::::
CCDS18 GRELTRKKGILLQYRLRSTAHLPGPLLSMREPAPADGAALEHSEEDGSIYEMADDPDIWV
1170 1180 1190 1200 1210 1220
2030 2040 2050 2060
pF1KE3 --RP-----------KMLVISGGDGYEDFRLSSGGGSSSETVGRDDSTNHLLLWRV
:: .. .::::.::..: . :... . :. ::: ::.:.:
CCDS18 RSRPCARDAHRKEICSVAIISGGQGYRNFGSALGSSGRQAPCGETDST--LLIWQVPLML
1230 1240 1250 1260 1270
>>CCDS78297.1 ARHGEF10 gene_id:9639|Hs108|chr8 (1306 aa)
initn: 427 init1: 270 opt: 530 Z-score: 318.7 bits: 71.9 E(32554): 2e-11
Smith-Waterman score: 765; 23.8% identity (54.0% similar) in 1041 aa overlap (1039-2057:337-1236)
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE3 QYMLNLHSGEVPAPVPVDMPCLPLAAPPSAEAKPPEAARPADEPTPASKCCSKPQVDMRK
. : ::: :: . :. :: .:.
CCDS78 RGRSFIRTKSLIAQDHRSSLEEEQNLFIDVDCKHPEAIL-----TPMPEGLSQQQV-VRR
310 320 330 340 350 360
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KE3 HVAMTLLDTEQSYVESLRTLMQGYMQPLKQPENSVLCDPSLVDEIFDQIPELLEHHEQFL
.. ...:.:..::..:. ... : .::.. : .:: . .: .: .. :.:. : :
CCDS78 YILGSVVDSEKNYVDALKRILEQYEKPLSEMEPKVLSERKL-KTVFYRVKEILQCHSLFQ
370 380 390 400 410
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KE3 EQVRHCMQTWHAQQKVGALLVQSFSKDVLVNIYSAYIDNFLNAKDAVRVAKEARPAFLKF
. .. : . . .: ..: ::::..... :: :..:: .: ... . ..::::.:
CCDS78 IALASRVSEWDSVEMIGDVFVASFSKSMVLDAYSEYVNNFSTAVAVLKKTCATKPAFLEF
420 430 440 450 460 470
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KE3 LEQSMRENKEKQALSDLMIKPVQRIPRYELLVKDLLKHTPEDHPDHPLLLEAQRNIKQVA
:.: .. . .. .: .::.::.::.:.. ::..:.::.: . :::. : : ... .:
CCDS78 LKQEQEASPDRTTLYSLMMKPIQRFPQFILLLQDMLKNTSKGHPDRLPLQMALTELETLA
480 490 500 510 520 530
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KE3 ERINKGVRSAEEAERHARVLQEI-EAHIEGMEDLQAPLRRFLRQEMVIEV-----KAIGG
:..:. :.:.. . .. . : : ... . :.. : ..:.. .::. :
CCDS78 EKLNERKRDADQRCEVKQIAKAINERYLNKL--LSSGSRYLIRSDDMIETVYNDRGEIVK
540 550 560 570 580 590
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KE3 KKDRSLFLFTDLIVCTTLKRKSGSLRRSSMSLYTAASVIDTASKYKMLWKLPLEDADIIK
:.: .:...:...:.:.. . . : . ....: . :..:: .: :.
CCDS78 TKERRVFMLNDVLMCATVSSRPSHDSR-----------VMSSQRYLLKWSVPLGHVDAIE
600 610 620 630 640
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KE3 GASQATNRENIQKAISRLDEDLTTLGQMSKLSESLGFPHQSLDDALRDLSAAMHRDLSEK
.:.: . :. .. . :.:..... . . .: : : ...::
CCDS78 YGSSAGTGEHSRHLAVHPPESLAVVANAKPNKVYMG-PGQ------------LYQDL---
650 660 670 680 690
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KE3 QALCYALSFPPTKLELCATRPEGTDSYIFEFPHPDARLGFEQAFDEAKRKLASSKSCLDP
: : . :. .: .. .:. . . . : :... . . . .. .. :
CCDS78 QNLLHDLNVIGQITQLIGNL-KGNYQNLNQSVAHDWTSGLQRLILKKEDEIRAADCC---
700 710 720 730 740
1490 1500 1510 1520 1530 1540
pF1KE3 EFLKAIPIMKTRSGMQFSCAAPTLNSCPEPSPEVWVCNSDGYVGQVCLLSLRAEPDVEAC
.. .: . .:: .: ..:. : :: :: :. :.:. : .
CCDS78 RIQLQLPGKQDKSGRPTFFTA-VFNTFTPAIKESWV-NSL----QMAKLALEEENHMGW-
750 760 770 780 790
1550 1560 1570 1580 1590 1600
pF1KE3 IAVCSARILCIGAVPGLQPRCHREPPPSLRSPPETAPEPAGPELDVEAAADEEAATLAEP
.:. : . . ...: . : .: . :. .: :: .
CCDS78 --------FCVED-DGNHIKKEKHPLLVGHMPVMVAKQQ---EFKIECAAYN--------
800 810 820 830
1610 1620 1630 1640 1650 1660
pF1KE3 GPQPCLHISIAGSGLEMTPG-LGEGDPRPELVPFDSDSDDESSPSPSGTLQSQASRSTIS
:.: :. ... . : : :. .. . : ..:.:. .
CCDS78 -PEPYLNNESQPDSFSTAHGFLWIGSCTHQMGQIAIVSFQNSTPK-------------VI
840 850 860 870 880
1670 1680 1690 1700 1710 1720
pF1KE3 SSFGNEETPSSKEATAETTSSEEEQEPGFLPLSGSFGPGGPCGTSPMDGRALRRSSHGSF
:. : : . :...::: .: : .: :.: :
CCDS78 ECFNVE---SRILCMLYVPVEEKRREPG--------APPDP--ETP----AVRAS-----
890 900 910 920
1730 1740 1750 1760 1770
pF1KE3 TRGSLEDLLSVDPEAYQSSVWLGTEDGCVHVYQSSDSIRDRRNSMKLQH-----AASVTC
:. : .. .:::.: . .:.::.. . ...::: ..:
CCDS78 ------DV----P-----TICVGTEEGSISIYKSSQGSK----KVRLQHFFTPEKSTVMS
930 940 950 960
1780 1790 1800 1810 1820 1830
pF1KE3 ILYLNNQVFVSLANGELVVYQREAGHFWDPQNFKSVTLGTQGSPITKMVSVGGRLWCGCQ
. .......:.:: .. : : :: . : . ::. :. ... . :: .
CCDS78 LACTSQSLYAGLVNGAVASYARAPDGSWDSEPQKVIKLGVL--PVRSLLMMEDTLWAASG
970 980 990 1000 1010 1020
1840 1850 1860 1870 1880 1890
pF1KE3 NRVLVLSPDTLQLEHMFYVGQDSSRCVACMVDSSLGVWVTLKGSAHVCLYHPDTFEQLAE
..:...: .: .: .. . :. . .. :. :..:.:... ... . :.: .:...: .
CCDS78 GQVFIISVETHAVEGQLEAHQEEGMVISHMAVSGVGIWIAFTSGSTLRLFHTETLKHLQD
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1900 1910 1920 1930 1940 1950
pF1KE3 VDVTPPVHRMLAGSDAIIRQHKAACLRITALLVCEELLWVGTSAGVVLTMPTSPGTVSCP
.... ::: :: : :. : .:.::::. :: :::: ::....:. : . :
CCDS78 INIATPVHNMLPG-------HQR--LSVTSLLVCHGLLMVGTSLGVLVALPV-PRLQGIP
1090 1100 1110 1120 1130
1960 1970 1980 1990 2000
pF1KE3 RAPLSPTGLG----QGHTGHVRFLA---AVQLPD---GFNLLCPTPPPPPDTGPEKLPSL
.. :: : ..:.. :.:.. :.. : . . : : : : . . :::
CCDS78 KV----TGRGMVSYHAHNSPVKFIVLATALHEKDKDKSRDSLAPGPEPQDEDQKDALPS-
1140 1150 1160 1170 1180
2010 2020 2030 2040 2050 2060
pF1KE3 EHRDSPWHRGPAPARPKMLVISGGDGYEDFRLSSGGGSSSETVGRDDSTNHLLLWRV
: .: : : : :. . :::..:: : . : ..: .:
CCDS78 GGAGSSLSQGD-PDAAIWLGDSLGSMTQKSDLSSSSGSLSLSHG-SSSLEHRSEDSTIYD
1190 1200 1210 1220 1230 1240
CCDS78 LLKDPVSLRSKARRAKKAKASSALVVCGGQGHRRVHRKARQPHQEELAPTVMVWQIPLLN
1250 1260 1270 1280 1290 1300
>>CCDS34794.1 ARHGEF10 gene_id:9639|Hs108|chr8 (1344 aa)
initn: 427 init1: 270 opt: 530 Z-score: 318.5 bits: 71.9 E(32554): 2e-11
Smith-Waterman score: 765; 23.8% identity (54.0% similar) in 1041 aa overlap (1039-2057:375-1274)
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE3 QYMLNLHSGEVPAPVPVDMPCLPLAAPPSAEAKPPEAARPADEPTPASKCCSKPQVDMRK
. : ::: :: . :. :: .:.
CCDS34 RGRSFIRTKSLIAQDHRSSLEEEQNLFIDVDCKHPEAIL-----TPMPEGLSQQQV-VRR
350 360 370 380 390
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KE3 HVAMTLLDTEQSYVESLRTLMQGYMQPLKQPENSVLCDPSLVDEIFDQIPELLEHHEQFL
.. ...:.:..::..:. ... : .::.. : .:: . .: .: .. :.:. : :
CCDS34 YILGSVVDSEKNYVDALKRILEQYEKPLSEMEPKVLSERKL-KTVFYRVKEILQCHSLFQ
400 410 420 430 440 450
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KE3 EQVRHCMQTWHAQQKVGALLVQSFSKDVLVNIYSAYIDNFLNAKDAVRVAKEARPAFLKF
. .. : . . .: ..: ::::..... :: :..:: .: ... . ..::::.:
CCDS34 IALASRVSEWDSVEMIGDVFVASFSKSMVLDAYSEYVNNFSTAVAVLKKTCATKPAFLEF
460 470 480 490 500 510
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KE3 LEQSMRENKEKQALSDLMIKPVQRIPRYELLVKDLLKHTPEDHPDHPLLLEAQRNIKQVA
:.: .. . .. .: .::.::.::.:.. ::..:.::.: . :::. : : ... .:
CCDS34 LKQEQEASPDRTTLYSLMMKPIQRFPQFILLLQDMLKNTSKGHPDRLPLQMALTELETLA
520 530 540 550 560 570
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KE3 ERINKGVRSAEEAERHARVLQEI-EAHIEGMEDLQAPLRRFLRQEMVIEV-----KAIGG
:..:. :.:.. . .. . : : ... . :.. : ..:.. .::. :
CCDS34 EKLNERKRDADQRCEVKQIAKAINERYLNKL--LSSGSRYLIRSDDMIETVYNDRGEIVK
580 590 600 610 620 630
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KE3 KKDRSLFLFTDLIVCTTLKRKSGSLRRSSMSLYTAASVIDTASKYKMLWKLPLEDADIIK
:.: .:...:...:.:.. . . : . ....: . :..:: .: :.
CCDS34 TKERRVFMLNDVLMCATVSSRPSHDSR-----------VMSSQRYLLKWSVPLGHVDAIE
640 650 660 670 680
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KE3 GASQATNRENIQKAISRLDEDLTTLGQMSKLSESLGFPHQSLDDALRDLSAAMHRDLSEK
.:.: . :. .. . :.:..... . . .: : : ...::
CCDS34 YGSSAGTGEHSRHLAVHPPESLAVVANAKPNKVYMG-PGQ------------LYQDL---
690 700 710 720
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KE3 QALCYALSFPPTKLELCATRPEGTDSYIFEFPHPDARLGFEQAFDEAKRKLASSKSCLDP
: : . :. .: .. .:. . . . : :... . . . .. .. :
CCDS34 QNLLHDLNVIGQITQLIGNL-KGNYQNLNQSVAHDWTSGLQRLILKKEDEIRAADCC---
730 740 750 760 770 780
1490 1500 1510 1520 1530 1540
pF1KE3 EFLKAIPIMKTRSGMQFSCAAPTLNSCPEPSPEVWVCNSDGYVGQVCLLSLRAEPDVEAC
.. .: . .:: .: ..:. : :: :: :. :.:. : .
CCDS34 RIQLQLPGKQDKSGRPTFFTA-VFNTFTPAIKESWV-NSL----QMAKLALEEENHMGW-
790 800 810 820 830
1550 1560 1570 1580 1590 1600
pF1KE3 IAVCSARILCIGAVPGLQPRCHREPPPSLRSPPETAPEPAGPELDVEAAADEEAATLAEP
.:. : . . ...: . : .: . :. .: :: .
CCDS34 --------FCVED-DGNHIKKEKHPLLVGHMPVMVAKQQ---EFKIECAAYN--------
840 850 860 870
1610 1620 1630 1640 1650 1660
pF1KE3 GPQPCLHISIAGSGLEMTPG-LGEGDPRPELVPFDSDSDDESSPSPSGTLQSQASRSTIS
:.: :. ... . : : :. .. . : ..:.:. .
CCDS34 -PEPYLNNESQPDSFSTAHGFLWIGSCTHQMGQIAIVSFQNSTPK-------------VI
880 890 900 910 920
1670 1680 1690 1700 1710 1720
pF1KE3 SSFGNEETPSSKEATAETTSSEEEQEPGFLPLSGSFGPGGPCGTSPMDGRALRRSSHGSF
:. : : . :...::: .: : .: :.: :
CCDS34 ECFNVE---SRILCMLYVPVEEKRREPG--------APPDP--ETP----AVRAS-----
930 940 950 960
1730 1740 1750 1760 1770
pF1KE3 TRGSLEDLLSVDPEAYQSSVWLGTEDGCVHVYQSSDSIRDRRNSMKLQH-----AASVTC
:. : .. .:::.: . .:.::.. . ...::: ..:
CCDS34 ------DV----P-----TICVGTEEGSISIYKSSQGSK----KVRLQHFFTPEKSTVMS
970 980 990 1000
1780 1790 1800 1810 1820 1830
pF1KE3 ILYLNNQVFVSLANGELVVYQREAGHFWDPQNFKSVTLGTQGSPITKMVSVGGRLWCGCQ
. .......:.:: .. : : :: . : . ::. :. ... . :: .
CCDS34 LACTSQSLYAGLVNGAVASYARAPDGSWDSEPQKVIKLGVL--PVRSLLMMEDTLWAASG
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1840 1850 1860 1870 1880 1890
pF1KE3 NRVLVLSPDTLQLEHMFYVGQDSSRCVACMVDSSLGVWVTLKGSAHVCLYHPDTFEQLAE
..:...: .: .: .. . :. . .. :. :..:.:... ... . :.: .:...: .
CCDS34 GQVFIISVETHAVEGQLEAHQEEGMVISHMAVSGVGIWIAFTSGSTLRLFHTETLKHLQD
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1900 1910 1920 1930 1940 1950
pF1KE3 VDVTPPVHRMLAGSDAIIRQHKAACLRITALLVCEELLWVGTSAGVVLTMPTSPGTVSCP
.... ::: :: : :. : .:.::::. :: :::: ::....:. : . :
CCDS34 INIATPVHNMLPG-------HQR--LSVTSLLVCHGLLMVGTSLGVLVALPV-PRLQGIP
1130 1140 1150 1160 1170
1960 1970 1980 1990 2000
pF1KE3 RAPLSPTGLG----QGHTGHVRFLA---AVQLPD---GFNLLCPTPPPPPDTGPEKLPSL
.. :: : ..:.. :.:.. :.. : . . : : : : . . :::
CCDS34 KV----TGRGMVSYHAHNSPVKFIVLATALHEKDKDKSRDSLAPGPEPQDEDQKDALPS-
1180 1190 1200 1210 1220
2010 2020 2030 2040 2050 2060
pF1KE3 EHRDSPWHRGPAPARPKMLVISGGDGYEDFRLSSGGGSSSETVGRDDSTNHLLLWRV
: .: : : : :. . :::..:: : . : ..: .:
CCDS34 GGAGSSLSQGD-PDAAIWLGDSLGSMTQKSDLSSSSGSLSLSHG-SSSLEHRSEDSTIYD
1230 1240 1250 1260 1270 1280
CCDS34 LLKDPVSLRSKARRAKKAKASSALVVCGGQGHRRVHRKARQPHQEELAPTVMVWQIPLLN
1290 1300 1310 1320 1330 1340
>>CCDS78296.1 ARHGEF10 gene_id:9639|Hs108|chr8 (1368 aa)
initn: 431 init1: 149 opt: 514 Z-score: 309.1 bits: 70.2 E(32554): 6.7e-11
Smith-Waterman score: 749; 23.7% identity (54.0% similar) in 1041 aa overlap (1039-2057:400-1298)
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE3 QYMLNLHSGEVPAPVPVDMPCLPLAAPPSAEAKPPEAARPADEPTPASKCCSKPQVDMRK
. : ::: :: . :. :: .:.
CCDS78 RGRSFIRTKSLIAQDHRSSLEEEQNLFIDVDCKHPEAIL-----TPMPEGLSQQQV-VRR
370 380 390 400 410 420
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KE3 HVAMTLLDTEQSYVESLRTLMQGYMQPLKQPENSVLCDPSLVDEIFDQIPELLEHHEQFL
.. ...:.:..::..:. ... : .::.. : .:: . .: .: .. :.:. : :
CCDS78 YILGSVVDSEKNYVDALKRILEQYEKPLSEMEPKVLSERKL-KTVFYRVKEILQCHSLFQ
430 440 450 460 470 480
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KE3 EQVRHCMQTWHAQQKVGALLVQSFSKDVLVNIYSAYIDNFLNAKDAVRVAKEARPAFLKF
. .. : . . .: ..: ::::..... :: :..:: .: ... . ..::::.:
CCDS78 IALASRVSEWDSVEMIGDVFVASFSKSMVLDAYSEYVNNFSTAVAVLKKTCATKPAFLEF
490 500 510 520 530 540
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KE3 LEQSMRENKEKQALSDLMIKPVQRIPRYELLVKDLLKHTPEDHPDHPLLLEAQRNIKQVA
:... . . .. .: .::.::.::.:.. ::..:.::.: . :::. : : ... .:
CCDS78 LKEQ-EASPDRTTLYSLMMKPIQRFPQFILLLQDMLKNTSKGHPDRLPLQMALTELETLA
550 560 570 580 590 600
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KE3 ERINKGVRSAEEAERHARVLQEI-EAHIEGMEDLQAPLRRFLRQEMVIEV-----KAIGG
:..:. :.:.. . .. . : : ... . :.. : ..:.. .::. :
CCDS78 EKLNERKRDADQRCEVKQIAKAINERYLNKL--LSSGSRYLIRSDDMIETVYNDRGEIVK
610 620 630 640 650
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KE3 KKDRSLFLFTDLIVCTTLKRKSGSLRRSSMSLYTAASVIDTASKYKMLWKLPLEDADIIK
:.: .:...:...:.:.. . . : . ....: . :..:: .: :.
CCDS78 TKERRVFMLNDVLMCATVSSRPSHDSR-----------VMSSQRYLLKWSVPLGHVDAIE
660 670 680 690 700
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KE3 GASQATNRENIQKAISRLDEDLTTLGQMSKLSESLGFPHQSLDDALRDLSAAMHRDLSEK
.:.: . :. .. . :.:..... . . .: : : ...::
CCDS78 YGSSAGTGEHSRHLAVHPPESLAVVANAKPNKVYMG-PGQ------------LYQDL---
710 720 730 740 750
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KE3 QALCYALSFPPTKLELCATRPEGTDSYIFEFPHPDARLGFEQAFDEAKRKLASSKSCLDP
: : . :. .: .. .:. . . . : :... . . . .. .. :
CCDS78 QNLLHDLNVIGQITQLIGNL-KGNYQNLNQSVAHDWTSGLQRLILKKEDEIRAADCC---
760 770 780 790 800
1490 1500 1510 1520 1530 1540
pF1KE3 EFLKAIPIMKTRSGMQFSCAAPTLNSCPEPSPEVWVCNSDGYVGQVCLLSLRAEPDVEAC
.. .: . .:: .: ..:. : :: :: :. :.:. : .
CCDS78 RIQLQLPGKQDKSGRPTFFTA-VFNTFTPAIKESWV-NSL----QMAKLALEEENHMGW-
810 820 830 840 850 860
1550 1560 1570 1580 1590 1600
pF1KE3 IAVCSARILCIGAVPGLQPRCHREPPPSLRSPPETAPEPAGPELDVEAAADEEAATLAEP
.:. : . . ...: . : .: . :. .: :: .
CCDS78 --------FCVED-DGNHIKKEKHPLLVGHMPVMVAKQQ---EFKIECAAYN--------
870 880 890 900
1610 1620 1630 1640 1650 1660
pF1KE3 GPQPCLHISIAGSGLEMTPG-LGEGDPRPELVPFDSDSDDESSPSPSGTLQSQASRSTIS
:.: :. ... . : : :. .. . : ..:.:. .
CCDS78 -PEPYLNNESQPDSFSTAHGFLWIGSCTHQMGQIAIVSFQNSTPK-------------VI
910 920 930 940
1670 1680 1690 1700 1710 1720
pF1KE3 SSFGNEETPSSKEATAETTSSEEEQEPGFLPLSGSFGPGGPCGTSPMDGRALRRSSHGSF
:. : : . :...::: .: : .: :.: :
CCDS78 ECFNVE---SRILCMLYVPVEEKRREPG--------APPDP--ETP----AVRAS-----
950 960 970 980
1730 1740 1750 1760 1770
pF1KE3 TRGSLEDLLSVDPEAYQSSVWLGTEDGCVHVYQSSDSIRDRRNSMKLQH-----AASVTC
:. : .. .:::.: . .:.::.. . ...::: ..:
CCDS78 ------DV----P-----TICVGTEEGSISIYKSSQGSK----KVRLQHFFTPEKSTVMS
990 1000 1010 1020
1780 1790 1800 1810 1820 1830
pF1KE3 ILYLNNQVFVSLANGELVVYQREAGHFWDPQNFKSVTLGTQGSPITKMVSVGGRLWCGCQ
. .......:.:: .. : : :: . : . ::. :. ... . :: .
CCDS78 LACTSQSLYAGLVNGAVASYARAPDGSWDSEPQKVIKLGVL--PVRSLLMMEDTLWAASG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1840 1850 1860 1870 1880 1890
pF1KE3 NRVLVLSPDTLQLEHMFYVGQDSSRCVACMVDSSLGVWVTLKGSAHVCLYHPDTFEQLAE
..:...: .: .: .. . :. . .. :. :..:.:... ... . :.: .:...: .
CCDS78 GQVFIISVETHAVEGQLEAHQEEGMVISHMAVSGVGIWIAFTSGSTLRLFHTETLKHLQD
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1900 1910 1920 1930 1940 1950
pF1KE3 VDVTPPVHRMLAGSDAIIRQHKAACLRITALLVCEELLWVGTSAGVVLTMPTSPGTVSCP
.... ::: :: : :. : .:.::::. :: :::: ::....:. : . :
CCDS78 INIATPVHNMLPG-------HQR--LSVTSLLVCHGLLMVGTSLGVLVALPV-PRLQGIP
1150 1160 1170 1180 1190
1960 1970 1980 1990 2000
pF1KE3 RAPLSPTGLG----QGHTGHVRFLA---AVQLPD---GFNLLCPTPPPPPDTGPEKLPSL
.. :: : ..:.. :.:.. :.. : . . : : : : . . :::
CCDS78 KV----TGRGMVSYHAHNSPVKFIVLATALHEKDKDKSRDSLAPGPEPQDEDQKDALPS-
1200 1210 1220 1230 1240
2010 2020 2030 2040 2050 2060
pF1KE3 EHRDSPWHRGPAPARPKMLVISGGDGYEDFRLSSGGGSSSETVGRDDSTNHLLLWRV
: .: : : : :. . :::..:: : . : ..: .:
CCDS78 GGAGSSLSQGD-PDAAIWLGDSLGSMTQKSDLSSSSGSLSLSHG-SSSLEHRSEDSTIYD
1250 1260 1270 1280 1290 1300
CCDS78 LLKDPVSLRSKARRAKKAKASSALVVCGGQGHRRVHRKARQPHQEELAPTVMVWQIPLLN
1310 1320 1330 1340 1350 1360
2063 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 03:34:32 2016 done: Tue Nov 8 03:34:33 2016
Total Scan time: 4.700 Total Display time: 0.300
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]