FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3526, 1036 aa
1>>>pF1KE3526 1036 - 1036 aa - 1036 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.0430+/-0.0011; mu= -17.3663+/- 0.067
mean_var=450.7420+/-91.862, 0's: 0 Z-trim(114.6): 13 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.060410
statistics sampled from 15334 (15346) to 15334 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.753), E-opt: 0.2 (0.459), width: 16
Scan time: 3.180
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS6833.2 DAB2IP gene_id:153090|Hs109|chr9 (1132) 6851 612.1 2.1e-174
CCDS6832.1 DAB2IP gene_id:153090|Hs109|chr9 (1065) 6829 610.2 7.6e-174
CCDS1322.1 RASAL2 gene_id:9462|Hs109|chr1 (1139) 3742 341.2 7.9e-93
CCDS1321.2 RASAL2 gene_id:9462|Hs109|chr1 (1280) 3110 286.1 3.3e-76
CCDS34434.2 SYNGAP1 gene_id:8831|Hs109|chr6 (1343) 1727 165.6 6.7e-40
CCDS46006.1 RASAL3 gene_id:64926|Hs109|chr19 (1011) 1506 146.3 3.3e-34
CCDS47243.1 RASA1 gene_id:5921|Hs109|chr5 ( 870) 635 70.3 2.1e-11
CCDS34200.1 RASA1 gene_id:5921|Hs109|chr5 (1047) 635 70.3 2.4e-11
>>CCDS6833.2 DAB2IP gene_id:153090|Hs109|chr9 (1132 aa)
initn: 6851 init1: 6851 opt: 6851 Z-score: 3244.7 bits: 612.1 E(33420): 2.1e-174
Smith-Waterman score: 6851; 100.0% identity (100.0% similar) in 1036 aa overlap (1-1036:97-1132)
10 20 30
pF1KE3 MPRLKESRSHESLLSPSSAVEALDLSMEEE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 KLDRNHSFRHILPGFRSAAAAAADNERSHLMPRLKESRSHESLLSPSSAVEALDLSMEEE
70 80 90 100 110 120
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 VVIKPVHSSILGQDYCFEVTTSSGSKCFSCRSAAERDKWMENLRRAVHPNKDNSRRVEHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 VVIKPVHSSILGQDYCFEVTTSSGSKCFSCRSAAERDKWMENLRRAVHPNKDNSRRVEHI
130 140 150 160 170 180
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 LKLWVIEAKDLPAKKKYLCELCLDDVLYARTTGKLKTDNVFWGEHFEFHNLPPLRTVTVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 LKLWVIEAKDLPAKKKYLCELCLDDVLYARTTGKLKTDNVFWGEHFEFHNLPPLRTVTVH
190 200 210 220 230 240
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 LYRETDKKKKKERNSYLGLVSLPAASVAGRQFVEKWYPVVTPNPKGGKGPGPMIRIKARY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 LYRETDKKKKKERNSYLGLVSLPAASVAGRQFVEKWYPVVTPNPKGGKGPGPMIRIKARY
250 260 270 280 290 300
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 QTITILPMEMYKEFAEHITNHYLGLCAALEPILSAKTKEEMASALVHILQSTGKVKDFLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 QTITILPMEMYKEFAEHITNHYLGLCAALEPILSAKTKEEMASALVHILQSTGKVKDFLT
310 320 330 340 350 360
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 DLMMSEVDRCGDNEHLIFRENTLATKAIEEYLKLVGQKYLQDALGEFIKALYESDENCEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 DLMMSEVDRCGDNEHLIFRENTLATKAIEEYLKLVGQKYLQDALGEFIKALYESDENCEV
370 380 390 400 410 420
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 DPSKCSAADLPEHQGNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWRQECSSRGRPDISE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 DPSKCSAADLPEHQGNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWRQECSSRGRPDISE
430 440 450 460 470 480
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 RLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLLQEYPDDRTARTLTLIAKVTQNLANFAKFGSKEEYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 RLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLLQEYPDDRTARTLTLIAKVTQNLANFAKFGSKEEYM
490 500 510 520 530 540
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 SFMNQFLEHEWTNMQRFLLEISNPETLSNTAGFEGYIDLGRELSSLHSLLWEAVSQLEQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 SFMNQFLEHEWTNMQRFLLEISNPETLSNTAGFEGYIDLGRELSSLHSLLWEAVSQLEQS
550 560 570 580 590 600
520 530 540 550 560 570
pF1KE3 IVSKLGPLPRILRDVHTALSTPGSGQLPGTNDLASTPGSGSSSISAGLQKMVIENDLSGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 IVSKLGPLPRILRDVHTALSTPGSGQLPGTNDLASTPGSGSSSISAGLQKMVIENDLSGL
610 620 630 640 650 660
580 590 600 610 620 630
pF1KE3 IDFTRLPSPTPENKDLFFVTRSSGVQPSPARSSSYSEANEPDLQMANGGKSLSMVDLQDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 IDFTRLPSPTPENKDLFFVTRSSGVQPSPARSSSYSEANEPDLQMANGGKSLSMVDLQDA
670 680 690 700 710 720
640 650 660 670 680 690
pF1KE3 RTLDGEAGSPAGPDVLPTDGQAAAAQLVAGWPARATPVNLAGLATVRRAGQTPTTPGTSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 RTLDGEAGSPAGPDVLPTDGQAAAAQLVAGWPARATPVNLAGLATVRRAGQTPTTPGTSE
730 740 750 760 770 780
700 710 720 730 740 750
pF1KE3 GAPGRPQLLAPLSFQNPVYQMAAGLPLSPRGLGDSGSEGHSSLSSHSNSEELAAAAKLGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 GAPGRPQLLAPLSFQNPVYQMAAGLPLSPRGLGDSGSEGHSSLSSHSNSEELAAAAKLGS
790 800 810 820 830 840
760 770 780 790 800 810
pF1KE3 FSTAAEELARRPGELARRQMSLTEKGGQPTVPRQNSAGPQRRIDQPPPPPPPPPPAPRGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 FSTAAEELARRPGELARRQMSLTEKGGQPTVPRQNSAGPQRRIDQPPPPPPPPPPAPRGR
850 860 870 880 890 900
820 830 840 850 860 870
pF1KE3 TPPNLLSTLQYPRPSSGTLASASPDWVGPSTRLRQQSSSSKGDSPELKPRAVHKQGPSPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 TPPNLLSTLQYPRPSSGTLASASPDWVGPSTRLRQQSSSSKGDSPELKPRAVHKQGPSPV
910 920 930 940 950 960
880 890 900 910 920 930
pF1KE3 SPNALDRTAAWLLTMNAQLLEDEGLGPDPPHRDRLRSKDELSQAEKDLAVLQDKLRISTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 SPNALDRTAAWLLTMNAQLLEDEGLGPDPPHRDRLRSKDELSQAEKDLAVLQDKLRISTK
970 980 990 1000 1010 1020
940 950 960 970 980 990
pF1KE3 KLEEYETLFKCQEETTQKLVLEYQARLEEGEERLRRQQEDKDIQMKGIISRLMSVEEELK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 KLEEYETLFKCQEETTQKLVLEYQARLEEGEERLRRQQEDKDIQMKGIISRLMSVEEELK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1000 1010 1020 1030
pF1KE3 KDHAEMQAAVDSKQKIIDAQEKRIASLDAANARLMSALTQLKESMH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 KDHAEMQAAVDSKQKIIDAQEKRIASLDAANARLMSALTQLKESMH
1090 1100 1110 1120 1130
>>CCDS6832.1 DAB2IP gene_id:153090|Hs109|chr9 (1065 aa)
initn: 6829 init1: 6829 opt: 6829 Z-score: 3234.7 bits: 610.2 E(33420): 7.6e-174
Smith-Waterman score: 6829; 100.0% identity (100.0% similar) in 1033 aa overlap (1-1033:1-1033)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MPRLKESRSHESLLSPSSAVEALDLSMEEEVVIKPVHSSILGQDYCFEVTTSSGSKCFSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 MPRLKESRSHESLLSPSSAVEALDLSMEEEVVIKPVHSSILGQDYCFEVTTSSGSKCFSC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 RSAAERDKWMENLRRAVHPNKDNSRRVEHILKLWVIEAKDLPAKKKYLCELCLDDVLYAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 RSAAERDKWMENLRRAVHPNKDNSRRVEHILKLWVIEAKDLPAKKKYLCELCLDDVLYAR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 TTGKLKTDNVFWGEHFEFHNLPPLRTVTVHLYRETDKKKKKERNSYLGLVSLPAASVAGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 TTGKLKTDNVFWGEHFEFHNLPPLRTVTVHLYRETDKKKKKERNSYLGLVSLPAASVAGR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 QFVEKWYPVVTPNPKGGKGPGPMIRIKARYQTITILPMEMYKEFAEHITNHYLGLCAALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 QFVEKWYPVVTPNPKGGKGPGPMIRIKARYQTITILPMEMYKEFAEHITNHYLGLCAALE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 PILSAKTKEEMASALVHILQSTGKVKDFLTDLMMSEVDRCGDNEHLIFRENTLATKAIEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 PILSAKTKEEMASALVHILQSTGKVKDFLTDLMMSEVDRCGDNEHLIFRENTLATKAIEE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 YLKLVGQKYLQDALGEFIKALYESDENCEVDPSKCSAADLPEHQGNLKMCCELAFCKIIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 YLKLVGQKYLQDALGEFIKALYESDENCEVDPSKCSAADLPEHQGNLKMCCELAFCKIIN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 SYCVFPRELKEVFASWRQECSSRGRPDISERLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLLQEYPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 SYCVFPRELKEVFASWRQECSSRGRPDISERLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLLQEYPD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 DRTARTLTLIAKVTQNLANFAKFGSKEEYMSFMNQFLEHEWTNMQRFLLEISNPETLSNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 DRTARTLTLIAKVTQNLANFAKFGSKEEYMSFMNQFLEHEWTNMQRFLLEISNPETLSNT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 AGFEGYIDLGRELSSLHSLLWEAVSQLEQSIVSKLGPLPRILRDVHTALSTPGSGQLPGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 AGFEGYIDLGRELSSLHSLLWEAVSQLEQSIVSKLGPLPRILRDVHTALSTPGSGQLPGT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 NDLASTPGSGSSSISAGLQKMVIENDLSGLIDFTRLPSPTPENKDLFFVTRSSGVQPSPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 NDLASTPGSGSSSISAGLQKMVIENDLSGLIDFTRLPSPTPENKDLFFVTRSSGVQPSPA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 RSSSYSEANEPDLQMANGGKSLSMVDLQDARTLDGEAGSPAGPDVLPTDGQAAAAQLVAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 RSSSYSEANEPDLQMANGGKSLSMVDLQDARTLDGEAGSPAGPDVLPTDGQAAAAQLVAG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 WPARATPVNLAGLATVRRAGQTPTTPGTSEGAPGRPQLLAPLSFQNPVYQMAAGLPLSPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 WPARATPVNLAGLATVRRAGQTPTTPGTSEGAPGRPQLLAPLSFQNPVYQMAAGLPLSPR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 GLGDSGSEGHSSLSSHSNSEELAAAAKLGSFSTAAEELARRPGELARRQMSLTEKGGQPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 GLGDSGSEGHSSLSSHSNSEELAAAAKLGSFSTAAEELARRPGELARRQMSLTEKGGQPT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 VPRQNSAGPQRRIDQPPPPPPPPPPAPRGRTPPNLLSTLQYPRPSSGTLASASPDWVGPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 VPRQNSAGPQRRIDQPPPPPPPPPPAPRGRTPPNLLSTLQYPRPSSGTLASASPDWVGPS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 TRLRQQSSSSKGDSPELKPRAVHKQGPSPVSPNALDRTAAWLLTMNAQLLEDEGLGPDPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 TRLRQQSSSSKGDSPELKPRAVHKQGPSPVSPNALDRTAAWLLTMNAQLLEDEGLGPDPP
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 HRDRLRSKDELSQAEKDLAVLQDKLRISTKKLEEYETLFKCQEETTQKLVLEYQARLEEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 HRDRLRSKDELSQAEKDLAVLQDKLRISTKKLEEYETLFKCQEETTQKLVLEYQARLEEG
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 EERLRRQQEDKDIQMKGIISRLMSVEEELKKDHAEMQAAVDSKQKIIDAQEKRIASLDAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 EERLRRQQEDKDIQMKGIISRLMSVEEELKKDHAEMQAAVDSKQKIIDAQEKRIASLDAA
970 980 990 1000 1010 1020
1030
pF1KE3 NARLMSALTQLKESMH
:::::::::::::
CCDS68 NARLMSALTQLKERYSMQARNGISPTNPTKLQITENGEFRNSSNC
1030 1040 1050 1060
>>CCDS1322.1 RASAL2 gene_id:9462|Hs109|chr1 (1139 aa)
initn: 3413 init1: 2751 opt: 3742 Z-score: 1780.2 bits: 341.2 E(33420): 7.9e-93
Smith-Waterman score: 3762; 57.9% identity (79.4% similar) in 1064 aa overlap (1-1033:81-1108)
10 20 30
pF1KE3 MPRLKESRSHESLLSPSSAVEALDLSMEEE
.:.::::::::::::: :.:: :::. :
CCDS13 IKRTKSQSKLDRNTSFRLPSLRSTDDRSRGLPKLKESRSHESLLSPCSTVECLDLGRGEP
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 VVIKPVHSSILGQDYCFEVTTSSGSKCFSCRSAAERDKWMENLRRAVHPNKDNSRRVEHI
: .::.::::::::.::::: :::::::: ::.:::::::::::.:.::::: ::.:..
CCDS13 VSVKPLHSSILGQDFCFEVTYLSGSKCFSCNSASERDKWMENLRRTVQPNKDNCRRAENV
120 130 140 150 160 170
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 LKLWVIEAKDLPAKKKYLCELCLDDVLYARTTGKLKTDNVFWGEHFEFHNLPPLRTVTVH
:.::.:::::: ::::.:::::::.:.::::.: :.::.:::::::: .::::...:::
CCDS13 LRLWIIEAKDLAPKKKYFCELCLDDTLFARTTSKTKADNIFWGEHFEFFSLPPLHSITVH
180 190 200 210 220 230
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 LYRETDKKKKKERNSYLGLVSLPAASVAGRQFVEKWYPVVTPNPKGGKGPGPMIRIKARY
.:....:::::..:.:.:::..:.:::.::::::::::: ::.:. :: :: ::::.:.
CCDS13 IYKDVEKKKKKDKNNYVGLVNIPTASVTGRQFVEKWYPVSTPTPNKGKTGGPSIRIKSRF
240 250 260 270 280 290
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 QTITILPMEMYKEFAEHITNHYLGLCAALEPILSAKTKEEMASALVHILQSTGKVKDFLT
:::::::::.:::::: .:..: ::..:::..:...:::.: ::::::::::..:::::
CCDS13 QTITILPMEQYKEFAEFVTSNYTMLCSVLEPVISVRNKEELACALVHILQSTGRAKDFLT
300 310 320 330 340 350
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 DLMMSEVDRCGDNEHLIFRENTLATKAIEEYLKLVGQKYLQDALGEFIKALYESDENCEV
::.::::::::... :::::::.:::.::::::::::.::.:::::::::::::::::::
CCDS13 DLVMSEVDRCGEHDVLIFRENTIATKSIEEYLKLVGQQYLHDALGEFIKALYESDENCEV
360 370 380 390 400 410
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 DPSKCSAADLPEHQGNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWRQECSSRGRPDISE
::::::...: .::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:.: .::. ::::
CCDS13 DPSKCSSSELIDHQSNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWKQQCLNRGKQDISE
420 430 440 450 460 470
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 RLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLLQEYPDDRTARTLTLIAKVTQNLANFAKFGSKEEYM
::::::::::::::::::::::::.::::::::.::::::::: ::::::::::.:::::
CCDS13 RLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLMQEYPDDRTSRTLTLIAKVIQNLANFAKFGNKEEYM
480 490 500 510 520 530
460 470 480 490 500
pF1KE3 SFMNQFLEHEWTNMQRFLLEISNPETLSNTAGFEGYIDLGRELSSLHSLLWEAVSQLE--
.:::.:::::: .:.:::::::::.:.::: ::.:::::::::: :::::::.::::.
CCDS13 AFMNDFLEHEWGGMKRFLLEISNPDTISNTPGFDGYIDLGRELSVLHSLLWEVVSQLDKG
540 550 560 570 580 590
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 -----QSIVSKLGPLPRILRDVHTALS--TPGSGQLPGTNDLASTPGSGSSSISAGLQKM
:. :.:::::::.: :. .:. :: . :: .. :.:. :.:.:.::::
CCDS13 ENSFLQATVAKLGPLPRVLADITKSLTNPTPIQQQLRRFTEHNSSPNV-SGSLSSGLQK-
600 610 620 630 640
570 580 590 600 610 620
pF1KE3 VIENDLSGLIDFTRLPSPTPENKDLFFVTRSSG-VQPSPARSSSYSEANEPDLQMANGGK
..:. .. :. .: ::. .: : .: .. :: . ..: .::: .: . .. :: .
CCDS13 IFEDPTDS--DLHKLKSPSQDNTDSYFRGKTLLLVQQASSQSMTYSEKDERESSLPNG-R
650 660 670 680 690 700
630 640 650 660 670
pF1KE3 SLSMVDLQDARTLDGEAGSPAGPDVLP---TDGQAAAAQLVAGWPARATPVNLAGLATVR
:.:..::::... . : .: . :: : : .: . .:... : : . . ::
CCDS13 SVSLMDLQDTHAAQVEHAS-VMLDV-PIRLTGSQLSITQVASIKQLRETQSTPQSAPQVR
710 720 730 740 750 760
680 690 700 710 720 730
pF1KE3 RAGQTPTTPGTSEGAPGRPQLLAPLSFQNPVYQMAAGLPLSPRGLGDSGSEGHSSLSS--
: : :. .. :: : :::::::::.. .: :.. ::. :. :. ::
CCDS13 R----PLHPALNQ--PGG---LQPLSFQNPVYHLNNPIPAMPKASIDSSLENLSTASSRS
770 780 790 800 810
740 750 760 770 780 790
pF1KE3 HSNSEELAAAAKLGSFSTAAEELARRP--GELARRQMSLTEKGGQPTVPRQNSAGPQ--R
.::::.. . : ... :....: .: :. .. .. ..:::::.: :
CCDS13 QSNSEDFKLS---GPSNSSMEDFTKRSTQSEDFSRRHTVPDRHIPLALPRQNSTGQAQIR
820 830 840 850 860 870
800 810 820 830 840
pF1KE3 RIDQPPPPPPPPPPAPRGRTPPNLLSTLQYPRPSSGTLASAS--PDWVGPSTRLRQQSSS
..:: . :...::.: . . .: ...::. . : ..: ::::::
CCDS13 KVDQGGL-------GARAKAPPSLPHSASLRSTGSMSVVSAALVAEPVQNGSRSRQQSSS
880 890 900 910 920
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 SKGDSPELKPRAVHKQGP----SPVSPNAL---DRTAAWLLTMNAQLLEDEGLGPDPPHR
:. .:: : ::...: :::. .. .:::::.:. :.: :: .
CCDS13 SR-ESPVPKVRAIQRQQTQQVQSPVDSATMSPVERTAAWVLN-NGQYEEDV--------E
930 940 950 960 970
910 920 930 940 950
pF1KE3 DRLRSKDELSQAEK---DLAVLQDKLRISTKKLEEYETLFKCQEETTQKLVLEYQARLEE
. .. :: ..::: ... :...::.:...::::: . ::. :::.:::.::::.
CCDS13 ETEQNLDEAKHAEKYEQEITKLKERLRVSSRRLEEYERRLLVQEQQMQKLLLEYKARLED
980 990 1000 1010 1020 1030
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE3 GEERLRRQQEDKDIQMKGIISRLMSVEEELKKDHAEMQAAVDSKQKIIDAQEKRIASLDA
.:::::::::.:: :::.::::::.::::::::::::::..:.::::::::::::.:::.
CCDS13 SEERLRRQQEEKDSQMKSIISRLMAVEEELKKDHAEMQAVIDAKQKIIDAQEKRIVSLDS
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1020 1030
pF1KE3 ANARLMSALTQLKESMH
::.::::::::.::
CCDS13 ANTRLMSALTQVKERYSMQVRNGISPTNPTKLSITENGEFKNSSC
1100 1110 1120 1130
>>CCDS1321.2 RASAL2 gene_id:9462|Hs109|chr1 (1280 aa)
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10 20 30
pF1KE3 MPRLKESRSHESLLSPSSAVEALDLSMEEE
.:.::::::::::::: :.:: :::. :
CCDS13 IKRTKSQSKLDRNTSFRLPSLRSTDDRSRGLPKLKESRSHESLLSPCSTVECLDLGRGEP
200 210 220 230 240 250
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 VVIKPVHSSILGQDYCFEVTTSSGSKCFSCRSAAERDKWMENLRRAVHPNKDNSRRVEHI
: .::.::::::::.::::: :::::::: ::.:::::::::::.:.::::: ::.:..
CCDS13 VSVKPLHSSILGQDFCFEVTYLSGSKCFSCNSASERDKWMENLRRTVQPNKDNCRRAENV
260 270 280 290 300 310
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 LKLWVIEAKDLPAKKKYLCELCLDDVLYARTTGKLKTDNVFWGEHFEFHNLPPLRTVTVH
:.::.:::::: ::::.:::::::.:.::::.: :.::.:::::::: .::::...:::
CCDS13 LRLWIIEAKDLAPKKKYFCELCLDDTLFARTTSKTKADNIFWGEHFEFFSLPPLHSITVH
320 330 340 350 360 370
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 LYRETDKKKKKERNSYLGLVSLPAASVAGRQFVEKWYPVVTPNPKGGKGPGPMIRIKARY
.:....:::::..:.:.:::..:.:::.::::::::::: ::.:. :: :: ::::.:.
CCDS13 IYKDVEKKKKKDKNNYVGLVNIPTASVTGRQFVEKWYPVSTPTPNKGKTGGPSIRIKSRF
380 390 400 410 420 430
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 QTITILPMEMYKEFAEHITNHYLGLCAALEPILSAKTKEEMASALVHILQSTGKVKDFLT
:::::::::.:::::: .:..: ::..:::..:...:::.: ::::::::::..:::::
CCDS13 QTITILPMEQYKEFAEFVTSNYTMLCSVLEPVISVRNKEELACALVHILQSTGRAKDFLT
440 450 460 470 480 490
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 DLMMSEVDRCGDNEHLIFRENTLATKAIEEYLKLVGQKYLQDALGEFIKALYESDENCEV
::.::::::::... :::::::.:::.::::::::::.::.:::::::::::::::::::
CCDS13 DLVMSEVDRCGEHDVLIFRENTIATKSIEEYLKLVGQQYLHDALGEFIKALYESDENCEV
500 510 520 530 540 550
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 DPSKCSAADLPEHQGNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWRQECSSRGRPDISE
::::::...: .::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:.: .::. ::::
CCDS13 DPSKCSSSELIDHQSNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWKQQCLNRGKQDISE
560 570 580 590 600 610
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 RLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLLQEYPDDRTARTLTLIAKVTQNLANFAKFGSKEEYM
::::::::::::::::::::::::.::::::::.::::::::: ::::::::::.:::::
CCDS13 RLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLMQEYPDDRTSRTLTLIAKVIQNLANFAKFGNKEEYM
620 630 640 650 660 670
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 SFMNQFLEHEWTNMQRFLLEISNPETLSNTAGFEGYIDLGRELSSLHSLLWEAVSQLEQS
.:::.:::::: .:.:::::::::.:.::: ::.:::::::::: :::::::.::::...
CCDS13 AFMNDFLEHEWGGMKRFLLEISNPDTISNTPGFDGYIDLGRELSVLHSLLWEVVSQLDKA
680 690 700 710 720 730
520 530 540 550 560
pF1KE3 IVSKLGPLPRILRDVHTALS--TPGSGQLPGTNDLASTPGSGSSSISAGLQKMVIENDLS
:.:::::::.: :. .:. :: . :: .. :.:. :.:.:.:::: ..:. .
CCDS13 TVAKLGPLPRVLADITKSLTNPTPIQQQLRRFTEHNSSPNV-SGSLSSGLQK-IFEDPTD
740 750 760 770 780 790
570 580 590 600 610 620
pF1KE3 GLIDFTRLPSPTPENKDLFFVTRSSG-VQPSPARSSSYSEANEPDLQMANGGKSLSMVDL
. :. .: ::. .: : .: .. :: . ..: .::: .: . .. :: .:.:..::
CCDS13 S--DLHKLKSPSQDNTDSYFRGKTLLLVQQASSQSMTYSEKDERESSLPNG-RSVSLMDL
800 810 820 830 840 850
630 640 650 660 670 680
pF1KE3 QDARTLDGEAGSPAGPDVLP---TDGQAAAAQLVAGWPARATPVNLAGLATVRRAGQTPT
::... . : .: . :: : : .: . .:... : : . . ::: :
CCDS13 QDTHAAQVEHAS-VMLDV-PIRLTGSQLSITQVASIKQLRETQSTPQSAPQVRR----PL
860 870 880 890 900
690 700 710 720 730 740
pF1KE3 TPGTSEGAPGRPQLLAPLSFQNPVYQMAAGLPLSPRGLGDSGSEGHSSLSS--HSNSEEL
:. .. :: : :::::::::.. .: :.. ::. :. :. :: .::::..
CCDS13 HPALNQ--PGG---LQPLSFQNPVYHLNNPIPAMPKASIDSSLENLSTASSRSQSNSEDF
910 920 930 940 950 960
750 760 770 780 790
pF1KE3 AAAAKLGSFSTAAEELARRP--GELARRQMSLTEKGGQPTVPRQNSAGPQ--RRIDQPPP
. : ... :....: .: :. .. .. ..:::::.: :..::
CCDS13 KLS---GPSNSSMEDFTKRSTQSEDFSRRHTVPDRHIPLALPRQNSTGQAQIRKVDQGGL
970 980 990 1000 1010
800 810 820 830 840 850
pF1KE3 PPPPPPPAPRGRTPPNLLSTLQYPRPSSGTLASAS--PDWVGPSTRLRQQSSSSKGDSPE
. :...::.: . . .: ...::. . : ..: :::::::. .::
CCDS13 -------GARAKAPPSLPHSASLRSTGSMSVVSAALVAEPVQNGSRSRQQSSSSR-ESPV
1020 1030 1040 1050 1060 1070
860 870 880 890 900
pF1KE3 LKPRAVHKQGP----SPVSPNAL---DRTAAWLLTMNAQLLEDEGLGPDPPHRDRLRSKD
: ::...: :::. .. .:::::.:. :.: :: .. .. :
CCDS13 PKVRAIQRQQTQQVQSPVDSATMSPVERTAAWVLN-NGQYEEDV--------EETEQNLD
1080 1090 1100 1110 1120
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 ELSQAEK---DLAVLQDKLRISTKKLEEYETLFKCQEETTQKLVLEYQARLEEGEERLRR
: ..::: ... :...::.:...::::: . ::. :::.:::.::::..::::::
CCDS13 EAKHAEKYEQEITKLKERLRVSSRRLEEYERRLLVQEQQMQKLLLEYKARLEDSEERLRR
1130 1140 1150 1160 1170 1180
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 QQEDKDIQMKGIISRLMSVEEELKKDHAEMQAAVDSKQKIIDAQEKRIASLDAANARLMS
:::.:: :::.::::::.::::::::::::::..:.::::::::::::.:::.::.::::
CCDS13 QQEEKDSQMKSIISRLMAVEEELKKDHAEMQAVIDAKQKIIDAQEKRIVSLDSANTRLMS
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1030
pF1KE3 ALTQLKESMH
::::.::
CCDS13 ALTQVKERYSMQVRNGISPTNPTKLSITENGEFKNSSC
1250 1260 1270 1280
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10 20 30
pF1KE3 MPRLKESRSHESLLSPSSAVEALDLSMEEE
: .:::.:::::::::::.:::.:...:.
CCDS34 TKSQPKLDRTSSFRQILPRFRSADHDRARLMQSFKESHSHESLLSPSSAAEALELNLDED
150 160 170 180 190 200
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 VVIKPVHSSILGQDYCFEVTTSSGSKCFSCRSAAERDKWMENLRRAVHPNKDNSRRVEHI
.:::::::::::..:::::::::.:::.::::::::::.:::.:::.:::::::::...
CCDS34 SIIKPVHSSILGQEFCFEVTTSSGTKCFACRSAAERDKWIENLQRAVKPNKDNSRRVDNV
210 220 230 240 250 260
100 110 120 130 140
pF1KE3 LKLWVIEAKDLPAKKKYLCELCLDDVLYARTTGKLKT---DNVFWGEHFEFHNLPPLRTV
::::.:::..:: ::.: :::::::.::::::.: .. :.:::::::::.::: .:..
CCDS34 LKLWIIEARELPPKKRYYCELCLDDMLYARTTSKPRSASGDTVFWGEHFEFNNLPAVRAL
270 280 290 300 310 320
150 160 170 180 190
pF1KE3 TVHLYRETDKKKKKERNSYLGLVSLPAASVAGRQFVEKWYPVVTPNPKGG----------
.::::..:::.::.. .:.:::..:.:..:::.:.:.::::. :. .::
CCDS34 RLHLYRDSDKKRKKDKAGYVGLVTVPVATLAGRHFTEQWYPVTLPTGSGGSGGMGSGGGG
330 340 350 360 370 380
200 210 220 230 240
pF1KE3 --------KGPG--PMIRIKARYQTITILPMEMYKEFAEHITNHYLGLCAALEPILSAKT
:: : : .:.::::::..:::::.::::::..:::: :::.::: :..:
CCDS34 GSGGGSGGKGKGGCPAVRLKARYQTMSILPMELYKEFAEYVTNHYRMLCAVLEPALNVKG
390 400 410 420 430 440
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 KEEMASALVHILQSTGKVKDFLTDLMMSEVDRCGDNEHLIFRENTLATKAIEEYLKLVGQ
:::.:::::::::::::.::::.:. :::::: . ::::::::::::::::::..:.::
CCDS34 KEEVASALVHILQSTGKAKDFLSDMAMSEVDRFMEREHLIFRENTLATKAIEEYMRLIGQ
450 460 470 480 490 500
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 KYLQDALGEFIKALYESDENCEVDPSKCSAADLPEHQGNLKMCCELAFCKIINSYCVFPR
:::.::.::::.:::::.::::::: ::.:..: :::.::.::::::.::..::.:::::
CCDS34 KYLKDAIGEFIRALYESEENCEVDPIKCTASSLAEHQANLRMCCELALCKVVNSHCVFPR
510 520 530 540 550 560
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 ELKEVFASWRQECSSRGRPDISERLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLLQEYPDDRTARTL
:::::::::: .:. ::: ::..::::::::::::::::::::::.:.:::::..:.:::
CCDS34 ELKEVFASWRLRCAERGREDIADRLISASLFLRFLCPAIMSPSLFGLMQEYPDEQTSRTL
570 580 590 600 610 620
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pF1KE3 TLIAKVTQNLANFAKFGSKEEYMSFMNQFLEHEWTNMQRFLLEISNPETLSNTAGFEGYI
:::::: ::::::.:: :::....:::.::: :: .::.:: :::: .::.:...:::::
CCDS34 TLIAKVIQNLANFSKFTSKEDFLGFMNEFLELEWGSMQQFLYEISNLDTLTNSSSFEGYI
630 640 650 660 670 680
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 DLGRELSSLHSLLWEAVSQLEQSIVSKLGPLPRILRDVHTALSTPGSGQLPGTNDLASTP
:::::::.::.::::.. :: . . :::::::.: :. ::: .:. . :. .. :
CCDS34 DLGRELSTLHALLWEVLPQLSKEALLKLGPLPRLLNDISTALRNPNIQRQPSRQSERPRP
690 700 710 720 730 740
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pF1KE3 GSGS-SSISAGLQKMVIEN-----DLS-----GL---IDFTRLPSPTPEN---------K
. :: .: ..... ::. :: .:..:::::: :. :
CCDS34 QPVVLRGPSAEMQGYMMRDLNSSIDLQSFMARGLNSSMDMARLPSPTKEKPPPPPPGGGK
750 760 770 780 790 800
590 600 610 620 630 640
pF1KE3 DLFFVTRSSGVQPSPARSSSYSEANEPDLQMANGGKSLSMVDLQDARTLDGEAGSPAGPD
:::.:.: .. ::: .: :. .::. .: . .::.::.::: :: .: . .
CCDS34 DLFYVSRPPLARSSPAYCTSSSDITEPEQKMLSVNKSVSMLDLQG----DGPGGRLNSSS
810 820 830 840 850
650 660 670 680 690
pF1KE3 V--LPTDG---QAAAAQLVAGWPARATP---VNLAGLATVRRAGQTPTTPG-TSEGAPGR
: : . : ... :.:.:. : .: .. .. ... ::. . : :..:.:..
CCDS34 VSNLAAVGDLLHSSQASLTAALGLRPAPAGRLSQGSGSSITAAGMRLSQMGVTTDGVPAQ
860 870 880 890 900 910
700 710 720 730
pF1KE3 PQLLAPLSFQNPVYQMAAGLPLSPRGLGDSGSEGHSSLSSH-------------------
:: :::::::...::: : : : : .: ::. :::
CCDS34 -QLRIPLSFQNPLFHMAADGPGPPGGHGGGG--GHGPPSSHHHHHHHHHHRGGEPPGDTF
920 930 940 950 960 970
740 750 760 770 780
pF1KE3 ------SNSEELAA------AAKLGSFSTAAEELARRPGELARRQMSLTEKGGQPTVPRQ
:.::.:.. ::.. . ..:.. ...:::.:: .. . : :
CCDS34 APFHGYSKSEDLSSGVPKPPAASILHSHSYSDEFGPSGTDFTRRQLSLQDNLQHMLSPPQ
980 990 1000 1010 1020 1030
790 800 810 820 830
pF1KE3 NSAGPQRRIDQPPPPPP--------------PPPPAPRGRTPPNLLSTLQYPRPSSGTLA
. :::: : : : ::: ::.. .:. : ::::::.:
CCDS34 ITIGPQR----PAPSGPGGGSGGGSGGGGGGQPPPLQRGKSQQLTVSAAQKPRPSSGNLL
1040 1050 1060 1070 1080 1090
840 850 860 870
pF1KE3 SASPDWVGPSTRLRQQSSSSKGD-----------SPELKPRAV--HKQGPSPVSPN--AL
.. ::. : :::: :..:. . ::: . :.: :: ..:. :
CCDS34 QSPEPSYGPA-RPRQQSLSKEGSIGGSGGSGGGGGGGLKPSITKQHSQTPSTLNPTMPAS
1100 1110 1120 1130 1140 1150
880 890 900 910 920
pF1KE3 DRTAAWLLTM--------NAQLLEDE-GLGPDPPHRDRLRSKDELSQAEKDLAVLQDKLR
.::.::. .: .:.. ..: : :. : :.... :... :...:.
CCDS34 ERTVAWVSNMPHLSADIESAHIEREEYKLKEYSKSMDESRL-DRVKEYEEEIHSLKERLH
1160 1170 1180 1190 1200 1210
930 940 950 960 970 980
pF1KE3 ISTKKLEEYETLFKCQEETTQKLVLEYQARLEEGEERLRRQQEDKDIQMKGIISRLMSVE
.:..:::::: . ::: :.:....::::::..:.:::.:: .:: :.:.::
CCDS34 MSNRKLEEYERRLLSQEEQTSKILMQYQARLEQSEKRLRQQQAEKDSQIKSIIGRLMLVE
1220 1230 1240 1250 1260 1270
990 1000 1010 1020 1030
pF1KE3 EELKKDHAEMQAAVDSKQKIIDAQEKRIASLDAANARLMSALTQLKESMH
CCDS34 EELRRDHPAMAEPLPEPKKRLLDAQERQLPPLGPTNPRVTLAPPWNGLAPPAPPPPPRLQ
1280 1290 1300 1310 1320 1330
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10 20 30
pF1KE3 MPRLKESRSHESLLSPSSAVEALDLSMEEEVVIKPVHS
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CCDS46 VHNVRGLLKRLKEKKKARLEPRDGPPSALGSRESLATLS----ELDLGAERDVRIWPLHP
200 210 220 230 240 250
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 SILGQDYCFEVTTSSGSKCFSCRSAAERDKWMENLRRAVHPNKDNSRRVEHILKLWVIEA
:.::. .::.:: ..::.:::::::::::.:.:.::: .:..:: .: : :..:: ::
CCDS46 SLLGEPHCFQVTWTGGSRCFSCRSAAERDRWIEDLRRQFQPTQDNVEREETWLSVWVHEA
260 270 280 290 300 310
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 KDLP----AKKKYLCELCLDDVLYARTTGKLKTDNVFWGEHFEFHNLPPLRTVTVHLYRE
: :: . :: :: .: :::. . ..::.:.:.:. ::: : ....: :
CCDS46 KGLPRAAAGAPGVRAELWLDGALLARTAPRAGPGQLFWAERFHFEALPPARRLSLRL-RG
320 330 340 350 360 370
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 TDKKKKKERNSYLGLVSL--PAASVAGRQFVEKWYPVVTPNPKGGKGPGPMIRIKARYQT
. :.: : : : .:: .:.:.:.. : : .: . : .
CCDS46 LGPGSAVLGRVALALEELDAPRAPAAG---LERWFPLL------GAPAGAALRARIRARR
380 390 400 410 420
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 ITILPMEMYKEFAEHITNHYLGLCAALEPILSAKTKEEMASALVHILQSTGKVKDFLTDL
. .:: : :::.:: .: :: ::.:::: : :..:::.:.:.:..:..::... ..:::
CCDS46 LRVLPSERYKELAEFLTFHYARLCGALEPALPAQAKEELAAAMVRVLRATGRAQALVTDL
430 440 450 460 470 480
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 MMSEVDRCGDNEHLIFRENTLATKAIEEYLKLVGQKYLQDALGEFIKALYESDENCEVDP
.:. ::: : :.:::::::::::.::.:::.: :::..::. .. : : :.:::::
CCDS46 GTAELARCGGREALLFRENTLATKAIDEYMKLVAQDYLQETLGQVVRRLCASTEDCEVDP
490 500 510 520 530 540
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 SKCSAADLPEHQGNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWRQECSSRGRPDISERL
::: :..:::::. :. :: .: ::.:: :: :: ::.:::. :. :: .. ::
CCDS46 SKCPASELPEHQARLRNSCEEVFETIIHSYDWFPAELGIVFSSWREACKERGSEVLGPRL
550 560 570 580 590 600
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 ISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLLQEYPDDRTARTLTLIAKVTQNLANFAKFGSKEEYMSF
. ::::::.:::::..::::.: ..: :::::::::: ::::: : :: :: ::.:
CCDS46 VCASLFLRLLCPAILAPSLFGLAPDHPAPGPARTLTLIAKVIQNLANRAPFGEKEAYMGF
610 620 630 640 650 660
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 MNQFLEHEWTNMQRFLLEISNPETLSNTAGFEGYIDLGRELSSLHSLLWEAVSQLEQSIV
::.:::.. :: :: ... .. . .:..: ::. .:. ::. : ..:.:.
CCDS46 MNSFLEEHGPAMQCFLDQVAMVDVDAAPSGYQGSGDLALQLAVLHAQLCTIFAELDQTTR
670 680 690 700 710 720
520 530 540 550 560
pF1KE3 SKLGPLPRILRDVHTA----LSTPGSGQLPGTNDLASTPGSGSSSISAGLQKMVIENDLS
. : ::: ::: .. . .:.: :: :.. ::.::: .
CCDS46 DTLEPLPTILRAIEEGQPVLVSVPMRLPLP--------PAQVHSSLSAGEKP--------
730 740 750 760
570 580 590 600 610 620
pF1KE3 GLIDFTRLPSPTP---ENKDLFFVTRS-SGVQPSPARSSSYSEANEPDLQMANGGKSLSM
:.. ::. :: ....: : :: : ..: :
CCDS46 GFLAPRDLPKHTPLISKSQSLRSVRRSESWARPRPDEERPLRRPRPVQRTQSVPVRRPAR
770 780 790 800 810 820
630 640 650 660 670 680
pF1KE3 VDLQDARTLDGEAGSPAGPDVLPTDGQAAAAQLVAGWPARATPVNLAGLATVRRAGQTPT
CCDS46 RRQSAGPWPRPKGSLSMGPAPRARPWTRDSASLPRKPSVPWQRQMDQPQDRNQALGTHRP
830 840 850 860 870 880
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CCDS34 PVKHFTNPYCNIYLNSVQVAKTHAR-EGQNPVWSEEFVFDDLPP----DINRFEITLSNK
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CCDS34 TKKSKDPDILFMRCQLSRLQKGHATDEWFLLSSHIPLKGIEPGSL-RVRARYSMEKIMPE
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CCDS34 SMEDEATTLFRATTLASTLMEQYMKATATQFVHHALKDSILKIMESKQSCELSPSKLEKN
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