FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3380, 1132 aa
1>>>pF1KE3380 1132 - 1132 aa - 1132 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5286+/-0.00152; mu= 5.0456+/- 0.086
mean_var=275.3668+/-63.865, 0's: 0 Z-trim(102.8): 714 B-trim: 62 in 1/48
Lambda= 0.077289
statistics sampled from 6382 (7189) to 6382 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.557), E-opt: 0.2 (0.215), width: 16
Scan time: 2.010
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS6457.1 JAK2 gene_id:3717|Hs109|chr9 (1132) 7669 871.2 0
CCDS12366.1 JAK3 gene_id:3718|Hs109|chr19 (1124) 3009 351.6 6.1e-96
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CCDS12236.1 TYK2 gene_id:7297|Hs109|chr19 (1187) 785 103.6 2.8e-21
CCDS33928.1 TNK2 gene_id:10188|Hs109|chr3 (1038) 537 75.9 5.5e-13
CCDS77875.1 TNK2 gene_id:10188|Hs109|chr3 (1040) 537 75.9 5.5e-13
CCDS33927.1 TNK2 gene_id:10188|Hs109|chr3 (1086) 537 75.9 5.6e-13
CCDS1241.1 DDR2 gene_id:4921|Hs109|chr1 ( 855) 504 72.1 6.2e-12
CCDS5103.1 FRK gene_id:2444|Hs109|chr6 ( 505) 496 71.0 8.1e-12
CCDS44283.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 ( 542) 481 69.4 2.7e-11
CCDS33254.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs109|chr2 ( 619) 481 69.4 3e-11
CCDS35166.1 ABL1 gene_id:25|Hs109|chr9 (1130) 485 70.2 3.2e-11
CCDS33255.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs109|chr2 ( 312) 474 68.3 3.2e-11
CCDS35165.1 ABL1 gene_id:25|Hs109|chr9 (1149) 485 70.2 3.3e-11
CCDS47992.1 SYK gene_id:6850|Hs109|chr9 ( 612) 479 69.2 3.4e-11
CCDS6688.1 SYK gene_id:6850|Hs109|chr9 ( 635) 479 69.2 3.5e-11
CCDS53435.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 (1043) 481 69.7 4.2e-11
CCDS53437.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 (1058) 481 69.7 4.2e-11
CCDS44282.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 (1064) 481 69.7 4.2e-11
CCDS53438.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 (1079) 481 69.7 4.3e-11
CCDS53436.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 (1161) 481 69.7 4.5e-11
CCDS41441.2 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 (1167) 481 69.7 4.5e-11
CCDS30947.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 (1182) 481 69.7 4.5e-11
CCDS42811.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs109|chr2 (1292) 480 69.7 5.2e-11
CCDS2394.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs109|chr2 (1308) 480 69.7 5.2e-11
CCDS10269.1 CSK gene_id:1445|Hs109|chr15 ( 450) 467 67.7 7.1e-11
CCDS47859.1 LYN gene_id:4067|Hs109|chr8 ( 491) 464 67.4 9.4e-11
CCDS6162.1 LYN gene_id:4067|Hs109|chr8 ( 512) 464 67.4 9.7e-11
>>CCDS6457.1 JAK2 gene_id:3717|Hs109|chr9 (1132 aa)
initn: 7669 init1: 7669 opt: 7669 Z-score: 4644.3 bits: 871.2 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 7669; 100.0% identity (100.0% similar) in 1132 aa overlap (1-1132:1-1132)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGMACLTMTEMEGTSTSSIYQNGDISGNANSMKQIDPVLQVYLYHSLGKSEADYLTFPSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MGMACLTMTEMEGTSTSSIYQNGDISGNANSMKQIDPVLQVYLYHSLGKSEADYLTFPSG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 EYVAEEICIAASKACGITPVYHNMFALMSETERIWYPPNHVFHIDESTRHNVLYRIRFYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 EYVAEEICIAASKACGITPVYHNMFALMSETERIWYPPNHVFHIDESTRHNVLYRIRFYF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 PRWYCSGSNRAYRHGISRGAEAPLLDDFVMSYLFAQWRHDFVHGWIKVPVTHETQEECLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PRWYCSGSNRAYRHGISRGAEAPLLDDFVMSYLFAQWRHDFVHGWIKVPVTHETQEECLG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 MAVLDMMRIAKENDQTPLAIYNSISYKTFLPKCIRAKIQDYHILTRKRIRYRFRRFIQQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MAVLDMMRIAKENDQTPLAIYNSISYKTFLPKCIRAKIQDYHILTRKRIRYRFRRFIQQF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 SQCKATARNLKLKYLINLETLQSAFYTEKFEVKEPGSGPSGEEIFATIIITGNGGIQWSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SQCKATARNLKLKYLINLETLQSAFYTEKFEVKEPGSGPSGEEIFATIIITGNGGIQWSR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 GKHKESETLTEQDLQLYCDFPNIIDVSIKQANQEGSNESRVVTIHKQDGKNLEIELSSLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GKHKESETLTEQDLQLYCDFPNIIDVSIKQANQEGSNESRVVTIHKQDGKNLEIELSSLR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 EALSFVSLIDGYYRLTADAHHYLCKEVAPPAVLENIQSNCHGPISMDFAISKLKKAGNQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 EALSFVSLIDGYYRLTADAHHYLCKEVAPPAVLENIQSNCHGPISMDFAISKLKKAGNQT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 GLYVLRCSPKDFNKYFLTFAVERENVIEYKHCLITKNENEEYNLSGTKKNFSSLKDLLNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GLYVLRCSPKDFNKYFLTFAVERENVIEYKHCLITKNENEEYNLSGTKKNFSSLKDLLNC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 YQMETVRSDNIIFQFTKCCPPKPKDKSNLLVFRTNGVSDVPTSPTLQRPTHMNQMVFHKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 YQMETVRSDNIIFQFTKCCPPKPKDKSNLLVFRTNGVSDVPTSPTLQRPTHMNQMVFHKI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 RNEDLIFNESLGQGTFTKIFKGVRREVGDYGQLHETEVLLKVLDKAHRNYSESFFEAASM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RNEDLIFNESLGQGTFTKIFKGVRREVGDYGQLHETEVLLKVLDKAHRNYSESFFEAASM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 MSKLSHKHLVLNYGVCVCGDENILVQEFVKFGSLDTYLKKNKNCINILWKLEVAKQLAWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MSKLSHKHLVLNYGVCVCGDENILVQEFVKFGSLDTYLKKNKNCINILWKLEVAKQLAWA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 MHFLEENTLIHGNVCAKNILLIREEDRKTGNPPFIKLSDPGISITVLPKDILQERIPWVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MHFLEENTLIHGNVCAKNILLIREEDRKTGNPPFIKLSDPGISITVLPKDILQERIPWVP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 PECIENPKNLNLATDKWSFGTTLWEICSGGDKPLSALDSQRKLQFYEDRHQLPAPKWAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PECIENPKNLNLATDKWSFGTTLWEICSGGDKPLSALDSQRKLQFYEDRHQLPAPKWAEL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 ANLINNCMDYEPDFRPSFRAIIRDLNSLFTPDYELLTENDMLPNMRIGALGFSGAFEDRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 ANLINNCMDYEPDFRPSFRAIIRDLNSLFTPDYELLTENDMLPNMRIGALGFSGAFEDRD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 PTQFEERHLKFLQQLGKGNFGSVEMCRYDPLQDNTGEVVAVKKLQHSTEEHLRDFEREIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PTQFEERHLKFLQQLGKGNFGSVEMCRYDPLQDNTGEVVAVKKLQHSTEEHLRDFEREIE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 ILKSLQHDNIVKYKGVCYSAGRRNLKLIMEYLPYGSLRDYLQKHKERIDHIKLLQYTSQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 ILKSLQHDNIVKYKGVCYSAGRRNLKLIMEYLPYGSLRDYLQKHKERIDHIKLLQYTSQI
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 CKGMEYLGTKRYIHRDLATRNILVENENRVKIGDFGLTKVLPQDKEYYKVKEPGESPIFW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 CKGMEYLGTKRYIHRDLATRNILVENENRVKIGDFGLTKVLPQDKEYYKVKEPGESPIFW
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 YAPESLTESKFSVASDVWSFGVVLYELFTYIEKSKSPPAEFMRMIGNDKQGQMIVFHLIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 YAPESLTESKFSVASDVWSFGVVLYELFTYIEKSKSPPAEFMRMIGNDKQGQMIVFHLIE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE3 LLKNNGRLPRPDGCPDEIYMIMTECWNNNVNQRPSFRDLALRVDQIRDNMAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LLKNNGRLPRPDGCPDEIYMIMTECWNNNVNQRPSFRDLALRVDQIRDNMAG
1090 1100 1110 1120 1130
>>CCDS12366.1 JAK3 gene_id:3718|Hs109|chr19 (1124 aa)
initn: 3246 init1: 1119 opt: 3009 Z-score: 1836.1 bits: 351.6 E(33420): 6.1e-96
Smith-Waterman score: 3664; 50.6% identity (76.8% similar) in 1092 aa overlap (48-1132:34-1104)
20 30 40 50 60 70
pF1KE3 SIYQNGDISGNANSMKQIDPVLQVYLYHSLGKSEADYLTFPSGEYVAEEICIAASKACGI
: . . :.: :...::..:. :.:: ::
CCDS12 PSEETPLIPQRSCSLLSTEAGALHVLLPARGPGPPQRLSFSFGDHLAEDLCVQAAKASGI
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KE3 TPVYHNMFALMSETERIWYPPNHVFHIDESTRHNVLYRIRFYFPRWYCSGSNRAYRHGIS
::::..::: .: :.::.:.: ..... . .::::::::: :. : .. .: :.
CCDS12 LPVYHSLFALATEDLSCWFPPSHIFSVEDASTQVLLYRIRFYFPNWF--GLEKCHRFGLR
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KE3 RGAEAPLLDDFVMSYLFAQWRHDFVHGWIKVPVTHETQEECLGMAVLDMMRIAKENDQTP
. . .:: :. .:::: : :.: : . : .. . : :::..::::. :.:.:. : :
CCDS12 KDLASAILDLPVLEHLFAQHRSDLVSGRLPVGLSLKEQGECLSLAVLDLARMAREQAQRP
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KE3 LAIYNSISYKTFLPKCIRAKIQDYHILTRKRIRYRFRRFIQQFSQCKATARNLKLKYLIN
. ...:::. :: .: :: ..::.::: :: ... . :.: ..: ::...
CCDS12 GELLKTVSYKACLPPSLRDLIQGLSFVTRRRIRRTVRRALRRVAACQADRHSLMAKYIMD
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 LETLQSAFYTEKFEVKEPGSGPSGEEIFATIIITGNGGIQWSRGKHKESETLTEQDLQLY
:: :. : .: :.: ::. .:.. .. . ..:.::: :..: :.:.: : .
CCDS12 LERLDPAGAAETFHVGLPGAL-GGHDGLGLLRVAGDGGIAWTQG---EQEVL-----QPF
250 260 270 280 290
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 CDFPNIIDVSIKQANQEG-SNESRVVTIHKQDGKNLEIELSSLREALSFVSLIDGYYRLT
::::.:.:.::::: . : ..: :.::. . :.. :: :. .: ::::::.:.:::.:::
CCDS12 CDFPEIVDISIKQAPRVGPAGEHRLVTVTRTDNQILEAEFPGLPEALSFVALVDGYFRLT
300 310 320 330 340 350
380 390 400 410 420 430
pF1KE3 ADAHHYLCKEVAPPAVLENIQSNCHGPISMDFAISKLKKAGNQTGLYVLRCSPKDFNKYF
.:..:..::::::: .::.. .:::::..::::.::: .:.. : :::: ::.::....
CCDS12 TDSQHFFCKEVAPPRLLEEVAEQCHGPITLDFAINKLKTGGSRPGSYVLRRSPQDFDSFL
360 370 380 390 400 410
440 450 460 470 480 490
pF1KE3 LTFAVERENVIEYKHCLITKNENEEYNLSGTKKNFSSLKDLL-NCYQMETVRSDNIIFQF
:: :. .:: ::: .. . . : : .. :::..:: .:.. .. :.. .
CCDS12 LTVCVQNPLGPDYKGCLIRRSPTGTFLLVGLSRPHSSLRELLATCWDG-GLHVDGVAVTL
420 430 440 450 460 470
500 510 520 530 540 550
pF1KE3 TKCCPPKPKDKSNLLVFRTNGVSDVPTSPTLQRPTH--MNQMVFHKIRNEDLIFNESLGQ
:.:: :.::.::::.: . : : ::: .: .. ..::.:::: ..: ..:.::.
CCDS12 TSCCIPRPKEKSNLIVVQR-GHSP-PTSSLVQPQSQYQLSQMTFHKIPADSLEWHENLGH
480 490 500 510 520
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pF1KE3 GTFTKIFKGVRREVGDYGQLHETEVLLKVLDKAHRNYSESFFEAASMMSKLSHKHLVLNY
:.::::..: :.:: : :. ..:::::::.: :.: :::.::::.::..:..:::: .
CCDS12 GSFTKIYRGCRHEVVD-GEARKTEVLLKVMDAKHKNCMESFLEAASLMSQVSYRHLVLLH
530 540 550 560 570 580
620 630 640 650 660 670
pF1KE3 GVCVCGDENILVQEFVKFGSLDTYLKKNKNCINILWKLEVAKQLAWAMHFLEENTLIHGN
:::. :: . .:::::..:..: ::.: . . :::.:.::::.:...::.. : :::
CCDS12 GVCMAGD-STMVQEFVHLGAIDMYLRKRGHLVPASWKLQVVKQLAYALNYLEDKGLPHGN
590 600 610 620 630 640
680 690 700 710 720 730
pF1KE3 VCAKNILLIREEDRKTGNPPFIKLSDPGISITVLPKDILQERIPWVPPECIENPKNLNLA
: :...:: :: :.::::::::::.: .:: ..: .::::: :::... ..:.:
CCDS12 VSARKVLLAREG--ADGSPPFIKLSDPGVSPAVLSLEMLTDRIPWVAPECLREAQTLSLE
650 660 670 680 690 700
740 750 760 770 780 790
pF1KE3 TDKWSFGTTLWEICSGGDKPLSALDSQRKLQFYEDRHQLPAPKWAELANLINNCMDYEPD
.:::.::.:.::. :: :.:::: .::::::::.:::::::.::: ::..:: :::
CCDS12 ADKWGFGATVWEVFSGVTMPISALDPAKKLQFYEDRQQLPAPKWTELALLIQQCMAYEPV
710 720 730 740 750 760
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pF1KE3 FRPSFRAIIRDLNSLFTPDYELLTENDMLPNMRIGALGF-SGA--FEDRDPTQFEERHLK
::::::.:::::::.. :::::. : :. :. .:: . .::: :::::::
CCDS12 QRPSFRAVIRDLNSLISSDYELLS--DPTPGALAPRDGLWNGAQLYACQDPTIFEERHLK
770 780 790 800 810 820
860 870 880 890 900 910
pF1KE3 FLQQLGKGNFGSVEMCRYDPLQDNTGEVVAVKKLQHSTEEHLRDFEREIEILKSLQHDNI
...:::::::::::.:::::: :::: .::::.:::: .. :::.:::.:::.:. : :
CCDS12 YISQLGKGNFGSVELCRYDPLGDNTGALVAVKQLQHSGPDQQRDFQREIQILKALHSDFI
830 840 850 860 870 880
920 930 940 950 960 970
pF1KE3 VKYKGVCYSAGRRNLKLIMEYLPYGSLRDYLQKHKERIDHIKLLQYTSQICKGMEYLGTK
:::.:: :. ::..:.:.::::: : :::.::.:. :.: .:: :.:::::::::::..
CCDS12 VKYRGVSYGPGRQSLRLVMEYLPSGCLRDFLQRHRARLDASRLLLYSSQICKGMEYLGSR
890 900 910 920 930 940
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KE3 RYIHRDLATRNILVENENRVKIGDFGLTKVLPQDKEYYKVKEPGESPIFWYAPESLTESK
: .:::::.::::::.: .:::.::::.:.:: ::.:: :.:::.:::::::::::...
CCDS12 RCVHRDLAARNILVESEAHVKIADFGLAKLLPLDKDYYVVREPGQSPIFWYAPESLSDNI
950 960 970 980 990 1000
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KE3 FSVASDVWSFGVVLYELFTYIEKSKSPPAEFMRMIGNDKQGQMIVFHLIELLKNNGRLPR
:: :::::::::::::::: .:: :: :::.::.: ... . .:.:::... :::
CCDS12 FSRQSDVWSFGVVLYELFTYCDKSCSPSAEFLRMMGCERDVPALC-RLLELLEEGQRLPA
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1100 1110 1120 1130
pF1KE3 PDGCPDEIYMIMTECWNNNVNQRPSFRDLALRVDQIRDNMAG
: .:: :.. .: :: . ..:::: :. ..:.. .. :
CCDS12 PPACPAEVHELMKLCWAPSPQDRPSFSALGPQLDMLWSGSRGCETHAFTAHPEGKHHSLS
1070 1080 1090 1100 1110 1120
CCDS12 FS
>>CCDS41346.1 JAK1 gene_id:3716|Hs109|chr1 (1154 aa)
initn: 2087 init1: 760 opt: 1119 Z-score: 697.0 bits: 140.9 E(33420): 1.7e-32
Smith-Waterman score: 3082; 44.0% identity (71.5% similar) in 1157 aa overlap (31-1119:28-1145)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGMACLTMTEMEGTSTSSIYQNGDISGNANSMKQIDPVLQVYLYHSLGKSEADYLTFPSG
... .: ..: .: : . . : . ::
CCDS41 MQYLNIKEDCNAMAFCAKMRSSKKTEVNLEAPEPGVEVIFYLS----DREPLRLGSG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 EYVAEEICIAASKACGITPVYHNMFALMSETERIWYPPNHVFHIDESTRHNVLYRIRFYF
::.:::.:: :..:: :.:. ::.:::..:. ..:: ::... .:.. . ::.::::
CCDS41 EYTAEELCIRAAQACRISPLCHNLFALYDENTKLWYAPNRTITVDDKMSLRLHYRMRFYF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160
pF1KE3 PRWYCSGSNR--AYRHGISR---GAE-------APLLDDFVMSYLFAQWRHDFVH--GWI
:. ...:. ..::. .. : : .:::: . ::::: ..:.:. . :
CCDS41 TNWHGTNDNEQSVWRHSPKKQKNGYEKKKIPDATPLLDASSLEYLFAQGQYDLVKCLAPI
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 KVPVT----HETQEECLGMAVLDMMRIAKEND-QTPLAIYNSISYKTFLPKCIRAKIQDY
. : : :. ..:::::::: . . : . : : . ..:::: ..:. . .:..
CCDS41 RDPKTEQDGHDIENECLGMAVLAISHYAMMKKMQLP-ELPKDISYKRYIPETLNKSIRQR
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KE3 HILTRKRIRYRFRRFIQQFSQ---CKATA--RNLKLKYLINLETLQSAFYTEKFEVK---
..::: :: :. :...:.. : ... ..::.::: .:::: . . .: ::..
CCDS41 NLLTRMRINNVFKDFLKEFNNKTICDSSVSTHDLKVKYLATLETLTKHYGAEIFETSMLL
240 250 260 270 280 290
280 290 300
pF1KE3 -----EPG---SGPSGEEIFATIIITGNGGIQWSR--------------------GKHKE
: . :. .:. .. ...::: :::: . .:::.
CCDS41 ISSENEMNWFHSNDGGNVLYYEVMVTGNLGIQWRHKPNVVSVEKEKNKLKRKKLENKHKK
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 SETLTE--QDLQLYCDFPNIIDVSIKQANQEGSNESRVVTIHKQDGKNLEIELSSLREAL
.: .. .. . . ::.: . ::.. ::.:.:::.:..:..::: .:::
CCDS41 DEEKNKIREEWNNFSYFPEITHIVIKES---------VVSINKQDNKKMELKLSSHEEAL
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370 380 390 400 410 420
pF1KE3 SFVSLIDGYYRLTADAHHYLCKEVAPPAVLENIQSNCHGPISMDFAISKLKKAGNQTGLY
:::::.:::.::::::::::: .:::: ...:::..::::: ..::.::.. :.. :.:
CCDS41 SFVSLVDGYFRLTADAHHYLCTDVAPPLIVHNIQNGCHGPICTEYAINKLRQEGSEEGMY
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430 440 450 460 470
pF1KE3 VLRCSPKDFNKYFLTFAV-ERENVIE-----YKHCLITKNENEEYNLSGTKKNFSSLKDL
::: : ::.. ..: . :. . .. .:. : . .. .:.: :. ..: :: ::
CCDS41 VLRWSCTDFDNILMTVTCFEKSEQVQGAQKQFKNFQI-EVQKGRYSLHGSDRSFPSLGDL
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pF1KE3 LNCYQMETVRSDNIIFQFTKCCPPKPKDKSNLLVFRTNGVSDVPTSPTLQRPTHMNQMVF
.. . . .:.::: :.. .:: :::.. ::::: .. :. : :.:. :
CCDS41 MSHLKKQILRTDNISFMLKRCCQPKPREISNLLVATKKAQEWQPVYP-------MSQLSF
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540 550 560 570 580 590
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.: ..::. .: ::.:: :.:..:. . : : .: . :.::::: .::. : .:
CCDS41 DRILKKDLVQGEHLGRGTRTHIYSGTLMDYKDDEGTSEEKKIKVILKVLDPSHRDISLAF
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::::::: ..::::.: ::::: :::.:.:::. : :: ....... .. ::..::
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pF1KE3 KQLAWAMHFLEENTLIHGNVCAKNILLIREE-DRKTGNPPFIKLSDPGISITVLPKDILQ
:::: :. .::.. :.:::::.::.:: :: : . : :::::::::: :::: ..
CCDS41 KQLASALSYLEDKDLVHGNVCTKNLLLAREGIDSECG--PFIKLSDPGIPITVLSRQECI
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:::::. :::.:. :::..:.::::::::::::: .:. ::. .: .:::.: .
CCDS41 ERIPWIAPECVEDSKNLSVAADKWSFGTTLWEICYNGEIPLKDKTLIEKERFYESRCRPV
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pF1KE3 APKWAELANLINNCMDYEPDFRPSFRAIIRDLNSLFTPDYELLTENDMLPNMRIGALGFS
.:. :::.:.. ::.:.:. :: ::::.::.:.: . ....:. : ..
CCDS41 TPSCKELADLMTRCMNYDPNQRPFFRAIMRDINKLEEQNPDIVSEKK--PATEV------
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pF1KE3 GAFEDRDPTQFEERHLKFLQQLGKGNFGSVEMCRYDPLQDNTGEVVAVKKLQ-HSTEEHL
:::.::.: :: ...::.:.::.::.::::: ::::: ::::.:. .: .:.
CCDS41 ------DPTHFEKRFLKRIRDLGEGHFGKVELCRYDPEGDNTGEQVAVKSLKPESGGNHI
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pF1KE3 RDFEREIEILKSLQHDNIVKYKGVCYSAGRRNLKLIMEYLPYGSLRDYLQKHKERIDHIK
:...:::::..: :.:::::::.: : ..:::::.:: :::..:: :.:..:. .
CCDS41 ADLKKEIEILRNLYHENIVKYKGICTEDGGNGIKLIMEFLPSGSLKEYLPKNKNKINLKQ
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pF1KE3 LLQYTSQICKGMEYLGTKRYIHRDLATRNILVENENRVKIGDFGLTKVLPQDKEYYKVKE
:.:. ::::::.:::...:.:::::.::.:::.:..::::::::::.. ::::: ::.
CCDS41 QLKYAVQICKGMDYLGSRQYVHRDLAARNVLVESEHQVKIGDFGLTKAIETDKEYYTVKD
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pF1KE3 PGESPIFWYAPESLTESKFSVASDVWSFGVVLYELFTYIEKSKSPPAEFMRMIGNDKQGQ
.::.:::::: : .::: .:::::::::.:.::.:: ....:: : :..::: .::
CCDS41 DRDSPVFWYAPECLMQSKFYIASDVWSFGVTLHELLTYCDSDSSPMALFLKMIG-PTHGQ
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1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE3 MIVFHLIELLKNNGRLPRPDGCPDEIYMIMTECWNNNVNQRPSFRDLALRVDQIRDNMAG
: : .:.. ::.. ::: : .::::.:..: .::. . ..: ::..:
CCDS41 MTVTRLVNTLKEGKRLPCPPNCPDEVYQLMRKCWEFQPSNRTSFQNLIEGFEALLK
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: : : . .. ..:: . .:::.::
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CCDS12 AHKVGITPPCFNLFALFDAQAQVWLPPNHILEIPRDASLMLYFRIRFYFRNWH--GMNPR
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CCDS12 EPAVYRCGPP-GTEASSDQTAQGMQLLDPASFEYLFEQGKHEFVNDVASLWELSTEEEIH
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. ..: :::: : . ..: .. :: . .. :.: .:. .: .:... ::: :.:
CCDS12 HFKNESLGMAFLHLCHLALRHG-IPLEEVAKKTSFKDCIPRSFRRHIRQHSALTRLRLRN
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::::...:. . . . . .::: .:: : : ::. : ::
CCDS12 VFRRFLRDFQPGRLSQQMVMVKYLATLERLAPRFGTERVPVCHLRLLAQAEGEPCYIRDS
240 250 260 270 280 290
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: .:. : : : ...::.::::: : :.
CCDS12 GVAPTDPGPESAAGPPTHEVLVTGTGGIQWWPVEEEVNKEEGSSGSSGRNPQASLFGKKA
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310 320 330 340 350
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:: .. : .::: .: : .:. . :.::.::.: ::. :
CCDS12 KAHKAVGQPADRPREPLWAYFCDFRDITHVVLKE---------HCVSIHRQDNKCLELSL
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CCDS12 PSRAAALSFVSLVDGYFRLTADSSHYLCHEVAPPRLVMSIRDGIHGPLLEPFVQAKLRP-
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CCDS12 LSQLSFHRVDQKEITQLSHLGQGTRTNVYEGRLRVEGSGDPEEGKMDDEDPLVPGRDRGQ
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: .:.::::: .:.. . .:.:.::.::..:: ::.. .:::: : :::.: :.:. : :
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:..:..... . . ::. ::.::: :. .::...:.:::::..:::: : :. ::
CCDS12 DVWLRRERGHVPMAWKMVVAQQLASALSYLENKNLVHGNVCGRNILLARL-GLAEGTSPF
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:.. . ..: .::. .:.:: :. .::.: ..:. ::: :::::.:.:::. : .
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.: ::::::: .:. : .:: ...:::.:: :: ...:::::::.::.:..:. ::
CCDS12 VPLGSLRDYLPRHS--IGLAQLLLFAQQICEGMAYLHAQHYIHRDLAARNVLLDNDRLVK
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CCDS12 IGDFGLAKAVPEGHEYYRVREDGDSPVFWYAPECLKEYKFYYASDVWSFGVTLYELLTHC
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CCDS12 DSSQSPPTKFLELIGI-AQGQMTVLRLTELLERGERLPRPDKCPCEVYHLMKNCWETEAS
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1120 1130
pF1KE3 QRPSFRDLALRVDQIRDNMAG
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CCDS12 FRPTFENLIPILKTVHEKYQGQAPSVFSVC
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pF1KE3 QRPSFRDLALRVDQIRDNMAG
.::.: .:::
CCDS33 DRPTF--VALRDFLLEAQPTDMRALQDFEEPDKLHIQMNDVITVIEGRAENYWWRGQNTR
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CCDS77 PLGSLLDRLRKHQGHFLLGTLSRYAVQVAEGMGYLESKRFIHRDLAARNLLLATRDLVKI
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CCDS77 GDFGLMRALPQNDDHYVMQEHRKVPFAWCAPESLKTRTFSHASDTWMFGVTLWEMFTY--
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CCDS77 -GQEP------WIGLNGSQ----ILHKID--KEGERLPRPEDCPQDIYNVMVQCWAHKPE
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pF1KE3 QRPSFRDLALRVDQIRDNMAG
.::.: .:::
CCDS77 DRPTF--VALRDFLLEAQPTDMRALQDFEEPDKLHIQMNDVITVIEGRAENYWWRGQNTR
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:. :..:..:: :.:: :. ..: . .:
CCDS33 HSQSTFRKTSPAPGGPAGEGPLQSLTCLIGEKDLRLLEKLGDGSFGVVRRGEWDAPSGKT
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pF1KE3 GEVVAVKKLQH---STEEHLRDFEREIEILKSLQHDNIVKYKGVCYSAGRRNLKLIMEYL
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CCDS33 -VSVAVKCLKPDVLSQPEAMDDFIREVNAMHSLDHRNLIRLYGVVLTPP---MKMVTELA
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pF1KE3 PYGSLRDYLQKHKERIDHIKLLQYTSQICKGMEYLGTKRYIHRDLATRNILVENENRVKI
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CCDS33 PLGSLLDRLRKHQGHFLLGTLSRYAVQVAEGMGYLESKRFIHRDLAARNLLLATRDLVKI
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CCDS51 TFETLRWKLEDYFETDSSYSDANNFIR
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CCDS44 GVWKKYSLTVAVKTLKEDTME-VEEFLKEAAVMKEIKHPNLVQLLGVC--TLEPPFYIVT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]