Result of FASTA (ccds) for
pF1KE3369
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3369, 1089 aa
1>>>pF1KE3369 1089 - 1089 aa - 1089 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.9787+/-0.00192; mu= -22.0845+/- 0.107
mean_var=615.8491+/-146.411, 0's: 0 Z-trim(103.4): 345 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.051682
statistics sampled from 7126 (7403) to 7126 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.565), E-opt: 0.2 (0.227), width: 16
Scan time: 3.590
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3495.1 PDGFRA gene_id:5156|Hs108|chr4 (1089) 7141 549.9 1.1e-155
CCDS4303.1 PDGFRB gene_id:5159|Hs108|chr5 (1106) 3019 242.6 3.6e-63
CCDS47058.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4 ( 972) 822 78.7 6.8e-14
CCDS3496.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4 ( 976) 822 78.8 6.8e-14
CCDS9330.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13 (1338) 773 75.2 1.1e-12
CCDS31953.1 FLT3 gene_id:2322|Hs108|chr13 ( 993) 765 74.5 1.3e-12
CCDS4302.1 CSF1R gene_id:1436|Hs108|chr5 ( 972) 756 73.8 2.1e-12
CCDS43412.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5 (1298) 754 73.8 2.8e-12
CCDS4457.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5 (1363) 754 73.8 2.9e-12
CCDS3497.1 KDR gene_id:3791|Hs108|chr4 (1356) 750 73.5 3.6e-12
>>CCDS3495.1 PDGFRA gene_id:5156|Hs108|chr4 (1089 aa)
initn: 7141 init1: 7141 opt: 7141 Z-score: 2908.6 bits: 549.9 E(32554): 1.1e-155
Smith-Waterman score: 7141; 100.0% identity (100.0% similar) in 1089 aa overlap (1-1089:1-1089)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGTSHPAFLVLGCLLTGLSLILCQLSLPSILPNENEKVVQLNSSFSLRCFGESEVSWQYP
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CCDS34 MGTSHPAFLVLGCLLTGLSLILCQLSLPSILPNENEKVVQLNSSFSLRCFGESEVSWQYP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 MSEEESSDVEIRNEENNSGLFVTVLEVSSASAAHTGLYTCYYNHTQTEENELEGRHIYIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MSEEESSDVEIRNEENNSGLFVTVLEVSSASAAHTGLYTCYYNHTQTEENELEGRHIYIY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VPDPDVAFVPLGMTDYLVIVEDDDSAIIPCRTTDPETPVTLHNSEGVVPASYDSRQGFNG
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CCDS34 VPDPDVAFVPLGMTDYLVIVEDDDSAIIPCRTTDPETPVTLHNSEGVVPASYDSRQGFNG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 TFTVGPYICEATVKGKKFQTIPFNVYALKATSELDLEMEALKTVYKSGETIVVTCAVFNN
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CCDS34 TFTVGPYICEATVKGKKFQTIPFNVYALKATSELDLEMEALKTVYKSGETIVVTCAVFNN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 EVVDLQWTYPGEVKGKGITMLEEIKVPSIKLVYTLTVPEATVKDSGDYECAARQATREVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EVVDLQWTYPGEVKGKGITMLEEIKVPSIKLVYTLTVPEATVKDSGDYECAARQATREVK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 EMKKVTISVHEKGFIEIKPTFSQLEAVNLHEVKHFVVEVRAYPPPRISWLKNNLTLIENL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EMKKVTISVHEKGFIEIKPTFSQLEAVNLHEVKHFVVEVRAYPPPRISWLKNNLTLIENL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 TEITTDVEKIQEIRYRSKLKLIRAKEEDSGHYTIVAQNEDAVKSYTFELLTQVPSSILDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TEITTDVEKIQEIRYRSKLKLIRAKEEDSGHYTIVAQNEDAVKSYTFELLTQVPSSILDL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 VDDHHGSTGGQTVRCTAEGTPLPDIEWMICKDIKKCNNETSWTILANNVSNIITEIHSRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VDDHHGSTGGQTVRCTAEGTPLPDIEWMICKDIKKCNNETSWTILANNVSNIITEIHSRD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 RSTVEGRVTFAKVEETIAVRCLAKNLLGAENRELKLVAPTLRSELTVAAAVLVLLVIVII
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CCDS34 RSTVEGRVTFAKVEETIAVRCLAKNLLGAENRELKLVAPTLRSELTVAAAVLVLLVIVII
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 SLIVLVVIWKQKPRYEIRWRVIESISPDGHEYIYVDPMQLPYDSRWEFPRDGLVLGRVLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SLIVLVVIWKQKPRYEIRWRVIESISPDGHEYIYVDPMQLPYDSRWEFPRDGLVLGRVLG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 SGAFGKVVEGTAYGLSRSQPVMKVAVKMLKPTARSSEKQALMSELKIMTHLGPHLNIVNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SGAFGKVVEGTAYGLSRSQPVMKVAVKMLKPTARSSEKQALMSELKIMTHLGPHLNIVNL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 LGACTKSGPIYIITEYCFYGDLVNYLHKNRDSFLSHHPEKPKKELDIFGLNPADESTRSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LGACTKSGPIYIITEYCFYGDLVNYLHKNRDSFLSHHPEKPKKELDIFGLNPADESTRSY
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 VILSFENNGDYMDMKQADTTQYVPMLERKEVSKYSDIQRSLYDRPASYKKKSMLDSEVKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VILSFENNGDYMDMKQADTTQYVPMLERKEVSKYSDIQRSLYDRPASYKKKSMLDSEVKN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 LLSDDNSEGLTLLDLLSFTYQVARGMEFLASKNCVHRDLAARNVLLAQGKIVKICDFGLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LLSDDNSEGLTLLDLLSFTYQVARGMEFLASKNCVHRDLAARNVLLAQGKIVKICDFGLA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 RDIMHDSNYVSKGSTFLPVKWMAPESIFDNLYTTLSDVWSYGILLWEIFSLGGTPYPGMM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RDIMHDSNYVSKGSTFLPVKWMAPESIFDNLYTTLSDVWSYGILLWEIFSLGGTPYPGMM
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 VDSTFYNKIKSGYRMAKPDHATSEVYEIMVKCWNSEPEKRPSFYHLSEIVENLLPGQYKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VDSTFYNKIKSGYRMAKPDHATSEVYEIMVKCWNSEPEKRPSFYHLSEIVENLLPGQYKK
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 SYEKIHLDFLKSDHPAVARMRVDSDNAYIGVTYKNEEDKLKDWEGGLDEQRLSADSGYII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SYEKIHLDFLKSDHPAVARMRVDSDNAYIGVTYKNEEDKLKDWEGGLDEQRLSADSGYII
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 PLPDIDPVPEEEDLGKRNRHSSQTSEESAIETGSSSSTFIKREDETIEDIDMMDDIGIDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PLPDIDPVPEEEDLGKRNRHSSQTSEESAIETGSSSSTFIKREDETIEDIDMMDDIGIDS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 SDLVEDSFL
:::::::::
CCDS34 SDLVEDSFL
>>CCDS4303.1 PDGFRB gene_id:5159|Hs108|chr5 (1106 aa)
initn: 2551 init1: 996 opt: 3019 Z-score: 1247.5 bits: 242.6 E(32554): 3.6e-63
Smith-Waterman score: 3019; 45.7% identity (72.5% similar) in 1071 aa overlap (6-1057:8-1059)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MGTSHPAFLVLGCLLTGLSLILC---QLSLPSIL-PNENEKVVQLNSSFSLRCFGESE
::. . : :: :::.: :.: .. : : :....:.: : : : .
CCDS43 MRLPGAMPALALKGELLL-LSLLLLLEPQISQGLVVTPPGPELVLNVSSTFVLTCSGSAP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 VSWQYPMSEEESSDVEIRNEENNSGLFVTVLEVSSASAAHTGLYTCYYNHTQTEENELEG
: :. ::.: ... . ..: : .:: ... .. :: : : .: .. :.. :
CCDS43 VVWER-MSQEPPQEMA----KAQDGTFSSVLTLTNLTGLDTGEYFCTHNDSRGLETD-ER
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 RHIYIYVPDPDVAFVPLGMTDYLVIVEDDDSAIIPCRTTDPETPVTLHNSEGVV--PASY
...::.:::: :.:.: . .... . ::::.:::. ::::...: : :. :
CCDS43 KRLYIFVPDPTVGFLPNDAEELFIFLTEITEITIPCRVTDPQLVVTLHEKKGDVALPVPY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 DSRQGFNGTFTVGPYICEATVKGKKFQTIPFNVYALKATSELDLEMEALKTVYKSGETIV
: ..::.: : :::..:. .. .. . :: :...: ... ..:..:: ..::.:.
CCDS43 DHQRGFSGIFEDRSYICKTTIGDREVDSDAYYVYRLQVSS-INVSVNAVQTVVRQGENIT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 VTCAVFNNEVVDLQWTYPGEVKGKGITMLEE--IKVPSIKLVYTLTVPEATVKDSGDYEC
. : :..::::...:::: . .:. . . . . .: .. : .: : ..::: : :
CCDS43 LMCIVIGNEVVNFEWTYPRKESGRLVEPVTDFLLDMP-YHIRSILHIPSAELEDSGTYTC
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 AARQATREVKEMKKVTISVHEKGFIEIKPTFSQLEAVNLHEVKHFVVEVRAYPPPRISWL
. ... . .. : ..:.: :.:.... . :. ..::. . . : .::::: . :.
CCDS43 NVTESVNDHQDEKAINITVVESGYVRLLGEVGTLQFAELHRSRTLQVVFEAYPPPTVLWF
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KE3 KNNLTLIENLT-EITTDVEKIQEIRYRSKLKLIRAKEEDSGHYTIVAQNEDAVKSYTFEL
:.: :: .. . ::. ......: :: :.: :.:.: ..::::. : .::: . .:.:
CCDS43 KDNRTLGDSSAGEIALSTRNVSETRYVSELTLVRVKVAEAGHYTMRAFHEDAEVQLSFQL
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 LTQVPSSILDLVDDHHGSTGGQTVRCTAEGTPLPDIEWMICKDIKKCNNETSWTILANN-
.:: .:.: ..: : : ::::: ..: : :.: : :.:.:.: : :.:.:.
CCDS43 QINVPVRVLELSESHPDS-GEQTVRCRGRGMPQPNIIWSACRDLKRCPRELPPTLLGNSS
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 -----VSNIITEIHSRDRSTVEGRVTFAKVEETIAVRCLAKNLLGAENRELKLVAPTLRS
. . .: . ... : . . . .:.. ..::: .: .: ...:. .: .:
CCDS43 EEESQLETNVTYWEEEQEFEVVSTLRLQHVDRPLSVRCTLRNAVGQDTQEVIVVPHSLPF
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE3 ELTVAAAVLVLLVIVIISLIVLVVIWKQKPRYEIRWRVIESISPDGHEYIYVDPMQLPYD
...: .:.:.:.:..:::::.:...:..::::::::.::::.: ::::::::::::::::
CCDS43 KVVVISAILALVVLTIISLIILIMLWQKKPRYEIRWKVIESVSSDGHEYIYVDPMQLPYD
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE3 SRWEFPRDGLVLGRVLGSGAFGKVVEGTAYGLSRSQPVMKVAVKMLKPTARSSEKQALMS
: ::.::: :::::.:::::::.:::.::.:::.:: .::::::::: ::::::::::::
CCDS43 STWELPRDQLVLGRTLGSGAFGQVVEATAHGLSHSQATMKVAVKMLKSTARSSEKQALMS
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KE3 ELKIMTHLGPHLNIVNLLGACTKSGPIYIITEYCFYGDLVNYLHKNRDSFLSHHPEK---
:::::.:::::::.:::::::::.:::::::::: :::::.:::.:. .::.:: .:
CCDS43 ELKIMSHLGPHLNVVNLLGACTKGGPIYIITEYCRYGDLVDYLHRNKHTFLQHHSDKRRP
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KE3 PKKELDIFGLNPADESTRSYVILSFENNGDYMDMKQADTTQYVPMLERKEVSKYSDIQRS
:. :: .: :. :.: :. :..: ::::.. ....:::::. : ::.::. :
CCDS43 PSAELYSNAL-PVGLPLPSHVSLTGESDGGYMDMSKDESVDYVPMLDMKGDVKYADIESS
720 730 740 750 760
770 780 790 800 810 820
pF1KE3 LYDRPASYKKKSMLDSEVKNLLSDDNSEGLTLLDLLSFTYQVARGMEFLASKNCVHRDLA
: : . : . . : .. : :. .::..:.:::: ::::::::::::::::
CCDS43 NYMAPYDNYVPSAPERTCRATLINE-SPVLSYMDLVGFSYQVANGMEFLASKNCVHRDLA
770 780 790 800 810 820
830 840 850 860 870 880
pF1KE3 ARNVLLAQGKIVKICDFGLARDIMHDSNYVSKGSTFLPVKWMAPESIFDNLYTTLSDVWS
:::::. .::.:::::::::::::.::::.::::::::.:::::::::..::::::::::
CCDS43 ARNVLICEGKLVKICDFGLARDIMRDSNYISKGSTFLPLKWMAPESIFNSLYTTLSDVWS
830 840 850 860 870 880
890 900 910 920 930 940
pF1KE3 YGILLWEIFSLGGTPYPGMMVDSTFYNKIKSGYRMAKPDHATSEVYEIMVKCWNSEPEKR
.::::::::.::::::: . .. ::: :: :::::.: ::..:.:::: :::. . : :
CCDS43 FGILLWEIFTLGGTPYPELPMNEQFYNAIKRGYRMAQPAHASDEIYEIMQKCWEEKFEIR
890 900 910 920 930 940
950 960 970 980 990 1000
pF1KE3 PSFYHLSEIVENLLPGQYKKSYEKIHLDFLKSDHPAVARMRVDSDNAYIGVTYKNEEDKL
: : .: ..: :: :::.:... .::.:::::. : .. . . :. .. :
CCDS43 PPFSQLVLLLERLLGEGYKKKYQQVDEEFLRSDHPAILRSQARLPG-FHGL--RSPLDTS
950 960 970 980 990 1000
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE3 KDWEGGLDEQRLSADSGYIIPLPDIDPVPEEEDLGK-RNRHSSQTSEESAIETGSSSSTF
. ... .. .:. ::::::: : :: : : .. : .: . ..:.:. :
CCDS43 SVLYTAVQPNE--GDNDYIIPLPD--PKPEVADEGPLEGSPSLASSTLNEVNTSSTISCD
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1060 1070 1080
pF1KE3 IKREDETIEDIDMMDDIGIDSSDLVEDSFL
CCDS43 SPLEPQDEPEPEPQLELQVEPEPELEQLPDSGCPAPRAEAEDSFL
1070 1080 1090 1100
>>CCDS47058.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4 (972 aa)
initn: 1503 init1: 788 opt: 822 Z-score: 362.9 bits: 78.7 E(32554): 6.8e-14
Smith-Waterman score: 1866; 36.5% identity (64.2% similar) in 987 aa overlap (26-984:35-955)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MGTSHPAFLVLGCLLTGLSLILCQLSLPSILPNENEKVVQLNSSFSLRCFGESEV
: ::: :.... .:.... . : : . :
CCDS47 RGAWDFLCVLLLLLRVQTGSSQPSVSPGEPSPPSIHPGKSDLIVRVGDEIRLLCTDPGFV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 SWQYPMSEEESSDVEIRNEENNSGLFVTVLEVSSASAAHTGLYTCYYNHTQTEENELEGR
.: . . .: . ::... ..: .: :..:: ::: .: ..
CCDS47 KWTFEILDETN--------ENKQNEWIT----EKAEATNTGKYTCTNKHGLSNS------
70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 HIYIYVPDPDVAFVPLGMTDYLVIVEDDDSAIIPCRTTDPE-TPVTLHNSEGV-VPASY-
::..: :: : ..: . ..:..... : :::: : .:.. .: .: .
CCDS47 -IYVFVRDPAKLF----LVDRSLYGKEDNDTLVRCPLTDPEVTNYSLKGCQGKPLPKDLR
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KE3 ---DSRQGFNGTFTVGPYI-----CEATVKGKKFQTIPFNVYALKATSELDLEMEALKTV
: . :. . : : . .::. . : . . : . . . . . :.
CCDS47 FIPDPKAGIMIKSVKRAYHRLCLHCSVDQEGKSVLSEKFILKVRPAFKAVPV-VSVSKAS
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KE3 Y--KSGETIVVTCAVFN-NEVVDLQWTYPGEVKGKGITMLEEIKVPSIK---LVY----T
: . :: ..:::.. . . : : . .. : :.: : : . . : :
CCDS47 YLLREGEEFTVTCTIKDVSSSVYSTWK-----RENSQTKLQE-KYNSWHHGDFNYERQAT
230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 LTVPEATVKDSGDYECAARQATREVKEMKKVTISVHEKGFIEIKPTFSQLEAVNLHEVKH
::. : :.::: . : : .. .. .:. : .::::.: : .. :: :
CCDS47 LTISSARVNDSGVFMCYANNTFGSANV--TTTLEVVDKGFINIFPMINTTVFVNDGENVD
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 FVVEVRAYPPPR-ISWLKNNLTLIENLTEITTDVEKIQEIRYRSKLKLIRAKEEDSGHYT
..:: .:.: :. .:. : :. .. . . :. ..::: :.:.: : : ..: ::
CCDS47 LIVEYEAFPKPEHQQWIYMNRTFTDKWEDYPKS-ENESNIRYVSELHLTRLKGTEGGTYT
340 350 360 370 380 390
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 IVAQNEDAVKSYTFELLTQVPSSILDLVDDHHGSTGGQTVRCTAEGTPLPDIEWMICKDI
....: :. . .:.. ... :: . ..:. ..:.: : : : :.:..:
CCDS47 FLVSNSDVNAAIAFNVYVNTKPEILT----YDRLVNGM-LQCVAAGFPEPTIDWYFCPGT
400 410 420 430 440
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 -KKCNNETSWTILANNVSNIITEIHSRDRSTVEGRVTFAKVEETIAVRCLAKNLLGAENR
..: : ..: .:... . . .:.. . . ... .:.: : : .: .
CCDS47 EQRC----SASVLPVDVQTLNSSGPPFGKLVVQSSIDSSAFKHNGTVECKAYNDVGKTSA
450 460 470 480 490 500
520 530 540 550 560
pF1KE3 ELKLVAPTLRSELTVAAAVLVLLVIV--IISLIVLVVIWK--QKPRYEIRWRVIESISPD
.... :. . .:. .::: .. .::... .: ::: ::..:.:.: : .
CCDS47 YFNFAFKEQIHPHTLFTPLLIGFVIVAGMMCIIVMILTYKYLQKPMYEVQWKVVEEI--N
510 520 530 540 550 560
570 580 590 600 610 620
pF1KE3 GHEYIYVDPMQLPYDSRWEFPRDGLVLGRVLGSGAFGKVVEGTAYGLSRSQPVMKVAVKM
:..:.:.:: ::::: .:::::. : .:..::.::::::::.::::: .:. .: :::::
CCDS47 GNNYVYIDPTQLPYDHKWEFPRNRLSFGKTLGAGAFGKVVEATAYGLIKSDAAMTVAVKM
570 580 590 600 610 620
630 640 650 660 670 680
pF1KE3 LKPTARSSEKQALMSELKIMTHLGPHLNIVNLLGACTKSGPIYIITEYCFYGDLVNYLHK
:::.:. .:..:::::::....:: :.:::::::::: .:: .::::: ::::.:.:..
CCDS47 LKPSAHLTEREALMSELKVLSYLGNHMNIVNLLGACTIGGPTLVITEYCCYGDLLNFLRR
630 640 650 660 670 680
690 700 710 720 730 740
pF1KE3 NRDSFLSHHPEKPKKELDIFGLNPADESTRSYVILSFENNGDYMDMKQADTTQYVPMLER
.::::. . : . .: . ::. : .....::::: . ..::
CCDS47 KRDSFICSKQEDHAEAALYKNLLHSKESSCS------DSTNEYMDMKPG--VSYV-----
690 700 710 720
750 760 770 780 790 800
pF1KE3 KEVSKYSDIQRSLYDRPASYKKKSMLDSEVKNLLSDDNSEGLTLLDLLSFTYQVARGMEF
: .: .::. : .:: .. .: . .:. .: : :::::.::::.:: :
CCDS47 --VPTKADKRRSV--RIGSY-----IERDVTPAIMEDDELALDLEDLLSFSYQVAKGMAF
730 740 750 760 770
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pF1KE3 LASKNCVHRDLAARNVLLAQGKIVKICDFGLARDIMHDSNYVSKGSTFLPVKWMAPESIF
::::::.::::::::.::..:.:.::::::::::: .::::: ::.. ::::::::::::
CCDS47 LASKNCIHRDLAARNILLTHGRITKICDFGLARDIKNDSNYVVKGNARLPVKWMAPESIF
780 790 800 810 820 830
870 880 890 900 910 920
pF1KE3 DNLYTTLSDVWSYGILLWEIFSLGGTPYPGMMVDSTFYNKIKSGYRMAKPDHATSEVYEI
. .:: ::::::::.:::.::::..::::: ::: ::. :: :.:: .:.:: .:.:.:
CCDS47 NCVYTFESDVWSYGIFLWELFSLGSSPYPGMPVDSKFYKMIKEGFRMLSPEHAPAEMYDI
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pF1KE3 MVKCWNSEPEKRPSFYHLSEIVENLLPGQYKKSYEKIHLDFLKSDHPAVAR-MRVDSDNA
: ::...: :::.: .. ...:. . . .. : .. . ..:.: . .:..:
CCDS47 MKTCWDADPLKRPTFKQIVQLIEKQISESTNHIYSNLANCSPNRQKPVVDHSVRINSVGS
900 910 920 930 940 950
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pF1KE3 YIGVTYKNEEDKLKDWEGGLDEQRLSADSGYIIPLPDIDPVPEEEDLGKRNRHSSQTSEE
CCDS47 TASSSQPLLVHDDV
960 970
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: ::: :.... .:.... . : : . :
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.: . . .: . ::... ..: .: :..:: ::: .: ..
CCDS34 KWTFEILDETN--------ENKQNEWIT----EKAEATNTGKYTCTNKHGLSNS------
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pF1KE3 HIYIYVPDPDVAFVPLGMTDYLVIVEDDDSAIIPCRTTDPE-TPVTLHNSEGV-VPASY-
::..: :: : ..: . ..:..... : :::: : .:.. .: .: .
CCDS34 -IYVFVRDPAKLF----LVDRSLYGKEDNDTLVRCPLTDPEVTNYSLKGCQGKPLPKDLR
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pF1KE3 ---DSRQGFNGTFTVGPYI-----CEATVKGKKFQTIPFNVYALKATSELDLEMEALKTV
: . :. . : : . .::. . : . . : . . . . . :.
CCDS34 FIPDPKAGIMIKSVKRAYHRLCLHCSVDQEGKSVLSEKFILKVRPAFKAVPV-VSVSKAS
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KE3 Y--KSGETIVVTCAVFN-NEVVDLQWTYPGEVKGKGITMLEEIKVPSIK---LVY----T
: . :: ..:::.. . . : : . .. : :.: : : . . : :
CCDS34 YLLREGEEFTVTCTIKDVSSSVYSTWK-----RENSQTKLQE-KYNSWHHGDFNYERQAT
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pF1KE3 LTVPEATVKDSGDYECAARQATREVKEMKKVTISVHEKGFIEIKPTFSQLEAVNLHEVKH
::. : :.::: . : : .. .. .:. : .::::.: : .. :: :
CCDS34 LTISSARVNDSGVFMCYANNTFGSANV--TTTLEVVDKGFINIFPMINTTVFVNDGENVD
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pF1KE3 FVVEVRAYPPPR-ISWLKNNLTLIENLTEITTDVEKIQEIRYRSKLKLIRAKEEDSGHYT
..:: .:.: :. .:. : :. .. . . :. ..::: :.:.: : : ..: ::
CCDS34 LIVEYEAFPKPEHQQWIYMNRTFTDKWEDYPKS-ENESNIRYVSELHLTRLKGTEGGTYT
340 350 360 370 380 390
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pF1KE3 IVAQNEDAVKSYTFELLTQVPSSILDLVDDHHGSTGGQTVRCTAEGTPLPDIEWMICKDI
....: :. . .:.. ... :: . ..:. ..:.: : : : :.:..:
CCDS34 FLVSNSDVNAAIAFNVYVNTKPEILT----YDRLVNGM-LQCVAAGFPEPTIDWYFCPGT
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pF1KE3 -KKCNNETSWTILANNVSNIITEIHSRDRSTVEGRVTFAKVEETIAVRCLAKNLLGAENR
..: : ..: .:... . . .:.. . . ... .:.: : : .: .
CCDS34 EQRC----SASVLPVDVQTLNSSGPPFGKLVVQSSIDSSAFKHNGTVECKAYNDVGKTSA
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.... .: :. . .:. .::: .. .::... .: ::: ::..:.:.:
CCDS34 YFNFAFKGNNKEQIHPHTLFTPLLIGFVIVAGMMCIIVMILTYKYLQKPMYEVQWKVVEE
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: .:..:.:.:: ::::: .:::::. : .:..::.::::::::.::::: .:. .: :
CCDS34 I--NGNNYVYIDPTQLPYDHKWEFPRNRLSFGKTLGAGAFGKVVEATAYGLIKSDAAMTV
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:::::::.:. .:..:::::::....:: :.:::::::::: .:: .::::: ::::.:
CCDS34 AVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLSYLGNHMNIVNLLGACTIGGPTLVITEYCCYGDLLN
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pF1KE3 YLHKNRDSFLSHHPEKPKKELDIFGLNPADESTRSYVILSFENNGDYMDMKQADTTQYVP
.:...::::. . : . .: . ::. : .....::::: . ..::
CCDS34 FLRRKRDSFICSKQEDHAEAALYKNLLHSKESSCS------DSTNEYMDMKPG--VSYV-
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pF1KE3 MLERKEVSKYSDIQRSLYDRPASYKKKSMLDSEVKNLLSDDNSEGLTLLDLLSFTYQVAR
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:: :::::::.::::::::.::..:.:.::::::::::: .::::: ::.. ::::::::
CCDS34 GMAFLASKNCIHRDLAARNILLTHGRITKICDFGLARDIKNDSNYVVKGNARLPVKWMAP
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CCDS34 ESIFNCVYTFESDVWSYGIFLWELFSLGSSPYPGMPVDSKFYKMIKEGFRMLSPEHAPAE
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pF1KE3 VYEIMVKCWNSEPEKRPSFYHLSEIVENLLPGQYKKSYEKIHLDFLKSDHPAVAR-MRVD
.:.:: ::...: :::.: .. ...:. . . .. : .. . ..:.: . .:..
CCDS34 MYDIMKTCWDADPLKRPTFKQIVQLIEKQISESTNHIYSNLANCSPNRQKPVVDHSVRIN
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CCDS34 SVGSTASSSQPLLVHDDV
960 970
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.:. ::. : .:.. :..:. : ...: . :. ::
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: ..: : ..: : ..::.... ..: . : .:.. .
CCDS93 YEKAVSSFPD------PALYPLGSRQILTCTAYGIPQPTIKWFWHPCNHNHSEARCDFCS
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:: .. :: :.. ::.: .. . :: : : : . .
CCDS93 NNEESFILDADSNMGNRIESITQRMAIIEGKNKMASTLVVADSRI--SGIYICIASNKVG
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: . . :. .:: .... .. : ..: :..:. . ..:.
CCDS93 TVGRNISFYITDVPNGFHVNLEKMPTEGEDLKLSCTVNKFLYR-------DVTWILLRTV
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:: :. .... . : . : .: .. .. .::: :. :.: :. ... .
CCDS93 NNRTMHYSISKQKMAITKEHSITL--NLTIMNVSLQDSGTYACRARNVYTGEEILQKKEI
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. : .: ..:: . ... :. : :.:.: :.: :. :. .: ..: . ::.
CCDS93 TIRDQEAPYLLRNLSDHTVAISSSTTLDCHANGVPEPQITWF--KNNHKIQQEPG-IILG
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pF1KE3 NNVSNIITEIHSRDRSTVEGRVTFAKVEETIAVRCLAKNLLGA--ENRELKLVAPTLRSE
. :... : ::: :. . .: : : :. . : . . . .:.
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pF1KE3 LTVAAAVLVLLVIVIISLIVLVVIWKQK-PRYEIRWRVIESISPDGHEYIYVDPM--QLP
: . . . . .. ... :.. . : :.: ::. . :: : : . .: . .::
CCDS93 LELITLTCTCVAATLFWLLLTLFIRKMKRSSSEIKTDYL-SIIMDPDE-VPLDEQCERLP
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:: :.::: :. : ::. :: :::::::...:.:...: ::::::: : .:: .:
CCDS93 YDASKWEFARERLKLGKSLGRGAFGKVVQASAFGIKKSPTCRTVAVKMLKEGATASEYKA
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::.::::.::.: :::.:::::::::.: :...:.::: ::.: :::...:: :.
CCDS93 LMTELKILTHIGHHLNVVNLLGACTKQGGPLMVIVEYCKYGNLSNYLKSKRDLFF-----
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:: : . : .: . . :. : ::. . . ...
CCDS93 ----------LNK-DAA------LHMEPKKEKME----------PGLEQGKKPRLDSVTS
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pF1KE3 SLYDRPASYKK-KSMLDSEVKNLLSDDNSEGLTLLDLLSFTYQVARGMEFLASKNCVHRD
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CCDS93 SESFASSGFQEDKSLSDVEEEEDSDGFYKEPITMEDLISYSFQVARGMEFLSSRKCIHRD
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pF1KE3 LAARNVLLAQGKIVKICDFGLARDIMHDSNYVSKGSTFLPVKWMAPESIFDNLYTTLSDV
:::::.::.....::::::::::::... .:: ::.: ::.::::::::::..:.: :::
CCDS93 LAARNILLSENNVVKICDFGLARDIYKNPDYVRKGDTRLPLKWMAPESIFDKIYSTKSDV
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pF1KE3 WSYGILLWEIFSLGGTPYPGMMVDSTFYNKIKSGYRMAKPDHATSEVYEIMVKCWNSEPE
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CCDS93 WSYGVLLWEIFSLGGSPYPGVQMDEDFCSRLREGMRMRAPEYSTPEIYQIMLDCWHRDPK
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pF1KE3 KRPSFYHLSEIVENLLPGQYKKSYEKIHLDFLKSDHPAVARMRVDSDNAYIGVTYKNEED
.:: : .: : . .:: .. ..
CCDS93 ERPRFAELVEKLGDLLQANVQQDGKDYIPINAILTGNSGFTYSTPAFSEDFFKESISAPK
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CCDS31 CLWVFKHSSLNCQPHFDLQNRGVVSMVILKMTETQAGEYLLFIQSEATNYTILFTV----
110 120 130 140 150
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pF1KE3 SASAAHTGLYTCYYNHTQTEENELEGRHIYIYVPDPDVAFVPLGMTDYLVIVEDDDSAII
: .: ::: . . ::. : ::.: : .: ::
CCDS31 --SIRNTLLYTLRRPYFRKMENQDALVCISESVPEPIVEWVLC------------DSQGE
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pF1KE3 PCRTTDPETPVTLHNSEGVVPASYDSRQGFNGTFTVGPYICEATVKGKKFQTIPFNVYAL
:. :.:..... : :. . : . : . :.. . :.. :
CCDS31 SCK---EESPAVVKKEEKVL----------HELFGTDIRCCARNELGRECTRL-FTI-DL
210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 KATSELDLEMEALKTVYKSGETIVVTC-AVFNNEVVDLQWTYPGEV--KGKGITM-LEEI
. : . : . ::. :: . . : :: :. : : ... .:. . :
CCDS31 NQTPQTTLPQLFLKV----GEPLWIRCKAVHVNHGFGLTWELENKALEEGNYFEMSTYST
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270 280 290 300 310 320
pF1KE3 KVPSIKLVYTLTVPEATVKDSGDYECAARQATREVKEMKKVTISVHEKGFIEIKPTFSQL
. :...... : .. .:.: : :.. . . ... ... :::::. . .
CCDS31 NRTMIRILFAF-VSSVARNDTGYYTCSSSK-----HPSQSALVTIVEKGFINATNSSEDY
310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 EAVNLHEVKHFVVEVRAYPPPRISWLKNNLTLIENLTEITTDVEKIQEIRYRSKLKLIRA
: .. .: : :. .::: : .: .... . :. : :.
CCDS31 E-IDQYEEFCFSVRFKAYPQIRCTW---------TFSRKSFPCEQKGLDNGYSISKFCNH
360 370 380 390 400
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pF1KE3 KEEDSGHYTIVAQNEDAVKSYTFELLTQVPSSILDLVDDHHGSTGGQTVRCTAEGTPLPD
:.. :.: . :.:.:: . : : . ..: .. ..: : ..: :::.
CCDS31 KHQP-GEYIFHAENDDAQFTKMFTLNIRRKPQVLAEASASQAS-------CFSDGYPLPS
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pF1KE3 IEWMICKDIK-KCNNETSWTILANNVSNIITEIHSRDRSTVEGRVTFAKVEETIAVRCLA
: :.: . .:..: . . : .: .. .. :. . ...... . . :.: :
CCDS31 WTWKKCSDKSPNCTEEITEGVW-NRKAN--RKVFGQWVSS--STLNMSEAIKGFLVKCCA
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pF1KE3 KNLLGAENRELKLVAPT----LRSELTVAAAVLVLLVIVIISLIVLVVIWKQKPRYEIRW
: ::. . . : .: ...... :.. : :..... ... .:.. ::: .
CCDS31 YNSLGTSCETILLNSPGPFPFIQDNISFYATIGVCLLFIVVLTLLICHKYKKQFRYESQL
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pF1KE3 RVIESISPDGHEYIYVDPMQLPYDSRWEFPRDGLVLGRVLGSGAFGKVVEGTAYGLSRSQ
.... . . .::.::: . :: .:::::..: .:.::::::::::...::::.:..
CCDS31 QMVQVTGSSDNEYFYVDFREYEYDLKWEFPRENLEFGKVLGSGAFGKVMNATAYGISKTG
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..::::::: : :::..:::::::.::.:: : :::::::::: :::::.: ::: :
CCDS31 VSIQVAVKMLKEKADSSEREALMSELKMMTQLGSHENIVNLLGACTLSGPIYLIFEYCCY
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CCDS31 GDLLNYLRSKREKF---H--------------------RTWTEIFKEHNFSFYPTFQSHP
700 710 720 730
740 750 760 770 780 790
pF1KE3 TQYVPMLERKEVSKYSDIQRSLYDRPASYKKKSMLDSEV-KNLLSDDNSEGLTLLDLLSF
.. .: .. .. :: .:. :..... .. : : : ... . ::. ::: :
CCDS31 NSSMPGSREVQIHPDSDQISGLHGN--SFHSEDEIEYENQKRLEEEEDLNVLTFEDLLCF
740 750 760 770 780 790
800 810 820 830 840 850
pF1KE3 TYQVARGMEFLASKNCVHRDLAARNVLLAQGKIVKICDFGLARDIMHDSNYVSKGSTFLP
.::::.::::: :.::::::::::::...::.::::::::::::: ::::: .:.. ::
CCDS31 AYQVAKGMEFLEFKSCVHRDLAARNVLVTHGKVVKICDFGLARDIMSDSNYVVRGNARLP
800 810 820 830 840 850
860 870 880 890 900 910
pF1KE3 VKWMAPESIFDNLYTTLSDVWSYGILLWEIFSLGGTPYPGMMVDSTFYNKIKSGYRMAKP
::::::::.:...:: ::::::::::::::::: .::::. ::..::. :..:..: .:
CCDS31 VKWMAPESLFEGIYTIKSDVWSYGILLWEIFSLGVNPYPGIPVDANFYKLIQNGFKMDQP
860 870 880 890 900 910
920 930 940 950 960 970
pF1KE3 DHATSEVYEIMVKCWNSEPEKRPSFYHLSEIVENLLPGQYKKSYEKIHLDFLKSDHPAVA
.:: :.: :: .:: . .::::: .:. .. : . :...
CCDS31 FYATEEIYIIMQSCWAFDSRKRPSFPNLTSFLGCQLADAEEAMYQNVDGRVSECPHTYQN
920 930 940 950 960 970
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KE3 RMRVDSDNAYIGVTYKNEEDKLKDWEGGLDEQRLSADSGYIIPLPDIDPVPEEEDLGKRN
CCDS31 RRPFSREMDLGLLSPQAQVEDS
980 990
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10 20 30 40 50 60
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.: : :. : ::. ... .::: :.. : :. :
CCDS43 MGPGVLLLLLVATAWHGQGIPVIEPSVPELVVKPGATVTLRCVGNGSVEWDGP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE3 MSEEESSDVEIRNEENNSGLFVTVLEVSSASAAHTGLYTCYYNHTQTEENELEGRH--IY
: . . . .. ..: .: ...:. .:: : : :: .. : :.
CCDS43 PSPHWT----LYSDGSSS-----ILSTNNATFQNTGTYRC------TEPGDPLGGSAAIH
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 IYVPDPDVAFVPLGMTDYLVIVEDDDSAIIPCRTTDP--ETPVTLHNSEGV-----VPAS
.:: :: : .. :.: .:..:..:: ::: :. :.: .: . :
CCDS43 LYVKDPA---RPWNVLAQEVVVFEDQDALLPCLLTDPVLEAGVSLVRVRGRPLMRHTNYS
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220
pF1KE3 YDSRQGFN---GTFTVGP-YICEATVKGKKFQTIPFNVYALKAT-SELDLEMEALKTVYK
.. .::. . : . : : : . :.: ..: . . . :. . : . . :
CCDS43 FSPWHGFTIHRAKFIQSQDYQCSALMGGRKVMSISIRLKVQKVIPGPPALTLVPAELVRI
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 SGETIVVTCAVFNNEVVDLQWTYPGEVKGKGITMLEEIKVPSIKLVYTLTVPEATVKDSG
::. ..:.. . .: ... . .: . ... . : ::.. .. . .:
CCDS43 RGEAAQIVCSASSVDV-NFDVFLQHNNTKLAIPQQSDFHNNRYQKVLTLNLDQVDFQHAG
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 DYECAARQATREVKEMKKVTISVHEKGFIEIKPTFSQLEAVNLHEVKHFVVEVRAYPPPR
.: :.: .. . :. .. . : :....... . .. :.. : .. : :.::: .
CCDS43 NYSCVASNV--QGKHSTSMFFRVVESAYLNLSSEQNLIQEVTVGEGLNLKVMVEAYPGLQ
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 -ISWLK-NNLTLIENLTEITTDVEKIQEIRYRSKLKLIRAKEEDSGHYTIVAQNEDAVKS
..: . .. . .... . : . :. :.: : : ..:.:...:.: . ..
CCDS43 GFNWTYLGPFSDHQPEPKLANATTK-DTYRHTFTLSLPRLKPSEAGRYSFLARNPGGWRA
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 YTFELLTQVPSSILDLVDDHHGSTGGQTVRCTAEGTPLPDIEWMICKD-IKKCNNETSWT
:::: . : . ... ...: :. :.: : : :.. :. :. .:..
CCDS43 LTFELTLRYPPEV-SVIWTFINGSG--TLLCAASGYPQPNVTWLQCSGHTDRCDEAQVLQ
400 410 420 430 440
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pF1KE3 ILANNVSNIITEIHSRDRSTVEGRVTFAKVEETIAVRCLAKNLLGAENRELKLVAPTLRS
. . ..... . . ::.. .: .:.. . .: :.: .:. . . .. ..
CCDS43 VWDDPYPEVLSQ-EPFHKVTVQSLLTVETLEHNQTYECRAHNSVGSGSWAFIPISAGAHT
450 460 470 480 490 500
530 540 550 560 570
pF1KE3 E-------LTVAAAVLVLLVIVIISLIVLVVIWKQKPRYEIRWRVIESISPDGHEYIYVD
. :..: . ....... :..:. .::::.:..::..::: .:. : ..:
CCDS43 HPPDEFLFTPVVVACMSIMALLLLLLLLLLYKYKQKPKYQVRWKIIESY--EGNSYTFID
510 520 530 540 550 560
580 590 600 610 620 630
pF1KE3 PMQLPYDSRWEFPRDGLVLGRVLGSGAFGKVVEGTAYGLSRSQPVMKVAVKMLKPTARSS
: ::::. .:::::..: .:..::.::::::::.::.::.. . :.:::::::: ::...
CCDS43 PTQLPYNEKWEFPRNNLQFGKTLGAGAFGKVVEATAFGLGKEDAVLKVAVKMLKSTAHAD
570 580 590 600 610 620
640 650 660 670 680 690
pF1KE3 EKQALMSELKIMTHLGPHLNIVNLLGACTKSGPIYIITEYCFYGDLVNYLHKNRDSFLSH
::.:::::::::.::: : ::::::::::..::. .::::: ::::.:.:... ...:.
CCDS43 EKEALMSELKIMSHLGQHENIVNLLGACTHGGPVLVITEYCCYGDLLNFLRRKAEAMLG-
630 640 650 660 670 680
700 710 720 730 740 750
pF1KE3 HPEKPKKELDIFGLNPADESTRSYVILSFENNGDYMDMKQADTTQYVPMLERKEVSKYSD
:. :.:... :.. :: ... ::.: : . :
CCDS43 ----PS-------LSPGQDP---------EGGVDYKNIH----------LEKKYVRRDSG
690 700 710
760 770 780 790 800 810
pF1KE3 IQRSLYD-----RPASYKKKSMLDSEVKNLLSDDNSEGLTLLDLLSFTYQVARGMEFLAS
.. . : ::.: : :: .. :. .... : : ::: :. :::.:: ::::
CCDS43 FSSQGVDTYVEMRPVS---TSSNDSFSEQDLDKEDGRPLELRDLLHFSSQVAQGMAFLAS
720 730 740 750 760 770
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pF1KE3 KNCVHRDLAARNVLLAQGKIVKICDFGLARDIMHDSNYVSKGSTFLPVKWMAPESIFDNL
:::.:::.:::::::..:...:: :::::::::.::::. ::.. ::::::::::::: .
CCDS43 KNCIHRDVAARNVLLTNGHVAKIGDFGLARDIMNDSNYIVKGNARLPVKWMAPESIFDCV
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pF1KE3 YTTLSDVWSYGILLWEIFSLGGTPYPGMMVDSTFYNKIKSGYRMAKPDHATSEVYEIMVK
::. ::::::::::::::::: .::::..:.: ::. .:.::.::.: : ...: ::
CCDS43 YTVQSDVWSYGILLWEIFSLGLNPYPGILVNSKFYKLVKDGYQMAQPAFAPKNIYSIMQA
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940 950 960 970 980 990
pF1KE3 CWNSEPEKRPSFYHL-SEIVENLLPGQYKKSYEKIHLDFLKSDHPAVARMRVDSDNAYIG
:: :: .::.: .. : . :. . ...: ..
CCDS43 CWALEPTHRPTFQQICSFLQEQAQEDRRERDYTNLPSSSRSGGSGSSSSELEEESSSEHL
900 910 920 930 940 950
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE3 VTYKNEEDKLKDWEGGLDEQRLSADSGYIIPLPDIDPVPEEEDLGKRNRHSSQTSEESAI
CCDS43 TCCEQGDIAQPLLQPNNYQFC
960 970
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: ... . : ...: .. . ... : .. ..... :: : .:
CCDS43 PL--PLSIQWHWRPWTPCKMFAQRSLRRR--QQQDLMPQCRDWRAVTTQDAVNPIESLDT
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:: :.::. : : :.. .:.: :. :.:.. . . . ...
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... :: :: ::. ::. . . .. .: .. : . ::. ...
CCDS43 YVTTIPDGFTIESKPSEELLEGQPVL----LSCQADSYKYEHLRWYRLNLSTLHDAHGNP
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: .....:.. :. . .:.. :. : :::. .:.. .
CCDS43 LLLDCKNVHLFATPLAASLEEVAPGARHATLSLSIPRVAPEHEGHYVCEVQDRRSHDKHC
610 620 630 640 650 660
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 -KSYTFELLTQVPSSILDLVDDHHGSTGGQTVRCTAEGTPLPDIEWMICKDIKKCNNETS
:.: ..: .:.: . . . ..: . :. :.: :. :: .. .: :
CCDS43 HKKYLSVQALEAPRLTQNLTDLLVNVSDSLEMQCLVAGAHAPSIVWY--KD-ERLLEEKS
670 680 690 700 710 720
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pF1KE3 WTILANNVSNIITEIHSRDRSTVEGRVTFAKVEETIAVRCLAKNLLGAENRELKLVAPTL
. ::. :: :. : : :: : . : : : ....
CCDS43 GVDLAD--SNQKLSIQ-RVREEDAGRYL-----------CSVCNAKGCVNSSASVAVEGS
730 740 750 760
530 540 550 560 570
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... .. ..:: ::... ..:..:. ..: . .:. . : :. . .
CCDS43 EDKGSMEIVILVGTGVIAVFFWVLLLLIFCNMRRPAHADIKTGYLSIIMDPGEVPLEEQC
770 780 790 800 810 820
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pF1KE3 MQLPYD-SRWEFPRDGLVLGRVLGSGAFGKVVEGTAYGLSRSQPVMKVAVKMLKPTARSS
: :: :.:::::. : :::::: ::::::::..:.:. ... ::::::: : .:
CCDS43 EYLSYDASQWEFPRERLHLGRVLGYGAFGKVVEASAFGIHKGSSCDTVAVKMLKEGATAS
830 840 850 860 870 880
640 650 660 670 680 690
pF1KE3 EKQALMSELKIMTHLGPHLNIVNLLGACTK-SGPIYIITEYCFYGDLVNYLHKNRDSFLS
:..::::::::. :.: :::.::::::::: .::...:.:.: ::.: :.:. .::.:
CCDS43 EHRALMSELKILIHIGNHLNVVNLLGACTKPQGPLMVIVEFCKYGNLSNFLRAKRDAF--
890 900 910 920 930 940
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pF1KE3 HHPEKPKKELDIFGLNPADESTRSYVILSFENNGDYMDMKQADTTQYVPMLERKEVSKYS
.: :. : :. : . : . . :.:.. .. .
CCDS43 ---------------SPCAEK-------SPEQRGRFRAMVE------LARLDRRRPGSSD
950 960 970
760 770 780 790 800 810
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. . ... . ... :.:...: :: ::. ::. ...:::::::::::..:
CCDS43 RVLFARFSKTEGGARRASPDQEAEDLWLSP-----LTMEDLVCYSFQVARGMEFLASRKC
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pF1KE3 VHRDLAARNVLLAQGKIVKICDFGLARDIMHDSNYVSKGSTFLPVKWMAPESIFDNLYTT
.::::::::.::... .::::::::::::..: .:: :::. ::.::::::::::..:::
CCDS43 IHRDLAARNILLSESDVVKICDFGLARDIYKDPDYVRKGSARLPLKWMAPESIFDKVYTT
1040 1050 1060 1070 1080 1090
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pF1KE3 LSDVWSYGILLWEIFSLGGTPYPGMMVDSTFYNKIKSGYRMAKPDHATSEVYEIMVKCWN
:::::.:.:::::::::..::::.... : .....: :: :. :: . .::..::.
CCDS43 QSDVWSFGVLLWEIFSLGASPYPGVQINEEFCQRLRDGTRMRAPELATPAIRRIMLNCWS
1100 1110 1120 1130 1140 1150
940 950 960 970 980 990
pF1KE3 SEPEKRPSFYHLSEIVENLLPGQYKKSYEKIHLDFLKSDHPAVARMRVDSDNAYIGVTYK
..:. ::.: .: ::. .:: :. . :..
CCDS43 GDPKARPAFSELVEILGDLLQGRGLQEEEEVCMAPRSSQSSEEGSFSQVSTMALHIAQAD
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE3 NEEDKLKDWEGGLDEQRLSADSGYIIPLPDIDPVPEEEDLGKRNRHSSQTSEESAIETGS
CCDS43 AEDSPPSLQRHSLAARYYNWVSFPGCLARGAETRGSSRMKTFEEFPMTPTTYKGSVDNQT
1220 1230 1240 1250 1260 1270
>>CCDS4457.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5 (1363 aa)
initn: 1340 init1: 742 opt: 754 Z-score: 333.6 bits: 73.8 E(32554): 2.9e-12
Smith-Waterman score: 1231; 32.5% identity (59.9% similar) in 841 aa overlap (158-965:421-1184)
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 FVPLGMTDYLVIVEDDDSAIIPCRTTDPETPVTLHNSEGVVPASYD--SRQGFNGTFTVG
: .:..:. :. :. :::... :
CCDS44 EASTGTYTLALWNSAAGLRRNISLELVVNVPPQIHEKEASSPSIYSRHSRQALTCTAYGV
400 410 420 430 440 450
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 PYICEATVKGKKFQTIPFNVYALKATSELDLEMEALKTVYKSGETIVVTCAVFNNEVVDL
: ... . : ...: .. . ... : .. ..... :: : .:
CCDS44 PL--PLSIQWHWRPWTPCKMFAQRSLRRR--QQQDLMPQCRDWRAVTTQDAVNPIESLDT
460 470 480 490 500
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 QWTYPGEVKGKGITMLEEIKVPSIKLVYTLTVPEATVKDSGDYECAARQATREVKEMKKV
:: :.::. : : :.. .:.: :. :.:.. . . . ...
CCDS44 -WTE--FVEGKN------------KTVSKLVIQNANV--SAMYKCVVSNKVGQDERLIYF
510 520 530 540
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 TISVHEKGF-IEIKPTFSQLEAVNLHEVKHFVVEVRAYPPPRISWLKNNLTLIENL----
... :: :: ::. ::. . . .. .: .. : . ::. ...
CCDS44 YVTTIPDGFTIESKPSEELLEGQPVL----LSCQADSYKYEHLRWYRLNLSTLHDAHGNP
550 560 570 580 590 600
370 380 390 400
pF1KE3 ------------TEITTDVEKIQE-IRYRS-KLKLIRAKEEDSGHYTIVAQNEDAV----
: .....:.. :. . .:.. :. : :::. .:.. .
CCDS44 LLLDCKNVHLFATPLAASLEEVAPGARHATLSLSIPRVAPEHEGHYVCEVQDRRSHDKHC
610 620 630 640 650 660
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 -KSYTFELLTQVPSSILDLVDDHHGSTGGQTVRCTAEGTPLPDIEWMICKDIKKCNNETS
:.: ..: .:.: . . . ..: . :. :.: :. :: .. .: :
CCDS44 HKKYLSVQALEAPRLTQNLTDLLVNVSDSLEMQCLVAGAHAPSIVWY--KD-ERLLEEKS
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pF1KE3 WTILANNVSNIITEIHSRDRSTVEGRVTFAKVEETIAVRCLAKNLLGAENRELKLVAPTL
. ::. :: :. : : :: : . : : : ....
CCDS44 GVDLAD--SNQKLSIQ-RVREEDAGRYL-----------CSVCNAKGCVNSSASVAVEGS
730 740 750 760
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pF1KE3 RSELTVAAAVLVLL-VIVIISLIVLVVIW--KQKPRY-EIRWRVIESISPDGHEYIYVDP
... .. ..:: ::... ..:..:. ..: . .:. . : :. . .
CCDS44 EDKGSMEIVILVGTGVIAVFFWVLLLLIFCNMRRPAHADIKTGYLSIIMDPGEVPLEEQC
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pF1KE3 MQLPYD-SRWEFPRDGLVLGRVLGSGAFGKVVEGTAYGLSRSQPVMKVAVKMLKPTARSS
: :: :.:::::. : :::::: ::::::::..:.:. ... ::::::: : .:
CCDS44 EYLSYDASQWEFPRERLHLGRVLGYGAFGKVVEASAFGIHKGSSCDTVAVKMLKEGATAS
830 840 850 860 870 880
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pF1KE3 EKQALMSELKIMTHLGPHLNIVNLLGACTK-SGPIYIITEYCFYGDLVNYLHKNRDSFLS
:..::::::::. :.: :::.::::::::: .::...:.:.: ::.: :.:. .::.:
CCDS44 EHRALMSELKILIHIGNHLNVVNLLGACTKPQGPLMVIVEFCKYGNLSNFLRAKRDAF--
890 900 910 920 930 940
700 710 720 730 740 750
pF1KE3 HHPEKPKKELDIFGLNPADESTRSYVILSFENNGDYMDMKQADTTQYVPMLERKEVSKYS
.: :. : :. : . : . . :.:.. .. .
CCDS44 ---------------SPCAEK-------SPEQRGRFRAMVE------LARLDRRRPGSSD
950 960 970
760 770 780 790 800 810
pF1KE3 DIQRSLYDRPASYKKKSMLDSEVKNL-LSDDNSEGLTLLDLLSFTYQVARGMEFLASKNC
. . ... . ... :.:...: :: ::. ::. ...:::::::::::..:
CCDS44 RVLFARFSKTEGGARRASPDQEAEDLWLSP-----LTMEDLVCYSFQVARGMEFLASRKC
980 990 1000 1010 1020 1030
820 830 840 850 860 870
pF1KE3 VHRDLAARNVLLAQGKIVKICDFGLARDIMHDSNYVSKGSTFLPVKWMAPESIFDNLYTT
.::::::::.::... .::::::::::::..: .:: :::. ::.::::::::::..:::
CCDS44 IHRDLAARNILLSESDVVKICDFGLARDIYKDPDYVRKGSARLPLKWMAPESIFDKVYTT
1040 1050 1060 1070 1080 1090
880 890 900 910 920 930
pF1KE3 LSDVWSYGILLWEIFSLGGTPYPGMMVDSTFYNKIKSGYRMAKPDHATSEVYEIMVKCWN
:::::.:.:::::::::..::::.... : .....: :: :. :: . .::..::.
CCDS44 QSDVWSFGVLLWEIFSLGASPYPGVQINEEFCQRLRDGTRMRAPELATPAIRRIMLNCWS
1100 1110 1120 1130 1140 1150
940 950 960 970 980 990
pF1KE3 SEPEKRPSFYHLSEIVENLLPGQYKKSYEKIHLDFLKSDHPAVARMRVDSDNAYIGVTYK
..:. ::.: .: ::. .:: :. . :..
CCDS44 GDPKARPAFSELVEILGDLLQGRGLQEEEEVCMAPRSSQSSEEGSFSQVSTMALHIAQAD
1160 1170 1180 1190 1200 1210
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