Result of FASTA (ccds) for
pF1KE3355
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3355, 1047 aa
1>>>pF1KE3355 1047 - 1047 aa - 1047 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1792+/-0.00137; mu= 6.4476+/- 0.079
mean_var=240.2981+/-58.118, 0's: 0 Z-trim(105.4): 255 B-trim: 217 in 1/49
Lambda= 0.082737
statistics sampled from 8232 (8520) to 8232 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.611), E-opt: 0.2 (0.255), width: 16
Scan time: 2.100
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS6590.1 NPR2 gene_id:4882|Hs109|chr9 (1047) 7020 853.2 0
CCDS1051.1 NPR1 gene_id:4881|Hs109|chr1 (1061) 4181 514.4 5.3e-145
CCDS14545.1 GUCY2F gene_id:2986|Hs109|chrX (1108) 1712 219.7 2.9e-56
CCDS11127.1 GUCY2D gene_id:3000|Hs109|chr17 (1103) 1677 215.5 5.2e-55
CCDS8664.1 GUCY2C gene_id:2984|Hs109|chr12 (1073) 1411 183.7 1.8e-45
CCDS8335.1 GUCY1A2 gene_id:2977|Hs109|chr11 ( 732) 604 87.2 1.4e-16
CCDS34085.1 GUCY1A1 gene_id:2982|Hs109|chr4 ( 690) 582 84.6 8.3e-16
CCDS54812.1 GUCY1A1 gene_id:2982|Hs109|chr4 ( 624) 577 83.9 1.2e-15
CCDS77978.1 GUCY1B1 gene_id:2983|Hs109|chr4 ( 551) 569 82.9 2.1e-15
CCDS77977.1 GUCY1B1 gene_id:2983|Hs109|chr4 ( 599) 569 83.0 2.2e-15
CCDS47154.1 GUCY1B1 gene_id:2983|Hs109|chr4 ( 619) 569 83.0 2.3e-15
CCDS77975.1 GUCY1B1 gene_id:2983|Hs109|chr4 ( 641) 569 83.0 2.3e-15
CCDS75203.1 GUCY1B1 gene_id:2983|Hs109|chr4 ( 594) 539 79.4 2.6e-14
CCDS47196.1 NPR3 gene_id:4883|Hs109|chr5 ( 540) 509 75.8 3e-13
CCDS56357.1 NPR3 gene_id:4883|Hs109|chr5 ( 541) 509 75.8 3e-13
>>CCDS6590.1 NPR2 gene_id:4882|Hs109|chr9 (1047 aa)
initn: 7020 init1: 7020 opt: 7020 Z-score: 4548.4 bits: 853.2 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 7020; 100.0% identity (100.0% similar) in 1047 aa overlap (1-1047:1-1047)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MALPSLLLLVAALAGGVRPPGARNLTLAVVLPEHNLSYAWAWPRVGPAVALAVEALGRAL
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CCDS65 MALPSLLLLVAALAGGVRPPGARNLTLAVVLPEHNLSYAWAWPRVGPAVALAVEALGRAL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 PVDLRFVSSELEGACSEYLAPLSAVDLKLYHDPDLLLGPGCVYPAASVARFASHWRLPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 PVDLRFVSSELEGACSEYLAPLSAVDLKLYHDPDLLLGPGCVYPAASVARFASHWRLPLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 TAGAVASGFSAKNDHYRTLVRTGPSAPKLGEFVVTLHGHFNWTARAALLYLDARTDDRPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 TAGAVASGFSAKNDHYRTLVRTGPSAPKLGEFVVTLHGHFNWTARAALLYLDARTDDRPH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 YFTIEGVFEALQGSNLSVQHQVYAREPGGPEQATHFIRANGRIVYICGPLEMLHEILLQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 YFTIEGVFEALQGSNLSVQHQVYAREPGGPEQATHFIRANGRIVYICGPLEMLHEILLQA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 QRENLTNGDYVFFYLDVFGESLRAGPTRATGRPWQDNRTREQAQALREAFQTVLVITYRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 QRENLTNGDYVFFYLDVFGESLRAGPTRATGRPWQDNRTREQAQALREAFQTVLVITYRE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 PPNPEYQEFQNRLLIRAREDFGVELGPSLMNLIAGCFYDGILLYAEVLNETIQEGGTRED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 PPNPEYQEFQNRLLIRAREDFGVELGPSLMNLIAGCFYDGILLYAEVLNETIQEGGTRED
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 GLRIVEKMQGRRYHGVTGLVVMDKNNDRETDFVLWAMGDLDSGDFQPAAHYSGAEKQIWW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 GLRIVEKMQGRRYHGVTGLVVMDKNNDRETDFVLWAMGDLDSGDFQPAAHYSGAEKQIWW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 TGRPIPWVKGAPPSDNPPCAFDLDDPSCDKTPLSTLAIVALGTGITFIMFGVSSFLIFRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 TGRPIPWVKGAPPSDNPPCAFDLDDPSCDKTPLSTLAIVALGTGITFIMFGVSSFLIFRK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 LMLEKELASMLWRIRWEELQFGNSERYHKGAGSRLTLSLRGSSYGSLMTAHGKYQIFANT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 LMLEKELASMLWRIRWEELQFGNSERYHKGAGSRLTLSLRGSSYGSLMTAHGKYQIFANT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 GHFKGNVVAIKHVNKKRIELTRQVLFELKHMRDVQFNHLTRFIGACIDPPNICIVTEYCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 GHFKGNVVAIKHVNKKRIELTRQVLFELKHMRDVQFNHLTRFIGACIDPPNICIVTEYCP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 RGSLQDILENDSINLDWMFRYSLINDLVKGMAFLHNSIISSHGSLKSSNCVVDSRFVLKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 RGSLQDILENDSINLDWMFRYSLINDLVKGMAFLHNSIISSHGSLKSSNCVVDSRFVLKI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 TDYGLASFRSTAEPDDSHALYAKKLWTAPELLSGNPLPTTGMQKADVYSFGIILQEIALR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 TDYGLASFRSTAEPDDSHALYAKKLWTAPELLSGNPLPTTGMQKADVYSFGIILQEIALR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 SGPFYLEGLDLSPKEIVQKVRNGQRPYFRPSIDRTQLNEELVLLMERCWAQDPAERPDFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 SGPFYLEGLDLSPKEIVQKVRNGQRPYFRPSIDRTQLNEELVLLMERCWAQDPAERPDFG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 QIKGFIRRFNKEGGTSILDNLLLRMEQYANNLEKLVEERTQAYLEEKRKAEALLYQILPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 QIKGFIRRFNKEGGTSILDNLLLRMEQYANNLEKLVEERTQAYLEEKRKAEALLYQILPH
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 SVAEQLKRGETVQAEAFDSVTIYFSDIVGFTALSAESTPMQVVTLLNDLYTCFDAIIDNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 SVAEQLKRGETVQAEAFDSVTIYFSDIVGFTALSAESTPMQVVTLLNDLYTCFDAIIDNF
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 DVYKVETIGDAYMVVSGLPGRNGQRHAPEIARMALALLDAVSSFRIRHRPHDQLRLRIGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 DVYKVETIGDAYMVVSGLPGRNGQRHAPEIARMALALLDAVSSFRIRHRPHDQLRLRIGV
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 HTGPVCAGVVGLKMPRYCLFGDTVNTASRMESNGQALKIHVSSTTKDALDELGCFQLELR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 HTGPVCAGVVGLKMPRYCLFGDTVNTASRMESNGQALKIHVSSTTKDALDELGCFQLELR
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040
pF1KE3 GDVEMKGKGKMRTYWLLGERKGPPGLL
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 GDVEMKGKGKMRTYWLLGERKGPPGLL
1030 1040
>>CCDS1051.1 NPR1 gene_id:4881|Hs109|chr1 (1061 aa)
initn: 3605 init1: 1950 opt: 4181 Z-score: 2716.9 bits: 514.4 E(33420): 5.3e-145
Smith-Waterman score: 4181; 62.0% identity (81.6% similar) in 1048 aa overlap (6-1040:16-1055)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MALPSLLLLVAALAGGVRPPGARNLTLAVVLPEHNLSYAWAWPRVGPAVA
::::. : .: : :::.::::: : :: :.: ::::::
CCDS10 MPGPRRPAGSRLRLLLLLLLPPLLLLLRGSHAGNLTVAVVLPLANTSYPWSWARVGPAVE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE3 LA---VEALGRALP-VDLRFV--SSELE-GACSEYLAPLSAVDLKLYHDPDLLLGPGCVY
:: :.: :: .: : ::: :.::. :::.::::: :.: ..:::::::
CCDS10 LALAQVKARPDLLPGWTVRTVLGSSENALGVCSDTAAPLAAVDLKWEHNPAVFLGPGCVY
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 PAASVARFASHWRLPLLTAGAVASGFSAKNDHYRTLVRTGPSAPKLGEFVVTLHGHFNWT
:: :.::..:::.::::::: : ::..: :.: .:.::: :::.::..:: ...:
CCDS10 AAAPVGRFTAHWRVPLLTAGAPALGFGVK-DEYALTTRAGPSYAKLGDFVAALHRRLGWE
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KE3 ARAALLYLDARTDDRPH-YFTIEGVFEALQGS-NLSVQHQVYAREPGGPEQATHFIRA--
.: .:: : :. : .: .::.: .. :..:.: .:.. . . :...:.
CCDS10 RQALMLYA-YRPGDEEHCFFLVEGLFMRVRDRLNITVDHLEFAEDDLS--HYTRLLRTMP
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 -NGRIVYICGPLEMLHEILLQAQRENLTNGDYVFFYLDVFGESLRAGPTRATGRPWQDNR
.::..:::. . .. ..: : . .: . :::::.::.::.::..: : :::. :
CCDS10 RKGRVIYICSSPDAFRTLMLLALEAGLCGEDYVFFHLDIFGQSLQGGQGPAPRRPWE--R
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 TREQAQALREAFQTVLVITYREPPNPEYQEFQNRLLIRAREDFGVELGPSLMNLIAGCFY
: . :.:::.. .:::..: :::: :: ..: : :.:. . .:.: : . :.
CCDS10 GDGQDVSARQAFQAAKIITYKDPDNPEYLEFLKQLKHLAYEQFNFTMEDGLVNTIPASFH
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 DGILLYAEVLNETIQEGGTREDGLRIVEKMQGRRYHGVTGLVVMDKNNDRETDFVLWAMG
::.::: ....::. .::: :: :...: .: ..:::: . .:...:::::: :: :
CCDS10 DGLLLYIQAVTETLAHGGTVTDGENITQRMWNRSFQGVTGYLKIDSSGDRETDFSLWDM-
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 DLDSGDFQPAAHYSGAEKQ-IWWTGRPIPWVKGAPPSDNPPCAFDLDDPSCDKTPLSTLA
: ..: :. . .:.:. .. . .:: . : : :: : : :.:: .::.:.. ::::
CCDS10 DPENGAFRVVLNYNGTSQELVAVSGRKLNWPLGYPPPDIPKCGFDNEDPACNQDHLSTLE
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 IVALGTGITFIMFGVSSFLIFRKLMLEKELASMLWRIRWEELQFGNSERYHKGAGSRLTL
..:: ..... . . ::.:.::..::::::: :::.:::... .. ::. ..:::::::
CCDS10 VLALVGSLSLLGILIVSFFIYRKMQLEKELASELWRVRWEDVEPSSLERHLRSAGSRLTL
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KE3 SLRGSSYGSLMTAHGKYQIFANTGHFKGNVVAIKHVNKKRIELTRQVLFELKHMRDVQFN
: :::.::::.:..:..:.::.:...:::.::.:.::.:::::::.:::::::::::: .
CCDS10 SGRGSNYGSLLTTEGQFQVFAKTAYYKGNLVAVKRVNRKRIELTRKVLFELKHMRDVQNE
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KE3 HLTRFIGACIDPPNICIVTEYCPRGSLQDILENDSINLDWMFRYSLINDLVKGMAFLHNS
:::::.::: :::::::.:::::::::::::::.::.::::::::: ::.:::: ::::.
CCDS10 HLTRFVGACTDPPNICILTEYCPRGSLQDILENESITLDWMFRYSLTNDIVKGMLFLHNG
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KE3 IISSHGSLKSSNCVVDSRFVLKITDYGLASFRSTAEPDDSHALYAKKLWTAPELLSGNPL
: :::.:::::::::.::::::::::: :::. .:...:..::::::::::::
CCDS10 AICSHGNLKSSNCVVDGRFVLKITDYGLESFRDL-DPEQGHTVYAKKLWTAPELLRMASP
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730 740 750
pF1KE3 PTTGMQKADVYSFGIILQEIALRSGPFYLEGLDLSPKEIVQKVRNGQRPYFRPSIDRTQL
:. : : .::::::::::::::::: :..::::::::::...: :..: ::::. .
CCDS10 PVRGSQAGDVYSFGIILQEIALRSGVFHVEGLDLSPKEIIERVTRGEQPPFRPSLALQSH
720 730 740 750 760 770
760 770 780 790 800 810
pF1KE3 NEELVLLMERCWAQDPAERPDFGQIKGFIRRFNKEGGTSILDNLLLRMEQYANNLEKLVE
::: :::.::::.:: ::: : ::. .:.::.:....:::::: ::::::::::.:::
CCDS10 LEELGLLMQRCWAEDPQERPPFQQIRLTLRKFNRENSSNILDNLLSRMEQYANNLEELVE
780 790 800 810 820 830
820 830 840 850 860 870
pF1KE3 ERTQAYLEEKRKAEALLYQILPHSVAEQLKRGETVQAEAFDSVTIYFSDIVGFTALSAES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ERTQAYLEEKRKAEALLYQILPHSVAEQLKRGETVQAEAFDSVTIYFSDIVGFTALSAES
840 850 860 870 880 890
880 890 900 910 920 930
pF1KE3 TPMQVVTLLNDLYTCFDAIIDNFDVYKVETIGDAYMVVSGLPGRNGQRHAPEIARMALAL
::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: :::. :: :.:::::::
CCDS10 TPMQVVTLLNDLYTCFDAVIDNFDVYKVETIGDAYMVVSGLPVRNGRLHACEVARMALAL
900 910 920 930 940 950
940 950 960 970 980 990
pF1KE3 LDAVSSFRIRHRPHDQLRLRIGVHTGPVCAGVVGLKMPRYCLFGDTVNTASRMESNGQAL
:::: ::::::::..:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS10 LDAVRSFRIRHRPQEQLRLRIGIHTGPVCAGVVGLKMPRYCLFGDTVNTASRMESNGEAL
960 970 980 990 1000 1010
1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE3 KIHVSSTTKDALDELGCFQLELRGDVEMKGKGKMRTYWLLGERKGPPGLL
:::.:: :: .:.:.: :.::::::::::::::.:::::::::
CCDS10 KIHLSSETKAVLEEFGGFELELRGDVEMKGKGKVRTYWLLGERGSSTRG
1020 1030 1040 1050 1060
>>CCDS14545.1 GUCY2F gene_id:2986|Hs109|chrX (1108 aa)
initn: 1573 init1: 1007 opt: 1712 Z-score: 1123.9 bits: 219.7 E(33420): 2.9e-56
Smith-Waterman score: 1801; 36.1% identity (63.5% similar) in 1040 aa overlap (38-1042:67-1065)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 LLVAALAGGVRPPGARNLTLAVVLPEHNLSYAWAWPRVGPAVALAVEALGRALPVDLRFV
.. : :.: :. ::.: ..: :: .
CCDS14 CLLSVMSLPQQVWTLPYKIGVVGPWACDSLFSKALPEV--AARLAIERINRDPSFDLSY-
40 50 60 70 80 90
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 SSE---LEGACSEYLAPLSAVDLKLYHDPDLLLGPGCVYPAASVARFASHWRLPLLTAGA
: : :. :. : ::. .. .. . ..:: ... ... : ... .
CCDS14 SFEYVILNEDCQTSRA-LSSF-ISHHQMASGFIGPTNPGYCEAASLLGNSWDKGIFSWAC
100 110 120 130 140 150
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VASGFSAKNDHYRTLVRTGPSAPKLGEFVVTLHGHFNWTARAALLYLDARTDDRPHYFTI
: .. : . : :. :: :: .. .::. .:.: :.:... .:. :
CCDS14 VNYELDNKIS-YPTFSRTLPSPIRV---LVTVMKYFQW-AHAGVI----SSDEDIWVHTA
160 170 180 190 200
190 200 210 220 230
pF1KE3 EGVFEALQGSNLSVQHQVYA-REPGGPEQATHFIRANGRI--VYIC------GPLEMLHE
. : ::.. .: : . . .. . ..: . :. :: . .: : ..:
CCDS14 NRVASALRSHGLPVGVVLTTGQDSQSMRKALQRIHQADRIRIIIMCMHSALIGGETQMH-
210 220 230 240 250 260
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 ILLQAQRENLTNGDYVFFYLDVFGESLRAGPTRATGRPWQDNRTREQAQALREAFQTVLV
.: :. ..:.: ::: :.. :: : . : :. :. .. ::::...::.
CCDS14 LLECAHDLKMTDGTYVFVPYDALLYSL---PYKHT--PY---RVLRNNPKLREAYDAVLT
270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 ITYREPPNPEYQEFQNRLLIRAREDFGVELGPSLMNLIAGCFYDGILLYAEVLNETIQEG
:: . . :: : . :: .. .: . .. . : .:..: . :...:....:.
CCDS14 ITVESQEKTFYQAFTE---AAARGEIPEKLEFDQVSPLFGTIYNSIYFIAQAMNNAMKEN
320 330 340 350 360 370
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 GTREDGLRIVEKMQGRRYHGVTGLVVMDKNNDRETDFVLWAMGDLDSGDFQPAAHYSGAE
: . . .:.. .. ..:: . :. :.:.. ...:. .: ... . .
CCDS14 G-QAGAASLVQHSRNMQFHGFNQLMRTDSNGNGISEYVILDT-NLKEWELHSTYTVDMEM
380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 KQIWWTGRPIPWVKGAPPSDNPPCAFDLDDPSCDKTPLSTLAIVALGTGITFIMFGVSSF
. . . : :: . : :: . : : . : ..:... : . . ......:
CCDS14 ELLRFGGTPIHFPGGRPPRADAKCWFA-EGKICHGGIDPAFAMMVCLT-LLIALLSINGF
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520
pF1KE3 LIF-RKLMLEKELASMLWRI--RWEELQFGNSERYHKGAGSRLTLSLRGSSY--------
: :. . . .: . :: :.. : : . . . ::: ..:.. .:
CCDS14 AYFIRRRINKIQLIKGPNRILLTLEDVTFINPH-FGSKRGSRASVSFQITSEVQSGRSPR
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570
pF1KE3 -----GSLMTAHGKYQIFANTGHFKGNVVAIKHV------NKKRIELTRQVLFELKHMRD
::: : :. .: . ..:. : .:. . : :. . .::. :.:
CCDS14 LSFSSGSLTPA--TYEN-SNIAIYEGDWVWLKKFSLGDFGDLKSIKSRASDVFEM--MKD
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KE3 VQFNHLTRFIGACIDPPNICIVTEYCPRGSLQDILENDSINLDWMFRYSLINDLVKGMAF
.. .... ..: : . ::::.: ::::.::: :....:::::. ::. ::.::: .
CCDS14 LRHENINPLLGFFYDSGMFAIVTEFCSRGSLEDILTNQDVKLDWMFKSSLLLDLIKGMKY
610 620 630 640 650 660
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CCDS14 PEHAPPECLQLMKQCWAEAAEQRPTFDEIFNQFKTFNKGKKTNIIDSMLRMLEQYSSNLE
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pF1KE3 KLVEERTQAYLEEKRKAEALLYQILPHSVAEQLKRGETVQAEAFDSVTIYFSDIVGFTAL
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CCDS14 DLIRERTEELEIEKQKTEKLLTQMLPPSVAESLKKGCTVEPEGFDLVTLYFSDIVGFTTI
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CCDS14 SLDILSSVGTFKMRHMPEVPVRIRIGLHSGPVVAGVVGLTMPRYCLFGDTVNTASRMEST
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CCDS14 GLPYRIHVSLSTVTILQNLSEGYEVELRGRTELKGKGTEETFWLIG-KKGFMKPLPVPPP
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CCDS14 VDKDGQVGHGLQPVEIAAFQRRKAERQLVRNKP
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. :. ..:. :: .:. :. .: . : : .: :..
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:. .:.. .: :: .. ... ::.: ..::..: . : . .
CCDS11 FLPFDTIHYALSPGPEALAALA--------NSSQLRRAHDAVLTLTRHCPSEGSVLDSLR
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: . :... .:. . .. . : .::...: :. . :. :: .: ......
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. : : : ..:.: ::: : :. :: :... . :. .. .: . .
CCDS11 AQVPGFCG----DLGGDEEPPFVLL---DTDAAGDRLFATYMLDPARGSFLSAGTRMHFP
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.: . :. .: : :: .. : : :. : .:..: . .:. : :. ..
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. ... . : . . . :.:.. . ::: .:. : :.... .. ... :
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: ..:. : .:. . ..: . :. .. .:...: . .: :.. . :
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:::..: ::.. . ... .:: :.:.:..: .:::..::: :..:::. ::
CCDS11 CWAEQPELRPSMDHTFDLFKNINKGRKTNIIDSMLRMLEQYSSNLEDLIRERTEELELEK
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CCDS11 DLYTLFDAIIGSHDVYKVETIGDAYMVASGLPQRNGQRHAAEIANMSLDILSAVGTFRMR
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. .. .... ... . . .: :. .. .. .. .:: :.:..
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:. : :: .:. .:.:. .. : . .::::....: . . :.:
CCDS86 LS--PG-------NSLL---NSSFSRNLSPTKRDF-ALAYLNGILLFGHML-KIFLENGE
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.... ... ..: : :..: .: .. .:: . ..:. .. : . ..:
CCDS86 NITTPKFAHAFRNLTFEGYDGPVTLDDWGDVDSTMVLL-YTSVDTKKYKVLLTYDTHVNK
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: . : .. :.: . : . : :: . ... :. .
CCDS86 TYPVDMSPTFTWKNSKLPNDIT-----------GRGPQILMIAVFTLTGAVVLLLLVA-L
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:..:: . :: . : .: :.. . ..: : .. .. . : .. : .
CCDS86 LMLRKYRKDYELRQKKWSHIPPENIFPLETNETNH--VSLKIDDDKRRDTIQRLRQCKYD
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CCDS86 IFGVIEYCERGSLREVL-NDTISYPDGTFMDWEFKISVLYDIAKGMSYLHSSKTEVHGRL
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CCDS86 KSTNCVVDSRMVVKITDFGCNSI---LPPK-------KDLWTAPEHLRQANIS----QKG
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CCDS86 YLLVKNCWEEDPEKRPDFKKIETTLAKIFGLFHDQKNESYMDTLIRRLQLYSRNLEHLVE
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:::: : :. .:. : ...::. :...::. :. : .. ::::::::::::.. :
CCDS86 ERTQLYKAERDRADRLNFMLLPRLVVKSLKEKGFVEPELYEEVTIYFSDIVGFTTICKYS
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CCDS86 RIHVSGSTIAILKRTECQFLYEVRGETYLKGRGNETTYWLTGMKDQKFNLPTPPTVENQQ
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CCDS83 KTVDLLYSIFPGDVAQQLWQGQQVQARKFDDVTMLFSDIVGFTAICAQCTPMQVISMLNE
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CCDS83 GRP---IQMRIGIHSGSVLAGVVGVRMPRYCLFGNNVTLASKFESGSHPRRINVSPTTYQ
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CCDS83 LLKREESFTFIPRSREELPDNFPKEIPGICYFLEVRTGPKPPKPSLSSSRIKKVSYNIGT
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CCDS34 GRGLYLSDIPIHNALRDVVLIGEQARAQDGLKKRLGKLKATLEQAHQALEEEKKKTVDLL
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CCDS34 CSIFPCEVAQQLWQGQVVQAKKFSNVTMLFSDIVGFTAICSQCSPLQVITMLNALYTRFD
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CCDS34 QQCGELDVYKVETIGDAYCVAGGLH-KESDTHAVQIALMALKMMELSDEV---MSPHGEP
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: . :. :.
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780 790 800 810 820 830
pF1KE3 AERPDFGQIKGFIRRFNKEGGTSILDNLLLRMEQYANNLEKLVEERTQAYLEEKRKAEAL
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CCDS77 TRRGLYLSDIPLHDATRDLVLLGEQFREEYKLTQELEILTDRLQLTLRALEDEKKKTDTL
320 330 340 350 360 370
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pF1KE3 LYQILPHSVAEQLKRGETVQAEAFDSVTIYFSDIVGFTALSAESTP----MQVVTLLNDL
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CCDS77 LYSVLPPSVANELRHKRPVPAKRYDNVTILFSGIVGFNAFCSKHASGEGAMKIVNLLNDL
380 390 400 410 420 430
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pF1KE3 YTCFDAIID---NFDVYKVETIGDAYMVVSGLPGRNGQRHAPEIARMALALLDAVSSFRI
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CCDS77 YTRFDTLTDSRKNPFVYKVETVGDKYMTVSGLP-EPCIHHARSICHLALDMMEIAGQVQV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]