Result of FASTA (ccds) for
pF1KE3145
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3145, 354 aa
1>>>pF1KE3145 354 - 354 aa - 354 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3818+/-0.00106; mu= 16.4743+/- 0.064
mean_var=70.8979+/-13.717, 0's: 0 Z-trim(103.4): 48 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.152320
statistics sampled from 7356 (7402) to 7356 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.592), E-opt: 0.2 (0.227), width: 16
Scan time: 2.600
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47625.1 GNAT3 gene_id:346562|Hs108|chr7 ( 354) 2320 519.2 2.1e-147
CCDS803.1 GNAT2 gene_id:2780|Hs108|chr1 ( 354) 1940 435.7 2.9e-122
CCDS2812.1 GNAT1 gene_id:2779|Hs108|chr3 ( 350) 1860 418.1 5.6e-117
CCDS2813.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 355) 1697 382.3 3.5e-106
CCDS5595.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7 ( 354) 1685 379.6 2.1e-105
CCDS802.1 GNAI3 gene_id:2773|Hs108|chr1 ( 354) 1678 378.1 6.2e-105
CCDS54587.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 318) 1562 352.6 2.7e-97
CCDS63642.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 339) 1562 352.6 2.8e-97
CCDS63644.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 303) 1483 335.2 4.4e-92
CCDS59061.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7 ( 302) 1481 334.8 5.9e-92
CCDS10756.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16 ( 354) 1470 332.4 3.6e-91
CCDS10757.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16 ( 354) 1459 330.0 1.9e-90
CCDS13804.1 GNAZ gene_id:2781|Hs108|chr22 ( 355) 1407 318.5 5.3e-87
CCDS6657.1 GNA14 gene_id:9630|Hs108|chr9 ( 355) 1114 254.1 1.3e-67
CCDS6658.1 GNAQ gene_id:2776|Hs108|chr9 ( 359) 1106 252.4 4.4e-67
CCDS12103.1 GNA11 gene_id:2767|Hs108|chr19 ( 359) 1103 251.7 6.9e-67
CCDS5335.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7 ( 381) 932 214.2 1.5e-55
CCDS12104.1 GNA15 gene_id:2769|Hs108|chr19 ( 374) 873 201.2 1.2e-51
CCDS11661.1 GNA13 gene_id:10672|Hs108|chr17 ( 377) 869 200.3 2.2e-51
CCDS42892.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 379) 825 190.7 1.8e-48
CCDS46624.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 380) 818 189.1 5.1e-48
CCDS11852.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18 ( 381) 818 189.1 5.2e-48
CCDS11851.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18 ( 458) 812 187.8 1.5e-47
CCDS64584.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7 ( 322) 727 169.1 4.7e-42
CCDS62302.1 GNA13 gene_id:10672|Hs108|chr17 ( 282) 660 154.3 1.1e-37
CCDS13472.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 394) 648 151.8 9.3e-37
CCDS46623.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 395) 648 151.8 9.3e-37
CCDS46622.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 (1037) 648 152.0 2.1e-36
CCDS64583.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7 ( 305) 629 147.5 1.4e-35
CCDS58614.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18 ( 174) 360 88.3 5.4e-18
>>CCDS47625.1 GNAT3 gene_id:346562|Hs108|chr7 (354 aa)
initn: 2320 init1: 2320 opt: 2320 Z-score: 2759.8 bits: 519.2 E(32554): 2.1e-147
Smith-Waterman score: 2320; 100.0% identity (100.0% similar) in 354 aa overlap (1-354:1-354)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGSGISSESKESAKRSKELEKKLQEDAERDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHKNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MGSGISSESKESAKRSKELEKKLQEDAERDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHKNG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 YSEQECMEFKAVIYSNTLQSILAIVKAMTTLGIDYVNPRSAEDQRQLYAMANTLEDGGMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YSEQECMEFKAVIYSNTLQSILAIVKAMTTLGIDYVNPRSAEDQRQLYAMANTLEDGGMT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 PQLAEVIKRLWRDPGIQACFERASEYQLNDSAAYYLNDLDRITASGYVPNEQDVLHSRVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PQLAEVIKRLWRDPGIQACFERASEYQLNDSAAYYLNDLDRITASGYVPNEQDVLHSRVK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 TTGIIETQFSFKDLHFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDEEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TTGIIETQFSFKDLHFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDEEV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 NRMHESLHLFNSICNHKYFSTTSIVLFLNKKDIFQEKVTKVHLSICFPEYTGPNTFEDAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NRMHESLHLFNSICNHKYFSTTSIVLFLNKKDIFQEKVTKVHLSICFPEYTGPNTFEDAG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE3 NYIKNQFLDLNLKKEDKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NYIKNQFLDLNLKKEDKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
310 320 330 340 350
>>CCDS803.1 GNAT2 gene_id:2780|Hs108|chr1 (354 aa)
initn: 1940 init1: 1940 opt: 1940 Z-score: 2308.5 bits: 435.7 E(32554): 2.9e-122
Smith-Waterman score: 1940; 80.2% identity (94.6% similar) in 354 aa overlap (1-354:1-354)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGSGISSESKESAKRSKELEKKLQEDAERDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHKNG
:::: :.:.:: :::::::::::::::...:.:::::::::::::::::::::::::..:
CCDS80 MGSGASAEDKELAKRSKELEKKLQEDADKEAKTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 YSEQECMEFKAVIYSNTLQSILAIVKAMTTLGIDYVNPRSAEDQRQLYAMANTLEDGGMT
:: .::.::::.::.:.:::::::..:::::::::..: :.: ::: .:...:.: :
CCDS80 YSPEECLEFKAIIYGNVLQSILAIIRAMTTLGIDYAEPSCADDGRQLNNLADSIEEGTMP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 PQLAEVIKRLWRDPGIQACFERASEYQLNDSAAYYLNDLDRITASGYVPNEQDVLHSRVK
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CCDS80 PELVEVIRRLWKDGGVQACFERAAEYQLNDSASYYLNQLERITDPEYLPSEQDVLRSRVK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 TTGIIETQFSFKDLHFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDEEV
:::::::.:: :::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS80 TTGIIETKFSVKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDDEV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 NRMHESLHLFNSICNHKYFSTTSIVLFLNKKDIFQEKVTKVHLSICFPEYTGPNTFEDAG
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CCDS80 NRMHESLHLFNSICNHKFFAATSIVLFLNKKDLFEEKIKKVHLSICFPEYDGNNSYDDAG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE3 NYIKNQFLDLNLKKEDKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
::::.::::::..:. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 NYIKSQFLDLNMRKDVKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
310 320 330 340 350
>>CCDS2812.1 GNAT1 gene_id:2779|Hs108|chr3 (350 aa)
initn: 1844 init1: 1844 opt: 1860 Z-score: 2213.5 bits: 418.1 E(32554): 5.6e-117
Smith-Waterman score: 1860; 78.2% identity (92.7% similar) in 354 aa overlap (1-354:1-350)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGSGISSESKESAKRSKELEKKLQEDAERDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHKNG
::.: :.: :.: .::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::..:
CCDS28 MGAGASAEEKHS----RELEKKLKEDAEKDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 YSEQECMEFKAVIYSNTLQSILAIVKAMTTLGIDYVNPRSAEDQRQLYAMANTLEDGGMT
:: .::.:: :.::.::::::::::.:::::.:.: . .: :.:. ::.:.:.: :
CCDS28 YSLEECLEFIAIIYGNTLQSILAIVRAMTTLNIQYGDSARQDDARKLMHMADTIEEGTMP
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 PQLAEVIKRLWRDPGIQACFERASEYQLNDSAAYYLNDLDRITASGYVPNEQDVLHSRVK
.....:.:::.: ::::::::::::::::::.:::.::.:... ::::.:::::.::::
CCDS28 KEMSDIIQRLWKDSGIQACFERASEYQLNDSAGYYLSDLERLVTPGYVPTEQDVLRSRVK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 TTGIIETQFSFKDLHFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDEEV
::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::.::
CCDS28 TTGIIETQFSFKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFIAALSAYDMVLVEDDEV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 NRMHESLHLFNSICNHKYFSTTSIVLFLNKKDIFQEKVTKVHLSICFPEYTGPNTFEDAG
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CCDS28 NRMHESLHLFNSICNHRYFATTSIVLFLNKKDVFFEKIKKAHLSICFPDYDGPNTYEDAG
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KE3 NYIKNQFLDLNLKKEDKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
:::: :::.::.... ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 NYIKVQFLELNMRRDVKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
300 310 320 330 340 350
>>CCDS2813.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 (355 aa)
initn: 1222 init1: 1222 opt: 1697 Z-score: 2019.9 bits: 382.3 E(32554): 3.5e-106
Smith-Waterman score: 1697; 68.7% identity (90.7% similar) in 355 aa overlap (1-354:1-355)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGSGISSESKESAKRSKELEKKLQEDAERDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHKNG
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CCDS28 MGCTVSAEDKAAAERSKMIDKNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 YSEQECMEFKAVIYSNTLQSILAIVKAMTTLGIDYVNPRSAEDQRQLYAMANTLEDGGMT
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CCDS28 YSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMGNLQIDFADPSRADDARQLFALSCTAEEQGVL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE3 PQ-LAEVIKRLWRDPGIQACFERASEYQLNDSAAYYLNDLDRITASGYVPNEQDVLHSRV
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CCDS28 PDDLSGVIRRLWADHGVQACFGRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 KTTGIIETQFSFKDLHFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDEE
:::::.::.:.::::::.:::::::::::::::::::::: ::::.::::::.::.::::
CCDS28 KTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 VNRMHESLHLFNSICNHKYFSTTSIVLFLNKKDIFQEKVTKVHLSICFPEYTGPNTFEDA
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CCDS28 MNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEA
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 GNYIKNQFLDLNLKKEDKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
..::...: ::: .:. ::::.:.::::::.::.::::::::.:::.::::::::
CCDS28 ASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF
310 320 330 340 350
>>CCDS5595.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7 (354 aa)
initn: 1685 init1: 1685 opt: 1685 Z-score: 2005.6 bits: 379.6 E(32554): 2.1e-105
Smith-Waterman score: 1685; 68.4% identity (89.8% similar) in 354 aa overlap (1-354:1-354)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGSGISSESKESAKRSKELEKKLQEDAERDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHKNG
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CCDS55 MGCTLSAEDKAAVERSKMIDRNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 YSEQECMEFKAVIYSNTLQSILAIVKAMTTLGIDYVNPRSAEDQRQLYAMANTLEDGGMT
:::.:: ..:::.::::.:::.::..:: : ::. . :.: :::...:.. :.: ::
CCDS55 YSEEECKQYKAVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGDSARADDARQLFVLAGAAEEGFMT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 PQLAEVIKRLWRDPGIQACFERASEYQLNDSAAYYLNDLDRITASGYVPNEQDVLHSRVK
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CCDS55 AELAGVIKRLWKDSGVQACFNRSREYQLNDSAAYYLNDLDRIAQPNYIPTQQDVLRTRVK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 TTGIIETQFSFKDLHFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDEEV
::::.::.:.::::::.:::::::::::::::::::::: ::::.::: ::.::.::::.
CCDS55 TTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 NRMHESLHLFNSICNHKYFSTTSIVLFLNKKDIFQEKVTKVHLSICFPEYTGPNTFEDAG
::::::..::.::::.:.:. :::.:::::::.:.::. : :.::.:::.: ::.:.:.
CCDS55 NRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKIKKSPLTICYPEYAGSNTYEEAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE3 NYIKNQFLDLNLKKEDKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
::. :: ::: .:. ::::.:.::::::.::.::::::::.:::.::::::::
CCDS55 AYIQCQFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF
310 320 330 340 350
>>CCDS802.1 GNAI3 gene_id:2773|Hs108|chr1 (354 aa)
initn: 1678 init1: 1678 opt: 1678 Z-score: 1997.3 bits: 378.1 E(32554): 6.2e-105
Smith-Waterman score: 1678; 67.5% identity (90.4% similar) in 354 aa overlap (1-354:1-354)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGSGISSESKESAKRSKELEKKLQEDAERDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHKNG
:: .:.:.: ...::: ....:.::.:. :. ::::::::::::::::::::::::..:
CCDS80 MGCTLSAEDKAAVERSKMIDRNLREDGEKAAKEVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 YSEQECMEFKAVIYSNTLQSILAIVKAMTTLGIDYVNPRSAEDQRQLYAMANTLEDGGMT
:::.:: ..:.:.::::.:::.::..:: : ::. . :.: :::...:.. :.: ::
CCDS80 YSEDECKQYKVVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGEAARADDARQLFVLAGSAEEGVMT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 PQLAEVIKRLWRDPGIQACFERASEYQLNDSAAYYLNDLDRITASGYVPNEQDVLHSRVK
:.:: :::::::: :.:::: :. ::::::::.:::::::::. :.:.:..::::..:::
CCDS80 PELAGVIKRLWRDGGVQACFSRSREYQLNDSASYYLNDLDRISQSNYIPTQQDVLRTRVK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 TTGIIETQFSFKDLHFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDEEV
::::.::.:.::::.:.:::::::::::::::::::::: ::::.::: ::.::.::::.
CCDS80 TTGIVETHFTFKDLYFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 NRMHESLHLFNSICNHKYFSTTSIVLFLNKKDIFQEKVTKVHLSICFPEYTGPNTFEDAG
::::::..::.::::.:.:. :::.:::::::.:.::. . :.::.::::: ::.:.:.
CCDS80 NRMHESMKLFDSICNNKWFTETSIILFLNKKDLFEEKIKRSPLTICYPEYTGSNTYEEAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE3 NYIKNQFLDLNLKKEDKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
::. :: ::: .:. ::::.:.::::::.::.::::::::.:::.:::.:::.
CCDS80 AYIQCQFEDLNRRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKECGLY
310 320 330 340 350
>>CCDS54587.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 (318 aa)
initn: 1222 init1: 1222 opt: 1562 Z-score: 1860.2 bits: 352.6 E(32554): 2.7e-97
Smith-Waterman score: 1562; 70.3% identity (91.5% similar) in 316 aa overlap (40-354:3-318)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 KESAKRSKELEKKLQEDAERDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHKNGYSEQECMEF
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CCDS54 DLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF
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10 20 30 40 50 60
pF1KE3 KESAKRSKELEKKLQEDAERDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHKNGYSEQECMEF
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pF1KE3 KAVIYSNTLQSILAIVKAMTTLGIDYVNPRSAEDQRQLYAMANTLEDGGMTPQ-LAEVIK
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CCDS63 RAVVYSNTIQSIMAIVKAMGNLQIDFADPSRADDARQLFALSCTAEEQGVLPDDLSGVIR
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pF1KE3 RLWRDPGIQACFERASEYQLNDSAAYYLNDLDRITASGYVPNEQDVLHSRVKTTGIIETQ
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CCDS63 RLWADHGVQACFGRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETH
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pF1KE3 FSFKDLHFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDEEVNRMHESLH
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CCDS63 FTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMK
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pF1KE3 LFNSICNHKYFSTTSIVLFLNKKDIFQEKVTKVHLSICFPEYTGPNTFEDAGNYIKNQFL
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CCDS63 LFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFE
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CCDS63 DLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF
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>>CCDS63644.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 (303 aa)
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pF1KE3 LQEDAERDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHKNGYSEQECMEFKAVIYSNTLQSIL
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CCDS63 MKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIM
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pF1KE3 AIVKAMTTLGIDYVNPRSAEDQRQLYAMANTLEDGGMTPQ-LAEVIKRLWRDPGIQACFE
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CCDS63 AIVKAMGNLQIDFADPSRADDARQLFALSCTAEEQGVLPDDLSGVIRRLWADHGVQACFG
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pF1KE3 RASEYQLNDSAAYYLNDLDRITASGYVPNEQDVLHSRVKTTGIIETQFSFKDLHFRMFDV
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pF1KE3 GGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDEEVNRMHESLHLFNSICNHKYFST
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pF1KE3 TSIVLFLNKKDIFQEKVTKVHLSICFPEYTGPNTFEDAGNYIKNQFLDLNLKKEDKEIYS
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CCDS63 TSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYT
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pF1KE3 HMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
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CCDS63 HFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF
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>>CCDS59061.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7 (302 aa)
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Smith-Waterman score: 1481; 69.2% identity (90.1% similar) in 302 aa overlap (53-354:1-302)
30 40 50 60 70 80
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CCDS59 MKIIHEAGYSEEECKQYKAVVYSNTIQSII
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90 100 110 120 130 140
pF1KE3 AIVKAMTTLGIDYVNPRSAEDQRQLYAMANTLEDGGMTPQLAEVIKRLWRDPGIQACFER
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CCDS59 AIIRAMGRLKIDFGDSARADDARQLFVLAGAAEEGFMTAELAGVIKRLWKDSGVQACFNR
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CCDS59 SREYQLNDSAAYYLNDLDRIAQPNYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVG
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CCDS59 GQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDT
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pF1KE3 SIVLFLNKKDIFQEKVTKVHLSICFPEYTGPNTFEDAGNYIKNQFLDLNLKKEDKEIYSH
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CCDS59 SIILFLNKKDLFEEKIKKSPLTICYPEYAGSNTYEEAAAYIQCQFEDLNKRKDTKEIYTH
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CCDS59 FTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF
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354 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]