Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2770
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2770, 1218 aa
1>>>pF1KE2770 1218 - 1218 aa - 1218 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.5654+/-0.00106; mu= -24.6345+/- 0.064
mean_var=517.5275+/-106.387, 0's: 0 Z-trim(116.4): 61 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.056378
statistics sampled from 17153 (17209) to 17153 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.773), E-opt: 0.2 (0.515), width: 16
Scan time: 3.150
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS54775.1 AFF1 gene_id:4299|Hs109|chr4 (1218) 8104 674.4 4.6e-193
CCDS3616.1 AFF1 gene_id:4299|Hs109|chr4 (1210) 8011 666.9 8.7e-191
CCDS4164.1 AFF4 gene_id:27125|Hs109|chr5 (1163) 1581 143.9 2.3e-33
CCDS33258.1 AFF3 gene_id:3899|Hs109|chr2 (1251) 1318 122.5 6.7e-27
CCDS42723.1 AFF3 gene_id:3899|Hs109|chr2 (1226) 1313 122.1 8.8e-27
CCDS14684.1 AFF2 gene_id:2334|Hs109|chrX (1311) 780 78.8 1e-13
CCDS78510.1 AFF2 gene_id:2334|Hs109|chrX (1276) 772 78.1 1.6e-13
CCDS55521.1 AFF2 gene_id:2334|Hs109|chrX ( 952) 761 77.2 2.3e-13
CCDS76040.1 AFF2 gene_id:2334|Hs109|chrX (1276) 751 76.4 5.2e-13
>>CCDS54775.1 AFF1 gene_id:4299|Hs109|chr4 (1218 aa)
initn: 8104 init1: 8104 opt: 8104 Z-score: 3579.7 bits: 674.4 E(33420): 4.6e-193
Smith-Waterman score: 8104; 100.0% identity (100.0% similar) in 1218 aa overlap (1-1218:1-1218)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAFTERVNSSGNSLYNDDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYKTAKGDEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MAFTERVNSSGNSLYNDDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYKTAKGDEL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SSRIQNMLGNYEEVKEFLSTKSHTHRLDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPSSSFHTSVHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SSRIQNMLGNYEEVKEFLSTKSHTHRLDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPSSSFHTSVHH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 QSIHTPASGPLSVGNISHNPKMAQPRTEPMPSLHAKSCGPPDSQHLTQDRLGQEGFGSSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QSIHTPASGPLSVGNISHNPKMAQPRTEPMPSLHAKSCGPPDSQHLTQDRLGQEGFGSSH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 HKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSPVPPLSPIHSNQQTLPRTQGSSKVHGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSPVPPLSPIHSNQQTLPRTQGSSKVHGS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SNNSKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSLVAPAQPPSQTFPPPSLPSKSVAMQQKPTAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SNNSKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSLVAPAQPPSQTFPPPSLPSKSVAMQQKPTAY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VRPMDGQDQAPSESPELKPLPEDYRQQTFEKTDLKVPAKAKLTKLKMPSQSVEQTYSNEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VRPMDGQDQAPSESPELKPLPEDYRQQTFEKTDLKVPAKAKLTKLKMPSQSVEQTYSNEV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 HCVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSSVTQNQKQYDTSSKTHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HCVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSSVTQNQKQYDTSSKTHS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 NSQQGTSSMLEDDLQLSDSEDSDSEQTPEKPPSSSAPPSAPQSLPEPVASAHSSSAESES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NSQQGTSSMLEDDLQLSDSEDSDSEQTPEKPPSSSAPPSAPQSLPEPVASAHSSSAESES
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 TSDSDSSSDSESESSSSDSEENEPLETPAPEPEPPTTNKWQLDNWLTKVSQPAAPPEGPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TSDSDSSSDSESESSSSDSEENEPLETPAPEPEPPTTNKWQLDNWLTKVSQPAAPPEGPR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 STEPPRRHPESKGSSDSATSQEHSESKDPPPKSSSKAPRAPPEAPHPGKRSCQKSPAQQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 STEPPRRHPESKGSSDSATSQEHSESKDPPPKSSSKAPRAPPEAPHPGKRSCQKSPAQQE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 PPQRQTVGTKQPKKPVKASARAGSRTSLQGEREPGLLPYGSRDQTSKDKPKVKTKGRPRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PPQRQTVGTKQPKKPVKASARAGSRTSLQGEREPGLLPYGSRDQTSKDKPKVKTKGRPRA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 AASNEPKPAVPPSSEKKKHKSSLPAPSKALSGPEPAKDNVEDRTPEHFALVPLTESQGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AASNEPKPAVPPSSEKKKHKSSLPAPSKALSGPEPAKDNVEDRTPEHFALVPLTESQGPP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 HSGSGSRTSGCRQAVVVQEDSRKDRLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HSGSGSRTSGCRQAVVVQEDSRKDRLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 PQPPGKGSRQRKAEDKQPPAGKKHSSEKRSSDSSSKLAKKRKGEAERDCDNKKIRLEKEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PQPPGKGSRQRKAEDKQPPAGKKHSSEKRSSDSSSKLAKKRKGEAERDCDNKKIRLEKEI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 KSQSSSSSSSHKESSKTKPSRPSSQSSKKEMLPPPPVSSSSQKPAKPALKRSRREADTCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KSQSSSSSSSHKESSKTKPSRPSSQSSKKEMLPPPPVSSSSQKPAKPALKRSRREADTCG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 QDPPKSASSTKSNHKDSSIPKQRRVEGKGSRSSSEHKGSSGDTANPFPVPSLPNGNSKPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QDPPKSASSTKSNHKDSSIPKQRRVEGKGSRSSSEHKGSSGDTANPFPVPSLPNGNSKPG
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 KPQVKFDKQQADLHMREAKKMKQKAELMTDRVGKAFKYLEAVLSFIECGIATESESQSSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KPQVKFDKQQADLHMREAKKMKQKAELMTDRVGKAFKYLEAVLSFIECGIATESESQSSK
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 SAYSVYSETVDLIKFIMSLKSFSDATAPTQEKIFAVLCMRCQSILNMAMFRCKKDIAIKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SAYSVYSETVDLIKFIMSLKSFSDATAPTQEKIFAVLCMRCQSILNMAMFRCKKDIAIKY
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 SRTLNKHFESSSKVAQAPSPCIARSTGTPSPLSPMPSPASSVGSQSSAGSVGSSGVAATI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SRTLNKHFESSSKVAQAPSPCIARSTGTPSPLSPMPSPASSVGSQSSAGSVGSSGVAATI
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 STPVTIQNMTSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCTLALNSSLVDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 STPVTIQNMTSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCTLALNSSLVDL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210
pF1KE2 VHYTRQGFQQLQELTKTP
::::::::::::::::::
CCDS54 VHYTRQGFQQLQELTKTP
1210
>>CCDS3616.1 AFF1 gene_id:4299|Hs109|chr4 (1210 aa)
initn: 7595 init1: 7309 opt: 8011 Z-score: 3538.9 bits: 666.9 E(33420): 8.7e-191
Smith-Waterman score: 8011; 99.8% identity (99.9% similar) in 1207 aa overlap (12-1218:5-1210)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAFTERVNSSGNSLYNDDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYKTAKGDEL
.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 MAAQSSLYNDDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYKTAKGDEL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SSRIQNMLGNYEEVKEFLSTKSHTHRLDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPSSSFHTSVHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 SSRIQNMLGNYEEVKEFLSTKSHTHRLDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPSSSFHTSVHH
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 QSIHTPASGPLSVGNISHNPKMAQPRTEPMPSLHAKSCGPPDSQHLTQDRLGQEGFGSSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 QSIHTPASGPLSVGNISHNPKMAQPRTEPMPSLHAKSCGPPDSQHLTQDRLGQEGFGSSH
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 HKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSPVPPLSPIHSNQQTLPRTQGSSKVHGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 HKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSPVPPLSPIHSNQQTLPRTQGSSKVHGS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SNNSKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSLVAPAQPPSQTFPPPSLPSKSVAMQQKPTAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 SNNSKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSLVAPAQPPSQTFPPPSLPSKSVAMQQKPTAY
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VRPMDGQDQAPSESPELKPLPEDYRQQTFEKTDLKVPAKAKLTKLKMPSQSVEQTYSNEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 VRPMDGQDQAPSESPELKPLPEDYRQQTFEKTDLKVPAKAKLTKLKMPSQSVEQTYSNEV
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 HCVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSSVTQNQKQYDTSSKTHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 HCVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSSVTQNQKQYDTSSKTHS
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 NSQQGTSSMLEDDLQLSDSEDSDSEQTPEKPPSSSAPPSAPQSLPEPVASAHSSSAESES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 NSQQGTSSMLEDDLQLSDSEDSDSEQTPEKPPSSSAPPSAPQSLPEPVASAHSSSAESES
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 TSDSDSSSDSESESSSSDSEENEPLETPAPEPEPPTTNKWQLDNWLTKVSQPAAPPEGPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 TSDSDSSSDSESESSSSDSEENEPLETPAPEPEPPTTNKWQLDNWLTKVSQPAAPPEGPR
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 STEPPRRHPESKGSSDSATSQEHSESKDPPPKSSSKAPRAPPEAPHPGKRSCQKSPAQQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 STEPPRRHPESKGSSDSATSQEHSESKDPPPKSSSKAPRAPPEAPHPGKRSCQKSPAQQE
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 PPQRQTVGTKQPKKPVKASARAGSRTSLQGEREPGLLPYGSRDQTSKDKPKVKTKGRPRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 PPQRQTVGTKQPKKPVKASARAGSRTSLQGEREPGLLPYGSRDQTSKDKPKVKTKGRPRA
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 AASNEPKPAVPPSSEKKKHKSSLPAPSKALSGPEPAKDNVEDRTPEHFALVPLTESQGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 AASNEPKPAVPPSSEKKKHKSSLPAPSKALSGPEPAKDNVEDRTPEHFALVPLTESQGPP
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 HSGSGSRTSGCRQAVVVQEDSRKDRLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 HSGSGSRTSGCRQAVVVQEDSRKDRLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRI
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 PQPPGKGSRQRKAEDKQPPAGKKHSSEKRSSDSSSKLAKKRKGEAERDCDNKKIRLEKEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 PQPPGKGSRQRKAEDKQPPAGKKHSSEKRSSDSSSKLAKKRKGEAERDCDNKKIRLEKEI
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 KSQSSSSSSSHKESSKTKPSRPSSQSSKKEMLPPPPVSSSSQKPAKPALKRSRREADTCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 KSQSSSSSSSHKESSKTKPSRPSSQSSKKEMLPPPPVSSSSQKPAKPALKRSRREADTCG
840 850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 QDPPKSASSTKSNHKDSSIPKQRRVEGKGSRSSSEHKGSSGDTANPFPVPSLPNGNSKPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 QDPPKSASSTKSNHKDSSIPKQRRVEGKGSRSSSEHKGSSGDTANPFPVPSLPNGNSKPG
900 910 920 930 940 950
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 KPQVKFDKQQADLHMREAKKMKQKAELMTDRVGKAFKYLEAVLSFIECGIATESESQSSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 KPQVKFDKQQADLHMREAKKMKQKAELMTDRVGKAFKYLEAVLSFIECGIATESESQSSK
960 970 980 990 1000 1010
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 SAYSVYSETVDLIKFIMSLKSFSDATAPTQEKIFAVLCMRCQSILNMAMFRCKKDIAIKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 SAYSVYSETVDLIKFIMSLKSFSDATAPTQEKIFAVLCMRCQSILNMAMFRCKKDIAIKY
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 SRTLNKHFESSSKVAQAPSPCIARSTGTPSPLSPMPSPASSVGSQSSAGSVGSSGVAATI
::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 SRTLNKHFESSSKVAQAPSPCIA-STGTPSPLSPMPSPASSVGSQSSAGSVGSSGVAATI
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 STPVTIQNMTSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCTLALNSSLVDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 STPVTIQNMTSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCTLALNSSLVDL
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1210
pF1KE2 VHYTRQGFQQLQELTKTP
::::::::::::::::::
CCDS36 VHYTRQGFQQLQELTKTP
1200 1210
>>CCDS4164.1 AFF4 gene_id:27125|Hs109|chr5 (1163 aa)
initn: 1393 init1: 451 opt: 1581 Z-score: 712.7 bits: 143.9 E(33420): 2.3e-33
Smith-Waterman score: 2476; 39.7% identity (68.6% similar) in 1228 aa overlap (17-1216:4-1160)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MAFTERVNSSGNSLYNDDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYK-TAKGDE
.:::.::..:.:::::: .: ..::: . :::.:::: :.: :.
CCDS41 MNREDRNVLRMKERERRNQEIQQGEDAFPPSSPLFAEPYKVTSKEDK
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 LSSRIQNMLGNYEEVKEFLSTKSHTHRLDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPS--SSFHTS
::::::.:::::.:.:.:.. .: .: : . :: : :. :. :. . : .
CCDS41 LSSRIQSMLGNYDEMKDFIGDRS-IPKLVA----IPKPTVPPSADEKSN-PNFFEQRHGG
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 VHHQSIHTPASGPLSVGNISHNPKMAQPRTEPMPSLH------AKSCGPPDSQHLTQDRL
:..: ::. :: . . ...: :. . : : : : . .:. .::
CCDS41 SHQSSKWTPV-GP------APSTSQSQKRSSGLQSGHSSQRTSAGSSSGTNSSGQRHDRE
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 GQEGFGSSHHKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSPVPPLSPIHSNQQTLPRT
. .. ::: .:::.. :.. .. .:.: . :. : :. ::
CCDS41 SYNNSGSSSRKKGQH---GSEHSKSRSSSPGK--------PQAVSSLNSSHS--------
160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 QGSSKVHGSSNNSKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSLVAPAQPPSQTFPPPSLPSKSV
. ::....:: . .:::.: . . ..:. . .: .:.::: :: :::
CCDS41 ----RSHGNDHHSKEHQRSKSPRDPDA---NWDSPSRVPFSSGQHSTQSFPP-SLMSKSN
200 210 220 230 240
300 310 320 330 340
pF1KE2 AMQQKPTAYVRPMDGQDQAPSESPELKPLPEDYRQQTFEK--TDLKVPAKAKLTKLKMPS
.: :::::::::::::. : :.:. : : .:. . :.:: .::.:::::.::
CCDS41 SMLQKPTAYVRPMDGQE---SMEPKLS--SEHYSSQSHGNSMTELKPSSKAHLTKLKIPS
250 260 270 280 290 300
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 QSVEQTYSNEVHCVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSSVTQNQ
: .. . :..: ::.:::::::::::::::::::: .::::::::::.::. . : .:
CCDS41 QPLDASASGDVSCVDEILKEMTHSWPPPLTAIHTPCKTEPSKFPFPTKESQQSNFGTGEQ
310 320 330 340 350 360
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 KQYDTSSKTHSNSQQGTSSMLEDDLQLSDSEDSDSEQT-----PEKPPSSSAPPSAPQSL
:.:. : :: ::..: ..:::.:::.::.:::::.:: :.. :.:.. :: .:
CCDS41 KRYNPS-KT-SNGHQ-SKSMLKDDLKLSSSEDSDGEQDCDKTMPRSTPGSNSEPSHHNS-
370 380 390 400 410
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 PEPVASAHSSSAESESTSDSDSSSDSESESSSSDSEENEPLETPAPEPEPPTTNKWQLDN
: . .....:. :.: :.:.:.::::::::::::: ::: .. .:::::: ::::::::
CCDS41 -EGADNSRDDSS-SHSGSESSSGSDSESESSSSDSEANEPSQSASPEPEPPPTNKWQLDN
420 430 440 450 460 470
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 WLTKVSQPAAPPEGPRSTEPPRRHPESKGSSDSATSQEHSESKDPPPKSSSKAPRAPPEA
::.::. . : . ... : . .: . ...:.. ..... : ..:: .: ..
CCDS41 WLNKVNPHKVSPASSVDSNIPSSQGYKKEGREQGTGNSYTDTSGPK-ETSSATPGRDSKT
480 490 500 510 520 530
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 PHPGK---RSCQKSPAQQEPP-QRQTVGTKQPKKPVKASARAGSRTSLQGEREPGLLPYG
. :. :. ::::::.. ::.::: ::::: ::.:. : .:. : : :
CCDS41 IQKGSESGRGRQKSPAQSDSTTQRRTVGKKQPKKAEKAAAEE-PRGGLKIESET---PVD
540 550 560 570 580 590
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 SRDQTSKDKPKVKTKGRPRAAASNEPKPAVPPSSEKKKHKSSLPAPSKALSGPEPAKDNV
.. ... :. ::: . ..: : . :..::::.::. . .:. : :.
CCDS41 LASSMPSSRHKAATKGSRKPNIKKESKSSPRPTAEKKKYKSTSKSSQKSREIIET--DTS
600 610 620 630 640
710 720 730 740 750
pF1KE2 EDRTPEHFALVPLTESQGPPHSGSGSRTSGCRQAVVVQEDSR-KDRLPLPLRDTKLLSPL
. . : .: : ... :.: .:: . . : .::: ..:. :... .:::::
CCDS41 SSDSDESESLPPSSQTPKYPES---NRTP-VKPSSVEEEDSFFRQRMFSPMEEKELLSPL
650 660 670 680 690 700
760 770 780 790 800 810
pF1KE2 RDTPPPQSLMVKITLDLLSRIPQPPGKGSRQRKAEDKQPPAGKKHSSEKRSSDSSSKLAK
. :.::: :.::.::: : : .. :.: :. : .::. : ... .: :...
CCDS41 SEPDDRYPLIVKIDLNLLTRIPGKPYKETEPPKGEKKNVP--EKHTREAQKQ-ASEKVSN
710 720 730 740 750 760
820 830 840 850 860 870
pF1KE2 KRKGEAERDCDNKKIRLEKEIKSQSSSSSSSHKESSKTKPSRPSSQSSKKEMLPPP--PV
: : . ... :... :. :.....:.. :: ::. . :. :. ...:..:: : ::
CCDS41 KGK-RKHKNEDDNRASESKKPKTEDKNSAG-HKPSSNRESSKQSA-AKEKDLLPSPAGPV
770 780 790 800 810
880 890 900 910 920 930
pF1KE2 SSSSQKPAKPALKRSRREADTCGQDPPKSASSTKSNHKDSSIPKQRRVEGKGSRSSSEHK
:.. : . . ::. .... .. .. .. :....:: ::...::: : ::.: :
CCDS41 PSKDPKTEHGSRKRTISQSSSLKSSSNSNKETSGSSKNSSSTSKQKKTEGKTSSSSKEVK
820 830 840 850 860 870
940 950 960 970 980 990
pF1KE2 GSSGDTANPFPVPSLPN-GNSKPGKPQVKFDKQQ--ADLHMREAKKMKQKAELMTDRVGK
.. .... : :: :. .::: . .. :: .. :: ...::::.:..:. ..:: :
CCDS41 EKAPSSSSNCP-PSAPTLDSSKPRRTKLVFDDRNYSADHYLQEAKKLKHNADALSDRFEK
880 890 900 910 920 930
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE2 AFKYLEAVLSFIECGIATESESQSSKSAYSVYSETVDLIKFIMSLKSFSDATAPTQEKIF
: ::.::.:::::: : :...: ::: . .:::::::::. :.::.. : . .: .
CCDS41 AVYYLDAVVSFIECGNALEKNAQESKSPFPMYSETVDLIKYTMKLKNYLAPDATAADKRL
940 950 960 970 980 990
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE2 AVLCMRCQSILNMAMFRCKKDIAIKYSRTLNKHFESSSKVAQAPSPCI-ARSTGTPSPLS
.:::.::.:.: . .:. ::. :.:::.::..:...: . .::::: . ....: :::.:
CCDS41 TVLCLRCESLLYLRLFKLKKENALKYSKTLTEHLKNSYNNSQAPSPGLGSKAVGMPSPVS
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE2 PMPSPASSVGSQSSAGSVGSSGVAATISTPVTIQNMTSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEAL
: ::..: . .:.:.:...:: ..:: : :..:..::: .::. : : ..:.::: :
CCDS41 PKLSPGNSGNYSSGASSASASGSSVTI--PQKIHQMAASYVQVTSNFLYATEIWDQAEQL
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1180 1190 1200 1210
pF1KE2 TRKNKEFFARLSTNVCTLALNSSLV-DLVHYTRQGFQQLQELTKTP
....:::::.:. . : .:.:.. :::.:::::.. :.. .:
CCDS41 SKEQKEFFAELDKVMGPLIFNASIMTDLVRYTRQGLHWLRQDAKLIS
1120 1130 1140 1150 1160
>>CCDS33258.1 AFF3 gene_id:3899|Hs109|chr2 (1251 aa)
initn: 1710 init1: 449 opt: 1318 Z-score: 596.6 bits: 122.5 E(33420): 6.7e-27
Smith-Waterman score: 1945; 35.0% identity (60.2% similar) in 1294 aa overlap (13-1212:43-1245)
10 20 30 40
pF1KE2 MAFTERVNSSGNSLYNDDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFP
:.:. ::: :: .:.::::::..:. .:
CCDS33 DLESLWGEDILNQRNDSLVVEFQSSASRCRSVYEPDRNALRRKERERRNQETQQDDGTFN
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 EKIPLFGEPYKTAKGDELSSRIQNMLGNYEEVKEFLSTKSHTHRLDASENRLGKPKYPLI
. ::.::::: ::::::.:::: ::::.:.:.::. .:. .: .: :: : .
CCDS33 SSYSLFSEPYKTNKGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHL------VGVPK-PGV
80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 PDKGSSIPSSSFHTSVHHQSIHTPASGPLSVGNISHNPKMAQPRTEPMPS-LHAKSCGPP
: .:: :..:... .:. :.. .:: . . . . :
CCDS33 P--------------------QTP------VNKIDEHF-VADSRAQNQPSSICSTTTSTP
130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 DSQHLTQDRLGQEGFGSSHHKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSP-VPPLSP
. . :.. : :. .: : .::.. :. : . :. .. .: . .
CCDS33 AAVPVQQSKRGTMGW----QKAGHPPSDGQQRATQQGSL-RTLLGDGVGRQQPRAKQVCN
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 IHSNQQTLPRTQGSSKVHGSSNNSKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSLVAPAQPPSQT
.. . :: : . . :.:: :.: :.
CCDS33 VEVGLQTQERPPAMAAKHSSS----GHC-----------------------------VQN
220 230 240
290 300 310 320 330
pF1KE2 FPPPSLPSKSVAMQQKPTAYVRPMDGQDQAPSESPELKPLPE------DYRQQTFEKTDL
::: :: :: .::::::::::::::::::.:::.:: : .:: : .
CCDS33 FPP-SLASKPSLVQQKPTAYVRPMDGQDQAPDESPKLKSSSETSVHCTSYRGVPASKPE-
250 260 270 280 290
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 KVPAKAKLTKLKMPSQSVEQTYSNEVH-CVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFP
. :::::.:...:.:. :.. :.:.. :::::..::: : :::.::..:. .::.:::
CCDS33 PARAKAKLSKFSIPKQG-EESRSGETNSCVEEIIREMT--WLPPLSAIQAPGKVEPTKFP
300 310 320 330 340 350
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 FPTKDSQHVSSVTQNQKQYDTSSKTHSNSQQGTSSMLEDDLQLSDSEDSDSEQTPEKPP-
::.:::: ::: .: :. :. .. .:. ..:: ::::::.::..:. . .:. ..
CCDS33 FPNKDSQLVSSGHNNPKKGDAEPESPDNGTSNTS-MLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTAL
360 370 380 390 400 410
460 470 480 490 500
pF1KE2 ---SSSA---PPSAPQSLPEPVASAHSSSA-ESESTSDSDSSS--DSESESSSSDSEENE
:.:: :. :.: .:. :::. : :.:::.::: :::.:::::.:: ..
CCDS33 RALSDSAVVQQPNCRTSVPSSKGSSSSSSSGSSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSK
420 430 440 450 460 470
510 520 530 540 550
pF1KE2 PLETPAPEPEPPTTNKWQLDNWLTKVSQPAAPP-------EGPRSTE---PPRRHPESKG
: . .:: :: ..::::::.::.::. : :: .: .:.. : .. .. :
CCDS33 PPHFSSPEAEPASSNKWQLDKWLNKVN-PHKPPILIQNESHGSESNQYYNPVKEDVQDCG
480 490 500 510 520 530
560 570 580 590
pF1KE2 S-----SDSATSQE-HSESKDPP-PKSSSKAP-------RAPPEA--------PHPGKRS
. . : .: .: :. :....::: ..:: : :
CCDS33 KVPDVCQPSLREKEIKSTCKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAVP
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640
pF1KE2 CQKSPAQQEP-PQRQTVGTKQPKKPVKASAR--AGSRTSLQGEREPGLLP-YGSRDQTSK
: .::.. : : :...: :::.. . : ::. .. . .::. :. .
CCDS33 C--APAENAPAPARRSAG----KKPTRRTERTSAGDGANCHRPEEPAAADALGTSVVVPP
600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 DKPKVKTKGRPRAAASNEPKPAVPPSSEKKKHKSSLPAPSKAL-----SGPEPAKDNVED
. :.. : ::. .: . .: ... . : . :: . :. ..:. .
CCDS33 EPTKTRPCGNNRASHRKELRSSVTCEKRRTRGLSRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLE
650 660 670 680 690 700
710 720 730 740
pF1KE2 RTPEHFAL-----VPLTESQG--------PPHSGSGSRTS-GCRQAV----VVQEDSRKD
:.. : : . :.: ..::: :. : .: ...: ..
CCDS33 SEQEEYPLSKAQTVAASASSGNDQRLKEAAANGGSGPRAPVGSINARTTSDIAKELEEQF
710 720 730 740 750 760
750 760 770 780 790
pF1KE2 RLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRIP----QPPGKGSRQ-RKAEDKQPP
.:. ..:::::.:. .:: ::: : :::::: : :: : : .. ::
CCDS33 YTLVPFGRNELLSPLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPEHLPQEPGVLSAPATKDSESAPP
770 780 790 800 810 820
800 810 820 830 840 850
pF1KE2 AGKKHSSEKRSSDSSSKLAKKRKGEAERDC-DNKKIRLEKEIKSQSSSSSSS-----HKE
. :.:. . . : .::: . : : . :: . ::. .:. ..:.:. : .
CCDS33 S---HTSDTPAEKALPKSKRKRKCDNEDDYREIKKSQGEKDSSSRLATSTSNTLSANHCN
830 840 850 860 870 880
860 870 880 890 900 910
pF1KE2 SSKTKPSRPSSQSSKKEMLPPPPVSSSSQ-KPAKPALKRSRREADTCGQDPPKSASSTKS
. .. . : ... : : :.:..:. : .. : : : :.. ::::.:.
CCDS33 MNINSVAIPINKNEKMLRSPISPLSDASKHKYTSEDLTSSSRPN---GNSLFTSASSSKK
890 900 910 920 930 940
920 930 940 950 960 970
pF1KE2 NHKDSSIPKQRRVEGKGSRSSSEHKGSSGDTANPFPVPSLPNGNSKPGKPQVKFDK--QQ
. ::.. . :.....::. . . : ::. . .. :: ..
CCDS33 PKADSQLQPHGGDLTKAAHNNSENIPLHKSRPQTKPWSPGSNGHRDCKRQKLVFDDMPRS
950 960 970 980 990 1000
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KE2 ADLHMREAKKMKQKAELMTDRVGKAFKYLEAVLSFIECGIATESESQSSKSAYSVYSETV
:: :.:::.::.::. :... :::..: ::.::::::: : :. . ::: :..:::::
CCDS33 ADYFMQEAKRMKHKADAMVEKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQGPMESKSPYTMYSETV
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KE2 DLIKFIMSLKSFSDATAPTQEKIFAVLCMRCQSILNMAMFRCKKDIAIKYSRTLNKHFES
.::.. : ::. : .: ..: .:.::.:: ..: ::: :.: :.:::..: .:..
CCDS33 ELIRYAMRLKTHSGPNATPEDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKRDHAVKYSKALIDYFKN
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 SSKVAQAPSPCIA--RSTGTPSPLSPMPSPASSVGSQSSAGSVGSSGVAATISTPVTIQN
:::.:::::: : .:::::::.:: ::::::::::.: ..... . .. .: : :..
CCDS33 SSKAAQAPSPWGASGKSTGTPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNASALSPSTIVSIPQRIHQ
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 MTSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCTLALNSSLVDLVHYTRQGF
:....:.::. .: ..: ::.:. :...:.::: :. . ..:.::. ::.:..::.
CCDS33 MAANHVSITNSILHSYDYWEMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVTLHSSMEHLVQYSQQGL
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1210
pF1KE2 QQLQELTKTP
. :.
CCDS33 HWLRNSAHLS
1250
>>CCDS42723.1 AFF3 gene_id:3899|Hs109|chr2 (1226 aa)
initn: 1710 init1: 449 opt: 1313 Z-score: 594.5 bits: 122.1 E(33420): 8.8e-27
Smith-Waterman score: 1940; 35.0% identity (60.2% similar) in 1293 aa overlap (14-1212:19-1220)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MAFTERVNSSGNSLYNDDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYKTA
.:. ::: :: .:.::::::..:. .: . ::.:::::
CCDS42 MDSFDLALLQEWDLESLCVYEPDRNALRRKERERRNQETQQDDGTFNSSYSLFSEPYKTN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 KGDELSSRIQNMLGNYEEVKEFLSTKSHTHRLDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPSSSFH
::::::.:::: ::::.:.:.::. .:. .: .: :: : .:
CCDS42 KGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHL------VGVPK-PGVP------------
70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 TSVHHQSIHTPASGPLSVGNISHNPKMAQPRTEPMPS-LHAKSCGPPDSQHLTQDRLGQE
.:: :..:... .:. :.. .:: . . . . : . . :.. :
CCDS42 --------QTP------VNKIDEHF-VADSRAQNQPSSICSTTTSTPAAVPVQQSKRGTM
110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 GFGSSHHKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSP-VPPLSPIHSNQQTLPRTQG
:. .: : .::.. :. : . :. .. .: . . .. . :: : .
CCDS42 GW----QKAGHPPSDGQQRATQQGSL-RTLLGDGVGRQQPRAKQVCNVEVGLQTQERPPA
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 SSKVHGSSNNSKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSLVAPAQPPSQTFPPPSLPSKSVAM
. :.:: :.: :.::: :: :: .
CCDS42 MAAKHSSS----GHC-----------------------------VQNFPP-SLASKPSLV
210 220
300 310 320 330 340
pF1KE2 QQKPTAYVRPMDGQDQAPSESPELKPLPE------DYRQQTFEKTDLKVPAKAKLTKLKM
::::::::::::::::::.:::.:: : .:: : . . :::::.:...
CCDS42 QQKPTAYVRPMDGQDQAPDESPKLKSSSETSVHCTSYRGVPASKPE-PARAKAKLSKFSI
230 240 250 260 270 280
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 PSQSVEQTYSNEVH-CVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSSVT
:.:. :.. :.:.. :::::..::: : :::.::..:. .::.:::::.:::: :::
CCDS42 PKQG-EESRSGETNSCVEEIIREMT--WLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKDSQLVSSGH
290 300 310 320 330 340
410 420 430 440 450
pF1KE2 QNQKQYDTSSKTHSNSQQGTSSMLEDDLQLSDSEDSDSEQTPEKPP----SSSA---PPS
.: :. :. .. .:. ..:: ::::::.::..:. . .:. .. :.:: :.
CCDS42 NNPKKGDAEPESPDNGTSNTS-MLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRALSDSAVVQQPN
350 360 370 380 390 400
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 APQSLPEPVASAHSSSA-ESESTSDSDSSS--DSESESSSSDSEENEPLETPAPEPEPPT
:.: .:. :::. : :.:::.::: :::.:::::.:: ..: . .:: :: .
CCDS42 CRTSVPSSKGSSSSSSSGSSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPPHFSSPEAEPAS
410 420 430 440 450 460
520 530 540 550 560
pF1KE2 TNKWQLDNWLTKVSQPAAPP-------EGPRSTE---PPRRHPESKGS-----SDSATSQ
.::::::.::.::. : :: .: .:.. : .. .. :. . : .
CCDS42 SNKWQLDKWLNKVN-PHKPPILIQNESHGSESNQYYNPVKEDVQDCGKVPDVCQPSLREK
470 480 490 500 510 520
570 580 590 600
pF1KE2 E-HSESKDPP-PKSSSKAP-------RAPPEA--------PHPGKRSCQKSPAQQEP-PQ
: .: :. :....::: ..:: : : : .::.. : :
CCDS42 EIKSTCKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAVPC--APAENAPAPA
530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 RQTVGTKQPKKPVKASAR--AGSRTSLQGEREPGLLP-YGSRDQTSKDKPKVKTKGRPRA
:...: :::.. . : ::. .. . .::. :. . . :.. : ::
CCDS42 RRSAG----KKPTRRTERTSAGDGANCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPTKTRPCGNNRA
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710
pF1KE2 AASNEPKPAVPPSSEKKKHKSSLPAPSKAL-----SGPEPAKDNVEDRTPEHFAL-----
. .: . .: ... . : . :: . :. ..:. . :.. :
CCDS42 SHRKELRSSVTCEKRRTRGLSRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLESEQEEYPLSKAQT
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750
pF1KE2 VPLTESQG--------PPHSGSGSRTS-GCRQAV----VVQEDSRKDRLPLPLRDTKLLS
: . :.: ..::: :. : .: ...: .. .:. ..:::
CCDS42 VAASASSGNDQRLKEAAANGGSGPRAPVGSINARTTSDIAKELEEQFYTLVPFGRNELLS
700 710 720 730 740 750
760 770 780 790 800 810
pF1KE2 PLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRIP----QPPGKGSRQ-RKAEDKQPPAGKKHSSEKRSSD
::.:. .:: ::: : :::::: : :: : : .. ::. :.:. .
CCDS42 PLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPEHLPQEPGVLSAPATKDSESAPPS---HTSDTPAEK
760 770 780 790 800 810
820 830 840 850 860
pF1KE2 SSSKLAKKRKGEAERDC-DNKKIRLEKEIKSQSSSSSSS-----HKESSKTKPSRPSSQS
. : .::: . : : . :: . ::. .:. ..:.:. : . . .. . : ...
CCDS42 ALPKSKRKRKCDNEDDYREIKKSQGEKDSSSRLATSTSNTLSANHCNMNINSVAIPINKN
820 830 840 850 860 870
870 880 890 900 910 920
pF1KE2 SKKEMLPPPPVSSSSQ-KPAKPALKRSRREADTCGQDPPKSASSTKSNHKDSSIPKQRRV
: : :.:..:. : .. : : : :.. ::::.:. . ::.. .
CCDS42 EKMLRSPISPLSDASKHKYTSEDLTSSSRPN---GNSLFTSASSSKKPKADSQLQPHGGD
880 890 900 910 920
930 940 950 960 970 980
pF1KE2 EGKGSRSSSEHKGSSGDTANPFPVPSLPNGNSKPGKPQVKFDK--QQADLHMREAKKMKQ
:.....::. . . : ::. . .. :: ..:: :.:::.::.
CCDS42 LTKAAHNNSENIPLHKSRPQTKPWSPGSNGHRDCKRQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKH
930 940 950 960 970 980
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE2 KAELMTDRVGKAFKYLEAVLSFIECGIATESESQSSKSAYSVYSETVDLIKFIMSLKSFS
::. :... :::..: ::.::::::: : :. . ::: :..:::::.::.. : ::. :
CCDS42 KADAMVEKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQGPMESKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHS
990 1000 1010 1020 1030 1040
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE2 DATAPTQEKIFAVLCMRCQSILNMAMFRCKKDIAIKYSRTLNKHFESSSKVAQAPSPCIA
.: ..: .:.::.:: ..: ::: :.: :.:::..: .:..:::.:::::: :
CCDS42 GPNATPEDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKRDHAVKYSKALIDYFKNSSKAAQAPSPWGA
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE2 --RSTGTPSPLSPMPSPASSVGSQSSAGSVGSSGVAATISTPVTIQNMTSSYVTITSHVL
.:::::::.:: ::::::::::.: ..... . .. .: : :..:....:.::. .:
CCDS42 SGKSTGTPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNASALSPSTIVSIPQRIHQMAANHVSITNSIL
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1170 1180 1190 1200 1210
pF1KE2 TAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCTLALNSSLVDLVHYTRQGFQQLQELTKTP
..: ::.:. :...:.::: :. . ..:.::. ::.:..::.. :.
CCDS42 HSYDYWEMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVTLHSSMEHLVQYSQQGLHWLRNSAHLS
1170 1180 1190 1200 1210 1220
>>CCDS14684.1 AFF2 gene_id:2334|Hs109|chrX (1311 aa)
initn: 1345 init1: 389 opt: 780 Z-score: 359.8 bits: 78.8 E(33420): 1e-13
Smith-Waterman score: 1615; 30.4% identity (56.7% similar) in 1281 aa overlap (63-1212:70-1305)
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 EAHQEKEAFPEKIPLFGEPYKTAKGDELSSRIQNMLGNYEEVKEFLSTKSH-THRLDASE
:.:: ::::.:.:..:...:. .: . .
CCDS14 EDDLFSSGFDLFGEPYKVAEYTNKGDALANRVQNTLGNYDEMKNLLTNHSNQNHLVGIPK
40 50 60 70 80 90
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 NRLGKPKYPLIPDKGSSIPSSSFHTSVHHQSIHTPASGPLSVGNIS-HNPKMAQPRTEPM
: . :. : .. : .: .. . ::. .: :.:. .. : . . .
CCDS14 NSV--PQNPNNKNEPSFFPEQKNRIIPPHQD-NTHPSAPMPPPSVVILNSTLIHSNRKSK
100 110 120 130 140 150
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 PSLHAKSCGPPDSQHLTQDRLGQEGFGSSHHKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLIS
: : .: : :... :: .. ..:.. . .: ..
CCDS14 PEWSRDSHNP--STVLASQASGQP----------------NKMQTLTQDQSQAKLEDFFV
160 170 180 190
220 230 240 250 260
pF1KE2 LPSPVPPLSPIHSNQQTLPRTQGSSKVHGSSNNS-KGYCPAKSPKDLAVKVHDKETP--Q
:. : .. . ... : .. .:. ..:.... : ..::.. :. .:
CCDS14 YPAEQPQIGEV---EESNPSAKEDSNPNSSGEDAFKEIFQSNSPEESEFAVQAPGSPLVA
200 210 220 230 240 250
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 DSLVAPAQPPS-QTFPPPSLPSKSVAMQQKPTAYVRPMDGQDQAPSESPELKPLPE---D
.::.::.. : :.::: .: :. ::::::::::::::::::. :: ::: : .
CCDS14 SSLLAPSSGLSVQNFPP-GLYCKTSMGQQKPTAYVRPMDGQDQAPDISPTLKPSIEFENS
260 270 280 290 300 310
330 340 350 360 370
pF1KE2 YRQQTFEKTDLKVPAKAKLTKLKMPS----QSVEQTYSNEVHCVEEILKEMTHSWPPPLT
. . .: : : .: .: :.:. :. : . .. ::::::.::::::: :::
CCDS14 FGNLSF-GTLLDGKPSAASSKTKLPKFTILQTSEVSLPSDPSCVEEILREMTHSWPTPLT
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 AIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSSVTQNQKQYDTSSKTHSNSQQGTSSMLEDDLQLSDS
..:: . .: : : .: ..:::.. :: : .... ..: . .:::::::.::..
CCDS14 SMHTAGHSEQSTFSIPGQESQHLTPGFTLQKWNDPTTRASTKSVS-FKSMLEDDLKLSSD
380 390 400 410 420 430
440 450 460 470 480
pF1KE2 ED--------------SDSEQTPEKPPSSSAPPSAPQSLPEPVASAHSSSAE-SESTSDS
:: .. :. :: . : . : . :.: ....:.. : : :.:
CCDS14 EDDLEPVKTLTTQCTATELYQAVEKAKPRNNPVNPPLATPQPPPAVQASGGSGSSSESES
440 450 460 470 480 490
490 500 510 520 530
pF1KE2 DSSSDSESESSSSDSEENEPLETPAPEPEPPTTNKWQLDNWLTKVS---------QPAAP
.: :::..:::..::: :: .. .::::::.:::::::.::.::. : .:
CCDS14 SSESDSDTESSTTDSESNEAPRVATPEPEPPSTNKWQLDKWLNKVTSQNKSFICGQNETP
500 510 520 530 540 550
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 PEGPRSTEPPRRHP-ESKGSSDSATSQEHSESKDPPPKS--SSKA-PRAPPEAPHPGKRS
: : :: .: : . . . .:: .: :. : : :: :: . :. .
CCDS14 ME-TISLPPPIIQPMEVQMKVKTNASQVPAEPKERPLLSLIREKARPRPTQKIPETKALK
560 570 580 590 600 610
600 610 620 630 640
pF1KE2 CQKSPAQQEPPQRQTVGTKQPKKPVKASARAGSRTSLQGEREPGLLPYGSRDQTS---KD
. : ... :: :.: ::::: : .. :. .:.. ... : .:
CCDS14 HKLSTTSETVSQR-TIGKKQPKKVEKNTS-----TDEFTWPKPNITSSTPKEKESVELHD
620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 KPKVKTKGRP-RAAASNEPKPAVPPSSEKKKHKSS---LPAPSKALSGPEPAKDNVEDR-
:. ..:. . : .::.: .: . ::::... .: . . ..:. :.
CCDS14 PPRGRNKATAHKPAPRKEPRPNIPLAPEKKKYRGPGKIVPKSREFIETDSSTSDSNTDQE
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750
pF1KE2 -TPEHFALVPLTESQGPPHSGS---GSR--------TSGCRQAVVVQEDSRKDRLPLPLR
: . .: : : : ... :. .:: . . .... . :.:.
CCDS14 ETLQIKVLPPCIISGGNTAKSKEICGASLTLSTLMSSSGSNNNLSISNE-EPTFSPIPVM
730 740 750 760 770 780
760 770 780 790 800 810
pF1KE2 DTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRIPQPPGKGSRQRKAEDKQPPAGKKHSSEKRSS
.:..:::::: ..: ::: ::::::.: . . : . :. . :... .
CCDS14 QTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDLLSRVPGHSSLHAAPAKPDHKETATKPKRQTAVTAV
790 800 810 820 830 840
820 830 840 850 860
pF1KE2 DSSSKLAKKRKG--EAERDCDNKKIRLEKE----IKSQSSSSSSSHKE-SSKTKPSRPSS
.. . .:... :. . .:: :::. . : . :: ... . : .
CCDS14 EKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEKKQRLEEATTICLLPPCISPAPPHKPPNTRENNSSRRA
850 860 870 880 890 900
870 880 890 900
pF1KE2 QSSKKEMLPPPPVSSSSQKPAK---------P--------------ALKRSRREADTCGQ
. :.: : :::.: . : . : . : .: :. :.
CCDS14 NRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRRRNVSGNNGPFGQDKNIAMTGQITSTKPKRTEGKFCAT
910 920 930 940 950 960
910 920 930 940
pF1KE2 ---------DPPKSASS-----TKSNHKDSSIPKQRRVEGKGSRSSSEHKGSSGDTANPF
: ::.::: :.. ... : . ... .. :..
CCDS14 FKGISVNEGDTPKKASSATITVTNTAIATATVTATAIVTTTVTATATATATTTTTTTTIS
970 980 990 1000 1010 1020
950 960 970 980
pF1KE2 PV----------------------PSLPNGNSKPGKPQVKFDK--QQADLHMREAKKMKQ
. : : ..... .:.. :: ..:: .:.::::.:.
CCDS14 TITSTITTGLMDSSHLEMTSWAALPLLSSSSTNVRRPKLTFDDSVHNADYYMQEAKKLKH
1030 1040 1050 1060 1070 1080
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE2 KAELMTDRVGKAFKYLEAVLSFIECGIATESESQSSKSAYSVYSETVDLIKFIMSLKSFS
::. . .. ::: .: .:.::: ::: : : . .:: :..:::::.:... : ::.:.
CCDS14 KADALFEKFGKAVNYADAALSFTECGNAMERDPLEAKSPYTMYSETVELLRYAMRLKNFA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE2 DATAPTQEKIFAVLCMRCQSILNMAMFRCKKDIAIKYSRTLNKHF-ESSSKVAQAPSPCI
. : .: .::::.:: :.: . ::. ::: :.::::.: ..: ...::::: ::: .
CCDS14 SPLASDGDKKLAVLCYRCLSLLYLRMFKLKKDHAMKYSRSLMEYFKQNASKVAQIPSPWV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE2 ARSTGTPSPLS-PMPSPASSVGSQSSAGSVGSSGVAATISTPVTIQNMTSSYVTITSHVL
. . .::::.: :: ...:. ... .. : :..:..:.:.:::.::
CCDS14 SNGKNTPSPVSLNNVSPINAMGNCNNG----------PVTIPQRIHHMAASHVNITSNVL
1210 1220 1230 1240 1250
1170 1180 1190 1200 1210
pF1KE2 TAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCTLALNSSLVDLVHYTRQGFQQLQELTKTP
... :..:. :::.:::::. :.: . :. .::...::.:.:::. :.
CCDS14 RGYEHWDMADKLTRENKEFFGDLDTLMGPLTQHSSMTNLVRYVRQGLCWLRIDAHLL
1260 1270 1280 1290 1300 1310
>>CCDS78510.1 AFF2 gene_id:2334|Hs109|chrX (1276 aa)
initn: 1446 init1: 389 opt: 772 Z-score: 356.4 bits: 78.1 E(33420): 1.6e-13
Smith-Waterman score: 1548; 29.9% identity (55.4% similar) in 1310 aa overlap (32-1212:35-1270)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 AFTERVNSSGNSLYNDDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYKTAKGDELS
::..:: . : . :::::::: ::: :.
CCDS78 DFFRDWDLEQQCHYEQDRSALKKREWERRNQEVQQEDDLFSSGFDLFGEPYKTNKGDALA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SRIQNMLGNYEEVKEFLSTKSH-THRLDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPSSSFHTSVHH
.:.:: ::::.:.:..:...:. .: . .: . :. : .. : .: .. . :
CCDS78 NRVQNTLGNYDEMKNLLTNHSNQNHLVGIPKNSV--PQNPNNKNEPSFFPEQKNRIIPPH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE2 QSIHTPASGPLSVGNIS-HNPKMAQPRTEPMPSLHAKSCGPPDSQHLTQDRLGQEGFGSS
:. : :.:. .. : . . . : : .: : :... ::
CCDS78 QDNTHP-SAPMPPPSVVILNSTLIHSNRKSKPEWSRDSHNP--STVLASQASGQP-----
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 HHKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSPVPPLSPIHSNQQTLPRTQGSSKVHG
.. ..:.. . .: .. :. : .. . ... : .. .:. ..
CCDS78 -----------NKMQTLTQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEV---EESNPSAKEDSNPNS
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 SSNNS-KGYCPAKSPKDLAVKVHDKETP--QDSLVAPAQPPS-QTFPPPSLPSKSVAMQQ
:.... : ..::.. :. .: .::.::.. : :.::: .: :. ::
CCDS78 SGEDAFKEIFQSNSPEESEFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGLSVQNFPP-GLYCKTSMGQQ
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340
pF1KE2 KPTAYVRPMDGQDQAPSESPELKPLPE---DYRQQTFEKTDLKVPAKAKLTKLKMPS---
::::::::::::::::. :: ::: : .. . .: : : .: .: :.:.
CCDS78 KPTAYVRPMDGQDQAPDISPTLKPSIEFENSFGNLSF-GTLLDGKPSAASSKTKLPKFTI
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 -QSVEQTYSNEVHCVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSSVTQN
:. : . .. ::::::.: :::..
CCDS78 LQTSEVSLPSDPSCVEEILRE-----------------------------SQHLTPGFTL
340 350 360
410 420 430 440 450
pF1KE2 QKQYDTSSKTHSNSQQGTSSMLEDDLQLSDSED--------------SDSEQTPEKPPSS
:: : .... ..: . .:::::::.::..:: .. :. ::
CCDS78 QKWNDPTTRASTKSVS-FKSMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELYQAVEKAKPR
370 380 390 400 410 420
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 SAPPSAPQSLPEPVASAHSSSAE-SESTSDSDSSSDSESESSSSDSEENEPLETPAPEPE
. : . : . :.: ....:.. : : :.:.: :::..:::..::: :: .. .::::
CCDS78 NNPVNPPLATPQPPPAVQASGGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAPRVATPEPE
430 440 450 460 470 480
520 530 540 550 560
pF1KE2 PPTTNKWQLDNWLTKVS---------QPAAPPEGPRSTEPPRRHP-ESKGSSDSATSQEH
::.:::::::.::.::. : .: : : :: .: : . . . .::
CCDS78 PPSTNKWQLDKWLNKVTSQNKSFICGQNETPME-TISLPPPIIQPMEVQMKVKTNASQVP
490 500 510 520 530 540
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 SESKDPPPKS--SSKA-PRAPPEAPHPGKRSCQKSPAQQEPPQRQTVGTKQPKKPVKASA
.: :. : : :: :: . :. . . : ... :: :.: ::::: : ..
CCDS78 AEPKERPLLSLIREKARPRPTQKIPETKALKHKLSTTSETVSQR-TIGKKQPKKVEKNTS
550 560 570 580 590 600
630 640 650 660 670
pF1KE2 RAGSRTSLQGEREPGLLPYGSRDQTS---KDKPKVKTKGRP-RAAASNEPKPAVPPSSEK
:. .:.. ... : .: :. ..:. . : .::.: .: . ::
CCDS78 -----TDEFTWPKPNITSSTPKEKESVELHDPPRGRNKATAHKPAPRKEPRPNIPLAPEK
610 620 630 640 650 660
680 690 700 710 720
pF1KE2 KKHKSS---LPAPSKALSGPEPAKDNVEDR--TPEHFALVPLTESQGPPHSGS---GSR-
::... .: . . ..:. :. : . .: : : : ... :.
CCDS78 KKYRGPGKIVPKSREFIETDSSTSDSNTDQEETLQIKVLPPCIISGGNTAKSKEICGASL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 -------TSGCRQAVVVQEDSRKDRLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRI
.:: . . .... . :.:. .:..:::::: ..: ::: ::::::.
CCDS78 TLSTLMSSSGSNNNLSISNE-EPTFSPIPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDLLSRV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KE2 PQPPGKGSRQRKAEDKQPPAGKKHSSEKRSSDSSSKLAKKRKG--EAERDCDNKKIRLEK
: . . : . :. . :... . .. . .:... :. . .:: :::.
CCDS78 PGHSSLHAAPAKPDHKETATKPKRQTAVTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEKKQRLEE
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880
pF1KE2 E----IKSQSSSSSSSHKE-SSKTKPSRPSSQSSKKEMLPPPPVSSSSQKPAK-------
. : . :: ... . : .. :.: : :::.: . : .
CCDS78 ATTICLLPPCISPAPPHKPPNTRENNSSRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRRRNVSGN
850 860 870 880 890 900
890 900 910
pF1KE2 --P--------------ALKRSRREADTCGQ-------DPPKSASS-----TKSNHKDSS
: . : .: :. :. : ::.::: :.. ..
CCDS78 NGPFGQDKNIAMTGQITSTKPKRTEGKFCATFKGISEGDTPKKASSATITVTNTAIATAT
910 920 930 940 950 960
920 930 940 950
pF1KE2 IPKQRRVEGKGSRSSSEHKGSSGDTANPFPV----------------------PSLPNGN
. : . ... .. :.. . : : ...
CCDS78 VTATAIVTTTVTATATATATTTTTTTTISTITSTITTGLMDSSHLEMTSWAALPLLSSSS
970 980 990 1000 1010 1020
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE2 SKPGKPQVKFDK--QQADLHMREAKKMKQKAELMTDRVGKAFKYLEAVLSFIECGIATES
.. .:.. :: ..:: .:.::::.:.::. . .. ::: .: .:.::: ::: : :
CCDS78 TNVRRPKLTFDDSVHNADYYMQEAKKLKHKADALFEKFGKAVNYADAALSFTECGNAMER
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE2 ESQSSKSAYSVYSETVDLIKFIMSLKSFSDATAPTQEKIFAVLCMRCQSILNMAMFRCKK
. .:: :..:::::.:... : ::.:.. : .: .::::.:: :.: . ::. ::
CCDS78 DPLEAKSPYTMYSETVELLRYAMRLKNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLSLLYLRMFKLKK
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE2 DIAIKYSRTLNKHF-ESSSKVAQAPSPCIARSTGTPSPLS-PMPSPASSVGSQSSAGSVG
: :.::::.: ..: ...::::: ::: .. . .::::.: :: ...:. ...
CCDS78 DHAMKYSRSLMEYFKQNASKVAQIPSPWVSNGKNTPSPVSLNNVSPINAMGNCNNG----
1150 1160 1170 1180 1190
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE2 SSGVAATISTPVTIQNMTSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCTLA
.. : :..:..:.:.:::.:: ... :..:. :::.:::::. :.: . :.
CCDS78 ------PVTIPQRIHHMAASHVNITSNVLRGYEHWDMADKLTRENKEFFGDLDTLMGPLT
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1200 1210
pF1KE2 LNSSLVDLVHYTRQGFQQLQELTKTP
.::...::.:.:::. :.
CCDS78 QHSSMTNLVRYVRQGLCWLRIDAHLL
1260 1270
>>CCDS55521.1 AFF2 gene_id:2334|Hs109|chrX (952 aa)
initn: 1016 init1: 389 opt: 761 Z-score: 353.6 bits: 77.2 E(33420): 2.3e-13
Smith-Waterman score: 1179; 29.8% identity (56.0% similar) in 959 aa overlap (372-1212:7-946)
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 LTKLKMPSQSVEQTYSNEVHCVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQH
:. : . ... ..:: ..:::
CCDS55 MKFKRRHQAFPSFFKMKVSLPSDPSCVEEILRESQH
10 20 30
410 420 430 440
pF1KE2 VSSVTQNQKQYDTSSKTHSNSQQGTSSMLEDDLQLSDSED--------------SDSEQT
.. :: : .... ..: . .:::::::.::..:: .. :.
CCDS55 LTPGFTLQKWNDPTTRASTKSVS-FKSMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELYQA
40 50 60 70 80 90
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 PEKPPSSSAPPSAPQSLPEPVASAHSSSAE-SESTSDSDSSSDSESESSSSDSEENEPLE
:: . : . : . :.: ....:.. : : :.:.: :::..:::..::: :: .
CCDS55 VEKAKPRNNPVNPPLATPQPPPAVQASGGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAPR
100 110 120 130 140 150
510 520 530 540 550
pF1KE2 TPAPEPEPPTTNKWQLDNWLTKVS---------QPAAPPEGPRSTEPPRRHP-ESKGSSD
. .::::::.:::::::.::.::. : .: : : :: .: : . .
CCDS55 VATPEPEPPSTNKWQLDKWLNKVTSQNKSFICGQNETPMETI-SLPPPIIQPMEVQMKVK
160 170 180 190 200 210
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 SATSQEHSESKDPPPKS--SSKA-PRAPPEAPHPGKRSCQKSPAQQEPPQRQTVGTKQPK
. .:: .: :. : : :: :: . :. . . : ... :: :.: ::::
CCDS55 TNASQVPAEPKERPLLSLIREKARPRPTQKIPETKALKHKLSTTSETVSQR-TIGKKQPK
220 230 240 250 260 270
620 630 640 650 660
pF1KE2 KPVKASARAGSRTSLQGEREPGLLPYGSRDQTS---KDKPKVKTKGRP-RAAASNEPKPA
: : .. :. .:.. ... : .: :. ..:. . : .::.:
CCDS55 KVEKNTS-----TDEFTWPKPNITSSTPKEKESVELHDPPRGRNKATAHKPAPRKEPRPN
280 290 300 310 320
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 VPPSSEKKKHKSS---LPAPSKALSGPEPAKDNVEDR--TPEHFALVPLTESQGPPHSGS
.: . ::::... .: . . ..:. :. : . .: : : : ...
CCDS55 IPLAPEKKKYRGPGKIVPKSREFIETDSSTSDSNTDQEETLQIKVLPPCIISGGNTAKSK
330 340 350 360 370 380
730 740 750 760 770
pF1KE2 ---GSR--------TSGCRQAVVVQEDSRKDRLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKIT
:. .:: . . .... . :.:. .:..:::::: ..: :::
CCDS55 EICGASLTLSTLMSSSGSNNNLSISNE-EPTFSPIPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKID
390 400 410 420 430 440
780 790 800 810 820 830
pF1KE2 LDLLSRIPQPPGKGSRQRKAEDKQPPAGKKHSSEKRSSDSSSKLAKKRKG--EAERDCDN
::::::.: . . : . :. . :... . .. . .:... :. . .
CCDS55 LDLLSRVPGHSSLHAAPAKPDHKETATKPKRQTAVTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPE
450 460 470 480 490 500
840 850 860 870 880
pF1KE2 KKIRLEKE----IKSQSSSSSSSHKE-SSKTKPSRPSSQSSKKEMLPPPPVSSSSQKPAK
:: :::. . : . :: ... . : .. :.: : :::.: . : .
CCDS55 KKQRLEEATTICLLPPCISPAPPHKPPNTRENNSSRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPR
510 520 530 540 550 560
890 900
pF1KE2 ---------P--------------ALKRSRREADTCGQ---------DPPKSASS-----
: . : .: :. :. : ::.:::
CCDS55 RRNVSGNNGPFGQDKNIAMTGQITSTKPKRTEGKFCATFKGISVNEGDTPKKASSATITV
570 580 590 600 610 620
910 920 930 940
pF1KE2 TKSNHKDSSIPKQRRVEGKGSRSSSEHKGSSGDTANPFPV--------------------
:.. ... : . ... .. :.. .
CCDS55 TNTAIATATVTATAIVTTTVTATATATATTTTTTTTISTITSTITTGLMDSSHLEMTSWA
630 640 650 660 670 680
950 960 970 980 990 1000
pF1KE2 --PSLPNGNSKPGKPQVKFDK--QQADLHMREAKKMKQKAELMTDRVGKAFKYLEAVLSF
: : ..... .:.. :: ..:: .:.::::.:.::. . .. ::: .: .:.:::
CCDS55 ALPLLSSSSTNVRRPKLTFDDSVHNADYYMQEAKKLKHKADALFEKFGKAVNYADAALSF
690 700 710 720 730 740
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE2 IECGIATESESQSSKSAYSVYSETVDLIKFIMSLKSFSDATAPTQEKIFAVLCMRCQSIL
::: : : . .:: :..:::::.:... : ::.:.. : .: .::::.:: :.:
CCDS55 TECGNAMERDPLEAKSPYTMYSETVELLRYAMRLKNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLSLL
750 760 770 780 790 800
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KE2 NMAMFRCKKDIAIKYSRTLNKHF-ESSSKVAQAPSPCIARSTGTPSPLS-PMPSPASSVG
. ::. ::: :.::::.: ..: ...::::: ::: .. . .::::.: :: ...:
CCDS55 YLRMFKLKKDHAMKYSRSLMEYFKQNASKVAQIPSPWVSNGKNTPSPVSLNNVSPINAMG
810 820 830 840 850 860
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KE2 SQSSAGSVGSSGVAATISTPVTIQNMTSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNKEFFAR
. ... .. : :..:..:.:.:::.:: ... :..:. :::.:::::.
CCDS55 NCNNG----------PVTIPQRIHHMAASHVNITSNVLRGYEHWDMADKLTRENKEFFGD
870 880 890 900 910
1190 1200 1210
pF1KE2 LSTNVCTLALNSSLVDLVHYTRQGFQQLQELTKTP
:.: . :. .::...::.:.:::. :.
CCDS55 LDTLMGPLTQHSSMTNLVRYVRQGLCWLRIDAHLL
920 930 940 950
>>CCDS76040.1 AFF2 gene_id:2334|Hs109|chrX (1276 aa)
initn: 1454 init1: 389 opt: 751 Z-score: 347.2 bits: 76.4 E(33420): 5.2e-13
Smith-Waterman score: 1515; 29.9% identity (55.9% similar) in 1302 aa overlap (32-1212:35-1270)
10 20 30 40 50
pF1KE2 AFTERVNSSGNSLYNDDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYKTA----KG
::..:: . : . :::::::.: ::
CCDS76 DFFRDWDLEQQCHYEQDRSALKKREWERRNQEVQQEDDLFSSGFDLFGEPYKVAEYTNKG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 DELSSRIQNMLGNYEEVKEFLSTKSH-THRLDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPSSSFHT
: :..:.:: ::::.:.:..:...:. .: . .: . :. : .. : .: .. .
CCDS76 DALANRVQNTLGNYDEMKNLLTNHSNQNHLVGIPKNSV--PQNPNNKNEPSFFPEQKNRI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 SVHHQSIHTPASGPLSVGNIS-HNPKMAQPRTEPMPSLHAKSCGPPDSQHLTQDRLGQEG
::. : :.:. .. : . . . : : .: : :... ::
CCDS76 IPPHQDNTHP-SAPMPPPSVVILNSTLIHSNRKSKPEWSRDSHNP--STVLASQASGQP-
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 FGSSHHKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSPVPPLSPIHSNQQTLPRTQGSS
.. ..:.. . .: .. :. : .. . ... : .. .:
CCDS76 ---------------NKMQTLTQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEV---EESNPSAKEDS
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 KVHGSSNNS-KGYCPAKSPKDLAVKVHDKETP--QDSLVAPAQPPS-QTFPPPSLPSKSV
. ..:.... : ..::.. :. .: .::.::.. : :.::: .: :.
CCDS76 NPNSSGEDAFKEIFQSNSPEESEFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGLSVQNFPP-GLYCKTS
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340
pF1KE2 AMQQKPTAYVRPMDGQDQAPSESPELKPLPE---DYRQQTFEKTDLKVPAKAKLTKLKMP
::::::::::::::::::. :: ::: : .. . .: : : .: .: :.:
CCDS76 MGQQKPTAYVRPMDGQDQAPDISPTLKPSIEFENSFGNLSF-GTLLDGKPSAASSKTKLP
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 S----QSVEQTYSNEVHCVEEILKEMTHSWPP-PLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVS
. :. : . .. ::::::.: : : : . :.: .:. .:. ..:
CCDS76 KFTILQTSEVSLPSDPSCVEEILRESQHLTPGFTLQKWNDPTTRASTKM---LEDDLKLS
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 SVTQNQKQYDTSSKTHSNSQQGTSSMLEDDLQLSDSEDSDSEQTPEKPPSSSAPPSAPQS
: . : ... . : :.. : . . : . ...: .:: .. ::
CCDS76 S------DEDDLEPVKTLTTQCTATELYQAV-----EKAKPRNNPVNPPLAT-----PQ-
400 410 420 430
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 LPEPVASAHSSSAESESTSDSDSSSDSESESSSSDSEENEPLETPAPEPEPPTTNKWQLD
: :...: ..:. : : :.:.: :::..:::..::: :: .. .::::::.:::::::
CCDS76 -PPPAVQASGGSGSS-SESESSSESDSDTESSTTDSESNEAPRVATPEPEPPSTNKWQLD
440 450 460 470 480 490
530 540 550 560 570
pF1KE2 NWLTKVS---------QPAAPPEGPRSTEPPRRHP-ESKGSSDSATSQEHSESKDPPPKS
.::.::. : .: : : :: .: : . . . .:: .: :. : :
CCDS76 KWLNKVTSQNKSFICGQNETPME-TISLPPPIIQPMEVQMKVKTNASQVPAEPKERPLLS
500 510 520 530 540 550
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 --SSKA-PRAPPEAPHPGKRSCQKSPAQQEPPQRQTVGTKQPKKPVKASARAGSRTSLQG
:: :: . :. . . : ... :: :.: ::::: : .. :.
CCDS76 LIREKARPRPTQKIPETKALKHKLSTTSETVSQR-TIGKKQPKKVEKNTS-----TDEFT
560 570 580 590 600
640 650 660 670 680
pF1KE2 EREPGLLPYGSRDQTS---KDKPKVKTKGRP-RAAASNEPKPAVPPSSEKKKHKSS---L
.:.. ... : .: :. ..:. . : .::.: .: . ::::... .
CCDS76 WPKPNITSSTPKEKESVELHDPPRGRNKATAHKPAPRKEPRPNIPLAPEKKKYRGPGKIV
610 620 630 640 650 660
690 700 710 720 730
pF1KE2 PAPSKALSGPEPAKDNVEDR--TPEHFALVPLTESQGPPHSGS---GSR--------TSG
: . . ..:. :. : . .: : : : ... :. .::
CCDS76 PKSREFIETDSSTSDSNTDQEETLQIKVLPPCIISGGNTAKSKEICGASLTLSTLMSSSG
670 680 690 700 710 720
740 750 760 770 780 790
pF1KE2 CRQAVVVQEDSRKDRLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRIPQPPGKGSRQ
. . .... . :.:. .:..:::::: ..: ::: ::::::.: . .
CCDS76 SNNNLSISNE-EPTFSPIPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDLLSRVPGHSSLHAAP
730 740 750 760 770 780
800 810 820 830 840
pF1KE2 RKAEDKQPPAGKKHSSEKRSSDSSSKLAKKRKG--EAERDCDNKKIRLEKE----IKSQS
: . :. . :... . .. . .:... :. . .:: :::. .
CCDS76 AKPDHKETATKPKRQTAVTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEKKQRLEEATTICLLPPC
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880
pF1KE2 SSSSSSHKE-SSKTKPSRPSSQSSKKEMLPPPPVSSSSQKPAK---------P-------
: . :: ... . : .. :.: : :::.: . : . :
CCDS76 ISPAPPHKPPNTRENNSSRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRRRNVSGNNGPFGQDKNI
850 860 870 880 890 900
890 900 910 920
pF1KE2 -------ALKRSRREADTCGQ---------DPPKSASS-----TKSNHKDSSIPKQRRVE
. : .: :. :. : ::.::: :.. ... :
CCDS76 AMTGQITSTKPKRTEGKFCATFKGISVNEGDTPKKASSATITVTNTAIATATVTATAIVT
910 920 930 940 950 960
930 940 950 960
pF1KE2 GKGSRSSSEHKGSSGDTANPFPV----------------------PSLPNGNSKPGKPQV
. ... .. :.. . : : ..... .:..
CCDS76 TTVTATATATATTTTTTTTISTITSTITTGLMDSSHLEMTSWAALPLLSSSSTNVRRPKL
970 980 990 1000 1010 1020
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 KFDK--QQADLHMREAKKMKQKAELMTDRVGKAFKYLEAVLSFIECGIATESESQSSKSA
:: ..:: .:.::::.:.::. . .. ::: .: .:.::: ::: : : . .::
CCDS76 TFDDSVHNADYYMQEAKKLKHKADALFEKFGKAVNYADAALSFTECGNAMERDPLEAKSP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 YSVYSETVDLIKFIMSLKSFSDATAPTQEKIFAVLCMRCQSILNMAMFRCKKDIAIKYSR
:..:::::.:... : ::.:.. : .: .::::.:: :.: . ::. ::: :.::::
CCDS76 YTMYSETVELLRYAMRLKNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLSLLYLRMFKLKKDHAMKYSR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 TLNKHF-ESSSKVAQAPSPCIARSTGTPSPLS-PMPSPASSVGSQSSAGSVGSSGVAATI
.: ..: ...::::: ::: .. . .::::.: :: ...:. ... .
CCDS76 SLMEYFKQNASKVAQIPSPWVSNGKNTPSPVSLNNVSPINAMGNCNNG----------PV
1150 1160 1170 1180 1190
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 STPVTIQNMTSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCTLALNSSLVDL
. : :..:..:.:.:::.:: ... :..:. :::.:::::. :.: . :. .::...:
CCDS76 TIPQRIHHMAASHVNITSNVLRGYEHWDMADKLTRENKEFFGDLDTLMGPLTQHSSMTNL
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1210
pF1KE2 VHYTRQGFQQLQELTKTP
:.:.:::. :.
CCDS76 VRYVRQGLCWLRIDAHLL
1260 1270
1218 residues in 1 query sequences
18921897 residues in 33420 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Jul 3 20:43:51 2020 done: Fri Jul 3 20:43:52 2020
Total Scan time: 3.150 Total Display time: 0.320
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]