Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2754
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2754, 281 aa
1>>>pF1KE2754 281 - 281 aa - 281 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0278+/-0.00092; mu= 15.9949+/- 0.055
mean_var=58.9853+/-12.503, 0's: 0 Z-trim(103.7): 19 B-trim: 456 in 1/50
Lambda= 0.166995
statistics sampled from 7644 (7658) to 7644 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.601), E-opt: 0.2 (0.229), width: 16
Scan time: 0.940
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS34164.1 ELOVL7 gene_id:79993|Hs109|chr5 ( 281) 1956 479.8 9.8e-136
CCDS78013.1 ELOVL7 gene_id:79993|Hs109|chr5 ( 268) 1806 443.6 7.1e-125
CCDS485.1 ELOVL1 gene_id:64834|Hs109|chr1 ( 279) 1194 296.2 1.8e-80
CCDS57987.1 ELOVL1 gene_id:64834|Hs109|chr1 ( 252) 822 206.6 1.6e-53
CCDS4992.1 ELOVL4 gene_id:6785|Hs109|chr6 ( 314) 822 206.6 1.9e-53
CCDS4518.1 ELOVL2 gene_id:54898|Hs109|chr6 ( 296) 697 176.5 2.1e-44
CCDS4951.1 ELOVL5 gene_id:60481|Hs109|chr6 ( 299) 620 157.9 8.1e-39
CCDS56433.1 ELOVL5 gene_id:60481|Hs109|chr6 ( 326) 465 120.6 1.5e-27
CCDS75470.1 ELOVL5 gene_id:60481|Hs109|chr6 ( 262) 398 104.4 9.1e-23
CCDS3690.1 ELOVL6 gene_id:79071|Hs109|chr4 ( 265) 318 85.1 5.8e-17
CCDS7531.1 ELOVL3 gene_id:83401|Hs109|chr10 ( 270) 294 79.4 3.3e-15
>>CCDS34164.1 ELOVL7 gene_id:79993|Hs109|chr5 (281 aa)
initn: 1956 init1: 1956 opt: 1956 Z-score: 2550.6 bits: 479.8 E(33420): 9.8e-136
Smith-Waterman score: 1956; 100.0% identity (100.0% similar) in 281 aa overlap (1-281:1-281)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAFSDLTSRTVHLYDNWIKDADPRVEDWLLMSSPLPQTILLGFYVYFVTSLGPKLMENRK
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CCDS34 MAFSDLTSRTVHLYDNWIKDADPRVEDWLLMSSPLPQTILLGFYVYFVTSLGPKLMENRK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 PFELKKAMITYNFFIVLFSVYMCYEFVMSGWGIGYSFRCDIVDYSRSPTALRMARTCWLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PFELKKAMITYNFFIVLFSVYMCYEFVMSGWGIGYSFRCDIVDYSRSPTALRMARTCWLY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 YFSKFIELLDTIFFVLRKKNSQVTFLHVFHHTIMPWTWWFGVKFAAGGLGTFHALLNTAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YFSKFIELLDTIFFVLRKKNSQVTFLHVFHHTIMPWTWWFGVKFAAGGLGTFHALLNTAV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 HVVMYSYYGLSALGPAYQKYLWWKKYLTSLQLVQFVIVAIHISQFFFMEDCKYQFPVFAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HVVMYSYYGLSALGPAYQKYLWWKKYLTSLQLVQFVIVAIHISQFFFMEDCKYQFPVFAC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280
pF1KE2 IIMSYSFMFLLLFLHFWYRAYTKGQRLPKTVKNGTCKNKDN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IIMSYSFMFLLLFLHFWYRAYTKGQRLPKTVKNGTCKNKDN
250 260 270 280
>>CCDS78013.1 ELOVL7 gene_id:79993|Hs109|chr5 (268 aa)
initn: 1806 init1: 1806 opt: 1806 Z-score: 2355.6 bits: 443.6 E(33420): 7.1e-125
Smith-Waterman score: 1806; 100.0% identity (100.0% similar) in 259 aa overlap (23-281:10-268)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAFSDLTSRTVHLYDNWIKDADPRVEDWLLMSSPLPQTILLGFYVYFVTSLGPKLMENRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MEKPINILYPRVEDWLLMSSPLPQTILLGFYVYFVTSLGPKLMENRK
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 PFELKKAMITYNFFIVLFSVYMCYEFVMSGWGIGYSFRCDIVDYSRSPTALRMARTCWLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 PFELKKAMITYNFFIVLFSVYMCYEFVMSGWGIGYSFRCDIVDYSRSPTALRMARTCWLY
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 YFSKFIELLDTIFFVLRKKNSQVTFLHVFHHTIMPWTWWFGVKFAAGGLGTFHALLNTAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 YFSKFIELLDTIFFVLRKKNSQVTFLHVFHHTIMPWTWWFGVKFAAGGLGTFHALLNTAV
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 HVVMYSYYGLSALGPAYQKYLWWKKYLTSLQLVQFVIVAIHISQFFFMEDCKYQFPVFAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 HVVMYSYYGLSALGPAYQKYLWWKKYLTSLQLVQFVIVAIHISQFFFMEDCKYQFPVFAC
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280
pF1KE2 IIMSYSFMFLLLFLHFWYRAYTKGQRLPKTVKNGTCKNKDN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 IIMSYSFMFLLLFLHFWYRAYTKGQRLPKTVKNGTCKNKDN
230 240 250 260
>>CCDS485.1 ELOVL1 gene_id:64834|Hs109|chr1 (279 aa)
initn: 1231 init1: 1185 opt: 1194 Z-score: 1558.4 bits: 296.2 E(33420): 1.8e-80
Smith-Waterman score: 1194; 59.2% identity (86.8% similar) in 265 aa overlap (11-274:5-269)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAFSDLTSRTVHLYDNWIKDADPRVEDWLLMSSPLPQTILLGFYVYFVTSLGPKLMENRK
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CCDS48 MEAVVNLYQEVMKHADPRIQGYPLMGSPLLMTSILLTYVYFVLSLGPRIMANRK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 PFELKKAMITYNFFIVLFSVYMCYEFVMSGWGIGYSFRCDIVDYSRSPTALRMARTCWLY
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CCDS48 PFQLRGFMIVYNFSLVALSLYIVYEFLMSGWLSTYTWRCDPVDYSNSPEALRMVRVAWLF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 YFSKFIELLDTIFFVLRKKNSQVTFLHVFHHTIMPWTWWFGVKFAAGGLGTFHALLNTAV
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CCDS48 LFSKFIELMDTVIFILRKKDGQVTFLHVFHHSVLPWSWWWGVKIAPGGMGSFHAMINSSV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 HVVMYSYYGLSALGPAYQKYLWWKKYLTSLQLVQFVIVAIHISQFFFMEDCKYQFPVFAC
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CCDS48 HVIMYLYYGLSAFGPVAQPYLWWKKHMTAIQLIQFVLVSLHISQYYFMSSCNYQYPVIIH
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280
pF1KE2 IIMSYSFMFLLLFLHFWYRAYTKGQRLPKTVK-NGTCKNKDN
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CCDS48 LIWMYGTIFFMLFSNFWYHSYTKGKRLPRALQQNGAPGIAKVKAN
240 250 260 270
>>CCDS57987.1 ELOVL1 gene_id:64834|Hs109|chr1 (252 aa)
initn: 1074 init1: 782 opt: 822 Z-score: 1074.8 bits: 206.6 E(33420): 1.6e-53
Smith-Waterman score: 1003; 52.5% identity (78.9% similar) in 265 aa overlap (11-274:5-242)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAFSDLTSRTVHLYDNWIKDADPRVEDWLLMSSPLPQTILLGFYVYFVTSLGPKLMENRK
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CCDS57 MEAVVNLYQEVMKHADPRIQGYPLMGSPLLMTSILLTYVYFVLSLGPRIMANRK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 PFELKKAMITYNFFIVLFSVYMCYEFVMSGWGIGYSFRCDIVDYSRSPTALRMARTCWLY
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CCDS57 PFQLRGFMIVYNFSLVALSLYIVYE---------------------------MVRVAWLF
60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 YFSKFIELLDTIFFVLRKKNSQVTFLHVFHHTIMPWTWWFGVKFAAGGLGTFHALLNTAV
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CCDS57 LFSKFIELMDTVIFILRKKDGQVTFLHVFHHSVLPWSWWWGVKIAPGGMGSFHAMINSSV
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 HVVMYSYYGLSALGPAYQKYLWWKKYLTSLQLVQFVIVAIHISQFFFMEDCKYQFPVFAC
::.:: ::::::.::. : ::::::..:..::.:::.:..::::..:: .:.::.::.
CCDS57 HVIMYLYYGLSAFGPVAQPYLWWKKHMTAIQLIQFVLVSLHISQYYFMSSCNYQYPVIIH
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280
pF1KE2 IIMSYSFMFLLLFLHFWYRAYTKGQRLPKTVK-NGTCKNKDN
.: :. .:..:: .:::..::::.:::.... ::
CCDS57 LIWMYGTIFFMLFSNFWYHSYTKGKRLPRALQQNGAPGIAKVKAN
210 220 230 240 250
>>CCDS4992.1 ELOVL4 gene_id:6785|Hs109|chr6 (314 aa)
initn: 833 init1: 710 opt: 822 Z-score: 1073.3 bits: 206.6 E(33420): 1.9e-53
Smith-Waterman score: 822; 45.8% identity (71.4% similar) in 273 aa overlap (10-278:22-289)
10 20 30 40
pF1KE2 MAFSDLTSRTVHLYDNWIKD-ADPRVEDWLLMSSPLPQTILLGFYVYF
::..: : . :: :::.: ::.:: : . .:. :
CCDS49 MGLLDSEPGSVLNVVSTALNDTVEFY-RWTWSIADKRVENWPLMQSPWPTLSISTLYLLF
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 VTSLGPKLMENRKPFELKKAMITYNFFIVLFSVYMCYEFVMSGWGIGYSFRCDIVDYSRS
: :::: :..:.::... ..: ::: .::..... :. :.... :::. :. :::: .
CCDS49 VW-LGPKWMKDREPFQMRLVLIIYNFGMVLLNLFIFRELFMGSYNAGYSYICQSVDYSNN
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 PTALRMARTCWLYYFSKFIELLDTIFFVLRKKNSQVTFLHVFHHTIMPWTWWFGVKFAAG
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CCDS49 VHEVRIAAALWWYFVSKGVEYLDTVFFILRKKNNQVSFLHVYHHCTMFTLWWIGIKWVAG
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 GLGTFHALLNTAVHVVMYSYYGLSALGPAYQKYLWWKKYLTSLQLVQFVIVAIHISQFFF
: . : : ::. .::.:::::::.:.:: :::::::.::: :::.:: .. : . ..
CCDS49 GQAFFGAQLNSFIHVIMYSYYGLTAFGPWIQKYLWWKRYLTMLQLIQFHVTIGHTALSLY
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 MEDCKYQFPVFAC-IIMSYSFMFLLLFLHFWYRAYT--KGQRLPKTVKNGTCKNKDN
:: :: . ...:.. :..:::.:. :.: : . ::. :: :
CCDS49 T-DC--PFPKWMHWALIAYAISFIFLFLNFYIRTYKEPKKPKAGKTAMNGISANGVSKSE
240 250 260 270 280 290
CCDS49 KQLMIENGKKQKNGKAKGD
300 310
>>CCDS4518.1 ELOVL2 gene_id:54898|Hs109|chr6 (296 aa)
initn: 666 init1: 335 opt: 697 Z-score: 910.9 bits: 176.5 E(33420): 2.1e-44
Smith-Waterman score: 697; 43.4% identity (68.2% similar) in 274 aa overlap (15-277:16-281)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MAFSDLTSRTVHLYDNWIKDADPRVEDWLLMSSPLPQTILLGFYVYFVTSLGPKLMENR
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CCDS45 MEHLKAFDDEINAFLDNMFGPRDSRVRGWFMLDSYLPTFFLTVMYLLSIW-LGNKYMKNR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 KPFELKKAMITYNFFIVLFSVYMCYEFVMSGWGIGYSFRCDIVDYSRSPTA-LRMARTCW
. :. . ::. :.:.:.:: :...: : ::...:. : . . : .:.:.. :
CCDS45 PALSLRGILTLYNLGITLLSAYMLAELILSTWEGGYNLQCQ--DLTSAGEADIRVAKVLW
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 LYYFSKFIELLDTIFFVLRKKNSQVTFLHVFHHTIMPWTWWFGVKFAAGGLGTFHALLNT
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CCDS45 WYYFSKSVEFLDTIFFVLRKKTSQITFLHVYHHASMFNIWWCVLNWIPCGQSFFGPTLNS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 AVHVVMYSYYGLSALGPAYQKYLWWKKYLTSLQLVQFVIVAIHISQFFFMEDCKYQFPVF
.:..::::::::.. :...::::::::::. ::::::.. : .. .. : :: :
CCDS45 FIHILMYSYYGLSVF-PSMHKYLWWKKYLTQAQLVQFVLTITH-TMSAVVKPC--GFP-F
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE2 ACIIMSYSFMFLL--LFLHFWYRAYTKG------QRLP--KTVKNGTCKNKDN
.:.:.. :.:. : :::.:. ..: : :. : : :::: :
CCDS45 GCLIFQSSYMLTLVILFLNFYVQTYRKKPMKKDMQEPPAGKEVKNGFSKAYFTAANGVMN
240 250 260 270 280 290
CCDS45 KKAQ
>>CCDS4951.1 ELOVL5 gene_id:60481|Hs109|chr6 (299 aa)
initn: 512 init1: 294 opt: 620 Z-score: 810.6 bits: 157.9 E(33420): 8.1e-39
Smith-Waterman score: 620; 39.5% identity (71.2% similar) in 243 aa overlap (22-263:20-256)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAFSDLTSRTVHLYDNWIKDADPRVEDWLLMSSPLPQTILLGFYVYFVTSLGPKLMENRK
: ::. :.:... .: : .:. ... :::: :.:..
CCDS49 MEHFDASLSTYFKALLGPRDTRVKGWFLLDNYIPTFICSVIYL-LIVWLGPKYMRNKQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 PFELKKAMITYNFFIVLFSVYMCYEFVMSGWGIGYSFRCDIVDYSRSPTALRMARTCWLY
:: . ...::. ..:.:.:: :.: . : :.: :. . . . . ... :. : :
CCDS49 PFSCRGILVVYNLGLTLLSLYMFCELVTGVWEGKYNFFCQGT-RTAGESDMKIIRVLWWY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 YFSKFIELLDTIFFVLRKKNSQVTFLHVFHHTIMPWTWWFGVKFAAGGLGTFHALLNTAV
::::.::..::.::.:::.: :.: :::.::. : ::: .... : . : : ::. .
CCDS49 YFSKLIEFMDTFFFILRKNNHQITVLHVYHHASMLNIWWFVMNWVPCGHSYFGATLNSFI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE2 HVVMYSYYGLSALGPAYQKYLWWKKYLTSLQLVQFVIVAIHISQFFFMEDCKYQFPV-FA
::.::::::::.. :... :::::::.:. ::.:::.. :. : . : ::. .
CCDS49 HVLMYSYYGLSSV-PSMRPYLWWKKYITQGQLLQFVLTIIQTS-CGVIWPCT--FPLGWL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE2 CIIMSYSFMFLLLFLHFWYRAYTKGQRLPKTVKNGTCKNKDN
. ..: . .. :: .:. ..:.:
CCDS49 YFQIGYMISLIALFTNFYIQTYNKKGASRRKDHLKDHQNGSMAAVNGHTNSFSPLENNVK
240 250 260 270 280 290
>>CCDS56433.1 ELOVL5 gene_id:60481|Hs109|chr6 (326 aa)
initn: 512 init1: 294 opt: 465 Z-score: 608.2 bits: 120.6 E(33420): 1.5e-27
Smith-Waterman score: 556; 35.6% identity (64.1% similar) in 270 aa overlap (22-263:20-283)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAFSDLTSRTVHLYDNWIKDADPRVEDWLLMSSPLPQTILLGFYVYFVTSLGPKLMENRK
: ::. :.:... .: : .:. ... :::: :.:..
CCDS56 MEHFDASLSTYFKALLGPRDTRVKGWFLLDNYIPTFICSVIYL-LIVWLGPKYMRNKQ
10 20 30 40 50
70 80 90
pF1KE2 PFELKKAMITYNFFIVLFSVYMCYE---------------------------FVMSGWGI
:: . ...::. ..:.:.:: : .: . :
CCDS56 PFSCRGILVVYNLGLTLLSLYMFCESKREQPRRSACASRTDPSTQQQLPENRLVTGVWEG
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 GYSFRCDIVDYSRSPTALRMARTCWLYYFSKFIELLDTIFFVLRKKNSQVTFLHVFHHTI
:.: :. . . . . ... :. : :::::.::..::.::.:::.: :.: :::.::.
CCDS56 KYNFFCQGT-RTAGESDMKIIRVLWWYYFSKLIEFMDTFFFILRKNNHQITVLHVYHHAS
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 MPWTWWFGVKFAAGGLGTFHALLNTAVHVVMYSYYGLSALGPAYQKYLWWKKYLTSLQLV
: ::: .... : . : : ::. .::.::::::::.. :... :::::::.:. ::.
CCDS56 MLNIWWFVMNWVPCGHSYFGATLNSFIHVLMYSYYGLSSV-PSMRPYLWWKKYITQGQLL
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 QFVIVAIHISQFFFMEDCKYQFPV-FACIIMSYSFMFLLLFLHFWYRAYTKGQRLPKTVK
:::.. :. : . : ::. . . ..: . .. :: .:. ..:.:
CCDS56 QFVLTIIQTS-CGVIWPCT--FPLGWLYFQIGYMISLIALFTNFYIQTYNKKGASRRKDH
240 250 260 270 280 290
280
pF1KE2 NGTCKNKDN
CCDS56 LKDHQNGSMAAVNGHTNSFSPLENNVKPRKLRKD
300 310 320
>>CCDS75470.1 ELOVL5 gene_id:60481|Hs109|chr6 (262 aa)
initn: 322 init1: 225 opt: 398 Z-score: 522.4 bits: 104.4 E(33420): 9.1e-23
Smith-Waterman score: 398; 38.8% identity (71.4% similar) in 147 aa overlap (22-168:20-164)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAFSDLTSRTVHLYDNWIKDADPRVEDWLLMSSPLPQTILLGFYVYFVTSLGPKLMENRK
: ::. :.:... .: : .:. ... :::: :.:..
CCDS75 MEHFDASLSTYFKALLGPRDTRVKGWFLLDNYIPTFICSVIYL-LIVWLGPKYMRNKQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 PFELKKAMITYNFFIVLFSVYMCYEFVMSGWGIGYSFRCDIVDYSRSPTALRMARTCWLY
:: . ...::. ..:.:.:: :.: . : :.: :. . . . . ... :. : :
CCDS75 PFSCRGILVVYNLGLTLLSLYMFCELVTGVWEGKYNFFCQGT-RTAGESDMKIIRVLWWY
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