FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2742, 1361 aa
1>>>pF1KE2742 1361 - 1361 aa - 1361 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4667+/-0.0011; mu= 21.5116+/- 0.066
mean_var=61.3513+/-12.052, 0's: 0 Z-trim(101.7): 32 B-trim: 3 in 1/49
Lambda= 0.163743
statistics sampled from 6690 (6716) to 6690 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.548), E-opt: 0.2 (0.201), width: 16
Scan time: 2.250
The best scores are: opt bits E(33420)
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CCDS47979.1 CEMIP2 gene_id:23670|Hs109|chr9 (1320) 2846 681.9 3.3e-195
>>CCDS10315.1 CEMIP gene_id:57214|Hs109|chr15 (1361 aa)
initn: 9456 init1: 9456 opt: 9456 Z-score: 12057.1 bits: 2243.4 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 9456; 100.0% identity (100.0% similar) in 1361 aa overlap (1-1361:1-1361)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGAAGRQDFLFKAMLTISWLTLTCFPGATSTVAAGCPDQSPELQPWNPGHDQDHHVHIGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MGAAGRQDFLFKAMLTISWLTLTCFPGATSTVAAGCPDQSPELQPWNPGHDQDHHVHIGQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GKTLLLTSSATVYSIHISEGGKLVIKDHDEPIVLRTRHILIDNGGELHAGSALCPFQGNF
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TIILYGRADEGIQPDPYYGLKYIGVGKGGALELHGQKKLSWTFLNKTLHPGGMAEGGYFF
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ERSWGHRGVIVHVIDPKSGTVIHSDRFDTYRSKKESERLVQYLNAVPDGRILSVAVNDEG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SRNLDDMARKAMTKLGSKHFLHLGFRHPWSFLTVKGNPSSSVEDHIEYHGHRGSAAARVF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IQATTMDGVNLSTEVVYKKGQDYRFACYDRGRACRSYRVRFLCGKPVRPKLTVTIDTNVN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 STILNLEDNVQSWKPGDTLVIASTDYSMYQAEEFQVLPCRSCAPNQVKVAGKPMYLHIGE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE2 GTELKHMGQQLVGQYPIHFHLAGDVDERGGYDPPTYIRDLSIHHTFSRCVTVHGSNGLLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GTELKHMGQQLVGQYPIHFHLAGDVDERGGYDPPTYIRDLSIHHTFSRCVTVHGSNGLLI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 KDVVGYNSLGHCFFTEDGPEERNTFDHCLGLLVKSGTLLPSDRDSKMCKMITEDSYPGYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KDVVGYNSLGHCFFTEDGPEERNTFDHCLGLLVKSGTLLPSDRDSKMCKMITEDSYPGYI
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pF1KE2 PKPRQDCNAVSTFWMANPNNNLINCAAAGSEETGFWFIFHHVPTGPSVGMYSPGYSEHIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PKPRQDCNAVSTFWMANPNNNLINCAAAGSEETGFWFIFHHVPTGPSVGMYSPGYSEHIP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 LGKFYNNRAHSNYRAGMIIDNGVKTTEASAKDKRPFLSIISARYSPHQDADPLKPREPAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LGKFYNNRAHSNYRAGMIIDNGVKTTEASAKDKRPFLSIISARYSPHQDADPLKPREPAI
730 740 750 760 770 780
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pF1KE2 IRHFIAYKNQDHGAWLRGGDVWLDSCRFADNGIGLTLASGGTFPYDDGSKQEIKNSLFVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IRHFIAYKNQDHGAWLRGGDVWLDSCRFADNGIGLTLASGGTFPYDDGSKQEIKNSLFVG
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850 860 870 880 890 900
pF1KE2 ESGNVGTEMMDNRIWGPGGLDHSGRTLPIGQNFPIRGIQLYDGPINIQNCTFRKFVALEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ESGNVGTEMMDNRIWGPGGLDHSGRTLPIGQNFPIRGIQLYDGPINIQNCTFRKFVALEG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RHTSALAFRLNNAWQSCPHNNVTGIAFEDVPITSRVFFGEPGPWFNQLDMDGDKTSVFHD
910 920 930 940 950 960
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pF1KE2 VDGSVSEYPGSYLTKNDNWLVRHPDCINVPDWRGAICSGCYAQMYIQAYKTSNLRMKIIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VDGSVSEYPGSYLTKNDNWLVRHPDCINVPDWRGAICSGCYAQMYIQAYKTSNLRMKIIK
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 NDFPSHPLYLEGALTRSTHYQQYQPVVTLQKGYTIHWDQTAPAELAIWLINFNKGDWIRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NDFPSHPLYLEGALTRSTHYQQYQPVVTLQKGYTIHWDQTAPAELAIWLINFNKGDWIRV
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 GLCYPRGTTFSILSDVHNRLLKQTSKTGVFVRTLQMDKVEQSYPGRSHYYWDEDSGLLFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GLCYPRGTTFSILSDVHNRLLKQTSKTGVFVRTLQMDKVEQSYPGRSHYYWDEDSGLLFL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 KLKAQNEREKFAFCSMKGCERIKIKALIPKNAGVSDCTATAYPKFTERAVVDVPMPKKLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KLKAQNEREKFAFCSMKGCERIKIKALIPKNAGVSDCTATAYPKFTERAVVDVPMPKKLF
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 GSQLKTKDHFLEVKMESSKQHFFHLWNDFAYIEVDGKKYPSSEDGIQVVVIDGNQGRVVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GSQLKTKDHFLEVKMESSKQHFFHLWNDFAYIEVDGKKYPSSEDGIQVVVIDGNQGRVVS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 HTSFRNSILQGIPWQLFNYVATIPDNSIVLMASKGRYVSRGPWTRVLEKLGADRGLKLKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HTSFRNSILQGIPWQLFNYVATIPDNSIVLMASKGRYVSRGPWTRVLEKLGADRGLKLKE
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360
pF1KE2 QMAFVGFKGSFRPIWVTLDTEDHKAKIFQVVPIPVVKKKKL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QMAFVGFKGSFRPIWVTLDTEDHKAKIFQVVPIPVVKKKKL
1330 1340 1350 1360
>>CCDS6638.1 CEMIP2 gene_id:23670|Hs109|chr9 (1383 aa)
initn: 1916 init1: 1300 opt: 3076 Z-score: 3911.7 bits: 736.2 E(33420): 1.5e-211
Smith-Waterman score: 3667; 43.3% identity (69.6% similar) in 1358 aa overlap (6-1338:80-1337)
10 20 30
pF1KE2 MGAAGRQDFLFKAMLTISW-LTLTCFPGATSTVAA
.. :. :. ..:. ..:. . : .: :
CCDS66 TSIRREDRATFAFSPEEQQAQRESQKQKRHKNTFICFAITSFSFFIALAIILGISSKYAP
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80
pF1KE2 --GCPDQSPELQPWNPGHDQDHHVHIGQGKTLLLTSSATVYSIHISEGGKLVI---KDHD
.::::.:.:. :.::.:. ..: : .: : :::.:::.:: :..:: ::. :: .
CCDS66 DENCPDQNPRLRNWDPGQDSAKQVVIKEGDMLRLTSDATVHSIVIQDGGLLVFGDNKDGS
110 120 130 140 150 160
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 EPIVLRTRHILIDNGGELHAGSALCPFQGNFTIILYGRADEGIQPDPYYGLKYIGVGKGG
. :.:::..:::..:: :: :. : .... :: :::..::: . : .: :.::: ::
CCDS66 RNITLRTHYILIQDGGALHIGAEKCRYKSKATITLYGKSDEG-ESMPTFGKKFIGVEAGG
170 180 190 200 210 220
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 ALELHGQKKLSWTFLNKTLHPGGMAEGGYFFERSWGHRGVIVHVIDPKSGTVIHSDRFDT
.::::: .: :::.: .::. .:. :.: ::.... ::. :.::: .. ...:.::::
CCDS66 TLELHGARKASWTLLARTLNSSGLPFGSYTFEKDFS-RGLNVRVIDQDTAKILESERFDT
230 240 250 260 270 280
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 YRSKKESERLVQYLNAVPDGRILSVAVNDEGSRNL-DDMARKAMTKLGSKHFLHLGFRHP
.. ..::.:: ..: :::...::.: ....: . . . .:::. . ::.:.
CCDS66 HEYRNESRRLQEFLRFQDPGRIVAIAVGDSAAKSLLQGTIQMIQERLGSELIQGLGYRQA
290 300 310 320 330 340
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 WSFLTVKGNPSSSVEDHIE-YHGHRGSAAARVFKLFQTEHGEYFNVSLSSEWVQDVEWTE
:... : . :.: .. .. :..: ... : . . : : :. :.:. :::..
CCDS66 WALVGVIDGGSTSCNESVRNYENHSSGGKALAQREFYTVDGQKFSVTAYSEWIE------
350 360 370 380 390 400
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 WFDHDKVSQTKGGEKISDLWKAHPGKICNRPIDIQATTMDGVNLSTEVVYKKGQDYRFAC
::.::
CCDS66 ----------------------------------------GVSLS---------------
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 YDRGRACRSYRVRFLCGKPVRPKLTVTIDTNVNSTILNLEDNVQSWKPGDTLVIASTDYS
..::. :... ::: :.:.:::::: .:.::::::
CCDS66 --------GFRVEV-----------------VDGVKLNLLDDVSSWKPGDQIVVASTDYS
410 420 430 440
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 MYQAEEFQVLPCRSCAPNQVKVAGKPMYLHIGEEIDGVDMRAEVGLLSRNIIVMGEMEDK
::::::: .::: :. :::: :..::.:: :::::::::::.:.:::...::.::.
CCDS66 MYQAEEFTLLPCSECSHFQVKVKETPQFLHMGEIIDGVDMRAEVGILTRNIVIQGEVEDS
450 460 470 480 490 500
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 CYPYRNHICNFFDFDTFGGHIKFALGFKAAHLEGTELKHMGQQLVGQYPIHFHLAGDVDE
:: .. :.:::.::::::: . .: ..:: .:::::::: .:.::.:::: ::::
CCDS66 CYA--ENQCQFFDYDTFGGHIMIMKNFTSVHLSYVELKHMGQQQMGRYPVHFHLCGDVDY
510 520 530 540 550
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 RGGYDPPTYIRDLSIHHTFSRCVTVHGSNGLLIKDVVGYNSLGHCFFTEDGPEERNTFDH
.::: :.. :::::.::::.::::.:::::::..:...:::::: ::: :.:::. :
CCDS66 KGGYRHATFVDGLSIHHSFSRCITVHGTNGLLIKDTIGFDTLGHCFFLEDGIEQRNTLFH
560 570 580 590 600 610
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 CLGLLVKSGTLLPSDRDSKMCKMITEDSYPGYIPKPRQDCNAVSTFWMANPNNNLINCAA
::::.: :::::.::...:: . . . .::: : :: ::::::.:.::::::: ::
CCDS66 NLGLLTKPGTLLPTDRNNSMCTTMRDKVFGNYIPVPATDCMAVSTFWIAHPNNNLINNAA
620 630 640 650 660 670
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pF1KE2 AGSEETGFWFIFHHVPTGPSVGMYSPGYSEHIPLGKFYNNRAHSNYRAGMIIDNGVKTTE
:::...:.:..::. ::: : :. . : ::: :::::.:::..::..::.:::::.
CCDS66 AGSQDAGIWYLFHKEPTGESSGLQLLAKPELTPLGIFYNNRVHSNFKAGLFIDKGVKTTN
680 690 700 710 720 730
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pF1KE2 ASAKDKRPFLSI-ISARYSPHQDADPLKPREPAIIRHFIAYKNQDHGAWLRGGDVWLDSC
.:: : : .: . :::. :::::.: ::: :.: ..::.::.:.:::.::::. ...
CCDS66 SSAADPREYLCLDNSARFRPHQDANPEKPRVAALIDRLIAFKNNDNGAWVRGGDIIVQNS
740 750 760 770 780 790
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pF1KE2 RFADNGIGLTLASGGTFPYDDGSKQEIKNSLFVGESGNVGTEMMDNRIWGPGGLDHSGRT
:::::::::.:: :.:: :.::.::...::::::: : : . .:. : ::.:.. ::
CCDS66 AFADNGIGLTFASDGSFPSDEGSSQEVSESLFVGESRNYGFQGGQNKYVGTGGIDQKPRT
800 810 820 830 840 850
870 880 890 900 910 920
pF1KE2 LPIGQNFPIRGIQLYDGPINIQNCTFRKFVALEGRHTSALAFRLNNAWQSCPHNNVTGIA
:: ...:::::.:.:::::.. ::.:.: :..::..: ..:.:: :.::.. .
CCDS66 LPRNRTFPIRGFQIYDGPIHLTRSTFKKYVPTPDRYSSAIGFLMKNSWQITPRNNISLVK
860 870 880 890 900 910
930 940 950 960 970 980
pF1KE2 FEDVPITSRVFFGEPGPWFNQLDMDGDKTSVFHDVDGSVSEYPGSYLTKNDNWLVRHPDC
: .. ::::.:::::.. .:::::.:.:::.::::. : .:. . ::.:.:::.:
CCDS66 F-GPHVSLNVFFGKPGPWFEDCEMDGDKNSIFHDIDGSVTGYKDAYVGRMDNYLIRHPSC
920 930 940 950 960 970
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pF1KE2 INVPDWRGAICSGCYAQMYIQAYKTSNLRMKIIKNDFPSHPLYLEGALTRSTHYQQYQPV
.:: : ..:::: :::.:.:...:.:: : : ....::.:. :.: ..... . :::::
CCDS66 VNVSKWNAVICSGTYAQVYVQTWSTQNLSMTITRDEYPSNPMVLRG-INQKAAFPQYQPV
980 990 1000 1010 1020 1030
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE2 VTLQKGYTIHWDQTAPAELAIWLINFNKGDWIRVGLCYPRGTTFSILSDVHNRLLKQTSK
: :.:::::::. :: ..:.::::.:::::::::: .:.:.. .: . ::
CCDS66 VMLEKGYTIHWNGPAPRTTFLYLVNFNKNDWIRVGLCYPSNTSFQVTFGYLQRQNGSLSK
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE2 TGVFVRTLQMDKVEQSYPGRSHYYWDEDSGLLFLKLKAQNEREKFAFCSMKGCERIKIKA
. . ........ :. .:.: ..::::: :::...:. ..:: .::::.::.:
CCDS66 IEEYEPVHSLEELQRKQSERK-FYFDSSTGLLFLYLKAKSHRHGHSYCSSQGCERVKIQA
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1170 1180 1190 1200 1210
pF1KE2 LIPKNAGVSDCTATAYPKFTERAVVDVPMPKKLFG-------SQLK-TKD-H--FLEVKM
. .:.: : :::.. .. : :: : : :. :.: : .: :..
CCDS66 -ATDSKDISNCMAKAYPQYYRKPSVVKRMPAMLTGLCQGCGTRQVVFTSDPHKSYLPVQF
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KE2 ESSKQHFFHLWNDFAYIEVDGKKYPSSEDGIQVVVIDGNQG--RVVSHTSFRNSILQGIP
.: . . .: . : :.: . :. ..:.: . :.. .: : : .
CCDS66 QSPDKAETQR-GDPSVISVNGTDFTFRSAGVLLLVVDPCSVPFRLTEKTVFP---LADVS
1220 1230 1240 1250 1260 1270
1280 1290 1300 1310 1320 1330
pF1KE2 WQLFNYVAT-IPDNSIVLMASKGRYVSRGPWTRVLEKLGADRGLKL--KEQMAFVGFKGS
.. .:. : :: ::::....:. ... ...: :: . .: : . :.::.:.
CCDS66 -RIEEYLKTGIPPRSIVLLSTRGE-IKQLNISHLLVPLGLAKPAHLYDKGSTIFLGFSGN
1280 1290 1300 1310 1320
1340 1350 1360
pF1KE2 FRPIWVTLDTEDHKAKIFQVVPIPVVKKKKL
:.: :. :
CCDS66 FKPSWTKLFTSPAGQGLGVLEQFIPLQLDEYGCPRATTVRRRDLELLKQASKAH
1330 1340 1350 1360 1370 1380
>>CCDS47979.1 CEMIP2 gene_id:23670|Hs109|chr9 (1320 aa)
initn: 1916 init1: 1300 opt: 2846 Z-score: 3618.4 bits: 681.9 E(33420): 3.3e-195
Smith-Waterman score: 3294; 40.4% identity (65.8% similar) in 1358 aa overlap (6-1338:80-1274)
10 20 30
pF1KE2 MGAAGRQDFLFKAMLTISW-LTLTCFPGATSTVAA
.. :. :. ..:. ..:. . : .: :
CCDS47 TSIRREDRATFAFSPEEQQAQRESQKQKRHKNTFICFAITSFSFFIALAIILGISSKYAP
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80
pF1KE2 --GCPDQSPELQPWNPGHDQDHHVHIGQGKTLLLTSSATVYSIHISEGGKLVI---KDHD
.::::.:.:. :.::.:. ..: : .: : :::.:::.:: :..:: ::. :: .
CCDS47 DENCPDQNPRLRNWDPGQDSAKQVVIKEGDMLRLTSDATVHSIVIQDGGLLVFGDNKDGS
110 120 130 140 150 160
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 EPIVLRTRHILIDNGGELHAGSALCPFQGNFTIILYGRADEGIQPDPYYGLKYIGVGKGG
. :.:::..:::..:: :: :. : .... :: :::..::: . : .: :.::: ::
CCDS47 RNITLRTHYILIQDGGALHIGAEKCRYKSKATITLYGKSDEG-ESMPTFGKKFIGVEAGG
170 180 190 200 210 220
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 ALELHGQKKLSWTFLNKTLHPGGMAEGGYFFERSWGHRGVIVHVIDPKSGTVIHSDRFDT
.::::: .: :::.: .::. .:. :.: ::.... ::. :.::: .. ...:.::::
CCDS47 TLELHGARKASWTLLARTLNSSGLPFGSYTFEKDFS-RGLNVRVIDQDTAKILESERFDT
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