Result of FASTA (omim) for
pF1KE2708
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2708, 1590 aa
1>>>pF1KE2708 1590 - 1590 aa - 1590 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
63842531 residues in 89799 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 17.4274+/-0.000514; mu= -30.1953+/- 0.032
mean_var=820.6144+/-167.445, 0's: 0 Z-trim(124.6): 281 B-trim: 0 in 0/61
Lambda= 0.044772
statistics sampled from 47414 (47743) to 47414 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.773), E-opt: 0.2 (0.532), width: 16
Scan time: 10.520
The best scores are: opt bits E(89799)
NP_003061 (OMIM: 600014,601358) probable global tr (1590) 10647 704.4 2.1e-201
NP_001276325 (OMIM: 600014,601358) probable global (1590) 10647 704.4 2.1e-201
NP_620614 (OMIM: 600014,601358) probable global tr (1572) 9415 624.8 1.9e-177
XP_016882656 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1614) 7111 476.0 1.2e-132
NP_001122319 (OMIM: 603254,613325,614609) transcri (1614) 7111 476.0 1.2e-132
NP_001122320 (OMIM: 603254,613325,614609) transcri (1613) 7103 475.5 1.7e-132
XP_016882657 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1613) 7103 475.5 1.7e-132
XP_016882654 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1617) 7095 475.0 2.4e-132
NP_001122317 (OMIM: 603254,613325,614609) transcri (1617) 7095 475.0 2.4e-132
XP_016882655 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1616) 7087 474.4 3.5e-132
NP_001122318 (OMIM: 603254,613325,614609) transcri (1616) 7087 474.4 3.5e-132
XP_016882653 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1645) 6217 418.2 2.9e-115
XP_016882651 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1646) 6217 418.2 2.9e-115
NP_001276326 (OMIM: 600014,601358) probable global (1514) 5900 397.7 4e-109
XP_016882652 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1646) 5584 377.4 6e-103
NP_003063 (OMIM: 603254,613325,614609) transcripti (1647) 5584 377.4 6e-103
NP_001122316 (OMIM: 603254,613325,614609) transcri (1647) 5584 377.4 6e-103
XP_016882650 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1650) 5584 377.4 6e-103
XP_016882649 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1678) 5584 377.4 6e-103
XP_011526500 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1679) 5584 377.4 6e-103
XP_006722909 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1679) 5584 377.4 6e-103
NP_001122321 (OMIM: 603254,613325,614609) transcri (1679) 5584 377.4 6e-103
XP_006722908 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1679) 5584 377.4 6e-103
NP_001276327 (OMIM: 600014,601358) probable global ( 248) 1114 88.0 1.1e-16
NP_001276328 (OMIM: 600014,601358) probable global ( 276) 1114 88.1 1.2e-16
NP_001276329 (OMIM: 600014,601358) probable global ( 278) 1114 88.1 1.2e-16
XP_011515862 (OMIM: 189960,214800,608892,612370) P (1621) 1144 90.6 1.3e-16
XP_016869102 (OMIM: 189960,214800,608892,612370) P (2996) 1144 90.8 2e-16
NP_060250 (OMIM: 189960,214800,608892,612370) chro (2997) 1144 90.8 2e-16
XP_011515857 (OMIM: 189960,214800,608892,612370) P (3026) 1144 90.8 2.1e-16
XP_011515855 (OMIM: 189960,214800,608892,612370) P (3027) 1144 90.8 2.1e-16
XP_016869101 (OMIM: 189960,214800,608892,612370) P (3027) 1144 90.8 2.1e-16
XP_011515856 (OMIM: 189960,214800,608892,612370) P (3027) 1144 90.8 2.1e-16
XP_016879558 (OMIM: 602120) PREDICTED: chromodomai (1888) 1046 84.3 1.1e-14
NP_005843 (OMIM: 602120) chromodomain-helicase-DNA (1966) 1046 84.3 1.2e-14
NP_001005273 (OMIM: 602120) chromodomain-helicase- (2000) 1046 84.3 1.2e-14
XP_006721491 (OMIM: 602120) PREDICTED: chromodomai (2025) 1046 84.3 1.2e-14
XP_016879555 (OMIM: 602120) PREDICTED: chromodomai (2036) 1046 84.3 1.2e-14
XP_016879557 (OMIM: 602120) PREDICTED: chromodomai (2036) 1046 84.3 1.2e-14
XP_016879556 (OMIM: 602120) PREDICTED: chromodomai (2045) 1046 84.3 1.2e-14
XP_016879554 (OMIM: 602120) PREDICTED: chromodomai (2047) 1046 84.3 1.2e-14
XP_016879559 (OMIM: 602120) PREDICTED: chromodomai (2050) 1046 84.3 1.2e-14
XP_016879553 (OMIM: 602120) PREDICTED: chromodomai (2055) 1046 84.3 1.2e-14
XP_016879552 (OMIM: 602120) PREDICTED: chromodomai (2056) 1046 84.3 1.2e-14
NP_001005271 (OMIM: 602120) chromodomain-helicase- (2059) 1046 84.3 1.2e-14
XP_005256486 (OMIM: 602120) PREDICTED: chromodomai (2060) 1046 84.3 1.2e-14
XP_005256485 (OMIM: 602120) PREDICTED: chromodomai (2080) 1046 84.3 1.2e-14
XP_016879551 (OMIM: 602120) PREDICTED: chromodomai (2105) 1046 84.3 1.2e-14
XP_016879550 (OMIM: 602120) PREDICTED: chromodomai (2109) 1046 84.3 1.2e-14
XP_006721487 (OMIM: 602120) PREDICTED: chromodomai (2111) 1046 84.3 1.2e-14
>>NP_003061 (OMIM: 600014,601358) probable global transc (1590 aa)
initn: 10647 init1: 10647 opt: 10647 Z-score: 3737.3 bits: 704.4 E(89799): 2.1e-201
Smith-Waterman score: 10647; 100.0% identity (100.0% similar) in 1590 aa overlap (1-1590:1-1590)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSTPTDPGAMPHPGPSPGPGPSPGPILGPSPGPGPSPGSVHSMMGPSPGPPSVSHPMPTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MSTPTDPGAMPHPGPSPGPGPSPGPILGPSPGPGPSPGSVHSMMGPSPGPPSVSHPMPTM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 GSTDFPQEGMHQMHKPIDGIHDKGIVEDIHCGSMKGTGMRPPHPGMGPPQSPMDQHSQGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GSTDFPQEGMHQMHKPIDGIHDKGIVEDIHCGSMKGTGMRPPHPGMGPPQSPMDQHSQGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 MSPHPSPLGAPEHVSSPMSGGGPTPPQMPPSQPGALIPGDPQAMSQPNRGPSPFSPVQLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MSPHPSPLGAPEHVSSPMSGGGPTPPQMPPSQPGALIPGDPQAMSQPNRGPSPFSPVQLH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QLRAQILAYKMLARGQPLPETLQLAVQGKRTLPGLQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QLRAQILAYKMLARGQPLPETLQLAVQGKRTLPGLQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQPQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 QQPPQPQTQQQQQPALVNYNRPSGPGPELSGPSTPQKLPVPAPGGRPSPAPPAAAQPPAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QQPPQPQTQQQQQPALVNYNRPSGPGPELSGPSTPQKLPVPAPGGRPSPAPPAAAQPPAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 AVPGPSVPQPAPGQPSPVLQLQQKQSRISPIQKPQGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 AVPGPSVPQPAPGQPSPVLQLQQKQSRISPIQKPQGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LENLPGSLPPDLRTKATVELKALRLLNFQRQLRQEVVACMRRDTTLETALNSKAYKRSKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LENLPGSLPPDLRTKATVELKALRLLNFQRQLRQEVVACMRRDTTLETALNSKAYKRSKR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 QTLREARMTEKLEKQQKIEQERKRRQKHQEYLNSILQHAKDFKEYHRSVAGKIQKLSKAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QTLREARMTEKLEKQQKIEQERKRRQKHQEYLNSILQHAKDFKEYHRSVAGKIQKLSKAV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 ATWHANTEREQKKETERIEKERMRRLMAEDEEGYRKLIDQKKDRRLAYLLQQTDEYVANL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ATWHANTEREQKKETERIEKERMRRLMAEDEEGYRKLIDQKKDRRLAYLLQQTDEYVANL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 TNLVWEHKQAQAAKEKKKRRRRKKKAEENAEGGESALGPDGEPIDESSQMSDLPVKVTHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TNLVWEHKQAQAAKEKKKRRRRKKKAEENAEGGESALGPDGEPIDESSQMSDLPVKVTHT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 ETGKVLFGPEAPKASQLDAWLEMNPGYEVAPRSDSEESDSDYEEEDEEEESSRQETEEKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ETGKVLFGPEAPKASQLDAWLEMNPGYEVAPRSDSEESDSDYEEEDEEEESSRQETEEKI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 LLDPNSEEVSEKDAKQIIETAKQDVDDEYSMQYSARGSQSYYTVAHAISERVEKQSALLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LLDPNSEEVSEKDAKQIIETAKQDVDDEYSMQYSARGSQSYYTVAHAISERVEKQSALLI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 NGTLKHYQLQGLEWMVSLYNNNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRLNGPYLIIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 NGTLKHYQLQGLEWMVSLYNNNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRLNGPYLIIV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 PLSTLSNWTYEFDKWAPSVVKISYKGTPAMRRSLVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PLSTLSNWTYEFDKWAPSVVKISYKGTPAMRRSLVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHIL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 AKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTHYVAPRRILLTGTPLQNKLPELWALLNFLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 AKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTHYVAPRRILLTGTPLQNKLPELWALLNFLLP
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 TIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGERVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVESQLPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGERVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVESQLPE
910 920 930 940 950 960
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pF1KE2 KVEYVIKCDMSALQKILYRHMQAKGILLTDGSEKDKKGKGGAKTLMNTIMQLRKICNHPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KVEYVIKCDMSALQKILYRHMQAKGILLTDGSEKDKKGKGGAKTLMNTIMQLRKICNHPY
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 MFQHIEESFAEHLGYSNGVINGAELYRASGKFELLDRILPKLRATNHRVLLFCQMTSLMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MFQHIEESFAEHLGYSNGVINGAELYRASGKFELLDRILPKLRATNHRVLLFCQMTSLMT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
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pF1KE2 IMEDYFAFRNFLYLRLDGTTKSEDRAALLKKFNEPGSQYFIFLLSTRAGGLGLNLQAADT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 IMEDYFAFRNFLYLRLDGTTKSEDRAALLKKFNEPGSQYFIFLLSTRAGGLGLNLQAADT
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KE2 VVIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VVIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQ
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 AGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEENEEEDEVPDDETLNQMIARREEEFDLFMRMDMDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 AGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEENEEEDEVPDDETLNQMIARREEEFDLFMRMDMDR
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 RREDARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKIFGRGSRQRRDVDYSDAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 RREDARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKIFGRGSRQRRDVDYSDAL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 TEKQWLRAIEDGNLEEMEEEVRLKKRKRRRNVDKDPAKEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TEKQWLRAIEDGNLEEMEEEVRLKKRKRRRNVDKDPAKEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNP
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE2 PKLTKQMNAIIDTVINYKDRCNVEKVPSNSQLEIEGNSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PKLTKQMNAIIDTVINYKDRCNVEKVPSNSQLEIEGNSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYY
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE2 ELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFK
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE2 SARQKIAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDDKGRDKGKGKKRPNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SARQKIAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDDKGRDKGKGKKRPNR
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590
pF1KE2 GKAKPVVSDFDSDEEQDEREQSEGSGTDDE
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GKAKPVVSDFDSDEEQDEREQSEGSGTDDE
1570 1580 1590
>>NP_001276325 (OMIM: 600014,601358) probable global tra (1590 aa)
initn: 10647 init1: 10647 opt: 10647 Z-score: 3737.3 bits: 704.4 E(89799): 2.1e-201
Smith-Waterman score: 10647; 100.0% identity (100.0% similar) in 1590 aa overlap (1-1590:1-1590)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSTPTDPGAMPHPGPSPGPGPSPGPILGPSPGPGPSPGSVHSMMGPSPGPPSVSHPMPTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSTPTDPGAMPHPGPSPGPGPSPGPILGPSPGPGPSPGSVHSMMGPSPGPPSVSHPMPTM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 GSTDFPQEGMHQMHKPIDGIHDKGIVEDIHCGSMKGTGMRPPHPGMGPPQSPMDQHSQGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSTDFPQEGMHQMHKPIDGIHDKGIVEDIHCGSMKGTGMRPPHPGMGPPQSPMDQHSQGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 MSPHPSPLGAPEHVSSPMSGGGPTPPQMPPSQPGALIPGDPQAMSQPNRGPSPFSPVQLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSPHPSPLGAPEHVSSPMSGGGPTPPQMPPSQPGALIPGDPQAMSQPNRGPSPFSPVQLH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QLRAQILAYKMLARGQPLPETLQLAVQGKRTLPGLQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QLRAQILAYKMLARGQPLPETLQLAVQGKRTLPGLQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQPQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 QQPPQPQTQQQQQPALVNYNRPSGPGPELSGPSTPQKLPVPAPGGRPSPAPPAAAQPPAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QQPPQPQTQQQQQPALVNYNRPSGPGPELSGPSTPQKLPVPAPGGRPSPAPPAAAQPPAA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AVPGPSVPQPAPGQPSPVLQLQQKQSRISPIQKPQGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LENLPGSLPPDLRTKATVELKALRLLNFQRQLRQEVVACMRRDTTLETALNSKAYKRSKR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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NP_001 GKAKPVVSDFDSDEEQDEREQSEGSGTDDE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE2 ELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFK
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NP_620 ELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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NP_620 GKAKPVVSDFDSDEEQDEREQSEGSGTDDE
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pF1KE2 MGSTDFPQEGMHQMHKPIDGIHDKGIVEDIHCGSMKGTGMRPP-HPGMGPPQSPMDQHSQ
.: .::..:::::::....:.::. .: . ..::: ::: : ::::: ::::::::
XP_016 QGPGGYPQDNMHQMHKPMESMHEKGMSDDPRYNQMKGMGMRSGGHAGMGPPPSPMDQHSQ
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pF1KE2 GYMSPHPSPLGAPEHVSSPMSGGGPTP-PQMPPSQPGALIPG-DPQAMSQPNRGPSPFSP
:: :::::. ::.:::. ..::. ::: . :: . : ::::..: ::::.::.
XP_016 GY----PSPLGGSEHASSPVPASGPSSGPQMSSGPGGAPLDGADPQALGQQNRGPTPFNQ
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pF1KE2 VQLHQLRAQILAYKMLARGQPLPETLQLAVQGKRTLPGLQQQQQQQQQQQ----------
:::::::::.::::::::::::. ::.:::::: .::.:::. .
XP_016 NQLHQLRAQIMAYKMLARGQPLPDHLQMAVQGKRPMPGMQQQMPTLPPPSVSATGPGPGP
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. .. . . :.. :: :. . : :. : :: . ..
XP_016 GPGPGPGPGPAPPNYSRPHGMGGPNMPPPGPSGVPPGMPGQPPGGPPKPWPEGPMANAAA
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: :::::: : : :::::::::. ::::. : :.. .:. :.::.:.. :.::::::
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.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.::::::::::
XP_016 TPIQKPRGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLAGDLRTKATIELKALRLLNF
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:::::::::.::::::.::::::.:::::::::.:::::.::::::::::::::::::::
XP_016 QRQLRQEVVVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEKLEKQQKIEQERKRRQKH
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 QEYLNSILQHAKDFKEYHRSVAGKIQKLSKAVATWHANTEREQKKETERIEKERMRRLMA
:::::::::::::::::::::.::::::.:::::.:::::::::::.:::::::::::::
XP_016 QEYLNSILQHAKDFKEYHRSVTGKIQKLTKAVATYHANTEREQKKENERIEKERMRRLMA
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 EDEEGYRKLIDQKKDRRLAYLLQQTDEYVANLTNLVWEHKQAQAAKEKKKRRRRKKKAEE
:::::::::::::::.:::::::::::::::::.:: .:: ::.::::::....:: :
XP_016 EDEEGYRKLIDQKKDKRLAYLLQQTDEYVANLTELVRQHKAAQVAKEKKKKKKKKK--AE
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 NAEGGESALGPDGEPIDESSQMSDLPVKVTHTETGKVLFGPEAPKASQLDAWLEMNPGYE
:::: :.::::::.::.:::::::::: :.:.::.: : .::::.::.::::::::::
XP_016 NAEGQTPAIGPDGEPLDETSQMSDLPVKVIHVESGKILTGTDAPKAGQLEAWLEMNPGYE
600 610 620 630 640 650
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 VAPRSDSEESDSDYEEEDEEEESSRQET-------EEKILLDPNSEEVSEKDAKQIIETA
:::::::::: :. :::.::::. . :.: . ::.:..::: ::..:::.:
XP_016 VAPRSDSEESGSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDDVSEVDARHIIENA
660 670 680 690 700 710
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 KQDVDDEYSM-QYSARGSQSYYTVAHAISERVEKQSALLINGTLKHYQLQGLEWMVSLYN
::::::::.. : ::: ::::.::::..:::.:::::..::.::.::..::::.:::::
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pF1KE2 NNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRLNGPYLIIVPLSTLSNWTYEFDKWAPSVV
:::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::.:::::::::::
XP_016 NNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRINGPFLIIVPLSTLSNWAYEFDKWAPSVV
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pF1KE2 KISYKGTPAMRRSLVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHH
:.::::.:: ::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KVSYKGSPAARRAFVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHH
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pF1KE2 CKLTQVLNTHYVAPRRILLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMT
::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CKLTQVLNTHYVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMT
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pF1KE2 GERVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVESQLPEKVEYVIKCDMSALQKILYRH
::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::..::::
XP_016 GEKVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVEAQLPEKVEYVIKCDMSALQRVLYRH
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pF1KE2 MQAKGILLTDGSEKDKKGKGGAKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFAEHLGYSNGVI
:::::.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::...:..
XP_016 MQAKGVLLTDGSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFSEHLGFTGGIV
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE2 NGAELYRASGKFELLDRILPKLRATNHRVLLFCQMTSLMTIMEDYFAFRNFLYLRLDGTT
.: .:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.:.: ::::::::
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pF1KE2 KSEDRAALLKKFNEPGSQYFIFLLSTRAGGLGLNLQAADTVVIFDSDWNPHQDLQAQDRA
:.:::. ::: ::::::.::::::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::
XP_016 KAEDRGMLLKTFNEPGSEYFIFLLSTRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRA
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pF1KE2 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KE2 LEHEEENEEEDEVPDDETLNQMIARREEEFDLFMRMDMDRRREDARNPKRKPRLMEEDEL
:::::..:::::::::::.::::::.:::::::::::.:::::.::::::::::::::::
XP_016 LEHEEQDEEEDEVPDDETVNQMIARHEEEFDLFMRMDLDRRREEARNPKRKPRLMEEDEL
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KE2 PSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKIFGRGSRQRRDVDYSDALTEKQWLRAIEDGNLEEMEEE
::::::::::::::::::::::.::::::.:..:::::.:::::::.:::.:.:::.:::
XP_016 PSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMFGRGSRHRKEVDYSDSLTEKQWLKAIEEGTLEEIEEE
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1350 1360 1370 1380
pF1KE2 VRLKKRKRRRNVDKD-----PA-------KEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNPPKLTKQMN
:: :: .:.:. :.: :. :.: : .:.::::::::::::::.:::.:.
XP_016 VRQKKSSRKRKRDSDAGSSTPTTSTRSRDKDDESKKQKKRGRPPAEKLSPNPPNLTKKMK
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE2 AIIDTVINYKDRCNVEKVPSNSQLEIEGNSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVD
:.:.::.::: .:::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KIVDAVIKYKD-----------------SSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVD
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1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE2 FKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFKSARQKIAK
::::::::::::::::.::::::::::.:::::::::: :::::::::::: :.:::: :
XP_016 FKKIKERIRNHKYRSLNDLEKDVMLLCQNAQTFNLEGSLIYEDSIVLQSVFTSVRQKIEK
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pF1KE2 EEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDDKGRDKGKG-KKRPNRG-KAKPV
:..:: : .::::: .:: ::::..::::::::..:. :..:. :: ..::.:: .::::
XP_016 EDDSEGEESEEEEEGEEEGSESESRSVKVKIKLGRKE-KAQDRLKGGRRRPSRGSRAKPV
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1570 1580 1590
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::: ::.:::.: ... :: :
XP_016 VSDDDSEEEQEEDRSGSGSEED
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.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.::::::::::
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pF1KE2 EDEEGYRKLIDQKKDRRLAYLLQQTDEYVANLTNLVWEHKQAQAAKEKKKRRRRKKKAEE
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NP_001 EDEEGYRKLIDQKKDKRLAYLLQQTDEYVANLTELVRQHKAAQVAKEKKKKKKKKK--AE
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:::: :.::::::.::.:::::::::: :.:.::.: : .::::.::.::::::::::
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pF1KE2 VAPRSDSEESDSDYEEEDEEEESSRQET-------EEKILLDPNSEEVSEKDAKQIIETA
:::::::::: :. :::.::::. . :.: . ::.:..::: ::..:::.:
NP_001 VAPRSDSEESGSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDDVSEVDARHIIENA
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::::::::.. : ::: ::::.::::..:::.:::::..::.::.::..::::.:::::
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::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::...:..
NP_001 MQAKGVLLTDGSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFSEHLGFTGGIV
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.: .:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.:.: ::::::::
NP_001 QGLDLYRASGKFELLDRILPKLRATNHKVLLFCQMTSLMTIMEDYFAYRGFKYLRLDGTT
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pF1KE2 KSEDRAALLKKFNEPGSQYFIFLLSTRAGGLGLNLQAADTVVIFDSDWNPHQDLQAQDRA
:.:::. ::: ::::::.::::::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::
NP_001 KAEDRGMLLKTFNEPGSEYFIFLLSTRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRA
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pF1KE2 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI
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::::::::::::::::::::::.::::::.:..:::::.:::::::.:::.:.:::.:::
NP_001 PSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMFGRGSRHRKEVDYSDSLTEKQWLKAIEEGTLEEIEEE
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1350 1360 1370 1380
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:: :: .:.:. :.: :. :.: : .:.::::::::::::::.:::.:.
NP_001 VRQKKSSRKRKRDSDAGSSTPTTSTRSRDKDDESKKQKKRGRPPAEKLSPNPPNLTKKMK
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1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE2 AIIDTVINYKDRCNVEKVPSNSQLEIEGNSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVD
:.:.::.::: .:::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KIVDAVIKYKD-----------------SSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVD
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1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE2 FKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFKSARQKIAK
::::::::::::::::.::::::::::.:::::::::: :::::::::::: :.:::: :
NP_001 FKKIKERIRNHKYRSLNDLEKDVMLLCQNAQTFNLEGSLIYEDSIVLQSVFTSVRQKIEK
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1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE2 EEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDDKGRDKGKG-KKRPNRG-KAKPV
:..:: : .::::: .:: ::::..::::::::..:. :..:. :: ..::.:: .::::
NP_001 EDDSEGEESEEEEEGEEEGSESESRSVKVKIKLGRKE-KAQDRLKGGRRRPSRGSRAKPV
1540 1550 1560 1570 1580 1590
1570 1580 1590
pF1KE2 VSDFDSDEEQDEREQSEGSGTDDE
::: ::.:::.: ... :: :
NP_001 VSDDDSEEEQEEDRSGSGSEED
1600 1610
>>NP_001122320 (OMIM: 603254,613325,614609) transcriptio (1613 aa)
initn: 6156 init1: 4045 opt: 7103 Z-score: 2500.1 bits: 475.5 E(89799): 1.7e-132
Smith-Waterman score: 8095; 75.8% identity (88.0% similar) in 1642 aa overlap (1-1588:1-1613)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MSTPTDP-GAMPHPGPSPGPGPSPGPILGPSPGPGPSPGSVHSMMGPSPGPPSVSHPMPT
:::: : :. :.:::::::::::: .::::::: ::::.::::::::::::..::.::
NP_001 MSTPDPPLGGTPRPGPSPGPGPSPGAMLGPSPGP--SPGSAHSMMGPSPGPPSAGHPIPT
10 20 30 40 50
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pF1KE2 MGSTDFPQEGMHQMHKPIDGIHDKGIVEDIHCGSMKGTGMRPP-HPGMGPPQSPMDQHSQ
.: .::..:::::::....:.::. .: . ..::: ::: : ::::: ::::::::
NP_001 QGPGGYPQDNMHQMHKPMESMHEKGMSDDPRYNQMKGMGMRSGGHAGMGPPPSPMDQHSQ
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pF1KE2 GYMSPHPSPLGAPEHVSSPMSGGGPTP-PQMPPSQPGALIPG-DPQAMSQPNRGPSPFSP
:: :::::. ::.:::. ..::. ::: . :: . : ::::..: ::::.::.
NP_001 GY----PSPLGGSEHASSPVPASGPSSGPQMSSGPGGAPLDGADPQALGQQNRGPTPFNQ
120 130 140 150 160 170
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pF1KE2 VQLHQLRAQILAYKMLARGQPLPETLQLAVQGKRTLPGLQQQQQQQQQQQ----------
:::::::::.::::::::::::. ::.:::::: .::.:::. .
NP_001 NQLHQLRAQIMAYKMLARGQPLPDHLQMAVQGKRPMPGMQQQMPTLPPPSVSATGPGPGP
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pF1KE2 -----------QQQQQQQQQQQQPQQQPPQPQT----QQQQQPALVNYNRPSGPGPELSG
. .. . . :.. :: :. . : :. : :: . ..
NP_001 GPGPGPGPGPAPPNYSRPHGMGGPNMPPPGPSGVPPGMPGQPPGGPPKPWPEGPMANAAA
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280 290 300 310 320
pF1KE2 P-STPQKLPVPAPGGRPSPAPPAAAQPPAAA-VPGPSVPQPA-PGQPSPVLQLQQKQSRI
: :::::: : : :::::::::. ::::. : :.. .:. :.::.:.. :.::::::
NP_001 PTSTPQKLIPPQPTGRPSPAPPAV--PPAASPVMPPQTQSPGQPAQPAPMVPLHQKQSRI
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 SPIQKPQGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLPPDLRTKATVELKALRLLNF
.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.::::::::::
NP_001 TPIQKPRGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLAGDLRTKATIELKALRLLNF
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 QRQLRQEVVACMRRDTTLETALNSKAYKRSKRQTLREARMTEKLEKQQKIEQERKRRQKH
:::::::::.::::::.::::::.:::::::::.:::::.::::::::::::::::::::
NP_001 QRQLRQEVVVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEKLEKQQKIEQERKRRQKH
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450 460 470 480 490 500
pF1KE2 QEYLNSILQHAKDFKEYHRSVAGKIQKLSKAVATWHANTEREQKKETERIEKERMRRLMA
:::::::::::::::::::::.::::::.:::::.:::::::::::.:::::::::::::
NP_001 QEYLNSILQHAKDFKEYHRSVTGKIQKLTKAVATYHANTEREQKKENERIEKERMRRLMA
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510 520 530 540 550 560
pF1KE2 EDEEGYRKLIDQKKDRRLAYLLQQTDEYVANLTNLVWEHKQAQAAKEKKKRRRRKKKAEE
:::::::::::::::.:::::::::::::::::.:: .:: ::.::::::....:: :
NP_001 EDEEGYRKLIDQKKDKRLAYLLQQTDEYVANLTELVRQHKAAQVAKEKKKKKKKKK--AE
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570 580 590 600 610 620
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:::: :.::::::.::.:::::::::: :.:.::.: : .::::.::.::::::::::
NP_001 NAEGQTPAIGPDGEPLDETSQMSDLPVKVIHVESGKILTGTDAPKAGQLEAWLEMNPGYE
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630 640 650 660 670 680
pF1KE2 VAPRSDSEESDSDYEEEDEEEESSRQET-------EEKILLDPNSEEVSEKDAKQIIETA
:::::::::: :. :::.::::. . :.: . ::.:..::: ::..:::.:
NP_001 VAPRSDSEESGSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDDVSEVDARHIIENA
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690 700 710 720 730 740
pF1KE2 KQDVDDEYSM-QYSARGSQSYYTVAHAISERVEKQSALLINGTLKHYQLQGLEWMVSLYN
::::::::.. : ::: ::::.::::..:::.:::::..::.::.::..::::.:::::
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:::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::.:::::::::::
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pF1KE2 KISYKGTPAMRRSLVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHH
:.::::.:: ::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CKLTQVLNTHYVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMT
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pF1KE2 GERVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVESQLPEKVEYVIKCDMSALQKILYRH
::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::..::::
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:::::.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::...:..
NP_001 MQAKGVLLTDGSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFSEHLGFTGGIV
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.: .:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.:.: ::::::::
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pF1KE2 KSEDRAALLKKFNEPGSQYFIFLLSTRAGGLGLNLQAADTVVIFDSDWNPHQDLQAQDRA
:.:::. ::: ::::::.::::::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::
NP_001 KAEDRGMLLKTFNEPGSEYFIFLLSTRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRA
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pF1KE2 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI
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1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KE2 LEHEEENEEEDEVPDDETLNQMIARREEEFDLFMRMDMDRRREDARNPKRKPRLMEEDEL
:::::..:::::::::::.::::::.:::::::::::.:::::.::::::::::::::::
NP_001 LEHEEQDEEEDEVPDDETVNQMIARHEEEFDLFMRMDLDRRREEARNPKRKPRLMEEDEL
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pF1KE2 PSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKIFGRGSRQRRDVDYSDALTEKQWLRAIEDGNLEEMEEE
::::::::::::::::::::::.::::::.:..:::::.:::::::.:::.:.:::.:::
NP_001 PSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMFGRGSRHRKEVDYSDSLTEKQWLKAIEEGTLEEIEEE
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1350 1360 1370 1380
pF1KE2 VRLKKRKRRRNVDKD-----PA-------KEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNPPKLTKQMN
:: :: .:.:. :.: :. :.: : .:.::::::::::::::.:::.:.
NP_001 VRQKKSSRKRKRDSDAGSSTPTTSTRSRDKDDESKKQKKRGRPPAEKLSPNPPNLTKKMK
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1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE2 AIIDTVINYKDRCNVEKVPSNSQLEIEGNSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVD
:.:.::.::: :::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KIVDAVIKYKD------------------SSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVD
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pF1KE2 FKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFKSARQKIAK
::::::::::::::::.::::::::::.:::::::::: :::::::::::: :.:::: :
NP_001 FKKIKERIRNHKYRSLNDLEKDVMLLCQNAQTFNLEGSLIYEDSIVLQSVFTSVRQKIEK
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pF1KE2 EEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDDKGRDKGKG-KKRPNRG-KAKPV
:..:: : .::::: .:: ::::..::::::::..:. :..:. :: ..::.:: .::::
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1570 1580 1590
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:::::::::: :. :::.::::. . :.: . ::.:..::: ::..:::.:
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XP_016 KAEDRGMLLKTFNEPGSEYFIFLLSTRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRA
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XP_016 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI
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:.:.::.::: :::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE2 FKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFKSARQKIAK
::::::::::::::::.::::::::::.:::::::::: :::::::::::: :.:::: :
XP_016 FKKIKERIRNHKYRSLNDLEKDVMLLCQNAQTFNLEGSLIYEDSIVLQSVFTSVRQKIEK
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pF1KE2 EEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDDKGRDKGKG-KKRPNRG-KAKPV
:..:: : .::::: .:: ::::..::::::::..:. :..:. :: ..::.:: .::::
XP_016 EDDSEGEESEEEEEGEEEGSESESRSVKVKIKLGRKE-KAQDRLKGGRRRPSRGSRAKPV
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pF1KE2 VSDFDSDEEQDEREQSEGSGTDDE
::: ::.:::.: ... :: :
XP_016 VSDDDSEEEQEEDRSGSGSEED
1600 1610
>>XP_016882654 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTED: t (1617 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE2 MSTPTDP-GAMPHPGPSPGPGPSPGPILGPSPGPGPSPGSVHSMMGPSPGPPSVSHPMPT
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XP_016 MSTPDPPLGGTPRPGPSPGPGPSPGAMLGPSPGP--SPGSAHSMMGPSPGPPSAGHPIPT
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pF1KE2 MGSTDFPQEGMHQMHKPIDGIHDKGIVEDIHCGSMKGTGMRPP-HPGMGPPQSPMDQHSQ
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pF1KE2 GYMSPHPSPLGAPEHVSSPMSGGGPTP-PQMPPSQPGALIPG-DPQAMSQPNRGPSPFSP
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XP_016 GY----PSPLGGSEHASSPVPASGPSSGPQMSSGPGGAPLDGADPQALGQQNRGPTPFNQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE2 VQLHQLRAQILAYKMLARGQPLPETLQLAVQGKRTLPGLQQQQQQQQQQQ----------
:::::::::.::::::::::::. ::.:::::: .::.:::. .
XP_016 NQLHQLRAQIMAYKMLARGQPLPDHLQMAVQGKRPMPGMQQQMPTLPPPSVSATGPGPGP
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KE2 -----------QQQQQQQQQQQQPQQQPPQPQT----QQQQQPALVNYNRPSGPGPELSG
. .. . . :.. :: :. . : :. : :: . ..
XP_016 GPGPGPGPGPAPPNYSRPHGMGGPNMPPPGPSGVPPGMPGQPPGGPPKPWPEGPMANAAA
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320
pF1KE2 P-STPQKLPVPAPGGRPSPAPPAAAQPPAAA-VPGPSVPQPA-PGQPSPVLQLQQKQSRI
: :::::: : : :::::::::. ::::. : :.. .:. :.::.:.. :.::::::
XP_016 PTSTPQKLIPPQPTGRPSPAPPAV--PPAASPVMPPQTQSPGQPAQPAPMVPLHQKQSRI
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 SPIQKPQGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLPPDLRTKATVELKALRLLNF
.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.::::::::::
XP_016 TPIQKPRGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLAGDLRTKATIELKALRLLNF
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 QRQLRQEVVACMRRDTTLETALNSKAYKRSKRQTLREARMTEKLEKQQKIEQERKRRQKH
:::::::::.::::::.::::::.:::::::::.:::::.::::::::::::::::::::
XP_016 QRQLRQEVVVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEKLEKQQKIEQERKRRQKH
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:::::::::::::::::::::.::::::.:::::.:::::::::::.:::::::::::::
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:::::::::::::::.:::::::::::::::::.:: .:: ::.::::::....:: :
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:::: :.::::::.::.:::::::::: :.:.::.: : .::::.::.::::::::::
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:::::::::: :. :::.::::. . :.: . ::.:..::: ::..:::.:
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::::::::.. : ::: ::::.::::..:::.:::::..::.::.::..::::.:::::
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:::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::.:::::::::::
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:.::::.:: ::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CKLTQVLNTHYVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMT
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::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::..::::
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:::::.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::...:..
XP_016 MQAKGVLLTDGSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFSEHLGFTGGIV
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.: .:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.:.: ::::::::
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:.:::. ::: ::::::.::::::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI
1200 1210 1220 1230 1240 1250
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pF1KE2 LEHEEENEEEDEVPDDETLNQMIARREEEFDLFMRMDMDRRREDARNPKRKPRLMEEDEL
:::::..:::::::::::.::::::.:::::::::::.:::::.::::::::::::::::
XP_016 LEHEEQDEEEDEVPDDETVNQMIARHEEEFDLFMRMDLDRRREEARNPKRKPRLMEEDEL
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pF1KE2 PSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKIFGRGSRQRRDVDYSDALTEKQWLR---AIEDGNLEEM
::::::::::::::::::::::.::::::.:..:::::.:::::::. :::.:.:::.
XP_016 PSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMFGRGSRHRKEVDYSDSLTEKQWLKTLKAIEEGTLEEI
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1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 EEEVRLKKRKRRRNVDKD-----PA-------KEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNPPKLTK
::::: :: .:.:. :.: :. :.: : .:.::::::::::::::.:::
XP_016 EEEVRQKKSSRKRKRDSDAGSSTPTTSTRSRDKDDESKKQKKRGRPPAEKLSPNPPNLTK
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1390 1400 1410 1420 1430 1440
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.:. :.:.::.::: .::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KMKKIVDAVIKYKD-----------------SSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRK
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pF1KE2 PVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFKSARQK
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pF1KE2 IAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDDKGRDKGKG-KKRPNRG-KA
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XP_016 IEKEDDSEGEESEEEEEGEEEGSESESRSVKVKIKLGRKE-KAQDRLKGGRRRPSRGSRA
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. .. . . :.. :: :. . : :. : :: . ..
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: :::::: : : :::::::::. ::::. : :.. .:. :.::.:.. :.::::::
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.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.::::::::::
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NP_001 VAPRSDSEESGSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDDVSEVDARHIIENA
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NP_001 KAEDRGMLLKTFNEPGSEYFIFLLSTRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRA
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NP_001 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI
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NP_001 PSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMFGRGSRHRKEVDYSDSLTEKQWLKTLKAIEEGTLEEI
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::::: :: .:.:. :.: :. :.: : .:.::::::::::::::.:::
NP_001 EEEVRQKKSSRKRKRDSDAGSSTPTTSTRSRDKDDESKKQKKRGRPPAEKLSPNPPNLTK
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.:. :.:.::.::: .::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KMKKIVDAVIKYKD-----------------SSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRK
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NP_001 IEKEDDSEGEESEEEEEGEEEGSESESRSVKVKIKLGRKE-KAQDRLKGGRRRPSRGSRA
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pF1KE2 KPVVSDFDSDEEQDEREQSEGSGTDDE
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NP_001 KPVVSDDDSEEEQEEDRSGSGSEED
1600 1610
>>XP_016882655 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTED: t (1616 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE2 MSTPTDP-GAMPHPGPSPGPGPSPGPILGPSPGPGPSPGSVHSMMGPSPGPPSVSHPMPT
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XP_016 QGPGGYPQDNMHQMHKPMESMHEKGMSDDPRYNQMKGMGMRSGGHAGMGPPPSPMDQHSQ
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XP_016 GY----PSPLGGSEHASSPVPASGPSSGPQMSSGPGGAPLDGADPQALGQQNRGPTPFNQ
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XP_016 NQLHQLRAQIMAYKMLARGQPLPDHLQMAVQGKRPMPGMQQQMPTLPPPSVSATGPGPGP
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XP_016 GPGPGPGPGPAPPNYSRPHGMGGPNMPPPGPSGVPPGMPGQPPGGPPKPWPEGPMANAAA
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XP_016 PTSTPQKLIPPQPTGRPSPAPPAV--PPAASPVMPPQTQSPGQPAQPAPMVPLHQKQSRI
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XP_016 VAPRSDSEESGSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDDVSEVDARHIIENA
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XP_016 KVSYKGSPAARRAFVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHH
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XP_016 CKLTQVLNTHYVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMT
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XP_016 GEKVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVEAQLPEKVEYVIKCDMSALQRVLYRH
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XP_016 MQAKGVLLTDGSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFSEHLGFTGGIV
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XP_016 KAEDRGMLLKTFNEPGSEYFIFLLSTRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRA
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XP_016 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]