Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2708
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2708, 1590 aa
1>>>pF1KE2708 1590 - 1590 aa - 1590 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.6108+/-0.00133; mu= -19.7858+/- 0.081
mean_var=663.7269+/-134.912, 0's: 0 Z-trim(116.2): 128 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.049783
statistics sampled from 16660 (16774) to 16660 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.762), E-opt: 0.2 (0.515), width: 16
Scan time: 3.470
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34977.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1590) 10647 780.9 0
CCDS34978.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1572) 9415 692.4 3e-198
CCDS54217.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1614) 7111 526.9 2e-148
CCDS54218.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1613) 7103 526.4 2.9e-148
CCDS45972.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1617) 7095 525.8 4.4e-148
CCDS45973.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1616) 7087 525.2 6.5e-148
CCDS83338.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1514) 5900 439.9 2.9e-122
CCDS12253.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1647) 5584 417.3 2.1e-115
CCDS75807.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 ( 248) 1114 95.6 2.1e-19
CCDS83339.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 ( 276) 1114 95.7 2.3e-19
CCDS75808.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 ( 278) 1114 95.7 2.3e-19
CCDS47865.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8 (2997) 1144 98.6 3.3e-19
CCDS32555.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (1966) 1046 91.4 3.1e-17
CCDS32554.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (2000) 1046 91.4 3.1e-17
CCDS32553.2 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (2059) 1046 91.4 3.2e-17
CCDS57.1 CHD5 gene_id:26038|Hs108|chr1 (1954) 1040 91.0 4.2e-17
CCDS53885.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2581) 1037 90.8 6e-17
CCDS76510.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12 (1905) 1032 90.4 6.1e-17
CCDS8552.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12 (1912) 1032 90.4 6.1e-17
CCDS45081.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2302) 1032 90.5 7e-17
CCDS13317.1 CHD6 gene_id:84181|Hs108|chr20 (2715) 1026 90.1 1.1e-16
CCDS45485.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16 (2881) 1014 89.2 2e-16
CCDS76865.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16 (2897) 1014 89.2 2.1e-16
CCDS10071.1 INO80 gene_id:54617|Hs108|chr15 (1556) 902 81.0 3.4e-14
CCDS7229.1 ERCC6 gene_id:2074|Hs108|chr10 (1493) 882 79.5 8.8e-14
CCDS10689.2 SRCAP gene_id:10847|Hs108|chr16 (3230) 848 77.3 8.7e-13
>>CCDS34977.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1590 aa)
initn: 10647 init1: 10647 opt: 10647 Z-score: 4150.9 bits: 780.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10647; 100.0% identity (100.0% similar) in 1590 aa overlap (1-1590:1-1590)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSTPTDPGAMPHPGPSPGPGPSPGPILGPSPGPGPSPGSVHSMMGPSPGPPSVSHPMPTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MSTPTDPGAMPHPGPSPGPGPSPGPILGPSPGPGPSPGSVHSMMGPSPGPPSVSHPMPTM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 GSTDFPQEGMHQMHKPIDGIHDKGIVEDIHCGSMKGTGMRPPHPGMGPPQSPMDQHSQGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GSTDFPQEGMHQMHKPIDGIHDKGIVEDIHCGSMKGTGMRPPHPGMGPPQSPMDQHSQGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 MSPHPSPLGAPEHVSSPMSGGGPTPPQMPPSQPGALIPGDPQAMSQPNRGPSPFSPVQLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MSPHPSPLGAPEHVSSPMSGGGPTPPQMPPSQPGALIPGDPQAMSQPNRGPSPFSPVQLH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QLRAQILAYKMLARGQPLPETLQLAVQGKRTLPGLQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QLRAQILAYKMLARGQPLPETLQLAVQGKRTLPGLQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQPQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 QQPPQPQTQQQQQPALVNYNRPSGPGPELSGPSTPQKLPVPAPGGRPSPAPPAAAQPPAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QQPPQPQTQQQQQPALVNYNRPSGPGPELSGPSTPQKLPVPAPGGRPSPAPPAAAQPPAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 AVPGPSVPQPAPGQPSPVLQLQQKQSRISPIQKPQGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AVPGPSVPQPAPGQPSPVLQLQQKQSRISPIQKPQGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LENLPGSLPPDLRTKATVELKALRLLNFQRQLRQEVVACMRRDTTLETALNSKAYKRSKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LENLPGSLPPDLRTKATVELKALRLLNFQRQLRQEVVACMRRDTTLETALNSKAYKRSKR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 QTLREARMTEKLEKQQKIEQERKRRQKHQEYLNSILQHAKDFKEYHRSVAGKIQKLSKAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QTLREARMTEKLEKQQKIEQERKRRQKHQEYLNSILQHAKDFKEYHRSVAGKIQKLSKAV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 ATWHANTEREQKKETERIEKERMRRLMAEDEEGYRKLIDQKKDRRLAYLLQQTDEYVANL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ATWHANTEREQKKETERIEKERMRRLMAEDEEGYRKLIDQKKDRRLAYLLQQTDEYVANL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 TNLVWEHKQAQAAKEKKKRRRRKKKAEENAEGGESALGPDGEPIDESSQMSDLPVKVTHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TNLVWEHKQAQAAKEKKKRRRRKKKAEENAEGGESALGPDGEPIDESSQMSDLPVKVTHT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 ETGKVLFGPEAPKASQLDAWLEMNPGYEVAPRSDSEESDSDYEEEDEEEESSRQETEEKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ETGKVLFGPEAPKASQLDAWLEMNPGYEVAPRSDSEESDSDYEEEDEEEESSRQETEEKI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 LLDPNSEEVSEKDAKQIIETAKQDVDDEYSMQYSARGSQSYYTVAHAISERVEKQSALLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LLDPNSEEVSEKDAKQIIETAKQDVDDEYSMQYSARGSQSYYTVAHAISERVEKQSALLI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 NGTLKHYQLQGLEWMVSLYNNNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRLNGPYLIIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NGTLKHYQLQGLEWMVSLYNNNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRLNGPYLIIV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 PLSTLSNWTYEFDKWAPSVVKISYKGTPAMRRSLVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PLSTLSNWTYEFDKWAPSVVKISYKGTPAMRRSLVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHIL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 AKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTHYVAPRRILLTGTPLQNKLPELWALLNFLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTHYVAPRRILLTGTPLQNKLPELWALLNFLLP
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 TIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGERVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVESQLPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGERVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVESQLPE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 KVEYVIKCDMSALQKILYRHMQAKGILLTDGSEKDKKGKGGAKTLMNTIMQLRKICNHPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KVEYVIKCDMSALQKILYRHMQAKGILLTDGSEKDKKGKGGAKTLMNTIMQLRKICNHPY
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 MFQHIEESFAEHLGYSNGVINGAELYRASGKFELLDRILPKLRATNHRVLLFCQMTSLMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MFQHIEESFAEHLGYSNGVINGAELYRASGKFELLDRILPKLRATNHRVLLFCQMTSLMT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 IMEDYFAFRNFLYLRLDGTTKSEDRAALLKKFNEPGSQYFIFLLSTRAGGLGLNLQAADT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IMEDYFAFRNFLYLRLDGTTKSEDRAALLKKFNEPGSQYFIFLLSTRAGGLGLNLQAADT
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 VVIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VVIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQ
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 AGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEENEEEDEVPDDETLNQMIARREEEFDLFMRMDMDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEENEEEDEVPDDETLNQMIARREEEFDLFMRMDMDR
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 RREDARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKIFGRGSRQRRDVDYSDAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RREDARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKIFGRGSRQRRDVDYSDAL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 TEKQWLRAIEDGNLEEMEEEVRLKKRKRRRNVDKDPAKEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TEKQWLRAIEDGNLEEMEEEVRLKKRKRRRNVDKDPAKEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNP
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE2 PKLTKQMNAIIDTVINYKDRCNVEKVPSNSQLEIEGNSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PKLTKQMNAIIDTVINYKDRCNVEKVPSNSQLEIEGNSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYY
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE2 ELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFK
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE2 SARQKIAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDDKGRDKGKGKKRPNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SARQKIAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDDKGRDKGKGKKRPNR
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590
pF1KE2 GKAKPVVSDFDSDEEQDEREQSEGSGTDDE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GKAKPVVSDFDSDEEQDEREQSEGSGTDDE
1570 1580 1590
>>CCDS34978.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1572 aa)
initn: 9415 init1: 9415 opt: 9415 Z-score: 3672.7 bits: 692.4 E(32554): 3e-198
Smith-Waterman score: 10481; 98.9% identity (98.9% similar) in 1590 aa overlap (1-1590:1-1572)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSTPTDPGAMPHPGPSPGPGPSPGPILGPSPGPGPSPGSVHSMMGPSPGPPSVSHPMPTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MSTPTDPGAMPHPGPSPGPGPSPGPILGPSPGPGPSPGSVHSMMGPSPGPPSVSHPMPTM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 GSTDFPQEGMHQMHKPIDGIHDKGIVEDIHCGSMKGTGMRPPHPGMGPPQSPMDQHSQGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GSTDFPQEGMHQMHKPIDGIHDKGIVEDIHCGSMKGTGMRPPHPGMGPPQSPMDQHSQGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 MSPHPSPLGAPEHVSSPMSGGGPTPPQMPPSQPGALIPGDPQAMSQPNRGPSPFSPVQLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MSPHPSPLGAPEHVSSPMSGGGPTPPQMPPSQPGALIPGDPQAMSQPNRGPSPFSPVQLH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QLRAQILAYKMLARGQPLPETLQLAVQGKRTLPGLQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QLRAQILAYKMLARGQPLPETLQLAVQGKRTLPGLQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQPQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 QQPPQPQTQQQQQPALVNYNRPSGPGPELSGPSTPQKLPVPAPGGRPSPAPPAAAQPPAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QQPPQPQTQQQQQPALVNYNRPSGPGPELSGPSTPQKLPVPAPGGRPSPAPPAAAQPPAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 AVPGPSVPQPAPGQPSPVLQLQQKQSRISPIQKPQGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AVPGPSVPQPAPGQPSPVLQLQQKQSRISPIQKPQGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LENLPGSLPPDLRTKATVELKALRLLNFQRQLRQEVVACMRRDTTLETALNSKAYKRSKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LENLPGSLPPDLRTKATVELKALRLLNFQRQLRQEVVACMRRDTTLETALNSKAYKRSKR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 QTLREARMTEKLEKQQKIEQERKRRQKHQEYLNSILQHAKDFKEYHRSVAGKIQKLSKAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QTLREARMTEKLEKQQKIEQERKRRQKHQEYLNSILQHAKDFKEYHRSVAGKIQKLSKAV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 ATWHANTEREQKKETERIEKERMRRLMAEDEEGYRKLIDQKKDRRLAYLLQQTDEYVANL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ATWHANTEREQKKETERIEKERMRRLMAEDEEGYRKLIDQKKDRRLAYLLQQTDEYVANL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 TNLVWEHKQAQAAKEKKKRRRRKKKAEENAEGGESALGPDGEPIDESSQMSDLPVKVTHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TNLVWEHKQAQAAKEKKKRRRRKKKAEENAEGGESALGPDGEPIDESSQMSDLPVKVTHT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 ETGKVLFGPEAPKASQLDAWLEMNPGYEVAPRSDSEESDSDYEEEDEEEESSRQETEEKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ETGKVLFGPEAPKASQLDAWLEMNPGYEVAPRSDSEESDSDYEEEDEEEESSRQETEEKI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 LLDPNSEEVSEKDAKQIIETAKQDVDDEYSMQYSARGSQSYYTVAHAISERVEKQSALLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LLDPNSEEVSEKDAKQIIETAKQDVDDEYSMQYSARGSQSYYTVAHAISERVEKQSALLI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 NGTLKHYQLQGLEWMVSLYNNNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRLNGPYLIIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NGTLKHYQLQGLEWMVSLYNNNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRLNGPYLIIV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 PLSTLSNWTYEFDKWAPSVVKISYKGTPAMRRSLVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PLSTLSNWTYEFDKWAPSVVKISYKGTPAMRRSLVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHIL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 AKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTHYVAPRRILLTGTPLQNKLPELWALLNFLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTHYVAPRRILLTGTPLQNKLPELWALLNFLLP
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 TIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGERVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVESQLPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGERVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVESQLPE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 KVEYVIKCDMSALQKILYRHMQAKGILLTDGSEKDKKGKGGAKTLMNTIMQLRKICNHPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KVEYVIKCDMSALQKILYRHMQAKGILLTDGSEKDKKGKGGAKTLMNTIMQLRKICNHPY
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 MFQHIEESFAEHLGYSNGVINGAELYRASGKFELLDRILPKLRATNHRVLLFCQMTSLMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MFQHIEESFAEHLGYSNGVINGAELYRASGKFELLDRILPKLRATNHRVLLFCQMTSLMT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 IMEDYFAFRNFLYLRLDGTTKSEDRAALLKKFNEPGSQYFIFLLSTRAGGLGLNLQAADT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IMEDYFAFRNFLYLRLDGTTKSEDRAALLKKFNEPGSQYFIFLLSTRAGGLGLNLQAADT
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 VVIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VVIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQ
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 AGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEENEEEDEVPDDETLNQMIARREEEFDLFMRMDMDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEENEEEDEVPDDETLNQMIARREEEFDLFMRMDMDR
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 RREDARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKIFGRGSRQRRDVDYSDAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RREDARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKIFGRGSRQRRDVDYSDAL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 TEKQWLRAIEDGNLEEMEEEVRLKKRKRRRNVDKDPAKEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TEKQWLRAIEDGNLEEMEEEVRLKKRKRRRNVDKDPAKEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNP
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE2 PKLTKQMNAIIDTVINYKDRCNVEKVPSNSQLEIEGNSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYY
::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
CCDS34 PKLTKQMNAIIDTVINYKD------------------SSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYY
1390 1400 1410 1420
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE2 ELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFK
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE2 SARQKIAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDDKGRDKGKGKKRPNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SARQKIAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDDKGRDKGKGKKRPNR
1490 1500 1510 1520 1530 1540
1570 1580 1590
pF1KE2 GKAKPVVSDFDSDEEQDEREQSEGSGTDDE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GKAKPVVSDFDSDEEQDEREQSEGSGTDDE
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:::: : :. :.:::::::::::: .::::::: ::::.::::::::::::..::.::
CCDS54 MSTPDPPLGGTPRPGPSPGPGPSPGAMLGPSPGP--SPGSAHSMMGPSPGPPSAGHPIPT
10 20 30 40 50
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.: .::..:::::::....:.::. .: . ..::: ::: : ::::: ::::::::
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60 70 80 90 100 110
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:: :::::. ::.:::. ..::. ::: . :: . : ::::..: ::::.::.
CCDS54 GY----PSPLGGSEHASSPVPASGPSSGPQMSSGPGGAPLDGADPQALGQQNRGPTPFNQ
120 130 140 150 160 170
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pF1KE2 VQLHQLRAQILAYKMLARGQPLPETLQLAVQGKRTLPGLQQQQQQQQQQQ----------
:::::::::.::::::::::::. ::.:::::: .::.:::. .
CCDS54 NQLHQLRAQIMAYKMLARGQPLPDHLQMAVQGKRPMPGMQQQMPTLPPPSVSATGPGPGP
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KE2 -----------QQQQQQQQQQQQPQQQPPQPQT----QQQQQPALVNYNRPSGPGPELSG
. .. . . :.. :: :. . : :. : :: . ..
CCDS54 GPGPGPGPGPAPPNYSRPHGMGGPNMPPPGPSGVPPGMPGQPPGGPPKPWPEGPMANAAA
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320
pF1KE2 P-STPQKLPVPAPGGRPSPAPPAAAQPPAAA-VPGPSVPQPA-PGQPSPVLQLQQKQSRI
: :::::: : : :::::::::. ::::. : :.. .:. :.::.:.. :.::::::
CCDS54 PTSTPQKLIPPQPTGRPSPAPPAV--PPAASPVMPPQTQSPGQPAQPAPMVPLHQKQSRI
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 SPIQKPQGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLPPDLRTKATVELKALRLLNF
.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.::::::::::
CCDS54 TPIQKPRGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLAGDLRTKATIELKALRLLNF
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 QRQLRQEVVACMRRDTTLETALNSKAYKRSKRQTLREARMTEKLEKQQKIEQERKRRQKH
:::::::::.::::::.::::::.:::::::::.:::::.::::::::::::::::::::
CCDS54 QRQLRQEVVVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEKLEKQQKIEQERKRRQKH
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450 460 470 480 490 500
pF1KE2 QEYLNSILQHAKDFKEYHRSVAGKIQKLSKAVATWHANTEREQKKETERIEKERMRRLMA
:::::::::::::::::::::.::::::.:::::.:::::::::::.:::::::::::::
CCDS54 QEYLNSILQHAKDFKEYHRSVTGKIQKLTKAVATYHANTEREQKKENERIEKERMRRLMA
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 EDEEGYRKLIDQKKDRRLAYLLQQTDEYVANLTNLVWEHKQAQAAKEKKKRRRRKKKAEE
:::::::::::::::.:::::::::::::::::.:: .:: ::.::::::....:: :
CCDS54 EDEEGYRKLIDQKKDKRLAYLLQQTDEYVANLTELVRQHKAAQVAKEKKKKKKKKK--AE
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570 580 590 600 610 620
pF1KE2 NAEGGESALGPDGEPIDESSQMSDLPVKVTHTETGKVLFGPEAPKASQLDAWLEMNPGYE
:::: :.::::::.::.:::::::::: :.:.::.: : .::::.::.::::::::::
CCDS54 NAEGQTPAIGPDGEPLDETSQMSDLPVKVIHVESGKILTGTDAPKAGQLEAWLEMNPGYE
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630 640 650 660 670 680
pF1KE2 VAPRSDSEESDSDYEEEDEEEESSRQET-------EEKILLDPNSEEVSEKDAKQIIETA
:::::::::: :. :::.::::. . :.: . ::.:..::: ::..:::.:
CCDS54 VAPRSDSEESGSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDDVSEVDARHIIENA
660 670 680 690 700 710
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 KQDVDDEYSM-QYSARGSQSYYTVAHAISERVEKQSALLINGTLKHYQLQGLEWMVSLYN
::::::::.. : ::: ::::.::::..:::.:::::..::.::.::..::::.:::::
CCDS54 KQDVDDEYGVSQALARGLQSYYAVAHAVTERVDKQSALMVNGVLKQYQIKGLEWLVSLYN
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750 760 770 780 790 800
pF1KE2 NNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRLNGPYLIIVPLSTLSNWTYEFDKWAPSVV
:::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::.:::::::::::
CCDS54 NNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRINGPFLIIVPLSTLSNWAYEFDKWAPSVV
780 790 800 810 820 830
810 820 830 840 850 860
pF1KE2 KISYKGTPAMRRSLVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHH
:.::::.:: ::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KVSYKGSPAARRAFVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHH
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870 880 890 900 910 920
pF1KE2 CKLTQVLNTHYVAPRRILLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMT
::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CKLTQVLNTHYVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMT
900 910 920 930 940 950
930 940 950 960 970 980
pF1KE2 GERVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVESQLPEKVEYVIKCDMSALQKILYRH
::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::..::::
CCDS54 GEKVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVEAQLPEKVEYVIKCDMSALQRVLYRH
960 970 980 990 1000 1010
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pF1KE2 MQAKGILLTDGSEKDKKGKGGAKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFAEHLGYSNGVI
:::::.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::...:..
CCDS54 MQAKGVLLTDGSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFSEHLGFTGGIV
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE2 NGAELYRASGKFELLDRILPKLRATNHRVLLFCQMTSLMTIMEDYFAFRNFLYLRLDGTT
.: .:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.:.: ::::::::
CCDS54 QGLDLYRASGKFELLDRILPKLRATNHKVLLFCQMTSLMTIMEDYFAYRGFKYLRLDGTT
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE2 KSEDRAALLKKFNEPGSQYFIFLLSTRAGGLGLNLQAADTVVIFDSDWNPHQDLQAQDRA
:.:::. ::: ::::::.::::::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::
CCDS54 KAEDRGMLLKTFNEPGSEYFIFLLSTRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRA
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE2 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KE2 LEHEEENEEEDEVPDDETLNQMIARREEEFDLFMRMDMDRRREDARNPKRKPRLMEEDEL
:::::..:::::::::::.::::::.:::::::::::.:::::.::::::::::::::::
CCDS54 LEHEEQDEEEDEVPDDETVNQMIARHEEEFDLFMRMDLDRRREEARNPKRKPRLMEEDEL
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KE2 PSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKIFGRGSRQRRDVDYSDALTEKQWLRAIEDGNLEEMEEE
::::::::::::::::::::::.::::::.:..:::::.:::::::.:::.:.:::.:::
CCDS54 PSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMFGRGSRHRKEVDYSDSLTEKQWLKAIEEGTLEEIEEE
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1350 1360 1370 1380
pF1KE2 VRLKKRKRRRNVDKD-----PA-------KEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNPPKLTKQMN
:: :: .:.:. :.: :. :.: : .:.::::::::::::::.:::.:.
CCDS54 VRQKKSSRKRKRDSDAGSSTPTTSTRSRDKDDESKKQKKRGRPPAEKLSPNPPNLTKKMK
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE2 AIIDTVINYKDRCNVEKVPSNSQLEIEGNSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVD
:.:.::.::: .:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KIVDAVIKYKD-----------------SSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVD
1440 1450 1460 1470
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE2 FKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFKSARQKIAK
::::::::::::::::.::::::::::.:::::::::: :::::::::::: :.:::: :
CCDS54 FKKIKERIRNHKYRSLNDLEKDVMLLCQNAQTFNLEGSLIYEDSIVLQSVFTSVRQKIEK
1480 1490 1500 1510 1520 1530
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE2 EEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDDKGRDKGKG-KKRPNRG-KAKPV
:..:: : .::::: .:: ::::..::::::::..:. :..:. :: ..::.:: .::::
CCDS54 EDDSEGEESEEEEEGEEEGSESESRSVKVKIKLGRKE-KAQDRLKGGRRRPSRGSRAKPV
1540 1550 1560 1570 1580 1590
1570 1580 1590
pF1KE2 VSDFDSDEEQDEREQSEGSGTDDE
::: ::.:::.: ... :: :
CCDS54 VSDDDSEEEQEEDRSGSGSEED
1600 1610
>>CCDS54218.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1613 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE2 MSTPTDP-GAMPHPGPSPGPGPSPGPILGPSPGPGPSPGSVHSMMGPSPGPPSVSHPMPT
:::: : :. :.:::::::::::: .::::::: ::::.::::::::::::..::.::
CCDS54 MSTPDPPLGGTPRPGPSPGPGPSPGAMLGPSPGP--SPGSAHSMMGPSPGPPSAGHPIPT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 MGSTDFPQEGMHQMHKPIDGIHDKGIVEDIHCGSMKGTGMRPP-HPGMGPPQSPMDQHSQ
.: .::..:::::::....:.::. .: . ..::: ::: : ::::: ::::::::
CCDS54 QGPGGYPQDNMHQMHKPMESMHEKGMSDDPRYNQMKGMGMRSGGHAGMGPPPSPMDQHSQ
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 GYMSPHPSPLGAPEHVSSPMSGGGPTP-PQMPPSQPGALIPG-DPQAMSQPNRGPSPFSP
:: :::::. ::.:::. ..::. ::: . :: . : ::::..: ::::.::.
CCDS54 GY----PSPLGGSEHASSPVPASGPSSGPQMSSGPGGAPLDGADPQALGQQNRGPTPFNQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE2 VQLHQLRAQILAYKMLARGQPLPETLQLAVQGKRTLPGLQQQQQQQQQQQ----------
:::::::::.::::::::::::. ::.:::::: .::.:::. .
CCDS54 NQLHQLRAQIMAYKMLARGQPLPDHLQMAVQGKRPMPGMQQQMPTLPPPSVSATGPGPGP
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KE2 -----------QQQQQQQQQQQQPQQQPPQPQT----QQQQQPALVNYNRPSGPGPELSG
. .. . . :.. :: :. . : :. : :: . ..
CCDS54 GPGPGPGPGPAPPNYSRPHGMGGPNMPPPGPSGVPPGMPGQPPGGPPKPWPEGPMANAAA
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320
pF1KE2 P-STPQKLPVPAPGGRPSPAPPAAAQPPAAA-VPGPSVPQPA-PGQPSPVLQLQQKQSRI
: :::::: : : :::::::::. ::::. : :.. .:. :.::.:.. :.::::::
CCDS54 PTSTPQKLIPPQPTGRPSPAPPAV--PPAASPVMPPQTQSPGQPAQPAPMVPLHQKQSRI
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 SPIQKPQGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLPPDLRTKATVELKALRLLNF
.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.::::::::::
CCDS54 TPIQKPRGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLAGDLRTKATIELKALRLLNF
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390 400 410 420 430 440
pF1KE2 QRQLRQEVVACMRRDTTLETALNSKAYKRSKRQTLREARMTEKLEKQQKIEQERKRRQKH
:::::::::.::::::.::::::.:::::::::.:::::.::::::::::::::::::::
CCDS54 QRQLRQEVVVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEKLEKQQKIEQERKRRQKH
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pF1KE2 QEYLNSILQHAKDFKEYHRSVAGKIQKLSKAVATWHANTEREQKKETERIEKERMRRLMA
:::::::::::::::::::::.::::::.:::::.:::::::::::.:::::::::::::
CCDS54 QEYLNSILQHAKDFKEYHRSVTGKIQKLTKAVATYHANTEREQKKENERIEKERMRRLMA
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pF1KE2 EDEEGYRKLIDQKKDRRLAYLLQQTDEYVANLTNLVWEHKQAQAAKEKKKRRRRKKKAEE
:::::::::::::::.:::::::::::::::::.:: .:: ::.::::::....:: :
CCDS54 EDEEGYRKLIDQKKDKRLAYLLQQTDEYVANLTELVRQHKAAQVAKEKKKKKKKKK--AE
540 550 560 570 580 590
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pF1KE2 NAEGGESALGPDGEPIDESSQMSDLPVKVTHTETGKVLFGPEAPKASQLDAWLEMNPGYE
:::: :.::::::.::.:::::::::: :.:.::.: : .::::.::.::::::::::
CCDS54 NAEGQTPAIGPDGEPLDETSQMSDLPVKVIHVESGKILTGTDAPKAGQLEAWLEMNPGYE
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pF1KE2 VAPRSDSEESDSDYEEEDEEEESSRQET-------EEKILLDPNSEEVSEKDAKQIIETA
:::::::::: :. :::.::::. . :.: . ::.:..::: ::..:::.:
CCDS54 VAPRSDSEESGSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDDVSEVDARHIIENA
660 670 680 690 700 710
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pF1KE2 KQDVDDEYSM-QYSARGSQSYYTVAHAISERVEKQSALLINGTLKHYQLQGLEWMVSLYN
::::::::.. : ::: ::::.::::..:::.:::::..::.::.::..::::.:::::
CCDS54 KQDVDDEYGVSQALARGLQSYYAVAHAVTERVDKQSALMVNGVLKQYQIKGLEWLVSLYN
720 730 740 750 760 770
750 760 770 780 790 800
pF1KE2 NNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRLNGPYLIIVPLSTLSNWTYEFDKWAPSVV
:::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::.:::::::::::
CCDS54 NNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRINGPFLIIVPLSTLSNWAYEFDKWAPSVV
780 790 800 810 820 830
810 820 830 840 850 860
pF1KE2 KISYKGTPAMRRSLVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHH
:.::::.:: ::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KVSYKGSPAARRAFVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHH
840 850 860 870 880 890
870 880 890 900 910 920
pF1KE2 CKLTQVLNTHYVAPRRILLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMT
::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CKLTQVLNTHYVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMT
900 910 920 930 940 950
930 940 950 960 970 980
pF1KE2 GERVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVESQLPEKVEYVIKCDMSALQKILYRH
::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::..::::
CCDS54 GEKVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVEAQLPEKVEYVIKCDMSALQRVLYRH
960 970 980 990 1000 1010
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE2 MQAKGILLTDGSEKDKKGKGGAKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFAEHLGYSNGVI
:::::.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::...:..
CCDS54 MQAKGVLLTDGSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFSEHLGFTGGIV
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE2 NGAELYRASGKFELLDRILPKLRATNHRVLLFCQMTSLMTIMEDYFAFRNFLYLRLDGTT
.: .:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.:.: ::::::::
CCDS54 QGLDLYRASGKFELLDRILPKLRATNHKVLLFCQMTSLMTIMEDYFAYRGFKYLRLDGTT
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pF1KE2 KSEDRAALLKKFNEPGSQYFIFLLSTRAGGLGLNLQAADTVVIFDSDWNPHQDLQAQDRA
:.:::. ::: ::::::.::::::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::
CCDS54 KAEDRGMLLKTFNEPGSEYFIFLLSTRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRA
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1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE2 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KE2 LEHEEENEEEDEVPDDETLNQMIARREEEFDLFMRMDMDRRREDARNPKRKPRLMEEDEL
:::::..:::::::::::.::::::.:::::::::::.:::::.::::::::::::::::
CCDS54 LEHEEQDEEEDEVPDDETVNQMIARHEEEFDLFMRMDLDRRREEARNPKRKPRLMEEDEL
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KE2 PSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKIFGRGSRQRRDVDYSDALTEKQWLRAIEDGNLEEMEEE
::::::::::::::::::::::.::::::.:..:::::.:::::::.:::.:.:::.:::
CCDS54 PSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMFGRGSRHRKEVDYSDSLTEKQWLKAIEEGTLEEIEEE
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1350 1360 1370 1380
pF1KE2 VRLKKRKRRRNVDKD-----PA-------KEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNPPKLTKQMN
:: :: .:.:. :.: :. :.: : .:.::::::::::::::.:::.:.
CCDS54 VRQKKSSRKRKRDSDAGSSTPTTSTRSRDKDDESKKQKKRGRPPAEKLSPNPPNLTKKMK
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE2 AIIDTVINYKDRCNVEKVPSNSQLEIEGNSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVD
:.:.::.::: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KIVDAVIKYKD------------------SSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVD
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pF1KE2 FKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFKSARQKIAK
::::::::::::::::.::::::::::.:::::::::: :::::::::::: :.:::: :
CCDS54 FKKIKERIRNHKYRSLNDLEKDVMLLCQNAQTFNLEGSLIYEDSIVLQSVFTSVRQKIEK
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pF1KE2 EEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDDKGRDKGKG-KKRPNRG-KAKPV
:..:: : .::::: .:: ::::..::::::::..:. :..:. :: ..::.:: .::::
CCDS54 EDDSEGEESEEEEEGEEEGSESESRSVKVKIKLGRKE-KAQDRLKGGRRRPSRGSRAKPV
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1570 1580 1590
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CCDS54 VSDDDSEEEQEEDRSGSGSEED
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.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.::::::::::
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:::::::::::::::::::::.::::::.:::::.:::::::::::.:::::::::::::
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CCDS45 EDEEGYRKLIDQKKDKRLAYLLQQTDEYVANLTELVRQHKAAQVAKEKKKKKKKKK--AE
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:::: :.::::::.::.:::::::::: :.:.::.: : .::::.::.::::::::::
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:::::::::: :. :::.::::. . :.: . ::.:..::: ::..:::.:
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pF1KE2 KQDVDDEYSM-QYSARGSQSYYTVAHAISERVEKQSALLINGTLKHYQLQGLEWMVSLYN
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::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CKLTQVLNTHYVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMT
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:::::.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::...:..
CCDS45 MQAKGVLLTDGSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFSEHLGFTGGIV
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.: .:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.:.: ::::::::
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:.:::. ::: ::::::.::::::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::
CCDS45 KAEDRGMLLKTFNEPGSEYFIFLLSTRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRA
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pF1KE2 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI
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:::::..:::::::::::.::::::.:::::::::::.:::::.::::::::::::::::
CCDS45 LEHEEQDEEEDEVPDDETVNQMIARHEEEFDLFMRMDLDRRREEARNPKRKPRLMEEDEL
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pF1KE2 PSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKIFGRGSRQRRDVDYSDALTEKQWLR---AIEDGNLEEM
::::::::::::::::::::::.::::::.:..:::::.:::::::. :::.:.:::.
CCDS45 PSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMFGRGSRHRKEVDYSDSLTEKQWLKTLKAIEEGTLEEI
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1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 EEEVRLKKRKRRRNVDKD-----PA-------KEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNPPKLTK
::::: :: .:.:. :.: :. :.: : .:.::::::::::::::.:::
CCDS45 EEEVRQKKSSRKRKRDSDAGSSTPTTSTRSRDKDDESKKQKKRGRPPAEKLSPNPPNLTK
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pF1KE2 QMNAIIDTVINYKDRCNVEKVPSNSQLEIEGNSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRK
.:. :.:.::.::: .::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KMKKIVDAVIKYKD-----------------SSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRK
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pF1KE2 PVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFKSARQK
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CCDS45 PVDFKKIKERIRNHKYRSLNDLEKDVMLLCQNAQTFNLEGSLIYEDSIVLQSVFTSVRQK
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pF1KE2 IAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDDKGRDKGKG-KKRPNRG-KA
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CCDS45 IEKEDDSEGEESEEEEEGEEEGSESESRSVKVKIKLGRKE-KAQDRLKGGRRRPSRGSRA
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1570 1580 1590
pF1KE2 KPVVSDFDSDEEQDEREQSEGSGTDDE
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CCDS45 KPVVSDDDSEEEQEEDRSGSGSEED
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CCDS45 MSTPDPPLGGTPRPGPSPGPGPSPGAMLGPSPGP--SPGSAHSMMGPSPGPPSAGHPIPT
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CCDS45 QGPGGYPQDNMHQMHKPMESMHEKGMSDDPRYNQMKGMGMRSGGHAGMGPPPSPMDQHSQ
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CCDS45 GY----PSPLGGSEHASSPVPASGPSSGPQMSSGPGGAPLDGADPQALGQQNRGPTPFNQ
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CCDS45 NQLHQLRAQIMAYKMLARGQPLPDHLQMAVQGKRPMPGMQQQMPTLPPPSVSATGPGPGP
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CCDS45 EDEEGYRKLIDQKKDKRLAYLLQQTDEYVANLTELVRQHKAAQVAKEKKKKKKKKK--AE
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CCDS45 VAPRSDSEESGSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDDVSEVDARHIIENA
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CCDS45 KVSYKGSPAARRAFVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHH
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930 940 950 960 970 980
pF1KE2 GERVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVESQLPEKVEYVIKCDMSALQKILYRH
::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::..::::
CCDS45 GEKVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVEAQLPEKVEYVIKCDMSALQRVLYRH
960 970 980 990 1000 1010
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE2 MQAKGILLTDGSEKDKKGKGGAKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFAEHLGYSNGVI
:::::.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::...:..
CCDS45 MQAKGVLLTDGSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFSEHLGFTGGIV
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE2 NGAELYRASGKFELLDRILPKLRATNHRVLLFCQMTSLMTIMEDYFAFRNFLYLRLDGTT
.: .:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.:.: ::::::::
CCDS45 QGLDLYRASGKFELLDRILPKLRATNHKVLLFCQMTSLMTIMEDYFAYRGFKYLRLDGTT
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE2 KSEDRAALLKKFNEPGSQYFIFLLSTRAGGLGLNLQAADTVVIFDSDWNPHQDLQAQDRA
:.:::. ::: ::::::.::::::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::
CCDS45 KAEDRGMLLKTFNEPGSEYFIFLLSTRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRA
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE2 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KE2 LEHEEENEEEDEVPDDETLNQMIARREEEFDLFMRMDMDRRREDARNPKRKPRLMEEDEL
:::::..:::::::::::.::::::.:::::::::::.:::::.::::::::::::::::
CCDS45 LEHEEQDEEEDEVPDDETVNQMIARHEEEFDLFMRMDLDRRREEARNPKRKPRLMEEDEL
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1290 1300 1310 1320 1330
pF1KE2 PSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKIFGRGSRQRRDVDYSDALTEKQWLR---AIEDGNLEEM
::::::::::::::::::::::.::::::.:..:::::.:::::::. :::.:.:::.
CCDS45 PSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMFGRGSRHRKEVDYSDSLTEKQWLKTLKAIEEGTLEEI
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 EEEVRLKKRKRRRNVDKD-----PA-------KEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNPPKLTK
::::: :: .:.:. :.: :. :.: : .:.::::::::::::::.:::
CCDS45 EEEVRQKKSSRKRKRDSDAGSSTPTTSTRSRDKDDESKKQKKRGRPPAEKLSPNPPNLTK
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE2 QMNAIIDTVINYKDRCNVEKVPSNSQLEIEGNSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRK
.:. :.:.::.::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KMKKIVDAVIKYKD------------------SSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRK
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1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE2 PVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFKSARQK
:::::::::::::::::::.::::::::::.:::::::::: :::::::::::: :.:::
CCDS45 PVDFKKIKERIRNHKYRSLNDLEKDVMLLCQNAQTFNLEGSLIYEDSIVLQSVFTSVRQK
1480 1490 1500 1510 1520 1530
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE2 IAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDDKGRDKGKG-KKRPNRG-KA
: ::..:: : .::::: .:: ::::..::::::::..:. :..:. :: ..::.:: .:
CCDS45 IEKEDDSEGEESEEEEEGEEEGSESESRSVKVKIKLGRKE-KAQDRLKGGRRRPSRGSRA
1540 1550 1560 1570 1580 1590
1570 1580 1590
pF1KE2 KPVVSDFDSDEEQDEREQSEGSGTDDE
:::::: ::.:::.: ... :: :
CCDS45 KPVVSDDDSEEEQEEDRSGSGSEED
1600 1610
>>CCDS83338.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1514 aa)
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10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MSTPTDPGAMPHPGPSPGPGPSPGPILGPSPGPGPSPGSVHSMMGPSPGPPSVSHPMPTM
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pF1KE2 GSTDFPQEGMHQMHKPIDGIHDKGIVEDIHCGSMKGTGMRPPHPGMGPPQSPMDQHSQGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GSTDFPQEGMHQMHKPIDGIHDKGIVEDIHCGSMKGTGMRPPHPGMGPPQSPMDQHSQGY
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MSPHPSPLGAPEHVSSPMSGGGPTPPQMPPSQPGALIPGDPQAMSQPNRGPSPFSPVQLH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 QLRAQILAYKMLARGQPLPETLQLAVQGKRTLPGLQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQPQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 QQPPQPQTQQQQQPALVNYNRPSGPGPELSGPSTPQKLPVPAPGGRPSPAPPAAAQPPAA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 AVPGPSVPQPAPGQPSPVLQLQQKQSRISPIQKPQGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LENLPGSLPPDLRTKATVELKALRLLNFQRQLRQEVVACMRRDTTLETALNSKAYKRSKR
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 QTLREARMTEKLEKQQKIEQERKRRQKHQEYLNSILQHAKDFKEYHRSVAGKIQKLSKAV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ATWHANTEREQKKETERIEKERMRRLMAEDEEGYRKLIDQKKDRRLAYLLQQTDEYVANL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 TNLVWEHKQAQAAKEKKKRRRRKKKAEENAEGGESALGPDGEPIDESSQMSDLPVKVTHT
550 560 570 580 590 600
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ETGKVLFGPEAPKASQLDAWLEMNPGYEVAPRSDSEESDSDYEEEDEEEESSRQETEEKI
610 620 630 640 650 660
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pF1KE2 LLDPNSEEVSEKDAKQIIETAKQDVDDEYSMQYSARGSQSYYTVAHAISERVEKQSALLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LLDPNSEEVSEKDAKQIIETAKQDVDDEYSMQYSARGSQSYYTVAHAISERVEKQSALLI
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pF1KE2 NGTLKHYQLQGLEWMVSLYNNNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRLNGPYLIIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 NGTLKHYQLQGLEWMVSLYNNNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRLNGPYLIIV
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pF1KE2 PLSTLSNWTYEFDKWAPSVVKISYKGTPAMRRSLVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PLSTLSNWTYEFDKWAPSVVKISYKGTPAMRRSLVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHIL
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::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 AKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQV----------------------------------
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pF1KE2 TIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGERVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVESQLPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ------------------------DLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVESQLPE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 KVEYVIKCDMSALQKILYRHMQAKGILLTDGSEKDKKGKGGAKTLMNTIMQLRKICNHPY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MFQHIEESFAEHLGYSNGVINGAELYRASGKFELLDRILPKLRATNHRVLLFCQMTSLMT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 IMEDYFAFRNFLYLRLDGTTKSEDRAALLKKFNEPGSQYFIFLLSTRAGGLGLNLQAADT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 VVIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQ
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KE2 AGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEENEEEDEVPDDETLNQMIARREEEFDLFMRMDMDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 AGMFDQKSSSHERRAFLQAILEHEEENEEEDEVPDDETLNQMIARREEEFDLFMRMDMDR
1150 1160 1170 1180 1190 1200
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pF1KE2 RREDARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKIFGRGSRQRRDVDYSDAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RREDARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKIFGRGSRQRRDVDYSDAL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 TEKQWLRAIEDGNLEEMEEEVRLKKRKRRRNVDKDPAKEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 TEKQWLRAIEDGNLEEMEEEVRLKKRKRRRNVDKDPAKEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNP
1270 1280 1290 1300 1310 1320
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pF1KE2 PKLTKQMNAIIDTVINYKDRCNVEKVPSNSQLEIEGNSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYY
::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
CCDS83 PKLTKQMNAIIDTVINYKD------------------SSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYY
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pF1KE2 ELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFK
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE2 SARQKIAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDDKGRDKGKGKKRPNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SARQKIAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVKVKIKLNKKDDKGRDKGKGKKRPNR
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1570 1580 1590
pF1KE2 GKAKPVVSDFDSDEEQDEREQSEGSGTDDE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GKAKPVVSDFDSDEEQDEREQSEGSGTDDE
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>>CCDS12253.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1647 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE2 MSTPTDP-GAMPHPGPSPGPGPSPGPILGPSPGPGPSPGSVHSMMGPSPGPPSVSHPMPT
:::: : :. :.:::::::::::: .::::::: ::::.::::::::::::..::.::
CCDS12 MSTPDPPLGGTPRPGPSPGPGPSPGAMLGPSPGP--SPGSAHSMMGPSPGPPSAGHPIPT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 MGSTDFPQEGMHQMHKPIDGIHDKGIVEDIHCGSMKGTGMRPP-HPGMGPPQSPMDQHSQ
.: .::..:::::::....:.::. .: . ..::: ::: : ::::: ::::::::
CCDS12 QGPGGYPQDNMHQMHKPMESMHEKGMSDDPRYNQMKGMGMRSGGHAGMGPPPSPMDQHSQ
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 GYMSPHPSPLGAPEHVSSPMSGGGPTP-PQMPPSQPGALIPG-DPQAMSQPNRGPSPFSP
:: :::::. ::.:::. ..::. ::: . :: . : ::::..: ::::.::.
CCDS12 GY----PSPLGGSEHASSPVPASGPSSGPQMSSGPGGAPLDGADPQALGQQNRGPTPFNQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE2 VQLHQLRAQILAYKMLARGQPLPETLQLAVQGKRTLPGLQQQQQQQQQQQ----------
:::::::::.::::::::::::. ::.:::::: .::.:::. .
CCDS12 NQLHQLRAQIMAYKMLARGQPLPDHLQMAVQGKRPMPGMQQQMPTLPPPSVSATGPGPGP
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KE2 -----------QQQQQQQQQQQQPQQQPPQPQT----QQQQQPALVNYNRPSGPGPELSG
. .. . . :.. :: :. . : :. : :: . ..
CCDS12 GPGPGPGPGPAPPNYSRPHGMGGPNMPPPGPSGVPPGMPGQPPGGPPKPWPEGPMANAAA
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320
pF1KE2 P-STPQKLPVPAPGGRPSPAPPAAAQPPAAA-VPGPSVPQPA-PGQPSPVLQLQQKQSRI
: :::::: : : :::::::::. ::::. : :.. .:. :.::.:.. :.::::::
CCDS12 PTSTPQKLIPPQPTGRPSPAPPAV--PPAASPVMPPQTQSPGQPAQPAPMVPLHQKQSRI
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 SPIQKPQGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLPPDLRTKATVELKALRLLNF
.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.::::::::::
CCDS12 TPIQKPRGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLAGDLRTKATIELKALRLLNF
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 QRQLRQEVVACMRRDTTLETALNSKAYKRSKRQTLREARMTEKLEKQQKIEQERKRRQKH
:::::::::.::::::.::::::.:::::::::.:::::.::::::::::::::::::::
CCDS12 QRQLRQEVVVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEKLEKQQKIEQERKRRQKH
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 QEYLNSILQHAKDFKEYHRSVAGKIQKLSKAVATWHANTEREQKKETERIEKERMRRLMA
:::::::::::::::::::::.::::::.:::::.:::::::::::.:::::::::::::
CCDS12 QEYLNSILQHAKDFKEYHRSVTGKIQKLTKAVATYHANTEREQKKENERIEKERMRRLMA
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 EDEEGYRKLIDQKKDRRLAYLLQQTDEYVANLTNLVWEHKQAQAAKEKKKRRRRKKKAEE
:::::::::::::::.:::::::::::::::::.:: .:: ::.::::::....:: :
CCDS12 EDEEGYRKLIDQKKDKRLAYLLQQTDEYVANLTELVRQHKAAQVAKEKKKKKKKKK--AE
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 NAEGGESALGPDGEPIDESSQMSDLPVKVTHTETGKVLFGPEAPKASQLDAWLEMNPGYE
:::: :.::::::.::.:::::::::: :.:.::.: : .::::.::.::::::::::
CCDS12 NAEGQTPAIGPDGEPLDETSQMSDLPVKVIHVESGKILTGTDAPKAGQLEAWLEMNPGYE
600 610 620 630 640 650
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 VAPRSDSEESDSDYEEEDEEEESSRQET-------EEKILLDPNSEEVSEKDAKQIIETA
:::::::::: :. :::.::::. . :.: . ::.:..::: ::..:::.:
CCDS12 VAPRSDSEESGSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDDVSEVDARHIIENA
660 670 680 690 700 710
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 KQDVDDEYSM-QYSARGSQSYYTVAHAISERVEKQSALLINGTLKHYQLQGLEWMVSLYN
::::::::.. : ::: ::::.::::..:::.:::::..::.::.::..::::.:::::
CCDS12 KQDVDDEYGVSQALARGLQSYYAVAHAVTERVDKQSALMVNGVLKQYQIKGLEWLVSLYN
720 730 740 750 760 770
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pF1KE2 NNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRLNGPYLIIVPLSTLSNWTYEFDKWAPSVV
:::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::.:::::::::::
CCDS12 NNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRINGPFLIIVPLSTLSNWAYEFDKWAPSVV
780 790 800 810 820 830
810 820 830 840 850 860
pF1KE2 KISYKGTPAMRRSLVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHH
:.::::.:: ::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KVSYKGSPAARRAFVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHH
840 850 860 870 880 890
870 880 890 900 910 920
pF1KE2 CKLTQVLNTHYVAPRRILLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMT
::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CKLTQVLNTHYVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMT
900 910 920 930 940 950
930 940 950 960 970 980
pF1KE2 GERVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVESQLPEKVEYVIKCDMSALQKILYRH
::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::..::::
CCDS12 GEKVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVEAQLPEKVEYVIKCDMSALQRVLYRH
960 970 980 990 1000 1010
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE2 MQAKGILLTDGSEKDKKGKGGAKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFAEHLGYSNGVI
:::::.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::...:..
CCDS12 MQAKGVLLTDGSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKICNHPYMFQHIEESFSEHLGFTGGIV
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE2 NGAELYRASGKFELLDRILPKLRATNHRVLLFCQMTSLMTIMEDYFAFRNFLYLRLDGTT
.: .:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.:.: ::::::::
CCDS12 QGLDLYRASGKFELLDRILPKLRATNHKVLLFCQMTSLMTIMEDYFAYRGFKYLRLDGTT
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE2 KSEDRAALLKKFNEPGSQYFIFLLSTRAGGLGLNLQAADTVVIFDSDWNPHQDLQAQDRA
:.:::. ::: ::::::.::::::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::
CCDS12 KAEDRGMLLKTFNEPGSEYFIFLLSTRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRA
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE2 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI
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CCDS12 HRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1230 1240
pF1KE2 LEHEEENE---------------------------------EEDEVPDDETLNQMIARRE
:::::..: ::::::::::.::::::.:
CCDS12 LEHEEQDESRHCSTGSGSASFAHTAPPPAGVNPDLEEPPLKEEDEVPDDETVNQMIARHE
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KE2 EEFDLFMRMDMDRRREDARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKIFGRG
::::::::::.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS12 EEFDLFMRMDLDRRREEARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEKMFGRG
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1310 1320 1330 1340 1350
pF1KE2 SRQRRDVDYSDALTEKQWLRAIEDGNLEEMEEEVRLKKRKRRRNVDKD-----PA-----
::.:..:::::.:::::::.:::.:.:::.::::: :: .:.:. :.: :.
CCDS12 SRHRKEVDYSDSLTEKQWLKAIEEGTLEEIEEEVRQKKSSRKRKRDSDAGSSTPTTSTRS
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KE2 --KEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNPPKLTKQMNAIIDTVINYKDRCNVEKVPSNSQLEIE
:.: : .:.::::::::::::::.:::.:. :.:.::.:::
CCDS12 RDKDDESKKQKKRGRPPAEKLSPNPPNLTKKMKKIVDAVIKYKD----------------
1440 1450 1460 1470
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KE2 GNSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLC
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS12 -SSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLNDLEKDVMLLC
1480 1490 1500 1510 1520 1530
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KE2 HNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFKSARQKIAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSV
.:::::::::: :::::::::::: :.:::: ::..:: : .::::: .:: ::::..::
CCDS12 QNAQTFNLEGSLIYEDSIVLQSVFTSVRQKIEKEDDSEGEESEEEEEGEEEGSESESRSV
1540 1550 1560 1570 1580 1590
1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KE2 KVKIKLNKKDDKGRDKGKG-KKRPNRG-KAKPVVSDFDSDEEQDEREQSEGSGTDDE
::::::..:. :..:. :: ..::.:: .::::::: ::.:::.: ... :: :
CCDS12 KVKIKLGRKE-KAQDRLKGGRRRPSRGSRAKPVVSDDDSEEEQEEDRSGSGSEED
1600 1610 1620 1630 1640
>>CCDS75807.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (248 aa)
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1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KE2 TCEEEEEKIFGRGSRQRRDVDYSDALTEKQWLRAIEDGNLEEMEEEVRLKKRKRRRNVDK
:: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MWL-AIEDGNLEEMEEEVRLKKRKRRRNVDK
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pF1KE2 DPAKEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNPPKLTKQMNAIIDTVINYKDRCNVEKVPSNSQLEI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DPAKEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNPPKLTKQMNAIIDTVINYKD---------------
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pF1KE2 EGNSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ---SSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLL
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pF1KE2 CHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFKSARQKIAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 CHNAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFKSARQKIAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKS
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pF1KE2 VKVKIKLNKKDDKGRDKGKGKKRPNRGKAKPVVSDFDSDEEQDEREQSEGSGTDDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VKVKIKLNKKDDKGRDKGKGKKRPNRGKAKPVVSDFDSDEEQDEREQSEGSGTDDE
200 210 220 230 240
>>CCDS83339.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (276 aa)
initn: 1114 init1: 1114 opt: 1114 Z-score: 461.2 bits: 95.7 E(32554): 2.3e-19
Smith-Waterman score: 1539; 92.8% identity (93.2% similar) in 264 aa overlap (1327-1590:31-276)
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KE2 EEEEEKIFGRGSRQRRDVDYSDALTEKQWLRAIEDGNLEEMEEEVRLKKRKRRRNVDKDP
.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MKRLAARCFAGLLILSPLTVISDSRPADSGKAIEDGNLEEMEEEVRLKKRKRRRNVDKDP
10 20 30 40 50 60
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pF1KE2 AKEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNPPKLTKQMNAIIDTVINYKDRCNVEKVPSNSQLEIEG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 AKEDVEKAKKRRGRPPAEKLSPNPPKLTKQMNAIIDTVINYKD-----------------
70 80 90 100
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pF1KE2 NSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 -SSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLGDLEKDVMLLCH
110 120 130 140 150 160
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pF1KE2 NAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFKSARQKIAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 NAQTFNLEGSQIYEDSIVLQSVFKSARQKIAKEEESEDESNEEEEEEDEEESESEAKSVK
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pF1KE2 VKIKLNKKDDKGRDKGKGKKRPNRGKAKPVVSDFDSDEEQDEREQSEGSGTDDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 VKIKLNKKDDKGRDKGKGKKRPNRGKAKPVVSDFDSDEEQDEREQSEGSGTDDE
230 240 250 260 270
1590 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Feb 8 18:22:25 2018 done: Thu Feb 8 18:22:26 2018
Total Scan time: 3.470 Total Display time: 0.520
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]