FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2698, 770 aa
1>>>pF1KE2698 770 - 770 aa - 770 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6173+/-0.00121; mu= 8.9338+/- 0.072
mean_var=127.5612+/-26.452, 0's: 0 Z-trim(104.6): 57 B-trim: 47 in 1/51
Lambda= 0.113557
statistics sampled from 7942 (7971) to 7942 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.608), E-opt: 0.2 (0.245), width: 16
Scan time: 3.860
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS42793.1 STAT1 gene_id:6772|Hs108|chr2 ( 712) 2614 440.5 4.4e-123
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CCDS8931.1 STAT6 gene_id:6778|Hs108|chr12 ( 847) 603 111.1 7.7e-24
CCDS74066.1 STAT5A gene_id:6776|Hs108|chr17 ( 763) 406 78.8 3.6e-14
>>CCDS32656.1 STAT3 gene_id:6774|Hs108|chr17 (770 aa)
initn: 5139 init1: 5139 opt: 5139 Z-score: 4558.3 bits: 854.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5139; 100.0% identity (100.0% similar) in 770 aa overlap (1-770:1-770)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LGEIDQQYSRFLQESNVLYQHNLRRIKQFLQSRYLEKPMEIARIVARCLWEESRLLQTAA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TAAQQGGQANHPTAAVVTEKQQMLEQHLQDVRKRVQDLEQKMKVVENLQDDFDFNYKTLK
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190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SQGDMQDLNGNNQSVTRQKMQQLEQMLTALDQMRRSIVSELAGLLSAMEYVQKTLTDEEL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HRPMLEERIVELFRNLMKSAFVVERQPCMPMHPDRPLVIKTGVQFTTKVRLLVKFPELNY
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370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QLKIKVCIDKDSGDVAALRGSRKFNILGTNTKVMNMEESNNGSLSAEFKHLTLREQRCGN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 GGRANCDASLIVTEELHLITFETEVYHQGLKIDLETHSLPVVVISNICQMPNAWASILWY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GGRANCDASLIVTEELHLITFETEVYHQGLKIDLETHSLPVVVISNICQMPNAWASILWY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 NMLTNNPKNVNFFTKPPIGTWDQVAEVLSWQFSSTTKRGLSIEQLTTLAEKLLGPGVNYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NMLTNNPKNVNFFTKPPIGTWDQVAEVLSWQFSSTTKRGLSIEQLTTLAEKLLGPGVNYS
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550 560 570 580 590 600
pF1KE2 GCQITWAKFCKENMAGKGFSFWVWLDNIIDLVKKYILALWNEGYIMGFISKERERAILST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GCQITWAKFCKENMAGKGFSFWVWLDNIIDLVKKYILALWNEGYIMGFISKERERAILST
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KPPGTFLLRFSESSKEGGVTFTWVEKDISGKTQIQSVEPYTKQQLNNMSFAEIIMGYKIM
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670 680 690 700 710 720
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DATNILVSPLVYLYPDIPKEEAFGKYCRPESQEHPEADPGSAAPYLKTKFICVTPTTCSN
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730 740 750 760 770
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TIDLPMSPRTLDSLMQFGNNGEGAEPSAGGQFESLTFDMELTSECATSPM
730 740 750 760 770
>>CCDS32657.1 STAT3 gene_id:6774|Hs108|chr17 (769 aa)
initn: 4751 init1: 4675 opt: 5122 Z-score: 4543.3 bits: 851.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5122; 99.9% identity (99.9% similar) in 770 aa overlap (1-770:1-769)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAQWNQLQQLDTRYLEQLHQLYSDSFPMELRQFLAPWIESQDWAYAASKESHATLVFHNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MAQWNQLQQLDTRYLEQLHQLYSDSFPMELRQFLAPWIESQDWAYAASKESHATLVFHNL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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190 200 210 220 230 240
pF1KE2 SQGDMQDLNGNNQSVTRQKMQQLEQMLTALDQMRRSIVSELAGLLSAMEYVQKTLTDEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SQGDMQDLNGNNQSVTRQKMQQLEQMLTALDQMRRSIVSELAGLLSAMEYVQKTLTDEEL
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250 260 270 280 290 300
pF1KE2 ADWKRRQQIACIGGPPNICLDRLENWITSLAESQLQTRQQIKKLEELQQKVSYKGDPIVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ADWKRRQQIACIGGPPNICLDRLENWITSLAESQLQTRQQIKKLEELQQKVSYKGDPIVQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HRPMLEERIVELFRNLMKSAFVVERQPCMPMHPDRPLVIKTGVQFTTKVRLLVKFPELNY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE2 GCQITWAKFCKENMAGKGFSFWVWLDNIIDLVKKYILALWNEGYIMGFISKERERAILST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GCQITWAKFCKENMAGKGFSFWVWLDNIIDLVKKYILALWNEGYIMGFISKERERAILST
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610 620 630 640 650 660
pF1KE2 KPPGTFLLRFSESSKEGGVTFTWVEKDISGKTQIQSVEPYTKQQLNNMSFAEIIMGYKIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KPPGTFLLRFSESSKEGGVTFTWVEKDISGKTQIQSVEPYTKQQLNNMSFAEIIMGYKIM
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670 680 690 700 710 720
pF1KE2 DATNILVSPLVYLYPDIPKEEAFGKYCRPESQEHPEADPGSAAPYLKTKFICVTPTTCSN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
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730 740 750 760 770
pF1KE2 TIDLPMSPRTLDSLMQFGNNGEGAEPSAGGQFESLTFDMELTSECATSPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TIDLPMSPRTLDSLMQFGNNGEGAEPSAGGQFESLTFDMELTSECATSPM
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>>CCDS59288.1 STAT3 gene_id:6774|Hs108|chr17 (722 aa)
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Smith-Waterman score: 4770; 100.0% identity (100.0% similar) in 715 aa overlap (1-715:1-715)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LGEIDQQYSRFLQESNVLYQHNLRRIKQFLQSRYLEKPMEIARIVARCLWEESRLLQTAA
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CCDS59 TAAQQGGQANHPTAAVVTEKQQMLEQHLQDVRKRVQDLEQKMKVVENLQDDFDFNYKTLK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SQGDMQDLNGNNQSVTRQKMQQLEQMLTALDQMRRSIVSELAGLLSAMEYVQKTLTDEEL
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pF1KE2 ADWKRRQQIACIGGPPNICLDRLENWITSLAESQLQTRQQIKKLEELQQKVSYKGDPIVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ADWKRRQQIACIGGPPNICLDRLENWITSLAESQLQTRQQIKKLEELQQKVSYKGDPIVQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 HRPMLEERIVELFRNLMKSAFVVERQPCMPMHPDRPLVIKTGVQFTTKVRLLVKFPELNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 HRPMLEERIVELFRNLMKSAFVVERQPCMPMHPDRPLVIKTGVQFTTKVRLLVKFPELNY
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pF1KE2 QLKIKVCIDKDSGDVAALRGSRKFNILGTNTKVMNMEESNNGSLSAEFKHLTLREQRCGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 QLKIKVCIDKDSGDVAALRGSRKFNILGTNTKVMNMEESNNGSLSAEFKHLTLREQRCGN
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pF1KE2 GGRANCDASLIVTEELHLITFETEVYHQGLKIDLETHSLPVVVISNICQMPNAWASILWY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GGRANCDASLIVTEELHLITFETEVYHQGLKIDLETHSLPVVVISNICQMPNAWASILWY
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pF1KE2 NMLTNNPKNVNFFTKPPIGTWDQVAEVLSWQFSSTTKRGLSIEQLTTLAEKLLGPGVNYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 NMLTNNPKNVNFFTKPPIGTWDQVAEVLSWQFSSTTKRGLSIEQLTTLAEKLLGPGVNYS
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pF1KE2 GCQITWAKFCKENMAGKGFSFWVWLDNIIDLVKKYILALWNEGYIMGFISKERERAILST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GCQITWAKFCKENMAGKGFSFWVWLDNIIDLVKKYILALWNEGYIMGFISKERERAILST
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610 620 630 640 650 660
pF1KE2 KPPGTFLLRFSESSKEGGVTFTWVEKDISGKTQIQSVEPYTKQQLNNMSFAEIIMGYKIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KPPGTFLLRFSESSKEGGVTFTWVEKDISGKTQIQSVEPYTKQQLNNMSFAEIIMGYKIM
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 DATNILVSPLVYLYPDIPKEEAFGKYCRPESQEHPEADPGSAAPYLKTKFICVTPTTCSN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DATNILVSPLVYLYPDIPKEEAFGKYCRPESQEHPEADPGSAAPYLKTKFICVTPFIDAV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KE2 TIDLPMSPRTLDSLMQFGNNGEGAEPSAGGQFESLTFDMELTSECATSPM
CCDS59 WK
>>CCDS2309.1 STAT1 gene_id:6772|Hs108|chr2 (750 aa)
initn: 1957 init1: 916 opt: 2643 Z-score: 2348.5 bits: 445.3 E(32554): 1.7e-124
Smith-Waterman score: 2643; 53.0% identity (81.3% similar) in 739 aa overlap (1-732:1-732)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAQWNQLQQLDTRYLEQLHQLYSDSFPMELRQFLAPWIESQDWAYAASKESHATLVFHNL
:.:: .:::::...:::.::::.::::::.::.:: :.:.::: .::. : ::. ::.:
CCDS23 MSQWYELQQLDSKFLEQVHQLYDDSFPMEIRQYLAQWLEKQDWEHAANDVSFATIRFHDL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LGEIDQQYSRFLQESNVLYQHNLRRIKQFLQSRYLEKPMEIARIVARCLWEESRLLQTAA
:...:.::::: :.: : :::.:. :. ::. . : :.... :. :: :: ..:..:
CCDS23 LSQLDDQYSRFSLENNFLLQHNIRKSKRNLQDNFQEDPIQMSMIIYSCLKEERKILENAQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 TAAQQGGQANHPTAAVVTEKQQMLEQHLQDVRKRVQDLEQKMKVVENLQDDFDFNYKTLK
: .:... ..:. .::. :......:. .:. .:...: .:.:::..::. :::
CCDS23 RFNQ--AQSGNIQSTVMLDKQKELDSKVRNVKDKVMCIEHEIKSLEDLQDEYDFKCKTL-
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 SQGDMQDLNGNNQSVTRQKMQQLEQMLTALDQMRRSIVSELAGLLSAMEYVQKTLTDEEL
:. .. :: .: .:.. :..: ::. :. .: .. ::.. : .:..: ..::
CCDS23 -QNREHETNGVAKSDQKQEQLLLKKMYLMLDNKRKEVVHKIIELLNVTELTQNALINDEL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 ADWKRRQQIACIGGPPNICLDRLENWITSLAESQLQTRQQIKKLEELQQKVSYKGDPIVQ
..:::::: :::::::: :::.:.::.: .::: :.:::.::::::.:: .:. :::..
CCDS23 VEWKRRQQSACIGGPPNACLDQLQNWFTIVAESLQQVRQQLKKLEELEQKYTYEHDPITK
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 HRPMLEERIVELFRNLMKSAFVVERQPCMPMHPDRPLVIKTGVQFTTKVRLLVKFPELNY
.. .: .: ::..:..:.:::::::::: ::.::::.:::::::.:.:::::. ::::
CCDS23 NKQVLWDRTFSLFQQLIQSSFVVERQPCMPTHPQRPLVLKTGVQFTVKLRLLVKLQELNY
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 QLKIKVCIDKDSGDVAALRGSRKFNILGTNTKVMNMEESNNGSLSAEFKHLTLREQRCGN
.::.:: .::: .. ...: ::::::::.:::::::::.::::.:::.:: :.::. :
CCDS23 NLKVKVLFDKDVNERNTVKGFRKFNILGTHTKVMNMEESTNGSLAAEFRHLQLKEQK--N
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 GGRANCDASLIVTEELHLITFETEVYHQGLKIDLETHSLPVVVISNICQMPNAWASILWY
.: . .. :::::::: ..:::.. . :: ::::: :::::::::. :.:..:::::::
CCDS23 AGTRTNEGPLIVTEELHSLSFETQLCQPGLVIDLETTSLPVVVISNVSQLPSGWASILWY
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 NMLTNNPKNVNFFTKPPIGTWDQVAEVLSWQFSSTTKRGLSIEQLTTLAEKLLGPGVNYS
:::. .:.:..:: :: . : :..:::::::::.:::::...::. :.::::::... .
CCDS23 NMLVAEPRNLSFFLTPPCARWAQLSEVLSWQFSSVTKRGLNVDQLNMLGEKLLGPNASPD
480 490 500 510 520 530
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pF1KE2 GCQITWAKFCKENMAGKGFSFWVWLDNIIDLVKKYILALWNEGYIMGFISKERERAILST
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CCDS55 YK-IQAKGKTPSLDPHQ--TKEQKI--LQETLNELDKRRKEVLDASKALLGRLTTLIELL
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CCDS55 DPLTKGVDLRNAQVTELLQRLLHRAFVVETQPCMPQTPHRPLILKTGSKFTVRTRLLVRL
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