FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2689, 562 aa
1>>>pF1KE2689 562 - 562 aa - 562 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6729+/-0.00067; mu= 17.7568+/- 0.041
mean_var=79.7699+/-15.515, 0's: 0 Z-trim(111.6): 22 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.143600
statistics sampled from 12493 (12509) to 12493 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.734), E-opt: 0.2 (0.384), width: 16
Scan time: 2.660
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS58228.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 ( 562) 3917 820.9 0
CCDS44876.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 ( 528) 2522 531.8 7.7e-151
CCDS8796.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 ( 574) 1872 397.2 2.8e-110
CCDS11276.1 ASIC2 gene_id:40|Hs108|chr17 ( 563) 1761 374.2 2.3e-103
CCDS42296.1 ASIC2 gene_id:40|Hs108|chr17 ( 512) 1757 373.3 3.9e-103
CCDS5916.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 ( 531) 1019 220.5 4.2e-57
CCDS5914.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 ( 543) 1019 220.5 4.3e-57
CCDS5915.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 ( 549) 1019 220.5 4.3e-57
CCDS3793.1 ASIC5 gene_id:51802|Hs108|chr4 ( 505) 753 165.3 1.6e-40
CCDS2442.1 ASIC4 gene_id:55515|Hs108|chr2 ( 647) 583 130.2 7.7e-30
>>CCDS58228.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 (562 aa)
initn: 3917 init1: 3917 opt: 3917 Z-score: 4383.0 bits: 820.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3917; 100.0% identity (100.0% similar) in 562 aa overlap (1-562:1-562)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MPIQIFCSMSFSSGEEAPGPLGDIWGPHHHQQQQDISESEEEEEEKEKEAVRKEASEGHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MPIQIFCSMSFSSGEEAPGPLGDIWGPHHHQQQQDISESEEEEEEKEKEAVRKEASEGHS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 PMDLVAFANSCTLHGTNHIFVEGGPGPRQVLWAVAFVLALGAFLCQVGDRVAYYLSYPHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PMDLVAFANSCTLHGTNHIFVEGGPGPRQVLWAVAFVLALGAFLCQVGDRVAYYLSYPHV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 TLLNEVATTELAFPAVTLCNTNAVRLSQLSYPDLLYLAPMLGLDESDDPGVPLAPPGPEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TLLNEVATTELAFPAVTLCNTNAVRLSQLSYPDLLYLAPMLGLDESDDPGVPLAPPGPEA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 FSGEPFNLHRFYNRSCHRLEDMLLYCSYQGGPCGPHNFSVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FSGEPFNLHRFYNRSCHRLEDMLLYCSYQGGPCGPHNFSVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 LKTMKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LKTMKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 PGFQTFVACQEQRLIYLPPPWGTCKAVTMDSDLDFFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PGFQTFVACQEQRLIYLPPPWGTCKAVTMDSDLDFFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 MVHMPGDAPYCTPEQYKECADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MVHMPGDAPYCTPEQYKECADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKAS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 AKYLAKKFNKSEQYIGENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AKYLAKKFNKSEQYIGENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGAS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 ILTVLELFDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ILTVLELFDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAG
490 500 510 520 530 540
550 560
pF1KE2 MTYAANILPHHPARGTFEDFTC
::::::::::::::::::::::
CCDS58 MTYAANILPHHPARGTFEDFTC
550 560
>>CCDS44876.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 (528 aa)
initn: 2814 init1: 2515 opt: 2522 Z-score: 2821.5 bits: 531.8 E(32554): 7.7e-151
Smith-Waterman score: 2794; 78.9% identity (88.7% similar) in 522 aa overlap (53-562:7-528)
30 40 50 60 70 80
pF1KE2 DIWGPHHHQQQQDISESEEEEEEKEKEAVRKEASEGHSPMDLVAFANSCTLHGTNHIFVE
.: : .:... :::.: :::: :::
CCDS44 MELKAEEEEVGGVQPVSIQAFASSSTLHGLAHIFSY
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 GGPGPRQVLWAVAFVLALGAFLCQVGDRVAYYLSYPHVTLLNEVATTELAFPAVTLCNTN
. ...:::. :. .:...:: .:: ::. : ::: :.:::...:.:::::::: :
CCDS44 ERLSLKRALWALCFLGSLAVLLCVCTERVQYYFHYHHVTKLDEVAASQLTFPAVTLCNLN
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190
pF1KE2 AVRLSQLSYPDLLYLAPMLGL--DESDDPGVPLAPPGP----------EAFSGEPFNLHR
:.::.: :: . . .:.: .. . : . .: ..:. .:::...
CCDS44 EFRFSQVSKNDLYHAGELLALLNNRYEIPDTQMADEKQLEILQDKANFRSFKPKPFNMRE
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 FYNRSCHRLEDMLLYCSYQGGPCGPHNFSVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGN
::.:. : ..:::: : ..: :. ..:.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FYDRAGHDIRDMLLSCHFRGEVCSAEDFKVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGN
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 GLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQ
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 EQRLIYLPPPWGTCKAVTMDSDLDFFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EQRLIYLPPPWGTCKAVTMDSDLDFFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPY
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 CTPEQYKECADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 CTPEQYKECADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNK
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 SEQYIGENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLELFDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SEQYIGENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLELFDY
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 AYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANILPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANILPH
460 470 480 490 500 510
560
pF1KE2 HPARGTFEDFTC
::::::::::::
CCDS44 HPARGTFEDFTC
520
>>CCDS8796.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 (574 aa)
initn: 2142 init1: 1857 opt: 1872 Z-score: 2093.2 bits: 397.2 E(32554): 2.8e-110
Smith-Waterman score: 2579; 71.8% identity (81.0% similar) in 554 aa overlap (53-548:7-560)
30 40 50 60 70 80
pF1KE2 DIWGPHHHQQQQDISESEEEEEEKEKEAVRKEASEGHSPMDLVAFANSCTLHGTNHIFVE
.: : .:... :::.: :::: :::
CCDS87 MELKAEEEEVGGVQPVSIQAFASSSTLHGLAHIFSY
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 GGPGPRQVLWAVAFVLALGAFLCQVGDRVAYYLSYPHVTLLNEVATTELAFPAVTLCNTN
. ...:::. :. .:...:: .:: ::. : ::: :.:::...:.:::::::: :
CCDS87 ERLSLKRALWALCFLGSLAVLLCVCTERVQYYFHYHHVTKLDEVAASQLTFPAVTLCNLN
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190
pF1KE2 AVRLSQLSYPDLLYLAPMLGL--DESDDPGVPLAPPGP----------EAFSGEPFNLHR
:.::.: :: . . .:.: .. . : . .: ..:. .:::...
CCDS87 EFRFSQVSKNDLYHAGELLALLNNRYEIPDTQMADEKQLEILQDKANFRSFKPKPFNMRE
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 FYNRSCHRLEDMLLYCSYQGGPCGPHNFSVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGN
::.:. : ..:::: : ..: :. ..:.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 FYDRAGHDIRDMLLSCHFRGEVCSAEDFKVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGN
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 GLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 GLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQ
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 EQRLIYLPPPWGTCKAVTMDSDLDFFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 EQRLIYLPPPWGTCKAVTMDSDLDFFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPY
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 CTPEQYKECADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 CTPEQYKECADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNK
340 350 360 370 380 390
440 450 460
pF1KE2 SEQYIGENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLG-----------------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 SEQYIGENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGELLMTPVPFSCHGHGVAPYHPKA
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500
pF1KE2 -----------------------DIGGQMGLFIGASILTVLELFDYAYEVIKHKLCRRGK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 GCSLLSHEGPPPQRPFPKPCCLGDIGGQMGLFIGASILTVLELFDYAYEVIKHKLCRRGK
460 470 480 490 500 510
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 CQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANILPHHPARGTFEDFTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 CQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANILPHHPARGTFEDFTC
520 530 540 550 560 570
>>CCDS11276.1 ASIC2 gene_id:40|Hs108|chr17 (563 aa)
initn: 1178 init1: 979 opt: 1761 Z-score: 1969.0 bits: 374.2 E(32554): 2.3e-103
Smith-Waterman score: 1964; 59.5% identity (76.6% similar) in 516 aa overlap (73-562:66-563)
50 60 70 80 90
pF1KE2 EEEKEKEAVRKEASEGHSPMDLVAFANSCTLHGTNHIFV----EGGPGPRQVLWAVAFVL
::: :. . :: :..::..::
CCDS11 GQPGGGRGGERALQGPGVARRGRPSLSRAKLHGLRHMCAGRTAAGGSFQRRALWVLAFCT
40 50 60 70 80 90
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 ALGAFLCQVGDRVAYYLSYPHVTLLNEVATTELAFPAVTLCNTNAVRLSQLSYPDLLYLA
..: .: ..:. :.::.: : ... . .: :::::.::.: .:. .:: :: : .
CCDS11 SFGLLLSWSSNRLLYWLSFPSHTRVHREWSRQLPFPAVTVCNNNPLRFPRLSKGDLYYAG
100 110 120 130 140 150
160 170 180 190
pF1KE2 PMLGLDESDDPGVPLAPPGPEAFSG-EP----------FNL-----H------RFYNRSC
::: . . ::. : . : :: : : : :..:
CCDS11 HWLGLLLPNRTARPLVS---ELLRGDEPRRQWFRKLADFRLFLPPRHFEGISAAFMDRLG
160 170 180 190 200 210
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 HRLEDMLLYCSYQGGPCGPHNFSVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGNGLEIML
:.:::::: :.:.: ::::::: :::.::::: ::::.::.: : :.::::::::::::
CCDS11 HQLEDMLLSCKYRGELCGPHNFSSVFTKYGKCYMFNSGEDGKPLLTTVKGGTGNGLEIML
220 230 240 250 260 270
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 DIQQDEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRLIY
:::::::::.::::.::.::::.:::::::.:::::..:::::::::::::: ::::: :
CCDS11 DIQQDEYLPIWGETEETTFEAGVKVQIHSQSEPPFIQELGFGVAPGFQTFVATQEQRLTY
280 290 300 310 320 330
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 LPPPWGTCKAVTMDSDLDFFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPYCTPEQY
:::::: :.. : :::: ::::::::::::::.::::::::::::::::.:::::.
CCDS11 LPPPWGECRSSEMG--LDFFPVYSITACRIDCETRYIVENCNCRMVHMPGDAPFCTPEQH
340 350 360 370 380 390
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 KECADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNKSEQYIG
::::.::: .:.:::..::.:. :::::::.:::::::::::.::::: :::::::.::.
CCDS11 KECAEPALGLLAEKDSNYCLCRTPCNLTRYNKELSMVKIPSKTSAKYLEKKFNKSEKYIS
400 410 420 430 440 450
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 ENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLELFDYAYEVIK
:::::::::::.:::::::::::::.:.:::::::::::::::::::.:::::: ::.::
CCDS11 ENILVLDIFFEALNYETIEQKKAYEVAALLGDIGGQMGLFIGASILTILELFDYIYELIK
460 470 480 490 500 510
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 HKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANILPHHPARGT
.:: :: ..: :..:. :... .: .....:. : . . ::
CCDS11 EKLL--DLLGKEEDEGSHDENVST----------CDTMPNHSETISHTVNV-PLQTTLGT
520 530 540 550
560
pF1KE2 FEDFTC
.:...:
CCDS11 LEEIAC
560
>>CCDS42296.1 ASIC2 gene_id:40|Hs108|chr17 (512 aa)
initn: 1291 init1: 979 opt: 1757 Z-score: 1965.2 bits: 373.3 E(32554): 3.9e-103
Smith-Waterman score: 2088; 60.6% identity (79.8% similar) in 525 aa overlap (51-562:3-512)
30 40 50 60 70
pF1KE2 LGDIWGPHHHQQQQDISESEEEEEEKEKEAVRKEASEGH-SPMDLVAFANSCTLHGTNHI
... ::: .: .. :::. :::: ::
CCDS42 MDLKESPSEGSLQPSSIQIFANTSTLHGIRHI
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 FVEGGPGPRQVLWAVAFVLALGAFLCQVGDRVAYYLSYPHVTLLNEVATTELAFPAVTLC
:: : :.:::::::: .:: .: . ..::.::.:: ::: ..::.. :.:::::::
CCDS42 FVYGPLTIRRVLWAVAFVGSLGLLLVESSERVSYYFSYQHVTKVDEVVAQSLVFPAVTLC
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180
pF1KE2 NTNAVRLSQLSYPDLLYLAPMLGLDESDD--PGVPLAPPGP-EA---------FSGEPFN
: :. :.:.:. :: . . .:.: . . : :: :. :: .. . :.
CCDS42 NLNGFRFSRLTTNDLYHAGELLALLDVNLQIPDPHLADPSVLEALRQKANFKHYKPKQFS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LHRFYNRSCHRLEDMLLYCSYQGGPCGPHNFSVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGG
. .: .: : :.::.:::...: :: ..:..:::.::::: ::::.::.: : :.:::
CCDS42 MLEFLHRVGHDLKDMMLYCKFKGQECGHQDFTTVFTKYGKCYMFNSGEDGKPLLTTVKGG
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 TGNGLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFV
::::::::::::::::::.::::.::.::::.:::::::.:::::..:::::::::::::
CCDS42 TGNGLEIMLDIQQDEYLPIWGETEETTFEAGVKVQIHSQSEPPFIQELGFGVAPGFQTFV
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 ACQEQRLIYLPPPWGTCKAVTMDSDLDFFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGD
: ::::: ::::::: :.. : :::: ::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS42 ATQEQRLTYLPPPWGECRSSEMG--LDFFPVYSITACRIDCETRYIVENCNCRMVHMPGD
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 APYCTPEQYKECADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKK
::.:::::.::::.::: .:.:::..::.:. :::::::.:::::::::::.::::: ::
CCDS42 APFCTPEQHKECAEPALGLLAEKDSNYCLCRTPCNLTRYNKELSMVKIPSKTSAKYLEKK
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 FNKSEQYIGENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLEL
:::::.::.:::::::::::.:::::::::::::.:.:::::::::::::::::::.:::
CCDS42 FNKSEKYISENILVLDIFFEALNYETIEQKKAYEVAALLGDIGGQMGLFIGASILTILEL
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 FDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANI
::: ::.::.:: :: ..: :..:. :... .: .....:.
CCDS42 FDYIYELIKEKLL--DLLGKEEDEGSHDENVST----------CDTMPNHSETISHTVNV
460 470 480 490
550 560
pF1KE2 LPHHPARGTFEDFTC
: . . ::.:...:
CCDS42 -PLQTTLGTLEEIAC
500 510
>>CCDS5916.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 (531 aa)
initn: 1463 init1: 673 opt: 1019 Z-score: 1138.6 bits: 220.5 E(32554): 4.2e-57
Smith-Waterman score: 1744; 50.7% identity (76.8% similar) in 501 aa overlap (57-538:9-507)
30 40 50 60 70 80
pF1KE2 PHHHQQQQDISESEEEEEEKEKEAVRKEASEGHSPM-DLVAFANSCTLHGTNHIFVEGGP
:.. : :. .::..:..:: .:.: :.
CCDS59 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPGSL
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 GPRQVLWAVAFVLALGAFLCQVGDRVAYYLSYPHVTLLNEVATTELAFPAVTLCNTNAVR
. :. .::.: ::....:: ::..:: :: . : : :.: . .: :::::::: : .:
CCDS59 SLRRGMWAAAVVLSVATFLYQVAERVRYYREFHHQTALDERESHRLIFPAVTLCNINPLR
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 LSQLSYPDLLYL-APMLGLDESDDPGVPLA---PPGPEAFSGEP-FNLHRFYNRSCHRLE
:.:. :: . . .:::: .. . : ::.: .: : :.. ..: :. : :.
CCDS59 RSRLTPNDLHWAGSALLGLDPAEHAAFLRALGRPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLD
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 DMLLYCSYQGGPCGPHNFSVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGNGLEIMLDIQQ
:::: : ..: ::::.::...:::.::::::::: :: : : .:: ::::.::::.::
CCDS59 DMLLDCRFRGQPCGPENFTTIFTRMGKCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQ
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 DEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRLIYLPPP
.:::::: ...:: ::.::.::::::.:::.:::::.::.::.::::.::.:.: .::::
CCDS59 EEYLPVWRDNEETPFEVGIRVQIHSQEEPPIIDQLGLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPP
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360
pF1KE2 WGTCKAVTMDSDLDFFDS-------------YSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGD
:: :...... . . : :.. .::. :::::....:.::::.::::
CCDS59 WGDCSSASLNPNYEPEPSDPLGSPSPSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVYMPGD
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 APYCTPEQYKECADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKK
.: :.:.:::.:: ::.: ...::. :.: :: :::.::::::.:::.:.:..::.:
CCDS59 VPVCSPQQYKNCAHPAIDAMLRKDS--CACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFLARK
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 FNKSEQYIGENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLEL
.:.:: ::.::.:.::::::.:::::.:::::::.. ::::::::::::::::.::.::.
CCDS59 LNRSEAYIAENVLALDIFFEALNYETVEQKKAYEMSELLGDIGGQMGLFIGASLLTILEI
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 FDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANI
.:: ::.. :. .....: :. . . .: . . . : :: .:
CCDS59 LDYLCEVFRDKVLGYFWNRQHSQRHSSTNLLQEGLGSHRTQVPHLSLGPRPPTPPCAVTK
460 470 480 490 500 510
550 560
pF1KE2 LPHHPARGTFEDFTC
CCDS59 TLSASHRTCYLVTQL
520 530
>>CCDS5914.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 (543 aa)
initn: 1721 init1: 714 opt: 1019 Z-score: 1138.5 bits: 220.5 E(32554): 4.3e-57
Smith-Waterman score: 1745; 50.4% identity (75.8% similar) in 516 aa overlap (57-553:9-511)
30 40 50 60 70 80
pF1KE2 PHHHQQQQDISESEEEEEEKEKEAVRKEASEGHSPM-DLVAFANSCTLHGTNHIFVEGGP
:.. : :. .::..:..:: .:.: :.
CCDS59 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPGSL
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 GPRQVLWAVAFVLALGAFLCQVGDRVAYYLSYPHVTLLNEVATTELAFPAVTLCNTNAVR
. :. .::.: ::....:: ::..:: :: . : : :.: . .: :::::::: : .:
CCDS59 SLRRGMWAAAVVLSVATFLYQVAERVRYYREFHHQTALDERESHRLIFPAVTLCNINPLR
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 LSQLSYPDLLYL-APMLGLDESDDPGVPLA---PPGPEAFSGEP-FNLHRFYNRSCHRLE
:.:. :: . . .:::: .. . : ::.: .: : :.. ..: :. : :.
CCDS59 RSRLTPNDLHWAGSALLGLDPAEHAAFLRALGRPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLD
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 DMLLYCSYQGGPCGPHNFSVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGNGLEIMLDIQQ
:::: : ..: ::::.::...:::.::::::::: :: : : .:: ::::.::::.::
CCDS59 DMLLDCRFRGQPCGPENFTTIFTRMGKCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQ
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 DEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRLIYLPPP
.:::::: ...:: ::.::.::::::.:::.:::::.::.::.::::.::.:.: .::::
CCDS59 EEYLPVWRDNEETPFEVGIRVQIHSQEEPPIIDQLGLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPP
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360
pF1KE2 WGTCKAVTMDSDLDFFDS-------------YSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGD
:: :...... . . : :.. .::. :::::....:.::::.::::
CCDS59 WGDCSSASLNPNYEPEPSDPLGSPSPSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVYMPGD
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 APYCTPEQYKECADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKK
.: :.:.:::.:: ::.: ...::. :.: :: :::.::::::.:::.:.:..::.:
CCDS59 VPVCSPQQYKNCAHPAIDAMLRKDS--CACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFLARK
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 FNKSEQYIGENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLEL
.:.:: ::.::.:.::::::.:::::.:::::::.. ::::::::::::::::.::.::.
CCDS59 LNRSEAYIAENVLALDIFFEALNYETVEQKKAYEMSELLGDIGGQMGLFIGASLLTILEI
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 FDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANI
.:: ::.. :. .....: :. . : .. ::. .::: : ..
CCDS59 LDYLCEVFRDKVLGYFWNRQHSQRHSSTN--LTSHPSLCRHQ--DSLRLPP-------HL
460 470 480 490 500
550 560
pF1KE2 LPHHPARGTFEDFTC
:: : :
CCDS59 LPCHTALDLLSVSSEPRPDILDMPSLHVAFPSSPQIKS
510 520 530 540
>>CCDS5915.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 (549 aa)
initn: 1463 init1: 673 opt: 1019 Z-score: 1138.4 bits: 220.5 E(32554): 4.3e-57
Smith-Waterman score: 1741; 50.0% identity (76.4% similar) in 512 aa overlap (57-549:9-516)
30 40 50 60 70 80
pF1KE2 PHHHQQQQDISESEEEEEEKEKEAVRKEASEGHSPM-DLVAFANSCTLHGTNHIFVEGGP
:.. : :. .::..:..:: .:.: :.
CCDS59 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPGSL
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 GPRQVLWAVAFVLALGAFLCQVGDRVAYYLSYPHVTLLNEVATTELAFPAVTLCNTNAVR
. :. .::.: ::....:: ::..:: :: . : : :.: . .: :::::::: : .:
CCDS59 SLRRGMWAAAVVLSVATFLYQVAERVRYYREFHHQTALDERESHRLIFPAVTLCNINPLR
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 LSQLSYPDLLYL-APMLGLDESDDPGVPLA---PPGPEAFSGEP-FNLHRFYNRSCHRLE
:.:. :: . . .:::: .. . : ::.: .: : :.. ..: :. : :.
CCDS59 RSRLTPNDLHWAGSALLGLDPAEHAAFLRALGRPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLD
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 DMLLYCSYQGGPCGPHNFSVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGNGLEIMLDIQQ
:::: : ..: ::::.::...:::.::::::::: :: : : .:: ::::.::::.::
CCDS59 DMLLDCRFRGQPCGPENFTTIFTRMGKCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQ
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 DEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRLIYLPPP
.:::::: ...:: ::.::.::::::.:::.:::::.::.::.::::.::.:.: .::::
CCDS59 EEYLPVWRDNEETPFEVGIRVQIHSQEEPPIIDQLGLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPP
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360
pF1KE2 WGTCKAVTMDSDLDFFDS-------------YSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGD
:: :...... . . : :.. .::. :::::....:.::::.::::
CCDS59 WGDCSSASLNPNYEPEPSDPLGSPSPSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVYMPGD
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 APYCTPEQYKECADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKK
.: :.:.:::.:: ::.: ...::. :.: :: :::.::::::.:::.:.:..::.:
CCDS59 VPVCSPQQYKNCAHPAIDAMLRKDS--CACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFLARK
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 FNKSEQYIGENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLEL
.:.:: ::.::.:.::::::.:::::.:::::::.. ::::::::::::::::.::.::.
CCDS59 LNRSEAYIAENVLALDIFFEALNYETVEQKKAYEMSELLGDIGGQMGLFIGASLLTILEI
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 FDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANI
.:: ::.. :. .....: :. . . .: . . . : :: : :. . . ..
CCDS59 LDYLCEVFRDKVLGYFWNRQHSQRHSSTNLLQEGLGSHRTQVPHLSL-G-PSTLLCSEDL
460 470 480 490 500 510
550 560
pF1KE2 LPHHPARGTFEDFTC
:
CCDS59 PPLPVPSPRLSPPPTAPATLSHSSRPAVCVLGAPP
520 530 540
>>CCDS3793.1 ASIC5 gene_id:51802|Hs108|chr4 (505 aa)
initn: 683 init1: 250 opt: 753 Z-score: 841.1 bits: 165.3 E(32554): 1.6e-40
Smith-Waterman score: 753; 30.4% identity (62.4% similar) in 441 aa overlap (67-492:41-468)
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 SESEEEEEEKEKEAVRKEASEGHSPMDLVAFANSCTLHGTNHIFVEGGPGPRQVLWAVAF
:: : ..:: ..: :.. :.::: :.
CCDS37 AENGLLEKIKLCLSKKPLPSPTERKKFDHDFAISTSFHGIHNI-VQNRSKIRRVLWLVVV
20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 VLALGAFLCQVGDRVAYYLSYPHVTLLNEVATTELAFPAVTLCNTNAVRLSQLSYPDLLY
. ... :. :. :...: .: .. . .. :::::.:: : . . .. ...
CCDS37 LGSVSLVTWQIYIRLLNYFTWPTTTSIEVQYVEKMEFPAVTFCNLNRFQTDAVAKFGVIF
70 80 90 100 110 120
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 L-----APMLGLDESDDPGVPLAPPGPEAFSGEPFNLHRFY-NRSCHRLEDMLLYCSYQG
. . .: :.: .. : : . :.. .: :.. . .. :: : . :
CCDS37 FLWHIVSKVLHLQEITANSTGSREATDFAASHQNFSIVEFIRNKGFYLNNSTLLDCEFFG
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260
pF1KE2 GPCGPHNFSVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGNGLEIMLDIQQDEYL--PVWG
::.:..:. :::.::.:.::: :. . . :. . .: :: ......:. . :. :
CCDS37 KPCSPKDFAHVFTEYGNCFTFNHGETLQAKRKV--SVSGRGLSLLFNVNQEAFTDNPALG
190 200 210 220 230 240
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 ETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRLIYLPPPWGTCKAVT
.: ::: ::: . : .: ::. :... :. .. . .. ::: :.
CCDS37 FVD-----AGIIFVIHSPKKVPQFDGLGLLSPVGMHARVTIRQVKTVHQEYPWGECNP--
250 260 270 280 290 300
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 MDSDLDFFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPYCTPEQYKECADPALDFLV
. :. :.::: ..: .:..... ..:.: .:: . : ..: :..:.:: .
CCDS37 -NIKLQNFSSYSTSGCLKECKAQHIKKQCGCVPFLLPGYGIECDLQKYFSCVSPVLDHIE
310 320 330 340 350
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 EKDQEYCV-------CEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNKSEQYIGENILV
:: :. : . :. .: .:. ..::. . :::.::.:.:..:: ::..
CCDS37 FKD--LCTVGTHNSSCPVSCEEIEYPATISYSSFPSQKALKYLSKKLNQSRKYIRENLVK
360 370 380 390 400 410
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 LDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLELFDYAYEVIKHKLCR
..: . :::. .:.:: .. ::.:.:::.::: :::..:..:...: .
CCDS37 IEINYSDLNYKITQQQKAVSVSELLADLGGQLGLFCGASLITIIEIIEYLFTNFYWICIF
420 430 440 450 460 470
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 RGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANILPHHPARGTFEDFT
CCDS37 FLLKISEMTQWTPPPQNHLGNKNRIEEC
480 490 500
>>CCDS2442.1 ASIC4 gene_id:55515|Hs108|chr2 (647 aa)
initn: 1379 init1: 532 opt: 583 Z-score: 649.2 bits: 130.2 E(32554): 7.7e-30
Smith-Waterman score: 1619; 48.5% identity (70.7% similar) in 546 aa overlap (36-562:136-647)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 FCSMSFSSGEEAPGPLGDIWGPHHHQQQQDISESEEEEEEKEKEAVRKEA-----SEGHS
:. .::. . ::::: ... . : .
CCDS24 PGLLAREGQGREALASPSSRGQMPIEIVCKIKFAEEDAKPKEKEAGDEQSLLGAVAPGAA
110 120 130 140 150 160
70 80 90 100 110
pF1KE2 PMDLVAFANSCTLHGTNHIFVEGGPGP---RQVLWAVAFVLALGAFLCQVGDRVAYYLSY
: ::..::.. :::: .. :::: :..:::.:.. .:.::: :.. . ::.
CCDS24 PRDLATFASTSTLHGLGRAC---GPGPHGLRRTLWALALLTSLAAFLYQAAGLARGYLTR
170 180 190 200 210 220
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 PHVTLLNEVATTELA-FPAVTLCNTNAVRLSQLSYPDLLYLAPMLGLDESDDPG---VPL
::.. .. .: . .: :::::::: : : : :: :...:: . :: .: : . :
CCDS24 PHLVAMDPAAPAPVAGFPAVTLCNINRFRHSALSDADIFHLANLTGLPPKDRDGHRAAGL
230 240 250 260 270 280
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 APPGPEAFSGEPFNLHRFYNRSCHRLEDMLLYCSYQGGPCGPHNFSVVFTRYGKCYTFNS
: :. . . ::. :.: ::: :...: :. :::::.::::::::::.
CCDS24 RYPEPDMVD--------ILNRTGHQLADMLKSCNFSGHHCSASNFSVVYTRYGKCYTFNA
290 300 310 320 330
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 GRDGRPRLKTMKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFID
: : : . :: :.::::::::::.::::.: ::.::::::::.::::::.:::.:
CCDS24 --DPRSSLPSRAGGMGSGLEIMLDIQQEEYLPIWRETNETSFEAGIRVQIHSQEEPPYIH
340 350 360 370 380 390
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 QLGFGVAPGFQTFVACQEQRLIYLPPPWGTCKAVTM--DSDLDFFDSYSITACRIDCETR
::::::.:::::::.:::::: ::: :::.:.: . . .:. ...::..:::. :: .
CCDS24 QLGFGVSPGFQTFVSCQEQRLTYLPQPWGNCRAESELREPELQGYSAYSVSACRLRCEKE
400 410 420 430 440 450
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 YLVENCNCRMVHMPGDAPYCTPEQYKECADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELS
... :.::::::: :. :: : : : ::::::::::.:
CCDS24 AVLQRCHCRMVHMP-DSLGGGPE------GP------------CFCPTPCNLTRYGKEIS
460 470 480 490
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 MVKIPSKASAKYLAKKFNKSEQYIGENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGG
::.::...::.:::.:.:..: :: ::.::::.:::.:. :..::. :: ...::::.::
CCDS24 MVRIPNRGSARYLARKYNRNETYIRENFLVLDVFFEALTSEAMEQRAAYGLSALLGDLGG
500 510 520 530 540 550
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 QMGLFIGASILTVLELFDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPC
::::::::::::.::..:: ::: .: : . : :.:. .:.:...:...::
CCDS24 QMGLFIGASILTLLEILDYIYEVSWDRLKRVWRRPKTPLRTSTGGISTLGLQELKEQSPC
560 570 580 590 600 610
540 550 560
pF1KE2 ESLRGHPAGMTYAANILPHH-----PARGTFEDFTC
: ::. : ....::.: : : ::::.:
CCDS24 PS-RGRVEG-GGVSSLLPNHHHPHGPPGGLFEDFAC
620 630 640
562 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Jun 2 11:44:48 2017 done: Fri Jun 2 11:44:49 2017
Total Scan time: 2.660 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]