Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2680
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2680, 427 aa
1>>>pF1KE2680 427 - 427 aa - 427 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6246+/-0.000827; mu= 16.5747+/- 0.050
mean_var=70.0081+/-13.849, 0's: 0 Z-trim(107.1): 70 B-trim: 3 in 1/52
Lambda= 0.153285
statistics sampled from 9287 (9361) to 9287 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.659), E-opt: 0.2 (0.288), width: 16
Scan time: 1.960
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19 ( 427) 2822 633.0 1.7e-181
CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6 ( 428) 2594 582.6 2.6e-166
CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3 ( 407) 891 205.9 5.7e-53
CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 406) 874 202.2 7.8e-52
CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17 ( 411) 858 198.6 9.1e-51
CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11 ( 483) 838 194.3 2.2e-49
CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1 ( 824) 776 180.6 4.8e-45
CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 455) 735 171.5 1.5e-42
CCDS10888.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 479) 716 167.3 3e-41
CCDS10889.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 478) 704 164.6 1.9e-40
CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19 ( 483) 693 162.2 1e-39
CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 ( 796) 686 160.7 4.5e-39
CCDS42187.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 370) 668 156.6 3.7e-38
CCDS58511.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 347) 655 153.7 2.6e-37
CCDS44766.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 483) 641 150.7 2.9e-36
CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1 ( 619) 641 150.7 3.6e-36
CCDS32475.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 448) 636 149.6 5.9e-36
CCDS58478.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 453) 636 149.6 6e-36
CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031) 638 150.2 8.9e-36
CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032) 638 150.2 8.9e-36
CCDS82009.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 447) 622 146.5 5e-35
CCDS81646.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 369) 597 140.9 2e-33
CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6 ( 648) 589 139.2 1.1e-32
CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17 ( 938) 579 137.1 7e-32
CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 729) 565 134.0 4.8e-31
CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 731) 565 134.0 4.8e-31
CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2 ( 670) 563 133.5 6e-31
CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX ( 631) 560 132.8 9.1e-31
CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 554 131.5 2.2e-30
CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 554 131.5 2.2e-30
CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 881) 554 131.6 3e-30
CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 882) 554 131.6 3e-30
CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17 ( 599) 545 129.5 8.7e-30
CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11 ( 875) 537 127.8 4.1e-29
CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5 ( 622) 533 126.9 5.6e-29
CCDS55404.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 646) 519 123.8 5e-28
CCDS43931.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 662) 519 123.8 5.1e-28
CCDS14782.1 DDX3Y gene_id:8653|Hs108|chrY ( 660) 512 122.2 1.5e-27
CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 575) 485 116.2 8.2e-26
CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 690) 485 116.3 9.7e-26
CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 704) 485 116.3 9.8e-26
CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 724) 485 116.3 1e-25
CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 715) 433 104.8 2.9e-22
CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 783) 433 104.8 3.1e-22
CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10 ( 737) 415 100.8 4.7e-21
CCDS59053.1 DDX56 gene_id:54606|Hs108|chr7 ( 507) 410 99.6 7.3e-21
CCDS8770.1 DDX23 gene_id:9416|Hs108|chr12 ( 820) 400 97.5 5.1e-20
CCDS5492.1 DDX56 gene_id:54606|Hs108|chr7 ( 547) 329 81.7 1.9e-15
CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12 ( 600) 292 73.5 6e-13
CCDS6952.1 DDX31 gene_id:64794|Hs108|chr9 ( 585) 291 73.3 6.9e-13
>>CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19 (427 aa)
initn: 2822 init1: 2822 opt: 2822 Z-score: 3371.9 bits: 633.0 E(32554): 1.7e-181
Smith-Waterman score: 2822; 100.0% identity (100.0% similar) in 427 aa overlap (1-427:1-427)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAEQDVENDLLDYDEEEEPQAPQESTPAPPKKDIKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MAEQDVENDLLDYDEEEEPQAPQESTPAPPKKDIKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 DCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVMCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVMCH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 TRELAFQISKEYERFSKYMPSVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TRELAFQISKEYERFSKYMPSVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALVR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 NRSFSLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLSKDIRPVCRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NRSFSLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLSKDIRPVCRK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 FMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVIIFVKSVQRCM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVIIFVKSVQRCM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 ALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 YDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDIS
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 TYIEQSR
:::::::
CCDS12 TYIEQSR
>>CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6 (428 aa)
initn: 2585 init1: 2519 opt: 2594 Z-score: 3099.4 bits: 582.6 E(32554): 2.6e-166
Smith-Waterman score: 2594; 90.0% identity (97.7% similar) in 428 aa overlap (1-427:1-428)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MAEQDVENDLLDY-DEEEEPQAPQESTPAPPKKDIKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAI
:::.::.:.:::: :.: : : ... :: :::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MAENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 VDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVMC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::.:::::
CCDS46 VDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMC
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 HTRELAFQISKEYERFSKYMPSVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALV
:::::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::::::::.:::::::::::.
CCDS46 HTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 RNRSFSLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLSKDIRPVCR
::.:..::..:::.::::::::::::::::::::::.:::::: :::::::::.::::::
CCDS46 RNKSLNLKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 KFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVIIFVKSVQRC
::::::::.::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS46 KFMQDPMEIFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDNEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRC
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 MALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVF
.:::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS46 IALAQLLVEQNFPAIAIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIAF
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 NYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::.::::
CCDS46 NYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEIDI
370 380 390 400 410 420
420
pF1KE2 STYIEQSR
:.::::.:
CCDS46 SSYIEQTR
>>CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3 (407 aa)
initn: 797 init1: 411 opt: 891 Z-score: 1064.4 bits: 205.9 E(32554): 5.7e-53
Smith-Waterman score: 891; 38.3% identity (72.4% similar) in 373 aa overlap (46-417:35-403)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 EEEPQAPQESTPAPPKKDIKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECI
: :. :: :::.: :::.:: .:.. :
CCDS32 SADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAI
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 PQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVMCHTRELAFQISKEYERF
: :.::. ::.:: ::::.:... :::.: .. .::. ::::: ::.: .
CCDS32 IPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILAL
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 SKYMPSVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALVRNRSFSLKNVKHFVLD
. :: .. . .:: ..... . :. . ::.:::::::.. .. : .: : .: ::::
CCDS32 GDYM-GATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLD
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 ECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLSKDIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETK
: :.:: . .. .. :::. : ...:::. :. : .:::.::....: : .
CCDS32 EADEMLSR-GFKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKE-E
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 LTLHGLQQYYVKLKDSE-KNRKLFDLLDVLEFNQVIIFVKSVQRCMALAQLLVEQNFPAI
:::.:..:.:.... : : : :: ..: ..:..::... .. :.. . ..: .
CCDS32 LTLEGIKQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTVS
250 260 270 280 290 300
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 AIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFNYDMPEDSDTYLHRV
:.: : :.:: ...:.. . :.:..:.:..::.:...:..:.:::.: . ..:.::.
CCDS32 ALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNRENYIHRI
310 320 330 340 350 360
380 390 400 410 420
pF1KE2 ARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDISTYIEQSR
.:.:::: ::.::.::..: : .:: :.. ....: :.: ..
CCDS32 GRGGRFGRKGVAINFVTEE-DKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI
370 380 390 400
>>CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 (406 aa)
initn: 781 init1: 405 opt: 874 Z-score: 1044.1 bits: 202.2 E(32554): 7.8e-52
Smith-Waterman score: 874; 36.5% identity (72.0% similar) in 389 aa overlap (30-417:19-402)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MAEQDVENDLLDYDEEEEPQAPQESTPAPPKKDIKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIV
:. :.... : .: : :. :. :::.:
CCDS11 MSASQDSRSRDNGPDGMEPEGVIESNWNEIVDS-FDDMNLSESLLRGIY
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 DCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVMCH
:::.:: .:.. : : :.::. ::.:: ::::.:... ::::: . .::.
CCDS11 AYGFEKPSAIQQRAILPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQIELDLKATQALVLAP
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 TRELAFQISKEYERFSKYMPSVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALVR
::::: ::.: .. :: ... . .:: ... . . :. . ::..::::::.. ..
CCDS11 TRELAQQIQKVVMALGDYM-GASCHACIGGTNVRAEVQKLQMEAPHIIVGTPGRVFDMLN
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 NRSFSLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLSKDIRPVCRK
: .: : .: ::::: :.:: . .. .. .::. . : ...:::. .:. : .:
CCDS11 RRYLSPKYIKMFVLDEADEMLSR-GFKDQIYDIFQKLNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTKK
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KE2 FMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSE-KNRKLFDLLDVLEFNQVIIFVKSVQRC
::.::....: : .:::.:..:.:.... : : : :: ..: ..:..::... ..
CCDS11 FMRDPIRILVKKE-ELTLEGIRQFYINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFINTRRKV
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 MALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVF
:.. . ..: . :.: : :.:: ...:.. . :.:..:.:..::.:...:..:.
CCDS11 DWLTEKMHARDFTVSAMHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVI
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 NYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDI
:::.: . ..:.::..:.:::: ::.::..:..: : . : :.. ..... :.: ..
CCDS11 NYDLPTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINMVTEE-DKRTLRDIETFYNTSIEEMPLNVAD
350 360 370 380 390 400
420
pF1KE2 STYIEQSR
CCDS11 LI
>>CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17 (411 aa)
initn: 715 init1: 379 opt: 858 Z-score: 1024.9 bits: 198.6 E(32554): 9.1e-51
Smith-Waterman score: 858; 35.9% identity (71.6% similar) in 373 aa overlap (46-417:40-407)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 EEEPQAPQESTPAPPKKDIKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECI
: . :. .:::.: :::.:: .:.. :
CCDS11 SGSARKRLLKEEDMTKVEFETSEEVDVTPTFDTMGLREDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAI
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 PQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVMCHTRELAFQISKEYERF
: : : ::. :..:: ::::.: ...:: .. .. .:.. ::::: ::.: .
CCDS11 KQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQVRETQALILAPTRELAVQIQKGLLAL
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 SKYMPSVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALVRNRSFSLKNVKHFVLD
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CCDS11 GDYM-NVQCHACIGGTNVGEDIRKLDYG-QHVVAGTPGRVFDMIRRRSLRTRAIKMLVLD
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 ECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLSKDIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETK
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CCDS11 EADEMLNK-GFKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPIRILVKRD-E
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 LTLHGLQQYYVKLKDSE-KNRKLFDLLDVLEFNQVIIFVKSVQRCMALAQLLVEQNFPAI
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CCDS11 LTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREANFTVS
250 260 270 280 290 300
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 AIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFNYDMPEDSDTYLHRV
..: : :.:: : ...:.. :.:..:....::.:. .:....:::.:.. . :.::.
CCDS11 SMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLISTDVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELYIHRI
310 320 330 340 350 360
380 390 400 410 420
pF1KE2 ARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDISTYIEQSR
.:.::.: ::.::.::... : .:: :... . ... :.: ..
CCDS11 GRSGRYGRKGVAINFVKND-DIRILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
370 380 390 400 410
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10 20 30 40 50
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CCDS44 NQLKNTNTINNGTQQQAQSMTTTIKPGDDWKKTLKLPPKDLRIKTSDVTSTKGNEFEDYC
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60 70 80 90 100 110
pF1KE2 LKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVN
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CCDS44 LKRELLMGIFEMGWEKPSPIQEESIPIALSGRDILARAKNGTGKSGAYLIPLLERLDLKK
110 120 130 140 150 160
120 130 140 150 160
pF1KE2 GQVTVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPSVKVSVFFGGLSIKKDEEVLK-KNCPHVVV
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CCDS44 DNIQAMVIVPTRELALQVSQICIQVSKHMGGAKVMATTGGTNLRDD--IMRLDDTVHVVI
170 180 190 200 210 220
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 GTPGRILALVRNRSFSLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSAT
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CCDS44 ATPGRILDLIKKGVAKVDHVQMIVLDEADKLLSQ-DFVQIMEDIILTLPKNRQILLYSAT
230 240 250 260 270
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 LSKDIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQV
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CCDS44 FPLSVQKFMNSHLQKPYEINLMEE--LTLKGVTQYYAYVTERQKVHCLNTLFSRLQINQS
280 290 300 310 320 330
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 IIFVKSVQRCMALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRG
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CCDS44 IIFCNSSQRVELLAKKISQLGYSCFYIHAKMRQEHRNRVFHDFRNGLCRNLVCTDLFTRG
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350 360 370 380 390 400
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CCDS44 IDIQAVNVVINFDFPKLAETYLHRIGRSGRFGHLGLAINLIT-YDDRFNLKSIEEQLGTE
400 410 420 430 440 450
410 420
pF1KE2 VAELPEEIDISTYIEQSR
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CCDS44 IKPIPSNIDKSLYVAEYHSEPVEDEKP
460 470 480
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10 20 30 40
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CCDS84 MAAAFEASGALAAVATAMPAEHVAVQVPAPEPTPGPVRILRTAQDLSSPRTRTGDVLLAE
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50 60 70 80 90 100
pF1KE2 SSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLAT
. :...::. .:... :::.:: :: . :: . :.:.. ::::: ::: :: .
CCDS84 PADFESLLLSRPVLEGLRAAGFERPSPVQLKAIPLGRCGLDLIVQAKSGTGKTCVFSTIA
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110 120 130 140 150 160
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CCDS84 LDSLVLENLSTQILILAPTREIAVQIHSVITAIGIKMEGLECHVFIGGTPLSQDKTRLKK
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
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CCDS84 -C-HIAVGSPGRIKQLIELDYLNPGSIRLFILDEADKLLEEGSFQEQINWIYSSLPASKQ
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230 240 250 260 270
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. ::: . . . :.:.:: : ... . .: ::.::: :. .: ::
CCDS84 MLAVSATYPEFLANALTKYMRDPTFVRLNS-SDPSLIGLKQYY-KVVNSYPLAHKVFEEK
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280 290 300 310 320 330
pF1KE2 NRKLFDLLDVLEFNQVIIFVKSVQRCMALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFK
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CCDS84 TQHLQELFSRIPFNQALVFSNLHSRAQHLADILSSKGFPAECISGNMNQNQRLDAMAKLK
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340 350 360 370 380 390
pF1KE2 DFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDE
:. :.:..:.: .::.: :.::.: : :.: : .::.::..::::::: ::..:.
CCDS84 HFHCRVLISTDLTSRGIDAEKVNLVVNLDVPLDWETYMHRIGRAGRFGTLGLTVTYCCRG
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400 410 420
pF1KE2 NDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDISTYIEQSR
.. ... . .. ..:. ::. :
CCDS84 EEENMMMRIAQKCNINLLPLPDPIPSGLMEECVDWDVEVKAAVHTYGIASVPNQPLKKQI
420 430 440 450 460 470
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CCDS86 DQLGWTKPTKIQIEAIPLALQGRDIIGLAETGSGKTGAFALPILNALLETPQRLFALVLT
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pF1KE2 HTRELAFQISKEYERFSKYMPSVKVSVFFGGL-SIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILAL
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CCDS86 PTRELAFQISEQFEALGSSI-GVQSAVIVGGIDSMSQSLALAKK--PHIIIATPGRLIDH
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pF1KE2 VRN-RSFSLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLSKDIRPV
..: ..:.:. .:..:.:: :..:. .:.. .:..:... :.... ..::::..: .. .
CCDS86 LENTKGFNLRALKYLVMDEADRILN-MDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKL
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: ...:.. :... . :.. :::::. . .. :. : .:. : :. .:: .. .
CCDS86 QRAALKNPVKCAVSSKYQ-TVEKLQQYYIFIPSKFKDTYLVYILNELAGNSFMIFCSTCN
220 230 240 250 260 270
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pF1KE2 RCMALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNI
. : :: . .: :: .: :.: .::. ..:: : ::.::.. .::.:: .:..
CCDS86 NTQRTALLLRNLGFTAIPLHGQMSQSKRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDV
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pF1KE2 VFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEI
: :.:.: : :.:::.:..: : .: :::::. . :..... .. . .. .: .
CCDS86 VVNFDIPTHSKDYIHRVGRTARAGRSGKAITFVT-QYDVELFQRIEHLIGKKLPGFPTQD
340 350 360 370 380 390
420
pF1KE2 DISTYIEQSR
:
CCDS86 DEVMMLTERVAEAQRFARMELREHGEKKKRSREDAGDNDDTEGAIGVRNKVAGGKMKKRK
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70 80 90 100 110
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CCDS10 AMGFNRPSKIQENALPLMLAEPPQNLIAQSQSGTGKTAAFVLAMLSQVEPANKYPQCLCL
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pF1KE2 CHTRELAFQISKEYERFSKYMPSVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILAL
: :::.: .: :...:..: .:.. : .... ... .. .:.:::: .:
CCDS10 SPTYELALQTGKVIEQMGKFYPELKLAYAVRGNKLERGQKISEQ----IVIGTPGTVLDW
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180 190 200 210 220 230
pF1KE2 VRNRSF-SLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLSKDIRPV
. .: . :..: ::::: : :. . . .: :. :.. : ..::::. ..
CCDS10 CSKLKFIDPKKIKVFVLDEADVMIATQGHQDQSIRIQRMLPRNCQMLLFSATFEDSVWKF
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240 250 260 270 280 290
pF1KE2 CRKFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKD-SEKNRKLFDLLDVLEFNQVIIFVKSV
.: . :: . . : . :: ..:::: .. .:: . : .: .. . :..:: ..
CCDS10 AQKVVPDPNVIKLKREEE-TLDTIKQYYVLCSSRDEKFQALCNLYGAITIAQAMIFCHTR
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300 310 320 330 340 350
pF1KE2 QRCMALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVN
. :: : ... . . : :.: . ..:.. ....::.::. .::.:.:.:.
CCDS10 KTASWLAAELSKEGHQVALLSGEMMVEQRAAVIERFREGKEKVLVTTNVCARGIDVEQVS
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360 370 380 390 400 410
pF1KE2 IVFNYDMPEDSD------TYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNV
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CCDS10 VVINFDLPVDKDGNPDNETYLHRIGRTGRFGKRGLAVNMVDSKHSMNILNRIQEHFNKKI
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420
pF1KE2 AELP-EEIDISTYIEQSR
.: ...:
CCDS10 ERLDTDDLDEIEKIAN
470
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pF1KE2 MAEQDVENDLLDYDEEEEPQAPQESTPAPPKKDIKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIV
..: .. :..: :... :::.::...
CCDS10 EEKEDRAAQSLLNKLIRSNLVDNTNQVEVLQRDPNSPLYSVKS--FEELRLKPQLLQGVY
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CCDS10 AMGFNRPSKIQENALPMMLAEPPQNLIAQSQSGTGKTAAFVLAMLSRVEPSDRYPQCLCL
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pF1KE2 CHTRELAFQISKEYERFSKYMPSVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILAL
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CCDS10 SPTYELALQTGKVIEQMGKFYPELKLAYAVRGNKLERGQKISEQ----IVIGTPGTVLDW
170 180 190 200 210 220
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pF1KE2 VRNRSF-SLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLSKDIRPV
. .: . :..: ::::: : :. . . .: :. :.. : ..::::. ..
CCDS10 CSKLKFIDPKKIKVFVLDEADVMIATQGHQDQSIRIQRMLPRNCQMLLFSATFEDSVWKF
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240 250 260 270 280 290
pF1KE2 CRKFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKD-SEKNRKLFDLLDVLEFNQVIIFVKSV
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CCDS10 AQKVVPDPNVIKLKREEE-TLDTIKQYYVLCSSRDEKFQALCNLYGAITIAQAMIFCHTR
290 300 310 320 330 340
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CCDS10 KTASWLAAELSKEGHQVALLSGEMMVEQRAAVIERFREGKEKVLVTTNVCARGIDVEQVS
350 360 370 380 390 400
360 370 380 390 400 410
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CCDS10 VVINFDLPVDKDGNPDNETYLHRIGRTGRFGKRGLAVNMVDSKHSMNILNRIQEHFNKKI
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.: ...:
CCDS10 ERLDTDDLDEIEKIAN
470
427 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]