Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2673
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2673, 793 aa
1>>>pF1KE2673 793 - 793 aa - 793 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7178+/-0.000991; mu= 18.5058+/- 0.060
mean_var=73.2766+/-14.725, 0's: 0 Z-trim(104.6): 49 B-trim: 54 in 1/50
Lambda= 0.149827
statistics sampled from 7969 (8009) to 7969 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.599), E-opt: 0.2 (0.246), width: 16
Scan time: 3.840
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS58856.1 TRPC1 gene_id:7220|Hs108|chr3 ( 793) 5237 1141.9 0
CCDS3126.1 TRPC1 gene_id:7220|Hs108|chr3 ( 759) 4345 949.1 0
CCDS45038.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 893) 2284 503.6 5.8e-142
CCDS9365.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 977) 2284 503.6 6.3e-142
CCDS45037.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 982) 2272 501.0 3.8e-141
CCDS14561.1 TRPC5 gene_id:7224|Hs108|chrX ( 973) 2257 497.8 3.6e-140
CCDS45039.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 836) 2211 487.8 3.1e-137
CCDS45036.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 828) 1921 425.1 2.3e-118
CCDS45035.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 804) 1397 311.8 2.8e-84
CCDS3725.1 TRPC3 gene_id:7222|Hs108|chr4 ( 848) 747 171.3 5.7e-42
CCDS47130.1 TRPC3 gene_id:7222|Hs108|chr4 ( 921) 747 171.4 6.2e-42
CCDS8311.1 TRPC6 gene_id:7225|Hs108|chr11 ( 931) 737 169.2 2.8e-41
CCDS47267.2 TRPC7 gene_id:57113|Hs108|chr5 ( 862) 692 159.5 2.2e-38
CCDS54905.1 TRPC7 gene_id:57113|Hs108|chr5 ( 746) 362 88.1 5.8e-17
CCDS54906.1 TRPC7 gene_id:57113|Hs108|chr5 ( 801) 362 88.1 6.2e-17
>>CCDS58856.1 TRPC1 gene_id:7220|Hs108|chr3 (793 aa)
initn: 5237 init1: 5237 opt: 5237 Z-score: 6112.6 bits: 1141.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5237; 100.0% identity (100.0% similar) in 793 aa overlap (1-793:1-793)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MMAALYPSTDLSGASSSSLPSSPSSSSPNEVMALKDVREVKEENTLNEKLFLLACDKGDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MMAALYPSTDLSGASSSSLPSSPSSSSPNEVMALKDVREVKEENTLNEKLFLLACDKGDY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 YMVKKILEENSSGDLNINCVDVLGRNAVTITIENENLDILQLLLDYGCQSADALLVAIDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YMVKKILEENSSGDLNINCVDVLGRNAVTITIENENLDILQLLLDYGCQSADALLVAIDS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 EVVGAVDILLNHRPKRSSRPTIVKLMERIQNPEYSTTMDVAPVILAAHRNNYEILTMLLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EVVGAVDILLNHRPKRSSRPTIVKLMERIQNPEYSTTMDVAPVILAAHRNNYEILTMLLK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QDVSLPKPHAVGCECTLCSAKNKKDSLRHSRFRLDIYRCLASPALIMLTEEDPILRAFEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QDVSLPKPHAVGCECTLCSAKNKKDSLRHSRFRLDIYRCLASPALIMLTEEDPILRAFEL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SADLKELSLVEVEFRNDYEELARQCKMFAKDLLAQARNSRELEVILNHTSSDEPLDKRGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SADLKELSLVEVEFRNDYEELARQCKMFAKDLLAQARNSRELEVILNHTSSDEPLDKRGL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 LEERMNLSRLKLAIKYNQKEFVSQSNCQQFLNTVWFGQMSGYRRKPTCKKIMTVLTVGIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LEERMNLSRLKLAIKYNQKEFVSQSNCQQFLNTVWFGQMSGYRRKPTCKKIMTVLTVGIF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 WPVLSLCYLIAPKSQFGRIIHTPFMKFIIHGASYFTFLLLLNLYSLVYNEDKKNTMGPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 WPVLSLCYLIAPKSQFGRIIHTPFMKFIIHGASYFTFLLLLNLYSLVYNEDKKNTMGPAL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ERIDYLLILWIIGMIWSDIKRLWYEGLEDFLEESRNQLSFVMNSLYLATFALKVVAHNKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ERIDYLLILWIIGMIWSDIKRLWYEGLEDFLEESRNQLSFVMNSLYLATFALKVVAHNKF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 HDFADRKDWDAFHPTLVAEGLFAFANVLSYLRLFFMYTTSSILGPLQISMGQMLQDFGKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HDFADRKDWDAFHPTLVAEGLFAFANVLSYLRLFFMYTTSSILGPLQISMGQMLQDFGKF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LGMFLLVLFSFTIGLTQLYDKGYTSKEQKDCVGIFCEQQSNDTFHSFIGTCFALFWYIFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LGMFLLVLFSFTIGLTQLYDKGYTSKEQKDCVGIFCEQQSNDTFHSFIGTCFALFWYIFS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 LAHVAIFVTRFSYGEELQSFVGAVIVGTYNVVVVIVLTKLLVAMLHKSFQLIANHEDKEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LAHVAIFVTRFSYGEELQSFVGAVIVGTYNVVVVIVLTKLLVAMLHKSFQLIANHEDKEW
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 KFARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNIIPSPKTICYMISSLSKWICSHTSKGKVKRQNSLKEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KFARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNIIPSPKTICYMISSLSKWICSHTSKGKVKRQNSLKEW
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 RNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQSTDQATVENLNELRQDLSKFRNEIRDLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQSTDQATVENLNELRQDLSKFRNEIRDLLG
730 740 750 760 770 780
790
pF1KE2 FRTSKYAMFYPRN
:::::::::::::
CCDS58 FRTSKYAMFYPRN
790
>>CCDS3126.1 TRPC1 gene_id:7220|Hs108|chr3 (759 aa)
initn: 5016 init1: 4338 opt: 4345 Z-score: 5070.8 bits: 949.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4952; 95.7% identity (95.7% similar) in 793 aa overlap (1-793:1-759)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MMAALYPSTDLSGASSSSLPSSPSSSSPNEVMALKDVREVKEENTLNEKLFLLACDKGDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MMAALYPSTDLSGASSSSLPSSPSSSSPNEVMALKDVREVKEENTLNEKLFLLACDKGDY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 YMVKKILEENSSGDLNINCVDVLGRNAVTITIENENLDILQLLLDYGCQSADALLVAIDS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YMVKKILEENSSGDLNINCVDVLGRNAVTITIENENLDILQLLLDYGCQ-----------
70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 EVVGAVDILLNHRPKRSSRPTIVKLMERIQNPEYSTTMDVAPVILAAHRNNYEILTMLLK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 -----------------------KLMERIQNPEYSTTMDVAPVILAAHRNNYEILTMLLK
110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QDVSLPKPHAVGCECTLCSAKNKKDSLRHSRFRLDIYRCLASPALIMLTEEDPILRAFEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QDVSLPKPHAVGCECTLCSAKNKKDSLRHSRFRLDIYRCLASPALIMLTEEDPILRAFEL
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SADLKELSLVEVEFRNDYEELARQCKMFAKDLLAQARNSRELEVILNHTSSDEPLDKRGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SADLKELSLVEVEFRNDYEELARQCKMFAKDLLAQARNSRELEVILNHTSSDEPLDKRGL
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 LEERMNLSRLKLAIKYNQKEFVSQSNCQQFLNTVWFGQMSGYRRKPTCKKIMTVLTVGIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LEERMNLSRLKLAIKYNQKEFVSQSNCQQFLNTVWFGQMSGYRRKPTCKKIMTVLTVGIF
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 WPVLSLCYLIAPKSQFGRIIHTPFMKFIIHGASYFTFLLLLNLYSLVYNEDKKNTMGPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 WPVLSLCYLIAPKSQFGRIIHTPFMKFIIHGASYFTFLLLLNLYSLVYNEDKKNTMGPAL
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ERIDYLLILWIIGMIWSDIKRLWYEGLEDFLEESRNQLSFVMNSLYLATFALKVVAHNKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ERIDYLLILWIIGMIWSDIKRLWYEGLEDFLEESRNQLSFVMNSLYLATFALKVVAHNKF
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 HDFADRKDWDAFHPTLVAEGLFAFANVLSYLRLFFMYTTSSILGPLQISMGQMLQDFGKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HDFADRKDWDAFHPTLVAEGLFAFANVLSYLRLFFMYTTSSILGPLQISMGQMLQDFGKF
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LGMFLLVLFSFTIGLTQLYDKGYTSKEQKDCVGIFCEQQSNDTFHSFIGTCFALFWYIFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LGMFLLVLFSFTIGLTQLYDKGYTSKEQKDCVGIFCEQQSNDTFHSFIGTCFALFWYIFS
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 LAHVAIFVTRFSYGEELQSFVGAVIVGTYNVVVVIVLTKLLVAMLHKSFQLIANHEDKEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LAHVAIFVTRFSYGEELQSFVGAVIVGTYNVVVVIVLTKLLVAMLHKSFQLIANHEDKEW
570 580 590 600 610 620
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 KFARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNIIPSPKTICYMISSLSKWICSHTSKGKVKRQNSLKEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KFARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNIIPSPKTICYMISSLSKWICSHTSKGKVKRQNSLKEW
630 640 650 660 670 680
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 RNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQSTDQATVENLNELRQDLSKFRNEIRDLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQSTDQATVENLNELRQDLSKFRNEIRDLLG
690 700 710 720 730 740
790
pF1KE2 FRTSKYAMFYPRN
:::::::::::::
CCDS31 FRTSKYAMFYPRN
750
>>CCDS45038.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 (893 aa)
initn: 2217 init1: 881 opt: 2284 Z-score: 2662.1 bits: 503.6 E(32554): 5.8e-142
Smith-Waterman score: 2284; 48.3% identity (75.0% similar) in 768 aa overlap (37-793:20-766)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 PSTDLSGASSSSLPSSPSSSSPNEVMALKDVREVKEENTLN--EKLFLLACDKGDYYMVK
.: :. :. :. :: .: : .:::: ::
CCDS45 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVK
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KILEENSSG-DLNINCVDVLGRNAVTITIENENLDILQLLLDYGCQSADALLVAIDSEVV
: ::: .::::.: :::.:. :.::::::....:::... .:::: :: .:::
CCDS45 KSLEEAEIYFKININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFNVYVGDALLHAIRKEVV
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 GAVDILLNHRPKRSSRPTIVKLMERIQNPEYSTTMDVAPVILAAHRNNYEILTMLLKQDV
:::..::::. : :.. . .. : :. : :..:.::::: :::::. .:... :
CCDS45 GAVELLLNHK-KPSGEKQVPPILLDKQFSEF--TPDITPIILAAHTNNYEIIKLLVQKGV
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 SLPKPHAVGCECTLCSAKNKKDSLRHSRFRLDIYRCLASPALIMLTEEDPILRAFELSAD
:.:.:: : :.:. : ... ::::::: ::.::. ::::.:: :. :::.: ::.:: .
CCDS45 SVPRPHEVRCNCVECVSSSDVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPFLTAFQLSWE
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 LKELSLVEVEFRNDYEELARQCKMFAKDLLAQARNSRELEVILNHTSSDEPLDKRGLLEE
:.::: :: ::...::::.::::.:::::: :.:.:::::.:::. : .:.::
CCDS45 LQELSKVENEFKSEYEELSRQCKQFAKDLLDQTRSSRELEIILNYR------DDNSLIEE
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 RM--NLSRLKLAIKYNQKEFVSQSNCQQFLNTVWFGQMSGYRRKPTCKKIMTVLTVGIFW
. .:.:::::::: :::::.: ::::.: . :. .. :.::. :..: . .:...
CCDS45 QSGNDLARLKLAIKYRQKEFVAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRHWAVKMVTCFIIGLLF
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 PVLSLCYLIAPKSQFGRIIHTPFMKFIIHGASYFTFLLLLNLYSLVYNEDKKNTMGPALE
::.:.:::::::: .: .:. ::.::: : :::.:::.:: : : ... : .::
CCDS45 PVFSVCYLIAPKSPLGLFIRKPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQHIDRSDLNRQGPPPT
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 RIDYLLILWIIGMIWSDIKRLWYEGLEDFLEESRNQLSFVMNSLYLATFALKVVAHNKFH
...... :..:.::..::..: ::.:.... : ..::::::::::..::.:: :.
CCDS45 IVEWMILPWVLGFIWGEIKQMWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVAFVKYS
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 DFADRKDWDAFHPTLVAEGLFAFANVLSYLRLFFMYTTSSILGPLQISMGQMLQDFGKFL
. :..:: .:::::::.:::.::..: :::. ..:..: :::::::.:.:: :. :::
CCDS45 ALNPRESWDMWHPTLVAEALFAIANIFSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFL
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590
pF1KE2 GMFLLVLFSFTIGLTQLYDKGYTSKEQKD--CVGIFCEQQSNDTFHSFIGTCFALFWYIF
.. :::..:. ::.::: . .: : : :: ::.: :..: ... : .::: ::
CCDS45 FIYCLVLLAFANGLNQLY---FYYEETKGLTCKGIRCEKQ-NNAFSTLFETLQSLFWSIF
530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 SLAHVAIFVTRFSYGEELQSFVGAVIVGTYNVVVVIVLTKLLVAMLHKSFQLIANHEDKE
.: . ..:: . .:. ::::.. :::::. ..:: ..:.::...:.::::.: : :
CCDS45 GL--INLYVTNVKAQHEFTEFVGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIE
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 WKFARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNIIPSPKTICYMISSLSKWICSHTSKGKVKRQ----N
:::::.:::.:::.. ::: :::.:::::.. :.: ::: .: : :..:. .
CCDS45 WKFARTKLWMSYFEEGGTLPTPFNVIPSPKSLWYLI----KWIWTHLCKKKMRRKPESFG
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 SLKEWRNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQSTDQATVENLNELRQDLSKFRNEI
.. . . .: ..::.:: ::.::...: . .. . : ::..::.::.:.:: :.
CCDS45 TIGRRAADNLRRHHQYQEVMRNLVKRYVAAMIRDAKTEEGLTEENFKELKQDISSFRFEV
700 710 720 730 740 750
780 790
pF1KE2 RDLLGFRTSKYAMFYPRN
:: : :: . . :
CCDS45 LGLL--RGSKLSTIQSANASKESSNSADSDEKSDSEEEVARQQAAGPLERNIQLESRGLA
760 770 780 790 800
>>CCDS9365.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 (977 aa)
initn: 2217 init1: 881 opt: 2284 Z-score: 2661.5 bits: 503.6 E(32554): 6.3e-142
Smith-Waterman score: 2284; 48.3% identity (75.0% similar) in 768 aa overlap (37-793:20-766)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 PSTDLSGASSSSLPSSPSSSSPNEVMALKDVREVKEENTLN--EKLFLLACDKGDYYMVK
.: :. :. :. :: .: : .:::: ::
CCDS93 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVK
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KILEENSSG-DLNINCVDVLGRNAVTITIENENLDILQLLLDYGCQSADALLVAIDSEVV
: ::: .::::.: :::.:. :.::::::....:::... .:::: :: .:::
CCDS93 KSLEEAEIYFKININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFNVYVGDALLHAIRKEVV
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 GAVDILLNHRPKRSSRPTIVKLMERIQNPEYSTTMDVAPVILAAHRNNYEILTMLLKQDV
:::..::::. : :.. . .. : :. : :..:.::::: :::::. .:... :
CCDS93 GAVELLLNHK-KPSGEKQVPPILLDKQFSEF--TPDITPIILAAHTNNYEIIKLLVQKGV
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 SLPKPHAVGCECTLCSAKNKKDSLRHSRFRLDIYRCLASPALIMLTEEDPILRAFELSAD
:.:.:: : :.:. : ... ::::::: ::.::. ::::.:: :. :::.: ::.:: .
CCDS93 SVPRPHEVRCNCVECVSSSDVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPFLTAFQLSWE
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 LKELSLVEVEFRNDYEELARQCKMFAKDLLAQARNSRELEVILNHTSSDEPLDKRGLLEE
:.::: :: ::...::::.::::.:::::: :.:.:::::.:::. : .:.::
CCDS93 LQELSKVENEFKSEYEELSRQCKQFAKDLLDQTRSSRELEIILNYR------DDNSLIEE
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 RM--NLSRLKLAIKYNQKEFVSQSNCQQFLNTVWFGQMSGYRRKPTCKKIMTVLTVGIFW
. .:.:::::::: :::::.: ::::.: . :. .. :.::. :..: . .:...
CCDS93 QSGNDLARLKLAIKYRQKEFVAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRHWAVKMVTCFIIGLLF
290 300 310 320 330 340
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:: : :: . . :
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: :. :::: :
CCDS14 RYEVLDLLGNRKHPRSFSTSSTELSQRDDNNDGSGGARAKSKSVSFNLGCKKKTCHGPPL
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CCDS45 GAVELLLNHK-KPSGEKQVPPILLDKQFSEF--TPDITPIILAAHTNNYEIIKLLVQKGV
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CCDS45 SVPRPHEVRCNCVECVSSSDVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPFLTAFQLSWE
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CCDS45 PVFSVCYLIAPKSPLGLFIRKPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQHIDRSDLNRQGPPPT
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pF1KE2 RIDYLLILWIIGMIWSDIKRLWYEGLEDFLEESRNQLSFVMNSLYLATFALKVVAHNKFH
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CCDS45 IVEWMILPWVLGFIWGEIKQMWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVAFVKYS
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CCDS45 ALNPRESWDMWHPTLVAEALFAIANIFSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFL
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CCDS45 GL--INLYVTNVKAQHEFTEFVGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIE
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pF1KE2 WKFARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNIIPSPKTICYMISSLSKWICSHTSKGKVKRQ----N
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CCDS45 WKFARTKLWMSYFEEGGTLPTPFNVIPSPKSLWYLI----KWIWTHLCKKKMRRKPESFG
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pF1KE2 SLKEWRNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQSTDQATVENLNELRQDLSKFRNEI
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CCDS45 TIGRRAADNLRRHHQYQEVMRNLVKRYVAAMIRDAKTEEVARQQAAGPLERNIQLESRGL
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pF1KE2 RDLLGFRTSKYAMFYPRN
CCDS45 ASRGDLSIPGLSEQCVLVDHRERNTDTLGLQVGKRVCPFKSEKVVVEDTVPIIPKEKHAK
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CCDS45 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVK
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CCDS45 KSLEEAEIYFKININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFNVYVGDALLHAIRKEVV
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:::..::::. : :.. . .. : :. : :..:.::::: :::::. .:... :
CCDS45 GAVELLLNHK-KPSGEKQVPPILLDKQFSEF--TPDITPIILAAHTNNYEIIKLLVQKGV
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 SLPKPHAVGCECTLCSAKNKKDSLRHSRFRLDIYRCLASPALIMLTEEDPILRAFELSAD
:.:.:: : :.:. : ... ::::::: ::.::. ::::.:: :. :::.: ::.:: .
CCDS45 SVPRPHEVRCNCVECVSSSDVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPFLTAFQLSWE
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 LKELSLVEVEFRNDYEELARQCKMFAKDLLAQARNSRELEVILNHTSSDEPLDKRGLLEE
:.::: :: ::...::::.::::.:::::: :.:.:::::.:::. : .:.::
CCDS45 LQELSKVENEFKSEYEELSRQCKQFAKDLLDQTRSSRELEIILNYR------DDNSLIEE
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 RM--NLSRLKLAIKYNQKEFVSQSNCQQFLNTVWFGQMSGYRRKPTCKKIMTVLTVGIFW
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CCDS45 QSGNDLARLKLAIKYRQKEFVAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRHWAVKMVTCFIIGLLF
290 300 310 320 330 340
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pF1KE2 PVLSLCYLIAPKSQFGRIIHTPFMKFIIHGASYFTFLLLLNLYSLVYNEDKKNTMGPALE
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CCDS45 PVFSVCYLIAPKSPLGLFIRKPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQHIDRSDLNRQGPPPT
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 RIDYLLILWIIGMIWSDIKRLWYEGLEDFLEESRNQLSFVMNSLYLATFALKVVAHNKFH
...... :..:.::..::..: ::.:.... : ..::::::::::..::.:: :.
CCDS45 IVEWMILPWVLGFIWGEIKQMWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVAFVKYS
410 420 430 440 450 460
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pF1KE2 DFADRKDWDAFHPTLVAEGLFAFANVLSYLRLFFMYTTSSILGPLQISMGQMLQDFGKFL
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CCDS45 ALNPRESWDMWHPTLVAEALFAIANIFSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFL
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590
pF1KE2 GMFLLVLFSFTIGLTQLYDKGYTSKEQKD--CVGIFCEQQSNDTFHSFIGTCFALFWYIF
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CCDS45 FIYCLVLLAFANGLNQLY---FYYEETKGLTCKGIRCEKQ-NNAFSTLFETLQSLFWSIF
530 540 550 560 570
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pF1KE2 SLAHVAIFVTRFSYGEELQSFVGAVIVGTYNVVVVIVLTKLLVAMLHKSFQLIANHEDKE
.: . ..:: . .:. ::::.. :::::. ..:: ..:.::...:.::::
CCDS45 GL--INLYVTNVKAQHEFTEFVGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIAR-----
580 590 600 610 620
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 WKFARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNIIPSPKTICYMISSLSKWICSHTSKGKVKRQNSLKE
:: :
CCDS45 ----RAA------D----------------------------------------------
630
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 WRNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQSTDQATVENLNELRQDLSKFRNEIRDLL
:: .: ..::.:: ::.::...: . .. . : ::..::.::.:.:: :. ::
CCDS45 --NL--RRHHQYQEVMRNLVKRYVAAMIRDAKTEEGLTEENFKELKQDISSFRFEVLGLL
640 650 660 670 680
780 790
pF1KE2 GFRTSKYAMFYPRN
: :: . . :
CCDS45 --RGSKLSTIQSANASKESSNSADSDEKSDSEEEVARQQAAGPLERNIQLESRGLASRGD
690 700 710 720 730 740
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.:.::.: ::::.: . :. .. :.::.
CCDS45 VYVGDALLHAIRKEVVGAVELLLNHKKPSGEKQFVAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRHW
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pF1KE2 CKKIMTVLTVGIFWPVLSLCYLIAPKSQFGRIIHTPFMKFIIHGASYFTFLLLLNLYSLV
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CCDS45 AVKMVTCFIIGLLFPVFSVCYLIAPKSPLGLFIRKPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQH
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... : .:: ...... :..:.::..::..: ::.:.... : ..::::::::
CCDS45 IDRSDLNRQGPPPTIVEWMILPWVLGFIWGEIKQMWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYL
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::..::.:: :. . :..:: .:::::::.:::.::..: :::. ..:..: :::::
CCDS45 ATISLKIVAFVKYSALNPRESWDMWHPTLVAEALFAIANIFSSLRLISLFTANSHLGPLQ
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pF1KE2 ISMGQMLQDFGKFLGMFLLVLFSFTIGLTQLYDKGYTSKEQKD--CVGIFCEQQSNDTFH
::.:.:: :. ::: .. :::..:. ::.::: . .: : : :: ::.: :..:
CCDS45 ISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLY---FYYEETKGLTCKGIRCEKQ-NNAFS
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pF1KE2 SFIGTCFALFWYIFSLAHVAIFVTRFSYGEELQSFVGAVIVGTYNVVVVIVLTKLLVAML
... : .::: ::.: . ..:: . .:. ::::.. :::::. ..:: ..:.::.
CCDS45 TLFETLQSLFWSIFGL--INLYVTNVKAQHEFTEFVGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMM
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pF1KE2 HKSFQLIANHEDKEWKFARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNIIPSPKTICYMISSLSKWICSH
..:.::::.: : ::::::.:::.:::.. ::: :::.:::::.. :.: ::: .:
CCDS45 NNSYQLIADHADIEWKFARTKLWMSYFEEGGTLPTPFNVIPSPKSLWYLI----KWIWTH
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pF1KE2 TSKGKVKRQ----NSLKEWRNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQSTDQATVENL
: :..:. ... . . .: ..::.:: ::.::...: . .. . : ::.
CCDS45 LCKKKMRRKPESFGTIGRRAADNLRRHHQYQEVMRNLVKRYVAAMIRDAKTEEGLTEENF
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pF1KE2 NELRQDLSKFRNEIRDLLGFRTSKYAMFYPRN
.::.::.:.:: :. :: : :: . . :
CCDS45 KELKQDISSFRFEVLGLL--RGSKLSTIQSANASKESSNSADSDEKSDSEGNSKDKKKNF
570 580 590 600 610 620
CCDS45 SLFDLTTLIHPRSAAIASERHNISNGSALVVQEPPREKQRKVNFVTDIKNFGLFHRRSKQ
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>--
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10 20 30 40 50 60
pF1KE2 PSTDLSGASSSSLPSSPSSSSPNEVMALKDVREVKEENTLN--EKLFLLACDKGDYYMVK
.: :. :. :. :: .: : .:::: ::
CCDS45 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVK
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: ::: .::::.: :::.:. :.::::::....:::... .:::: :: .:::
CCDS45 KSLEEAEIYFKININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFNVYVGDALLHAIRKEVV
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pF1KE2 GAVDILLNHRPKRSSRPTIVKLMERIQNPEYSTTMDVAPVILAAHRNNYEILTMLLKQDV
:::..::::.
CCDS45 GAVELLLNHKKPSGEKQFVAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRHWAVKMVTCFIIGLLFPV
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>>CCDS3725.1 TRPC3 gene_id:7222|Hs108|chr4 (848 aa)
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pF1KE2 SSSSLPSSPSSSSPNEVMALKDVREVKEENTLNEKLFLLACDKGDYYMVKKILEENSSGD
: .:. :: : . :. .:.:.:::...
CCDS37 LRRMTVMREKGRRQAVRGPAFMFNDRGTSLTAEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEESKT--
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pF1KE2 LNINCVDVLGRNAVTITIENENLDILQLLL--DYGCQSADALLVAIDSEVVGAVDILLNH
::.:::: .:.::. ... ::.:.. .::: . . .::::.::.. : :. .:::
CCDS37 LNVNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKENLARIGDALLLAISKGYVRIVEAILNH
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pF1KE2 RP--KRSSRPTIVKLMERIQNPEYST--------TMDVAPVILAAHRNNYEILTMLLKQD
: :.: :. ...:. .. . . :..:.::::: ..::.. ::: .
CCDS37 -PGFAASKRLTLSPCEQELQDDDFYAYDEDGTRFSPDITPIILAAHCQKYEVVHMLLMKG
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pF1KE2 VSLPKPHAVGCECTLCSAKNKKDSLRHSRFRLDIYRCLASPALIMLTEEDPILRAFELSA
. . .:: :.: : :...::. ::: :.. :. ::::: . :. :::.: :.:::
CCDS37 ARIERPHDYFCKCGDCMEKQRHDSFSHSRSRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVLTALELSN
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.: .:. .: ::.:::..:. ::: :. .: :.:.:.:.::: : :::. .
CCDS37 ELAKLANIEKEFKNDYRKLSMQCKDFVVGVLDLCRDSEEVEAILNGDLESAEPLE---VH
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... .:::.::::::. :.::.. :::: : :.:. ..:: :.. : ..::.:..
CCDS37 RHKASLSRVKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLTIWYENLSGLREQTIAIKCLVVLVVALGL
310 320 330 340 350 360
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: :.. : ::: :..:.:...:::::. :.::.. :: :: :.: . . : :
CCDS37 PFLAIGYWIAPCSRLGKILRSPFMKFVAHAASFIIFLGLL-----VFNASDRFEGITTLP
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. :: :...:..::.::. :.:: :: .... . : :.:
CCDS37 NITVTDYPKQIFRVKTTQFTWTEMLIMVWVLGMMWSECKELWLEGPREYILQLWNVLDFG
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470 480 490
pF1KE2 MNSLYLATFALKVVAH---NKFHDFAD-----------------------RKDWDAFHPT
: :...:.:. . .: .: ....: : : :
CCDS37 MLSIFIAAFTARFLAFLQATKAQQYVDSYVQESDLSEVTLPPEIQYFTYARDKWLPSDPQ
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pF1KE2 LVAEGLFAFANVLSYLRLFFMYTTSSILGPLQISMGQMLQDFGKFLGMFLLVLFSFTIGL
...:::.:.: :::. :. .. .. .::::::.:. ..:. ::. .:..:.:.: ::.
CCDS37 IISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDIFKFMVLFIMVFFAFMIGM
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CCDS37 FILYSYYLGAK-------------VNAAFTTVEESFKTLFWSIFGLSEVTSVVLK--YDH
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CCDS37 KFIENIGYVLYGIYNVTMVVVLLNMLIAMINSSYQEIEDDSDVEWKFARSKLWLSYFDDG
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CCDS37 KTLPPPFSLVPSPKSFVYFIMRIVNFPKCRRRRLQKDIEMGMGNSKSRLNLFTQSNSRVF
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CCDS37 ESHSFNSILNQPTRYQQIMKRLIKRYVLKA-QVDKENDEVNEGELKEIKQDISSLRYELL
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780 790
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CCDS37 EDKSQATEELAILIHKLSEKLNPSMLRCE
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start: Fri Feb 10 15:03:19 2017 done: Fri Feb 10 15:03:20 2017
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]