Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2654
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2654, 279 aa
1>>>pF1KE2654 279 - 279 aa - 279 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8743+/-0.00088; mu= 16.9673+/- 0.053
mean_var=58.1601+/-12.287, 0's: 0 Z-trim(105.0): 30 B-trim: 48 in 1/51
Lambda= 0.168175
statistics sampled from 8153 (8172) to 8153 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.614), E-opt: 0.2 (0.251), width: 16
Scan time: 2.070
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS485.1 ELOVL1 gene_id:64834|Hs108|chr1 ( 279) 1930 476.6 8.8e-135
CCDS57987.1 ELOVL1 gene_id:64834|Hs108|chr1 ( 252) 1235 307.9 4.7e-84
CCDS34164.1 ELOVL7 gene_id:79993|Hs108|chr5 ( 281) 1194 298.0 5e-81
CCDS78013.1 ELOVL7 gene_id:79993|Hs108|chr5 ( 268) 1158 289.2 2.1e-78
CCDS4992.1 ELOVL4 gene_id:6785|Hs108|chr6 ( 314) 752 190.8 1.1e-48
CCDS4951.1 ELOVL5 gene_id:60481|Hs108|chr6 ( 299) 633 161.9 5e-40
CCDS4518.1 ELOVL2 gene_id:54898|Hs108|chr6 ( 296) 599 153.6 1.5e-37
CCDS56433.1 ELOVL5 gene_id:60481|Hs108|chr6 ( 326) 479 124.6 9.5e-29
CCDS75470.1 ELOVL5 gene_id:60481|Hs108|chr6 ( 262) 386 101.9 4.9e-22
CCDS7531.1 ELOVL3 gene_id:83401|Hs108|chr10 ( 270) 296 80.1 1.9e-15
CCDS3690.1 ELOVL6 gene_id:79071|Hs108|chr4 ( 265) 269 73.6 1.7e-13
>>CCDS485.1 ELOVL1 gene_id:64834|Hs108|chr1 (279 aa)
initn: 1930 init1: 1930 opt: 1930 Z-score: 2533.3 bits: 476.6 E(32554): 8.8e-135
Smith-Waterman score: 1930; 100.0% identity (100.0% similar) in 279 aa overlap (1-279:1-279)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MEAVVNLYQEVMKHADPRIQGYPLMGSPLLMTSILLTYVYFVLSLGPRIMANRKPFQLRG
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CCDS48 MEAVVNLYQEVMKHADPRIQGYPLMGSPLLMTSILLTYVYFVLSLGPRIMANRKPFQLRG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 FMIVYNFSLVALSLYIVYEFLMSGWLSTYTWRCDPVDYSNSPEALRMVRVAWLFLFSKFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 FMIVYNFSLVALSLYIVYEFLMSGWLSTYTWRCDPVDYSNSPEALRMVRVAWLFLFSKFI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 ELMDTVIFILRKKDGQVTFLHVFHHSVLPWSWWWGVKIAPGGMGSFHAMINSSVHVIMYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 ELMDTVIFILRKKDGQVTFLHVFHHSVLPWSWWWGVKIAPGGMGSFHAMINSSVHVIMYL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 YYGLSAFGPVAQPYLWWKKHMTAIQLIQFVLVSLHISQYYFMSSCNYQYPVIIHLIWMYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 YYGLSAFGPVAQPYLWWKKHMTAIQLIQFVLVSLHISQYYFMSSCNYQYPVIIHLIWMYG
190 200 210 220 230 240
250 260 270
pF1KE2 TIFFMLFSNFWYHSYTKGKRLPRALQQNGAPGIAKVKAN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 TIFFMLFSNFWYHSYTKGKRLPRALQQNGAPGIAKVKAN
250 260 270
>>CCDS57987.1 ELOVL1 gene_id:64834|Hs108|chr1 (252 aa)
initn: 1220 init1: 1220 opt: 1235 Z-score: 1622.6 bits: 307.9 E(32554): 4.7e-84
Smith-Waterman score: 1666; 90.3% identity (90.3% similar) in 279 aa overlap (1-279:1-252)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MEAVVNLYQEVMKHADPRIQGYPLMGSPLLMTSILLTYVYFVLSLGPRIMANRKPFQLRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MEAVVNLYQEVMKHADPRIQGYPLMGSPLLMTSILLTYVYFVLSLGPRIMANRKPFQLRG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 FMIVYNFSLVALSLYIVYEFLMSGWLSTYTWRCDPVDYSNSPEALRMVRVAWLFLFSKFI
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CCDS57 FMIVYNFSLVALSLYIVYE---------------------------MVRVAWLFLFSKFI
70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 ELMDTVIFILRKKDGQVTFLHVFHHSVLPWSWWWGVKIAPGGMGSFHAMINSSVHVIMYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 ELMDTVIFILRKKDGQVTFLHVFHHSVLPWSWWWGVKIAPGGMGSFHAMINSSVHVIMYL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 YYGLSAFGPVAQPYLWWKKHMTAIQLIQFVLVSLHISQYYFMSSCNYQYPVIIHLIWMYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 YYGLSAFGPVAQPYLWWKKHMTAIQLIQFVLVSLHISQYYFMSSCNYQYPVIIHLIWMYG
160 170 180 190 200 210
250 260 270
pF1KE2 TIFFMLFSNFWYHSYTKGKRLPRALQQNGAPGIAKVKAN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 TIFFMLFSNFWYHSYTKGKRLPRALQQNGAPGIAKVKAN
220 230 240 250
>>CCDS34164.1 ELOVL7 gene_id:79993|Hs108|chr5 (281 aa)
initn: 1231 init1: 1185 opt: 1194 Z-score: 1568.1 bits: 298.0 E(32554): 5e-81
Smith-Waterman score: 1194; 59.2% identity (86.8% similar) in 265 aa overlap (5-269:11-274)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MEAVVNLYQEVMKHADPRIQGYPLMGSPLLMTSILLTYVYFVLSLGPRIMANRK
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CCDS34 MAFSDLTSRTVHLYDNWIKDADPRVEDWLLMSSPLPQTILLGFYVYFVTSLGPKLMENRK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 PFQLRGFMIVYNFSLVALSLYIVYEFLMSGWLSTYTWRCDPVDYSNSPEALRMVRVAWLF
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CCDS34 PFELKKAMITYNFFIVLFSVYMCYEFVMSGWGIGYSFRCDIVDYSRSPTALRMARTCWLY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 LFSKFIELMDTVIFILRKKDGQVTFLHVFHHSVLPWSWWWGVKIAPGGMGSFHAMINSSV
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CCDS34 YFSKFIELLDTIFFVLRKKNSQVTFLHVFHHTIMPWTWWFGVKFAAGGLGTFHALLNTAV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 HVIMYLYYGLSAFGPVAQPYLWWKKHMTAIQLIQFVLVSLHISQYYFMSSCNYQYPVIIH
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CCDS34 HVVMYSYYGLSALGPAYQKYLWWKKYLTSLQLVQFVIVAIHISQFFFMEDCKYQFPVFAC
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270
pF1KE2 LIWMYGTIFFMLFSNFWYHSYTKGKRLPRALQQNGAPGIAKVKAN
.: :. .:..:: .:::..::::.:::.... ::
CCDS34 IIMSYSFMFLLLFLHFWYRAYTKGQRLPKTVK-NGTCKNKDN
250 260 270 280
>>CCDS78013.1 ELOVL7 gene_id:79993|Hs108|chr5 (268 aa)
initn: 1222 init1: 1155 opt: 1158 Z-score: 1521.2 bits: 289.2 E(32554): 2.1e-78
Smith-Waterman score: 1158; 59.7% identity (87.0% similar) in 253 aa overlap (17-269:10-261)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MEAVVNLYQEVMKHADPRIQGYPLMGSPLLMTSILLTYVYFVLSLGPRIMANRKPFQLRG
::.. . ::.::: .: .: ::::: ::::..: :::::.:.
CCDS78 MEKPINILYPRVEDWLLMSSPLPQTILLGFYVYFVTSLGPKLMENRKPFELKK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 FMIVYNFSLVALSLYIVYEFLMSGWLSTYTWRCDPVDYSNSPEALRMVRVAWLFLFSKFI
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CCDS78 AMITYNFFIVLFSVYMCYEFVMSGWGIGYSFRCDIVDYSRSPTALRMARTCWLYYFSKFI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 ELMDTVIFILRKKDGQVTFLHVFHHSVLPWSWWWGVKIAPGGMGSFHAMINSSVHVIMYL
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CCDS78 ELLDTIFFVLRKKNSQVTFLHVFHHTIMPWTWWFGVKFAAGGLGTFHALLNTAVHVVMYS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 YYGLSAFGPVAQPYLWWKKHMTAIQLIQFVLVSLHISQYYFMSSCNYQYPVIIHLIWMYG
::::::.::. : ::::::..:..::.:::.:..::::..:: .:.::.::. .: :.
CCDS78 YYGLSALGPAYQKYLWWKKYLTSLQLVQFVIVAIHISQFFFMEDCKYQFPVFACIIMSYS
180 190 200 210 220 230
250 260 270
pF1KE2 TIFFMLFSNFWYHSYTKGKRLPRALQQNGAPGIAKVKAN
.:..:: .:::..::::.:::.... ::
CCDS78 FMFLLLFLHFWYRAYTKGQRLPKTVK-NGTCKNKDN
240 250 260
>>CCDS4992.1 ELOVL4 gene_id:6785|Hs108|chr6 (314 aa)
initn: 684 init1: 618 opt: 752 Z-score: 987.8 bits: 190.8 E(32554): 1.1e-48
Smith-Waterman score: 752; 41.8% identity (71.8% similar) in 280 aa overlap (1-275:19-293)
10 20 30 40
pF1KE2 MEAVVNLYQEVMKHADPRIQGYPLMGSPLLMTSILLTYVYFV
.. .:..:. . . :: :....::: :: :: :. ::
CCDS49 MGLLDSEPGSVLNVVSTALNDTVEFYRWTWSIADKRVENWPLMQSPWPTLSISTLYLLFV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 LSLGPRIMANRKPFQLRGFMIVYNFSLVALSLYIVYEFLMSGWLSTYTWRCDPVDYSNSP
:::. : .:.:::.: .:.:::..: :.:.: :..:... . :.. :. :::::.
CCDS49 W-LGPKWMKDREPFQMRLVLIIYNFGMVLLNLFIFRELFMGSYNAGYSYICQSVDYSNNV
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 EALRMVRVAWLFLFSKFIELMDTVIFILRKKDGQVTFLHVFHHSVLPWSWWWGVKIAPGG
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CCDS49 HEVRIAAALWWYFVSKGVEYLDTVFFILRKKNNQVSFLHVYHHCTMFTLWWIGIKWVAGG
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 MGSFHAMINSSVHVIMYLYYGLSAFGPVAQPYLWWKKHMTAIQLIQFVLVSLHISQYYFM
.. : :..:: .::::: ::::.:::: : :::::...: .::::: :.. . ..
CCDS49 QAFFGAQLNSFIHVIMYSYYGLTAFGPWIQKYLWWKRYLTMLQLIQF-HVTIGHTALSLY
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KE2 SSCNYQYPVIIHLIWM-YGTIFFMLFSNFWYHSYTKGKRLPRALQ--QNG--APGIAKVK
..: .: .: . :. :..:: ::. ..: . :. :.: . .:: : :..:
CCDS49 TDC--PFPKWMHWALIAYAISFIFLFLNFYIRTYKEPKK-PKAGKTAMNGISANGVSKSE
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 AN
CCDS49 KQLMIENGKKQKNGKAKGD
300 310
>>CCDS4951.1 ELOVL5 gene_id:60481|Hs108|chr6 (299 aa)
initn: 556 init1: 284 opt: 633 Z-score: 832.1 bits: 161.9 E(32554): 5e-40
Smith-Waterman score: 633; 37.6% identity (67.5% similar) in 274 aa overlap (8-270:12-273)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MEAVVNLYQEVMKHADPRIQGYPLMGS--PLLMTSILLTYVYFVLSLGPRIMANRK
.. .. : :..:. :. . : .. :.. :. .: :::. : :..
CCDS49 MEHFDASLSTYFKALLGPRDTRVKGWFLLDNYIPTFICSVI--YLLIVW-LGPKYMRNKQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 PFQLRGFMIVYNFSLVALSLYIVYEFLMSGWLSTYTWRCDPVDYSNSPEALRMVRVAWLF
::. ::...:::..:. ::::. :.. . : . :.. :. . .. . ....:: : .
CCDS49 PFSCRGILVVYNLGLTLLSLYMFCELVTGVWEGKYNFFCQGTRTAGESD-MKIIRVLWWY
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 LFSKFIELMDTVIFILRKKDGQVTFLHVFHHSVLPWSWWWGVKIAPGGMGSFHAMINSSV
:::.::.::: .:::::.. :.: :::.::. . ::. .. .: : . : : .:: .
CCDS49 YFSKLIEFMDTFFFILRKNNHQITVLHVYHHASMLNIWWFVMNWVPCGHSYFGATLNSFI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 HVIMYLYYGLSAFGPVAQPYLWWKKHMTAIQLIQFVLVSLHISQYYFMSSCNYQYPVIIH
::.:: :::::. : .:::::::..: ::.::::. .. .::. .: .
CCDS49 HVLMYSYYGLSSV-PSMRPYLWWKKYITQGQLLQFVLTIIQ-------TSCGVIWPCTFP
180 190 200 210 220
240 250 260 270
pF1KE2 LIWMYGTIFFM-----LFSNFWYHSYTK--GKRLPRALQ--QNGAPGIAKVKAN
: :.: : .: ::.::. ..:.: ..: :. :::.
CCDS49 LGWLYFQIGYMISLIALFTNFYIQTYNKKGASRRKDHLKDHQNGSMAAVNGHTNSFSPLE
230 240 250 260 270 280
CCDS49 NNVKPRKLRKD
290
>>CCDS4518.1 ELOVL2 gene_id:54898|Hs108|chr6 (296 aa)
initn: 382 init1: 260 opt: 599 Z-score: 787.6 bits: 153.6 E(32554): 1.5e-37
Smith-Waterman score: 599; 36.4% identity (68.2% similar) in 264 aa overlap (16-277:23-276)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MEAVVNLYQEVMKHADPRIQGYPLMGSPLLMTSILLTYVYFV-LSLGPRIMAN
: :..:. .. : : ...:: .:.. . :: . : :
CCDS45 MEHLKAFDDEINAFLDNMFGPRDSRVRGWFMLDSYL--PTFFLTVMYLLSIWLGNKYMKN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 RKPFQLRGFMIVYNFSLVALSLYIVYEFLMSGWLSTYTWRCDPVDYSNSPEA-LRMVRVA
: ..:::.. .::.... :: :.. :...: : . :. .:. : ... :: .:...:
CCDS45 RPALSLRGILTLYNLGITLLSAYMLAELILSTWEGGYNLQCQ--DLTSAGEADIRVAKVL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 WLFLFSKFIELMDTVIFILRKKDGQVTFLHVFHHSVLPWSWWWGVKIAPGGMGSFHAMIN
: . ::: .:..::..:.:::: .:.:::::.::. . :: .. : :.. : .:
CCDS45 WWYYFSKSVEFLDTIFFVLRKKTSQITFLHVYHHASMFNIWWCVLNWIPCGQSFFGPTLN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 SSVHVIMYLYYGLSAFGPVAQPYLWWKKHMTAIQLIQFVLVSLHISQYYFMSSCNYQYPV
: .:..:: :::::.: : . ::::::..: ::.::::. : .. .. :.. .
CCDS45 SFIHILMYSYYGLSVF-PSMHKYLWWKKYLTQAQLVQFVLTITH-TMSAVVKPCGFPFGC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270
pF1KE2 IIHLIWMYGTIFFMLFSNFWYHSYTKGKRLPRALQQNGAPGIAKVKAN
.: . : . .:: ::. ..: : : . . .:. :. .::
CCDS45 LI-FQSSYMLTLVILFLNFYVQTYRK-KPMKKDMQE--PPAGKEVKNGFSKAYFTAANGV
240 250 260 270 280 290
CCDS45 MNKKAQ
>>CCDS56433.1 ELOVL5 gene_id:60481|Hs108|chr6 (326 aa)
initn: 555 init1: 284 opt: 479 Z-score: 629.6 bits: 124.6 E(32554): 9.5e-29
Smith-Waterman score: 575; 34.9% identity (61.8% similar) in 301 aa overlap (8-270:12-300)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MEAVVNLYQEVMKHADPRIQGYPLMGS--PLLMTSILLTYVYFVLSLGPRIMANRK
.. .. : :..:. :. . : .. :.. :. .: :::. : :..
CCDS56 MEHFDASLSTYFKALLGPRDTRVKGWFLLDNYIPTFICSVI--YLLIVW-LGPKYMRNKQ
10 20 30 40 50
60 70 80
pF1KE2 PFQLRGFMIVYNFSLVALSLYIVYEF--------------------------LMSG-WLS
::. ::...:::..:. ::::. : :..: : .
CCDS56 PFSCRGILVVYNLGLTLLSLYMFCESKREQPRRSACASRTDPSTQQQLPENRLVTGVWEG
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 TYTWRCDPVDYSNSPEALRMVRVAWLFLFSKFIELMDTVIFILRKKDGQVTFLHVFHHSV
:.. :. . .. . ....:: : . :::.::.::: .:::::.. :.: :::.::.
CCDS56 KYNFFCQGTRTAGESD-MKIIRVLWWYYFSKLIEFMDTFFFILRKNNHQITVLHVYHHAS
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 LPWSWWWGVKIAPGGMGSFHAMINSSVHVIMYLYYGLSAFGPVAQPYLWWKKHMTAIQLI
. ::. .. .: : . : : .:: .::.:: :::::. : .:::::::..: ::.
CCDS56 MLNIWWFVMNWVPCGHSYFGATLNSFIHVLMYSYYGLSSV-PSMRPYLWWKKYITQGQLL
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 QFVLVSLHISQYYFMSSCNYQYPVIIHLIWMYGTIFFM-----LFSNFWYHSYTK--GKR
::::. .. .::. .: . : :.: : .: ::.::. ..:.: ..:
CCDS56 QFVLTIIQ-------TSCGVIWPCTFPLGWLYFQIGYMISLIALFTNFYIQTYNKKGASR
240 250 260 270 280
270
pF1KE2 LPRALQ--QNGAPGIAKVKAN
:. :::.
CCDS56 RKDHLKDHQNGSMAAVNGHTNSFSPLENNVKPRKLRKD
290 300 310 320
>>CCDS75470.1 ELOVL5 gene_id:60481|Hs108|chr6 (262 aa)
initn: 350 init1: 189 opt: 386 Z-score: 509.1 bits: 101.9 E(32554): 4.9e-22
Smith-Waterman score: 386; 35.0% identity (70.6% similar) in 163 aa overlap (8-168:12-170)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MEAVVNLYQEVMKHADPRIQGYPLMGS--PLLMTSILLTYVYFVLSLGPRIMANRK
.. .. : :..:. :. . : .. :.. :. ... :::. : :..
CCDS75 MEHFDASLSTYFKALLGPRDTRVKGWFLLDNYIPTFICSVI--YL-LIVWLGPKYMRNKQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 PFQLRGFMIVYNFSLVALSLYIVYEFLMSGWLSTYTWRCDPVDYSNSPEALRMVRVAWLF
::. ::...:::..:. ::::. :.. . : . :.. :. . .. . ....:: : .
CCDS75 PFSCRGILVVYNLGLTLLSLYMFCELVTGVWEGKYNFFCQGTRTAGESD-MKIIRVLWWY
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