Result of FASTA (omim) for
pF1KE2611
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2611, 295 aa
1>>>pF1KE2611 295 - 295 aa - 295 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5185+/-0.000411; mu= 19.2911+/- 0.025
mean_var=61.1231+/-12.298, 0's: 0 Z-trim(111.2): 42 B-trim: 22 in 1/52
Lambda= 0.164048
statistics sampled from 19632 (19673) to 19632 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.591), E-opt: 0.2 (0.231), width: 16
Scan time: 4.300
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_066190 (OMIM: 602914) aquaporin-9 isoform 1 [Ho ( 295) 1929 465.3 6.6e-131
NP_001307565 (OMIM: 602914) aquaporin-9 isoform 3 ( 230) 1516 367.4 1.4e-101
NP_001307564 (OMIM: 602914) aquaporin-9 isoform 2 ( 193) 1077 263.4 2.4e-70
NP_536354 (OMIM: 606578) aquaporin-10 [Homo sapien ( 301) 953 234.3 2.3e-61
NP_004916 (OMIM: 600170,607457) aquaporin-3 isofor ( 292) 952 234.0 2.6e-61
XP_011508406 (OMIM: 606578) PREDICTED: aquaporin-1 ( 302) 941 231.4 1.6e-60
XP_016870189 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 341) 830 205.2 1.5e-52
XP_005251510 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 342) 830 205.2 1.5e-52
NP_001161 (OMIM: 602974,614411) aquaporin-7 isofor ( 342) 830 205.2 1.5e-52
XP_011516168 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 342) 830 205.2 1.5e-52
XP_006716828 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 285) 739 183.6 3.9e-46
XP_011516169 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 285) 739 183.6 3.9e-46
NP_001305086 (OMIM: 602974,614411) aquaporin-7 iso ( 256) 702 174.8 1.5e-43
NP_001305087 (OMIM: 602974,614411) aquaporin-7 iso ( 257) 702 174.8 1.5e-43
XP_016870194 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 250) 636 159.2 7.6e-39
XP_016870192 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 250) 636 159.2 7.6e-39
XP_016870193 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 250) 636 159.2 7.6e-39
XP_016870191 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 250) 636 159.2 7.6e-39
XP_016870190 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 250) 636 159.2 7.6e-39
NP_001305085 (OMIM: 602974,614411) aquaporin-7 iso ( 216) 620 155.3 9.5e-38
XP_016870195 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 200) 611 153.2 3.9e-37
NP_001305073 (OMIM: 600170,607457) aquaporin-3 iso ( 237) 550 138.8 9.8e-33
XP_005268895 (OMIM: 600442) PREDICTED: aquaporin-5 ( 222) 217 60.0 5e-09
NP_001642 (OMIM: 600442) aquaporin-5 [Homo sapiens ( 265) 217 60.0 5.7e-09
NP_001643 (OMIM: 601383) aquaporin-6 [Homo sapiens ( 282) 198 55.6 1.3e-07
NP_001160 (OMIM: 603750) aquaporin-8 [Homo sapiens ( 261) 197 55.3 1.5e-07
XP_011544124 (OMIM: 603750) PREDICTED: aquaporin-8 ( 262) 197 55.3 1.5e-07
NP_000477 (OMIM: 107777,125800) aquaporin-2 [Homo ( 271) 196 55.1 1.8e-07
NP_001304316 (OMIM: 600308) aquaporin-4 isoform de ( 296) 196 55.1 1.9e-07
NP_004019 (OMIM: 600308) aquaporin-4 isoform M23 [ ( 301) 196 55.1 2e-07
XP_011524244 (OMIM: 600308) PREDICTED: aquaporin-4 ( 316) 196 55.1 2e-07
NP_001641 (OMIM: 600308) aquaporin-4 isoform M1 [H ( 323) 196 55.1 2.1e-07
NP_001304313 (OMIM: 600308) aquaporin-4 isoform M1 ( 352) 196 55.2 2.2e-07
NP_036196 (OMIM: 154050,615274) lens fiber major i ( 263) 185 52.5 1.1e-06
NP_932766 (OMIM: 107776,110450) aquaporin-1 isofor ( 269) 163 47.3 4e-05
NP_001316801 (OMIM: 107776,110450) aquaporin-1 iso ( 323) 163 47.3 4.6e-05
XP_011544125 (OMIM: 603750) PREDICTED: aquaporin-8 ( 148) 131 39.5 0.0049
>>NP_066190 (OMIM: 602914) aquaporin-9 isoform 1 [Homo s (295 aa)
initn: 1929 init1: 1929 opt: 1929 Z-score: 2471.2 bits: 465.3 E(85289): 6.6e-131
Smith-Waterman score: 1929; 99.7% identity (100.0% similar) in 295 aa overlap (1-295:1-295)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MQPEGAEKGKSFKQRLVLKSSLAKETLSEFLGTFILIVLGCGCVAQAILSRGRFGGVITI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 MQPEGAEKGKSFKQRLVLKSSLAKETLSEFLGTFILIVLGCGCVAQAILSRGRFGGVITI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 NVGFSMAVAMAIYVAGGVSGGHINPAVSLAMCLFGRMKWFKLPFYVGAQFLGAFVGAATV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 NVGFSMAVAMAIYVAGGVSGGHINPAVSLAMCLFGRMKWFKLPFYVGAQFLGAFVGAATV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 FGIYYDGLMSFAGGKLLIVGENATAHIFATYPAPYLSLANAFADQVVATMILLIIVFAIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 FGIYYDGLMSFAGGKLLIVGENATAHIFATYPAPYLSLANAFADQVVATMILLIIVFAIF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 DSRNLGAPRGLEPIAIGLLIIVIASSLGLNSGCAMNPARDLSPRLFTALAGWGFEVFRAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 DSRNLGAPRGLEPIAIGLLIIVIASSLGLNSGCAMNPARDLSPRLFTALAGWGFEVFRAG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE2 NNFWWIPVVGPLVGAVIGGLIYVLVIEIHHPEPDSVFKAEQSEDKPEKYELSVIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
NP_066 NNFWWIPVVGPLVGAVIGGLIYVLVIEIHHPEPDSVFKTEQSEDKPEKYELSVIM
250 260 270 280 290
>>NP_001307565 (OMIM: 602914) aquaporin-9 isoform 3 [Hom (230 aa)
initn: 1516 init1: 1516 opt: 1516 Z-score: 1944.4 bits: 367.4 E(85289): 1.4e-101
Smith-Waterman score: 1516; 99.6% identity (100.0% similar) in 230 aa overlap (66-295:1-230)
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 LIVLGCGCVAQAILSRGRFGGVITINVGFSMAVAMAIYVAGGVSGGHINPAVSLAMCLFG
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAVAMAIYVAGGVSGGHINPAVSLAMCLFG
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 RMKWFKLPFYVGAQFLGAFVGAATVFGIYYDGLMSFAGGKLLIVGENATAHIFATYPAPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RMKWFKLPFYVGAQFLGAFVGAATVFGIYYDGLMSFAGGKLLIVGENATAHIFATYPAPY
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 LSLANAFADQVVATMILLIIVFAIFDSRNLGAPRGLEPIAIGLLIIVIASSLGLNSGCAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSLANAFADQVVATMILLIIVFAIFDSRNLGAPRGLEPIAIGLLIIVIASSLGLNSGCAM
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 NPARDLSPRLFTALAGWGFEVFRAGNNFWWIPVVGPLVGAVIGGLIYVLVIEIHHPEPDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NPARDLSPRLFTALAGWGFEVFRAGNNFWWIPVVGPLVGAVIGGLIYVLVIEIHHPEPDS
160 170 180 190 200 210
280 290
pF1KE2 VFKAEQSEDKPEKYELSVIM
:::.::::::::::::::::
NP_001 VFKTEQSEDKPEKYELSVIM
220 230
>>NP_001307564 (OMIM: 602914) aquaporin-9 isoform 2 [Hom (193 aa)
initn: 1077 init1: 1077 opt: 1077 Z-score: 1383.9 bits: 263.4 E(85289): 2.4e-70
Smith-Waterman score: 1077; 100.0% identity (100.0% similar) in 165 aa overlap (1-165:1-165)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MQPEGAEKGKSFKQRLVLKSSLAKETLSEFLGTFILIVLGCGCVAQAILSRGRFGGVITI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MQPEGAEKGKSFKQRLVLKSSLAKETLSEFLGTFILIVLGCGCVAQAILSRGRFGGVITI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 NVGFSMAVAMAIYVAGGVSGGHINPAVSLAMCLFGRMKWFKLPFYVGAQFLGAFVGAATV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NVGFSMAVAMAIYVAGGVSGGHINPAVSLAMCLFGRMKWFKLPFYVGAQFLGAFVGAATV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 FGIYYDGLMSFAGGKLLIVGENATAHIFATYPAPYLSLANAFADQVVATMILLIIVFAIF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FGIYYDGLMSFAGGKLLIVGENATAHIFATYPAPYLSLANAFADQSWKQLLVDSCSGPFG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 DSRNLGAPRGLEPIAIGLLIIVIASSLGLNSGCAMNPARDLSPRLFTALAGWGFEVFRAG
NP_001 WCCHWRPHLCSCH
190
>>NP_536354 (OMIM: 606578) aquaporin-10 [Homo sapiens] (301 aa)
initn: 952 init1: 952 opt: 953 Z-score: 1222.7 bits: 234.3 E(85289): 2.3e-61
Smith-Waterman score: 953; 50.0% identity (80.1% similar) in 276 aa overlap (16-290:14-289)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MQPEGAEKGKSFKQRLVLKSSLAKETLSEFLGTFILIVLGCGCVAQAILSRGRFGGVITI
: ..: ::.. :.::::.:.:..: : ::::. : :. .:.
NP_536 MVFTQAPAEIMGHLRIRSLLARQCLAEFLGVFVLMLLTQGAVAQAVTSGETKGNFFTM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 NVGFSMAVAMAIYVAGGVSGGHINPAVSLAMCLFGRMKWFKLPFYVGAQFLGAFVGAATV
.. :.::..::::.:.:::.:.::: :::::. ::. : :::.:. .:.:.:: .....
NP_536 FLAGSLAVTIAIYVGGNVSGAHLNPAFSLAMCIVGRLPWVKLPIYILVQLLSAFCASGAT
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 FGIYYDGLMSFAGGKLLIVGENATAHIFATYPAPYLSLANAFADQVVATMILLIIVFAIF
. .:.:.:....::.: ..: . :: :::::::::::: :.: :::..: .:.. ..::.
NP_536 YVLYHDALQNYTGGNLTVTGPKETASIFATYPAPYLSLNNGFLDQVLGTGMLIVGLLAIL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 DSRNLGAPRGLEPIAIGLLIIVIASSLGLNSGCAMNPARDLSPRLFTALAGWGFEVFRAG
: :: :.: ::::...:.::.... :.: : : .::::::.::::: .:::: ::: ::
NP_536 DRRNKGVPAGLEPVVVGMLILALGLSMGANCGIPLNPARDLGPRLFTYVAGWGPEVFSAG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE2 NNFWWIPVVGPLVGAVIGGLIYVLVIEIHHPE-PDSVFKAEQSEDKPEKYELSVIM
:..::.:::.:::::..: : :.. .:::: :. . ... : . :
NP_536 NGWWWVPVVAPLVGATVGTATYQLLVALHHPEGPEPAQDLVSAQHKASELETPASAQMLE
240 250 260 270 280 290
NP_536 CKL
300
>>NP_004916 (OMIM: 600170,607457) aquaporin-3 isoform 1 (292 aa)
initn: 943 init1: 918 opt: 952 Z-score: 1221.6 bits: 234.0 E(85289): 2.6e-61
Smith-Waterman score: 952; 51.6% identity (82.2% similar) in 258 aa overlap (16-273:15-272)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MQPEGAEKGKSFKQRLVLKSSLAKETLSEFLGTFILIVLGCGCVAQAILSRGRFGGVITI
: .. : ...:.: :::.::...::: :::..:::: :: .::
NP_004 MGRQKELVSRCGEMLHIRYRLLRQALAECLGTLILVMFGCGSVAQVVLSRGTHGGFLTI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 NVGFSMAVAMAIYVAGGVSGGHINPAVSLAMCLFGRMKWFKLPFYVGAQFLGAFVGAATV
:..:..::...: .:: :::.:.::::..:::...: :.:::.:. :: ::::.::. :
NP_004 NLAFGFAVTLGILIAGQVSGAHLNPAVTFAMCFLAREPWIKLPIYTLAQTLGAFLGAGIV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 FGIYYDGLMSFAGGKLLIVGENATAHIFATYPAPYLSLANAFADQVVATMILLIIVFAIF
::.:::.. :: ..:.. : :.:: ::::::. .:.. :.: :: ..: :.. :.::
NP_004 FGLYYDAIWHFADNQLFVSGPNGTAGIFATYPSGHLDMINGFFDQFIGTASLIVCVLAIV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 DSRNLGAPRGLEPIAIGLLIIVIASSLGLNSGCAMNPARDLSPRLFTALAGWGFEVFRAG
: : .::::: ...::...::..:.:.::: :.:::::..::::::::::: :: .:
NP_004 DPYNNPVPRGLEAFTVGLVVLVIGTSMGFNSGYAVNPARDFGPRLFTALAGWGSAVFTTG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE2 NNFWWIPVVGPLVGAVIGGLIYVLVIEIHHPEPDSVFKAEQSEDKPEKYELSVIM
...::.:.:.::.:.. : ..: :.: : .:
NP_004 QHWWWVPIVSPLLGSIAGVFVYQLMIGCHLEQPPPSNEEENVKLAHVKHKEQI
240 250 260 270 280 290
>>XP_011508406 (OMIM: 606578) PREDICTED: aquaporin-10 is (302 aa)
initn: 876 init1: 876 opt: 941 Z-score: 1207.4 bits: 231.4 E(85289): 1.6e-60
Smith-Waterman score: 941; 49.8% identity (79.8% similar) in 277 aa overlap (16-290:14-290)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MQPEGAEKGKSFKQRLVLKSSLAKETLSEFLGTFILI-VLGCGCVAQAILSRGRFGGVIT
: ..: ::.. :.::::.:.:. .: : ::::. : :. .:
XP_011 MVFTQAPAEIMGHLRIRSLLARQCLAEFLGVFVLMQLLTQGAVAQAVTSGETKGNFFT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 INVGFSMAVAMAIYVAGGVSGGHINPAVSLAMCLFGRMKWFKLPFYVGAQFLGAFVGAAT
. .. :.::..::::.:.:::.:.::: :::::. ::. : :::.:. .:.:.:: ....
XP_011 MFLAGSLAVTIAIYVGGNVSGAHLNPAFSLAMCIVGRLPWVKLPIYILVQLLSAFCASGA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 VFGIYYDGLMSFAGGKLLIVGENATAHIFATYPAPYLSLANAFADQVVATMILLIIVFAI
.. .:.:.:....::.: ..: . :: :::::::::::: :.: :::..: .:.. ..::
XP_011 TYVLYHDALQNYTGGNLTVTGPKETASIFATYPAPYLSLNNGFLDQVLGTGMLIVGLLAI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 FDSRNLGAPRGLEPIAIGLLIIVIASSLGLNSGCAMNPARDLSPRLFTALAGWGFEVFRA
.: :: :.: ::::...:.::.... :.: : : .::::::.::::: .:::: ::: :
XP_011 LDRRNKGVPAGLEPVVVGMLILALGLSMGANCGIPLNPARDLGPRLFTYVAGWGPEVFSA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 GNNFWWIPVVGPLVGAVIGGLIYVLVIEIHHPE-PDSVFKAEQSEDKPEKYELSVIM
::..::.:::.:::::..: : :.. .:::: :. . ... : . :
XP_011 GNGWWWVPVVAPLVGATVGTATYQLLVALHHPEGPEPAQDLVSAQHKASELETPASAQML
240 250 260 270 280 290
XP_011 ECKL
300
>>XP_016870189 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aquapori (341 aa)
initn: 753 init1: 708 opt: 830 Z-score: 1064.7 bits: 205.2 E(85289): 1.5e-52
Smith-Waterman score: 830; 42.9% identity (77.7% similar) in 273 aa overlap (13-284:23-294)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MQPEGAEKGKSFKQRLVLKSSLAKETLSEFLGTFILIVLGCGCVAQAILS
: . .:. ....: :.::..:....:.: : ::. .:.
XP_016 MGSGHCLRSTRGSKMVSWSVIAKIQEILQRKMVREFLAEFMSTYVMMVFGLGSVAHMVLN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 RGRFGGVITINVGFSMAVAMAIYVAGGVSGGHINPAVSLAMCLFGRMKWFKLPFYVGAQF
. ..:. . .:.::...:.:...::: .::.:.: ::..: : .::. : :.: :: .::
XP_016 K-KYGSYLGVNLGFGFGVTMGVHVAGRISGAHMNAAVTFANCALGRVPWRKFPVYVLGQF
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 LGAFVGAATVFGIYYDGLMSFAGGKLLIVGENATAHIFATYPAPYLSLANAFADQVVATM
::.:..:::.....: ... :.::.:...: ::: ::::: ...: .: ... :
XP_016 LGSFLAAATIYSLFYTAILHFSGGQLMVTGPVATAGIFATYLPDHMTLWRGFLNEAWLTG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 ILLIIVFAIFDSRNLGAPRGLEPIAIGLLIIVIASSLGLNSGCAMNPARDLSPRLFTALA
.: . .::: :..: : : : ..::.:...:. :::.:.: :.::.::: ::.:: .:
XP_016 MLQLCLFAITDQENNPALPGTEALVIGILVVIIGVSLGMNTGYAINPSRDLPPRIFTFIA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE2 GWGFEVFRAGNNFWWIPVVGPLVGAVIGGLIYVLVIEIHHP-EPDSVFKAEQSEDKPEKY
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pF1KE2 YELSVIM
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]