Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2585
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2585, 838 aa
1>>>pF1KE2585 838 - 838 aa - 838 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0648+/-0.00121; mu= 16.6870+/- 0.073
mean_var=75.4467+/-15.302, 0's: 0 Z-trim(102.6): 37 B-trim: 75 in 1/49
Lambda= 0.147657
statistics sampled from 7029 (7040) to 7029 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.577), E-opt: 0.2 (0.216), width: 16
Scan time: 3.480
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45683.1 ATP6V0A1 gene_id:535|Hs108|chr17 ( 838) 5623 1208.0 0
CCDS11426.1 ATP6V0A1 gene_id:535|Hs108|chr17 ( 831) 5549 1192.3 0
CCDS45684.1 ATP6V0A1 gene_id:535|Hs108|chr17 ( 837) 5527 1187.6 0
CCDS5849.1 ATP6V0A4 gene_id:50617|Hs108|chr7 ( 840) 3534 763.0 0
CCDS8177.1 TCIRG1 gene_id:10312|Hs108|chr11 ( 830) 2162 470.8 4.4e-132
CCDS53670.1 TCIRG1 gene_id:10312|Hs108|chr11 ( 614) 1982 432.4 1.2e-120
CCDS9254.1 ATP6V0A2 gene_id:23545|Hs108|chr12 ( 856) 1830 400.0 8.7e-111
>>CCDS45683.1 ATP6V0A1 gene_id:535|Hs108|chr17 (838 aa)
initn: 5623 init1: 5623 opt: 5623 Z-score: 6469.4 bits: 1208.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5623; 100.0% identity (100.0% similar) in 838 aa overlap (1-838:1-838)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGELFRSEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELGELGKVQFRDLNPDVNVFQRKFVNEVRRCEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MGELFRSEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELGELGKVQFRDLNPDVNVFQRKFVNEVRRCEE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 MDRKLRFVEKEIRKANIPIMDTGENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MDRKLRFVEKEIRKANIPIMDTGENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALKR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 NFLELTELKFILRKTQQFFDEAELHHQQMADPDLLEESSSLLEPSEMGRGTPLRLGFVAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NFLELTELKFILRKTQQFFDEAELHHQQMADPDLLEESSSLLEPSEMGRGTPLRLGFVAG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 VINRERIPTFERMLWRVCRGNVFLRQAEIENPLEDPVTGDYVHKSVFIIFFQGDQLKNRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VINRERIPTFERMLWRVCRGNVFLRQAEIENPLEDPVTGDYVHKSVFIIFFQGDQLKNRV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 KKICEGFRASLYPCPETPQERKEMASGVNTRIDDLQMVLNQTEDHRQRVLQAAAKNIRVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KKICEGFRASLYPCPETPQERKEMASGVNTRIDDLQMVLNQTEDHRQRVLQAAAKNIRVW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 FIKVRKMKAIYHTLNLCNIDVTQKCLIAEVWCPVTDLDSIQFALRRGTEHSGSTVPSILN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FIKVRKMKAIYHTLNLCNIDVTQKCLIAEVWCPVTDLDSIQFALRRGTEHSGSTVPSILN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 RMQTNQTPPTYNKTNKFTYGFQNIVDAYGIGTYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDFGHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RMQTNQTPPTYNKTNKFTYGFQNIVDAYGIGTYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDFGHG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ILMTLFAVWMVLRESRILSQKNENEMFSTVFSGRYIILLMGVFSMYTGLIYNDCFSKSLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ILMTLFAVWMVLRESRILSQKNENEMFSTVFSGRYIILLMGVFSMYTGLIYNDCFSKSLN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 IFGSSWSVRPMFTYNWTEETLRGNPVLQLNPALPGVFGGPYPFGIDPIWNIATNKLTFLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IFGSSWSVRPMFTYNWTEETLRGNPVLQLNPALPGVFGGPYPFGIDPIWNIATNKLTFLN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 SFKMKMSVILGIIHMLFGVSLSLFNHIYFKKPLNIYFGFIPEIIFMTSLFGYLVILIFYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SFKMKMSVILGIIHMLFGVSLSLFNHIYFKKPLNIYFGFIPEIIFMTSLFGYLVILIFYK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 WTAYDAHTSENAPSLLIHFINMFLFSYPESGYSMLYSGQKGIQCFLVVVALLCVPWMLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 WTAYDAHTSENAPSLLIHFINMFLFSYPESGYSMLYSGQKGIQCFLVVVALLCVPWMLLF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 KPLVLRRQYLRRKHLGTLNFGGIRVGNGPTEEDAEIIQHDQLSTHSEDADEFDFGDTMVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KPLVLRRQYLRRKHLGTLNFGGIRVGNGPTEEDAEIIQHDQLSTHSEDADEFDFGDTMVH
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 QAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVIHIGLSVKSLAGGLVLFFFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVIHIGLSVKSLAGGLVLFFFF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KE2 TAFATLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGFKFLPFSFEHIREGKFEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TAFATLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGFKFLPFSFEHIREGKFEE
790 800 810 820 830
>>CCDS11426.1 ATP6V0A1 gene_id:535|Hs108|chr17 (831 aa)
initn: 4651 init1: 4651 opt: 5549 Z-score: 6384.2 bits: 1192.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5549; 99.2% identity (99.2% similar) in 838 aa overlap (1-838:1-831)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGELFRSEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELGELGKVQFRDLNPDVNVFQRKFVNEVRRCEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MGELFRSEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELGELGKVQFRDLNPDVNVFQRKFVNEVRRCEE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 MDRKLRFVEKEIRKANIPIMDTGENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MDRKLRFVEKEIRKANIPIMDTGENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALKR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 NFLELTELKFILRKTQQFFDEAELHHQQMADPDLLEESSSLLEPSEMGRGTPLRLGFVAG
::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NFLELTELKFILRKTQQFFDE-------MADPDLLEESSSLLEPSEMGRGTPLRLGFVAG
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 VINRERIPTFERMLWRVCRGNVFLRQAEIENPLEDPVTGDYVHKSVFIIFFQGDQLKNRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VINRERIPTFERMLWRVCRGNVFLRQAEIENPLEDPVTGDYVHKSVFIIFFQGDQLKNRV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 KKICEGFRASLYPCPETPQERKEMASGVNTRIDDLQMVLNQTEDHRQRVLQAAAKNIRVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KKICEGFRASLYPCPETPQERKEMASGVNTRIDDLQMVLNQTEDHRQRVLQAAAKNIRVW
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 FIKVRKMKAIYHTLNLCNIDVTQKCLIAEVWCPVTDLDSIQFALRRGTEHSGSTVPSILN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FIKVRKMKAIYHTLNLCNIDVTQKCLIAEVWCPVTDLDSIQFALRRGTEHSGSTVPSILN
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 RMQTNQTPPTYNKTNKFTYGFQNIVDAYGIGTYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDFGHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RMQTNQTPPTYNKTNKFTYGFQNIVDAYGIGTYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDFGHG
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ILMTLFAVWMVLRESRILSQKNENEMFSTVFSGRYIILLMGVFSMYTGLIYNDCFSKSLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ILMTLFAVWMVLRESRILSQKNENEMFSTVFSGRYIILLMGVFSMYTGLIYNDCFSKSLN
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 IFGSSWSVRPMFTYNWTEETLRGNPVLQLNPALPGVFGGPYPFGIDPIWNIATNKLTFLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IFGSSWSVRPMFTYNWTEETLRGNPVLQLNPALPGVFGGPYPFGIDPIWNIATNKLTFLN
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 SFKMKMSVILGIIHMLFGVSLSLFNHIYFKKPLNIYFGFIPEIIFMTSLFGYLVILIFYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SFKMKMSVILGIIHMLFGVSLSLFNHIYFKKPLNIYFGFIPEIIFMTSLFGYLVILIFYK
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 WTAYDAHTSENAPSLLIHFINMFLFSYPESGYSMLYSGQKGIQCFLVVVALLCVPWMLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 WTAYDAHTSENAPSLLIHFINMFLFSYPESGYSMLYSGQKGIQCFLVVVALLCVPWMLLF
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 KPLVLRRQYLRRKHLGTLNFGGIRVGNGPTEEDAEIIQHDQLSTHSEDADEFDFGDTMVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KPLVLRRQYLRRKHLGTLNFGGIRVGNGPTEEDAEIIQHDQLSTHSEDADEFDFGDTMVH
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 QAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVIHIGLSVKSLAGGLVLFFFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVIHIGLSVKSLAGGLVLFFFF
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830
pF1KE2 TAFATLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGFKFLPFSFEHIREGKFEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TAFATLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGFKFLPFSFEHIREGKFEE
780 790 800 810 820 830
>>CCDS45684.1 ATP6V0A1 gene_id:535|Hs108|chr17 (837 aa)
initn: 4637 init1: 3809 opt: 5527 Z-score: 6358.8 bits: 1187.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5527; 98.5% identity (98.5% similar) in 844 aa overlap (1-838:1-837)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGELFRSEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELGELGKVQFRDLNPDVNVFQRKFVNEVRRCEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MGELFRSEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELGELGKVQFRDLNPDVNVFQRKFVNEVRRCEE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 MDRKLRFVEKEIRKANIPIMDTGENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MDRKLRFVEKEIRKANIPIMDTGENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALKR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 NFLELTELKFILRKTQQFFDEAELHHQQMADPDLLEESSSLLEPSEMGRGTPLRLGFVAG
::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NFLELTELKFILRKTQQFFDE-------MADPDLLEESSSLLEPSEMGRGTPLRLGFVAG
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 VINRERIPTFERMLWRVCRGNVFLRQAEIENPLEDPVTGDYVHKSVFIIFFQGDQLKNRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VINRERIPTFERMLWRVCRGNVFLRQAEIENPLEDPVTGDYVHKSVFIIFFQGDQLKNRV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 KKICEGFRASLYPCPETPQERKEMASGVNTRIDDLQMVLNQTEDHRQRVLQAAAKNIRVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KKICEGFRASLYPCPETPQERKEMASGVNTRIDDLQMVLNQTEDHRQRVLQAAAKNIRVW
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 FIKVRKMKAIYHTLNLCNIDVTQKCLIAEVWCPVTDLDSIQFALRRGTEHSGSTVPSILN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FIKVRKMKAIYHTLNLCNIDVTQKCLIAEVWCPVTDLDSIQFALRRGTEHSGSTVPSILN
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 RMQTNQTPPTYNKTNKFTYGFQNIVDAYGIGTYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDFGHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RMQTNQTPPTYNKTNKFTYGFQNIVDAYGIGTYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDFGHG
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ILMTLFAVWMVLRESRILSQKNENEMFSTVFSGRYIILLMGVFSMYTGLIYNDCFSKSLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ILMTLFAVWMVLRESRILSQKNENEMFSTVFSGRYIILLMGVFSMYTGLIYNDCFSKSLN
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 IFGSSWSVRPMFTYNWTEETLRGNPVLQLNPALPGVFGGPYPFGIDPIWNIATNKLTFLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IFGSSWSVRPMFTYNWTEETLRGNPVLQLNPALPGVFGGPYPFGIDPIWNIATNKLTFLN
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 SFKMKMSVILGIIHMLFGVSLSLFNHIYFKKPLNIYFGFIPEIIFMTSLFGYLVILIFYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SFKMKMSVILGIIHMLFGVSLSLFNHIYFKKPLNIYFGFIPEIIFMTSLFGYLVILIFYK
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 WTAYDAHTSENAPSLLIHFINMFLFSYPESGYSMLYSGQKGIQCFLVVVALLCVPWMLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 WTAYDAHTSENAPSLLIHFINMFLFSYPESGYSMLYSGQKGIQCFLVVVALLCVPWMLLF
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710
pF1KE2 KPLVLRRQYLRRKHLGTLNFGGIRVGNGPTEEDAEIIQHDQLSTHSEDADE------FDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS45 KPLVLRRQYLRRKHLGTLNFGGIRVGNGPTEEDAEIIQHDQLSTHSEDADEPSEDEVFDF
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 GDTMVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVIHIGLSVKSLAGGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GDTMVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVIHIGLSVKSLAGGL
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KE2 VLFFFFTAFATLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGFKFLPFSFEHIREG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VLFFFFTAFATLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGFKFLPFSFEHIREG
780 790 800 810 820 830
pF1KE2 KFEE
::::
CCDS45 KFEE
>>CCDS5849.1 ATP6V0A4 gene_id:50617|Hs108|chr7 (840 aa)
initn: 3471 init1: 1574 opt: 3534 Z-score: 4064.3 bits: 763.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3540; 61.6% identity (84.8% similar) in 848 aa overlap (1-838:1-840)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGELFRSEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELGELGKVQFRDLNPDVNVFQRKFVNEVRRCEE
: .:::::: :.::::: :::::::.:::::: :::.::: .:: :::::::::::::
CCDS58 MVSVFRSEEMCLSQLFLQVEAAYCCVAELGELGLVQFKDLNMNVNSFQRKFVNEVRRCES
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 MDRKLRFVEKEIRKANIPIMDTGENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALKR
..: :::.: :... .: .. ..: .:.::.:: ::. .::.:.::.: : ::.:::.
CCDS58 LERILRFLEDEMQN-EIVVQLLEKSPLTPLPREMITLETVLEKLEGELQEANQNQQALKQ
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 NFLELTELKFILRKTQQFFDEAELHHQQMADPDLLEESSSLLEPSEMGRGTPLRLGFVAG
.::::::::..:.:::.:: :.: . .:: . :..:.::: . . .:::.::
CCDS58 SFLELTELKYLLKKTQDFF-ETETN---LADDFFTEDTSGLLELKAVPAYMTGKLGFIAG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 VINRERIPTFERMLWRVCRGNVFLRQAEIENPLEDPVTGDYVHKSVFIIFFQGDQLKNRV
::::::. .:::.:::.:::::.:. .:.. ::::::: . ..:..::::.::.::....
CCDS58 VINRERMASFERLLWRICRGNVYLKFSEMDAPLEDPVTKEEIQKNIFIIFYQGEQLRQKI
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 KKICEGFRASLYPCPETPQERKEMASGVNTRIDDLQMVLNQTEDHRQRVLQAAAKNIRVW
::::.::::..::::: ::.:: .::.:..:: :..:::.::::.:: :: : . :
CCDS58 KKICDGFRATVYPCPEPAVERREMLESVNVRLEDLITVITQTESHRQRLLQEAAANWHSW
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 FIKVRKMKAIYHTLNLCNIDVTQKCLIAEVWCPVTDLDSIQFALRRGTEHSGSTVPSILN
.:::.::::.:: ::.:::::::.:.:::.: ::.: :. ::..: : :::.. :..
CCDS58 LIKVQKMKAVYHILNMCNIDVTQQCVIAEIWFPVADATRIKRALEQGMELSGSSMAPIMT
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 RMQTNQTPPTYNKTNKFTYGFQNIVDAYGIGTYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDFGHG
.:.. .:::.:.::::: ::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::: :::
CCDS58 TVQSKTAPPTFNRTNKFTAGFQNIVDAYGVGSYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDCGHG
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ILMTLFAVWMVLRESRILSQKNENEMFSTVFSGRYIILLMGVFSMYTGLIYNDCFSKSLN
.: : :.::.: : :.::::..::...: : :::.:::::.::.:::::::::::::::
CCDS58 TVMLLAALWMILNERRLLSQKTDNEIWNTFFHGRYLILLMGIFSIYTGLIYNDCFSKSLN
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530
pF1KE2 IFGSSWSVRPMFTYN-WTEETLRGNPVLQLNPALPGV-FGGPYPFGIDPIWNIATNKLTF
::::::::.::: . :. .... . :::.::.::: ::.:::::::::::.:.:::::
CCDS58 IFGSSWSVQPMFRNGTWNTHVMEESLYLQLDPAIPGVYFGNPYPFGIDPIWNLASNKLTF
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 LNSFKMKMSVILGIIHMLFGVSLSLFNHIYFKKPLNIYFGFIPEIIFMTSLFGYLVILIF
:::.::::::::::..:.::: :::::::::.. ::: . ::::.::. ::::::..:.
CCDS58 LNSYKMKMSVILGIVQMVFGVILSLFNHIYFRRTLNIILQFIPEMIFILCLFGYLVFMII
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 YKWTAYDAHTSENAPSLLIHFINMFLFSYPESGYSMLYSGQKGIQCFLVVVALLCVPWML
.:: .:.:.:..:::.::::::::::.: .:. . ::. :. .: :.::.::. :::::
CCDS58 FKWCCFDVHVSQHAPSILIHFINMFLFNYSDSSNAPLYKHQQEVQSFFVVMALISVPWML
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 LFKPLVLRRQYLRRKHL--------GTLNFGGIRVGNGPTEEDAEIIQHDQLSTHSEDAD
:.::..:: .. :...: .: :. : ...:. .... . : .. .. ..
CCDS58 LIKPFILRASH-RKSQLQASRIQEDATENIEGD--SSSPSSRSGQRTSADTHGALDDHGE
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 EFDFGDTMVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVIHIGLSVKSL
::.:::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.. ::....
CCDS58 EFNFGDVFVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVMNSGLQTRGW
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KE2 AGGLVLFFFFTAFATLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGFKFLPFSFEH
.: . .:..:..::.::::::::::::::::::::::::::::::: : :.:: ::::.:
CCDS58 GGIVGVFIIFAVFAVLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYVGDGYKFSPFSFKH
780 790 800 810 820 830
pF1KE2 IREGKFEE
: .: ::
CCDS58 ILDGTAEE
840
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:: .:::::..:.:::: . ::: :::.::::: :.::::: .:..:::.:: .::::::
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10 20 30 40 50 60
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pF1KE2 MDRKLRFVEKEIRKANIPIMDT-GENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALK
... . :...:.:.:.. . :. : .: :::.. .. . :.. .::... ::.::.
CCDS81 LEKTFTFLQEEVRRAGLVLPPPKGRLP-APPPRDLLRIQEETERLAQELRDVRGNQQALR
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
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.. .: .::. . : .: : : : . ::. . : ::..:::
CCDS81 AQLHQLQLHAAVLRQGH----EPQL---AAAHTDGASERTPLLQ-APGGPHQDLRVNFVA
120 130 140 150 160 170
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:... .. :..::.:::.::: .. :.:.::: ::::. . .:.: . :.:. ..
CCDS81 GAVEPHKAPALERLLWRACRGFLIASFRELEQPLEHPVTGEPATWMTFLISYWGEQIGQK
180 190 200 210 220 230
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pF1KE2 VKKICEGFRASLYPCPETPQERKEMASGVNTRIDDLQMVLNQTEDHRQRVLQAAAKNIRV
..:: . :. ..: . . : . .. . ..:: ::..:: ..:: . . .
CCDS81 IRKITDCFHCHVFPFLQQEEARLGALQQLQQQSQELQEVLGETERFLSQVLGRVLQLLPP
240 250 260 270 280 290
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..:.::::.: .:: :....:.::::::.:: : :: ..: ::: .. . : : ..
CCDS81 GQVQVHKMKAVYLALNQCSVSTTHKCLIAEAWCSVRDLPALQEALRDSSMEEG--VSAVA
300 310 320 330 340
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pF1KE2 NRMQTNQTPPTYNKTNKFTYGFQNIVDAYGIGTYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDFGH
.:. . ::: .::.:: .::.::::::.: :.:.:::::::::::::::::::: ::
CCDS81 HRIPCRDMPPTLIRTNRFTASFQGIVDAYGVGRYQEVNPAPYTIITFPFLFAVMFGDVGH
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420 430 440 450 460 470
pF1KE2 GILMTLFAVWMVLRESRILSQKNENEMFSTVFSGRYIILLMGVFSMYTGLIYNDCFSKSL
:.:: :::. ::: :.: . .::...: : :::..::::.::.:::.:::.:::..
CCDS81 GLLMFLFALAMVLAENRPAVKAAQNEIWQTFFRGRYLLLLMGLFSIYTGFIYNECFSRAT
410 420 430 440 450 460
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pF1KE2 NIFGSSWSVRPMFTYN-WTEETLRGNPVLQLNPALPGVFGGPYPFGIDPIWNIATNKLTF
.:: :.::: : . . :.. : . .: :.: . ::: :::::::::::..:.:.:.:
CCDS81 SIFPSGWSVAAMANQSGWSDAFLAQHTMLTLDPNVTGVFLGPYPFGIDPIWSLAANHLSF
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 LNSFKMKMSVILGIIHMLFGVSLSLFNHIYFKKPLNIYFGFIPEIIFMTSLFGYLVILIF
:::::::::::::..:: ::: :..:::..: . . . .::. :. .::::::.:..
CCDS81 LNSFKMKMSVILGVVHMAFGVVLGVFNHVHFGQRHRLLLETLPELTFLLGLFGYLVFLVI
530 540 550 560 570 580
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pF1KE2 YKWTAYDAHTSENAPSLLIHFINMFLFSYPESGYSMLYSGQKGIQCFLVVVALLCVPWML
::: : . .:::.:::::::::::. :. .:: :. .: :::.:: :: .:
CCDS81 YKWLCVWAARAASAPSILIHFINMFLFSHSPSNR-LLYPRQEVVQATLVVLALAMVPILL
590 600 610 620 630 640
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pF1KE2 LFKPLVL---RRQYLRRK--------HLGTLNFGGIRVGNGPTEEDAEIIQHDQLSTHSE
: :: : .:. :::. . : :.. : :: . .. . :. :
CCDS81 LGTPLHLLHRHRRRLRRRPADRQEENKAGLLDLPDASV-NGWSSDEEKAGGLDD-----E
650 660 670 680 690 700
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pF1KE2 DADEFDFGDTMVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVIHIGLSV
. :. .....::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::.::..:::..
CCDS81 EEAELVPSEVLMHQAIHTIEFCLGCVSNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWAMVMRIGLGL
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770 780 790 800 810 820
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.: ..:: .:.:::..::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:. :
CCDS81 GREVGVAAVVLVPIFAAFAVMTVAILLVMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGYKLSP
770 780 790 800 810 820
830
pF1KE2 FSFEHIREGKFEE
:.:
CCDS81 FTFAATDD
830
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:.: . :.:. ....:: . :. ..: .
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260 270 280 290 300 310
pF1KE2 TPQERKEMASGVNTRIDDLQMVLNQTEDHRQRVLQAAAKNIRVWFIKVRKMKAIYHTLNL
. : . .. . ..:: ::..:: ..:: . . . ..:.::::.: .::
CCDS53 QEEARLGALQQLQQQSQELQEVLGETERFLSQVLGRVLQLLPPGQVQVHKMKAVYLALNQ
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pF1KE2 CNIDVTQKCLIAEVWCPVTDLDSIQFALRRGTEHSGSTVPSILNRMQTNQTPPTYNKTNK
:....:.::::::.:: : :: ..: ::: .. . : : .. .:. . ::: .::.
CCDS53 CSVSTTHKCLIAEAWCSVRDLPALQEALRDSSMEEG--VSAVAHRIPCRDMPPTLIRTNR
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:: .::.::::::.: :.:.:::::::::::::::::::: :::.:: :::. ::: :.:
CCDS53 FTASFQGIVDAYGVGRYQEVNPAPYTIITFPFLFAVMFGDVGHGLLMFLFALAMVLAENR
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pF1KE2 ILSQKNENEMFSTVFSGRYIILLMGVFSMYTGLIYNDCFSKSLNIFGSSWSVRPMFTYN-
. .::...: : :::..::::.::.:::.:::.:::.. .:: :.::: : . .
CCDS53 PAVKAAQNEIWQTFFRGRYLLLLMGLFSIYTGFIYNECFSRATSIFPSGWSVAAMANQSG
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pF1KE2 WTEETLRGNPVLQLNPALPGVFGGPYPFGIDPIWNIATNKLTFLNSFKMKMSVILGIIHM
:.. : . .: :.: . ::: :::::::::::..:.:.:.::::::::::::::..::
CCDS53 WSDAFLAQHTMLTLDPNVTGVFLGPYPFGIDPIWSLAANHLSFLNSFKMKMSVILGVVHM
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pF1KE2 LFGVSLSLFNHIYFKKPLNIYFGFIPEIIFMTSLFGYLVILIFYKWTAYDAHTSENAPSL
::: :..:::..: . . . .::. :. .::::::.:..::: : . .:::.
CCDS53 AFGVVLGVFNHVHFGQRHRLLLETLPELTFLLGLFGYLVFLVIYKWLCVWAARAASAPSI
340 350 360 370 380 390
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pF1KE2 LIHFINMFLFSYPESGYSMLYSGQKGIQCFLVVVALLCVPWMLLFKPLVL---RRQYLRR
:::::::::::. :. .:: :. .: :::.:: :: .:: :: : .:. :::
CCDS53 LIHFINMFLFSHSPSNR-LLYPRQEVVQATLVVLALAMVPILLLGTPLHLLHRHRRRLRR
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pF1KE2 K--------HLGTLNFGGIRVGNGPTEEDAEIIQHDQLSTHSEDADEFDFGDTMVHQAIH
. . : :.. : :: . .. . :. :. :. .....:::::
CCDS53 RPADRQEENKAGLLDLPDASV-NGWSSDEEKAGGLDD-----EEEAELVPSEVLMHQAIH
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pF1KE2 TIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVIHIGLSVKSLAG--GLVLFFFFTA
:::.::::.::::::::::::::::::::::::.::..:::.. .: ..:: .:.:
CCDS53 TIEFCLGCVSNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWAMVMRIGLGLGREVGVAAVVLVPIFAA
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pF1KE2 FATLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGFKFLPFSFEHIREGKFEE
::..::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:. ::.:
CCDS53 FAVMTVAILLVMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGYKLSPFTFAATDD
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pF1KE2 MGELFRSEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELGELGKVQFRDLNPDVNVFQRKFVNEVRRCEE
:: ::::: : :::::::: .:: :.: ::: : ::::::: .:. ::::::.::.::::
CCDS92 MGSLFRSETMCLAQLFLQSGTAYECLSALGEKGLVQFRDLNQNVSSFQRKFVGEVKRCEE
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..: : .. .:: .:.::. . .: .: ....... ...:.: ::.:.. :.: :..
CCDS92 LERILVYLVQEINRADIPLPEGEASPPAPPLKQVLEMQEQLQKLEVELREVTKNKEKLRK
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:.::: : .:: :. : . .:.. :.: ::.:::. : : : .::::.
CCDS92 NLLELIEYTHMLRVTKTFVKRNVEFEPTYEEFPSL--ESDSLLDYSCMQR-LGAKLGFVS
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pF1KE2 GVINRERIPTFERMLWRVCRGNVFLRQAEIENPLEDPVTGDYVHKSVFIIFFQGDQLKNR
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CCDS92 GLINQGKVEAFEKMLWRVCKGYTIVSYAELDESLEDPETGEVIKWYVFLISFWGEQIGHK
180 190 200 210 220 230
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CCDS92 VKKICDCYHCHVYPYPNTAEERREIQEGLNTRIQDLYTVLHKTEDYLRQVLCKAAESVYS
240 250 260 270 280 290
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pF1KE2 WFIKVRKMKAIYHTLNLCNIDVTQKCLIAEVWCPVTDLDSIQFALRRGTEHSGSTVPSIL
:.:.::::::: ::.:..:::.:::::::::: .::.... ::..:...::.:.::..
CCDS92 RVIQVKKMKAIYHMLNMCSFDVTNKCLIAEVWCPEADLQDLRRALEEGSRESGATIPSFM
300 310 320 330 340 350
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: . :..:::: .::::: ::::::::::.:.:::.::: .::::::::::::::::::
CCDS92 NIIPTKETPPTRIRTNKFTEGFQNIVDAYGVGSYREVNPALFTIITFPFLFAVMFGDFGH
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:..: :::. .:: :.. .... :.. :.::::.::::.::.:::::::::::::.
CCDS92 GFVMFLFALLLVLNENHPRLNQSQ-EIMRMFFNGRYILLLMGLFSVYTGLIYNDCFSKSV
420 430 440 450 460 470
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CCDS92 NLFGSGWNVSAMYSSSHPPAEHKKMVLWNDSVVRHNSILQLDPSIPGVFRGPYPLGIDPI
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CCDS92 WNLATNRLTFLNSFKMKMSVILGIIHMTFGVILGIFNHLHFRKKFNIYLVSIPELLFMLC
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pF1KE2 LFGYLVILIFYKWTAYDAHTSENAPSLLIHFINMFLFSYPESGYSMLYSGQKGIQCFLVV
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CCDS92 IFGYLIFMIFYKWLVFSAETSRVAPSILIEFINMFLF--PASKTSGLYTGQEYVQRVLLV
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CCDS92 VEDGCREMACEEFNFGEILMTQVIHSIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSDVLWAM
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CCDS92 LMRVGLRVDTTYGVLLLLPVIALFAVLTIFILLIMEGLSAFLHAIRLHWVEFQNKFYVGA
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pF1KE2 GFKFLPFSFEHIREGKFEE
: ::.::::
CCDS92 GTKFVPFSFSLLSSKFNNDDSVA
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838 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 16:40:34 2016 done: Tue Nov 8 16:40:35 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]