Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2523
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2523, 1251 aa
1>>>pF1KE2523 1251 - 1251 aa - 1251 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4179+/-0.00126; mu= 16.8478+/- 0.075
mean_var=82.4606+/-16.429, 0's: 0 Z-trim(101.1): 60 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.141238
statistics sampled from 6337 (6392) to 6337 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.523), E-opt: 0.2 (0.196), width: 16
Scan time: 4.110
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11965.1 ATP8B1 gene_id:5205|Hs108|chr18 (1251) 8278 1697.8 0
CCDS45901.1 ATP8B3 gene_id:148229|Hs108|chr19 (1300) 3308 685.1 3.2e-196
CCDS54196.1 ATP8B3 gene_id:148229|Hs108|chr19 (1263) 2538 528.2 5.3e-149
CCDS41873.1 ATP8A2 gene_id:51761|Hs108|chr13 (1188) 1980 414.4 8.4e-115
CCDS32238.1 ATP8B4 gene_id:79895|Hs108|chr15 (1192) 1654 348.0 8.4e-95
CCDS1066.1 ATP8B2 gene_id:57198|Hs108|chr1 (1223) 1613 339.7 2.8e-92
CCDS41405.1 ATP8B2 gene_id:57198|Hs108|chr1 ( 387) 1238 263.1 9.9e-70
CCDS47049.1 ATP8A1 gene_id:10396|Hs108|chr4 (1149) 909 196.2 4e-49
CCDS3466.1 ATP8A1 gene_id:10396|Hs108|chr4 (1164) 909 196.2 4.1e-49
CCDS43394.1 ATP10B gene_id:23120|Hs108|chr5 (1461) 859 186.1 5.8e-46
CCDS32011.1 ATP11A gene_id:23250|Hs108|chr13 (1134) 839 181.9 7.8e-45
CCDS32178.1 ATP10A gene_id:57194|Hs108|chr15 (1499) 792 172.4 7.7e-42
CCDS3476.1 ATP10D gene_id:57205|Hs108|chr4 (1426) 777 169.3 6.1e-41
CCDS33896.1 ATP11B gene_id:23200|Hs108|chr3 (1177) 769 167.7 1.6e-40
CCDS35410.1 ATP11C gene_id:286410|Hs108|chrX (1119) 738 161.4 1.2e-38
CCDS14668.1 ATP11C gene_id:286410|Hs108|chrX (1132) 738 161.4 1.2e-38
CCDS12014.1 ATP9B gene_id:374868|Hs108|chr18 (1147) 506 114.1 2.1e-24
CCDS77202.1 ATP9B gene_id:374868|Hs108|chr18 (1136) 493 111.4 1.3e-23
CCDS33489.1 ATP9A gene_id:10079|Hs108|chr20 (1047) 479 108.6 8.8e-23
>>CCDS11965.1 ATP8B1 gene_id:5205|Hs108|chr18 (1251 aa)
initn: 8278 init1: 8278 opt: 8278 Z-score: 9109.7 bits: 1697.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8278; 99.9% identity (100.0% similar) in 1251 aa overlap (1-1251:1-1251)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSTERDSETTFDEDSQPNDEVVPYSDDETEDELDDQGSAVEPEQNRVNREAEENREPFRK
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CCDS11 MSTERDSETTFDEDSQPNDEVVPYSDDETEDELDDQGSAVEPEQNRVNREAEENREPFRK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 ECTWQVKANDRKYHEQPHFMNTKFLCIKESKYANNAIKTYKYNAFTFIPMNLFEQFKRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ECTWQVKANDRKYHEQPHFMNTKFLCIKESKYANNAIKTYKYNAFTFIPMNLFEQFKRAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 NLYFLALLILQAVPQISTLAWYTTLVPLLVVLGVTAIKDLVDDVARHKMDKEINNRTCEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NLYFLALLILQAVPQISTLAWYTTLVPLLVVLGVTAIKDLVDDVARHKMDKEINNRTCEV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 IKDGRFKVAKWKEIQVGDVIRLKKNDFVPADILLLSSSEPNSLCYVETAELDGETNLKFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IKDGRFKVAKWKEIQVGDVIRLKKNDFVPADILLLSSSEPNSLCYVETAELDGETNLKFK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 MSLEITDQYLQREDTLATFDGFIECEEPNNRLDKFTGTLFWRNTSFPLDADKILLRGCVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSLEITDQYLQREDTLATFDGFIECEEPNNRLDKFTGTLFWRNTSFPLDADKILLRGCVI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 RNTDFCHGLVIFAGADTKIMKNSGKTRFKRTKIDYLMNYMVYTIFVVLILLSAGLAIGHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RNTDFCHGLVIFAGADTKIMKNSGKTRFKRTKIDYLMNYMVYTIFVVLILLSAGLAIGHA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 YWEAQVGNSSWYLYDGEDDTPSYRGFLIFWGYIIVLNTMVPISLYVSVEVIRLGQSHFIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YWEAQVGNSSWYLYDGEDDTPSYRGFLIFWGYIIVLNTMVPISLYVSVEVIRLGQSHFIN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 WDLQMYYAEKDTPAKARTTTLNEQLGQIHYIFSDKTGTLTQNIMTFKKCCINGQIYGDHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 WDLQMYYAEKDTPAKARTTTLNEQLGQIHYIFSDKTGTLTQNIMTFKKCCINGQIYGDHR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 DASQHNHNKIEQVDFSWNTYADGKLAFYDHYLIEQIQSGKEPEVRQFFFLLAVCHTVMVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DASQHNHNKIEQVDFSWNTYADGKLAFYDHYLIEQIQSGKEPEVRQFFFLLAVCHTVMVD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 RTDGQLNYQAASPDEGALVNAARNFGFAFLARTQNTITISELGTERTYNVLAILDFNSDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RTDGQLNYQAASPDEGALVNAARNFGFAFLARTQNTITISELGTERTYNVLAILDFNSDR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 KRMSIIVRTPEGNIKLYCKGADTVIYERLHRMNPTKQETQDALDIFANETLRTLCLCYKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KRMSIIVRTPEGNIKLYCKGADTVIYERLHRMNPTKQETQDALDIFANETLRTLCLCYKE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 IEEKEFTEWNKKFMAASVASTNRDEALDKVYEEIEKDLILLGATAIEDKLQDGVPETISK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IEEKEFTEWNKKFMAASVASTNRDEALDKVYEEIEKDLILLGATAIEDKLQDGVPETISK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 LAKADIKIWVLTGDKKETAENIGFACELLTEDTTICYGEDINSLLHARMENQRNRGGVYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LAKADIKIWVLTGDKKETAENIGFACELLTEDTTICYGEDINSLLHARMENQRNRGGVYA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 KFAPPVQESFFPPGGNRALIITGSWLNEILLEKKTKRNKILKLKFPRTEEERRMRTQSKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KFAPPVQESFFPPGGNRALIITGSWLNEILLEKKTKRNKILKLKFPRTEEERRMRTQSKR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 RLEAKKEQRQKNFVDLACECSAVICCRVTPKQKAMVVDLVKRYKKAITLAIGDGANDVNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RLEAKKEQRQKNFVDLACECSAVICCRVTPKQKAMVVDLVKRYKKAITLAIGDGANDVNM
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 IKTAHIGVGISGQEGMQAVMSSDYSFAQFRYLQRLLLVHGRWSYIRMCKFLRYFFYKNFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IKTAHIGVGISGQEGMQAVMSSDYSFAQFRYLQRLLLVHGRWSYIRMCKFLRYFFYKNFA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 FTLVHFWYSFFNGYSAQTAYEDWFITLYNVLYTSLPVLLMGLLDQDVSDKLSLRFPGLYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FTLVHFWYSFFNGYSAQTAYEDWFITLYNVLYTSLPVLLMGLLDQDVSDKLSLRFPGLYI
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 VGQRDLLFNYKRFFVSLLHGVLTSMILFFIPLGAYLQTVGQDGEAPSDYQSFAVTIASAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VGQRDLLFNYKRFFVSLLHGVLTSMILFFIPLGAYLQTVGQDGEAPSDYQSFAVTIASAL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 VITVNFQIGLDTSYWTFVNAFSIFGSIALYFGIMFDFHSAGIHVLFPSAFQFTGTASNAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VITVNFQIGLDTSYWTFVNAFSIFGSIALYFGIMFDFHSAGIHVLFPSAFQFTGTASNAL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 RQPYIWLTIILTVAVCLLPVVAIRFLSMTIWPSESDKIQKHRKRLKAEEQWQRRQQVFRR
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RQPYIWLTIILAVAVCLLPVVAIRFLSMTIWPSESDKIQKHRKRLKAEEQWQRRQQVFRR
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250
pF1KE2 GVSTRRSAYAFSHQRGYADLISSGRSIRKKRSPLDAIVADGTAEYRRTGDS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GVSTRRSAYAFSHQRGYADLISSGRSIRKKRSPLDAIVADGTAEYRRTGDS
1210 1220 1230 1240 1250
>>CCDS45901.1 ATP8B3 gene_id:148229|Hs108|chr19 (1300 aa)
initn: 3139 init1: 1976 opt: 3308 Z-score: 3636.3 bits: 685.1 E(32554): 3.2e-196
Smith-Waterman score: 3600; 47.0% identity (74.4% similar) in 1202 aa overlap (63-1229:106-1272)
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 LDDQGSAVEPEQNRVNREAEENREPFRKECTWQVKANDRKYHEQPHFMNTKFLCIKESKY
::.:.::.: :. : : . .:: ...::
CCDS45 KYEWRPEGPTSMGSLGQREDLQDEDRNSAFTWKVQANNRAYNGQ--FKEKVILCWQRKKY
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 ANNAIKTYKYNAFTFIPMNLFEQFKRAANLYFLALLILQAVPQISTLAWYTTLVPLLVVL
.:.:.: ::: ..:.:.::.:::.:..::.:: ..:::..:.:::: :.. .:.. .:
CCDS45 KTNVIRTAKYNFYSFLPLNLYEQFHRVSNLFFLIIIILQSIPDISTLPWFSLSTPMVCLL
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 GVTAIKDLVDDVARHKMDKEINNRTCEVIKDGRFKVAKWKEIQVGDVIRLKKNDFVPADI
. : .:::::..::: :. :::: :... :: ::... ::::. :.:...::::.
CCDS45 FIRATRDLVDDMGRHKSDRAINNRPCQILMGKSFKQKKWQDLCVGDVVCLRKDNIVPADM
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 LLLSSSEPNSLCYVETAELDGETNLKFKMSLEITDQYLQREDTLATFDGFIECEEPNNRL
:::.:.::.:::::::...::::::::...: .: . : .:.:.: . :: ::.:.
CCDS45 LLLASTEPSSLCYVETVDIDGETNLKFRQALMVTHKELATIKKMASFQGTVTCEAPNSRM
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 DKFTGTLFWRNTSFPLDADKILLRGCVIRNTDFCHGLVIFAGADTKIMKNSGKTRFKRTK
.:.: : : . .. :: ..::::: ::::: :.::::.:: ::::::: :: ..::::
CCDS45 HHFVGCLEWNDKKYSLDIGNLLLRGCRIRNTDTCYGLVIYAGFDTKIMKNCGKIHLKRTK
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 IDYLMNYMVYTIFVVLILLSAGLAIGHAYWEAQVGNSSWYLYDGEDDTPSYRGFLIFWGY
.: ::: .: .::. ..:. ::.: .. . . .:: . .. . ..:..::..
CCDS45 LDLLMNKLVVVIFISVVLVCLVLAFGFGFSVKEFKDHHYYLSGVHGSSVAAESFFVFWSF
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 IIVLNTMVPISLYVSVEVIRLGQSHFINWDLQMYYAEKDTPAKARTTTLNEQLGQIHYIF
.:.:.. .:.:... : : ::.: ::.::.:::: .:.:::::.:.::..:::..:::
CCDS45 LILLSVTIPMSMFILSEFIYLGNSVFIDWDVQMYYKPQDVPAKARSTSLNDHLGQVEYIF
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 SDKTGTLTQNIMTFKKCCINGQIYGDHRDASQHNHNKIEQVDFSWNTYADGKLAFYDHYL
:::::::::::.::.::::.:..:: .:. .. .. . :: .::::: :.. :
CCDS45 SDKTGTLTQNILTFNKCCISGRVYGPDSEAT----TRPKENPYLWNKFADGKLLFHNAAL
500 510 520 530 540
520 530 540 550 560
pF1KE2 IEQIQSGKEPEVRQFFFLLAVCHTVMV-----DRTDGQLNYQAASPDEGALVNAARNFGF
.. .... . ::.:. :::.:::::: .: : :: ::::::::::::.::::::.
CCDS45 LHLVRTNGDEAVREFWRLLAICHTVMVRESPRERPD-QLLYQAASPDEGALVTAARNFGY
550 560 570 580 590 600
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 AFLARTQNTITISELGTERTYNVLAILDFNSDRKRMSIIVRTPEGNIKLYCKGADTVIYE
.::.:::.:.:: ::: ::.:.::::.:::: :::::..:: ::: : :: :::::::.:
CCDS45 VFLSRTQDTVTIMELGEERVYQVLAIMDFNSTRKRMSVLVRKPEGAICLYTKGADTVIFE
610 620 630 640 650 660
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 RLHRMNPTKQETQDALDIFANETLRTLCLCYKEIEEKEFTEWNKKFMAASVASTNRDEAL
:::: . . :..:: ::.:::::::: :.:. : . .:... . ::. :: .::
CCDS45 RLHRRGAMEFATEEALAAFAQETLRTLCLAYREVAEDIYEDWQQRHQEASLLLQNRAQAL
670 680 690 700 710 720
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 DKVYEEIEKDLILLGATAIEDKLQDGVPETISKLAKADIKIWVLTGDKKETAENIGFACE
.. :::::::::.:::::::::. : :..::::::::::.::: :::::::
CCDS45 QQ----------LLGATAIEDRLQDGVPETIKCLKKSNIKIWVLTGDKQETAVNIGFACE
730 740 750 760 770
750 760 770 780 790 800
pF1KE2 LLTEDTTICYGEDINSLLHARMENQRNRGGVYAKFAPPVQESFFPPGGNRALIITGSWLN
::.:. : ..:. .:.. ::. : ..::. . ::.:.:..:.
CCDS45 LLSENMLILEEKEISRILETYWENSNNLL---------TRESLSQV--KLALVINGDFLD
780 790 800 810 820
810 820 830 840
pF1KE2 EILLE-KKTKRNKILKLKFPRTEEE-----------RRMRTQSKRR---LEAKKEQ----
..:. .: : .... .. .: ::. .: : : :
CCDS45 KLLVSLRKEPRALAQNVNMDEAWQELGQSRRDFLYARRLSLLCRRFGLPLAAPPAQDSRA
830 840 850 860 870 880
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 -------RQKNFVDLACECSAVICCRVTPKQKAMVVDLVKRYKKAITLAIGDGANDVNMI
... ::::: .:.:::::::::::::..: :::.:....::::::::::.:::
CCDS45 RRSSEVLQERAFVDLASKCQAVICCRVTPKQKALIVALVKKYHQVVTLAIGDGANDINMI
890 900 910 920 930 940
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 KTAHIGVGISGQEGMQAVMSSDYSFAQFRYLQRLLLVHGRWSYIRMCKFLRYFFYKNFAF
::: .:::..::::::::..::. ..:: .:::::::::::::.:.::::::::::..:
CCDS45 KTADVGVGLAGQEGMQAVQNSDFVLGQFCFLQRLLLVHGRWSYVRICKFLRYFFYKSMAS
950 960 970 980 990 1000
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 TLVHFWYSFFNGYSAQTAYEDWFITLYNVLYTSLPVLLMGLLDQDVSDKLSLRFPGLYIV
.:. :.. .::...: :: ::..:.:.::..:::: .::..:::: . ::. : ::.:
CCDS45 MMVQVWFACYNGFTGQPLYEGWFLALFNLLYSTLPVLYIGLFEQDVSAEQSLEKPELYVV
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 GQRDLLFNYKRFFVSLLHGVLTSMILFFIPLGAYLQTVGQDGEAPSDYQSFAVTIASALV
::.: :::: : .. ::: ::.. ::. : .:.: . ::.:::::..: . .
CCDS45 GQKDELFNYWVFVQAIAHGVTTSLVNFFMTLWISRDTAGP--ASFSDHQSFAVVVALSCL
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 ITVNFQIGLDTSYWTFVNAFSIFGSIALYFGIMFDFHSAGIHVLFPSAFQFTGTASNALR
....... : .::: . . .:. :...: . .: . . :..: : . ...
CCDS45 LSITMEVILIIKYWTALCVATILLSLGFYAIMTTTTQSFWLFRVSPTTFPFLYADLSVMS
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE2 QPYIWLTIILTVAVCLLPVVAIRFLSMTIWPSESDKIQKHRKRLK--AEEQWQRRQ--QV
.: : :...:.:.. .::.:.: .:.:. .. :..: . .:: . . .:
CCDS45 SPSILLVVLLSVSINTFPVLALR----VIFPALKELRAKEEKVEEGPSEEIFTMEPLPHV
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KE2 FRRGVSTRRSAYAFSHQRGYADLISSGRSIRKKRSPLDAIVADGTAEYRRTGDS
:.. .:::.:::::..:::.::..: .:.
CCDS45 HRES-RARRSSYAFSHREGYANLITQGTILRRGPGVSSDIASESLDPSDEEAASSPKESQ
1250 1260 1270 1280 1290 1300
>>CCDS54196.1 ATP8B3 gene_id:148229|Hs108|chr19 (1263 aa)
initn: 2626 init1: 1463 opt: 2538 Z-score: 2788.6 bits: 528.2 E(32554): 5.3e-149
Smith-Waterman score: 3646; 47.3% identity (74.8% similar) in 1208 aa overlap (63-1229:53-1235)
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 LDDQGSAVEPEQNRVNREAEENREPFRKECTWQVKANDRKYHEQPHFMNTKFLCIKESKY
::.:.::.: :. : : . .:: ...::
CCDS54 KYEWRPEGPTSMGSLGQREDLQDEDRNSAFTWKVQANNRAYNGQ--FKEKVILCWQRKKY
30 40 50 60 70 80
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 ANNAIKTYKYNAFTFIPMNLFEQFKRAANLYFLALLILQAVPQISTLAWYTTLVPLLVVL
.:.:.: ::: ..:.:.::.:::.:..::.:: ..:::..:.:::: :.. .:.. .:
CCDS54 KTNVIRTAKYNFYSFLPLNLYEQFHRVSNLFFLIIIILQSIPDISTLPWFSLSTPMVCLL
90 100 110 120 130 140
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pF1KE2 GVTAIKDLVDDVARHKMDKEINNRTCEVIKDGRFKVAKWKEIQVGDVIRLKKNDFVPADI
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CCDS54 FIRATRDLVDDMGRHKSDRAINNRPCQILMGKSFKQKKWQDLCVGDVVCLRKDNIVPADM
150 160 170 180 190 200
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 LLLSSSEPNSLCYVETAELDGETNLKFKMSLEITDQYLQREDTLATFDGFIECEEPNNRL
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CCDS54 LLLASTEPSSLCYVETVDIDGETNLKFRQALMVTHKELATIKKMASFQGTVTCEAPNSRM
210 220 230 240 250 260
280 290 300 310 320
pF1KE2 DKFTGTLFWRNTSFPLDADKILLRGCVIRNTDFCHGLVIFA------GADTKIMKNSGKT
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CCDS54 HHFVGCLEWNDKKYSLDIGNLLLRGCRIRNTDTCYGLVIYADGYMFVGFDTKIMKNCGKI
270 280 290 300 310 320
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pF1KE2 RFKRTKIDYLMNYMVYTIFVVLILLSAGLAIGHAYWEAQVGNSSWYLYDGEDDTPSYRGF
..::::.: ::: .: .::. ..:. ::.: .. . . .:: . .. . ..:
CCDS54 HLKRTKLDLLMNKLVVVIFISVVLVCLVLAFGFGFSVKEFKDHHYYLSGVHGSSVAAESF
330 340 350 360 370 380
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 LIFWGYIIVLNTMVPISLYVSVEVIRLGQSHFINWDLQMYYAEKDTPAKARTTTLNEQLG
..::...:.:.. .:.:... : : ::.: ::.::.:::: .:.:::::.:.::..::
CCDS54 FVFWSFLILLSVTIPMSMFILSEFIYLGNSVFIDWDVQMYYKPQDVPAKARSTSLNDHLG
390 400 410 420 430 440
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pF1KE2 QIHYIFSDKTGTLTQNIMTFKKCCINGQIYGDHRDASQHNHNKIEQVDFSWNTYADGKLA
:..::::::::::::::.::.::::.:..:: .:. .. .. . :: .:::::
CCDS54 QVEYIFSDKTGTLTQNILTFNKCCISGRVYGPDSEAT----TRPKENPYLWNKFADGKLL
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pF1KE2 FYDHYLIEQIQSGKEPEVRQFFFLLAVCHTVMV-----DRTDGQLNYQAASPDEGALVNA
:.. :.. .... . ::.:. :::.:::::: .: : :: ::::::::::::.:
CCDS54 FHNAALLHLVRTNGDEAVREFWRLLAICHTVMVRESPRERPD-QLLYQAASPDEGALVTA
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:::::..::.:::.:.:: ::: ::.:.::::.:::: :::::..:: ::: : :: :::
CCDS54 ARNFGYVFLSRTQDTVTIMELGEERVYQVLAIMDFNSTRKRMSVLVRKPEGAICLYTKGA
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pF1KE2 DTVIYERLHRMNPTKQETQDALDIFANETLRTLCLCYKEIEEKEFTEWNKKFMAASVAST
::::.::::: . . :..:: ::.:::::::: :.:. : . .:... . ::.
CCDS54 DTVIFERLHRRGAMEFATEEALAAFAQETLRTLCLAYREVAEDIYEDWQQRHQEASLLLQ
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pF1KE2 NRDEALDKVYEEIEKDLILLGATAIEDKLQDGVPETISKLAKADIKIWVLTGDKKETAEN
:: .::..::.:.:.:: :::::::::.:::::::::. : :..::::::::::.::: :
CCDS54 NRAQALQQVYNEMEQDLRLLGATAIEDRLQDGVPETIKCLKKSNIKIWVLTGDKQETAVN
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pF1KE2 IGFACELLTEDTTICYGEDINSLLHARMENQRNRGGVYAKFAPPVQESFFPPGGNRALII
::::::::.:. : ..:. .:.. ::. : ..::. . ::.:
CCDS54 IGFACELLSENMLILEEKEISRILETYWENSNNLL---------TRESLSQV--KLALVI
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pF1KE2 TGSWLNEILLE-KKTKRNKILKLKFPRTEEE-----------RRMRTQSKRR---LEAKK
.:..:...:. .: : .... .. .: ::. .: : :
CCDS54 NGDFLDKLLVSLRKEPRALAQNVNMDEAWQELGQSRRDFLYARRLSLLCRRFGLPLAAPP
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pF1KE2 EQ-----------RQKNFVDLACECSAVICCRVTPKQKAMVVDLVKRYKKAITLAIGDGA
: ... ::::: .:.:::::::::::::..: :::.:....::::::::
CCDS54 AQDSRARRSSEVLQERAFVDLASKCQAVICCRVTPKQKALIVALVKKYHQVVTLAIGDGA
850 860 870 880 890 900
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pF1KE2 NDVNMIKTAHIGVGISGQEGMQAVMSSDYSFAQFRYLQRLLLVHGRWSYIRMCKFLRYFF
::.:::::: .:::..::::::::..::. ..:: .:::::::::::::.:.::::::::
CCDS54 NDINMIKTADVGVGLAGQEGMQAVQNSDFVLGQFCFLQRLLLVHGRWSYVRICKFLRYFF
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pF1KE2 YKNFAFTLVHFWYSFFNGYSAQTAYEDWFITLYNVLYTSLPVLLMGLLDQDVSDKLSLRF
::..: .:. :.. .::...: :: ::..:.:.::..:::: .::..:::: . ::.
CCDS54 YKSMASMMVQVWFACYNGFTGQPLYEGWFLALFNLLYSTLPVLYIGLFEQDVSAEQSLEK
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1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE2 PGLYIVGQRDLLFNYKRFFVSLLHGVLTSMILFFIPLGAYLQTVGQDGEAPSDYQSFAVT
: ::.:::.: :::: : .. ::: ::.. ::. : .:.: . ::.:::::.
CCDS54 PELYVVGQKDELFNYWVFVQAIAHGVTTSLVNFFMTLWISRDTAGP--ASFSDHQSFAVV
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1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE2 IASALVITVNFQIGLDTSYWTFVNAFSIFGSIALYFGIMFDFHSAGIHVLFPSAFQFTGT
.: . ........ : .::: . . .:. :...: . .: . . :..: : .
CCDS54 VALSCLLSITMEVILIIKYWTALCVATILLSLGFYAIMTTTTQSFWLFRVSPTTFPFLYA
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1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE2 ASNALRQPYIWLTIILTVAVCLLPVVAIRFLSMTIWPSESDKIQKHRKRLK--AEEQWQR
... .: : :...:.:.. .::.:.: .:.:. .. :..: . .:: .
CCDS54 DLSVMSSPSILLVVLLSVSINTFPVLALR----VIFPALKELRAKEEKVEEGPSEEIFTM
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pF1KE2 RQ--QVFRRGVSTRRSAYAFSHQRGYADLISSGRSIRKKRSPLDAIVADGTAEYRRTGDS
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CCDS54 EPLPHVHRES-RARRSSYAFSHREGYANLITQGTILRRGPGVSSDIASESLDPSDEEAAS
1200 1210 1220 1230 1240 1250
CCDS54 SPKESQ
1260
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CCDS41 MLNGAGLDKALKMSLPRRSRIRSSVGPVRSSLGYKKAEDEMSRATSVGDQLE
10 20 30 40 50
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pF1KE2 ANDRK-YHEQPHFMNTKFLCIKESKYANNAIKTYKYNAFTFIPMNLFEQFKRAANLYFLA
: : : .:::. .:. .: :.: ::...::.: :.::..:::: .::
CCDS41 APARTIYLNQPHL----------NKFRDNQISTAKYSVLTFLPRFLYEQIRRAANAFFLF
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pF1KE2 LLILQAVPQISTLAWYTTLVPLLVVLGVTAIKDLVDDVARHKMDKEINNRTCEVIKDGRF
. .:: .:..: . :::::::...: ...::..:.: ::: :. .:.. :...: .
CCDS41 IALLQQIPDVSPTGRYTTLVPLIIILTIAGIKEIVEDFKRHKADNAVNKKKTIVLRNGMW
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.. :::. :::.... .....:::..:::::::...::::::.::::::::....: :
CCDS41 HTIMWKEVAVGDIVKVVNGQYLPADVVLLSSSEPQAMCYVETANLDGETNLKIRQGLSHT
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. .: ...: ..: :::: :: .: :::.: . :. : :.::::: .:::..
CCDS41 AD-MQTREVLMKLSGTIECEGPNRHLYDFTGNLNLDGKSLVALGPDQILLRGTQLRNTQW
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. :: . . : : :...:.. . : ...:. ::::::::. ..
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::.::::: : ..:::::::.::.::: . . .:: :. ::.: :::::. : ..
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:.:. :: : .. ::. .: . :.. :: :::.:.:::::::::.:: ::::::. :
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::.::::::::::.::: :::..:.:.... . : :: ... : .. . :.. .
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.:.::: :.:::::::.: ::. .::.::. ::::::::::::::.:
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. ....:..: ::.:.: .: : : ::::..:.:: . .:..... ... :::: ::
CCDS41 LYIIELWFAFVNGFSGQILFERWCIGLYNVIFTALPPFTLGIFERSCTQESMLRFPQLYK
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pF1KE2 VGQRDLLFNYKRFFVSLLHGVLTSMILFFIPLGAYLQ-TVGQDGEAPSDYQSFAVTIASA
. : :: : :. ..... :.:::..:. : . :: .:.: .:: . . .
CCDS41 ITQNGEGFNTKVFWGHCINALVHSLILFWFPMKALEHDTVLTSGHA-TDYLFVGNIVYTY
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.:.:: .. ::.:. :: . ....::. : . ..: ..:. : .: : .. : :. .
CCDS41 VVVTVCLKAGLETTAWTKFSHLAVWGSM-LTWLVFFGIYST-IWPTIPIAPDMRGQATMV
1010 1020 1030 1040 1050 1060
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: . ..:: ..:. ..::. :: : . : . ...:.
CCDS41 LSSAHFWLGLFLVPTACLIEDVAWRAAKHTCKKTLLEEVQELETKSRVLGKAVLRDSNGK
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pF1KE2 RGVSTRRSAYAFSHQRGYADLISSGRSIRKKRSPLDAIVADGTAEYRRTGDS
CCDS41 RLNERDRLIKRLGRKTPPTLFRGSSLQQGVPHGYAFSQEEHGAVSQEEVIRAYDTTKKKS
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pF1KE2 EDELDDQGSAVEPEQNRVNREAEENREPFRKECTWQVKANDRKYHEQPHFMNTKFLCIKE
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CCDS32 MFCSEKKLREVERIVKANDREYNE-------KF-----
10 20
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 SKYANNAIKTYKYNAFTFIPMNLFEQFKRAANLYFLALLILQAVPQISTLAWYTTLVPLL
.::.: :.: ::: .::.:.::::::.:.:: ::: ::::: .:.::.:.:.::.:::.
CCDS32 -QYADNRIHTSKYNILTFLPINLFEQFQRVANAYFLCLLILQLIPEISSLTWFTTIVPLV
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pF1KE2 VVLGVTAIKDLVDDVARHKMDKEINNRTCEVIKDGRFKVAKWKEIQVGDVIRLKKNDFVP
.:. .::.:: .:: ::: :...::: ::. ..... :: ...:::.:.:..:.::
CCDS32 LVITMTAVKDATDDYFRHKSDNQVNNRQSEVLINSKLQNEKWMNVKVGDIIKLENNQFVA
90 100 110 120 130 140
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pF1KE2 ADILLLSSSEPNSLCYVETAELDGETNLKFKMSLEITDQYLQREDTLATFDGFIECEEPN
::.::::::::..:::::::::::::::: . .: .:.. . :: :::.. :: ::
CCDS32 ADLLLLSSSEPHGLCYVETAELDGETNLKVRHALSVTSELGADISRLAGFDGIVVCEVPN
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pF1KE2 NRLDKFTGTLFWRNTSFPLDADKILLRGCVIRNTDFCHGLVIFAGADTKIMKNSGKTRFK
:.:::: : : :.... :. .::.::::..:::..: :.::::: :::.:.:::::.::
CCDS32 NKLDKFMGILSWKDSKHSLNNEKIILRGCILRNTSWCFGMVIFAGPDTKLMQNSGKTKFK
210 220 230 240 250 260
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pF1KE2 RTKIDYLMNYMVYTIFVVLILLSAGLAIGHAYWEAQVGNS-SWYLYDGEDDTPS-YRGFL
::.:: ::: .: :: :: :. ::::.. ::.:.:.. .:. .: . : . :::
CCDS32 RTSIDRLMNTLVLWIFGFLICLGIILAIGNSIWESQTGDQFRTFLFWNEGEKSSVFSGFL
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CCDS32 TFWSYIIILNTVVPISLYVSVEVIRLGHSYFINWDRKMYYSRKAIPAVARTTTLNEELGQ
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CCDS32 IEYIFSDKTGTLTQNIMTFKRCSINGRIYGEVHDDLDQKTEITQEKEPVDFSVKSQADRE
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pF1KE2 LAFYDHYLIEQIQSGKEPEVRQFFFLLAVCHTVMVDRTD-GQLNYQAASPDEGALVNAAR
. :.::.:.:.:. : .:.:..:. :::.::::: .... :.: ::. ::::::::.:::
CCDS32 FQFFDHHLMESIKMG-DPKVHEFLRLLALCHTVMSEENSAGELIYQVQSPDEGALVTAAR
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:::: : .:: .:::: :::: ::..::.::::. :::::.:::.:::.:::: :::::
CCDS32 NFGFIFKSRTPETITIEELGTLVTYQLLAFLDFNNTRKRMSVIVRNPEGQIKLYSKGADT
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pF1KE2 VIYERLHRMNPTKQE-TQDALDIFANETLRTLCLCYKEIEEKEFTEWNKKFMAASVASTN
...:.:: : . :.: :. ::.: :::: . :.....: : ::.: . :..:. .
CCDS32 ILFEKLHPSNEVLLSLTSDHLSEFAGEGLRTLAIAYRDLDDKYFKEWHKMLEDANAATEE
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pF1KE2 RDEALDKVYEEIEKDLILLGATAIEDKLQDGVPETISKLAKADIKIWVLTGDKKETAENI
::: . .:::::.::.::::::.:::::.:: ::...:. :.::::::::::.::: ::
CCDS32 RDERIAGLYEEIERDLMLLGATAVEDKLQEGVIETVTSLSLANIKIWVLTGDKQETAINI
630 640 650 660 670 680
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pF1KE2 GFACELLTEDTTICYGEDINSLLHARMENQRNRGGVYAKFAPPVQESFFPPGGNRALIIT
:.::..::.: . . :. ...: : .. . .... :. : :
CCDS32 GYACNMLTDDMNDVFVIAGNNAVEVREELRKAKQNLFG------QNRNFSNG--------
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... ::: .. .. .. . . ... .: . . ......::: :..
CCDS32 -----HVVCEKK-QQLELDSIVEETITGDYALIINGHSLAHALESDVKNDLLELACMCKT
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CCDS32 VICCRVTPLQKAQVVELVKKYRNAVTLAIGDGANDVSMIKSAHIGVGISGQEGLQAVLAS
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::::::::::::::::::::::.:::::: :::::::::::::::..:: :.::::.:..
CCDS32 DYSFAQFRYLQRLLLVHGRWSYFRMCKFLCYFFYKNFAFTLVHFWFGFFCGFSAQTVYDQ
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CCDS32 WFITLFNIVYTSLPVLAMGIFDQDVSDQNSVDCPQLYKPGQLNLLFNKRKFFICVLHGIY
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::..::::: ::. ...:.::. .::::::::.:..:::.:. ::.::::::::.:
CCDS32 TSLVLFFIPYGAFYNVAGEDGQHIADYQSFAVTMATSLVIVVSVQIALDTSYWTFINHVF
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CCDS32 IWGSIAIYFSILFTMHSNGIFGIFPNQFPFVGNARHSLTQKCIWLVILLTTVASVMPVVA
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pF1KE2 IRFLSMTIWPSESDKIQKHRKRLKAEEQWQRRQQVFRRGVSTRRSAYAFSHQRGYADLIS
.:::.. ..:. ::.:.. .: : . . :. ::. :.:::.:::.::.::..::.
CCDS32 FRFLKVDLYPTLSDQIRRWQKAQKKARPPSSRRPRTRRS-SSRRSGYAFAHQEGYGELIT
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CCDS32 SGKNMRAKNPPPTSGLEKTHYNSTSWIENLCKKTTDTVSSFSQDKTVKL
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CCDS41 FSGTLYWKENKFPLSNQNMLLRGCVLRNTEWCFGLVIFAGPDTKLMQNSGRTKFKRTSID
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CCDS47 DQEEVRTIFINQPQL----TKFCNNHVSTAKYNIITFLPRFLYSQFRRAANSFFLFIALL
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CCDS47 DWYLNLNYGGASNF-G-LNFLTFIILFNNLIPISLLVTLEVVKFTQAYFINWDLDMHYEP
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CCDS47 EWRAVYQRASTSVQNRLLKLEESYELIEKNLQLLGATAIEDKLQDQVPETIETLMKADIK
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CCDS47 IWILTGDKQETAINIGHSCKLLKKNMGMIV---IN---EGSLDGTRE---TLSRHCTTLG
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CCDS47 DALRKEN-DFALIIDG----------KT-------LKYALTFGVRQY-------------
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CCDS47 -----FLDLALSCKAVICCRVSPLQKSEVVEMVKKQVKVVTLAIGDGANDVSMIQTAHVG
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CCDS47 VGISGNEGLQAANSSDYSIAQFKYLKNLLMIHGAWNYNRVSKCILYCFYKNIVLYIIEIW
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..: ::.:.: .: : : ::::..:..: : .:..... . :..: :: ..: :
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:: : :.: :.:.. :.:::..:: : .. . ::: .. . . .:::: ..
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::.:::::. . ..:.:::::. ..: ..:. . .: : ...: :. . . .:.
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... .. :: :. . .. : . . :..:.
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::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]