Result of FASTA (omim) for
pF1KE2522
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2522, 924 aa
1>>>pF1KE2522 924 - 924 aa - 924 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.4563+/-0.000425; mu= -11.6414+/- 0.026
mean_var=424.8597+/-86.451, 0's: 0 Z-trim(123.4): 22 B-trim: 0 in 0/56
Lambda= 0.062223
statistics sampled from 43081 (43104) to 43081 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.788), E-opt: 0.2 (0.505), width: 16
Scan time: 13.480
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001303985 (OMIM: 612205) autophagy-related prot ( 924) 6384 588.0 7.1e-167
XP_011514367 (OMIM: 612205) PREDICTED: autophagy-r ( 924) 6384 588.0 7.1e-167
XP_011514368 (OMIM: 612205) PREDICTED: autophagy-r ( 924) 6384 588.0 7.1e-167
NP_001070666 (OMIM: 612204) autophagy-related prot ( 839) 2111 204.4 1.9e-51
NP_076990 (OMIM: 612204) autophagy-related protein ( 839) 2111 204.4 1.9e-51
>>NP_001303985 (OMIM: 612205) autophagy-related protein (924 aa)
initn: 6384 init1: 6384 opt: 6384 Z-score: 3116.9 bits: 588.0 E(85289): 7.1e-167
Smith-Waterman score: 6384; 100.0% identity (100.0% similar) in 924 aa overlap (1-924:1-924)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MVSRMGWGGRRRRLGRWGDLGPGSVPLLPMPLPPPPPPSCRGPGGGRISIFSLSPAPHTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MVSRMGWGGRRRRLGRWGDLGPGSVPLLPMPLPPPPPPSCRGPGGGRISIFSLSPAPHTR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SSPSSFSPPTAGPPCSVLQGTGASQSCHSALPIPATPPTQAQPAMTPASASPSWGSHSTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSPSSFSPPTAGPPCSVLQGTGASQSCHSALPIPATPPTQAQPAMTPASASPSWGSHSTP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PLAPATPTPSQQCPQDSPGLRVGPLIPEQDYERLEDCDPEGSQDSPIHGEEQQPLLHVPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLAPATPTPSQQCPQDSPGLRVGPLIPEQDYERLEDCDPEGSQDSPIHGEEQQPLLHVPE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 GLRGSWHHIQNLDSFFTKIYSYHQRNGFACILLEDVFQLGQFIFIVTFTTFLLRCVDYNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLRGSWHHIQNLDSFFTKIYSYHQRNGFACILLEDVFQLGQFIFIVTFTTFLLRCVDYNV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 LFANQPSNHTRPGPFHSKVTLSDAILPSAQCAERIRSSPLLVLLLVLAAGFWLVQLLRSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LFANQPSNHTRPGPFHSKVTLSDAILPSAQCAERIRSSPLLVLLLVLAAGFWLVQLLRSV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 CNLFSYWDIQVFYREALHIPPEELSSVPWAEVQSRLLALQRSGGLCVQPRPLTELDIHHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CNLFSYWDIQVFYREALHIPPEELSSVPWAEVQSRLLALQRSGGLCVQPRPLTELDIHHR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 ILRYTNYQVALANKGLLPARCPLPWGGSAAFLSRGLALNVDLLLFRGPFSLFRGGWELPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ILRYTNYQVALANKGLLPARCPLPWGGSAAFLSRGLALNVDLLLFRGPFSLFRGGWELPH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 AYKRSDQRGALAARWGRTVLLLAALNLALSPLVLAWQVLHVFYSHVELLRREPGALGARG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AYKRSDQRGALAARWGRTVLLLAALNLALSPLVLAWQVLHVFYSHVELLRREPGALGARG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 WSRLARLQLRHFNELPHELRARLARAYRPAAAFLRTAAPPAPLRTLLARQLVFFAGALFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WSRLARLQLRHFNELPHELRARLARAYRPAAAFLRTAAPPAPLRTLLARQLVFFAGALFA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 ALLVLTVYDEDVLAVEHVLTAMTALGVTATVARSFIPEEQCQGRAPQLLLQTALAHMHYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALLVLTVYDEDVLAVEHVLTAMTALGVTATVARSFIPEEQCQGRAPQLLLQTALAHMHYL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 PEEPGPGGRDRAYRQMAQLLQYRAVSLLEELLSPLLTPLFLLFWFRPRALEIIDFFHHFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PEEPGPGGRDRAYRQMAQLLQYRAVSLLEELLSPLLTPLFLLFWFRPRALEIIDFFHHFT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 VDVAGVGDICSFALMDVKRHGHPQWLSAGQTEASLSQRAEDGKTELSLMRFSLAHPLWRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VDVAGVGDICSFALMDVKRHGHPQWLSAGQTEASLSQRAEDGKTELSLMRFSLAHPLWRP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 PGHSSKFLGHLWGRVQQDAAAWGATSARGPSTPGVLSNCTSPLPEAFLANLFVHPLLPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PGHSSKFLGHLWGRVQQDAAAWGATSARGPSTPGVLSNCTSPLPEAFLANLFVHPLLPPR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 DLSPTAPCPAAATASLLASISRIAQDPSSVSPGGTGGQKLAQLPELASAEMSLHVIYLHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLSPTAPCPAAATASLLASISRIAQDPSSVSPGGTGGQKLAQLPELASAEMSLHVIYLHQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 LHQQQQQQEPWGEAAASILSRPCSSPSQPPSPDEEKPSWSSDGSSPASSPRQQWGTQKAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LHQQQQQQEPWGEAAASILSRPCSSPSQPPSPDEEKPSWSSDGSSPASSPRQQWGTQKAR
850 860 870 880 890 900
910 920
pF1KE2 NLFPGGFQVTTDTQKEPDRASCTD
::::::::::::::::::::::::
NP_001 NLFPGGFQVTTDTQKEPDRASCTD
910 920
>>XP_011514367 (OMIM: 612205) PREDICTED: autophagy-relat (924 aa)
initn: 6384 init1: 6384 opt: 6384 Z-score: 3116.9 bits: 588.0 E(85289): 7.1e-167
Smith-Waterman score: 6384; 100.0% identity (100.0% similar) in 924 aa overlap (1-924:1-924)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MVSRMGWGGRRRRLGRWGDLGPGSVPLLPMPLPPPPPPSCRGPGGGRISIFSLSPAPHTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MVSRMGWGGRRRRLGRWGDLGPGSVPLLPMPLPPPPPPSCRGPGGGRISIFSLSPAPHTR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SSPSSFSPPTAGPPCSVLQGTGASQSCHSALPIPATPPTQAQPAMTPASASPSWGSHSTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSPSSFSPPTAGPPCSVLQGTGASQSCHSALPIPATPPTQAQPAMTPASASPSWGSHSTP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PLAPATPTPSQQCPQDSPGLRVGPLIPEQDYERLEDCDPEGSQDSPIHGEEQQPLLHVPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PLAPATPTPSQQCPQDSPGLRVGPLIPEQDYERLEDCDPEGSQDSPIHGEEQQPLLHVPE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 GLRGSWHHIQNLDSFFTKIYSYHQRNGFACILLEDVFQLGQFIFIVTFTTFLLRCVDYNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GLRGSWHHIQNLDSFFTKIYSYHQRNGFACILLEDVFQLGQFIFIVTFTTFLLRCVDYNV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 LFANQPSNHTRPGPFHSKVTLSDAILPSAQCAERIRSSPLLVLLLVLAAGFWLVQLLRSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LFANQPSNHTRPGPFHSKVTLSDAILPSAQCAERIRSSPLLVLLLVLAAGFWLVQLLRSV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 CNLFSYWDIQVFYREALHIPPEELSSVPWAEVQSRLLALQRSGGLCVQPRPLTELDIHHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CNLFSYWDIQVFYREALHIPPEELSSVPWAEVQSRLLALQRSGGLCVQPRPLTELDIHHR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 ILRYTNYQVALANKGLLPARCPLPWGGSAAFLSRGLALNVDLLLFRGPFSLFRGGWELPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ILRYTNYQVALANKGLLPARCPLPWGGSAAFLSRGLALNVDLLLFRGPFSLFRGGWELPH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 AYKRSDQRGALAARWGRTVLLLAALNLALSPLVLAWQVLHVFYSHVELLRREPGALGARG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AYKRSDQRGALAARWGRTVLLLAALNLALSPLVLAWQVLHVFYSHVELLRREPGALGARG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 WSRLARLQLRHFNELPHELRARLARAYRPAAAFLRTAAPPAPLRTLLARQLVFFAGALFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 WSRLARLQLRHFNELPHELRARLARAYRPAAAFLRTAAPPAPLRTLLARQLVFFAGALFA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 ALLVLTVYDEDVLAVEHVLTAMTALGVTATVARSFIPEEQCQGRAPQLLLQTALAHMHYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ALLVLTVYDEDVLAVEHVLTAMTALGVTATVARSFIPEEQCQGRAPQLLLQTALAHMHYL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 PEEPGPGGRDRAYRQMAQLLQYRAVSLLEELLSPLLTPLFLLFWFRPRALEIIDFFHHFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PEEPGPGGRDRAYRQMAQLLQYRAVSLLEELLSPLLTPLFLLFWFRPRALEIIDFFHHFT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 VDVAGVGDICSFALMDVKRHGHPQWLSAGQTEASLSQRAEDGKTELSLMRFSLAHPLWRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VDVAGVGDICSFALMDVKRHGHPQWLSAGQTEASLSQRAEDGKTELSLMRFSLAHPLWRP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 PGHSSKFLGHLWGRVQQDAAAWGATSARGPSTPGVLSNCTSPLPEAFLANLFVHPLLPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PGHSSKFLGHLWGRVQQDAAAWGATSARGPSTPGVLSNCTSPLPEAFLANLFVHPLLPPR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 DLSPTAPCPAAATASLLASISRIAQDPSSVSPGGTGGQKLAQLPELASAEMSLHVIYLHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DLSPTAPCPAAATASLLASISRIAQDPSSVSPGGTGGQKLAQLPELASAEMSLHVIYLHQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 LHQQQQQQEPWGEAAASILSRPCSSPSQPPSPDEEKPSWSSDGSSPASSPRQQWGTQKAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LHQQQQQQEPWGEAAASILSRPCSSPSQPPSPDEEKPSWSSDGSSPASSPRQQWGTQKAR
850 860 870 880 890 900
910 920
pF1KE2 NLFPGGFQVTTDTQKEPDRASCTD
::::::::::::::::::::::::
XP_011 NLFPGGFQVTTDTQKEPDRASCTD
910 920
>>XP_011514368 (OMIM: 612205) PREDICTED: autophagy-relat (924 aa)
initn: 6384 init1: 6384 opt: 6384 Z-score: 3116.9 bits: 588.0 E(85289): 7.1e-167
Smith-Waterman score: 6384; 100.0% identity (100.0% similar) in 924 aa overlap (1-924:1-924)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MVSRMGWGGRRRRLGRWGDLGPGSVPLLPMPLPPPPPPSCRGPGGGRISIFSLSPAPHTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MVSRMGWGGRRRRLGRWGDLGPGSVPLLPMPLPPPPPPSCRGPGGGRISIFSLSPAPHTR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SSPSSFSPPTAGPPCSVLQGTGASQSCHSALPIPATPPTQAQPAMTPASASPSWGSHSTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSPSSFSPPTAGPPCSVLQGTGASQSCHSALPIPATPPTQAQPAMTPASASPSWGSHSTP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PLAPATPTPSQQCPQDSPGLRVGPLIPEQDYERLEDCDPEGSQDSPIHGEEQQPLLHVPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PLAPATPTPSQQCPQDSPGLRVGPLIPEQDYERLEDCDPEGSQDSPIHGEEQQPLLHVPE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 GLRGSWHHIQNLDSFFTKIYSYHQRNGFACILLEDVFQLGQFIFIVTFTTFLLRCVDYNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GLRGSWHHIQNLDSFFTKIYSYHQRNGFACILLEDVFQLGQFIFIVTFTTFLLRCVDYNV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 LFANQPSNHTRPGPFHSKVTLSDAILPSAQCAERIRSSPLLVLLLVLAAGFWLVQLLRSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LFANQPSNHTRPGPFHSKVTLSDAILPSAQCAERIRSSPLLVLLLVLAAGFWLVQLLRSV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 CNLFSYWDIQVFYREALHIPPEELSSVPWAEVQSRLLALQRSGGLCVQPRPLTELDIHHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CNLFSYWDIQVFYREALHIPPEELSSVPWAEVQSRLLALQRSGGLCVQPRPLTELDIHHR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 ILRYTNYQVALANKGLLPARCPLPWGGSAAFLSRGLALNVDLLLFRGPFSLFRGGWELPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ILRYTNYQVALANKGLLPARCPLPWGGSAAFLSRGLALNVDLLLFRGPFSLFRGGWELPH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 AYKRSDQRGALAARWGRTVLLLAALNLALSPLVLAWQVLHVFYSHVELLRREPGALGARG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AYKRSDQRGALAARWGRTVLLLAALNLALSPLVLAWQVLHVFYSHVELLRREPGALGARG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 WSRLARLQLRHFNELPHELRARLARAYRPAAAFLRTAAPPAPLRTLLARQLVFFAGALFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 WSRLARLQLRHFNELPHELRARLARAYRPAAAFLRTAAPPAPLRTLLARQLVFFAGALFA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 ALLVLTVYDEDVLAVEHVLTAMTALGVTATVARSFIPEEQCQGRAPQLLLQTALAHMHYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ALLVLTVYDEDVLAVEHVLTAMTALGVTATVARSFIPEEQCQGRAPQLLLQTALAHMHYL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 PEEPGPGGRDRAYRQMAQLLQYRAVSLLEELLSPLLTPLFLLFWFRPRALEIIDFFHHFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PEEPGPGGRDRAYRQMAQLLQYRAVSLLEELLSPLLTPLFLLFWFRPRALEIIDFFHHFT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 VDVAGVGDICSFALMDVKRHGHPQWLSAGQTEASLSQRAEDGKTELSLMRFSLAHPLWRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VDVAGVGDICSFALMDVKRHGHPQWLSAGQTEASLSQRAEDGKTELSLMRFSLAHPLWRP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 PGHSSKFLGHLWGRVQQDAAAWGATSARGPSTPGVLSNCTSPLPEAFLANLFVHPLLPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PGHSSKFLGHLWGRVQQDAAAWGATSARGPSTPGVLSNCTSPLPEAFLANLFVHPLLPPR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 DLSPTAPCPAAATASLLASISRIAQDPSSVSPGGTGGQKLAQLPELASAEMSLHVIYLHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DLSPTAPCPAAATASLLASISRIAQDPSSVSPGGTGGQKLAQLPELASAEMSLHVIYLHQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 LHQQQQQQEPWGEAAASILSRPCSSPSQPPSPDEEKPSWSSDGSSPASSPRQQWGTQKAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LHQQQQQQEPWGEAAASILSRPCSSPSQPPSPDEEKPSWSSDGSSPASSPRQQWGTQKAR
850 860 870 880 890 900
910 920
pF1KE2 NLFPGGFQVTTDTQKEPDRASCTD
::::::::::::::::::::::::
XP_011 NLFPGGFQVTTDTQKEPDRASCTD
910 920
>>NP_001070666 (OMIM: 612204) autophagy-related protein (839 aa)
initn: 1372 init1: 1197 opt: 2111 Z-score: 1044.4 bits: 204.4 E(85289): 1.9e-51
Smith-Waterman score: 2243; 47.5% identity (70.1% similar) in 798 aa overlap (148-908:5-782)
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 STPPLAPATPTPSQQCPQDSPGLRVGPLIPEQDYERLEDCDPEGSQDSPIHGEEQQPLLH
. .:.::: . .::: :::. :.:
NP_001 MAQFDTEYQRLE----ASYSDSP-PGEEDL-LVH
10 20
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 VPEGLRGSWHHIQNLDSFFTKIYSYHQRNGFACILLEDVFQLGQFIFIVTFTTFLLRCVD
: :: .. ::::.::: ::...:. ::.:::.:.:. ..:.: ::.:.:.:::::. :::
NP_001 VAEGSKSPWHHIENLDLFFSRVYNLHQKNGFTCMLIGEIFELMQFLFVVAFTTFLVSCVD
30 40 50 60 70 80
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 YNVLFANQPSNHTRPGPFHSKVTLSDAILPSAQCAERIRSSPLLVLLLVLAAGFWLVQLL
:..::::. ::. :::: ::.::. :. ::. . :. .::.:. ::. .:.
NP_001 YDILFANKMVNHSLHPTEPVKVTLPDAFLPAQVCSARIQENGSLITILVIAGVFWIHRLI
90 100 110 120 130 140
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 RSVCNLFSYWDIQVFYREALHIPPEELSSVPWAEVQSRLLALQRSGGLCVQPRPLTELDI
. . :. ::.:. :: .::.:: : : :::.:.. :. .:.. : ::::::
NP_001 KFIYNICCYWEIHSFYLHALRIPMSALPYCTWQEVQARIVQTQKEHQICIHKRELTELDI
150 160 170 180 190 200
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 HHRILRYTNYQVALANKGLLPARCPLPWGGSAAFLSRGLALNVDLLLFRGPFSLFRGGWE
.:::::. ::.:::.::.::: : :: : :.:..::: : .:.:: :: ::: . :
NP_001 YHRILRFQNYMVALVNKSLLPLRFRLPGLGEAVFFTRGLKYNFELILFWGPGSLFLNEWS
210 220 230 240 250 260
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]