Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2522
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2522, 924 aa
1>>>pF1KE2522 924 - 924 aa - 924 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.8802+/-0.00107; mu= -8.1387+/- 0.064
mean_var=381.4343+/-77.154, 0's: 0 Z-trim(115.7): 8 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.065670
statistics sampled from 16241 (16248) to 16241 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.784), E-opt: 0.2 (0.499), width: 16
Scan time: 5.090
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS83242.1 ATG9B gene_id:285973|Hs108|chr7 ( 924) 6384 619.5 9.3e-177
CCDS42820.1 ATG9A gene_id:79065|Hs108|chr2 ( 839) 2111 214.6 6.4e-55
>>CCDS83242.1 ATG9B gene_id:285973|Hs108|chr7 (924 aa)
initn: 6384 init1: 6384 opt: 6384 Z-score: 3286.8 bits: 619.5 E(32554): 9.3e-177
Smith-Waterman score: 6384; 100.0% identity (100.0% similar) in 924 aa overlap (1-924:1-924)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MVSRMGWGGRRRRLGRWGDLGPGSVPLLPMPLPPPPPPSCRGPGGGRISIFSLSPAPHTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MVSRMGWGGRRRRLGRWGDLGPGSVPLLPMPLPPPPPPSCRGPGGGRISIFSLSPAPHTR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SSPSSFSPPTAGPPCSVLQGTGASQSCHSALPIPATPPTQAQPAMTPASASPSWGSHSTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SSPSSFSPPTAGPPCSVLQGTGASQSCHSALPIPATPPTQAQPAMTPASASPSWGSHSTP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PLAPATPTPSQQCPQDSPGLRVGPLIPEQDYERLEDCDPEGSQDSPIHGEEQQPLLHVPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PLAPATPTPSQQCPQDSPGLRVGPLIPEQDYERLEDCDPEGSQDSPIHGEEQQPLLHVPE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 GLRGSWHHIQNLDSFFTKIYSYHQRNGFACILLEDVFQLGQFIFIVTFTTFLLRCVDYNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GLRGSWHHIQNLDSFFTKIYSYHQRNGFACILLEDVFQLGQFIFIVTFTTFLLRCVDYNV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 LFANQPSNHTRPGPFHSKVTLSDAILPSAQCAERIRSSPLLVLLLVLAAGFWLVQLLRSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LFANQPSNHTRPGPFHSKVTLSDAILPSAQCAERIRSSPLLVLLLVLAAGFWLVQLLRSV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 CNLFSYWDIQVFYREALHIPPEELSSVPWAEVQSRLLALQRSGGLCVQPRPLTELDIHHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 CNLFSYWDIQVFYREALHIPPEELSSVPWAEVQSRLLALQRSGGLCVQPRPLTELDIHHR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 ILRYTNYQVALANKGLLPARCPLPWGGSAAFLSRGLALNVDLLLFRGPFSLFRGGWELPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ILRYTNYQVALANKGLLPARCPLPWGGSAAFLSRGLALNVDLLLFRGPFSLFRGGWELPH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 AYKRSDQRGALAARWGRTVLLLAALNLALSPLVLAWQVLHVFYSHVELLRREPGALGARG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 AYKRSDQRGALAARWGRTVLLLAALNLALSPLVLAWQVLHVFYSHVELLRREPGALGARG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 WSRLARLQLRHFNELPHELRARLARAYRPAAAFLRTAAPPAPLRTLLARQLVFFAGALFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 WSRLARLQLRHFNELPHELRARLARAYRPAAAFLRTAAPPAPLRTLLARQLVFFAGALFA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 ALLVLTVYDEDVLAVEHVLTAMTALGVTATVARSFIPEEQCQGRAPQLLLQTALAHMHYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ALLVLTVYDEDVLAVEHVLTAMTALGVTATVARSFIPEEQCQGRAPQLLLQTALAHMHYL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 PEEPGPGGRDRAYRQMAQLLQYRAVSLLEELLSPLLTPLFLLFWFRPRALEIIDFFHHFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PEEPGPGGRDRAYRQMAQLLQYRAVSLLEELLSPLLTPLFLLFWFRPRALEIIDFFHHFT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 VDVAGVGDICSFALMDVKRHGHPQWLSAGQTEASLSQRAEDGKTELSLMRFSLAHPLWRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 VDVAGVGDICSFALMDVKRHGHPQWLSAGQTEASLSQRAEDGKTELSLMRFSLAHPLWRP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 PGHSSKFLGHLWGRVQQDAAAWGATSARGPSTPGVLSNCTSPLPEAFLANLFVHPLLPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PGHSSKFLGHLWGRVQQDAAAWGATSARGPSTPGVLSNCTSPLPEAFLANLFVHPLLPPR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 DLSPTAPCPAAATASLLASISRIAQDPSSVSPGGTGGQKLAQLPELASAEMSLHVIYLHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 DLSPTAPCPAAATASLLASISRIAQDPSSVSPGGTGGQKLAQLPELASAEMSLHVIYLHQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 LHQQQQQQEPWGEAAASILSRPCSSPSQPPSPDEEKPSWSSDGSSPASSPRQQWGTQKAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LHQQQQQQEPWGEAAASILSRPCSSPSQPPSPDEEKPSWSSDGSSPASSPRQQWGTQKAR
850 860 870 880 890 900
910 920
pF1KE2 NLFPGGFQVTTDTQKEPDRASCTD
::::::::::::::::::::::::
CCDS83 NLFPGGFQVTTDTQKEPDRASCTD
910 920
>>CCDS42820.1 ATG9A gene_id:79065|Hs108|chr2 (839 aa)
initn: 1372 init1: 1197 opt: 2111 Z-score: 1099.5 bits: 214.6 E(32554): 6.4e-55
Smith-Waterman score: 2243; 47.5% identity (70.1% similar) in 798 aa overlap (148-908:5-782)
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 STPPLAPATPTPSQQCPQDSPGLRVGPLIPEQDYERLEDCDPEGSQDSPIHGEEQQPLLH
. .:.::: . .::: :::. :.:
CCDS42 MAQFDTEYQRLE----ASYSDSP-PGEEDL-LVH
10 20
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 VPEGLRGSWHHIQNLDSFFTKIYSYHQRNGFACILLEDVFQLGQFIFIVTFTTFLLRCVD
: :: .. ::::.::: ::...:. ::.:::.:.:. ..:.: ::.:.:.:::::. :::
CCDS42 VAEGSKSPWHHIENLDLFFSRVYNLHQKNGFTCMLIGEIFELMQFLFVVAFTTFLVSCVD
30 40 50 60 70 80
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 YNVLFANQPSNHTRPGPFHSKVTLSDAILPSAQCAERIRSSPLLVLLLVLAAGFWLVQLL
:..::::. ::. :::: ::.::. :. ::. . :. .::.:. ::. .:.
CCDS42 YDILFANKMVNHSLHPTEPVKVTLPDAFLPAQVCSARIQENGSLITILVIAGVFWIHRLI
90 100 110 120 130 140
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 RSVCNLFSYWDIQVFYREALHIPPEELSSVPWAEVQSRLLALQRSGGLCVQPRPLTELDI
. . :. ::.:. :: .::.:: : : :::.:.. :. .:.. : ::::::
CCDS42 KFIYNICCYWEIHSFYLHALRIPMSALPYCTWQEVQARIVQTQKEHQICIHKRELTELDI
150 160 170 180 190 200
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 HHRILRYTNYQVALANKGLLPARCPLPWGGSAAFLSRGLALNVDLLLFRGPFSLFRGGWE
.:::::. ::.:::.::.::: : :: : :.:..::: : .:.:: :: ::: . :
CCDS42 YHRILRFQNYMVALVNKSLLPLRFRLPGLGEAVFFTRGLKYNFELILFWGPGSLFLNEWS
210 220 230 240 250 260
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 LPHAYKRSDQRGALAARWGRTVLLLAALNLALSPLVLAWQVLHVFYSHVELLRREPGALG
: :::. :: :: : . .: .. :. : ::.: ::.:..:.:..:.:.:::::::
CCDS42 LKAEYKRGGQRLELAQRLSNRILWIGIANFLLCPLILIWQILYAFFSYAEVLKREPGALG
270 280 290 300 310 320
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 ARGWSRLARLQLRHFNELPHELRARLARAYRPAAAFLRTAAPPAPLRTLLARQLVFFAGA
:: :: .: ::::::: :::..:: :.:.::. .. .:: ::::.. .::::.
CCDS42 ARCWSLYGRCYLRHFNELEHELQSRLNRGYKPASKYMNCFL--SPLLTLLAKNGAFFAGS
330 340 350 360 370 380
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 LFAALLVLTVYDEDVLAVEHVLTAMTALGVTATVARSFIPEEQCQGRAPQLLLQTALAHM
..:.:..::.:::::::::::::..: ::::.:: :::::. : . :. ::.. :::.
CCDS42 ILAVLIALTIYDEDVLAVEHVLTTVTLLGVTVTVCRSFIPD-QHMVFCPEQLLRVILAHI
390 400 410 420 430 440
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 HYLPEE-PGPGGRDRAYRQMAQLLQYRAVSLLEELLSPLLTPLFLLFWFRPRALEIIDFF
::.:.. : . :... ..:::.::.:: .:::::::..:::.:.: .:::::::::::
CCDS42 HYMPDHWQGNAHRSQTRDEFAQLFQYKAVFILEELLSPIVTPLILIFCLRPRALEIIDFF
450 460 470 480 490 500
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 HHFTVDVAGVGDICSFALMDVKRHGHPQWLSAGQTEASLSQRAEDGKTELSLMRFSLAHP
..:::.:.:::: :::: :::..:::::::::::::::. :.:::::::::::.:....:
CCDS42 RNFTVEVVGVGDTCSFAQMDVRQHGHPQWLSAGQTEASVYQQAEDGKTELSLMHFAITNP
510 520 530 540 550 560
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 LWRPPGHSSKFLGHLWGRVQQDAAAWGATSARGPSTP------GVLSNCTSPLPEAFLAN
:.:: .:. ::: : .::.:.:: :. :.: : .. : . : ...::
CCDS42 GWQPPRESTAFLGFLKEQVQRDGAA--ASLAQGGLLPENALFTSIQSLQSESEPLSLIAN
570 580 590 600 610 620
780 790 800
pF1KE2 LFVH------PLLPPRDL----------------SPTAP--CPAAATASLLASISRIAQD
. . :: :::: :: : :.. . : ... . :.
CCDS42 VVAGSSCRGPPL--PRDLQGSRHRAEVASALRSFSPLQPGQAPTGRAHSTMTGSGVDART
630 640 650 660 670 680
810 820 830 840 850 860
pF1KE2 PSSVSPGGTGGQKLAQLPELASAEMSLHVIYLHQLHQQQQQQEPWGEAAASILSRPCSSP
:: : : . : : ::.:::::..:.::::.:: : :: . : :.
CCDS42 ASSGSSVWEGQLQSLVLSEYASTEMSLHALYMHQLHKQQAQAEP----ERHVWHRRESDE
690 700 710 720 730
870 880 890 900 910 920
pF1KE2 SQPPSPDE-----EKP-SWSSDGSSPASSPRQQWGTQKARNLFPGGFQVTTDTQKEPDRA
: .::: . : : ..: : ..:: :. .. : ::::
CCDS42 SGESAPDEGGEGARAPQSIPRSASYPCAAPRP--GAPETTALH-GGFQRRYGGITDPGTV
740 750 760 770 780 790
pF1KE2 SCTD
CCDS42 PRVPSHFSRLPLGGWAEDGQSASRHPEPVPEEGSEDELPPQVHKV
800 810 820 830
924 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 03:20:51 2016 done: Tue Nov 8 03:20:51 2016
Total Scan time: 5.090 Total Display time: 0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]