Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2468
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2468, 568 aa
1>>>pF1KE2468 568 - 568 aa - 568 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6479+/-0.000919; mu= 16.3672+/- 0.055
mean_var=62.2550+/-12.910, 0's: 0 Z-trim(105.0): 26 B-trim: 268 in 1/49
Lambda= 0.162550
statistics sampled from 8176 (8194) to 8176 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.616), E-opt: 0.2 (0.252), width: 16
Scan time: 2.940
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11079.1 SLC13A5 gene_id:284111|Hs108|chr17 ( 568) 3767 892.3 0
CCDS67136.1 SLC13A5 gene_id:284111|Hs108|chr17 ( 525) 3310 785.1 0
CCDS45593.1 SLC13A5 gene_id:284111|Hs108|chr17 ( 522) 3166 751.3 6.5e-217
CCDS67137.1 SLC13A5 gene_id:284111|Hs108|chr17 ( 551) 2860 679.6 2.7e-195
CCDS11231.1 SLC13A2 gene_id:9058|Hs108|chr17 ( 592) 1469 353.4 4.6e-97
CCDS54098.1 SLC13A2 gene_id:9058|Hs108|chr17 ( 641) 1469 353.4 4.9e-97
CCDS42886.1 SLC13A3 gene_id:64849|Hs108|chr20 ( 555) 1259 304.1 2.9e-82
CCDS13400.1 SLC13A3 gene_id:64849|Hs108|chr20 ( 602) 1259 304.1 3.1e-82
CCDS5840.1 SLC13A4 gene_id:26266|Hs108|chr7 ( 626) 1184 286.6 6.3e-77
CCDS5786.1 SLC13A1 gene_id:6561|Hs108|chr7 ( 595) 1162 281.4 2.2e-75
CCDS54470.1 SLC13A3 gene_id:64849|Hs108|chr20 ( 552) 961 234.2 3.1e-61
CCDS54469.1 SLC13A3 gene_id:64849|Hs108|chr20 ( 520) 776 190.9 3.4e-48
>>CCDS11079.1 SLC13A5 gene_id:284111|Hs108|chr17 (568 aa)
initn: 3767 init1: 3767 opt: 3767 Z-score: 4768.9 bits: 892.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3767; 100.0% identity (100.0% similar) in 568 aa overlap (1-568:1-568)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASALSYVSKFKSFVILFVTPLLLLPLVILMPAKFVRCAYVIILMAIYWCTEVIPLAVTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MASALSYVSKFKSFVILFVTPLLLLPLVILMPAKFVRCAYVIILMAIYWCTEVIPLAVTS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LMPVLLFPLFQILDSRQVCVQYMKDTNMLFLGGLIVAVAVERWNLHKRIALRTLLWVGAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LMPVLLFPLFQILDSRQVCVQYMKDTNMLFLGGLIVAVAVERWNLHKRIALRTLLWVGAK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PARLMLGFMGVTALLSMWISNTATTAMMVPIVEAILQQMEATSAATEAGLELVDKGKAKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PARLMLGFMGVTALLSMWISNTATTAMMVPIVEAILQQMEATSAATEAGLELVDKGKAKE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LPGSQVIFEGPTLGQQEDQERKRLCKAMTLCICYAASIGGTATLTGTGPNVVLLGQMNEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LPGSQVIFEGPTLGQQEDQERKRLCKAMTLCICYAASIGGTATLTGTGPNVVLLGQMNEL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 FPDSKDLVNFASWFAFAFPNMLVMLLFAWLWLQFVYMRFNFKKSWGCGLESKKNEKAALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FPDSKDLVNFASWFAFAFPNMLVMLLFAWLWLQFVYMRFNFKKSWGCGLESKKNEKAALK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VLQEEYRKLGPLSFAEINVLICFFLLVILWFSRDPGFMPGWLTVAWVEGETKYVSDATVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VLQEEYRKLGPLSFAEINVLICFFLLVILWFSRDPGFMPGWLTVAWVEGETKYVSDATVA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 IFVATLLFIVPSQKPKFNFRSQTEEERKTPFYPPPLLDWKVTQEKVPWGIVLLLGGGFAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IFVATLLFIVPSQKPKFNFRSQTEEERKTPFYPPPLLDWKVTQEKVPWGIVLLLGGGFAL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 AKGSEASGLSVWMGKQMEPLHAVPPAAITLILSLLVAVFTECTSNVATTTLFLPIFASMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AKGSEASGLSVWMGKQMEPLHAVPPAAITLILSLLVAVFTECTSNVATTTLFLPIFASMS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 RSIGLNPLYIMLPCTLSASFAFMLPVATPPNAIVFTYGHLKVADMVKTGVIMNIIGVFCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RSIGLNPLYIMLPCTLSASFAFMLPVATPPNAIVFTYGHLKVADMVKTGVIMNIIGVFCV
490 500 510 520 530 540
550 560
pF1KE2 FLAVNTWGRAIFDLDHFPDWANVTHIET
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FLAVNTWGRAIFDLDHFPDWANVTHIET
550 560
>>CCDS67136.1 SLC13A5 gene_id:284111|Hs108|chr17 (525 aa)
initn: 3282 init1: 3282 opt: 3310 Z-score: 4190.3 bits: 785.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3384; 92.4% identity (92.4% similar) in 568 aa overlap (1-568:1-525)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASALSYVSKFKSFVILFVTPLLLLPLVILMPAKFVRCAYVIILMAIYWCTEVIPLAVTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 MASALSYVSKFKSFVILFVTPLLLLPLVILMPAK--------------------------
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LMPVLLFPLFQILDSRQVCVQYMKDTNMLFLGGLIVAVAVERWNLHKRIALRTLLWVGAK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 -----------------VCVQYMKDTNMLFLGGLIVAVAVERWNLHKRIALRTLLWVGAK
40 50 60 70
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PARLMLGFMGVTALLSMWISNTATTAMMVPIVEAILQQMEATSAATEAGLELVDKGKAKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 PARLMLGFMGVTALLSMWISNTATTAMMVPIVEAILQQMEATSAATEAGLELVDKGKAKE
80 90 100 110 120 130
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LPGSQVIFEGPTLGQQEDQERKRLCKAMTLCICYAASIGGTATLTGTGPNVVLLGQMNEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 LPGSQVIFEGPTLGQQEDQERKRLCKAMTLCICYAASIGGTATLTGTGPNVVLLGQMNEL
140 150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 FPDSKDLVNFASWFAFAFPNMLVMLLFAWLWLQFVYMRFNFKKSWGCGLESKKNEKAALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 FPDSKDLVNFASWFAFAFPNMLVMLLFAWLWLQFVYMRFNFKKSWGCGLESKKNEKAALK
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VLQEEYRKLGPLSFAEINVLICFFLLVILWFSRDPGFMPGWLTVAWVEGETKYVSDATVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 VLQEEYRKLGPLSFAEINVLICFFLLVILWFSRDPGFMPGWLTVAWVEGETKYVSDATVA
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 IFVATLLFIVPSQKPKFNFRSQTEEERKTPFYPPPLLDWKVTQEKVPWGIVLLLGGGFAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 IFVATLLFIVPSQKPKFNFRSQTEEERKTPFYPPPLLDWKVTQEKVPWGIVLLLGGGFAL
320 330 340 350 360 370
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 AKGSEASGLSVWMGKQMEPLHAVPPAAITLILSLLVAVFTECTSNVATTTLFLPIFASMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 AKGSEASGLSVWMGKQMEPLHAVPPAAITLILSLLVAVFTECTSNVATTTLFLPIFASMS
380 390 400 410 420 430
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 RSIGLNPLYIMLPCTLSASFAFMLPVATPPNAIVFTYGHLKVADMVKTGVIMNIIGVFCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 RSIGLNPLYIMLPCTLSASFAFMLPVATPPNAIVFTYGHLKVADMVKTGVIMNIIGVFCV
440 450 460 470 480 490
550 560
pF1KE2 FLAVNTWGRAIFDLDHFPDWANVTHIET
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 FLAVNTWGRAIFDLDHFPDWANVTHIET
500 510 520
>>CCDS45593.1 SLC13A5 gene_id:284111|Hs108|chr17 (522 aa)
initn: 3218 init1: 3165 opt: 3166 Z-score: 4007.8 bits: 751.3 E(32554): 6.5e-217
Smith-Waterman score: 3360; 91.9% identity (91.9% similar) in 568 aa overlap (1-568:1-522)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASALSYVSKFKSFVILFVTPLLLLPLVILMPAKFVRCAYVIILMAIYWCTEVIPLAVTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MASALSYVSKFKSFVILFVTPLLLLPLVILMPAKFVRCAYVIILMAIYWCTEVIPLAVTS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LMPVLLFPLFQILDSRQVCVQYMKDTNMLFLGGLIVAVAVERWNLHKRIALRTLLWVGAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LMPVLLFPLFQILDSRQVCVQYMKDTNMLFLGGLIVAVAVERWNLHKRIALRTLLWVGAK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PARLMLGFMGVTALLSMWISNTATTAMMVPIVEAILQQMEATSAATEAGLELVDKGKAKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PARLMLGFMGVTALLSMWISNTATTAMMVPIVEAILQQMEATSAATEAGLELVDKGKAKE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LPGSQVIFEGPTLGQQEDQERKRLCKAMTLCICYAASIGGTATLTGTGPNVVLLGQMNEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LPGSQVIFEGPTLGQQEDQERKRLCKAMTLCICYAASIGGTATLTGTGPNVVLLGQMNEL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 FPDSKDLVNFASWFAFAFPNMLVMLLFAWLWLQFVYMRFNFKKSWGCGLESKKNEKAALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FPDSKDLVNFASWFAFAFPNMLVMLLFAWLWLQFVYMRFNFKKSWGCGLESKKNEKAALK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VLQEEYRKLGPLSFAEINVLICFFLLVILWFSRDPGFMPGWLTVAWVEGETKYVSDATVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VLQEEYRKLGPLSFAEINVLICFFLLVILWFSRDPGFMPGWLTVAWVEGETKYVSDATVA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 IFVATLLFIVPSQKPKFNFRSQTEEERKTPFYPPPLLDWKVTQEKVPWGIVLLLGGGFAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IFVATLLFIVPSQKPKFNFRSQTEEERKTPFYPPPLLDWKVTQEKVPWGIVLLLGGGFAL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 AKGSEASGLSVWMGKQMEPLHAVPPAAITLILSLLVAVFTECTSNVATTTLFLPIFASMS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AKGSEASGLSVWMGKQMEPLHAVPPAAITLILSLLVAVFTECTSNVATTTLFLPIFASM-
430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 RSIGLNPLYIMLPCTLSASFAFMLPVATPPNAIVFTYGHLKVADMVKTGVIMNIIGVFCV
:::::::::::::::
CCDS45 ---------------------------------------------VKTGVIMNIIGVFCV
480 490
550 560
pF1KE2 FLAVNTWGRAIFDLDHFPDWANVTHIET
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FLAVNTWGRAIFDLDHFPDWANVTHIET
500 510 520
>>CCDS67137.1 SLC13A5 gene_id:284111|Hs108|chr17 (551 aa)
initn: 3643 init1: 2858 opt: 2860 Z-score: 3619.6 bits: 679.6 E(32554): 2.7e-195
Smith-Waterman score: 3613; 97.0% identity (97.0% similar) in 568 aa overlap (1-568:1-551)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASALSYVSKFKSFVILFVTPLLLLPLVILMPAKFVRCAYVIILMAIYWCTEVIPLAVTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 MASALSYVSKFKSFVILFVTPLLLLPLVILMPAKFVRCAYVIILMAIYWCTEVIPLAVTS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LMPVLLFPLFQILDSRQVCVQYMKDTNMLFLGGLIVAVAVERWNLHKRIALRTLLWVGAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 LMPVLLFPLFQILDSRQVCVQYMKDTNMLFLGGLIVAVAVERWNLHKRIALRTLLWVGAK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PARLMLGFMGVTALLSMWISNTATTAMMVPIVEAILQQMEATSAATEAGLELVDKGKAKE
::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 PAR-----------------NTATTAMMVPIVEAILQQMEATSAATEAGLELVDKGKAKE
130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LPGSQVIFEGPTLGQQEDQERKRLCKAMTLCICYAASIGGTATLTGTGPNVVLLGQMNEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 LPGSQVIFEGPTLGQQEDQERKRLCKAMTLCICYAASIGGTATLTGTGPNVVLLGQMNEL
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 FPDSKDLVNFASWFAFAFPNMLVMLLFAWLWLQFVYMRFNFKKSWGCGLESKKNEKAALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 FPDSKDLVNFASWFAFAFPNMLVMLLFAWLWLQFVYMRFNFKKSWGCGLESKKNEKAALK
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VLQEEYRKLGPLSFAEINVLICFFLLVILWFSRDPGFMPGWLTVAWVEGETKYVSDATVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 VLQEEYRKLGPLSFAEINVLICFFLLVILWFSRDPGFMPGWLTVAWVEGETKYVSDATVA
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 IFVATLLFIVPSQKPKFNFRSQTEEERKTPFYPPPLLDWKVTQEKVPWGIVLLLGGGFAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 IFVATLLFIVPSQKPKFNFRSQTEEERKTPFYPPPLLDWKVTQEKVPWGIVLLLGGGFAL
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 AKGSEASGLSVWMGKQMEPLHAVPPAAITLILSLLVAVFTECTSNVATTTLFLPIFASMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 AKGSEASGLSVWMGKQMEPLHAVPPAAITLILSLLVAVFTECTSNVATTTLFLPIFASMS
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 RSIGLNPLYIMLPCTLSASFAFMLPVATPPNAIVFTYGHLKVADMVKTGVIMNIIGVFCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 RSIGLNPLYIMLPCTLSASFAFMLPVATPPNAIVFTYGHLKVADMVKTGVIMNIIGVFCV
470 480 490 500 510 520
550 560
pF1KE2 FLAVNTWGRAIFDLDHFPDWANVTHIET
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 FLAVNTWGRAIFDLDHFPDWANVTHIET
530 540 550
>>CCDS11231.1 SLC13A2 gene_id:9058|Hs108|chr17 (592 aa)
initn: 2061 init1: 788 opt: 1469 Z-score: 1856.1 bits: 353.4 E(32554): 4.6e-97
Smith-Waterman score: 2130; 54.9% identity (84.0% similar) in 576 aa overlap (1-561:1-572)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASALSYVSKFKSFVILFVTPLLLLPLVILMPAKFVRCAYVIILMAIYWCTEVIPLAVTS
::. . . ..:..:.: .:.::::: ::.:.: . :::.:::::..::::..:::::.
CCDS11 MATCWQALWAYRSYLIVFFVPILLLPLPILVPSKEAYCAYAIILMALFWCTEALPLAVTA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LMPVLLFPLFQILDSRQVCVQYMKDTNMLFLGGLIVAVAVERWNLHKRIALRTLLWVGAK
:.:..:::.. :.:. .: :.:.::.:.::.:::.::.:::.::::::::::.:: ::..
CCDS11 LFPLILFPMMGIVDASEVAVEYLKDSNLLFFGGLLVAIAVEHWNLHKRIALRVLLIVGVR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE2 PARLMLGFMGVTALLSMWISNTATTAMMVPIVEAILQQMEATSAAT--EAG-----LELV
:: :.:::: :::.::::::::::.::::::..:.:.:.....:.. : : .::
CCDS11 PAPLILGFMLVTAFLSMWISNTATSAMMVPIAHAVLDQLHSSQASSNVEEGSNNPTFELQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KE2 DKGKAKE---LPGSQV--IFEGPTLGQQE-DQERKRLCKAMTLCICYAASIGGTATLTGT
. . :: : ..:. . . . :. . .:.. .: . :.::.::.::::: ::::::
CCDS11 EPSPQKEVTKLDNGQALPVTSASSEGRAHLSQKHLHLTQCMSLCVCYSASIGGIATLTGT
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 GPNVVLLGQMNELFPDSKDLVNFASWFAFAFPNMLVMLLFAWLWLQFVYMRFNFKKSWGC
.::.:: ::.: :::.. ..:::::::.::::.:...::.::::::.... :::.:..:
CCDS11 APNLVLQGQINSLFPQNGNVVNFASWFSFAFPTMVILLLLAWLWLQILFLGFNFRKNFGI
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 GLESKKNEKAALKVLQEEYRKLGPLSFAEINVLICFFLLVILWFSRDPGFMPGWLTVAW-
: . .....:: :.: :.: :::..::: . : : .::.:::.:.:::. :: ..:.
CCDS11 GEKMQEQQQAAYCVIQTEHRLLGPMTFAEKAISILFVILVLLWFTREPGFFLGWGNLAFP
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 -VEGETKYVSDATVAIFVATLLFIVPSQKPKFNFRSQTEEERKTPFYPPPLLDWKVTQEK
..::. .:::.:::::.. ..::.::. : .. .. . :.:. :::::....:
CCDS11 NAKGES-MVSDGTVAIFIGIIMFIIPSKFPGLTQDPENPGKLKAPL---GLLDWKTVNQK
370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 VPWGIVLLLGGGFALAKGSEASGLSVWMGKQMEPLHAVPPAAITLILSLLVAVFTECTSN
.::.::::::::.::::::: :::: :.:... ::..:: ::..:::::::.:::::::
CCDS11 MPWNIVLLLGGGYALAKGSERSGLSEWLGNKLTPLQSVPAPAIAIILSLLVATFTECTSN
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 VATTTLFLPIFASMSRSIGLNPLYIMLPCTLSASFAFMLPVATPPNAIVFTYGHLKVADM
:::::.::::.:::...: :.:::.::::::..:.:::::::::::::::..: ::: ::
CCDS11 VATTTIFLPILASMAQAICLHPLYVMLPCTLATSLAFMLPVATPPNAIVFSFGDLKVLDM
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560
pF1KE2 VKTGVIMNIIGVFCVFLAVNTWGRAIFDLDHFPDWANVTHIET
...: ..:::::. . ::.:.:: .:.: ::.::
CCDS11 ARAGFLLNIIGVLIIALAINSWGIPLFSLHSFPSWAQSNTTAQCLPSLANTTTPSP
540 550 560 570 580 590
>>CCDS54098.1 SLC13A2 gene_id:9058|Hs108|chr17 (641 aa)
initn: 1792 init1: 788 opt: 1469 Z-score: 1855.6 bits: 353.4 E(32554): 4.9e-97
Smith-Waterman score: 1955; 51.6% identity (77.7% similar) in 597 aa overlap (29-561:29-621)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASALSYVSKFKSFVILFVTPLLLLPLVILMPAKFVRCAYVIILMAIYWCTEVIPLAVTS
::.:.: . :::.:::::..::::..:::::.
CCDS54 MATCWQALWAYRSYLIVFFVPILLLPLPILVPSKEAYCAYAIILMALFWCTEALPLAVTA
10 20 30 40 50 60
70
pF1KE2 LMPVLLFPLFQILD--------------------------------------SR------
:.:..:::.. :.: ::
CCDS54 LFPLILFPMMGIVDASEIIQRPFPSSFESPGECQSVGMSVTASHNLGGTVGDSRVFPPLS
70 80 90 100 110 120
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 -----QVCVQYMKDTNMLFLGGLIVAVAVERWNLHKRIALRTLLWVGAKPARLMLGFMGV
:: :.:.::.:.::.:::.::.:::.::::::::::.:: ::..:: :.:::: :
CCDS54 HVSTCQVAVEYLKDSNLLFFGGLLVAIAVEHWNLHKRIALRVLLIVGVRPAPLILGFMLV
130 140 150 160 170 180
140 150 160 170 180
pF1KE2 TALLSMWISNTATTAMMVPIVEAILQQMEATSAAT--EAG-----LELVDKGKAKE---L
::.::::::::::.::::::..:.:.:.....:.. : : .:: . . :: :
CCDS54 TAFLSMWISNTATSAMMVPIAHAVLDQLHSSQASSNVEEGSNNPTFELQEPSPQKEVTKL
190 200 210 220 230 240
190 200 210 220 230
pF1KE2 PGSQV--IFEGPTLGQQE-DQERKRLCKAMTLCICYAASIGGTATLTGTGPNVVLLGQMN
..:. . . . :. . .:.. .: . :.::.::.::::: ::::::.::.:: ::.:
CCDS54 DNGQALPVTSASSEGRAHLSQKHLHLTQCMSLCVCYSASIGGIATLTGTAPNLVLQGQIN
250 260 270 280 290 300
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 ELFPDSKDLVNFASWFAFAFPNMLVMLLFAWLWLQFVYMRFNFKKSWGCGLESKKNEKAA
:::.. ..:::::::.::::.:...::.::::::.... :::.:..: : . .....::
CCDS54 SLFPQNGNVVNFASWFSFAFPTMVILLLLAWLWLQILFLGFNFRKNFGIGEKMQEQQQAA
310 320 330 340 350 360
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 LKVLQEEYRKLGPLSFAEINVLICFFLLVILWFSRDPGFMPGWLTVAW--VEGETKYVSD
:.: :.: :::..::: . : : .::.:::.:.:::. :: ..:. ..::. .:::
CCDS54 YCVIQTEHRLLGPMTFAEKAISILFVILVLLWFTREPGFFLGWGNLAFPNAKGES-MVSD
370 380 390 400 410
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 ATVAIFVATLLFIVPSQKPKFNFRSQTEEERKTPFYPPPLLDWKVTQEKVPWGIVLLLGG
.:::::.. ..::.::. : .. .. . :.:. :::::....:.::.:::::::
CCDS54 GTVAIFIGIIMFIIPSKFPGLTQDPENPGKLKAPL---GLLDWKTVNQKMPWNIVLLLGG
420 430 440 450 460 470
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 GFALAKGSEASGLSVWMGKQMEPLHAVPPAAITLILSLLVAVFTECTSNVATTTLFLPIF
:.::::::: :::: :.:... ::..:: ::..:::::::.::::::::::::.::::.
CCDS54 GYALAKGSERSGLSEWLGNKLTPLQSVPAPAIAIILSLLVATFTECTSNVATTTIFLPIL
480 490 500 510 520 530
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 ASMSRSIGLNPLYIMLPCTLSASFAFMLPVATPPNAIVFTYGHLKVADMVKTGVIMNIIG
:::...: :.:::.::::::..:.:::::::::::::::..: ::: ::...: ..::::
CCDS54 ASMAQAICLHPLYVMLPCTLATSLAFMLPVATPPNAIVFSFGDLKVLDMARAGFLLNIIG
540 550 560 570 580 590
540 550 560
pF1KE2 VFCVFLAVNTWGRAIFDLDHFPDWANVTHIET
:. . ::.:.:: .:.: ::.::
CCDS54 VLIIALAINSWGIPLFSLHSFPSWAQSNTTAQCLPSLANTTTPSP
600 610 620 630 640
>>CCDS42886.1 SLC13A3 gene_id:64849|Hs108|chr20 (555 aa)
initn: 1468 init1: 699 opt: 1259 Z-score: 1590.4 bits: 304.1 E(32554): 2.9e-82
Smith-Waterman score: 1728; 48.6% identity (77.3% similar) in 551 aa overlap (45-566:1-538)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 VILFVTPLLLLPLVILMPAKFVRCAYVIILMAIYWCTEVIPLAVTSLMPVLLFPLFQILD
::.:::::..::.::.:.:..:::.. ::
CCDS42 MAVYWCTEALPLSVTALLPIVLFPFMGILP
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 SRQVCVQYMKDTNMLFLGGLIVAVAVERWNLHKRIALRTLLWVGAKPARLMLGFMGVTAL
: .:: ::. :::.:::.:::.: :.:.::::.::::. :. ::..::::.::.: .:..
CCDS42 SNKVCPQYFLDTNFLFLSGLIMASAIEEWNLHRRIALKILMLVGVQPARLILGMMVTTSF
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170
pF1KE2 LSMWISNTATTAMMVPIVEAILQQM---------------EATSAATEAGLELVD-----
::::.::::.::::.::..:::... : :.:. . ::. :
CCDS42 LSMWLSNTASTAMMLPIANAILKSLFGQKEVRKDPSQESEENTAAVRRNGLHTVPTEMQF
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 --KGKAKELPG-SQVIFEGPTLGQQEDQERKRLCKAMTLCICYAASIGGTATLTGTGPNV
. .::. :: ..: .. :. ...::. :. . :.. . : :.::::::::::::.::.
CCDS42 LASTEAKDHPGETEVPLDLPADSRKEDEYRRNIWKGFLISIPYSASIGGTATLTGTAPNL
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 VLLGQMNELFPDSKDLVNFASWFAFAFPNMLVMLLFAWLWLQFVYMRFNFKKSWGCGL-E
.::::.. .::. :.:::.::: :::: ::..:: .:::..:.: ..:. .: . :
CCDS42 ILLGQLKSFFPQC-DVVNFGSWFIFAFPLMLLFLLAGWLWISFLYGGLSFR-GWRKNKSE
220 230 240 250 260
300 310 320 330 340
pF1KE2 SKKN-EKAALKVLQEEYRKLGPLSFAEINVLICFFLLVILWFSRDPGFMPGWLTVAWVEG
. : : : :..:::..:::..::: :.: : ...:: :.::: :.::: .. . :
CCDS42 IRTNAEDRARAVIREEYQNLGPIKFAEQAVFILFCMFAILLFTRDPKFIPGWASL-FNPG
270 280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 ETKYVSDATVAIFVATLLFIVPSQKPK----FNFRSQTEEERKTPFYPPPLLDWKVTQEK
..:::.... ..:.::. :::.:. :.:.. . : . ::: :: .::
CCDS42 ---FLSDAVTGVAIVTILFFFPSQRPSLKWWFDFKAPNTETE-------PLLTWKKAQET
330 340 350 360 370
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 VPWGIVLLLGGGFALAKGSEASGLSVWMGKQMEPLHAVPPAAITLILSLLVAVFTECTSN
:::.:.::::::::.::: : ::::::.: :..::. :::: .:......: ::: .::
CCDS42 VPWNIILLLGGGFAMAKGCEESGLSVWIGGQLHPLENVPPALAVLLITVVIAFFTEFASN
380 390 400 410 420 430
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 VATTTLFLPIFASMSRSIGLNPLYIMLPCTLSASFAFMLPVATPPNAIVFTYGHLKVADM
.:: .:::..: .. . ..:::.:.: :.. ::::::::.::::.:.:. ::: : ::
CCDS42 TATIIIFLPVLAELAIRLRVHPLYLMIPGTVGCSFAFMLPVSTPPNSIAFASGHLLVKDM
440 450 460 470 480 490
530 540 550 560
pF1KE2 VKTGVIMNIIGVFCVFLAVNTWGRAIFDLDHFPDWANVTHIET
:.::..::..::. . ::.:::...::.: :::::.. .
CCDS42 VRTGLLMNLMGVLLLSLAMNTWAQTIFQLGTFPDWADMYSVNVTALPPTLANDTFRTL
500 510 520 530 540 550
>>CCDS13400.1 SLC13A3 gene_id:64849|Hs108|chr20 (602 aa)
initn: 1573 init1: 699 opt: 1259 Z-score: 1589.9 bits: 304.1 E(32554): 3.1e-82
Smith-Waterman score: 1841; 48.1% identity (77.0% similar) in 595 aa overlap (1-566:4-585)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MASALSYVSKFKSFVILFVTPLLLLPLVILMPAKFVRCAYVIILMAIYWCTEVIPLA
.:.: . : . . ...:. ::: :::.:. .: : :: .::.:::.:::::..::.
CCDS13 MAALAAAAKKVWSARRLLVLLFTPLALLPVVFALPPKEGRCLFVILLMAVYWCTEALPLS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 VTSLMPVLLFPLFQILDSRQVCVQYMKDTNMLFLGGLIVAVAVERWNLHKRIALRTLLWV
::.:.:..:::.. :: : .:: ::. :::.:::.:::.: :.:.::::.::::. :. :
CCDS13 VTALLPIVLFPFMGILPSNKVCPQYFLDTNFLFLSGLIMASAIEEWNLHRRIALKILMLV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KE2 GAKPARLMLGFMGVTALLSMWISNTATTAMMVPIVEAILQQM---------------EAT
:..::::.::.: .:..::::.::::.::::.::..:::... : :
CCDS13 GVQPARLILGMMVTTSFLSMWLSNTASTAMMLPIANAILKSLFGQKEVRKDPSQESEENT
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210
pF1KE2 SAATEAGLELVD-------KGKAKELPG-SQVIFEGPTLGQQEDQERKRLCKAMTLCICY
.:. . ::. : . .::. :: ..: .. :. ...::. :. . :.. . : :
CCDS13 AAVRRNGLHTVPTEMQFLASTEAKDHPGETEVPLDLPADSRKEDEYRRNIWKGFLISIPY
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 AASIGGTATLTGTGPNVVLLGQMNELFPDSKDLVNFASWFAFAFPNMLVMLLFAWLWLQF
.::::::::::::.::..::::.. .::. :.:::.::: :::: ::..:: .:::..:
CCDS13 SASIGGTATLTGTAPNLILLGQLKSFFPQC-DVVNFGSWFIFAFPLMLLFLLAGWLWISF
250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 VYMRFNFKKSWGCGL-ESKKN-EKAALKVLQEEYRKLGPLSFAEINVLICFFLLVILWFS
.: ..:. .: . : . : : : :..:::..:::..::: :.: : ...:: :.
CCDS13 LYGGLSFR-GWRKNKSEIRTNAEDRARAVIREEYQNLGPIKFAEQAVFILFCMFAILLFT
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380
pF1KE2 RDPGFMPGWLTVAWVEGETKYVSDATVAIFVATLLFIVPSQKPK----FNFRSQTEEERK
::: :.::: .. . : ..:::.... ..:.::. :::.:. :.:.. . : .
CCDS13 RDPKFIPGWASL-FNPG---FLSDAVTGVAIVTILFFFPSQRPSLKWWFDFKAPNTETE-
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 TPFYPPPLLDWKVTQEKVPWGIVLLLGGGFALAKGSEASGLSVWMGKQMEPLHAVPPAAI
::: :: .:: :::.:.::::::::.::: : ::::::.: :..::. ::::
CCDS13 ------PLLTWKKAQETVPWNIILLLGGGFAMAKGCEESGLSVWIGGQLHPLENVPPALA
420 430 440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 TLILSLLVAVFTECTSNVATTTLFLPIFASMSRSIGLNPLYIMLPCTLSASFAFMLPVAT
.:......: ::: .::.:: .:::..: .. . ..:::.:.: :.. ::::::::.:
CCDS13 VLLITVVIAFFTEFASNTATIIIFLPVLAELAIRLRVHPLYLMIPGTVGCSFAFMLPVST
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 PPNAIVFTYGHLKVADMVKTGVIMNIIGVFCVFLAVNTWGRAIFDLDHFPDWANVTHIET
:::.:.:. ::: : :::.::..::..::. . ::.:::...::.: :::::.. .
CCDS13 PPNSIAFASGHLLVKDMVRTGLLMNLMGVLLLSLAMNTWAQTIFQLGTFPDWADMYSVNV
530 540 550 560 570 580
CCDS13 TALPPTLANDTFRTL
590 600
>>CCDS5840.1 SLC13A4 gene_id:26266|Hs108|chr7 (626 aa)
initn: 1499 init1: 655 opt: 1184 Z-score: 1494.5 bits: 286.6 E(32554): 6.3e-77
Smith-Waterman score: 1591; 41.4% identity (71.3% similar) in 606 aa overlap (26-566:25-622)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASALSYVSKFKSFVILFVTPLLLLPLVILMPAKFVRCAYVIILMAIYWCTEVIPLAVTS
:: .: :.. . ::::.:. :.:: .:..::....
CCDS58 MGLLQGLLRVRKLLLVVCVPLLLLPLPVLHPSSEASCAYVLIVTAVYWVSEAVPLGAAA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LMPVLLFPLFQILDSRQVCVQYMKDTNMLFLGGLIVAVAVERWNLHKRIALRTLLWVGAK
:.:..:.:.: .: : .: ..:.:.:..:..: . ::.:::.:::::::::: .: .:::
CCDS58 LVPAFLYPFFGVLRSNEVAAEYFKNTTLLLVGVICVAAAVEKWNLHKRIALRMVLMAGAK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160
pF1KE2 PARLMLGFMGVTALLSMWISNTATTAMMVPIVEAILQ--------QMEATSAATEAG---
:. :.: :: :.:::::.:::.::::..:::::.:: :. : .. :: .
CCDS58 PGMLLLCFMCCTTLLSMWLSNTSTTAMVMPIVEAVLQELVSAEDEQLVAGNSNTEEAEPI
120 130 140 150 160 170
170 180
pF1KE2 ----------LELV----------------------------------DKGKAKELPGS-
:::. .:: :. :..
CCDS58 SLDVKNSQPSLELIFVNEESNADLTTLMHNENLNGVPSITNPIKTANQHQGK-KQHPSQE
180 190 200 210 220 230
190 200 210 220 230
pF1KE2 --QVIFEGPTLGQQEDQERKR----LCKAMTLCICYAASIGGTATLTGTGPNVVLLGQMN
::. .: . . . :.. .:: ..: : :.:.::: .:. ::. ....: ..:
CCDS58 KPQVLTPSPRKQKLNRKYRSHHDQMICKCLSLSISYSATIGGLTTIIGTSTSLIFLEHFN
240 250 260 270 280 290
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 ELFPDSKDLVNFASWFAFAFPNMLVMLLFAWLWLQFVYMRFNFKKSWGCGLESKKN---E
. .: . ..:::..:: :.:: :.::. .:.:...... :::.. :.: .::. :
CCDS58 NQYP-AAEVVNFGTWFLFSFPISLIMLVVSWFWMHWLFLGCNFKET--CSLSKKKKTKRE
300 310 320 330 340 350
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 KAALKVLQEEYRKLGPLSFAEINVLICFFLLVILWFSRDPGFMPGWLTVAWVEGETKYVS
. . : .::::.::: .:. :. . . :.:...:::.:.:::.::: . .: : .
CCDS58 QLSEKRIQEEYEKLGDISYPEMVTGFFFILMTVLWFTREPGFVPGWDSFFEKKG---YRT
360 370 380 390 400 410
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 DATVAIFVATLLFIVPSQKPKFNFRSQTEEERKTPFYPPPLLDWKVTQEKVPWGIVLLLG
::::..:.. :::..:..:: :. ... :..... . :.. :: :. .:: ::.:.:
CCDS58 DATVSVFLGFLLFLIPAKKPCFGKKNDGENQEHS-LGTEPIITWKDFQKTMPWEIVILVG
420 430 440 450 460 470
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 GGFALAKGSEASGLSVWMGKQMEPLHAVPPAAITLILSLLVAVFTECTSNVATTTLFLPI
::.:::.::..::::.:.:.:: : ..:: :.::. .::.. :: .:: :: :.::::
CCDS58 GGYALASGSKSSGLSTWIGNQMLSLSSLPPWAVTLLACILVSIVTEFVSNPATITIFLPI
480 490 500 510 520 530
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 FASMSRSIGLNPLYIMLPCTLSASFAFMLPVATPPNAIVFTYGHLKVADMVKTGVIMNII
. :.:... .:::: ..: :. ::: ::::..:::::::.::: .. ::::.:. .:.:
CCDS58 LCSLSETLHINPLYTLIPVTMCISFAVMLPVGNPPNAIVFSYGHCQIKDMVKAGLGVNVI
540 550 560 570 580 590
540 550 560
pF1KE2 GVFCVFLAVNTWGRAIFDLDHFPDWANVTHIET
:. :..:.:::: ..: :: .: :: :..:
CCDS58 GLVIVMVAINTWGVSLFHLDTYPAWARVSNITDQA
600 610 620
>>CCDS5786.1 SLC13A1 gene_id:6561|Hs108|chr7 (595 aa)
initn: 1544 init1: 644 opt: 1162 Z-score: 1467.0 bits: 281.4 E(32554): 2.2e-75
Smith-Waterman score: 1657; 43.3% identity (72.7% similar) in 598 aa overlap (5-568:4-593)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASALSYVSKFKSFVILFVTPLLLLPLVILMPAKFVRCAYVIILMAIYWCTEVIPLAVTS
.::. .. :... : :.:::: :.. .: ..:::.....: .: ::..::.::.
CCDS57 MKFFSYILVYRRFLFVVFTVLVLLPLPIVLHTKEAECAYTLFVVATFWLTEALPLSVTA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LMPVLLFPLFQILDSRQVCVQYMKDTNMLFLGGLIVAVAVERWNLHKRIALRTLLWVGAK
:.: :..:.: :. :..: :.:: ..:..: . .:...:.:::::::::. .. ::..
CCDS57 LLPSLMLPMFGIMPSKKVASAYFKDFHLLLIGVICLATSIEKWNLHKRIALKMVMMVGVN
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160
pF1KE2 PARLMLGFMGVTALLSMWISNTATTAMMVPIVEAILQQM-------EAT-----SAATEA
:: : ::::. ::.::::.:::.:.::..::.::..::. ::: ...:.
CCDS57 PAWLTLGFMSSTAFLSMWLSNTSTAAMVMPIAEAVVQQIINAEAEVEATQMTYFNGSTNH
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200
pF1KE2 GLELVD----------KGKAKELPG---------SQVIFEGPTLGQQEDQERKR--LCKA
:::. . : :.: .:: :.: .: . :.. . :. . .
CCDS57 GLEIDESVNGHEINERKEKTKPVPGYNNDTGKISSKVELEKNS-GMRTKYRTKKGHVTRK
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 MT-LCICYAASIGGTATLTGTGPNVVLLGQMNELFPDSKDLVNFASWFAFAFPNMLVMLL
.: ::: :...::: .:.:::. :... .: .:: . : ::.:::.:.:: :..::
CCDS57 LTCLCIAYSSTIGGLTTITGTSTNLIFAEYFNTRYPDCRCL-NFGSWFTFSFPAALIILL
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 FAWLWLQFVYMRFNFKKSWGCGLESKKNEKAALKVLQEEYRKLGPLSFAEINVLICFFLL
..:.:::.... ::::. . :: . ..:: .:...::.::::. . :: .:. :...
CCDS57 LSWIWLQWLFLGFNFKEMFKCGKTKTVQQKACAEVIKQEYQKLGPIRYQEIVTLVLFIIM
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 VILWFSRDPGFMPGWLTVAWVEGETKYVSDATVAIFVATLLFIVPSQKPKFNFRSQTEEE
..:::::::::.::: : ...:.:::.... :.:..:.. .. . :
CCDS57 ALLWFSRDPGFVPGW--SALFSEYPGFATDSTVALLIGLLFFLIPAK----TLTKTTPTG
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 RKTPFYPPPLLDWKVTQEKVPWGIVLLLGGGFALAKGSEASGLSVWMGKQMEPLHAVPPA
. . : ::. :: : .:: :..:.::::::: : : :::: :.:... :: ..:
CCDS57 EIVAFDYSPLITWKEFQSFMPWDIAILVGGGFALADGCEESGLSKWIGNKLSPLGSLPAW
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 AITLILSLLVAVFTECTSNVATTTLFLPIFASMSRSIGLNPLYIMLPCTLSASFAFMLPV
: :: ::.:. .:: .:: :: ::::::.. ....: .:::::..: :: .::::.:::
CCDS57 LIILISSLMVTSLTEVASNPATITLFLPILSPLAEAIHVNPLYILIPSTLCTSFAFLLPV
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 ATPPNAIVFTYGHLKVADMVKTGVIMNIIGVFCVFLAVNTWGRAIFDLDHFPDWANVTHI
:.:::::::.:::::: ::::.:. .::.:: :.:.. :: .::: .:.:: .
CCDS57 ANPPNAIVFSYGHLKVIDMVKAGLGVNIVGVAVVMLGICTWIVPMFDLYTYPSWAPAMSN
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 ET
::
CCDS57 ETMP
568 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 20:25:39 2016 done: Mon Nov 7 20:25:39 2016
Total Scan time: 2.940 Total Display time: 0.120
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]