Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2456
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2456, 1709 aa
1>>>pF1KE2456 1709 - 1709 aa - 1709 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.4246+/-0.00125; mu= 1.4900+/- 0.076
mean_var=286.1589+/-57.259, 0's: 0 Z-trim(110.5): 100 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.075818
statistics sampled from 11571 (11662) to 11571 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.665), E-opt: 0.2 (0.358), width: 16
Scan time: 4.780
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34204.1 CHD1 gene_id:1105|Hs108|chr5 (1710) 11447 1267.2 0
CCDS10374.2 CHD2 gene_id:1106|Hs108|chr15 (1828) 4996 561.6 8.7e-159
CCDS76018.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1058) 1450 173.6 3.2e-42
CCDS32555.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (1966) 1420 170.5 5.1e-41
CCDS32554.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (2000) 1420 170.5 5.2e-41
CCDS32553.2 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (2059) 1420 170.5 5.3e-41
CCDS3761.1 SMARCA5 gene_id:8467|Hs108|chr4 (1052) 1397 167.8 1.8e-40
CCDS76510.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12 (1905) 1398 168.1 2.7e-40
CCDS8552.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12 (1912) 1398 168.1 2.7e-40
CCDS927.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 897) 1370 164.8 1.2e-39
CCDS57.1 CHD5 gene_id:26038|Hs108|chr1 (1954) 1312 158.7 1.8e-37
CCDS72882.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 797) 1086 133.7 2.5e-30
CCDS45356.1 CHD2 gene_id:1106|Hs108|chr15 ( 501) 1007 124.9 6.9e-28
CCDS58021.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 693) 792 101.5 1.1e-20
CCDS47865.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8 (2997) 795 102.3 2.7e-20
CCDS45485.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16 (2881) 760 98.4 3.8e-19
CCDS76865.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16 (2897) 760 98.4 3.8e-19
CCDS13317.1 CHD6 gene_id:84181|Hs108|chr20 (2715) 757 98.1 4.5e-19
CCDS45081.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2302) 742 96.4 1.2e-18
CCDS53885.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2581) 742 96.4 1.3e-18
CCDS54218.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1613) 733 95.3 1.8e-18
CCDS54217.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1614) 733 95.3 1.8e-18
CCDS83338.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1514) 711 92.9 9.3e-18
CCDS34978.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1572) 711 92.9 9.6e-18
CCDS34977.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1590) 710 92.8 1e-17
CCDS73164.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 700) 694 90.8 1.8e-17
CCDS73165.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 714) 694 90.8 1.9e-17
CCDS73163.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 740) 694 90.8 1.9e-17
CCDS45973.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1616) 701 91.8 2.1e-17
CCDS45972.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1617) 701 91.8 2.1e-17
CCDS7434.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 838) 694 90.8 2.1e-17
CCDS73162.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 884) 694 90.9 2.2e-17
CCDS12253.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1647) 700 91.7 2.3e-17
CCDS58022.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 616) 682 89.4 4.1e-17
CCDS14612.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1054) 676 88.9 9.9e-17
CCDS76019.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1070) 676 88.9 1e-16
CCDS10071.1 INO80 gene_id:54617|Hs108|chr15 (1556) 591 79.8 8.5e-14
CCDS7229.1 ERCC6 gene_id:2074|Hs108|chr10 (1493) 557 76.0 1.1e-12
CCDS31929.2 EP400 gene_id:57634|Hs108|chr12 (3123) 534 73.7 1.1e-11
CCDS10689.2 SRCAP gene_id:10847|Hs108|chr16 (3230) 528 73.1 1.8e-11
>>CCDS34204.1 CHD1 gene_id:1105|Hs108|chr5 (1710 aa)
initn: 11445 init1: 11276 opt: 11447 Z-score: 6778.1 bits: 1267.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 11447; 99.9% identity (99.9% similar) in 1710 aa overlap (1-1709:1-1710)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MNGHSDEESVRNSSGESSQSDDDSGSASGSGSGSSSGSSSDGSSSQSGSSDSDSGSESGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MNGHSDEESVRNSSGESSQSDDDSGSASGSGSGSSSGSSSDGSSSQSGSSDSDSGSESGS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 QSESESDTSRENKVQAKPPKVDGAEFWKSSPSILAVQRSAILKKQQQQQQQQQHQASSNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QSESESDTSRENKVQAKPPKVDGAEFWKSSPSILAVQRSAILKKQQQQQQQQQHQASSNS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 GSEEDSSSSEDSDDSSSEVKRKKHKDEDWQMSGSGSPSQSGSDSESEEEREKSSCDETES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GSEEDSSSSEDSDDSSSEVKRKKHKDEDWQMSGSGSPSQSGSDSESEEEREKSSCDETES
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 DYEPKNKVKSRKPQNRSKSKNGKKILGQKKRQIDSSEEDDDEEDYDNDKRSSRRQATVNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DYEPKNKVKSRKPQNRSKSKNGKKILGQKKRQIDSSEEDDDEEDYDNDKRSSRRQATVNV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SYKEDEEMKTDSDDLLEVCGEDVPQPEEEEFETIERFMDCRIGRKGATGATTTIYAVEAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SYKEDEEMKTDSDDLLEVCGEDVPQPEEEEFETIERFMDCRIGRKGATGATTTIYAVEAD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 GDPNAGFEKNKEPGEIQYLIKWKGWSHIHNTWETEETLKQQNVRGMKKLDNYKKKDQETK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GDPNAGFEKNKEPGEIQYLIKWKGWSHIHNTWETEETLKQQNVRGMKKLDNYKKKDQETK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 RWLKNASPEDVEYYNCQQELTDDLHKQYQIVERIIAHSNQKSAAGYPDYYCKWQGLPYSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RWLKNASPEDVEYYNCQQELTDDLHKQYQIVERIIAHSNQKSAAGYPDYYCKWQGLPYSE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 CSWEDGALISKKFQACIDEYFSRNQSKTTPFKDCKVLKQRPRFVALKKQPSYIGGHEGLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CSWEDGALISKKFQACIDEYFSRNQSKTTPFKDCKVLKQRPRFVALKKQPSYIGGHEGLE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 LRDYQLNGLNWLAHSWCKGNSCILADEMGLGKTIQTISFLNYLFHEHQLYGPFLLVVPLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LRDYQLNGLNWLAHSWCKGNSCILADEMGLGKTIQTISFLNYLFHEHQLYGPFLLVVPLS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 TLTSWQREIQTWASQMNAVVYLGDINSRNMIRTHEWTHHQTKRLKFNILLTTYEILLKDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TLTSWQREIQTWASQMNAVVYLGDINSRNMIRTHEWTHHQTKRLKFNILLTTYEILLKDK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 AFLGGLNWAFIGVDEAHRLKNDDSLLYKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLLHFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AFLGGLNWAFIGVDEAHRLKNDDSLLYKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLLHFI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 MPEKFSSWEDFEEEHGKGREYGYASLHKELEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRMEMSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MPEKFSSWEDFEEEHGKGREYGYASLHKELEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRMEMSA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 LQKQYYKWILTRNYKALSKGSKGSTSGFLNIMMELKKCCNHCYLIKPPDNNEFYNKQEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LQKQYYKWILTRNYKALSKGSKGSTSGFLNIMMELKKCCNHCYLIKPPDNNEFYNKQEAL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 QHLIRSSGKLILLDKLLIRLRERGNRVLIFSQMVRMLDILAEYLKYRQFPFQRLDGSIKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QHLIRSSGKLILLDKLLIRLRERGNRVLIFSQMVRMLDILAEYLKYRQFPFQRLDGSIKG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 ELRKQALDHFNAEGSEDFCFLLSTRAGGLGINLASADTVVIFDSDWNPQNDLQAQARAHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ELRKQALDHFNAEGSEDFCFLLSTRAGGLGINLASADTVVIFDSDWNPQNDLQAQARAHR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 IGQKKQVNIYRLVTKGSVEEDILERAKKKMVLDHLVIQRMDTTGKTVLHTGSAPSSSTPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IGQKKQVNIYRLVTKGSVEEDILERAKKKMVLDHLVIQRMDTTGKTVLHTGSAPSSSTPF
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 NKEELSAILKFGAEELFKEPEGEEQEPQEMDIDEILKRAETHENEPGPLTVGDELLSQFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NKEELSAILKFGAEELFKEPEGEEQEPQEMDIDEILKRAETHENEPGPLTVGDELLSQFK
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 VANFSNMDEDDIELEPERNSKNWEEIIPEDQRRRLEEEERQKELEEIYMLPRMRNCAKQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VANFSNMDEDDIELEPERNSKNWEEIIPEDQRRRLEEEERQKELEEIYMLPRMRNCAKQI
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 SFNGSEGRRSRSRRYSGSDSDSISEGKRPKKRGRPRTIPRENIKGFSDAEIRRFIKSYKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SFNGSEGRRSRSRRYSGSDSDSISEGKRPKKRGRPRTIPRENIKGFSDAEIRRFIKSYKK
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 FGGPLERLDAIARDAELVDKSETDLRRLGELVHNGCIKALKDSSSGTERTGGRLGKVKGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FGGPLERLDAIARDAELVDKSETDLRRLGELVHNGCIKALKDSSSGTERTGGRLGKVKGP
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 TFRISGVQVNAKLVISHEEELIPLHKSIPSDPEERKQYTIPCHTKAAHFDIDWGKEDDSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TFRISGVQVNAKLVISHEEELIPLHKSIPSDPEERKQYTIPCHTKAAHFDIDWGKEDDSN
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 LLIGIYEYGYGSWEMIKMDPDLSLTHKILPDDPDKKPQAKQLQTRADYLIKLLSRDLAKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LLIGIYEYGYGSWEMIKMDPDLSLTHKILPDDPDKKPQAKQLQTRADYLIKLLSRDLAKK
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 EALSGAGSSKRRKARAKKNKAMKSIKVKEEIKSDSSPLPSEKSDEDDDKLSESKSDGRER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EALSGAGSSKRRKARAKKNKAMKSIKVKEEIKSDSSPLPSEKSDEDDDKLSESKSDGRER
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE2 SKKSSVSDAPVHITASGEPVPISEESEELDQKTFSICKERMRPVKAALKQLDRPEKGLSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SKKSSVSDAPVHITASGEPVPISEESEELDQKTFSICKERMRPVKAALKQLDRPEKGLSE
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE2 REQLEHTRQCLIKIGDHITECLKEYTNPEQIKQWRKNLWIFVSKFTEFDARKLHKLYKHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 REQLEHTRQCLIKIGDHITECLKEYTNPEQIKQWRKNLWIFVSKFTEFDARKLHKLYKHA
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE2 IKKRQESQQNSDQNSNLNPHVIRNPDVERLKENTNHDDSSRDSYSSDRHLTQYHDHHKDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IKKRQESQQNSDQNSNLNPHVIRNPDVERLKENTNHDDSSRDSYSSDRHLTQYHDHHKDR
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE2 HQGDSYKKSDSRKRPYSSFSNGKDHRDWDHYKQDSRYYSDREKHRKLDDHRSRDHRSNLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HQGDSYKKSDSRKRPYSSFSNGKDHRDWDHYKQDSRYYSDREKHRKLDDHRSRDHRSNLE
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE2 GSLKDRSHSDHRSHSDHRLHSDHRSSSEYTHHKSSRDYRYHSDWQMDHRASSSGPRSPLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GSLKDRSHSDHRSHSDHRLHSDHRSSSEYTHHKSSRDYRYHSDWQMDHRASSSGPRSPLD
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700
pF1KE2 QRS-YGSRSPFEHSVEHKSTPEHTWSSRKT
::: ::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QRSPYGSRSPFEHSVEHKSTPEHTWSSRKT
1690 1700 1710
>>CCDS10374.2 CHD2 gene_id:1106|Hs108|chr15 (1828 aa)
initn: 5058 init1: 3063 opt: 4996 Z-score: 2964.2 bits: 561.6 E(32554): 8.7e-159
Smith-Waterman score: 6477; 58.7% identity (79.4% similar) in 1763 aa overlap (2-1669:20-1742)
10 20 30 40
pF1KE2 MNGHS-DEESVRNSSGESSQSDDDSGSASGSGSGSSSGSSSD
..:: .::. ..:: :::....:: ::: :: :.:::.
CCDS10 MMRNKDKSQEEDSSLHSNASSHSASEEASGSDSG--SQSESEQGSDPGSGHGSESNSSSE
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 GSSSQSGSSDSDSGSESGSQSESESDTSRENKVQAKPPKVDGAEFWKSSPSILAVQRSAI
.: ::: :.:.: .::.:. ..:. .. : .: ..:. :.. .:.::
CCDS10 SSESQS-ESESES---AGSKSQPVLPEAKEKPASKKERIADVKKMWEEYPDVYGVRRS--
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 LKKQQQQQQQQQHQASSNSGSEEDSSSSEDSDDSSSEVKRKKHKDEDWQMSGSGSPSQSG
....: : . .:..::. .: . . . .:. .:.: :.. : . ...:
CCDS10 ---------NRSRQEPSRFNIKEEASSGSESGSPKRRGQRQLKKQEKWKQEPSEDEQEQG
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 SDSESEEEREKSSCDETESDYEPKNKVKSRKPQNRSKSKNGKKILGQKKRQIDSSEEDDD
...::: :..: . . :. : :. : : :. : :..:.: :::.::::
CCDS10 TSAESEPEQKKVKARRPV----PRRTV----PKPRVK-KQPKTQRGKRKKQ-DSSDEDDD
170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 EEDYDNDKRSSRRQATVNVSYKEDEEMKTDSDDLLEVCGEDVPQPEEEEFETIERFMDCR
: . ::..::.:. :::::::....::::::.:. :: : . .... ::::. .: :
CCDS10 --DDEAPKRQTRRRAAKNVSYKEDDDFETDSDDLIEMTGEGVDE-QQDNSETIEKVLDSR
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 IGRKGATGATTTIYAVEADGDPNAGFEKNKEPGEIQYLIKWKGWSHIHNTWETEETLKQQ
.:.::::::.::.::.::.:::.. :. .:. :::::::::::::.::.:::.::.:.::
CCDS10 LGKKGATGASTTVYAIEANGDPSGDFDTEKDEGEIQYLIKWKGWSYIHSTWESEESLQQQ
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390
pF1KE2 NVRGMKKLDNYKKKDQETKRWLKNASPEDVEYYNCQQELTDDLHKQYQIVERIIA-----
.:.:.:::.:.:::..: :.:: ..:::::::.::::::...:.::::::::.::
CCDS10 KVKGLKKLENFKKKEDEIKQWLGKVSPEDVEYFNCQQELASELNKQYQIVERVIAVKTSK
340 350 360 370 380 390
400 410 420 430 440
pF1KE2 ----------HSNQKSAAGYPDYYCKWQGLPYSECSWEDGALISKKFQACIDEYFSRNQS
:: . . .. :.: :::.::::::::::: :::.:::: ::: . :::.:
CCDS10 STLGQTDFPAHSRKPAPSNEPEYLCKWMGLPYSECSWEDEALIGKKFQNCIDSFHSRNNS
400 410 420 430 440 450
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 KTTPFKDCKVLKQRPRFVALKKQPSYIGGHEGLELRDYQLNGLNWLAHSWCKGNSCILAD
:: : ..::.::::::::::::::.:.:: :.::::::::.:::::::::::.:: ::::
CCDS10 KTIPTRECKALKQRPRFVALKKQPAYLGG-ENLELRDYQLEGLNWLAHSWCKNNSVILAD
460 470 480 490 500
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 EMGLGKTIQTISFLNYLFHEHQLYGPFLLVVPLSTLTSWQREIQTWASQMNAVVYLGDIN
::::::::::::::.::::.::::::::.:::::::::::::.. :: ..:.:::.::.
CCDS10 EMGLGKTIQTISFLSYLFHQHQLYGPFLIVVPLSTLTSWQREFEIWAPEINVVVYIGDLM
510 520 530 540 550 560
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 SRNMIRTHEWTHHQTKRLKFNILLTTYEILLKDKAFLGGLNWAFIGVDEAHRLKNDDSLL
::: :: .:: : :::::::: :.::::::::::. ::..::::.:::::::::::::::
CCDS10 SRNTIREYEWIHSQTKRLKFNALITTYEILLKDKTVLGSINWAFLGVDEAHRLKNDDSLL
570 580 590 600 610 620
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 YKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFSSWEDFEEEHGKGREYGYASL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.:::::: :: ::
CCDS10 YKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFEFWEDFEEDHGKGRENGYQSL
630 640 650 660 670 680
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 HKELEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRMEMSALQKQYYKWILTRNYKALSKGSKGSTS
:: ::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.::..::::
CCDS10 HKVLEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRVEMSALQKQYYKWILTRNYKALAKGTRGSTS
690 700 710 720 730 740
750 760 770 780 790 800
pF1KE2 GFLNIMMELKKCCNHCYLIKPPDNNEFYNKQEALQHLIRSSGKLILLDKLLIRLRERGNR
:::::.::::::::::::::::..:: : :: : ::::::::::::::: ::::::::
CCDS10 GFLNIVMELKKCCNHCYLIKPPEENERENGQEILLSLIRSSGKLILLDKLLTRLRERGNR
750 760 770 780 790 800
810 820 830 840 850 860
pF1KE2 VLIFSQMVRMLDILAEYLKYRQFPFQRLDGSIKGELRKQALDHFNAEGSEDFCFLLSTRA
:::::::::::::::::: ...::::::::::::.::::::::::.:::::::::::::
CCDS10 VLIFSQMVRMLDILAEYLTIKHYPFQRLDGSIKGEIRKQALDHFNADGSEDFCFLLSTRA
810 820 830 840 850 860
870 880 890 900 910 920
pF1KE2 GGLGINLASADTVVIFDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQKKQVNIYRLVTKGSVEEDILERA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:.:::
CCDS10 GGLGINLASADTVVIFDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQKKQVNIYRLVTKGTVEEEIIERA
870 880 890 900 910 920
930 940 950 960 970 980
pF1KE2 KKKMVLDHLVIQRMDTTGKTVLHTGSAPSSSTPFNKEELSAILKFGAEELFKEPEGEEQE
::::::::::::::::::.:.:...:. :.:.:::::::.::::::::.:::: ::::.:
CCDS10 KKKMVLDHLVIQRMDTTGRTILENNSGRSNSNPFNKEELTAILKFGAEDLFKELEGEESE
930 940 950 960 970 980
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE2 PQEMDIDEILKRAETHENEPGPLTVGDELLSQFKVANFSNMDEDDIELEPERNSKNWEEI
::::::::::. :::.::: . .. ::::::::::::..: ::. ::: :: :.:.::
CCDS10 PQEMDIDEILRLAETRENEVST-SATDELLSQFKVANFATM-EDEEELE-ERPHKDWDEI
990 1000 1010 1020 1030 1040
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE2 IPEDQRRRLEEEERQKELEEIYMLPRMRNCAKQISFNGSEG---RRSRSRRYSGSDSDS-
:::.::...:::::::::::::::::.:. .:. . : :.. . ...: :.:.:..
CCDS10 IPEEQRKKVEEEERQKELEEIYMLPRIRSSTKKAQTNDSDSDTESKRQAQRSSASESETE
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE2 -ISEGKRPKKRGRPRTIPRENIKGFSDAEIRRFIKSYKKFGGPLERLDAIARDAELVDKS
.. :.::.:::::.. .. ..::.:::::::::.::::: :::::. :::::::::::
CCDS10 DSDDDKKPKRRGRPRSVRKDLVEGFTDAEIRRFIKAYKKFGLPLERLECIARDAELVDKS
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1170 1180 1190 1200 1210
pF1KE2 ETDLRRLGELVHNGCIKALKDSSSGTERT---GGRLGKVKGPTFRISGVQVNAKLVISHE
.::.:::::.::.:..:... ... : :: .:::..:::::::.: .:.::
CCDS10 VADLKRLGELIHNSCVSAMQEYEEQLKENASEGKGPGKRRGPTIKISGVQVNVKSIIQHE
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KE2 EELIPLHKSIPSDPEERKQYTIPCHTKAAHFDIDWGKEDDSNLLIGIYEYGYGSWEMIKM
::. :::::: ::::.:.: . :..::::::..:: :::: ::.::::.:::.::.::
CCDS10 EEFEMLHKSIPVDPEEKKKYCLTCRVKAAHFDVEWGVEDDSRLLLGIYEHGYGNWELIKT
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1280 1290 1300 1310 1320 1330
pF1KE2 DPDLSLTHKILPDDPDKKPQAKQLQTRADYLIKLLSRDLAKKEALSGAGSSK--RRKARA
::.:.:: :::: . :::::.::::::::::.::: . : :: :..:. .: .:: :.
CCDS10 DPELKLTDKILPVETDKKPQGKQLQTRADYLLKLLRKGLEKKGAVTGGEEAKLKKRKPRV
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1340 1350 1360
pF1KE2 KKNKAMKSIKVKE-----------------EIKSDS---SPLP----------------S
::.. . .: .. :.:.:. ::. :
CCDS10 KKENKVPRLKEEHGIELSSPRHSDNPSEEGEVKDDGLEKSPMKKKQKKKENKENKEKQMS
1350 1360 1370 1380 1390 1400
1370 1380 1390 1400 1410
pF1KE2 EKSDEDDDKLSESKSDGRERSK--------KSSVSDAPVHITASGEPVPISE-ESEELDQ
..:.. :: ....: .:. : ::. :..::::::..:::::.: :...:::
CCDS10 SRKDKEGDKERKKSKDKKEKPKSGDAKSSSKSKRSQGPVHITAGSEPVPIGEDEDDDLDQ
1410 1420 1430 1440 1450 1460
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KE2 KTFSICKERMRPVKAALKQLDRPEKGLSEREQLEHTRQCLIKIGDHITECLKEYTNPEQI
.::::::::::::: ::::::.:.:::. .:::::::.::.::::.:.:::: :.. :.:
CCDS10 ETFSICKERMRPVKKALKQLDKPDKGLNVQEQLEHTRNCLLKIGDRIAECLKAYSDQEHI
1470 1480 1490 1500 1510 1520
1480 1490 1500 1510 1520
pF1KE2 KQWRKNLWIFVSKFTEFDARKLHKLYKHAIKKR----QESQQNSDQNSNLNPHVIRNPDV
: ::.:::::::::::::::::::::: : ::: .:.....: ... .: .
CCDS10 KLWRRNLWIFVSKFTEFDARKLHKLYKMAHKKRSQEEEEQKKKDDVTGGKKPFRPEASGS
1530 1540 1550 1560 1570 1580
1530 1540 1550 1560 1570
pF1KE2 ER----LKENTNHDDSSRDSYSSDRHLTQYHDHHKD-------RHQGDSYKKSDSRKRPY
: . .:.:. . . : :.: : .: :: ... . . .:.: .
CCDS10 SRDSLISQSHTSHNLHPQKPHLPASHGPQMHGHPRDNYNHPNKRHFSNADRGDWQRERKF
1590 1600 1610 1620 1630 1640
1580 1590 1600 1610 1620 1630
pF1KE2 SSFSNGKDHRDWD---HYKQDSRYYSDRE--KHRKLDDHRSRDHRSNLEGSLKDRSHSDH
. ...:... : :.. ....:.:.. .:..: ::: ..: : . . : ....
CCDS10 N-YGGGNNNPPWGSDRHHQYEQHWYKDHHYGDRRHMDAHRSGSYRPN--NMSRKRPYDQY
1650 1660 1670 1680 1690 1700
1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE2 RSHSDHRLHSDHRSSSEYTHHKSSR----DYRYHSDWQMDHRASSSGPRSPLDQRSYGSR
: ::: : :. . :: :.: ..: .. :.: :
CCDS10 SSDRDHRGHRDYY---DRHHHDSKRRRSDEFRPQNYHQQDFRRMSDHRPAMGYHGQGPSD
1710 1720 1730 1740 1750 1760
1690 1700
pF1KE2 SPFEHSVEHKSTPEHTWSSRKT
CCDS10 HYRSFHTDKLGEYKQPLPPLHPAVSDPRSPPSQKSPHDSKSPLDHRSPLERSLEQKNNPD
1770 1780 1790 1800 1810 1820
>>CCDS76018.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1058 aa)
initn: 1249 init1: 641 opt: 1450 Z-score: 871.4 bits: 173.6 E(32554): 3.2e-42
Smith-Waterman score: 1531; 31.0% identity (59.3% similar) in 1134 aa overlap (287-1364:14-1052)
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 EVCGEDVPQPEEEEFETIERFMDCRIGRKGATGATTTIYAVEADGDPNAGFEKNKEPGEI
:. ::.:: ..: : . : ..: :
CCDS76 MEQDTAAVAATVAAADATATIVVIE---DEQPGPSTSQEEGAA
10 20 30 40
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 QYLIKWKGWSHIHNTWETEETLKQQNVRGMKKLDNYKKKDQETKRWLKNASPEDVEYYNC
. . : ::. :... :...... : . . :. . : ::
CCDS76 A--------AATEATAATEKGEKKKE----KNVSSFQLK--LAAKAPKSEKEMDPEY---
50 60 70 80
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 QQELTDDLHKQYQIVER---IIAHSNQKSAAGYPDYYCKWQ-GLPYSECSWEDGALISKK
.... : :..... . ..:: : :: : . . : : . . : .:::
CCDS76 EEKMKADRAKRFEFLLKQTELFAHFIQPSAQKSPTSPLNMKLGRPRIKKD-EKQSLIS--
90 100 110 120 130 140
440 450 460 470 480
pF1KE2 FQACIDEYFSRNQSKTTPFKDCKVLKQRPRF----VALKKQPSYIGGHEGLELRDYQLNG
.: : .: .: ..:.. . . .. .:::. .: :::::. :
CCDS76 ----AGDYRHR---RTEQEEDEELLSESRKTSNVCIRFEVSPSYV---KGGPLRDYQIRG
150 160 170 180 190
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 LNWLAHSWCKGNSCILADEMGLGKTIQTISFLNYLFHEHQLYGPFLLVVPLSTLTSWQRE
:::: . .: . :::::::::::.:::..:.:: : ... :: ...:: ::: .:. :
CCDS76 LNWLISLYENGVNGILADEMGLGKTLQTIALLGYLKHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMNE
200 210 220 230 240 250
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 IQTWASQMNAVVYLGDINSRNMIRTHEWTHHQTKRLKFNILLTTYEILLKDKAFLGGLNW
.. :. .. .. ..:: ..: . : . ... .:.::...:.:. . ..:
CCDS76 FKRWVPSLRVICFVGDKDARAAFIRDEMMPGE-----WDVCVTSYEMVIKEKSVFKKFHW
260 270 280 290 300
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 AFIGVDEAHRLKNDDSLLYKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFSSW
.. .:::::.::. : : . . .:::..:::.:::::::.:.:::.::.:..:. :.:
CCDS76 RYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHELWALLNFLLPDVFNSA
310 320 330 340 350 360
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 EDFEE----EHGKGREYGYASLHKELEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRMEMSALQKQ
.::. .. : . :: :.::::::.: ::::::: : : . . .: .:..
CCDS76 DDFDSWFDTKNCLGDQKLVERLHAVLKPFLLRRIKTDVEKSLPPKKEIKIYLGLSKMQRE
370 380 390 400 410 420
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 YYKWILTRNYKALSKGSKGSTSGFLNIMMELKKCCNHCYLIKPPDNNEFYNKQEALQHLI
.: :: .. .:....: . .:::.:.:.::::: ::. . . :. .: :..
CCDS76 WYTKILMKDIDVLNSSGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPGPPYTTDE---HIV
430 440 450 460 470 480
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 RSSGKLILLDKLLIRLRERGNRVLIFSQMVRMLDILAEYLKYRQFPFQRLDGSIKGELRK
.:::...::::: .:.:.:.::::::::.:.:::: .: .: . . ::::. : :.
CCDS76 SNSGKMVVLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTRLLDILEDYCMWRGYEYCRLDGQTPHEERE
490 500 510 520 530 540
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 QALDHFNAEGSEDFCFLLSTRAGGLGINLASADTVVIFDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQK
.:.. ::: .: : :.::::::::::::::::.:...::::::: ::::. ::::::::
CCDS76 EAIEAFNAPNSSKFIFMLSTRAGGLGINLASADVVILYDSDWNPQVDLQAMDRAHRIGQK
550 560 570 580 590 600
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 KQVNIYRLVTKGSVEEDILERAKKKMVLDHLVIQRMDTTGKTVLHTGSAPSSSTPFNKEE
: : ..::.: ..::: :.:::. :. :: .:::. :. . ..:. . :::
CCDS76 KPVRVFRLITDNTVEERIVERAEIKLRLDSIVIQQ----GRLI------DQQSNKLAKEE
610 620 630 640 650
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 LSAILKFGAEELFKEPEGEEQEPQEMDIDEILKRAETHENEPGP--LTVGDELLSQFKV-
. ... :: ..: ..:.: . :: ::.:.: . : . .:. : .:..
CCDS76 MLQMIRHGATHVFA---SKESELTDEDITTILERGEKKTAEMNERLQKMGESSLRNFRMD
660 670 680 690 700
1030 1040 1050
pF1KE2 --ANFSNMDEDDIELEPERNSKNWEEIIPEDQRR-------------RLEEEE-------
.. ... .: . . . . .: : :. .:. :. : .
CCDS76 IEQSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEP-PKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKIPKAPRP
710 720 730 740 750 760
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE2 -RQKELEEIYMLP-RMRNCAKQISFNGSEGRRSRSRRYSGSDSDSISEGKRPKK-RGRPR
.: ..... ..: :. . .. . . . : . .... .. :: :
CCDS76 PKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILYYRKTIGYKVPRNPDIPNPALAQREEQKKIDGAEP
770 780 790 800 810 820
1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE2 TIPREN-------IKGFSDAEIR---RFIKSYKKFGGPLERLDAIARDAELVDKSETDLR
:.:. .::.. : .:::. .:.: . .: :::..: :: ..
CCDS76 LTPEETEEKEKLLTQGFTNWTKRDFNQFIKANEKYG--RDDIDNIAREVE--GKSPEEVM
830 840 850 860 870 880
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE2 RLGELVHNGC--IKALKDSSSGTERTGGRLGKVKGPTFRISGVQVNAKLVISHEEELIPL
. . . . : .. .. . :: .:. . ::: .. : . . :.
CCDS76 EYSAVFWERCNELQDIEKIMAQIERGEARIQR------RIS---IKKALDAKIARYKAPF
890 900 910 920 930
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KE2 HKSIPSDPEERKQYTIPCHTKAAHFDIDWGKEDDSNLLIGIYEYGYGSWEMIKMDPDLSL
:. : :: .:. .. .:.: :. ....:. .. . .:
CCDS76 HQL-------RIQYGT---SKGKNYT----EEEDRFLICMLHKMGFDRENVYE---ELRQ
940 950 960 970
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KE2 THKILP----DDPDKKPQAKQLQTRADYLIKLLSRDLAKKEALSGAGSSKRRKARAKKNK
. : : :. : ..: : . ::.:. .. . : .:..:. ::..
CCDS76 CVRNAPQFRFDWFIKSRTAMEFQRRCNTLISLIEKENMEIE--------ERERAE-KKKR
980 990 1000 1010 1020
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KE2 AMKSIKVKEEIKSDSSPLPSEKSDEDDDKLSESKSDGRERSKKSSVSDAPVHITASGEPV
: :. .... :..:. : :.:
CCDS76 ATKT-PMSQKRKAESATESSGKKDVKKVKS
1030 1040 1050
>>CCDS32555.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (1966 aa)
initn: 1644 init1: 692 opt: 1420 Z-score: 849.8 bits: 170.5 E(32554): 5.1e-41
Smith-Waterman score: 1964; 39.4% identity (65.3% similar) in 937 aa overlap (298-1166:529-1445)
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 EEEFETIERFMDCRIGRKGATGATTTIYAVEADGDPNAGFEKNKEP-GEIQYLIKWKGWS
.:::.:.. . . .: ....:: : :
CCDS32 RCTCPVLKGRVQKILHWRWGEPPVAVPAPQQADGNPDVPPPRPLQGRSEREFFVKWVGLS
500 510 520 530 540 550
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 HIHNTWETEETLKQQNVRGMKKLDNYKKK-DQETKRWLKNASPEDVEYYNCQQELTD---
. : .: : :. . . ::..: :.. : .: :: . . .... :
CCDS32 YWHCSWAKELQLE---IFHLVMYRNYQRKNDMDEPPPLDYGSGED-DGKSDKRKVKDPHY
560 570 580 590 600 610
390 400 410 420 430
pF1KE2 -DLHKQY---------QIVERIIAHSNQKSAAGYPDYYCKWQGLPYSECSWEDGALISKK
.....: . :.::: :: .:. : : ::. :::.. .::. . .
CCDS32 AEMEEKYYRFGIKPEWMTVHRIINHSVDKK--GNYHYLVKWRDLPYDQSTWEEDEMNIPE
620 630 640 650 660 670
440 450 460 470
pF1KE2 FQACIDEYFSRNQ--SKTTPFKDCKVLKQRPRF--------------VALKKQPSYIGGH
.. . :. . . : . : :.. .. : . :: .: .
CCDS32 YEEHKQSYWRHRELIMGEDPAQPRKYKKKKKELQGDGPPSSPTNDPTVKYETQPRFITAT
680 690 700 710 720 730
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 EGLELRDYQLNGLNWLAHSWCKGNSCILADEMGLGKTIQTISFLNYLFHEHQLYGPFLLV
: :. :::.::::: :: .:.. ::::::::::::::: :: :..: . ::::.
CCDS32 GGT-LHMYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTIQTIVFLYSLYKEGHTKGPFLVS
740 750 760 770 780 790
540 550 560 570 580
pF1KE2 VPLSTLTSWQREIQTWASQMNAVVYLGDINSRNMIRTHEWTHH-----------QTKR--
.::::. .:.::.: :: .. .:.: :: .:: .:: .:.. . . ::
CCDS32 APLSTIINWEREFQMWAPKFYVVTYTGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIKGGKKAFKMKREA
800 810 820 830 840 850
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 -LKFNILLTTYEILLKDKAFLGGLNWAFIGVDEAHRLKNDDSLLYKTLIDFKSNHRLLIT
.::..:::.::.. :.: ::.. :: . :::::::::..: ....: .: .:.::.:
CCDS32 QVKFHVLLTSYELITIDQAALGSIRWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYKIDHKLLLT
860 870 880 890 900 910
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 GTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFSSWEDFEEEHGK-GREYGYASLHKELEPFLLRRVKKD
::::::.:.::. ::.:. ::.:.. : : :: . ..: .:: : : .:::.: :
CCDS32 GTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRRLKAD
920 930 940 950 960 970
710 720 730 740 750 760
pF1KE2 VEKSLPAKVEQILRMEMSALQKQYYKWILTRNYKALSKGSKGSTSGFLNIMMELKKCCNH
: :..:::.: :.:.:.: .::.:::.:::::..::.. . :. ..:::::.:::::::
CCDS32 VFKNMPAKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNSRGGGNQVSLLNIMMDLKKCCNH
980 990 1000 1010 1020 1030
770 780 790 800 810
pF1KE2 CYL--IKPPDNNEFYNKQEALQHLIRSSGKLILLDKLLIRLRERGNRVLIFSQMVRMLDI
:: . .. .. . ::.:::::.::.:.: .:.:.:.::::::::..:::.
CCDS32 PYLFPVAAMESPKLPSGAYEGGALIKSSGKLMLLQKMLRKLKEQGHRVLIFSQMTKMLDL
1040 1050 1060 1070 1080 1090
820 830 840 850 860 870
pF1KE2 LAEYLKYRQFPFQRLDGSIKGELRKQALDHFNAEGSEDFCFLLSTRAGGLGINLASADTV
: ..: :. . ..:.::.: : ::..:.:.::: :...:::::::::::::::::.::::
CCDS32 LEDFLDYEGYKYERIDGGITGALRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTV
1100 1110 1120 1130 1140 1150
880 890 900 910 920 930
pF1KE2 VIFDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQKKQVNIYRLVTKGSVEEDILERAKKKMVLDHLVIQR
.::::::::.::.:: .::::::: ..: :::.::..:::: : . ::.::.: :::..
CCDS32 IIFDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQANKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVVR-
1160 1170 1180 1190 1200 1210
940 950 960 970 980 990
pF1KE2 MDTTGKTVLHTGSAPSSSTPFNKEELSAILKFGAEELFK-EPEGEEQEPQ----EMDIDE
: :: .: ..:.::. :::::.::::: : :::..: . ..: .
CCDS32 ---PG-----LGSKAGS---MSKQELDDILKFGTEELFKDENEGENKEEDSSVIHYDNEA
1220 1230 1240 1250
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE2 ILKRAETHEN--EPGPLTVGDELLSQFKVANFSNMDEDDIELEPERNSKNWEEIIPEDQR
: . . ... : . .: ::.::::.. .:: :: : ::. . :: . :
CCDS32 IARLLDRNQDATEDTDVQNMNEYLSSFKVAQYVVREEDKIE-EIEREIIKQEENVDPDYW
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE2 RRLEEEERQKELEEI-YMLPRMRNCAKQISFNGS--EGRRSRSRRYSGS-----DSDSIS
..: ... ... :.. : . . ::...: . : . ..:. :: : :
CCDS32 EKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRVRKQVNYNDAAQEDQDNQSEYSVGSEEEDEDFDERP
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1110 1120 1130 1140 1150
pF1KE2 EGKRPKKRG----RPRTIPRENIKGFSDAEIRRF-IKSYKKFGGPLERLDAIARDAELVD
::.: .:: . . .: . .. :. : .. : : . . : .:: ..
CCDS32 EGRRQSKRQLRNEKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNTRQRKAFLNAVMRWGMPPQDAFTTQ
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KE2 KSETDLRRLGELVHNGCIKALKDSSSGTERTGGRLGKVKGPTFRISGVQVNAKLVISHEE
:::
CCDS32 WLVRDLRGKTEKEFKAYVSLFMRHLCEPGADGSETFADGVPREGLSRQQVLTRIGVMSLV
1440 1450 1460 1470 1480 1490
>>CCDS32554.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (2000 aa)
initn: 1644 init1: 692 opt: 1420 Z-score: 849.7 bits: 170.5 E(32554): 5.2e-41
Smith-Waterman score: 1964; 39.4% identity (65.3% similar) in 937 aa overlap (298-1166:529-1445)
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 EEEFETIERFMDCRIGRKGATGATTTIYAVEADGDPNAGFEKNKEP-GEIQYLIKWKGWS
.:::.:.. . . .: ....:: : :
CCDS32 RCTCPVLKGRVQKILHWRWGEPPVAVPAPQQADGNPDVPPPRPLQGRSEREFFVKWVGLS
500 510 520 530 540 550
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 HIHNTWETEETLKQQNVRGMKKLDNYKKK-DQETKRWLKNASPEDVEYYNCQQELTD---
. : .: : :. . . ::..: :.. : .: :: . . .... :
CCDS32 YWHCSWAKELQLE---IFHLVMYRNYQRKNDMDEPPPLDYGSGED-DGKSDKRKVKDPHY
560 570 580 590 600 610
390 400 410 420 430
pF1KE2 -DLHKQY---------QIVERIIAHSNQKSAAGYPDYYCKWQGLPYSECSWEDGALISKK
.....: . :.::: :: .:. : : ::. :::.. .::. . .
CCDS32 AEMEEKYYRFGIKPEWMTVHRIINHSVDKK--GNYHYLVKWRDLPYDQSTWEEDEMNIPE
620 630 640 650 660 670
440 450 460 470
pF1KE2 FQACIDEYFSRNQ--SKTTPFKDCKVLKQRPRF--------------VALKKQPSYIGGH
.. . :. . . : . : :.. .. : . :: .: .
CCDS32 YEEHKQSYWRHRELIMGEDPAQPRKYKKKKKELQGDGPPSSPTNDPTVKYETQPRFITAT
680 690 700 710 720 730
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 EGLELRDYQLNGLNWLAHSWCKGNSCILADEMGLGKTIQTISFLNYLFHEHQLYGPFLLV
: :. :::.::::: :: .:.. ::::::::::::::: :: :..: . ::::.
CCDS32 GGT-LHMYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTIQTIVFLYSLYKEGHTKGPFLVS
740 750 760 770 780 790
540 550 560 570 580
pF1KE2 VPLSTLTSWQREIQTWASQMNAVVYLGDINSRNMIRTHEWTHH-----------QTKR--
.::::. .:.::.: :: .. .:.: :: .:: .:: .:.. . . ::
CCDS32 APLSTIINWEREFQMWAPKFYVVTYTGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIKGGKKAFKMKREA
800 810 820 830 840 850
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 -LKFNILLTTYEILLKDKAFLGGLNWAFIGVDEAHRLKNDDSLLYKTLIDFKSNHRLLIT
.::..:::.::.. :.: ::.. :: . :::::::::..: ....: .: .:.::.:
CCDS32 QVKFHVLLTSYELITIDQAALGSIRWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYKIDHKLLLT
860 870 880 890 900 910
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 GTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFSSWEDFEEEHGK-GREYGYASLHKELEPFLLRRVKKD
::::::.:.::. ::.:. ::.:.. : : :: . ..: .:: : : .:::.: :
CCDS32 GTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRRLKAD
920 930 940 950 960 970
710 720 730 740 750 760
pF1KE2 VEKSLPAKVEQILRMEMSALQKQYYKWILTRNYKALSKGSKGSTSGFLNIMMELKKCCNH
: :..:::.: :.:.:.: .::.:::.:::::..::.. . :. ..:::::.:::::::
CCDS32 VFKNMPAKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNSRGGGNQVSLLNIMMDLKKCCNH
980 990 1000 1010 1020 1030
770 780 790 800 810
pF1KE2 CYL--IKPPDNNEFYNKQEALQHLIRSSGKLILLDKLLIRLRERGNRVLIFSQMVRMLDI
:: . .. .. . ::.:::::.::.:.: .:.:.:.::::::::..:::.
CCDS32 PYLFPVAAMESPKLPSGAYEGGALIKSSGKLMLLQKMLRKLKEQGHRVLIFSQMTKMLDL
1040 1050 1060 1070 1080 1090
820 830 840 850 860 870
pF1KE2 LAEYLKYRQFPFQRLDGSIKGELRKQALDHFNAEGSEDFCFLLSTRAGGLGINLASADTV
: ..: :. . ..:.::.: : ::..:.:.::: :...:::::::::::::::::.::::
CCDS32 LEDFLDYEGYKYERIDGGITGALRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTV
1100 1110 1120 1130 1140 1150
880 890 900 910 920 930
pF1KE2 VIFDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQKKQVNIYRLVTKGSVEEDILERAKKKMVLDHLVIQR
.::::::::.::.:: .::::::: ..: :::.::..:::: : . ::.::.: :::..
CCDS32 IIFDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQANKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVVR-
1160 1170 1180 1190 1200 1210
940 950 960 970 980 990
pF1KE2 MDTTGKTVLHTGSAPSSSTPFNKEELSAILKFGAEELFK-EPEGEEQEPQ----EMDIDE
: :: .: ..:.::. :::::.::::: : :::..: . ..: .
CCDS32 ---PG-----LGSKAGS---MSKQELDDILKFGTEELFKDENEGENKEEDSSVIHYDNEA
1220 1230 1240 1250
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE2 ILKRAETHEN--EPGPLTVGDELLSQFKVANFSNMDEDDIELEPERNSKNWEEIIPEDQR
: . . ... : . .: ::.::::.. .:: :: : ::. . :: . :
CCDS32 IARLLDRNQDATEDTDVQNMNEYLSSFKVAQYVVREEDKIE-EIEREIIKQEENVDPDYW
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE2 RRLEEEERQKELEEI-YMLPRMRNCAKQISFNGS--EGRRSRSRRYSGS-----DSDSIS
..: ... ... :.. : . . ::...: . : . ..:. :: : :
CCDS32 EKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRVRKQVNYNDAAQEDQDNQSEYSVGSEEEDEDFDERP
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1110 1120 1130 1140 1150
pF1KE2 EGKRPKKRG----RPRTIPRENIKGFSDAEIRRF-IKSYKKFGGPLERLDAIARDAELVD
::.: .:: . . .: . .. :. : .. : : . . : .:: ..
CCDS32 EGRRQSKRQLRNEKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNTRQRKAFLNAVMRWGMPPQDAFTTQ
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KE2 KSETDLRRLGELVHNGCIKALKDSSSGTERTGGRLGKVKGPTFRISGVQVNAKLVISHEE
:::
CCDS32 WLVRDLRGKTEKEFKAYVSLFMRHLCEPGADGSETFADGVPREGLSRQQVLTRIGVMSLV
1440 1450 1460 1470 1480 1490
>>CCDS32553.2 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (2059 aa)
initn: 1611 init1: 692 opt: 1420 Z-score: 849.5 bits: 170.5 E(32554): 5.3e-41
Smith-Waterman score: 1964; 39.4% identity (65.3% similar) in 937 aa overlap (298-1166:588-1504)
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 EEEFETIERFMDCRIGRKGATGATTTIYAVEADGDPNAGFEKNKEP-GEIQYLIKWKGWS
.:::.:.. . . .: ....:: : :
CCDS32 RCTCPVLKGRVQKILHWRWGEPPVAVPAPQQADGNPDVPPPRPLQGRSEREFFVKWVGLS
560 570 580 590 600 610
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 HIHNTWETEETLKQQNVRGMKKLDNYKKK-DQETKRWLKNASPEDVEYYNCQQELTD---
. : .: : :. . . ::..: :.. : .: :: . . .... :
CCDS32 YWHCSWAKELQLE---IFHLVMYRNYQRKNDMDEPPPLDYGSGED-DGKSDKRKVKDPHY
620 630 640 650 660 670
390 400 410 420 430
pF1KE2 -DLHKQY---------QIVERIIAHSNQKSAAGYPDYYCKWQGLPYSECSWEDGALISKK
.....: . :.::: :: .:. : : ::. :::.. .::. . .
CCDS32 AEMEEKYYRFGIKPEWMTVHRIINHSVDKK--GNYHYLVKWRDLPYDQSTWEEDEMNIPE
680 690 700 710 720 730
440 450 460 470
pF1KE2 FQACIDEYFSRNQ--SKTTPFKDCKVLKQRPRF--------------VALKKQPSYIGGH
.. . :. . . : . : :.. .. : . :: .: .
CCDS32 YEEHKQSYWRHRELIMGEDPAQPRKYKKKKKELQGDGPPSSPTNDPTVKYETQPRFITAT
740 750 760 770 780 790
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 EGLELRDYQLNGLNWLAHSWCKGNSCILADEMGLGKTIQTISFLNYLFHEHQLYGPFLLV
: :. :::.::::: :: .:.. ::::::::::::::: :: :..: . ::::.
CCDS32 GGT-LHMYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTIQTIVFLYSLYKEGHTKGPFLVS
800 810 820 830 840 850
540 550 560 570 580
pF1KE2 VPLSTLTSWQREIQTWASQMNAVVYLGDINSRNMIRTHEWTHH-----------QTKR--
.::::. .:.::.: :: .. .:.: :: .:: .:: .:.. . . ::
CCDS32 APLSTIINWEREFQMWAPKFYVVTYTGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIKGGKKAFKMKREA
860 870 880 890 900 910
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 -LKFNILLTTYEILLKDKAFLGGLNWAFIGVDEAHRLKNDDSLLYKTLIDFKSNHRLLIT
.::..:::.::.. :.: ::.. :: . :::::::::..: ....: .: .:.::.:
CCDS32 QVKFHVLLTSYELITIDQAALGSIRWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYKIDHKLLLT
920 930 940 950 960 970
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 GTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFSSWEDFEEEHGK-GREYGYASLHKELEPFLLRRVKKD
::::::.:.::. ::.:. ::.:.. : : :: . ..: .:: : : .:::.: :
CCDS32 GTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRRLKAD
980 990 1000 1010 1020 1030
710 720 730 740 750 760
pF1KE2 VEKSLPAKVEQILRMEMSALQKQYYKWILTRNYKALSKGSKGSTSGFLNIMMELKKCCNH
: :..:::.: :.:.:.: .::.:::.:::::..::.. . :. ..:::::.:::::::
CCDS32 VFKNMPAKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNSRGGGNQVSLLNIMMDLKKCCNH
1040 1050 1060 1070 1080 1090
770 780 790 800 810
pF1KE2 CYL--IKPPDNNEFYNKQEALQHLIRSSGKLILLDKLLIRLRERGNRVLIFSQMVRMLDI
:: . .. .. . ::.:::::.::.:.: .:.:.:.::::::::..:::.
CCDS32 PYLFPVAAMESPKLPSGAYEGGALIKSSGKLMLLQKMLRKLKEQGHRVLIFSQMTKMLDL
1100 1110 1120 1130 1140 1150
820 830 840 850 860 870
pF1KE2 LAEYLKYRQFPFQRLDGSIKGELRKQALDHFNAEGSEDFCFLLSTRAGGLGINLASADTV
: ..: :. . ..:.::.: : ::..:.:.::: :...:::::::::::::::::.::::
CCDS32 LEDFLDYEGYKYERIDGGITGALRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTV
1160 1170 1180 1190 1200 1210
880 890 900 910 920 930
pF1KE2 VIFDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQKKQVNIYRLVTKGSVEEDILERAKKKMVLDHLVIQR
.::::::::.::.:: .::::::: ..: :::.::..:::: : . ::.::.: :::..
CCDS32 IIFDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQANKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVVR-
1220 1230 1240 1250 1260
940 950 960 970 980 990
pF1KE2 MDTTGKTVLHTGSAPSSSTPFNKEELSAILKFGAEELFK-EPEGEEQEPQ----EMDIDE
: :: .: ..:.::. :::::.::::: : :::..: . ..: .
CCDS32 ---PG-----LGSKAGS---MSKQELDDILKFGTEELFKDENEGENKEEDSSVIHYDNEA
1270 1280 1290 1300 1310
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE2 ILKRAETHEN--EPGPLTVGDELLSQFKVANFSNMDEDDIELEPERNSKNWEEIIPEDQR
: . . ... : . .: ::.::::.. .:: :: : ::. . :: . :
CCDS32 IARLLDRNQDATEDTDVQNMNEYLSSFKVAQYVVREEDKIE-EIEREIIKQEENVDPDYW
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE2 RRLEEEERQKELEEI-YMLPRMRNCAKQISFNGS--EGRRSRSRRYSGS-----DSDSIS
..: ... ... :.. : . . ::...: . : . ..:. :: : :
CCDS32 EKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRVRKQVNYNDAAQEDQDNQSEYSVGSEEEDEDFDERP
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1110 1120 1130 1140 1150
pF1KE2 EGKRPKKRG----RPRTIPRENIKGFSDAEIRRF-IKSYKKFGGPLERLDAIARDAELVD
::.: .:: . . .: . .. :. : .. : : . . : .:: ..
CCDS32 EGRRQSKRQLRNEKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNTRQRKAFLNAVMRWGMPPQDAFTTQ
1440 1450 1460 1470 1480 1490
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KE2 KSETDLRRLGELVHNGCIKALKDSSSGTERTGGRLGKVKGPTFRISGVQVNAKLVISHEE
:::
CCDS32 WLVRDLRGKTEKEFKAYVSLFMRHLCEPGADGSETFADGVPREGLSRQQVLTRIGVMSLV
1500 1510 1520 1530 1540 1550
>>CCDS3761.1 SMARCA5 gene_id:8467|Hs108|chr4 (1052 aa)
initn: 1466 init1: 609 opt: 1397 Z-score: 840.1 bits: 167.8 E(32554): 1.8e-40
Smith-Waterman score: 1462; 37.1% identity (65.4% similar) in 723 aa overlap (356-1054:55-738)
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 SHIHNTWETEETLKQQNVRGMKKLDNYKKKDQETKRWLKNASP---EDVEYYN--CQQEL
: : .. . .::: .... . ....
CCDS37 ASGGSNSSNKGGPEGVAAQAVASAASAGPADAEMEEIFDDASPGKQKEIQEPDPTYEEKM
30 40 50 60 70 80
390 400 410 420 430
pF1KE2 TDDLHKQYQIVER---IIAHSNQKSAAGYPDYYCKWQ-GLPYSECSWEDGALISKKFQAC
: .... . . ..:: : .: : : . : : . . : :.:
CCDS37 QTDRANRFEYLLKQTELFAHFIQPAAQKTPTSPLKMKPGRPRIKKD-EKQNLLS------
90 100 110 120 130
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 IDEYFSRNQSKTTPFKDCKVLKQRPRFVAL----KKQPSYIGGHEGLELRDYQLNGLNWL
. .: : .: .: ..: . . . . . .:::. . : .:::::. :::::
CCDS37 VGDYRHR---RTEQEEDEELLTESSKATNVCTRFEDSPSYV--KWG-KLRDYQVRGLNWL
140 150 160 170 180 190
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 AHSWCKGNSCILADEMGLGKTIQTISFLNYLFHEHQLYGPFLLVVPLSTLTSWQREIQTW
. .: . :::::::::::.::::.:.:. : ... :: ...:: ::: .:. :.. :
CCDS37 ISLYENGINGILADEMGLGKTLQTISLLGYMKHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMSEFKRW
200 210 220 230 240 250
560 570 580 590 600
pF1KE2 ASQMNAVVYLGDINSR-----NMIRTHEWTHHQTKRLKFNILLTTYEILLKDKAFLGGLN
. . .: .:: ..: ... :: .. .:.::.:.:.:. . .:
CCDS37 VPTLRSVCLIGDKEQRAAFVRDVLLPGEW----------DVCVTSYEMLIKEKSVFKKFN
260 270 280 290 300
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 WAFIGVDEAHRLKNDDSLLYKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFSS
: .. .:::::.::. : : . . .::...:::.:::::::.:.::::::.:..:. :.:
CCDS37 WRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKTTNRLLLTGTPLQNNLHELWSLLNFLLPDVFNS
310 320 330 340 350 360
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 WEDFEEEHGKGREYG----YASLHKELEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRMEMSALQK
.::. . : :: :.::::::.: ::::::: : : . . .: .:.
CCDS37 ADDFDSWFDTNNCLGDQKLVERLHMVLRPFLLRRIKADVEKSLPPKKEVKIYVGLSKMQR
370 380 390 400 410 420
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 QYYKWILTRNYKALSKGSKGSTSGFLNIMMELKKCCNHCYLIKPPDNNEFYNKQEALQHL
..: :: .. :....: . .:::.:.:.::::: ::. . . :. . .::
CCDS37 EWYTRILMKDIDILNSAGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPGPPYTTD---MHL
430 440 450 460 470
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 IRSSGKLILLDKLLIRLRERGNRVLIFSQMVRMLDILAEYLKYRQFPFQRLDGSIKGELR
. .:::...::::: .:.:.:.::::::::.:.:::: .: .:.. . ::::. . :
CCDS37 VTNSGKMVVLDKLLPKLKEQGSRVLIFSQMTRVLDILEDYCMWRNYEYCRLDGQTPHDER
480 490 500 510 520 530
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 KQALDHFNAEGSEDFCFLLSTRAGGLGINLASADTVVIFDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQ
..... .: .: : :.:::::::::::::.::.:...::::::: ::::. :::::::
CCDS37 QDSINAYNEPNSTKFVFMLSTRAGGLGINLATADVVILYDSDWNPQVDLQAMDRAHRIGQ
540 550 560 570 580 590
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 KKQVNIYRLVTKGSVEEDILERAKKKMVLDHLVIQRMDTTGKTVLHTGSAPSSSTPFNKE
: : ..:..: ..::: :.:::. :. :: .:::. :. : .. . ..:.
CCDS37 TKTVRVFRFITDNTVEERIVERAEMKLRLDSIVIQQ----GRLV------DQNLNKIGKD
600 610 620 630 640
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 ELSAILKFGAEELFKEPEGEEQEPQEMDIDEILKRA--ETHENEPGPLTVGDELLSQFKV
:. ... :: ..: ..:.: . ::: ::.:. .: : . .:. : .: .
CCDS37 EMLQMIRHGATHVFA---SKESEITDEDIDGILERGAKKTAEMNEKLSKMGESSLRNFTM
650 660 670 680 690 700
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 ANFSNMDEDDIELEPERNSKNWEEIIPEDQRRRLEEEERQKELEEIYMLPRMRNCAKQIS
. :.. . . : :... . : : .:.:
CCDS37 DTESSVYNFEGEDYREKQKIAFTEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKAPKAPRP
710 720 730 740 750 760
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 FNGSEGRRSRSRRYSGSDSDSISEGKRPKKRGRPRTIPRENIKGFSDAEIRRFIKSYKKF
CCDS37 PKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILFYRKTIGYKVPRNPELPNAAQAQKEEQLKIDEAES
770 780 790 800 810 820
>>CCDS76510.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12 (1905 aa)
initn: 1602 init1: 686 opt: 1398 Z-score: 837.0 bits: 168.1 E(32554): 2.7e-40
Smith-Waterman score: 1989; 31.7% identity (58.2% similar) in 1509 aa overlap (116-1518:317-1755)
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 FWKSSPSILAVQRSAILKKQQQQQQQQQHQASSNSGSEEDSSSSEDSDDSSS-EVKRKKH
:: :: : :.:.:..: . .. .. .::.
CCDS76 LKIKLGGFGSKRKRSSSEDDDLDVESDFDDASINSYSVSDGSTSRSSRSRKKLRTTKKKK
290 300 310 320 330 340
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 KDEDWQMSGSGSPSQSGSDSE-SEEEREKSSCDETESDYEPK--NKVKSRKPQNRSKSKN
: :. . .: .. . : .. : :: :. . . :... . .
CCDS76 KGEEEVTAVDGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHMVCLDPDMEKAPEGKWSCPH
350 360 370 380 390 400
210 220 230 240 250
pF1KE2 GKKILGQKKRQIDSSEEDDDEEDYDND--KRSSRRQATVNVSYKEDEEMKTDS-DDLLEV
.: : . . :.:: .. :. .: ....... : : . :. . ..
CCDS76 CEKEGIQWEAKEDNSEGEEILEEVGGDLEEEDDHHMEFCRVCKDGGELLCCDTCPSSYHI
410 420 430 440 450 460
260 270 280 290 300
pF1KE2 CGEDVPQPEEEEFETIERFMDC-----RIGR----KGATGATTTIYAVEADGDPNAGFEK
. : :: . : . : .. . : . . : :.:::. :
CCDS76 HCLNPPLPEIPNGEWLCPRCTCPALKGKVQKILIWKWGQPPSPTPVPRPPDADPNTPSPK
470 480 490 500 510 520
310 320 330 340 350
pF1KE2 NKE--PGEIQYLIKWKGWSHIHNTWETEETLK---QQNVRGMKKLDNYKKK-------DQ
: : : :...::.: :. : .: .: :. : :.... ... . :.
CCDS76 PLEGRP-ERQFFVKWQGMSYWHCSWVSELQLELHCQVMFRNYQRKNDMDEPPSGDFGGDE
530 540 550 560 570 580
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 ETKRWLKNASPEDVEYYNCQQELTDDLHKQYQIVERIIAHSNQKSAAGYPDYYCKWQGLP
: .: :: .:. .:. .. .. ......::. :: .:. :. : ::. ::
CCDS76 EKSRKRKNKDPKFAEME--ERFYRYGIKPEWMMIHRILNHSVDKK--GHVHYLIKWRDLP
590 600 610 620 630 640
420 430 440 450 460
pF1KE2 YSECSWEDGALISKKFQACIDEYFSRNQ----SKTTPFKDCKVLK----QRPR-------
:.. :::. . . .. . :... . . : : : .: .::
CCDS76 YDQASWESEDVEIQDYDLFKQSYWNHRELMRGEEGRPGKKLKKVKLRKLERPPETPTVDP
650 660 670 680 690 700
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 FVALKKQPSYIGGHEGLELRDYQLNGLNWLAHSWCKGNSCILADEMGLGKTIQTISFLNY
: ..:: :. . : :. ::..::::: :: .:.. :::::::::::.:: ::
CCDS76 TVKYERQPEYLDA-TGGTLHPYQMEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTAVFLYS
710 720 730 740 750 760
530 540 550 560 570
pF1KE2 LFHEHQLYGPFLLVVPLSTLTSWQREIQTWASQMNAVVYLGDINSRNMIRTHEWTHH---
:..: . ::::. .::::. .:.::.. :: .: .:.:.:: .:: .:: .:.. .
CCDS76 LYKEGHSKGPFLVSAPLSTIINWEREFEMWAPDMYVVTYVGDKDSRAIIRENEFSFEDNA
770 780 790 800 810 820
580 590 600 610 620
pF1KE2 -----QTKRLK------FNILLTTYEILLKDKAFLGGLNWAFIGVDEAHRLKNDDSLLYK
...:.: :..:::.::.. : :.::...:: . :::::::::..: ...
CCDS76 IRGGKKASRMKKEASVKFHVLLTSYELITIDMAILGSIDWACLIVDEAHRLKNNQSKFFR
830 840 850 860 870 880
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 TLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFSSWEDFEEEHGK-GREYGYASLH
.: .. .:.::.:::::::.:.::. ::.:. ::.: . : : :: . ..: .::
CCDS76 VLNGYSLQHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFHNLEGFLEEFADIAKEDQIKKLH
890 900 910 920 930 940
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 KELEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRMEMSALQKQYYKWILTRNYKALSKGSKGSTSG
: : .:::.: :: :..:.:.: :.:.:.: .::.:::.:::::..::. . :. .
CCDS76 DMLGPHMLRRLKADVFKNMPSKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNARGGGNQVS
950 960 970 980 990 1000
750 760 770 780 790 800
pF1KE2 FLNIMMELKKCCNHCYL--IKPPDNNEFYNKQEALQHLIRSSGKLILLDKLLIRLRERGN
.::..:.::::::: :: . . .. : . . :::.::::.::.:.: :.: :.
CCDS76 LLNVVMDLKKCCNHPYLFPVAAMEAPKMPNGMYDGSALIRASGKLLLLQKMLKNLKEGGH
1010 1020 1030 1040 1050 1060
810 820 830 840 850 860
pF1KE2 RVLIFSQMVRMLDILAEYLKYRQFPFQRLDGSIKGELRKQALDHFNAEGSEDFCFLLSTR
::::::::..:::.: ..:... . ..:.::.: :..:..:.:.::: :...::::::::
CCDS76 RVLIFSQMTKMLDLLEDFLEHEGYKYERIDGGITGNMRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTR
1070 1080 1090 1100 1110 1120
870 880 890 900 910 920
pF1KE2 AGGLGINLASADTVVIFDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQKKQVNIYRLVTKGSVEEDILER
:::::::::.::::.:.::::::.::.:: .:::::::.:.: :::.::..:::: : .
CCDS76 AGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQV
1130 1140 1150 1160 1170 1180
930 940 950 960 970 980
pF1KE2 AKKKMVLDHLVIQRMDTTGKTVLHTGSAPSSSTPFNKEELSAILKFGAEELFKEP-----
:::::.: :::. : .:: :: ..:.::. :::::.:::::.
CCDS76 AKKKMMLTHLVV-RPGLGSKT----GS-------MSKQELDDILKFGTEELFKDEATDGG
1190 1200 1210 1220
990 1000 1010 1020 1030
pF1KE2 ----EGEEQEPQEMD---IDEILKRAETHENEPGPLTVGDELLSQFKVANFSNMDED-DI
:::.. ..: :...: : . :.: : .: ::.::::.. .:.
CCDS76 GDNKEGEDSSVIHYDDKAIERLLDRNQD-ETEDTELQGMNEYLSSFKVAQYVVREEEMGE
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KE2 ELEPERNSKNWEEIIPEDQRRRLEEEERQKELEEI-YMLPRMRNCAKQISFN-GSEGRRS
: : ::. . :: . : ..: ... ... :.. : . . ::...: ::. :.
CCDS76 EEEVEREIIKQEESVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIRKQVNYNDGSQEDRD
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1100 1110 1120 1130
pF1KE2 RSRRYSGSDSD-SIS--EG-----------KRPKKRG----RPRTIPRENIKGFSDAEIR
. : ..:: :.. :: .::...: . . .: . .. :.
CCDS76 WQDDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDERSEAPRRPSRKGLRNDKDKPLPPLLARVGGNIEVL
1350 1360 1370 1380 1390 1400
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE2 RF-IKSYKKFGGPLERLDAIARDAELVDKSETDLRRLGELVHNGCIKALKDSSSGTERTG
: .. : : . . : .:: .. ::: .: : .: : :
CCDS76 GFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKSE-------KEFKAYVSLFMRHL
1410 1420 1430 1440 1450 1460
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KE2 GRLGKVKGPTFRISGVQVNAKLVISHEEELIPLHKSIPSDPEERKQYTIPCHTKAAHFDI
. : . :: .:: .. : .: : . . : ::. . : .
CCDS76 CEPGADGAETF-ADGVPREG-LSRQHVLTRIGVMSLI------RKKV-----QEFEHVNG
1470 1480 1490 1500
1260 1270 1280 1290 1300
pF1KE2 DWGKEDDSNLLIGIYEYGYGSWEMIKMDPDLSLTHKI-LPDDP-DKKPQAKQLQTRADYL
:. . ... : ::. : . : :. : : .:.. :.
CCDS76 RWSMPELAEVE-----------ENKKMSQPGSPSPKTPTPSTPGDTQPNTPAPVPPAEDG
1510 1520 1530 1540 1550
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KE2 IKLLSRDLAKKEALSGAGSSKRRKARAKKNKAMKSIKVKEEIKSDSSPLPSEKSDEDDDK
::. .: ..:.. : .: .:: . :. ..: :. .:.:
CCDS76 IKIEENSLKEEESIEG-------------EKEVKSTAPETAIECTQAPAPA----SEDEK
1560 1570 1580 1590
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KE2 LSESKSDGRERSKKSSV---SDAPVHITASGEP-VPISEESEELDQKTFSIC----KERM
. .:.:. .:. : .. :.. .: : ::. .: . . :..
CCDS76 VVVEPPEGEEKVEKAEVKERTEEPMETEPKGAADVEKVEEKSAIDLTPIVVEDKEEKKEE
1600 1610 1620 1630 1640 1650
1430 1440 1450 1460 1470
pF1KE2 RPVKAALKQLDRPEKGLSEREQLEHTRQ-CLIKIGDH-ITECLKEYTNPEQIKQWRKNLW
. : .. : . : :....: .. .: ...:.: .:: . . : :. :. .
CCDS76 EEKKEVMLQNGETPKDLNDEKQKKNIKQRFMFNIADGGFTELHSLWQNEERAATVTKKTY
1660 1670 1680 1690 1700 1710
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KE2 IFVSKFTEFDARKLHKLYKHAIKKRQESQQNSDQNSNLNPHVIRNPDVERLKENTNHDDS
. . . : : . .:. . :. : :. . . ::
CCDS76 EIWHR--RHDYWLLAGIINHGYARWQDIQ-NDPRYAILNEPFKGEMNRGNFLEIKNKFLA
1720 1730 1740 1750 1760 1770
1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KE2 SRDSYSSDRHLTQYHDHHKDRHQGDSYKKSDSRKRPYSSFSNGKDHRDWDHYKQDSRYYS
CCDS76 RRFKLLEQALVIEEQLRRAAYLNMSEDPSHPSMALNTRFAEVECLAESHQHLSKESMAGN
1780 1790 1800 1810 1820 1830
>>CCDS8552.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12 (1912 aa)
initn: 1602 init1: 686 opt: 1398 Z-score: 837.0 bits: 168.1 E(32554): 2.7e-40
Smith-Waterman score: 1989; 31.7% identity (58.2% similar) in 1509 aa overlap (116-1518:324-1762)
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 FWKSSPSILAVQRSAILKKQQQQQQQQQHQASSNSGSEEDSSSSEDSDDSSS-EVKRKKH
:: :: : :.:.:..: . .. .. .::.
CCDS85 LKIKLGGFGSKRKRSSSEDDDLDVESDFDDASINSYSVSDGSTSRSSRSRKKLRTTKKKK
300 310 320 330 340 350
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 KDEDWQMSGSGSPSQSGSDSE-SEEEREKSSCDETESDYEPK--NKVKSRKPQNRSKSKN
: :. . .: .. . : .. : :: :. . . :... . .
CCDS85 KGEEEVTAVDGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHMVCLDPDMEKAPEGKWSCPH
360 370 380 390 400 410
210 220 230 240 250
pF1KE2 GKKILGQKKRQIDSSEEDDDEEDYDND--KRSSRRQATVNVSYKEDEEMKTDS-DDLLEV
.: : . . :.:: .. :. .: ....... : : . :. . ..
CCDS85 CEKEGIQWEAKEDNSEGEEILEEVGGDLEEEDDHHMEFCRVCKDGGELLCCDTCPSSYHI
420 430 440 450 460 470
260 270 280 290 300
pF1KE2 CGEDVPQPEEEEFETIERFMDC-----RIGR----KGATGATTTIYAVEADGDPNAGFEK
. : :: . : . : .. . : . . : :.:::. :
CCDS85 HCLNPPLPEIPNGEWLCPRCTCPALKGKVQKILIWKWGQPPSPTPVPRPPDADPNTPSPK
480 490 500 510 520 530
310 320 330 340 350
pF1KE2 NKE--PGEIQYLIKWKGWSHIHNTWETEETLK---QQNVRGMKKLDNYKKK-------DQ
: : : :...::.: :. : .: .: :. : :.... ... . :.
CCDS85 PLEGRP-ERQFFVKWQGMSYWHCSWVSELQLELHCQVMFRNYQRKNDMDEPPSGDFGGDE
540 550 560 570 580 590
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 ETKRWLKNASPEDVEYYNCQQELTDDLHKQYQIVERIIAHSNQKSAAGYPDYYCKWQGLP
: .: :: .:. .:. .. .. ......::. :: .:. :. : ::. ::
CCDS85 EKSRKRKNKDPKFAEME--ERFYRYGIKPEWMMIHRILNHSVDKK--GHVHYLIKWRDLP
600 610 620 630 640
420 430 440 450 460
pF1KE2 YSECSWEDGALISKKFQACIDEYFSRNQ----SKTTPFKDCKVLK----QRPR-------
:.. :::. . . .. . :... . . : : : .: .::
CCDS85 YDQASWESEDVEIQDYDLFKQSYWNHRELMRGEEGRPGKKLKKVKLRKLERPPETPTVDP
650 660 670 680 690 700
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 FVALKKQPSYIGGHEGLELRDYQLNGLNWLAHSWCKGNSCILADEMGLGKTIQTISFLNY
: ..:: :. . : :. ::..::::: :: .:.. :::::::::::.:: ::
CCDS85 TVKYERQPEYLDA-TGGTLHPYQMEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTAVFLYS
710 720 730 740 750 760
530 540 550 560 570
pF1KE2 LFHEHQLYGPFLLVVPLSTLTSWQREIQTWASQMNAVVYLGDINSRNMIRTHEWTHH---
:..: . ::::. .::::. .:.::.. :: .: .:.:.:: .:: .:: .:.. .
CCDS85 LYKEGHSKGPFLVSAPLSTIINWEREFEMWAPDMYVVTYVGDKDSRAIIRENEFSFEDNA
770 780 790 800 810 820
580 590 600 610 620
pF1KE2 -----QTKRLK------FNILLTTYEILLKDKAFLGGLNWAFIGVDEAHRLKNDDSLLYK
...:.: :..:::.::.. : :.::...:: . :::::::::..: ...
CCDS85 IRGGKKASRMKKEASVKFHVLLTSYELITIDMAILGSIDWACLIVDEAHRLKNNQSKFFR
830 840 850 860 870 880
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 TLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFSSWEDFEEEHGK-GREYGYASLH
.: .. .:.::.:::::::.:.::. ::.:. ::.: . : : :: . ..: .::
CCDS85 VLNGYSLQHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFHNLEGFLEEFADIAKEDQIKKLH
890 900 910 920 930 940
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 KELEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRMEMSALQKQYYKWILTRNYKALSKGSKGSTSG
: : .:::.: :: :..:.:.: :.:.:.: .::.:::.:::::..::. . :. .
CCDS85 DMLGPHMLRRLKADVFKNMPSKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNARGGGNQVS
950 960 970 980 990 1000
750 760 770 780 790 800
pF1KE2 FLNIMMELKKCCNHCYL--IKPPDNNEFYNKQEALQHLIRSSGKLILLDKLLIRLRERGN
.::..:.::::::: :: . . .. : . . :::.::::.::.:.: :.: :.
CCDS85 LLNVVMDLKKCCNHPYLFPVAAMEAPKMPNGMYDGSALIRASGKLLLLQKMLKNLKEGGH
1010 1020 1030 1040 1050 1060
810 820 830 840 850 860
pF1KE2 RVLIFSQMVRMLDILAEYLKYRQFPFQRLDGSIKGELRKQALDHFNAEGSEDFCFLLSTR
::::::::..:::.: ..:... . ..:.::.: :..:..:.:.::: :...::::::::
CCDS85 RVLIFSQMTKMLDLLEDFLEHEGYKYERIDGGITGNMRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTR
1070 1080 1090 1100 1110 1120
870 880 890 900 910 920
pF1KE2 AGGLGINLASADTVVIFDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQKKQVNIYRLVTKGSVEEDILER
:::::::::.::::.:.::::::.::.:: .:::::::.:.: :::.::..:::: : .
CCDS85 AGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQV
1130 1140 1150 1160 1170 1180
930 940 950 960 970 980
pF1KE2 AKKKMVLDHLVIQRMDTTGKTVLHTGSAPSSSTPFNKEELSAILKFGAEELFKEP-----
:::::.: :::. : .:: :: ..:.::. :::::.:::::.
CCDS85 AKKKMMLTHLVV-RPGLGSKT----GS-------MSKQELDDILKFGTEELFKDEATDGG
1190 1200 1210 1220 1230
990 1000 1010 1020 1030
pF1KE2 ----EGEEQEPQEMD---IDEILKRAETHENEPGPLTVGDELLSQFKVANFSNMDED-DI
:::.. ..: :...: : . :.: : .: ::.::::.. .:.
CCDS85 GDNKEGEDSSVIHYDDKAIERLLDRNQD-ETEDTELQGMNEYLSSFKVAQYVVREEEMGE
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KE2 ELEPERNSKNWEEIIPEDQRRRLEEEERQKELEEI-YMLPRMRNCAKQISFN-GSEGRRS
: : ::. . :: . : ..: ... ... :.. : . . ::...: ::. :.
CCDS85 EEEVEREIIKQEESVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIRKQVNYNDGSQEDRD
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1100 1110 1120 1130
pF1KE2 RSRRYSGSDSD-SIS--EG-----------KRPKKRG----RPRTIPRENIKGFSDAEIR
. : ..:: :.. :: .::...: . . .: . .. :.
CCDS85 WQDDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDERSEAPRRPSRKGLRNDKDKPLPPLLARVGGNIEVL
1360 1370 1380 1390 1400 1410
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE2 RF-IKSYKKFGGPLERLDAIARDAELVDKSETDLRRLGELVHNGCIKALKDSSSGTERTG
: .. : : . . : .:: .. ::: .: : .: : :
CCDS85 GFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKSE-------KEFKAYVSLFMRHL
1420 1430 1440 1450 1460
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KE2 GRLGKVKGPTFRISGVQVNAKLVISHEEELIPLHKSIPSDPEERKQYTIPCHTKAAHFDI
. : . :: .:: .. : .: : . . : ::. . : .
CCDS85 CEPGADGAETF-ADGVPREG-LSRQHVLTRIGVMSLI------RKKV-----QEFEHVNG
1470 1480 1490 1500 1510
1260 1270 1280 1290 1300
pF1KE2 DWGKEDDSNLLIGIYEYGYGSWEMIKMDPDLSLTHKI-LPDDP-DKKPQAKQLQTRADYL
:. . ... : ::. : . : :. : : .:.. :.
CCDS85 RWSMPELAEVE-----------ENKKMSQPGSPSPKTPTPSTPGDTQPNTPAPVPPAEDG
1520 1530 1540 1550 1560
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KE2 IKLLSRDLAKKEALSGAGSSKRRKARAKKNKAMKSIKVKEEIKSDSSPLPSEKSDEDDDK
::. .: ..:.. : .: .:: . :. ..: :. .:.:
CCDS85 IKIEENSLKEEESIEG-------------EKEVKSTAPETAIECTQAPAPA----SEDEK
1570 1580 1590 1600
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KE2 LSESKSDGRERSKKSSV---SDAPVHITASGEP-VPISEESEELDQKTFSIC----KERM
. .:.:. .:. : .. :.. .: : ::. .: . . :..
CCDS85 VVVEPPEGEEKVEKAEVKERTEEPMETEPKGAADVEKVEEKSAIDLTPIVVEDKEEKKEE
1610 1620 1630 1640 1650 1660
1430 1440 1450 1460 1470
pF1KE2 RPVKAALKQLDRPEKGLSEREQLEHTRQ-CLIKIGDH-ITECLKEYTNPEQIKQWRKNLW
. : .. : . : :....: .. .: ...:.: .:: . . : :. :. .
CCDS85 EEKKEVMLQNGETPKDLNDEKQKKNIKQRFMFNIADGGFTELHSLWQNEERAATVTKKTY
1670 1680 1690 1700 1710 1720
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KE2 IFVSKFTEFDARKLHKLYKHAIKKRQESQQNSDQNSNLNPHVIRNPDVERLKENTNHDDS
. . . : : . .:. . :. : :. . . ::
CCDS85 EIWHR--RHDYWLLAGIINHGYARWQDIQ-NDPRYAILNEPFKGEMNRGNFLEIKNKFLA
1730 1740 1750 1760 1770 1780
1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KE2 SRDSYSSDRHLTQYHDHHKDRHQGDSYKKSDSRKRPYSSFSNGKDHRDWDHYKQDSRYYS
CCDS85 RRFKLLEQALVIEEQLRRAAYLNMSEDPSHPSMALNTRFAEVECLAESHQHLSKESMAGN
1790 1800 1810 1820 1830 1840
>>CCDS927.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 (897 aa)
initn: 1392 init1: 317 opt: 1370 Z-score: 825.1 bits: 164.8 E(32554): 1.2e-39
Smith-Waterman score: 1409; 38.2% identity (66.3% similar) in 718 aa overlap (460-1165:25-707)
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 SKKFQACIDEYFSRNQSKTTPFKDCKVLKQRPRFVALKKQPSYIGGHEGLELRDYQLNGL
: . . ...: : :..::.:::.:.
CCDS92 MERAGATSRGGQAPGFLLRLHTEGRAEAARVQEQDLRQWGLTGIHLRSYQLEGV
10 20 30 40 50
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 NWLAHSWCKGNSCILADEMGLGKTIQTISFLNYLFHEHQLYGPFLLVVPLSTLTSWQREI
::::. . :.:::.:::::::: :::... :: . . ::::.. :::.:..:..:.
CCDS92 NWLAQRFHCQNGCILGDEMGLGKTCQTIALFIYLAGRLNDEGPFLILCPLSVLSNWKEEM
60 70 80 90 100 110
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 QTWASQMNAVVYLGDINSRNMIRTHEWTHHQTKRLKFNILLTTYEILLKDKAFLGGLNWA
: .: .. :.: :: . : .. . .. .:..::::::: ::: .:: .. :.
CCDS92 QRFAPGLSCVTYAGDKEERACLQ-----QDLKQESRFHVLLTTYEICLKDASFLKSFPWS
120 130 140 150 160
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 FIGVDEAHRLKNDDSLLYKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFSSWE
. :::::::::..:::.::: .:. ::.::::.::::.::.::: :. :. ::. :
CCDS92 VLVVDEAHRLKNQSSLLHKTLSEFSVVFSLLLTGTPIQNSLQELYSLLSFVEPDLFSKEE
170 180 190 200 210 220
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 --DFEEEHGK-GREYGYAS-LHKELEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRMEMSALQKQY
:: ... .: :: ::: :.:::::::: .: :: :.: .. ::::::.:
CCDS92 VGDFIQRYQDIEKESESASELHKLLQPFLLRRVKAEVATELPKKTEVVIYHGMSALQKKY
230 240 250 260 270 280
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 YKWILTRNYKALSKGSKGSTSGFLNIMMELKKCCNHCYLIKPPDNNEFYNKQEALQHLIR
:: :: .. :. . . ... . ::. .:.:: .: ::. . . : :. .:: .
CCDS92 YKAILMKDLDAFENETAKKVK-LQNILSQLRKCVDHPYLFDGVEPEPF----EVGDHLTE
290 300 310 320 330 340
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 SSGKLILLDKLLIRLRERGNRVLIFSQMVRMLDILAEYLKYRQFPFQRLDGSIKGELRKQ
.:::: :::::: : :.:::.::::..::::: .:. :: . ..:.:::..:: :.
CCDS92 ASGKLHLLDKLLAFLYSGGHRVLLFSQMTQMLDILQDYMDYRGYSYERVDGSVRGEERHL
350 360 370 380 390 400
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 ALDHFNAEGSEDFCFLLSTRAGGLGINLASADTVVIFDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQKK
:. .:. . : :::::::::.:.::..::::.. :::.:::::::: ::::::::.:
CCDS92 AIKNFGQQ--PIFVFLLSTRAGGVGMNLTAADTVIFVDSDFNPQNDLQAAARAHRIGQNK
410 420 430 440 450 460
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 QVNIYRLVTKGSVEEDILERAKKKMVLDHLVIQRMDTTGKTVLHTGSAPSSSTPFNKEEL
.:.. ::. . .::: . ..: .:. : ...:. : .. :.... . .:
CCDS92 SVKVIRLIGRDTVEEIVYRKAASKLQLTNMIIE-----GGHFTLGAQKPAADADL---QL
470 480 490 500 510
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 SAILKFGAEELFKEPEGEEQEPQEMDIDEILKRAETHE--NEPGPLTVGDELLSQFKVAN
: ::::: ..:. :: .. :.:.. :: ... . .. : . : .. .
CCDS92 SEILKFGLDKLLAS-EGSTMD--EIDLESILGETKDGQWVSDALPAAEGGSRDQEEGKNH
520 530 540 550 560 570
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 FSNMDEDDIELEPER-NSKNWEEIIPEDQRRRLEEEERQKELEEIYMLPRMRNCAKQISF
. .. : :: . . :..:... . :. ::. .. . .:: .. .
CCDS92 MYLFEGKDYSKEPSKEDRKSFEQLV-NLQKTLLEKASQEGR--------SLRNKGSVLIP
580 590 600 610 620
1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE2 NGSEGRRSRSRRYSGSDSDSISEGKRPKKRGRPRTIPRENIKGFSDAEIRRFI-----KS
. :: .:.: : . .. . :: . .. : . .:. . .:: .. . ..
CCDS92 GLVEGSTKRKRVLSPEELED-RQKKRQEAAAKRRRLIEEKKRQKEEAEHKKKMAWWESNN
630 640 650 660 670 680
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE2 YKKFGGPLERLDAIARDAELVDKSETDLRRLGELVHNGCIKALKDSSSGTERTGGRLGKV
:..: : :. . .: : ..: ..:
CCDS92 YQSFCLPSEESEP--EDLENGEESSAELDYQDPDATSLKYVSGDVTHPQAGAEDALIVHC
690 700 710 720 730
1709 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 20:14:56 2016 done: Mon Nov 7 20:14:57 2016
Total Scan time: 4.780 Total Display time: 0.670
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]