Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2450
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2450, 321 aa
1>>>pF1KE2450 321 - 321 aa - 321 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1459+/-0.00069; mu= 16.8685+/- 0.041
mean_var=71.1046+/-14.014, 0's: 0 Z-trim(110.3): 54 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.152099
statistics sampled from 11617 (11672) to 11617 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.724), E-opt: 0.2 (0.349), width: 16
Scan time: 1.180
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS42008.1 CHRFAM7A gene_id:89832|Hs109|chr15 ( 321) 2206 492.9 1.5e-139
CCDS32184.1 CHRFAM7A gene_id:89832|Hs109|chr15 ( 412) 2206 492.9 1.8e-139
CCDS10027.1 CHRNA7 gene_id:1139|Hs109|chr15 ( 502) 2206 493.0 2.1e-139
CCDS53924.1 CHRNA7 gene_id:1139|Hs109|chr15 ( 531) 2206 493.0 2.2e-139
CCDS64856.1 CHRNA2 gene_id:1135|Hs109|chr8 ( 514) 682 158.6 1e-38
CCDS6059.1 CHRNA2 gene_id:1135|Hs109|chr8 ( 529) 682 158.6 1e-38
CCDS10305.1 CHRNA3 gene_id:1136|Hs109|chr15 ( 505) 656 152.9 5.2e-37
CCDS13517.1 CHRNA4 gene_id:1137|Hs109|chr20 ( 627) 577 135.6 1e-31
CCDS53964.1 CHRNA3 gene_id:1136|Hs109|chr15 ( 489) 567 133.3 3.8e-31
CCDS3459.1 CHRNA9 gene_id:55584|Hs109|chr4 ( 479) 563 132.5 6.9e-31
CCDS7745.1 CHRNA10 gene_id:57053|Hs109|chr11 ( 450) 557 131.1 1.6e-30
CCDS10306.1 CHRNB4 gene_id:1143|Hs109|chr15 ( 498) 538 127.0 3.2e-29
CCDS1070.1 CHRNB2 gene_id:1141|Hs109|chr1 ( 502) 525 124.1 2.3e-28
CCDS56536.1 CHRNA6 gene_id:8973|Hs109|chr8 ( 479) 522 123.5 3.5e-28
CCDS6135.1 CHRNA6 gene_id:8973|Hs109|chr8 ( 494) 522 123.5 3.6e-28
CCDS2261.1 CHRNA1 gene_id:1134|Hs109|chr2 ( 457) 509 120.6 2.5e-27
CCDS33331.1 CHRNA1 gene_id:1134|Hs109|chr2 ( 482) 509 120.6 2.6e-27
CCDS11106.1 CHRNB1 gene_id:1140|Hs109|chr17 ( 501) 453 108.3 1.3e-23
CCDS58754.1 CHRND gene_id:1144|Hs109|chr2 ( 502) 437 104.8 1.5e-22
CCDS2494.1 CHRND gene_id:1144|Hs109|chr2 ( 517) 437 104.8 1.5e-22
CCDS10304.1 CHRNA5 gene_id:1138|Hs109|chr15 ( 468) 428 102.8 5.6e-22
CCDS6134.1 CHRNB3 gene_id:1142|Hs109|chr8 ( 458) 412 99.3 6.3e-21
CCDS53710.1 HTR3A gene_id:3359|Hs109|chr11 ( 463) 375 91.2 1.8e-18
CCDS8365.2 HTR3A gene_id:3359|Hs109|chr11 ( 484) 375 91.2 1.8e-18
CCDS33400.1 CHRNG gene_id:1146|Hs109|chr2 ( 517) 367 89.5 6.5e-18
CCDS11058.1 CHRNE gene_id:1145|Hs109|chr17 ( 493) 354 86.6 4.5e-17
CCDS3250.1 HTR3C gene_id:170572|Hs109|chr3 ( 447) 271 68.4 1.3e-11
CCDS8366.2 HTR3A gene_id:3359|Hs109|chr11 ( 516) 268 67.7 2.2e-11
CCDS58869.1 HTR3E gene_id:285242|Hs109|chr3 ( 441) 265 67.0 3.1e-11
CCDS58868.1 HTR3E gene_id:285242|Hs109|chr3 ( 456) 265 67.0 3.2e-11
CCDS58870.1 HTR3E gene_id:285242|Hs109|chr3 ( 456) 265 67.0 3.2e-11
CCDS3251.1 HTR3E gene_id:285242|Hs109|chr3 ( 471) 265 67.1 3.3e-11
CCDS58871.1 HTR3E gene_id:285242|Hs109|chr3 ( 482) 265 67.1 3.4e-11
>>CCDS42008.1 CHRFAM7A gene_id:89832|Hs109|chr15 (321 aa)
initn: 2206 init1: 2206 opt: 2206 Z-score: 2619.1 bits: 492.9 E(33420): 1.5e-139
Smith-Waterman score: 2206; 100.0% identity (100.0% similar) in 321 aa overlap (1-321:1-321)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MQEADISGYIPNGEWDLVGIPGKRSERFYECCKEPYPDVTFTVTMRRRTLYYGLNLLIPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MQEADISGYIPNGEWDLVGIPGKRSERFYECCKEPYPDVTFTVTMRRRTLYYGLNLLIPC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLISALALLVFLLPADSGEKISLGITVLLSLTVFMLLVAEIMPATSDSVPLIAQYFASTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VLISALALLVFLLPADSGEKISLGITVLLSLTVFMLLVAEIMPATSDSVPLIAQYFASTM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 IIVGLSVVVTVIVLQYHHHDPDGGKMPKWTRVILLNWCAWFLRMKRPGEDKVRPACQHKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IIVGLSVVVTVIVLQYHHHDPDGGKMPKWTRVILLNWCAWFLRMKRPGEDKVRPACQHKQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 RRCSLASVEMSAVAPPPASNGNLLYIGFRGLDGVHCVPTPDSGVVCGRMACSPTHDEHLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RRCSLASVEMSAVAPPPASNGNLLYIGFRGLDGVHCVPTPDSGVVCGRMACSPTHDEHLL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 HGGQPPEGDPDLAKILEEVRYIANRFRCQDESEAVCSEWKFAACVVDRLCLMAFSVFTII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HGGQPPEGDPDLAKILEEVRYIANRFRCQDESEAVCSEWKFAACVVDRLCLMAFSVFTII
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE2 CTIGILMSAPNFVEAVSKDFA
:::::::::::::::::::::
CCDS42 CTIGILMSAPNFVEAVSKDFA
310 320
>>CCDS32184.1 CHRFAM7A gene_id:89832|Hs109|chr15 (412 aa)
initn: 2206 init1: 2206 opt: 2206 Z-score: 2617.6 bits: 492.9 E(33420): 1.8e-139
Smith-Waterman score: 2206; 100.0% identity (100.0% similar) in 321 aa overlap (1-321:92-412)
10 20 30
pF1KE2 MQEADISGYIPNGEWDLVGIPGKRSERFYE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IDVRWFPFDVQHCKLKFGSWSYGGWSLDLQMQEADISGYIPNGEWDLVGIPGKRSERFYE
70 80 90 100 110 120
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 CCKEPYPDVTFTVTMRRRTLYYGLNLLIPCVLISALALLVFLLPADSGEKISLGITVLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CCKEPYPDVTFTVTMRRRTLYYGLNLLIPCVLISALALLVFLLPADSGEKISLGITVLLS
130 140 150 160 170 180
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 LTVFMLLVAEIMPATSDSVPLIAQYFASTMIIVGLSVVVTVIVLQYHHHDPDGGKMPKWT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LTVFMLLVAEIMPATSDSVPLIAQYFASTMIIVGLSVVVTVIVLQYHHHDPDGGKMPKWT
190 200 210 220 230 240
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 RVILLNWCAWFLRMKRPGEDKVRPACQHKQRRCSLASVEMSAVAPPPASNGNLLYIGFRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RVILLNWCAWFLRMKRPGEDKVRPACQHKQRRCSLASVEMSAVAPPPASNGNLLYIGFRG
250 260 270 280 290 300
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 LDGVHCVPTPDSGVVCGRMACSPTHDEHLLHGGQPPEGDPDLAKILEEVRYIANRFRCQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LDGVHCVPTPDSGVVCGRMACSPTHDEHLLHGGQPPEGDPDLAKILEEVRYIANRFRCQD
310 320 330 340 350 360
280 290 300 310 320
pF1KE2 ESEAVCSEWKFAACVVDRLCLMAFSVFTIICTIGILMSAPNFVEAVSKDFA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ESEAVCSEWKFAACVVDRLCLMAFSVFTIICTIGILMSAPNFVEAVSKDFA
370 380 390 400 410
>>CCDS10027.1 CHRNA7 gene_id:1139|Hs109|chr15 (502 aa)
initn: 2206 init1: 2206 opt: 2206 Z-score: 2616.4 bits: 493.0 E(33420): 2.1e-139
Smith-Waterman score: 2206; 100.0% identity (100.0% similar) in 321 aa overlap (1-321:182-502)
10 20 30
pF1KE2 MQEADISGYIPNGEWDLVGIPGKRSERFYE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IDVRWFPFDVQHCKLKFGSWSYGGWSLDLQMQEADISGYIPNGEWDLVGIPGKRSERFYE
160 170 180 190 200 210
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 CCKEPYPDVTFTVTMRRRTLYYGLNLLIPCVLISALALLVFLLPADSGEKISLGITVLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CCKEPYPDVTFTVTMRRRTLYYGLNLLIPCVLISALALLVFLLPADSGEKISLGITVLLS
220 230 240 250 260 270
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 LTVFMLLVAEIMPATSDSVPLIAQYFASTMIIVGLSVVVTVIVLQYHHHDPDGGKMPKWT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LTVFMLLVAEIMPATSDSVPLIAQYFASTMIIVGLSVVVTVIVLQYHHHDPDGGKMPKWT
280 290 300 310 320 330
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 RVILLNWCAWFLRMKRPGEDKVRPACQHKQRRCSLASVEMSAVAPPPASNGNLLYIGFRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RVILLNWCAWFLRMKRPGEDKVRPACQHKQRRCSLASVEMSAVAPPPASNGNLLYIGFRG
340 350 360 370 380 390
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 LDGVHCVPTPDSGVVCGRMACSPTHDEHLLHGGQPPEGDPDLAKILEEVRYIANRFRCQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LDGVHCVPTPDSGVVCGRMACSPTHDEHLLHGGQPPEGDPDLAKILEEVRYIANRFRCQD
400 410 420 430 440 450
280 290 300 310 320
pF1KE2 ESEAVCSEWKFAACVVDRLCLMAFSVFTIICTIGILMSAPNFVEAVSKDFA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ESEAVCSEWKFAACVVDRLCLMAFSVFTIICTIGILMSAPNFVEAVSKDFA
460 470 480 490 500
>>CCDS53924.1 CHRNA7 gene_id:1139|Hs109|chr15 (531 aa)
initn: 2206 init1: 2206 opt: 2206 Z-score: 2616.0 bits: 493.0 E(33420): 2.2e-139
Smith-Waterman score: 2206; 100.0% identity (100.0% similar) in 321 aa overlap (1-321:211-531)
10 20 30
pF1KE2 MQEADISGYIPNGEWDLVGIPGKRSERFYE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IDVRWFPFDVQHCKLKFGSWSYGGWSLDLQMQEADISGYIPNGEWDLVGIPGKRSERFYE
190 200 210 220 230 240
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 CCKEPYPDVTFTVTMRRRTLYYGLNLLIPCVLISALALLVFLLPADSGEKISLGITVLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 CCKEPYPDVTFTVTMRRRTLYYGLNLLIPCVLISALALLVFLLPADSGEKISLGITVLLS
250 260 270 280 290 300
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 LTVFMLLVAEIMPATSDSVPLIAQYFASTMIIVGLSVVVTVIVLQYHHHDPDGGKMPKWT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LTVFMLLVAEIMPATSDSVPLIAQYFASTMIIVGLSVVVTVIVLQYHHHDPDGGKMPKWT
310 320 330 340 350 360
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 RVILLNWCAWFLRMKRPGEDKVRPACQHKQRRCSLASVEMSAVAPPPASNGNLLYIGFRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RVILLNWCAWFLRMKRPGEDKVRPACQHKQRRCSLASVEMSAVAPPPASNGNLLYIGFRG
370 380 390 400 410 420
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 LDGVHCVPTPDSGVVCGRMACSPTHDEHLLHGGQPPEGDPDLAKILEEVRYIANRFRCQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LDGVHCVPTPDSGVVCGRMACSPTHDEHLLHGGQPPEGDPDLAKILEEVRYIANRFRCQD
430 440 450 460 470 480
280 290 300 310 320
pF1KE2 ESEAVCSEWKFAACVVDRLCLMAFSVFTIICTIGILMSAPNFVEAVSKDFA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ESEAVCSEWKFAACVVDRLCLMAFSVFTIICTIGILMSAPNFVEAVSKDFA
490 500 510 520 530
>>CCDS64856.1 CHRNA2 gene_id:1135|Hs109|chr8 (514 aa)
initn: 690 init1: 568 opt: 682 Z-score: 808.9 bits: 158.6 E(33420): 1e-38
Smith-Waterman score: 683; 39.4% identity (65.8% similar) in 322 aa overlap (2-313:203-510)
10 20 30
pF1KE2 MQEADISGYIPNGEWDLVGIPGKRSERFYEC
: .:.. : .::: .:. : . . :.:
CCDS64 TFFPFDQQNCKMKFGSWTYDKAKIDLEQMEQTVDLKDYWESGEWAIVNATGTYNSKKYDC
180 190 200 210 220 230
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 CKEPYPDVTFTVTMRRRTLYYGLNLLIPCVLISALALLVFLLPADSGEKISLGITVLLSL
: : :::::.. ..:: :.: .::.:::.::: :..::: ::.: ::::.: :.:::::
CCDS64 CAEIYPDVTYAFVIRRLPLFYTINLIIPCLLISCLTVLVFYLPSDCGEKITLCISVLLSL
240 250 260 270 280 290
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 TVFMLLVAEIMPATSDSVPLIAQYFASTMIIVGLSVVVTVIVLQYHHHDPDGGKMPKWTR
:::.::..::.:.:: .:::..:. :::.: ::.:.::.::. ::..:. ::.:.:
CCDS64 TVFLLLITEIIPSTSLVIPLIGEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHHRSPSTHTMPHWVR
300 310 320 330 340 350
160 170 180 190 200
pF1KE2 VILLNWCA--WFLRMKRPGEDKVRPACQHKQRRCSLASVEMSAVAPPPASN--GNLLYIG
::. :. :.: :.:: : . : ...: :: .. .
CCDS64 GALLG-CVPRWLL-MNRPP-----PPVE----LCHPLRLKLSPSYHWLESNVDAEEREVV
360 370 380 390 400
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 FRGLDGVHCVP--TPDSGVVC--GRM--ACSPTHDEHLLHGGQPPEGDPDLAKILEEVRY
. : :. .:. :..: :.. . : . : ::. :. .: . : :: :.:
CCDS64 VEEEDRWACAGHVAPSVGTLCSHGHLHSGASGPKAEALLQEGEL-LLSPHMQKALEGVHY
410 420 430 440 450 460
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 IANRFRCQDESEAVCSEWKFAACVVDRLCLMAFSVFTIICTIGILMSAPNFVEAVSKDFA
::...: .: . .: .::..: :.::. : : . .. :::... : :.
CCDS64 IADHLRSEDADSSVKEDWKYVAMVIDRIFLWLFIIVCFLGTIGLFL--PPFLAGMI
470 480 490 500 510
>>CCDS6059.1 CHRNA2 gene_id:1135|Hs109|chr8 (529 aa)
initn: 690 init1: 568 opt: 682 Z-score: 808.7 bits: 158.6 E(33420): 1e-38
Smith-Waterman score: 683; 39.4% identity (65.8% similar) in 322 aa overlap (2-313:218-525)
10 20 30
pF1KE2 MQEADISGYIPNGEWDLVGIPGKRSERFYEC
: .:.. : .::: .:. : . . :.:
CCDS60 TFFPFDQQNCKMKFGSWTYDKAKIDLEQMEQTVDLKDYWESGEWAIVNATGTYNSKKYDC
190 200 210 220 230 240
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 CKEPYPDVTFTVTMRRRTLYYGLNLLIPCVLISALALLVFLLPADSGEKISLGITVLLSL
: : :::::.. ..:: :.: .::.:::.::: :..::: ::.: ::::.: :.:::::
CCDS60 CAEIYPDVTYAFVIRRLPLFYTINLIIPCLLISCLTVLVFYLPSDCGEKITLCISVLLSL
250 260 270 280 290 300
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 TVFMLLVAEIMPATSDSVPLIAQYFASTMIIVGLSVVVTVIVLQYHHHDPDGGKMPKWTR
:::.::..::.:.:: .:::..:. :::.: ::.:.::.::. ::..:. ::.:.:
CCDS60 TVFLLLITEIIPSTSLVIPLIGEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHHRSPSTHTMPHWVR
310 320 330 340 350 360
160 170 180 190 200
pF1KE2 VILLNWCA--WFLRMKRPGEDKVRPACQHKQRRCSLASVEMSAVAPPPASN--GNLLYIG
::. :. :.: :.:: : . : ...: :: .. .
CCDS60 GALLG-CVPRWLL-MNRPP-----PPVE----LCHPLRLKLSPSYHWLESNVDAEEREVV
370 380 390 400 410
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 FRGLDGVHCVP--TPDSGVVC--GRM--ACSPTHDEHLLHGGQPPEGDPDLAKILEEVRY
. : :. .:. :..: :.. . : . : ::. :. .: . : :: :.:
CCDS60 VEEEDRWACAGHVAPSVGTLCSHGHLHSGASGPKAEALLQEGEL-LLSPHMQKALEGVHY
420 430 440 450 460 470
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 IANRFRCQDESEAVCSEWKFAACVVDRLCLMAFSVFTIICTIGILMSAPNFVEAVSKDFA
::...: .: . .: .::..: :.::. : : . .. :::... : :.
CCDS60 IADHLRSEDADSSVKEDWKYVAMVIDRIFLWLFIIVCFLGTIGLFL--PPFLAGMI
480 490 500 510 520
>>CCDS10305.1 CHRNA3 gene_id:1136|Hs109|chr15 (505 aa)
initn: 655 init1: 544 opt: 656 Z-score: 778.2 bits: 152.9 E(33420): 5.2e-37
Smith-Waterman score: 656; 34.6% identity (66.0% similar) in 309 aa overlap (5-307:197-496)
10 20 30
pF1KE2 MQEADISGYIPNGEWDLVGIPGKRSERFYECCKE
... : .::: .. :: . . :.::.:
CCDS10 PFDYQNCTMKFGSWSYDKAKIDLVLIGSSMNLKDYWESGEWAIIKAPGYKHDIKYNCCEE
170 180 190 200 210 220
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 PYPDVTFTVTMRRRTLYYGLNLLIPCVLISALALLVFLLPADSGEKISLGITVLLSLTVF
:::.:... .:: :.: .::.:::.::: :..::: ::.: :::..: :.::::::::
CCDS10 IYPDITYSLYIRRLPLFYTINLIIPCLLISFLTVLVFYLPSDCGEKVTLCISVLLSLTVF
230 240 250 260 270 280
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 MLLVAEIMPATSDSVPLIAQYFASTMIIVGLSVVVTVIVLQYHHHDPDGGKMPKWTRVIL
.:...: .:.:: .:::..:. :::.: ::.:.::.::. :.. : ::.:.....
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:: . : :: .. . :. : ..:.: . .... :. ::.
CCDS10 LNLLPRVMFMTRPTSNE-----GNAQKPRPLYGAELSNLNCFSRAESKGCKEGYPCQDGM
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.: . . .. : . : . : : .. :: . . .. :.:::. ..
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:.:.. . ..::..: :.::. : .:.. :. : :...
CCDS10 QNEAKEIQDDWKYVAMVIDRIFLWVFTLVCILGTAGLFLQPLMAREDA
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: . .::: .: : . : :::: :
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CCDS13 LLLITEIIPSTSLVIPLIGEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHHRSPRTHTMPTWVRRVF
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:. .: ::::. .:. : . .. : . :::..:. ... .
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::: : . : .:. :. : :: :..
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>>CCDS53964.1 CHRNA3 gene_id:1136|Hs109|chr15 (489 aa)
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10 20 30
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... : .::: .. :: . . :.::.:
CCDS53 PFDYQNCTMKFGSWSYDKAKIDLVLIGSSMNLKDYWESGEWAIIKAPGYKHDIKYNCCEE
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:::.:... .:: :.: .::.:::.::: :..::: ::.: :::..: :.::::::::
CCDS53 IYPDITYSLYIRRLPLFYTINLIIPCLLISFLTVLVFYLPSDCGEKVTLCISVLLSLTVF
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CCDS53 LLVITETIPSTSLVIPLIGEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHYRTPTTHTMPSWVKTVF
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CCDS53 CGYCHHRRIKISNFSANLTRSSSSESVDAVLSLSALSPE----IKEAIQSVKYIAENMKA
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:.:..
CCDS53 QNEAKEEQKAQEIQQLKRKEKSTETSDQEPGL
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>>CCDS3459.1 CHRNA9 gene_id:55584|Hs109|chr4 (479 aa)
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pF1KE2 MQEADISGYIPNGEWDLVGIPGKRSERFYE
.. .:.: .: . ::.. :.:. .. :
CCDS34 VTYFPFDNQQCNLTFGSWTYNGNQVDIFNALDSGDLSDFIEDVEWEVHGMPAVKNVISYG
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CCDS34 CCSEPYPDVTFTLLLKRRSSFYIVNLLIPCVLISFLAPLSFYLPAASGEKVSLGVTILLA
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CCDS34 MTVFQLMVAEIMPA-SENVPLIGKYYIATMALITASTALTIMVMNIHFCGAEARPVPHWA
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CCDS34 DHKATNSKGSEWKKVAKVIDRFFMWIFFIMVFVMTILIIARAD
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]