Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2435
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2435, 333 aa
1>>>pF1KE2435 333 - 333 aa - 333 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2900+/-0.00116; mu= 16.2558+/- 0.069
mean_var=72.1328+/-15.514, 0's: 0 Z-trim(102.5): 34 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.151011
statistics sampled from 6935 (6965) to 6935 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.555), E-opt: 0.2 (0.214), width: 16
Scan time: 2.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34765.1 TAS2R38 gene_id:5726|Hs108|chr7 ( 333) 2218 492.8 1.6e-139
CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 ( 318) 511 120.9 1.4e-27
CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 ( 316) 491 116.5 2.8e-26
CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 ( 312) 457 109.1 4.8e-24
CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 ( 314) 440 105.4 6.3e-23
CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 ( 303) 437 104.8 9.6e-23
CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 ( 309) 423 101.7 8e-22
CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 ( 317) 410 98.9 5.9e-21
CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 ( 338) 402 97.2 2.1e-20
CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 ( 307) 392 95.0 8.6e-20
CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 ( 323) 381 92.6 4.7e-19
CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs108|chr7 ( 299) 356 87.1 1.9e-17
CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 ( 309) 338 83.2 3e-16
CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 ( 309) 320 79.3 4.6e-15
CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 ( 299) 319 79.0 5.2e-15
CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 ( 309) 317 78.6 7.2e-15
CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 ( 319) 315 78.2 1e-14
CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 ( 318) 311 77.3 1.8e-14
CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 ( 309) 302 75.4 6.9e-14
CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 ( 299) 282 71.0 1.4e-12
CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 ( 299) 264 67.1 2.1e-11
>>CCDS34765.1 TAS2R38 gene_id:5726|Hs108|chr7 (333 aa)
initn: 2218 init1: 2218 opt: 2218 Z-score: 2618.2 bits: 492.8 E(32554): 1.6e-139
Smith-Waterman score: 2218; 99.7% identity (100.0% similar) in 333 aa overlap (1-333:1-333)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLTLTRIRTVSYEVRSTFLFISVLEFAVGFLTNAFVFLVNFWDVVKRQALSNSDCVLLCL
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CCDS34 MLTLTRIRTVSYEVRSTFLFISVLEFAVGFLTNAFVFLVNFWDVVKRQALSNSDCVLLCL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SISRLFLHGLLFLSAIQLTHFQKLSEPLNHSYQAIIMLWMIANQANLWLAACLSLLYCSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SISRLFLHGLLFLSAIQLTHFQKLSEPLNHSYQAIIMLWMIANQANLWLAACLSLLYCSK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LIRFSHTFLICLASWVSRKISQMLLGIILCSCICTVLCVWCFFSRPHFTVTTVLFMNNNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LIRFSHTFLICLASWVSRKISQMLLGIILCSCICTVLCVWCFFSRPHFTVTTVLFMNNNT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 RLNWQIKDLNLFYSFLFCYLWSVPPFLLFLVSSGMLTVSLGRHMRTMKVYTRNSRDPSLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RLNWQIKDLNLFYSFLFCYLWSVPPFLLFLVSSGMLTVSLGRHMRTMKVYTRNSRDPSLE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 AHIKALKSLVSFFCFFVISSCVAFISVPLLILWRDKIGVMVCVGIMAACPSGHAAILISG
:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AHIKALKSLVSFFCFFVISSCAAFISVPLLILWRDKIGVMVCVGIMAACPSGHAAILISG
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE2 NAKLRRAVMTILLWAQSSLKVRADHKADSRTLC
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NAKLRRAVMTILLWAQSSLKVRADHKADSRTLC
310 320 330
>>CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 (318 aa)
initn: 547 init1: 257 opt: 511 Z-score: 608.7 bits: 120.9 E(32554): 1.4e-27
Smith-Waterman score: 511; 32.5% identity (62.8% similar) in 323 aa overlap (13-326:4-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLTLTRIRTVSYEVRSTFLFISVLEFAVGFLTNAFVFLVNFWDVVKRQALSNSDCVLLCL
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CCDS86 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SISRLFLHGLLFLSAIQLTHFQKLSEPLNHSYQAIIMLWMIANQANLWLAACLSLLYCSK
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CCDS86 AISRICLLCVILLDCFILVLYPDVYAT-GKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE2 LIRFSHTFLICLASWVSRKISQMLLGIILCSCICTVLCVWCFFSRPHFTVTTVLF-----
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CCDS86 IGNFFHPLFLWMKWRIDRVISWILLG-------CVVLSV--FISLPATENLNADFRFCVK
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 MNNNTRLNW--QIKDLNLFYSFLFCYLWSVPPFLLFLVSSGMLTVSLGRHMRTMKVYTRN
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CCDS86 AKRKTNLTWSCRVNKTQHASTKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATG
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 SRDPSLEAHIKALKSLVSFFCFFVISSCVAFISVPLLILWRDKIGVMVCVGIMAACPSGH
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CCDS86 CRDPSTEAHVRALKAVISFLLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSH
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330
pF1KE2 AAILISGNAKLRRAVMTILLWAQSSLKVRA--DHKADSRTLC
. ::: :: :::.: . .. ..: :: : .::
CCDS86 SFILILGNNKLRHASLKVIWKVMSILKGRKFQQHKQI
290 300 310
>>CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 (316 aa)
initn: 493 init1: 248 opt: 491 Z-score: 585.1 bits: 116.5 E(32554): 2.8e-26
Smith-Waterman score: 491; 31.4% identity (62.4% similar) in 303 aa overlap (18-320:9-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLTLTRIRTVSYEVRSTFLFISVLEFAVGFLTNAFVFLVNFWDVVKRQALSNSDCVLLCL
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CCDS58 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SISRLFLHGLLFLSAIQLTHFQKLSEPLNHSYQAIIMLWMIANQANLWLAACLSLLYCSK
.. :..: ... ... : .:. .. . .: : . : ..:. ..:::.::..::: :
CCDS58 ALLRIILLCIILTDSF-LIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LIRFSHTFLICLASWVSRKISQMLLGIILCSCICTVLCVWCFFSRPHFTVTTVLFMNNNT
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CCDS58 IASFSHPTFLWLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINEF---KLYSVFRGIEATRNV
120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 RLNWQIKDLNLFYSFLFCYLWSVPPFLLFLVSSGMLTVSLGRHMRTMKVYTRNSRDPSLE
... : . . .. :: .::... :.: ..: ::::: : : .::::. :
CCDS58 TEHFRKKRSEYYLIHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTE
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 AHIKALKSLVSFFCFFVISSCVAFISVPLLILWRDKIGVMVCVGIMAACPSGHAAILISG
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CCDS58 AHKRAIRIILSFFFLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILG
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KE2 NAKLRRAVMTILLWAQSSLKVRADHKADSRTLC
:.::... ...: .. ::
CCDS58 NSKLKQTFVVMLRCESGHLKPGSKGPIFS
290 300 310
>>CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 425 init1: 239 opt: 457 Z-score: 545.2 bits: 109.1 E(32554): 4.8e-24
Smith-Waterman score: 457; 28.7% identity (64.7% similar) in 317 aa overlap (14-322:5-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLTLTRIRTVSYEVRSTFLFISVLEFAVGFLTNAFVFLVNFWDVVKRQALSNSDCVLLCL
... .... . :...:. :.:. ::: : .::. .: : .:. :
CCDS86 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE2 SISRLFLHGLLFLSAIQLTHFQKLSEPLNHSYQAII----MLWMIANQANLWLAACLSLL
.:::. : : .:.: : : : ... .... ..: .::...::...:::..
CCDS86 AISRICL-----LCVISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIF
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 YCSKLIRFSHTFLICLASWVSRKISQMLLGIILCSCICTVLCVWCFFSRPHFT-VTTVLF
: :. .:: :.. :.. ::....:.:.: : . ... .: :. . ::
CCDS86 YLLKIANISHPFFF----WLKLKINKVMLAILLGSFLISLI-----ISVPKNDDMWYHLF
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 -MNNNTRLNWQIKDLNLFYSF--LFCYLWSVPPFLLFLVSSGMLTVSLGRHMRTMKVYTR
.... ..:..: .. .: : : . ::.: :.: .: :: :: . .....
CCDS86 KVSHEENITWKFKVSKIPGTFKQLTLNLGVMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHAT
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 NSRDPSLEAHIKALKSLVSFFCFFVISSCVAFISVPLLILWRDKIGVMVCVGIMAACPSG
. :::: :::..:.:... :. .... : .. . .. . :. .:. . . ::.
CCDS86 GFRDPSTEAHMRAIKAVIIFLLLLIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSS
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330
pF1KE2 HAAILISGNAKLRRAVMTILLWAQSSLKVRADHKADSRTLC
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CCDS86 HSFILIMGNSKLREAFLKMLRFVKCFLRRRKPFVP
280 290 300 310
>>CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 (314 aa)
initn: 433 init1: 207 opt: 440 Z-score: 525.1 bits: 105.4 E(32554): 6.3e-23
Smith-Waterman score: 440; 29.8% identity (63.1% similar) in 312 aa overlap (13-314:4-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLTLTRIRTVSYEVRSTFLFISVLEFAVGFLTNAFVFLVNFWDVVKRQALSNSDCVLLCL
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CCDS31 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE2 SISRLFLHGLLFLSAIQLTHFQKLSEPLNHSY---QAIIMLWMIANQANLWLAACLSLLY
.:: . : :.. .. . . :. : .: ...:::: ..:. . :::.:::..:
CCDS31 AISTI---GQLLVILFD-SFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFY
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 CSKLIRFSHTFLICLASWVSRKISQMLLGIILCSCICTVL--CVWCFFSRPHFTV----T
:. .: :.... :. ... :.. ... : . .. : .: ... .
CCDS31 FFKIAHFPHSLFL----WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLIFDSLVLEIFIDISLNIIDKSN
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 TVLFMNNNTRLNWQIKDLNLFYSFLFCYLWSVPPFLLFLVSSGMLTVSLGRHMRTMKVYT
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CCDS31 LTLYLDESKTLYDKLSILKTLLS-----LTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSS
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 RNSRDPSLEAHIKALKSLVSFFCFFVISS-CVAFISVPLLILWRDKIGVMVCVGIMAACP
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CCDS31 LGSRDSSTEAHRRAMKMVMSFLFLFIVHFFSLQVANWIFFMLWNNKCIKFVMLA-LNAFP
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330
pF1KE2 SGHAAILISGNAKLRRAVMTILLWAQSSLKVRADHKADSRTLC
: :. ::: ::.::..... :::
CCDS31 SCHSFILILGNSKLQQTAVR-LLWHLRNYTKTPNPLPL
280 290 300 310
>>CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 (303 aa)
initn: 303 init1: 140 opt: 437 Z-score: 521.8 bits: 104.8 E(32554): 9.6e-23
Smith-Waterman score: 437; 29.2% identity (61.4% similar) in 308 aa overlap (16-316:7-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLTLTRIRTVSYEVRSTFLFISVLEFAVGFLTNAFVFLVNFWDVVKRQALSNSDCVLLCL
: : .. . :: .: :.:.:. :.: : :... ::. : .:. :
CCDS86 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIIL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SISRLFLHGLLFLSAIQLTHFQKLSEPLNHSYQAIIMLWMIANQANLWLAACLSLLYCSK
.:::. : ...: . :. . . . . .:. :...:. :::::. .:..: :
CCDS86 AISRIGLIWEILVSWFLALHYLAIFVS-GTGLRIMIFSWIVSNHFNLWLATIFSIFYLLK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE2 LIRFSHTFLICLASWVSRKISQMLLGIILCSCICTVLCVWCFFSRPHFTVTTVLFMNN--
. :: .. : :.. : ..::: . :. :.. .... ...
CCDS86 IASFSSPAFLYLKWRVNKVILMILLGTL----------VFLFLNLIQINMHIKDWLDRYE
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 -NTRLNWQIKDLNLF-YSFLFCY-LWSVPPFLLFLVSSGMLTVSLGRHMRTMKVYTRNSR
:: :....:.. : : : . ..:. :: . ..: .: :: .:.. :.. .. :
CCDS86 RNTTWNFSMSDFETFSVSVKFTMTMFSLTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHR
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 DPSLEAHIKALKSLVSFFCFFVISSCVAFISVPLLILWRDKIGVMVCVGIMAACPSGHAA
:: ..: .::: ..::. :.. ..:: . :... . :.: : . ::.:.
CCDS86 DPRTKVHTNALKIVISFLLFYASFFLCVLISW-ISELYQNTVIYMLCETIGVFSPSSHSF
230 240 250 260 270
300 310 320 330
pF1KE2 ILISGNAKLRRAVMTIL--LWAQSSLKVRADHKADSRTLC
.:: ::::::.: . . .::.
CCDS86 LLILGNAKLRQAFLLVAAKVWAKR
280 290 300
>>CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 380 init1: 217 opt: 423 Z-score: 505.2 bits: 101.7 E(32554): 8e-22
Smith-Waterman score: 423; 27.3% identity (62.3% similar) in 297 aa overlap (18-312:9-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLTLTRIRTVSYEVRSTFLFISVLEFAVGFLTNAFVFLVNFWDVVKRQALSNSDCVLLCL
:... . :: .:.: :... :::. : .:.. .:. : .: :
CCDS86 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SISRLFLHGLLFLSAIQLTHFQKLSEPLNHSYQAIIMLWMIANQANLWLAACLSLLYCSK
:.:. : ... ...: .. .. :.. .:. .: .:: :.:...::...: :
CCDS86 VIARICLISVMVVNGIVIV-LNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LIRFSHTFLICLASWVSRKISQMLLGIILCSCICTVLCVWCFFSRPHFTVTTVLFMNNNT
. :: ... : .. . .::: . : . ... . . .: . . . :
CCDS86 IASSSHPLFLWLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHA--IAKHKRNI
120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 RLNWQIKDLNLFYSFLFCYLWSVPPFLLFLVSSGMLTVSLGRHMRTMKVYTRNSRDPSLE
.... . : . . :... ::.. :.: .:. :: :: . .:.:. .::::: :
CCDS86 TEMFHVSKIPYFEPLTLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTE
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KE2 AHIKALKSLVSFFCFFVISSCVAFISVPLLILWRDKIGVMVCVGIMAAC--PSGHAAILI
.:..:.:...::. :: . ... . .. . :..: : .:: : ::. :::
CCDS86 VHVRAIKTMTSFIFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEF--GEIAAILYPLGHSLILI
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330
pF1KE2 SGNAKLRRAVMTILLWAQSSLKVRADHKADSRTLC
: :::.. . .:
CCDS86 VLNNKLRQTFVRMLTCRKIACMI
290 300
>>CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 (317 aa)
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Smith-Waterman score: 410; 29.1% identity (59.8% similar) in 316 aa overlap (14-320:5-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLTLTRIRTVSYEVRSTFLFISVLEFAVGFLTNAFVFLVNFWDVVKRQALSNSDCVLLCL
..: : :. ..:: .: : :.:. ::: : :: . .:. : .: :
CCDS86 MGGVIKSIFTFVLIVEFIIGNLGNSFIALVNCIDWVKGRKISSVDRILTAL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SISRLFLHGLLFLSAIQLTHFQKLSEPLNHSYQAIIMLWMIANQANLWLAACLSLLYCSK
.:::. : :.: : . : : .. .. . .: . :. ..:::. :. .: :
CCDS86 AISRISLVWLIFGSWCVSVFFPALFAT-EKMFRMLTNIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LIRFSHTFLICLASWVSRKISQMLLGIILCSCICTVLCVWCFFSRPHFTVTTVLFMNNNT
. ::..... : .: ......: ..: . . : . . :.... . :.:
CCDS86 IANFSNSIFLYL-KW---RVKKVVLVLLLVTSVFLFLNI--ALINIHINASINGYRRNKT
120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KE2 ----RLNW-QIKDLNLFYSFLFCYLWSVPPFLLFLVSSGMLTVSLGRHMRTMKVYTRNSR
:. ....: .. : .: .. :: : :. .: :. .: . :. .. :
CCDS86 CSSDSSNFTRFSSLIVLTSTVFIFI----PFTLSLAMFLLLIFSMWKHRKKMQHTVKISG
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 DPSLEAHIKALKSLVSFFCFFVISSCVAFISVPLLILW---RDKIGVMVCVGIMA-ACPS
: : .:: ...::...:: ...: : :::: : : . .... .:. : ::
CCDS86 DASTKAH-RGVKSVITFFLLYAIFSLSFFISV-----WTSERLEENLIILSQVMGMAYPS
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300 310 320 330
pF1KE2 GHAAILISGNAKLRRAVMTILLWAQSSLKVRADHKADSRTLC
:. .:: :: :::.: ...::: . .:
CCDS86 CHSCVLILGNKKLRQASLSVLLWLRYMFKDGEPSGHKEFRESS
280 290 300 310
>>CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 (338 aa)
initn: 289 init1: 150 opt: 402 Z-score: 479.9 bits: 97.2 E(32554): 2.1e-20
Smith-Waterman score: 402; 29.6% identity (63.1% similar) in 301 aa overlap (19-307:36-321)
10 20 30 40
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:...:: :. .:...:.:.. .. . :.
CCDS47 FPPDTKEKQQLRMTKLCDPAESELSPFLITLILAVLLAEYLIGIIANGFIMAIHAAEWVQ
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 RQALSNSDCVLLCLSISRLFLHGLLFLS-AIQLTHFQKLSEPLNHSYQAIIMLWMIANQA
.:.:.: .:. ::.::. :..:..: .:. : .. :: . : :. . ... :
CCDS47 NKAVSTSGRILVFLSVSRIALQSLMMLEITISSTSLSFYSE--DAVYYAFKISFIFLNFC
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 NLWLAACLSLLYCSKLIRFSHTFLICLASWVSRKISQML-LGIILC---SCICTVLC-VW
.::.:: ::..: :. ::. ... : .. : .: :.... : .: .: :.
CCDS47 SLWFAAWLSFFYFVKIANFSYPLFLKLRWRITGLIPWLLWLSVFISFSHSMFCINICTVY
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 CFFSRPHFTVTTVLFMNNNTRLNWQIKDLNLFYSFLFCYLWSVPPFLLFLVSSGMLTVSL
: : : . .:.:. .. ....:. .: : : :...:.... .: .::
CCDS47 CNNSFP-------IHSSNSTKKTY-LSEINVVGLAFFFNLGIVTPLIMFILTATLLILSL
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KE2 GRHMRTMKVYTRNSRDPSLEAHIKALKSLVSFFCFFVISSCVAFISVPLLI----LWRDK
:: : . .: :::.:::. :.:.. :. ...... . :: . .. :: .
CCDS47 KRHTLHMGSNATGSNDPSMEAHMGAIKAISYFLILYIFNAVALFIYLSNMFDINSLWNN-
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
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.: :::: :..:. .::. : ::::
CCDS47 ----LCQIIMAAYPASHSILLIQDNPGLRRAWKRLQLRLHLYPKEWTL
300 310 320 330
>>CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 (307 aa)
initn: 208 init1: 155 opt: 392 Z-score: 468.8 bits: 95.0 E(32554): 8.6e-20
Smith-Waterman score: 392; 28.4% identity (58.5% similar) in 306 aa overlap (19-316:11-302)
10 20 30 40 50 60
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:..:.: . .:. .:.:. :: . .. : : .:. :
CCDS43 MQAALTAFFVLLFSLLSL-LGIAANGFIVLVLGREWLRYGRLLPLDMILISL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE2 SISRLFLHGLLFLSAIQLTHF--QKLSEPLNHSYQAIIMLWMIANQANLWLAACLSLLYC
. ::. :. ...... .. ::. . . : . . : . :.:..:. . ::.:.:
CCDS43 GASRFCLQ---LVGTVHNFYYSAQKVEYSGGLGRQFFHLHWHFLNSATFWFCSWLSVLFC
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 SKLIRFSHTFLICLASWVSRKISQMLLGIILCSCICTVLCVWCFFSRPHFTVTTVLFMNN
:. ..:. .. : . .::: .: : : :.: : . : . . ...
CCDS43 VKIANITHSTFLWLKWRFPGWVPWLLLGSVLISFIITLLFFW--VNYPVYQEFLIRKFSG
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
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: .:. . . .. : .::.: : .:::: .: :: :: . :. .. .:::
CCDS43 NMTYKWNTRIETYYFPSLKLVIWSIP-FSVFLVSIMLLINSLRRHTQRMQHNGHSLQDPS
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
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.:: .:::::.::. ....: . . :::. . : .:.:..:...
CCDS43 TQAHTRALKSLISFLILYALSFLSLIIDAAKFISMQNDFYWPWQIAVYLCISV-------
230 240 250 260 270
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CCDS43 HPFILIFSNLKLRSVFSQLLLLARGFWVA
280 290 300
333 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]