FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2432, 309 aa
1>>>pF1KE2432 309 - 309 aa - 309 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
65089639 residues in 91964 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8629+/-0.000459; mu= 18.2168+/- 0.028
mean_var=74.9052+/-16.124, 0's: 0 Z-trim(109.0): 93 B-trim: 392 in 1/49
Lambda= 0.148190
statistics sampled from 17758 (17841) to 17758 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.53), E-opt: 0.2 (0.194), width: 16
Scan time: 3.220
The best scores are: opt bits E(91964)
NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 mem ( 309) 2007 439.0 6.3e-123
NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 mem ( 309) 1816 398.1 1.2e-110
NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 mem ( 309) 1734 380.6 2.3e-105
XP_003961040 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 ( 299) 1645 361.6 1.2e-99
NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 mem ( 299) 1645 361.6 1.2e-99
NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 ( 319) 1622 356.7 3.9e-98
NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 mem ( 299) 1328 293.8 3.1e-79
NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 mem ( 309) 1311 290.2 3.9e-78
NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 mem ( 299) 1306 289.1 8e-78
NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 mem ( 303) 808 182.6 9.1e-46
NP_076411 (OMIM: 604790) taste receptor type 2 mem ( 317) 785 177.7 2.8e-44
NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 mem ( 318) 655 149.9 6.6e-36
NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 mem ( 312) 654 149.7 7.6e-36
NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 mem ( 307) 616 141.6 2.1e-33
NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 mem ( 314) 589 135.8 1.2e-31
NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 mem ( 309) 556 128.8 1.5e-29
NP_058639 (OMIM: 604868) taste receptor type 2 mem ( 316) 550 127.5 3.8e-29
NP_795364 (OMIM: 613965) taste receptor type 2 mem ( 307) 473 111.0 3.3e-24
NP_061853 (OMIM: 605062) taste receptor type 2 mem ( 299) 395 94.3 3.4e-19
NP_062545 (OMIM: 604796) taste receptor type 2 mem ( 299) 393 93.9 4.6e-19
NP_795363 (OMIM: 613964) taste receptor type 2 mem ( 323) 375 90.1 7e-18
NP_803186 (OMIM: 613968) taste receptor type 2 mem ( 318) 358 86.4 8.6e-17
NP_058640 (OMIM: 604869) taste receptor type 2 mem ( 299) 357 86.2 9.6e-17
NP_058641 (OMIM: 103780,604867,617956) taste recep ( 291) 320 78.3 2.3e-14
NP_789787 (OMIM: 171200,607751) taste receptor typ ( 333) 302 74.5 3.6e-13
NP_005152 (OMIM: 600052) apelin receptor [Homo sap ( 380) 197 52.1 2.3e-06
NP_006574 (OMIM: 605224) visual pigment-like recep ( 337) 140 39.9 0.0096
>>NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 2007 init1: 2007 opt: 2007 Z-score: 2328.5 bits: 439.0 E(91964): 6.3e-123
Smith-Waterman score: 2007; 100.0% identity (100.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VKGEKPSSP
:::::::::
NP_795 VKGEKPSSP
>>NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 1816 init1: 1816 opt: 1816 Z-score: 2107.8 bits: 398.1 E(91964): 1.2e-110
Smith-Waterman score: 1816; 89.3% identity (96.1% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
: ::.::::::.::: :::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
NP_795 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
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NP_795 VLLLNWYSTVLNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
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NP_795 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
..:::::::::: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.
NP_795 MVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :.:::
NP_795 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQMRYW
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VKGEKPSSP
::::: :::
NP_795 VKGEKTSSP
>>NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 1734 init1: 1734 opt: 1734 Z-score: 2013.0 bits: 380.6 E(91964): 2.3e-105
Smith-Waterman score: 1734; 85.4% identity (93.8% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
: ::.::::: ..:: :::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
NP_795 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
::.::::.: .:::: :.::: :::::::: .::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
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NP_795 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
:.:::::::::. :::::::::::::::::::::::::: :::::::::: ::::::.
NP_795 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
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NP_795 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VKGEKPSSP
::::::::
NP_795 VKGEKPSSS
>>XP_003961040 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 memb (299 aa)
initn: 1645 init1: 1645 opt: 1645 Z-score: 1910.4 bits: 361.6 E(91964): 1.2e-99
Smith-Waterman score: 1645; 84.3% identity (94.0% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
: ::.::::: .::: :::::::::::::::: : ::::::::::::.::::::::::::
XP_003 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
::::::::::.::::::::.::::::.:::::::::: :::::::::::::::::::::.
XP_003 VLLLNWYSTVLNPAFYSVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
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XP_003 LKRRVKSVILVVLLGPLLFLACHLFVVNMNQIVWTKEYEGNMTWKIKLRRAMYLSDTTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
:.::::::.::. ::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::: :.:: :.
XP_003 MLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLLRAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
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XP_003 YFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQMRY
250 260 270 280 290
pF1KE2 VKGEKPSSP
>>NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 member (299 aa)
initn: 1645 init1: 1645 opt: 1645 Z-score: 1910.4 bits: 361.6 E(91964): 1.2e-99
Smith-Waterman score: 1645; 84.3% identity (94.0% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
: ::.::::: .::: :::::::::::::::: : ::::::::::::.::::::::::::
NP_795 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
::::::::::.::::::::.::::::.:::::::::: :::::::::::::::::::::.
NP_795 VLLLNWYSTVLNPAFYSVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
:::::::::::.::::::::::.:::.::..:: :::::::.::::::: :.::::.:::
NP_795 LKRRVKSVILVVLLGPLLFLACHLFVVNMNQIVWTKEYEGNMTWKIKLRRAMYLSDTTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
:.::::::.::. ::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::: :.:: :.
NP_795 MLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLLRAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
::.:..:::::: .::::::::::.:: :: : :::::::::::::::.:::: :.::
NP_795 YFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQMRY
250 260 270 280 290
pF1KE2 VKGEKPSSP
>>NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 memb (319 aa)
initn: 1622 init1: 1622 opt: 1622 Z-score: 1883.5 bits: 356.7 E(91964): 3.9e-98
Smith-Waterman score: 1622; 82.1% identity (93.4% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
: ::.::::: ..::.:::::::::::::::::: ::::::::.::::::::::::::::
NP_001 MITFLPIIFSILIVVIFVIGNFANGFIALVNSIEWVKRQKISFVDQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
::::.::.: .:::::::::: :::::::::.:::.:::::::.::::.::::::::::.
NP_001 VLLLHWYATQLNPAFYSVEVRITAYNVWAVTNHFSSWLATSLSMFYLLRIANFSNLIFLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
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NP_001 IKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMDETVWTKEYEGNVTWKIKLRSAMYHSNMTLT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
:.:.::.::::. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.
NP_001 MLANFVPLTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
::::..::: .:: ::..::::::.:: ::::: :::::: ::::::: ::::::.::::
NP_001 YFLSMIISVCNFGRLEKQPVFMFCQAIIFSYPSTHPFILILGNKKLKQIFLSVLRHVRYW
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VKGEKPSSP
::
NP_001 VKDRSLRLHRFTRGALCVF
310
>>NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 member (299 aa)
initn: 1322 init1: 1322 opt: 1328 Z-score: 1544.1 bits: 293.8 E(91964): 3.1e-79
Smith-Waterman score: 1328; 69.1% identity (87.2% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
: ::. :.:: ...::::.:::::::::::: :. :::.::: ::::::::::::.::::
NP_795 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
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NP_795 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
:::::.:::::.::: :.::.:.:.: :: : . ..:::::.: :.:::..:.:: :::
NP_795 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
:: ...::::.:. ::.::::::::::::::::.:::: :::::::::::.: ::::::.
NP_795 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
.:: ...:::: :.: :: : ::. : .. ::::: .::::.::: .: :.:
NP_795 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC
250 260 270 280 290
pF1KE2 VKGEKPSSP
>>NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 1310 init1: 1286 opt: 1311 Z-score: 1524.3 bits: 290.2 E(91964): 3.9e-78
Smith-Waterman score: 1311; 65.7% identity (84.1% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
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10 20 30 40 50 60
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]