Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2429
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2429, 658 aa
1>>>pF1KE2429 658 - 658 aa - 658 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3059+/-0.00088; mu= 15.2366+/- 0.053
mean_var=83.5799+/-16.519, 0's: 0 Z-trim(107.1): 17 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.140289
statistics sampled from 9335 (9350) to 9335 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.287), width: 16
Scan time: 2.620
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS575.1 CPT2 gene_id:1376|Hs108|chr1 ( 658) 4405 901.5 0
CCDS81326.1 CPT2 gene_id:1376|Hs108|chr1 ( 635) 3519 722.2 5.3e-208
CCDS6919.1 CRAT gene_id:1384|Hs108|chr9 ( 626) 743 160.4 7.1e-39
CCDS7233.1 CHAT gene_id:1103|Hs108|chr10 ( 630) 641 139.7 1.2e-32
CCDS44389.1 CHAT gene_id:1103|Hs108|chr10 ( 666) 641 139.7 1.2e-32
CCDS7232.1 CHAT gene_id:1103|Hs108|chr10 ( 748) 641 139.7 1.4e-32
CCDS47634.1 CROT gene_id:54677|Hs108|chr7 ( 640) 609 133.2 1.1e-30
CCDS46734.1 CPT1B gene_id:1375|Hs108|chr22 ( 738) 458 102.7 1.9e-21
CCDS14098.1 CPT1B gene_id:1375|Hs108|chr22 ( 772) 458 102.7 2e-21
CCDS46147.1 CPT1C gene_id:126129|Hs108|chr19 ( 792) 428 96.6 1.4e-19
CCDS12779.1 CPT1C gene_id:126129|Hs108|chr19 ( 803) 423 95.6 2.8e-19
>>CCDS575.1 CPT2 gene_id:1376|Hs108|chr1 (658 aa)
initn: 4405 init1: 4405 opt: 4405 Z-score: 4816.6 bits: 901.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4405; 100.0% identity (100.0% similar) in 658 aa overlap (1-658:1-658)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MVPRLLLRAWPRGPAVGPGAPSRPLSAGSGPGQYLQRSIVPTMHYQDSLPRLPIPKLEDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MVPRLLLRAWPRGPAVGPGAPSRPLSAGSGPGQYLQRSIVPTMHYQDSLPRLPIPKLEDT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 IRRYLSAQKPLLNDGQFRKTEQFCKSFENGIGKELHEQLVALDKQNKHTSYISGPWFDMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 IRRYLSAQKPLLNDGQFRKTEQFCKSFENGIGKELHEQLVALDKQNKHTSYISGPWFDMY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LSARDSVVLNFNPFMAFNPDPKSEYNDQLTRATNMTVSAIRFLKTLRAGLLEPEVFHLNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LSARDSVVLNFNPFMAFNPDPKSEYNDQLTRATNMTVSAIRFLKTLRAGLLEPEVFHLNP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 AKSDTITFKRLIRFVPSSLSWYGAYLVNAYPLDMSQYFRLFNSTRLPKPSRDELFTDDKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 AKSDTITFKRLIRFVPSSLSWYGAYLVNAYPLDMSQYFRLFNSTRLPKPSRDELFTDDKA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 RHLLVLRKGNFYIFDVLDQDGNIVSPSEIQAHLKYILSDSSPAPEFPLAYLTSENRDIWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 RHLLVLRKGNFYIFDVLDQDGNIVSPSEIQAHLKYILSDSSPAPEFPLAYLTSENRDIWA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 ELRQKLMSSGNEESLRKVDSAVFCLCLDDFPIKDLVHLSHNMLHGDGTNRWFDKSFNLII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 ELRQKLMSSGNEESLRKVDSAVFCLCLDDFPIKDLVHLSHNMLHGDGTNRWFDKSFNLII
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 AKDGSTAVHFEHSWGDGVAVLRFFNEVFKDSTQTPAVTPQSQPATTDSTVTVQKLNFELT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 AKDGSTAVHFEHSWGDGVAVLRFFNEVFKDSTQTPAVTPQSQPATTDSTVTVQKLNFELT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 DALKTGITAAKEKFDATMKTLTIDCVQFQRGGKEFLKKQKLSPDAVAQLAFQMAFLRQYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 DALKTGITAAKEKFDATMKTLTIDCVQFQRGGKEFLKKQKLSPDAVAQLAFQMAFLRQYG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 QTVATYESCSTAAFKHGRTETIRPASVYTKRCSEAFVREPSRHSAGELQQMMVECSKYHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 QTVATYESCSTAAFKHGRTETIRPASVYTKRCSEAFVREPSRHSAGELQQMMVECSKYHG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 QLTKEAAMGQGFDRHLFALRHLAAAKGIILPELYLDPAYGQINHNVLSTSTLSSPAVNLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 QLTKEAAMGQGFDRHLFALRHLAAAKGIILPELYLDPAYGQINHNVLSTSTLSSPAVNLG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650
pF1KE2 GFAPVVSDGFGVGYAVHDNWIGCNVSSYPGRNAREFLQCVEKALEDMFDALEGKSIKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 GFAPVVSDGFGVGYAVHDNWIGCNVSSYPGRNAREFLQCVEKALEDMFDALEGKSIKS
610 620 630 640 650
>>CCDS81326.1 CPT2 gene_id:1376|Hs108|chr1 (635 aa)
initn: 3519 init1: 3519 opt: 3519 Z-score: 3847.7 bits: 722.2 E(32554): 5.3e-208
Smith-Waterman score: 4195; 96.5% identity (96.5% similar) in 658 aa overlap (1-658:1-635)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MVPRLLLRAWPRGPAVGPGAPSRPLSAGSGPGQYLQRSIVPTMHYQDSLPRLPIPKLEDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MVPRLLLRAWPRGPAVGPGAPSRPLSAGSGPGQYLQRSIVPTMHYQDSLPRLPIPKLEDT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 IRRYLSAQKPLLNDGQFRKTEQFCKSFENGIGKELHEQLVALDKQNKHTSYISGPWFDMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IRRYLSAQKPLLNDGQFRKTEQFCKSFENGIGKELHEQLVALDKQNKHTSYISGPWFDMY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LSARDSVVLNFNPFMAFNPDPKSEYNDQLTRATNMTVSAIRFLKTLRAGLLEPEVFHLNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LSARDSVVLNFNPFMAFNPDPKSEYNDQLTRATNMTVSAIRFLKTLRAGLLEPEVFHLNP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 AKSDTITFKRLIRFVPSSLSWYGAYLVNAYPLDMSQYFRLFNSTRLPKPSRDELFTDDKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 AKSDTITFKRLIRFVPSSLSWYGAYLVNAYPLDMSQYFRLFNSTRLPKPSRDELFTDDKA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 RHLLVLRKGNFYIFDVLDQDGNIVSPSEIQAHLKYILSDSSPAPEFPLAYLTSENRDIWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RHLLVLRKGNFYIFDVLDQDGNIVSPSEIQAHLKYILSDSSPAPEFPLAYLTSENRDIWA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 ELRQKLMSSGNEESLRKVDSAVFCLCLDDFPIKDLVHLSHNMLHGDGTNRWFDKSFNLII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ELRQKLMSSGNEESLRKVDSAVFCLCLDDFPIKDLVHLSHNMLHGDGTNRWFDKSFNLII
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 AKDGSTAVHFEHSWGDGVAVLRFFNEVFKDSTQTPAVTPQSQPATTDSTVTVQKLNFELT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 AKDGSTAVHFEHSWGDGVAVLRFFNEVFKDSTQTPAVTPQSQPATTDSTVTVQKLNFELT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 DALKTGITAAKEKFDATMKTLTIDCVQFQRGGKEFLKKQKLSPDAVAQLAFQMAFLRQYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DALKTGITAAKEKFDATMKTLTIDCVQFQRGGKEFLKKQKLSPDAVAQLAFQMAFLRQYG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 QTVATYESCSTAAFKHGRTETIRPASVYTKRCSEAFVREPSRHSAGELQQMMVECSKYHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QTVATYESCSTAAFKHGRTETIRPASVYTKRCSEAFVREPSRHSAG--------------
490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 QLTKEAAMGQGFDRHLFALRHLAAAKGIILPELYLDPAYGQINHNVLSTSTLSSPAVNLG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ---------QGFDRHLFALRHLAAAKGIILPELYLDPAYGQINHNVLSTSTLSSPAVNLG
530 540 550 560 570
610 620 630 640 650
pF1KE2 GFAPVVSDGFGVGYAVHDNWIGCNVSSYPGRNAREFLQCVEKALEDMFDALEGKSIKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GFAPVVSDGFGVGYAVHDNWIGCNVSSYPGRNAREFLQCVEKALEDMFDALEGKSIKS
580 590 600 610 620 630
>>CCDS6919.1 CRAT gene_id:1384|Hs108|chr9 (626 aa)
initn: 734 init1: 270 opt: 743 Z-score: 811.4 bits: 160.4 E(32554): 7.1e-39
Smith-Waterman score: 938; 30.9% identity (62.2% similar) in 627 aa overlap (45-647:31-614)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 AVGPGAPSRPLSAGSGPGQYLQRSIVPTMHYQDSLPRLPIPKLEDTIRRYLSAQKPLLND
.::.:::::.: :.... .::.: .:....
CCDS69 MLAFAARTVVKPLGFLKPFSLMKASSRFKAHQDALPRLPVPPLQQSLDHYLKALQPIVSE
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 GQFRKTEQFCKSFE--NGIGKELHEQLVALDKQNKHT-SYISGPWFDM-YLSARDSVVLN
.. .:.:. :. .:.:..:.. .:... ..: ...: :. ::. :. ::.
CCDS69 EEWAHTKQLVDEFQASGGVGERLQK---GLERRARKTENWLSEWWLKTAYLQYRQPVVIY
70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 FNPFMAFNPDPKSEYNDQLTRATNMTVSAIRFLKTLRAGLLEPEVFHLNPAKSDTITFKR
.: . . ::... : . .:: : :.:. ::
CCDS69 SSPGVML---PKQDFVD--------LQGQLRFAAKLIEGVLD---------------FKV
120 130 140 150
200 210 220 230 240
pF1KE2 LIRFVPSSLSWYGAYLVNAYPLDMSQYFRLFNSTRLPKPSRDEL--FTDDKA--RHLLVL
.: . . :. :: :.::.....: :.: :..: . :. : :. :.
CCDS69 MIDNETLPVEYLGGK-----PLCMNQYYQILSSCRVPGPKQDTVSNFSKTKKPPTHITVV
160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 RKGNFYIFDVLDQDGNIVSPSEIQAHLKYILSDSSPAPEFPLAYLTSENRDIWAELRQKL
.. .:. .:: .::. .. ..: ..:. : ..: . . :.. :::..:. ::. . :
CCDS69 HNYQFFELDVYHSDGTPLTADQIFVQLEKIWNSSLQTNKEPVGILTSNHRNSWAKAYNTL
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350
pF1KE2 MSSG-NEESLRKVDSAVFCLCLD-DFP-IKDLVHLSH---NMLHGDGT-----NRWFDKS
... :..:.:......: .::: .: ... :. :: .:::: :. ::::::.
CCDS69 IKDKVNRDSVRSIQKSIFTVCLDATMPRVSEDVYRSHVAGQMLHGGGSRLNSGNRWFDKT
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 FNLIIAKDGSTAVHFEHSWGDGVAVLRFFNEVFKDSTQTPAVTPQSQPATTDSTVTVQKL
...:.:.::: .. .::. ..: .. ... :.. . . : : .::
CCDS69 LQFIVAEDGSCGLVYEHAAAEGPPIVTLLDYVIEYTKKPELVRSPLVPLPMP-----KKL
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 NFELTDALKTGITAAKEKFDATMKTLTIDCVQFQRGGKEFLKKQKLSPDAVAQLAFQMAF
:..: .:. : ::.... .. : : . :.. ::.: :..:::::: :.:.:.:.
CCDS69 RFNITPEIKSDIEKAKQNLSIMIQDLDITVMVFHHFGKDFPKSEKLSPDAFIQMALQLAY
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 LRQYGQTVATYESCSTAAFKHGRTETIRPASVYTKRCSEAFVREPSRHSAGELQQ--MMV
: :::. ::::: : :. :::.::: ::. : .::. . :. : :. ..
CCDS69 YRIYGQACATYESASLRMFHLGRTDTIRSASMD----SLTFVKAMDDSSVTEHQKVELLR
450 460 470 480 490
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 ECSKYHGQLTKEAAMGQGFDRHLFALRHLAAAKGIILPELYLDPAYGQINHNVLSTSTLS
. . : : .: :..:::::..:. : . .:....: .:. : :::: .
CCDS69 KAVQAHRGYTDRAIRGEAFDRHLLGLKLQAIEDLVSMPDIFMDTSYAIAMHFHLSTSQVP
500 510 520 530 540 550
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 SPAVNLGGFAPVVSDGFGVGYAVHDNWIGCNVSSYPG---RNAREFLQCVEKALEDMFDA
. . . :.::: ::.:: : . :. ..:.: . :: .. . .:::: ::
CCDS69 AKTDCVMFFGPVVPDGYGVCYNPMEAHINFSLSAYNSCAETNAARLAHYLEKALLDMRAL
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 LEGKSIKS
CCDS69 LQSHPRAKL
620
>>CCDS7233.1 CHAT gene_id:1103|Hs108|chr10 (630 aa)
initn: 786 init1: 356 opt: 641 Z-score: 699.7 bits: 139.7 E(32554): 1.2e-32
Smith-Waterman score: 855; 29.7% identity (61.9% similar) in 632 aa overlap (46-649:10-602)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 VGPGAPSRPLSAGSGPGQYLQRSIVPTMHYQDSLPRLPIPKLEDTIRRYLSAQKPLLNDG
...::.::.: :..:. ::. .. :...
CCDS72 MAAKTPSSEESGLPKLPVPPLQQTLATYLQCMRHLVSEE
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 QFRKTEQFCKSF--ENGIGKELHEQLVALDKQNKHTSYISGPWF-DMYLSARDSVVLNFN
::::.. . ..: .:.:. :...: :..:.: ....: :. ::::. : .. .: .
CCDS72 QFRKSQAIVQQFGAPGGLGETLQQKL--LERQEKTANWVSEYWLNDMYLNNRLALPVNSS
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 PFMAFNPDPKSEYNDQLTRATNMTVSAIRFLKTLRAGLLEPEVFHLNPAKSDTITFKRLI
: . : . .::: :: .: .:.: ..: :.
CCDS72 PAVIFARQHFPGTDDQL-----------RFAASLISGVL---------------SYKALL
100 110 120 130
200 210 220 230 240
pF1KE2 --RFVPSSLSWYGAYLVNAYPLDMSQYFRLFNSTRLPKPSRDELFTDDKA-----RHLLV
. .:.. . : ... :: :.::. ::.: ::: ..: : ..... .:..:
CCDS72 DSHSIPTDCA-KGQ--LSGQPLCMKQYYGLFSSYRLPGHTQDTLVAQNSSIMPEPEHVIV
140 150 160 170 180
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 LRKGNFYIFDVLDQDGNIVSPSEIQAHLKYILSDSSPAPEF--PLAYLTSENRDIWAELR
..:...::. . .: ... ..:. :.. .: : :.. :::..:. ::: :
CCDS72 ACCNQFFVLDVV-INFRRLSEGDLFTQLRKIVKMASNEDERLPPIGLLTSDGRSEWAEAR
190 200 210 220 230 240
310 320 330 340 350
pF1KE2 QKLMS-SGNEESLRKVDSAVFCLCLD---DFPIKDLVHLSHNMLHG-----DGTNRWFDK
:.. : :..:: .. . .::: ..: .: . ..::: .:.:::.::
CCDS72 TVLVKDSTNRDSLDMIERCICLVCLDAPGGVELSD-THRALQLLHGGGYSKNGANRWYDK
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 SFNLIIAKDGSTAVHFEHSWGDGVAVLRFFNEVFKDSTQTPAVTPQSQPATTDSTVTVQK
:.......::. .: ::: ::..... ....: ::. ... ... . ..
CCDS72 SLQFVVGRDGTCGVVCEHSPFDGIVLVQCTEHLLKHVTQSSRKLIRAD--SVSELPAPRR
310 320 330 340 350 360
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 LNFELTDALKTGITAAKEKFDATMKTLTIDCVQFQRGGKEFLKKQKLSPDAVAQLAFQMA
: .. . .. .... ::.. .:.: . .:. :: :.:::: :::: :.:.:.:
CCDS72 LRWKCSPEIQGHLASSAEKLQRIVKNLDFIVYKFDNYGKTFIKKQKCSPDAFIQVALQLA
370 380 390 400 410 420
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 FLRQYGQTVATYESCSTAAFKHGRTETIRPASVYTKRCSEAFVREPSRHSAG----ELQQ
: : . . : :::: : :..::...:: :. . :::: . :.:. :
CCDS72 FYRLHRRLVPTYESASIRRFQEGRVDNIRSATPE----ALAFVRAVTDHKAAVPASEKLL
430 440 450 460 470 480
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 MMVECSKYHGQLTKEAAMGQGFDRHLFALRHLAAAKGIILPELYLDPAYGQINHNVLSTS
.. . . . : : :...: ::.:::.:: : :::...: .: . :. :::::
CCDS72 LLKDAIRAQTAYTVMAITGMAIDNHLLALRELARAMCKELPEMFMDETYLMSNRFVLSTS
490 500 510 520 530 540
600 610 620 630 640
pF1KE2 TLSSPAVNLGGFAPVVSDGFGVGYAVHDNWIGCNVSSYPG---RNAREFLQCVEKALEDM
. . . . ..::: .:.:. : . . : .::. . .. .: . ::..: ::
CCDS72 QVPTTTEMFCCYGPVVPNGYGACYNPQPETILFCISSFHSCKETSSSKFAKAVEESLIDM
550 560 570 580 590 600
650
pF1KE2 FDALEGKSIKS
:
CCDS72 RDLCSLLPPTESKPLATKEKATRPSQGHQP
610 620 630
>>CCDS44389.1 CHAT gene_id:1103|Hs108|chr10 (666 aa)
initn: 786 init1: 356 opt: 641 Z-score: 699.4 bits: 139.7 E(32554): 1.2e-32
Smith-Waterman score: 857; 29.4% identity (61.1% similar) in 664 aa overlap (14-649:20-638)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MVPRLLLRAWPRGPAVGPGAPSRPLSAGSGPGQYLQRSIVPTMHYQDSLPRLPI
:: :: . :. : .. .. :. . ...::.::.
CCDS44 MWPECRDEALSTVGPHLCIPA--PGLTKTPILEKV-PRKMAAKT--PSSE-ESGLPKLPV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 PKLEDTIRRYLSAQKPLLNDGQFRKTEQFCKSF--ENGIGKELHEQLVALDKQNKHTSYI
: :..:. ::. .. :... ::::.. . ..: .:.:. :...: :..:.: ....
CCDS44 PPLQQTLATYLQCMRHLVSEEQFRKSQAIVQQFGAPGGLGETLQQKL--LERQEKTANWV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 SGPWF-DMYLSARDSVVLNFNPFMAFNPDPKSEYNDQLTRATNMTVSAIRFLKTLRAGLL
: :. ::::. : .. .: .: . : . .::: :: .: .:.:
CCDS44 SEYWLNDMYLNNRLALPVNSSPAVIFARQHFPGTDDQL-----------RFAASLISGVL
120 130 140 150 160
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..: :. . .:.. . : ... :: :.::. ::.: :::
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..: : ..... .:..: ..:...::. . .: ... ..:. :.. .:
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: :.. :::..:. ::: : :.. : :..:: .. . .::: ..: .:
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. ..::: .:.:::.:::.......::. .: ::: ::..... ....: ::
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. ... ... . ..: .. . .. .... ::.. .:.: . .:. ::
CCDS44 SSRKLIRAD--SVSELPAPRRLRWKCSPEIQGHLASSAEKLQRIVKNLDFIVYKFDNYGK
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:.:::: :::: :.:.:.:: : . . : :::: : :..::...:: :. .
CCDS44 TFIKKQKCSPDAFIQVALQLAFYRLHRRLVPTYESASIRRFQEGRVDNIRSATPE----A
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:::: . :.:. : .. . . . : : :...: ::.:::.:: :
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:::...: .: . :. ::::: . . . . ..::: .:.:. : . . : .::.
CCDS44 LPEMFMDETYLMSNRFVLSTSQVPTTTEMFCCYGPVVPNGYGACYNPQPETILFCISSFH
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. .. .: . ::..: :: :
CCDS44 SCKETSSSKFAKAVEESLIDMRDLCSLLPPTESKPLATKEKATRPSQGHQP
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.. .. :. . ...::.::.: :..:. ::. .. :... ::::.. . ..: .:
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:: .: .:.: ..: :. . .:.. . : .
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.. :: :.::. ::.: ::: ..: : ..... .:..: ..:...::. .
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.: ... ..:. :.. .: : :.. :::..:. ::: : :.. : :..:: ..
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. .::: ..: .: . ..::: .:.:::.:::.......::. .: :
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:: ::..... ....: ::. ... ... . ..: .. . .. ....
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::.. .:.: . .:. :: :.:::: :::: :.:.:.:: : . . : :::: :
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:..::...:: :. . :::: . :.:. : .. . . . : :
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CCDS72 KEKATRPSQGHQP
740
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.: .. .: :: : :: :::.::: ..: . . .:. :.. .. .
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: . :. . :. . : . ..: : . . . . :. :: .. . : :
CCDS47 YVDEKIFQNEGRWKGSEKVR-DIPLP-EELIFIVDEKVLNDINQAKAQYLREASDLQIAA
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: ::.. :.. : ::. :::.:.:. : .:. ::. : : ::::::.:
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.: . : :. ...:: . : :: :.. :... :. . :.::::::..: .:
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.:. .:::. :: . : .. ::::: .. :. : .:.: .:.: : ..:.
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CCDS47 VVACSAWKSCPETDAEKLVQLTFCAFHDMIQLMNSTHL
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: :.: :. . ..: .. . : : .: .. . . :.
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CCDS46 FQRILDDPSPPQPGEEKLAALTAGGRVEWAQARQAFFSSGKNKAALEAIERAAFFVALDE
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. .: . :: . .:::. ::::::::.:: :.:. ... ::.:.:. . .
CCDS46 ESYSYDPEDEASLSLYGKALLHGNCYNRWFDKSFTLISFKNGQLGLNAEHAWADAPIIGH
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... :. :: :.: . .:: . : .:.... .. : .. . :
CCDS46 LWEFVLGTDSFHLGYTETGHCLGKPNPALAPPT----RLQWDIPKQCQAVIESSYQVAKA
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. . : :: :: ..:: . :::: .:.:.:.: .:. :. :::. : :..
CCDS46 LADDVELYCFQFLPFGKGLIKKCRTSPDAFVQIALQLAHFRDRGKFCLTYEASMTRMFRE
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CCDS46 GRTETVRSCTSE----STAFVQAMMEGSHTKADLRDLFQKAAKKHQNMYRLAMTGAGIDR
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CCDS46 ADDGYGVSYMIAGENTIFFHISSKFSSSETNAQRFGNHIRKALLDIADLFQVPKAYS
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CCDS14 YHGWMFEMHGKTSNLTRIWAMCIRLLSSRHPMLYSFQTSLPKLPVPRVSATIQRYLESVR
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CCDS14 PLLDDEEYYRMELLAKEFQDKTAPRLQKYLVL--KSWWASNYVSDWWEEYIYLRGRSPLM
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CCDS14 VNSNYYVM-----------DLVLIKNTDVQAARLGNIIHAMIMYRR-------KLDREEI
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CCDS14 KPVMAL-------------GIVPMCSYQMERMFNTTRIPGKDTDVLQHLSDSRHVAVYHK
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CCDS14 GRFFKL-WLYEGARLLKPQDLEMQFQRILDDPSPPQPGEEKLAALTAGGRVEWAQARQAF
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CCDS14 FSSGKNKAALEAIERAAFFVALDEESYSYDPEDEASLSLYGKALLHGNCYNRWFDKSFTL
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: :.:. ... ::.:.:. . .... :. :: :.: . .:: . :
CCDS14 ISFKNGQLGLNAEHAWADAPIIGHLWEFVLGTDSFHLGYTETGHCLGKPNPALAPPT---
460 470 480 490 500 510
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.:.... .. : .. . : . . : :: :: ..:: . :::: .:.:.:
CCDS14 -RLQWDIPKQCQAVIESSYQVAKALADDVELYCFQFLPFGKGLIKKCRTSPDAFVQIALQ
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.: .:. :. :::. : :..:::::.: . . .:... . :. ..:....
CCDS14 LAHFRDRGKFCLTYEASMTRMFREGRTETVRSCTSESTAFVQAMME--GSHTKADLRDLF
580 590 600 610 620 630
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pF1KE2 VECSKYHGQLTKEAAMGQGFDRHLFALRHLAAAKGIILP---ELYLDP---AYGQINHNV
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