Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2381
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2381, 1490 aa
1>>>pF1KE2381 1490 - 1490 aa - 1490 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 16.6355+/-0.00126; mu= -25.2785+/- 0.076
mean_var=793.8625+/-171.078, 0's: 0 Z-trim(116.6): 225 B-trim: 1072 in 1/53
Lambda= 0.045520
statistics sampled from 17018 (17244) to 17018 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.779), E-opt: 0.2 (0.53), width: 16
Scan time: 7.070
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11337.1 CDK12 gene_id:51755|Hs108|chr17 (1490) 9956 670.3 1.2e-191
CCDS45666.1 CDK12 gene_id:51755|Hs108|chr17 (1481) 8393 567.7 9.2e-161
CCDS5461.1 CDK13 gene_id:8621|Hs108|chr7 (1512) 2928 208.8 1e-52
CCDS5462.1 CDK13 gene_id:8621|Hs108|chr7 (1452) 2678 192.4 8.7e-48
CCDS6879.1 CDK9 gene_id:1025|Hs108|chr9 ( 372) 979 80.3 1.2e-14
>>CCDS11337.1 CDK12 gene_id:51755|Hs108|chr17 (1490 aa)
initn: 9956 init1: 9956 opt: 9956 Z-score: 3554.3 bits: 670.3 E(32554): 1.2e-191
Smith-Waterman score: 9956; 99.9% identity (99.9% similar) in 1490 aa overlap (1-1490:1-1490)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MPNSERHGGKKDGSGGASGTLQPSSGGGSSNSRERHRLVSKHKRHKSKHSKDMGLVTPEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MPNSERHGGKKDGSGGASGTLQPSSGGGSSNSRERHRLVSKHKRHKSKHSKDMGLVTPEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 ASLGTVIKPLVEYDDISSDSDTFSDDMAFKLDRRENDERRGSDRSDRLHKHRHHQHRRSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ASLGTVIKPLVEYDDISSDSDTFSDDMAFKLDRRENDERRGSDRSDRLHKHRHHQHRRSR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 DLLKAKQTEKEKSQEVSSKSGSMKDRISGSSKRSNEETDDYGKAQVAKSSSKESRSSKLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DLLKAKQTEKEKSQEVSSKSGSMKDRISGSSKRSNEETDDYGKAQVAKSSSKESRSSKLH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 KEKTRKERELKSGHKDRSKSHRKRETPKSYKTVDSPKRRSRSPHRKWSDSSKQDDSPSGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KEKTRKERELKSGHKDRSKSHRKRETPKSYKTVDSPKRRSRSPHRKWSDSSKQDDSPSGA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SYGQDYDLSPSRSHTSSNYDSYKKSPGSTSRRQSVSPPYKEPSAYQSSTRSPSPYSRRQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SYGQDYDLSPSRSHTSSNYDSYKKSPGSTSRRQSVSPPYKEPSAYQSSTRSPSPYSRRQR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SVSPYSRRRSSSYERSGSYSGRSPSPYGRRRSSSPFLSKRSLSRSPLPSRKSMKSRSRSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SVSPYSRRRSSSYERSGSYSGRSPSPYGRRRSSSPFLSKRSLSRSPLPSRKSMKSRSRSP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 AYSRHSSSHSKKKRSSSRSRHSSISPVRLPLNSSLGAELSRKKKERAAAAAAAKMDGKES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AYSRHSSSHSKKKRSSSRSRHSSISPVRLPLNSSLGAELSRKKKERAAAAAAAKMDGKES
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KGSPVFLPRKENSSVEAKDSGLESKKLPRSVKLEKSAPDTELVNVTHLNTEVKNSSDTGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KGSPVFLPRKENSSVEAKDSGLESKKLPRSVKLEKSAPDTELVNVTHLNTEVKNSSDTGK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 VKLDENSEKHLVKDLKAQGTRDSKPIALKEEIVTPKETETSEKETPPPLPTIASPPPPLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VKLDENSEKHLVKDLKAQGTRDSKPIALKEEIVTPKETETSEKETPPPLPTIASPPPPLP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 TTTPPPQTPPLPPLPPIPALPQQPPLPPSQPAFSQVPASSTSTLPPSTHSKTSAVSSQAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TTTPPPQTPPLPPLPPIPALPQQPPLPPSQPAFSQVPASSTSTLPPSTHSKTSAVSSQAN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 SQPPVQVSVKTQVSVTAAIPHLKTSTLPPLPLPPLLPGDDDMDSPKETLPSKPVKKEKEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SQPPVQVSVKTQVSVTAAIPHLKTSTLPPLPLPPLLPGDDDMDSPKETLPSKPVKKEKEQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 RTRHLLTDLPLPPELPGGDLSPPDSPEPKAITPPQQPYKKRPKICCPRYGERRQTESDWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RTRHLLTDLPLPPELPGGDLSPPDSPEPKAITPPQQPYKKRPKICCPRYGERRQTESDWG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 KRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKAKDKDTGELVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKAKDKDTGELVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 LIHRSVVNMKEIVTDKQDALDFKKDKGAFYLVFEYMDHDLMGLLESGLVHFSEDHIKSFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LIHRSVVNMKEIVTDKQDALDFKKDKGAFYLVFEYMDHDLMGLLESGLVHFSEDHIKSFM
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 KQLMEGLEYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNSGQIKLADFGLARLYNSEESRPYTNKVITLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KQLMEGLEYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNSGQIKLADFGLARLYNSEESRPYTNKVITLW
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 YRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELFTKKPIFQANLELAQLELISRLCGSPCPAVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELFTKKPIFQANLELAQLELISRLCGSPCPAVW
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 PDVIKLPYFNTMKPKKQYRRRLREEFSFIPSAALDLLDHMLTLDPSKRCTAEQTLQSDFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PDVIKLPYFNTMKPKKQYRRRLREEFSFIPSAALDLLDHMLTLDPSKRCTAEQTLQSDFL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 KDVELSKMAPPDLPHWQDCHELWSKKRRRQRQSGVVVEEPPPSKTSRKETTSGTSTEPVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KDVELSKMAPPDLPHWQDCHELWSKKRRRQRQSGVVVEEPPPSKTSRKETTSGTSTEPVK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 NSSPAPPQPAPGKVESGAGDAIGLADITQQLNQSELAVLLNLLQSQTDLSIPQMAQLLNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NSSPAPPQPAPGKVESGAGDAIGLADITQQLNQSELAVLLNLLQSQTDLSIPQMAQLLNI
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 HSNPEMQQQLEALNQSISALTEATSQQQDSETMAPEESLKEAPSAPVILPSAEQMTLEAS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS11 HSNPEMQQQLEALNQSISALTEATSQQQDSETMAPEESLKEAPSAPVILPSAEQTTLEAS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 STPADMQNILAVLLSQLMKTQEPAGSLEENNSDKNSGPQGPRRTPTMPQEEAAACPPHIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 STPADMQNILAVLLSQLMKTQEPAGSLEENNSDKNSGPQGPRRTPTMPQEEAAACPPHIL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 PPEKRPPEPPGPPPPPPPPPLVEGDLSSAPQELNPAVTAALLQLLSQPEAEPPGHLPHEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PPEKRPPEPPGPPPPPPPPPLVEGDLSSAPQELNPAVTAALLQLLSQPEAEPPGHLPHEH
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 QALRPMEYSTRPRPNRTYGNTDGPETGFSAIDTDERNSGPALTESLVQTLVKNRTFSGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QALRPMEYSTRPRPNRTYGNTDGPETGFSAIDTDERNSGPALTESLVQTLVKNRTFSGSL
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE2 SHLGESSSYQGTGSVQFPGDQDLRFARVPLALHPVVGQPFLKAEGSSNSVVHAETKLQNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SHLGESSSYQGTGSVQFPGDQDLRFARVPLALHPVVGQPFLKAEGSSNSVVHAETKLQNY
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490
pF1KE2 GELGPGTTGASSSGAGLHWGGPTQSSAYGKLYRGPTRVPPRGGRGRGVPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GELGPGTTGASSSGAGLHWGGPTQSSAYGKLYRGPTRVPPRGGRGRGVPY
1450 1460 1470 1480 1490
>>CCDS45666.1 CDK12 gene_id:51755|Hs108|chr17 (1481 aa)
initn: 8334 init1: 8334 opt: 8393 Z-score: 2999.6 bits: 567.7 E(32554): 9.2e-161
Smith-Waterman score: 9850; 99.3% identity (99.3% similar) in 1490 aa overlap (1-1490:1-1481)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MPNSERHGGKKDGSGGASGTLQPSSGGGSSNSRERHRLVSKHKRHKSKHSKDMGLVTPEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MPNSERHGGKKDGSGGASGTLQPSSGGGSSNSRERHRLVSKHKRHKSKHSKDMGLVTPEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 ASLGTVIKPLVEYDDISSDSDTFSDDMAFKLDRRENDERRGSDRSDRLHKHRHHQHRRSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ASLGTVIKPLVEYDDISSDSDTFSDDMAFKLDRRENDERRGSDRSDRLHKHRHHQHRRSR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 DLLKAKQTEKEKSQEVSSKSGSMKDRISGSSKRSNEETDDYGKAQVAKSSSKESRSSKLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DLLKAKQTEKEKSQEVSSKSGSMKDRISGSSKRSNEETDDYGKAQVAKSSSKESRSSKLH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 KEKTRKERELKSGHKDRSKSHRKRETPKSYKTVDSPKRRSRSPHRKWSDSSKQDDSPSGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KEKTRKERELKSGHKDRSKSHRKRETPKSYKTVDSPKRRSRSPHRKWSDSSKQDDSPSGA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SYGQDYDLSPSRSHTSSNYDSYKKSPGSTSRRQSVSPPYKEPSAYQSSTRSPSPYSRRQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SYGQDYDLSPSRSHTSSNYDSYKKSPGSTSRRQSVSPPYKEPSAYQSSTRSPSPYSRRQR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SVSPYSRRRSSSYERSGSYSGRSPSPYGRRRSSSPFLSKRSLSRSPLPSRKSMKSRSRSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SVSPYSRRRSSSYERSGSYSGRSPSPYGRRRSSSPFLSKRSLSRSPLPSRKSMKSRSRSP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 AYSRHSSSHSKKKRSSSRSRHSSISPVRLPLNSSLGAELSRKKKERAAAAAAAKMDGKES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AYSRHSSSHSKKKRSSSRSRHSSISPVRLPLNSSLGAELSRKKKERAAAAAAAKMDGKES
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KGSPVFLPRKENSSVEAKDSGLESKKLPRSVKLEKSAPDTELVNVTHLNTEVKNSSDTGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KGSPVFLPRKENSSVEAKDSGLESKKLPRSVKLEKSAPDTELVNVTHLNTEVKNSSDTGK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 VKLDENSEKHLVKDLKAQGTRDSKPIALKEEIVTPKETETSEKETPPPLPTIASPPPPLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VKLDENSEKHLVKDLKAQGTRDSKPIALKEEIVTPKETETSEKETPPPLPTIASPPPPLP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 TTTPPPQTPPLPPLPPIPALPQQPPLPPSQPAFSQVPASSTSTLPPSTHSKTSAVSSQAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TTTPPPQTPPLPPLPPIPALPQQPPLPPSQPAFSQVPASSTSTLPPSTHSKTSAVSSQAN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 SQPPVQVSVKTQVSVTAAIPHLKTSTLPPLPLPPLLPGDDDMDSPKETLPSKPVKKEKEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SQPPVQVSVKTQVSVTAAIPHLKTSTLPPLPLPPLLPGDDDMDSPKETLPSKPVKKEKEQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 RTRHLLTDLPLPPELPGGDLSPPDSPEPKAITPPQQPYKKRPKICCPRYGERRQTESDWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RTRHLLTDLPLPPELPGGDLSPPDSPEPKAITPPQQPYKKRPKICCPRYGERRQTESDWG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 KRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKAKDKDTGELVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKAKDKDTGELVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 LIHRSVVNMKEIVTDKQDALDFKKDKGAFYLVFEYMDHDLMGLLESGLVHFSEDHIKSFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LIHRSVVNMKEIVTDKQDALDFKKDKGAFYLVFEYMDHDLMGLLESGLVHFSEDHIKSFM
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 KQLMEGLEYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNSGQIKLADFGLARLYNSEESRPYTNKVITLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KQLMEGLEYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNSGQIKLADFGLARLYNSEESRPYTNKVITLW
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 YRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELFTKKPIFQANLELAQLELISRLCGSPCPAVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELFTKKPIFQANLELAQLELISRLCGSPCPAVW
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 PDVIKLPYFNTMKPKKQYRRRLREEFSFIPSAALDLLDHMLTLDPSKRCTAEQTLQSDFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PDVIKLPYFNTMKPKKQYRRRLREEFSFIPSAALDLLDHMLTLDPSKRCTAEQTLQSDFL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 KDVELSKMAPPDLPHWQDCHELWSKKRRRQRQSGVVVEEPPPSKTSRKETTSGTSTEPVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KDVELSKMAPPDLPHWQDCHELWSKKRRRQRQSGVVVEEPPPSKTSRKETTSGTSTEPVK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 NSSPAPPQPAPGKVESGAGDAIGLADITQQLNQSELAVLLNLLQSQTDLSIPQMAQLLNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NSSPAPPQPAPGKVESGAGDAIGLADITQQLNQSELAVLLNLLQSQTDLSIPQMAQLLNI
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 HSNPEMQQQLEALNQSISALTEATSQQQDSETMAPEESLKEAPSAPVILPSAEQMTLEAS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS45 HSNPEMQQQLEALNQSISALTEATSQQQDSETMAPEESLKEAPSAPVILPSAEQTTLEAS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 STPADMQNILAVLLSQLMKTQEPAGSLEENNSDKNSGPQGPRRTPTMPQEEAAACPPHIL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 STPADMQNILAVLLSQLMKTQEPAGSLEENNSDKNSGPQGPRRTPTMPQEEAA-------
1210 1220 1230 1240 1250
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 PPEKRPPEPPGPPPPPPPPPLVEGDLSSAPQELNPAVTAALLQLLSQPEAEPPGHLPHEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 --EKRPPEPPGPPPPPPPPPLVEGDLSSAPQELNPAVTAALLQLLSQPEAEPPGHLPHEH
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 QALRPMEYSTRPRPNRTYGNTDGPETGFSAIDTDERNSGPALTESLVQTLVKNRTFSGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QALRPMEYSTRPRPNRTYGNTDGPETGFSAIDTDERNSGPALTESLVQTLVKNRTFSGSL
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE2 SHLGESSSYQGTGSVQFPGDQDLRFARVPLALHPVVGQPFLKAEGSSNSVVHAETKLQNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SHLGESSSYQGTGSVQFPGDQDLRFARVPLALHPVVGQPFLKAEGSSNSVVHAETKLQNY
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1450 1460 1470 1480 1490
pF1KE2 GELGPGTTGASSSGAGLHWGGPTQSSAYGKLYRGPTRVPPRGGRGRGVPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GELGPGTTGASSSGAGLHWGGPTQSSAYGKLYRGPTRVPPRGGRGRGVPY
1440 1450 1460 1470 1480
>>CCDS5461.1 CDK13 gene_id:8621|Hs108|chr7 (1512 aa)
initn: 2865 init1: 2243 opt: 2928 Z-score: 1059.9 bits: 208.8 E(32554): 1e-52
Smith-Waterman score: 3389; 45.0% identity (64.2% similar) in 1536 aa overlap (10-1474:127-1496)
10 20 30
pF1KE2 MPNSERHGGKKDGSGGASGTLQPSSGGGSSNSRERHRLV
..::.:::: :::: . : . .
CCDS54 RRAGGRQKRRRGPRAGQEAEKRRVFSLPQPQQDGGGGAS------SGGGVTPLVEYEDVS
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 SKHKRHKSKHSKDMGLVTPEAASLGTVIKPLVEYDDISSDSDTFSDDMAFKLDRRENDER
:. :... .: .. .:. .. . ::.. . . . :: :.:
CCDS54 SQ-----SEQGLLLGGASAATAATAAGGTGGSGGSPASSSGTQRRGEGSERRPRR--DRR
160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 RGSDRSDRLHKHRHHQHRRSRDLLKAKQTEKEKSQEVSSKSGSMKDRI--SGSSKRSNEE
.: :: :.::..::: :: .. .: ::. :.:: . .. ::::. :. .
CCDS54 SSSGRS----KERHREHRR-RDGQRGG-SEASKSRSRHSHSGEERAEVAKSGSSSSSGGR
210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 TDDYGKAQVAKSSSKESRSSKLHKEKTRKERELKSGHKDRSKSHRKRET-PKSYKTVDSP
. ..: ..:::...:.:: :. .:.. .: :..:. :..:. .: ::.:.
CCDS54 RKS-ASATSSSSSSRKDRDSKAHRSRTKSSKEPPSAYKEPPKAYREDKTEPKAYR-----
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 KRRSRSPHRKWSDSSKQDDSPSGASYGQDYDLSPSRSHTSSNYDSYKKSPGSTSRRQSVS
.::: :: . .:::: :: .:. .:::. .. . :
CCDS54 RRRSLSPL------GGRDDSPV--------------SHRASQSLRSRKSPSPAG---GGS
320 330 340
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 PPYKEPSAYQSSTRSPSPYSRRQRSVSPYSRRRSSSYERSGSYSGRSPSPYGR---RRSS
::. . :::::::::. :: : : :::::.:. : ::::. :::
CCDS54 SPYS-----RRLPRSPSPYSRRR---SP-SYSRHSSYERGGDVS---PSPYSSSSWRRSR
350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 SPFLSKRSLSRSPLPSRKSMKSRSRSPAYSRHSSSHSKKKRSSSRSRHSSISPVRLPLNS
::. ::. :.: ::::::: :::: :.:... : :::::::::: : :.:
CCDS54 SPY--------SPV-LRRSGKSRSRSPYSSRHSRSRSRHRLSRSRSRHSSISPSTLTLKS
400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 SLGAELSRKKKERAAAAAAAKMDGKESKGSPVFLPRKENSSVEAKDSGLESKKLPRSVKL
::.:::...:: ::: :: : .: .... . : .. :: :.
CCDS54 SLAAELNKNKKARAAEAARAAEAAKAAEATKA----AEAAAKAAKASNT-----------
450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 EKSAPDTELVNVTHLNTEVKNSSDTGKVKLDENSEKHLVKDLKAQGTRDSKPIALKEEIV
:.: :. :::.. :. :. . :::.: .: :
CCDS54 --STP-------TKGNTETSASA----------SQTNHVKDVKK----------IKIE--
500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 TPKETETSEKETPPPLPTIASPPPPLPTTTPPPQTPPLPPLPPIPALPQQPPLPPSQPAF
: :.. .. ::. . . : .. .
CCDS54 ----------------------HAPSPSSGGTLKNDKAKTKPPLQVTKVENNLIVDKATK
530 540 550
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 SQVPASSTSTLPPSTHSKTSAVSSQANSQPPV-QVSVKTQVSVTAAIPHLKTSTLPPLPL
. : ... : :. .: .:: . ...: . ....: . . .: . :::::::::
CCDS54 KAVIVGKES---KSAATKEESVSLKEKTKPLTPSIGAKEKEQHVALV----TSTLPPLPL
560 570 580 590 600 610
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 PPLLPGDDDMDSPKETLPSKPVKKEKEQRTRHLLTDLPLPPELPGGD-LSPPDSPEPKAI
::.:: : . :: . .. : :::: :.. : ::.:::::::::::: :: ::: :
CCDS54 PPMLPEDKEADSLRGNISVKAVKKEVEKKLRCLLADLPLPPELPGGDDLS--KSPEEKK-
620 630 640 650 660
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 TPPQQPYKKRPKICCPRYGERRQTESDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKAKDKDTGE
: : :.::::: ::::: .. . :::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS54 TATQLHSKRRPKICGPRYGETKEKDIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKARDKDTGE
670 680 690 700 710 720
760 770 780 790 800 810
pF1KE2 LVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLIHRSVVNMKEIVTDKQDALDFKKDKGAFYL
.::::::::::::::::::::::::::::: :.:..:::::::::.::::::::::::::
CCDS54 MVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDFKKDKGAFYL
730 740 750 760 770 780
820 830 840 850 860 870
pF1KE2 VFEYMDHDLMGLLESGLVHFSEDHIKSFMKQLMEGLEYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNSG
::::::::::::::::::::.:.::::::.::::::.::::::::::::::::::::: :
CCDS54 VFEYMDHDLMGLLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNRG
790 800 810 820 830 840
880 890 900 910 920 930
pF1KE2 QIKLADFGLARLYNSEESRPYTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELFT
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QIKLADFGLARLYSSEESRPYTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELFT
850 860 870 880 890 900
940 950 960 970 980 990
pF1KE2 KKPIFQANLELAQLELISRLCGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRRLREEFSFIPS
:::::::: ::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::.::::: :::.
CCDS54 KKPIFQANQELAQLELISRICGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKLREEFVFIPA
910 920 930 940 950 960
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE2 AALDLLDHMLTLDPSKRCTAEQTLQSDFLKDVELSKMAPPDLPHWQDCHELWSKKRRRQR
:::::.:.::.:::::::::::.:: .::.::: ::: ::::: :::::::::::::::.
CCDS54 AALDLFDYMLALDPSKRCTAEQALQCEFLRDVEPSKMPPPDLPLWQDCHELWSKKRRRQK
970 980 990 1000 1010 1020
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE2 QSGVVVEEPPPSKTSRKETTSGTSTEPVKNSSPAPPQPAPGKVESGAGDAIGL-ADITQQ
: :.. .. :. ::. . : . ....: :. .:.... . . :.
CCDS54 QMGMT-DDVSTIKAPRKDLSLG--LDDSRTNTPQGVLPSSQLKSQGSSNVAPVKTGPGQH
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE2 LNQSELAVLLNLLQSQTDLSIPQMAQLLNIHSNPEMQQQLEALNQSISALTEATSQQQDS
::.::::.:::::::.:.... ...:.:::. : : ::::. .: . : ::...: .
CCDS54 LNHSELAILLNLLQSKTSVNMADFVQVLNIKVNSETQQQLNKINLPAGIL--ATGEKQTD
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE2 ETMAPEESLKEAPSAPVILPSAE--QMTLEASSTPADMQNILAVLLSQLMKTQEPAGS--
. .:: : : . : ::.. : .:.... : .:. .::::.::.:.:. .
CCDS54 PSTPQQESSK--PLGG-IQPSSQTIQPKVETDAAQAAVQSAFAVLLTQLIKAQQSKQKDV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1230 1240 1250 1260
pF1KE2 -LEE--NNSDKNSGPQ-GPRRTPTMP---QE-----------EAAACP--PHILPPEKRP
::: :.: .... : : :. : :. : . : :.::::..::
CCDS54 LLEERENGSGHEASLQLRPPPEPSTPVSGQDDLIQHQDMRILELTPEPDRPRILPPDQRP
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310
pF1KE2 PEPPGPPPPPPPPPLVEGDL------------SSAPQELNPAVTAALLQLLSQ--PEAEP
:::: :::..: :: ::. . . .: :::::::.: :. .:
CCDS54 PEPP------EPPPVTEEDLDYRTENQHVPTTSSSLTDPHAGVKAALLQLLAQHQPQDDP
1270 1280 1290 1300 1310
1320 1330 1340 1350 1360
pF1KE2 PGHLPHEHQALRPMEYSTRPRPNRTYGNTDGPETGFSAIDTDERNSGPALTE------SL
. ..:: . .. . : .:... . . . : .:.: : . :
CCDS54 KREGGIDYQAGDTYVSTSDYKDN--FGSSSFSSAPYVSNDGLGSSSAPPLERRSFIGNSD
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1370 1380 1390 1400
pF1KE2 VQTLVKNRT-------------FSGSL--SHLGESSSYQGTGSVQFPGDQDLRF--ARVP
.:.: . : :: :. : : .. : ..: . : ::.: :: .. :
CCDS54 IQSLDNYSTASSHSGGPPQPSAFSESFPSSVAGYGDIYLNAGPMLFSGDKDHRFEYSHGP
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1410 1420 1430 1440 1450 1460
pF1KE2 LALHPVVGQPFLKAEGSSNSVVHAETKLQNYG-ELGPGTTGASSSGAGLHWGGPTQSSAY
.:. ..: : :. . :. . ::: .: . .: : : : .:.:. .:
CCDS54 IAVLANSSDPSTGPE--STHPLPAKMHNYNYGGNLQENPSGPSLMH-GQTWTSPAQGPGY
1440 1450 1460 1470 1480 1490
1470 1480 1490
pF1KE2 GKLYRGPTRVPPRGGRGRGVPY
.. :::
CCDS54 SQGYRGHISTSTGRGRGRGLPY
1500 1510
>>CCDS5462.1 CDK13 gene_id:8621|Hs108|chr7 (1452 aa)
initn: 2708 init1: 2243 opt: 2678 Z-score: 971.4 bits: 192.4 E(32554): 8.7e-48
Smith-Waterman score: 3201; 43.7% identity (61.5% similar) in 1550 aa overlap (10-1490:127-1452)
10 20 30
pF1KE2 MPNSERHGGKKDGSGGASGTLQPSSGGGSSNSRERHRLV
..::.:::: :::: . : . .
CCDS54 RRAGGRQKRRRGPRAGQEAEKRRVFSLPQPQQDGGGGAS------SGGGVTPLVEYEDVS
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 SKHKRHKSKHSKDMGLVTPEAASLGTVIKPLVEYDDISSDSDTFSDDMAFKLDRRENDER
:. :... .: .. .:. .. . ::.. . . . :: :.:
CCDS54 SQ-----SEQGLLLGGASAATAATAAGGTGGSGGSPASSSGTQRRGEGSERRPRR--DRR
160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 RGSDRSDRLHKHRHHQHRRSRDLLKAKQTEKEKSQEVSSKSGSMKDRI--SGSSKRSNEE
.: :: :.::..::: :: .. .: ::. :.:: . .. ::::. :. .
CCDS54 SSSGRS----KERHREHRR-RDGQRGG-SEASKSRSRHSHSGEERAEVAKSGSSSSSGGR
210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 TDDYGKAQVAKSSSKESRSSKLHKEKTRKERELKSGHKDRSKSHRKRET-PKSYKTVDSP
. ..: ..:::...:.:: :. .:.. .: :..:. :..:. .: ::.:.
CCDS54 RKS-ASATSSSSSSRKDRDSKAHRSRTKSSKEPPSAYKEPPKAYREDKTEPKAYR-----
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 KRRSRSPHRKWSDSSKQDDSPSGASYGQDYDLSPSRSHTSSNYDSYKKSPGSTSRRQSVS
.::: :: . .:::: :: .:. .:::. .. . :
CCDS54 RRRSLSPL------GGRDDSPV--------------SHRASQSLRSRKSPSPAG---GGS
320 330 340
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 PPYKEPSAYQSSTRSPSPYSRRQRSVSPYSRRRSSSYERSGSYSGRSPSPYGR---RRSS
::. . :::::::::. :: : : :::::.:. : ::::. :::
CCDS54 SPYS-----RRLPRSPSPYSRRR---SP-SYSRHSSYERGGDVS---PSPYSSSSWRRSR
350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 SPFLSKRSLSRSPLPSRKSMKSRSRSPAYSRHSSSHSKKKRSSSRSRHSSISPVRLPLNS
::. ::. :.: ::::::: :::: :.:... : :::::::::: : :.:
CCDS54 SPY--------SPV-LRRSGKSRSRSPYSSRHSRSRSRHRLSRSRSRHSSISPSTLTLKS
400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 SLGAELSRKKKERAAAAAAAKMDGKESKGSPVFLPRKENSSVEAKDSGLESKKLPRSVKL
::.:::...:: ::: :: : .: .... . : .. :: :.
CCDS54 SLAAELNKNKKARAAEAARAAEAAKAAEATKA----AEAAAKAAKASNT-----------
450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 EKSAPDTELVNVTHLNTEVKNSSDTGKVKLDENSEKHLVKDLKAQGTRDSKPIALKEEIV
:.: :. :::.. :. :. . :::.: .: :
CCDS54 --STP-------TKGNTETSASA----------SQTNHVKDVKK----------IKIE--
500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 TPKETETSEKETPPPLPTIASPPPPLPTTTPPPQTPPLPPLPPIPALPQQPPLPPSQPAF
: :.. .. ::. . . : .. .
CCDS54 ----------------------HAPSPSSGGTLKNDKAKTKPPLQVTKVENNLIVDKATK
530 540 550
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 SQVPASSTSTLPPSTHSKTSAVSSQANSQP--PVQVSVKTQVSVTAAIPHLKTSTLPPLP
. : ... : :. .: .:: . ...: : ....: . . .: : ::::::::
CCDS54 KAVIVGKESK---SAATKEESVSLKEKTKPLTP-SIGAKEKEQHVA----LVTSTLPPLP
560 570 580 590 600 610
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 LPPLLPGDDDMDSPKETLPSKPVKKEKEQRTRHLLTDLPLPPELPGGD-LSPPDSPEPKA
:::.:: : . :: . .. : :::: :.. : ::.:::::::::::: :: ::: :
CCDS54 LPPMLPEDKEADSLRGNISVKAVKKEVEKKLRCLLADLPLPPELPGGDDLSK--SPEEKK
620 630 640 650 660
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 ITPPQQPYKKRPKICCPRYGERRQTESDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKAKDKDTG
: : :.::::: ::::: .. . :::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS54 -TATQLHSKRRPKICGPRYGETKEKDIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKARDKDTG
670 680 690 700 710 720
760 770 780 790 800 810
pF1KE2 ELVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLIHRSVVNMKEIVTDKQDALDFKKDKGAFY
:.::::::::::::::::::::::::::::: :.:..:::::::::.:::::::::::::
CCDS54 EMVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDFKKDKGAFY
730 740 750 760 770 780
820 830 840 850 860 870
pF1KE2 LVFEYMDHDLMGLLESGLVHFSEDHIKSFMKQLMEGLEYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNS
:::::::::::::::::::::.:.::::::.::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS54 LVFEYMDHDLMGLLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNR
790 800 810 820 830 840
880 890 900 910 920 930
pF1KE2 GQIKLADFGLARLYNSEESRPYTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELF
::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GQIKLADFGLARLYSSEESRPYTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELF
850 860 870 880 890 900
940 950 960 970 980 990
pF1KE2 TKKPIFQANLELAQLELISRLCGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRRLREEFSFIP
::::::::: ::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::.::::: :::
CCDS54 TKKPIFQANQELAQLELISRICGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKLREEFVFIP
910 920 930 940 950 960
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE2 SAALDLLDHMLTLDPSKRCTAEQTLQSDFLKDVELSKMAPPDLPHWQDCHELWSKKRRRQ
.:::::.:.::.:::::::::::.:: .::.::: ::: ::::: :::::::::::::::
CCDS54 AAALDLFDYMLALDPSKRCTAEQALQCEFLRDVEPSKMPPPDLPLWQDCHELWSKKRRRQ
970 980 990 1000 1010 1020
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE2 RQSGVVVEEPPPSKTSRKETTSGTSTEPVKNSSPAPPQPAPGKVESGAGDAIGLADITQQ
.: :.. .. :. ::. . : . .: :: : . :. . : ....
CCDS54 KQMGMT-DDVSTIKAPRKDLSLG-----LDDSRTNTPQ---GVLPSSQLKSQGSSNVAPG
1030 1040 1050 1060 1070
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE2 LNQSELAVLLNLLQSQTDLSIPQMAQLLNIHSNPEMQQQLEALNQSISALTEATSQQQDS
..::: : :: :..:
CCDS54 -------------EKQTDPSTPQ---------------------------------QESS
1080 1090
1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE2 ETMAPEESLKEAPSAPVILPSAEQMTLEASSTPADMQNILAVLLSQLMKTQEPAGS---L
. .. . ::. .: :. .:.... : .:. .::::.::.:.:. . :
CCDS54 KPLGGIQ-----PSSQTIQPK-----VETDAAQAAVQSAFAVLLTQLIKAQQSKQKDVLL
1100 1110 1120 1130 1140
1230 1240 1250 1260
pF1KE2 EE--NNSDKNSGPQ-GPRRTPTMP---QE-----------EAAACP--PHILPPEKRPPE
:: :.: .... : : :. : :. : . : :.::::..::::
CCDS54 EERENGSGHEASLQLRPPPEPSTPVSGQDDLIQHQDMRILELTPEPDRPRILPPDQRPPE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1270 1280 1290 1300 1310
pF1KE2 PPGPPPPPPPPPLVEGDL------------SSAPQELNPAVTAALLQLLSQ--PEAEPPG
: : :::..: :: ::. . . .: :::::::.: :. .:
CCDS54 P------PEPPPVTEEDLDYRTENQHVPTTSSSLTDPHAGVKAALLQLLAQHQPQDDPKR
1210 1220 1230 1240 1250
1320 1330 1340 1350 1360
pF1KE2 HLPHEHQALRPMEYSTRPRPNRTYGNTDGPETGFSAIDTDERNSGPALTE------SLVQ
. ..:: . .. . : .:... . . . : .:.: : . : .:
CCDS54 EGGIDYQAGDTYVSTSDYKDN--FGSSSFSSAPYVSNDGLGSSSAPPLERRSFIGNSDIQ
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1370 1380 1390 1400 1410
pF1KE2 TLVKNRT-------------FSGSL--SHLGESSSYQGTGSVQFPGDQDLRF--ARVPLA
.: . : :: :. : : .. : ..: . : ::.: :: .. :.:
CCDS54 SLDNYSTASSHSGGPPQPSAFSESFPSSVAGYGDIYLNAGPMLFSGDKDHRFEYSHGPIA
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KE2 LHPVVGQPFLKAEGSSNSVVHAETKLQNYG-ELGPGTTGASSSGAGLHWGGPTQSSAYGK
. ..: : :. . :. . ::: .: . .: : : : .:.:. .:..
CCDS54 VLANSSDPSTGPE--STHPLPAKMHNYNYGGNLQENPSGPSLMH-GQTWTSPAQGPGYSQ
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1480 1490
pF1KE2 LYRGPTRVPPRGGRGRGVPY
::: . :::::.::
CCDS54 GYRGHISTSTGRGRGRGLPY
1440 1450
>>CCDS6879.1 CDK9 gene_id:1025|Hs108|chr9 (372 aa)
initn: 695 init1: 345 opt: 979 Z-score: 376.4 bits: 80.3 E(32554): 1.2e-14
Smith-Waterman score: 979; 43.7% identity (72.4% similar) in 366 aa overlap (724-1079:16-371)
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 PQQPYKKRPKICCPRYGERRQTESDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKAKDKDTGELV
:.:.. .. ::.::.:.:.::. . ::. :
CCDS68 MAKQYDSVECPFCDEVSKYEKLAKIGQGTFGEVFKARHRKTGQKV
10 20 30 40
760 770 780 790 800 810
pF1KE2 ALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLIHRSVVNMKEIVTDKQDALDFKKDKGAFYLVF
::::: ..::::::::::.::::::. : :..:::. :: : : ... ::..::::
CCDS68 ALKKVLMENEKEGFPITALREIKILQLLKHENVVNLIEICRTK--ASPYNRCKGSIYLVF
50 60 70 80 90 100
820 830 840 850 860 870
pF1KE2 EYMDHDLMGLLESGLVHFSEDHIKSFMKQLMEGLEYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNSGQI
.. .::: ::: . ::.:. ..:: :..:..:: : :....::::.: .:.:.. .: .
CCDS68 DFCEHDLAGLLSNVLVKFTLSEIKRVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGVL
110 120 130 140 150 160
880 890 900 910 920 930
pF1KE2 KLADFGLARLYN-SEESRP--YTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELF
::::::::: .. ...:.: :::.:.:::::::::::::. : : ::.:. :::..:..
CCDS68 KLADFGLARAFSLAKNSQPNRYTNRVVTLWYRPPELLLGERDYGPPIDLWGAGCIMAEMW
170 180 190 200 210 220
940 950 960 970 980
pF1KE2 TKKPIFQANLELAQLELISRLCGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRRLREEF-SFI
:..::.:.: : :: :::.:::: : :::.: . .. .. : .:...... ...
CCDS68 TRSPIMQGNTEQHQLALISQLCGSITPEVWPNVDNYELYEKLELVKGQKRKVKDRLKAYV
230 240 250 260 270 280
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE2 PSA-ALDLLDHMLTLDPSKRCTAEQTLQSDFLKDVELSKMAPPDLPHWQDCH-----ELW
. ::::.:..:.:::..: ....:. ::. : : :: . : :
CCDS68 RDPYALDLIDKLLVLDPAQRIDSDDALNHDFF----WSDPMPSDLKGMLSTHLTSMFEYL
290 300 310 320 330
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE2 SKKRRRQRQSGVVVEEPPPSKTSRKETTSGTSTEPVKNSSPAPPQPAPGKVESGAGDAIG
. ::. : . . ... ::. : : :
CCDS68 APPRRKGSQ----ITQQSTNQSRNPATTNQTEFERVF
340 350 360 370
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE2 LADITQQLNQSELAVLLNLLQSQTDLSIPQMAQLLNIHSNPEMQQQLEALNQSISALTEA
1490 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 13:51:48 2016 done: Sun Nov 6 13:51:49 2016
Total Scan time: 7.070 Total Display time: 0.340
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]