Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2342
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2342, 423 aa
1>>>pF1KE2342 423 - 423 aa - 423 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3482+/- 0.001; mu= 17.0307+/- 0.060
mean_var=65.3769+/-13.131, 0's: 0 Z-trim(103.6): 29 B-trim: 10 in 1/51
Lambda= 0.158621
statistics sampled from 7463 (7488) to 7463 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.602), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16
Scan time: 2.420
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10057.2 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15 ( 426) 2802 650.3 1e-186
CCDS53930.1 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15 ( 396) 2321 540.2 1.3e-153
CCDS9207.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12 ( 412) 866 207.3 2.3e-53
CCDS7634.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10 ( 432) 848 203.2 4.1e-52
CCDS2389.1 ACADL gene_id:33|Hs108|chr2 ( 430) 814 195.4 9e-50
CCDS65562.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 385) 782 188.0 1.3e-47
CCDS668.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 421) 782 188.1 1.4e-47
CCDS44165.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 425) 782 188.1 1.4e-47
CCDS3053.1 ACAD9 gene_id:28976|Hs108|chr3 ( 621) 772 185.9 9.6e-47
CCDS8498.1 ACAD8 gene_id:27034|Hs108|chr11 ( 415) 766 184.4 1.8e-46
CCDS81518.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10 ( 330) 762 183.4 2.8e-46
CCDS42249.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17 ( 633) 717 173.3 6e-43
CCDS11090.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17 ( 655) 717 173.3 6.2e-43
CCDS58509.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17 ( 678) 717 173.3 6.4e-43
CCDS76610.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12 ( 408) 700 169.3 6.2e-42
CCDS72807.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 454) 694 167.9 1.7e-41
CCDS12286.1 GCDH gene_id:2639|Hs108|chr19 ( 438) 561 137.5 2.5e-32
CCDS31903.1 ACAD10 gene_id:80724|Hs108|chr12 (1059) 364 92.6 1.9e-18
CCDS44973.1 ACAD10 gene_id:80724|Hs108|chr12 (1090) 364 92.6 2e-18
CCDS3074.1 ACAD11 gene_id:84129|Hs108|chr3 ( 780) 283 74.0 5.7e-13
>>CCDS10057.2 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15 (426 aa)
initn: 2802 init1: 2802 opt: 2802 Z-score: 3465.8 bits: 650.3 E(32554): 1e-186
Smith-Waterman score: 2802; 99.8% identity (99.8% similar) in 423 aa overlap (1-423:4-426)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MATATRLLGCRVASWRLRPPLAGFVSQRAHSLLPVDDAINGLSEEQRQLRQTMAKFL
::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MAEMATATRLLGWRVASWRLRPPLAGFVSQRAHSLLPVDDAINGLSEEQRQLRQTMAKFL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 QEHLAPKAQEIDRSNEFKNLREFWKQLGNLGVLGITAPVQYGGSGLGYLEHVLVMEEISR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QEHLAPKAQEIDRSNEFKNLREFWKQLGNLGVLGITAPVQYGGSGLGYLEHVLVMEEISR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 ASGAVGLSYGAHSNLCINQLVRNGNEAQKEKYLPKLISGEYIGALAMSEPNAGSDVVSMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ASGAVGLSYGAHSNLCINQLVRNGNEAQKEKYLPKLISGEYIGALAMSEPNAGSDVVSMK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 LKAEKKGNHYILNGNKFWITNGPDADVLIVYAKTDLAAVPASRGITAFIVEKGMPGFSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LKAEKKGNHYILNGNKFWITNGPDADVLIVYAKTDLAAVPASRGITAFIVEKGMPGFSTS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 KKLDKLGMRGSNTCELIFEDCKIPAANILGHENKGVYVLMSGLDLERLVLAGGPLGLMQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KKLDKLGMRGSNTCELIFEDCKIPAANILGHENKGVYVLMSGLDLERLVLAGGPLGLMQA
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 VLDHTIPYLHVREAFGQKIGHFQLMQGKMADMYTRLMACRQYVYNVAKACDEGHCTAKDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VLDHTIPYLHVREAFGQKIGHFQLMQGKMADMYTRLMACRQYVYNVAKACDEGHCTAKDC
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 AGVILYSAECATQVALDGIQCFGGNGYINDFPMGRFLRDAKLYEIGAGTSEVRRLVIGRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AGVILYSAECATQVALDGIQCFGGNGYINDFPMGRFLRDAKLYEIGAGTSEVRRLVIGRA
370 380 390 400 410 420
420
pF1KE2 FNADFH
::::::
CCDS10 FNADFH
>>CCDS53930.1 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15 (396 aa)
initn: 2308 init1: 2308 opt: 2321 Z-score: 2871.4 bits: 540.2 E(32554): 1.3e-153
Smith-Waterman score: 2539; 92.7% identity (92.7% similar) in 423 aa overlap (1-423:4-396)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MATATRLLGCRVASWRLRPPLAGFVSQRAHSLLPVDDAINGLSEEQRQLRQTMAKFL
::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MAEMATATRLLGWRVASWRLRPPLAGFVSQRAHSLLPVDDAINGLSEEQRQ---------
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 QEHLAPKAQEIDRSNEFKNLREFWKQLGNLGVLGITAPVQYGGSGLGYLEHVLVMEEISR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ---------------------EFWKQLGNLGVLGITAPVQYGGSGLGYLEHVLVMEEISR
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 ASGAVGLSYGAHSNLCINQLVRNGNEAQKEKYLPKLISGEYIGALAMSEPNAGSDVVSMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ASGAVGLSYGAHSNLCINQLVRNGNEAQKEKYLPKLISGEYIGALAMSEPNAGSDVVSMK
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 LKAEKKGNHYILNGNKFWITNGPDADVLIVYAKTDLAAVPASRGITAFIVEKGMPGFSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LKAEKKGNHYILNGNKFWITNGPDADVLIVYAKTDLAAVPASRGITAFIVEKGMPGFSTS
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 KKLDKLGMRGSNTCELIFEDCKIPAANILGHENKGVYVLMSGLDLERLVLAGGPLGLMQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KKLDKLGMRGSNTCELIFEDCKIPAANILGHENKGVYVLMSGLDLERLVLAGGPLGLMQA
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 VLDHTIPYLHVREAFGQKIGHFQLMQGKMADMYTRLMACRQYVYNVAKACDEGHCTAKDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VLDHTIPYLHVREAFGQKIGHFQLMQGKMADMYTRLMACRQYVYNVAKACDEGHCTAKDC
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 AGVILYSAECATQVALDGIQCFGGNGYINDFPMGRFLRDAKLYEIGAGTSEVRRLVIGRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AGVILYSAECATQVALDGIQCFGGNGYINDFPMGRFLRDAKLYEIGAGTSEVRRLVIGRA
340 350 360 370 380 390
420
pF1KE2 FNADFH
::::::
CCDS53 FNADFH
>>CCDS9207.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12 (412 aa)
initn: 833 init1: 495 opt: 866 Z-score: 1071.6 bits: 207.3 E(32554): 2.3e-53
Smith-Waterman score: 866; 38.1% identity (70.5% similar) in 373 aa overlap (42-414:34-402)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 VASWRLRPPLAGFVSQRAHSLLPVDDAINGLSEEQRQLRQTMAKFLQEHLAPKAQEIDRS
: : ...: :: : ...: : : ..:.
CCDS92 ALLARASGPARRALCPRAWRQLHTIYQSVELPETHQMLLQTCRDFAEKELFPIAAQVDKE
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 NEFKNLREFWKQLGNLGVLGITAPVQYGGSGLGYLEHVLVMEEISRASGAVGLSYGAHSN
. : . :..:.::.:.. .: . ::.:: :: ....::::::. ...:. ......
CCDS92 HLFPAAQV--KKMGGLGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYAIAMEEISRGCASTGVIMSVNNS
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 LCINQLVRNGNEAQKEKYLPKLISGEYIGALAMSEPNAGSDVVSMKLKAEKKGNHYILNG
: .. ... :.. ::. .. . ::. :: .:.:::. :::. . . :. .:. ..:::
CCDS92 LYLGPILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGNGSDAGAASTTARAEGDSWVLNG
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 NKFWITNGPDADVLIVYAKTDLAAVPASRGITAFIVEKGMPGFSTSKKLDKLGMRGSNTC
.: ::::. .:.. .:.:.:: : ..::.::.: ::.. .:: ::::.:::.:
CCDS92 TKAWITNAWEASAAVVFASTDRAL--QNKGISAFLVPMPTPGLTLGKKEDKLGIRGSSTA
190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 ELIFEDCKIPAANILGHENKGVYVLMSGLDLERLVLAGGPLGLMQAVLDHTIPYLHVREA
.::::::.:: .:::. . : . :. ::. :. .:. ::. :..:: .. : . : :
CCDS92 NLIFEDCRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQALGIAQTALDCAVNYAENRMA
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 FGQKIGHFQLMQGKMADMYTRLMACRQYVYNVAKACDEGHCTAKDCAGVILYSAECATQV
:: . ..:..: :.::: : . : .. .: :. . :. : . : ..: :: .
CCDS92 FGAPLTKLQVIQFKLADMALALESARLLTWRAAMLKDNKKPFIKEAAMAKLAASEAATAI
300 310 320 330 340 350
380 390 400 410 420
pF1KE2 ALDGIQCFGGNGYINDFPMGRFLRDAKLYEIGAGTSEVRRLVIGRAFNADFH
. ..:: .:: ::....: : :::.. :: ::::..::::
CCDS92 SHQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQRLVIAGHLLRSYRS
360 370 380 390 400 410
>>CCDS7634.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10 (432 aa)
initn: 789 init1: 453 opt: 848 Z-score: 1049.0 bits: 203.2 E(32554): 4.1e-52
Smith-Waterman score: 848; 33.8% identity (70.7% similar) in 423 aa overlap (7-422:19-432)
10 20 30 40
pF1KE2 MATATRLLGCRVASWRLRPPLAGFVSQRAHSLLPVDDA------INGL
.: : ..::.. :: .. :: ...:: . . .. .
CCDS76 MEGLAVRLLRGSRLLRRNFLTC-LSSWKI-PPHVSKSSQ-SEALLNITNNGIHFAPLQTF
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 SEEQRQLRQTMAKFLQEHLAPKAQEIDRSNEFKNLREFWKQLGNLGVLGITAPVQYGGSG
..:. ...... :: ::..:: .. .:...... . . : . :..:: . .:::.:
CCDS76 TDEEMMIKSSVKKFAQEQIAPLVSTMDENSKME--KSVIQGLFQQGLMGIEVDPEYGGTG
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 LGYLEHVLVMEEISRASGAVGLSYGAHSNLCINQLVR-NGNEAQKEKYLPKLISGEYIGA
..: :::.::.......:.. . .: :: :.: .:.: :: :::.: . : .:.
CCDS76 ASFLSTVLVIEELAKVDASVAV-FCEIQNTLINTLIRKHGTEEQKATYLPQLTT-EKVGS
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 LAMSEPNAGSDVVSMKLKAEKKGNHYILNGNKFWITNGPDADVLIVYAKTDLAAVPASRG
. .:: .:::: ..: .:.:.:..:.:::.:.::... : ...:.:..: . . .:
CCDS76 FCLSEAGAGSDSFALKTRADKEGDYYVLNGSKMWISSAEHAGLFLVMANVD--PTIGYKG
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 ITAFIVEKGMPGFSTSKKLDKLGMRGSNTCELIFEDCKIPAANILGHENKGVYVLMSGLD
::.:.:.. ::. .: .:::.:.:.:: : ::. :.: :::::. ..: ...:.
CCDS76 ITSFLVDRDTPGLHIGKPENKLGLRASSTCPLTFENVKVPEANILGQIGHGYKYAIGSLN
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 LERLVLAGGPLGLMQAVLDHTIPYLHVREAFGQKIGHFQLMQGKMADMYTRLMACRQYVY
:. .:. ::: :. .:.::::.. : ::... :: .: ..: . :.: : : .:
CCDS76 EGRIGIAAQMLGLAQGCFDYTIPYIKERIQFGKRLFDFQGLQHQVAHVATQLEAARLLTY
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 NVAKACDEGHCTAKDCAGVILYSAECATQVALDGIQCFGGNGYINDFPMGRFLRDAKLYE
:.:. . :. :. . . :..: : :.. :. .:: :: .:.:. ...::::.
CCDS76 NAARLLEAGKPFIKEASMAKYYASEIAGQTTSKCIEWMGGVGYTKDYPVEKYFRDAKIGT
360 370 380 390 400 410
410 420
pF1KE2 IGAGTSEVRRLVIGRAFNADFH
: :.:... .:.. ..:..
CCDS76 IYEGASNIQLNTIAKHIDAEY
420 430
>>CCDS2389.1 ACADL gene_id:33|Hs108|chr2 (430 aa)
initn: 787 init1: 680 opt: 814 Z-score: 1007.0 bits: 195.4 E(32554): 9e-50
Smith-Waterman score: 814; 34.9% identity (69.8% similar) in 384 aa overlap (42-421:53-429)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 VASWRLRPPLAGFVSQRAHSLLPVDDAINGLSEEQRQLRQTMAKFLQEHLAPKAQEIDRS
.: :. .:... ::.::.. :. .: ...
CCDS23 PAARCSHSGGEERLETPSAKKLTDIGIRRIFSPEHDIFRKSVRKFFQEEVIPHHSEWEKA
30 40 50 60 70 80
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 NEFKNLREFWKQLGNLGVLGITAPVQYGGSGLGYLEHVLVMEEISRASGAVGLSYGAHSN
.: . :: :.. :. :.::.. . :: : : : . .. : . :. : ... ::.
CCDS23 GEVS--REVWEKAGKQGLLGVNIAEHLGGIG-GDLYSAAIVWEEQAYSNCSGPGFSIHSG
90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 LCINQLVRNGNEAQKEKYLPKLISGEYIGALAMSEPNAGSDVVSMKLKAEKKGNHYILNG
. .. .. .:.: : ....:.. .:. :::.::.::.::::. ..: .:.: :. .::::
CCDS23 IVMSYITNHGSEEQIKHFIPQMTAGKCIGAIAMTEPGAGSDLQGIKTNAKKDGSDWILNG
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 NKFWITNGPDADVLIVYAKTDLAAVPASRGITAFIVEKGMPGFSTSKKLDKLGMRGSNTC
.: .:.:: .::.:: : :. : ..::. :.::.:: :: ..:: :.:.....:
CCDS23 SKVFISNGSLSDVVIVVAVTNHEAPSPAHGISLFLVENGMKGFIKGRKLHKMGLKAQDTA
200 210 220 230 240 250
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 ELIFEDCKIPAANILGHENKGVYVLMSGLDLERLVLAGGPLGLMQAVLDHTIPYLHVREA
::.::: ..::. .::.:::: : .:. : :::..: .. . ....: :.. :.:
CCDS23 ELFFEDIRLPASALLGEENKGFYYIMKELPQERLLIADVAISASEFMFEETRNYVKQRKA
260 270 280 290 300 310
320 330 340 350 360
pF1KE2 FGQKIGHFQLMQGKMADMYTRLMACRQYVYNVAKACDEGHCTAK-DCAGVIL---YSAEC
::. ..:.: .: :.:.. :.. . : .: : : . : . . : : . . ...:
CCDS23 FGKTVAHLQTVQHKLAELKTHICVTRAFVDN----CLQLHEAKRLDSATACMAKYWASEL
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 ATQVALDGIQCFGGNGYINDFPMGRFLRDAKLYEIGAGTSEVRRLVIGRAFNADFH
..:: : .: :: ::. ..:... ::.. : .::.:. . .:.: . :
CCDS23 QNSVAYDCVQLHGGWGYMWEYPIAKAYVDARVQPIYGGTNEIMKELIAREIVFDK
380 390 400 410 420 430
>>CCDS65562.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 (385 aa)
initn: 660 init1: 436 opt: 782 Z-score: 968.2 bits: 188.0 E(32554): 1.3e-47
Smith-Waterman score: 782; 34.6% identity (67.8% similar) in 379 aa overlap (42-416:5-377)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 VASWRLRPPLAGFVSQRAHSLLPVDDAINGLSEEQRQLRQTMAKFLQEHLAPKAQEIDRS
..:.:.... : :: .:.. : : : :..
CCDS65 MLQEFTEQQKEFQATARKFAREEIIPVAAEYDKT
10 20 30
80 90 100 110 120
pF1KE2 NEFKN--LREFWKQLGNLGVLGITAPVQYGGSGLGYLEHVLVMEEISRASGAVGLSYGAH
.:. .:. :. ::... : . :: ::: .. :. ::. : : .:.. . .
CCDS65 GEYPVPLIRRAWE----LGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEEL--AYGCTGVQTAIE
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 SN-LCINQLVRNGNEAQKEKYLPKLISGEYIGALAMSEPNAGSDVVSMKLKAEKKGNHYI
.: : .. ::. ::.::: .. . : ..::.:::::...: ::::::..::
CCDS65 GNSLGQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKAEKKGDEYI
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LNGNKFWITNGPDADVLIVYAKTDL-AAVPASRGITAFIVEKGMPGFSTSKKLDKLGMRG
.::.:.::::: :. .. :..: .::....:.:::: ::.. ..: ..:.:
CCDS65 INGQKMWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRKELNMGQRC
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SNTCELIFEDCKIPAANILGHENKGVYVLMSGLDLERLVLAGGPLGLMQAVLDHTIPYLH
:.: ..::: :.: :.: .. : : :...: : :.:.: .:: : .::.. :
CCDS65 SDTRGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGAVGLAQRALDEATKYAL
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VREAFGQKIGHFQLMQGKMADMYTRLMACRQYVYNVAKACDEGHCTAKDCAGVILYSAEC
:..::. . . : .. .:.: .. :. .: : :. .. . . ....
CCDS65 ERKTFGKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTYYASIAKAFAGDI
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
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:.:.: :..: .::::. ...:. ...::::.:.: :::...::...:
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..:.:.... : :: .:.. : : : :..
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CCDS66 ANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHIDKYKN
370 380 390 400 410 420
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20 30 40 50 60 70
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..:.:.... : :: .:.. : : : :..
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CCDS44 INGQKMWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRKELNMGQRC
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:.: ..::: :.: :.: .. : : :...: : :.:.: .:: : .::.. :
CCDS44 SDTRGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGAVGLAQRALDEATKYAL
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CCDS44 ANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHIDKYKN
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10 20 30
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10 20 30 40 50 60
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CCDS30 QDELNEINQFLGPVEKFFTEEV--DSRKIDQEGKIPD--ETLEKLKSLGLFGLQVPEEYG
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CCDS30 GLGFSNTMYSRLGEIIS-MDGSITVTLAAHQAIGLKGIILAGTEEQKAKYLPKLASGEHI
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160 170 180 190 200 210
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CCDS30 AAFCLTEPASGSDAASIRSRATLSEDKKHYILNGSKVWITNGGLANIFTVFAKTEVVDSD
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CCDS30 GSVKDKITAFIVERDFGGVTNGKPEDKLGIRGSNTCEVHFENTKIPVENILGEVGDGFKV
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CCDS30 AMNILNSGRFSMGSVVAGLLKRLIEMTAEYACTRKQFNKRLSEFGLIQEKFALMAQKAYV
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CCDS30 MESMTYLTAGMLDQPGFPDCSI-EAAMVKVFSSEAAWQCVSEALQILGGLGYTRDYPYER
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CCDS30 ILRDTRILLIFEGTNEILRMYIALTGLQHAGRILTTRIHELKQAKVSTVMDTVGRRLRDS
420 430 440 450 460 470
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10 20 30 40 50
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10 20 30 40 50
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CCDS84 ATGCTSTTAYISIHNMCAWMIDSFGNEEQRHKFCPPLCTMEKFASYCLTEPGSGSDAASL
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CCDS84 LTSAKKQGDHYILNGSKAFISGAGESDIYVVMCRT---GGPGPKGISCIVVEKGTPGLSF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]